1QOPA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with indole propanol phosphate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title Crystal Structure of Wild-Type Tryptophan Synthase Complexed with the Natural Substrate Indole-3-Glycerol Phosphate
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 99
structure length 265
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qopA00
3T40A 5DLCA 4DXVA 3O6YX 3TC6A 4LY8A 3O05A 3TROA 2ZRYA 2X1UA 1ICSA 4RCXA 5DCDA 3CC1A 4IMGA 1QOQA 1PCWA 4FEZA 3P60A 2ZA3A 3TV8A 4Y96A 1M6JA 2E6FA 1ZFJA 4EIVA 4MY1A 3TSBA 4WUIA 1DJQA 3TQVA 4WY0A 3S5NA 3BK0A 4J9JA 3LXAA 2EAWA 3ABQA 5CPOA 3ANYA 3F1QA 3PG8A 3EB2A 3G8EA 1MZHA 3G0SA 3R2GA 3YPIA 4GE8A 2R94A 4NZJA 3L66A 1SO4A 2Y7DA 2J6XA 4RR4A 3F03K 3NZ1A 1T99A 5CZJA 1F6KA 4MVAA 3T7VA 2ZTKA 2VXNA 3DI0A 5HQEA 2CWNA 4O1CA 1K7XA 2B7OA 2XN0A 3MO7A 4WXYA 3LX9A 3IRDA 4YCOA 3DGRA 1KTBA 3NEVA 1GT8A 4W9TA 4LRSA 3BLFA 3QJAA 5I3KA 1G7UA 3IGUA 5FEPA 1B3OA 2F7FA 3U8GA 3TW6A 3TX9A 3TJLA 2G96A 4DO4A 1P0KA 2GQ9A 4ORMA 3CM4A 3NO5A 3O1NA 1KM0A 1J5TA 3GR8A 2AGKA 5J5DA 4IMEA 1SSGA 1OG0A 4TR9A 1FBAA 2VEPA 4HPJA 1OYCA 3T4CA 4UTTC 4O19A 4KKXA 1WAUA 2Y7FA 4GFSA 1AG1O 4HNTA 1KBIA 4BF9A 3HOJA 5AHMA 3HO8A 5HULA 1EP2A 1EX5A 3CWOX 3DAQA 3STEA 3NPVA 3JRKA 4CQ8A 1DV7A 3INPA 2R91A 5G2WA 1FXQA 5A8GA 5G1TA 5C54A 3L2IA 2D73A 2V81A 1HO1A 1GVQA 1KBJA 5C55A 1R2TA 5L9FA 4JS3A 3Q2DA 2H3DA 4LVFA 3M5YA 4I7WA 1DQXA 1QPNA 3WJXA 4ZMGA 1LBFA 4UTWA 3IIVA 4O54A 3HG2A 1LROA 3DU0A 1H60A 3MHFA 2QCHA 3M5VA 1OFEA 1LBMA 2A7RA 1EUAA 5DN1A 3DBPA 2TRSA 5IM51 4UMBA 1BEUA 4JTKA 2NXHA 3ATYA 1S5VA 3EEGA 1XFBA 3NL6A 2Q3RA 2CFFA 1ZHAA 4E2DA 1QDSA 5G4EA 1YPFA 3H54A 3UXDA 2ZA2A 3B06A 4A29A 2E6YA 3N9SA 4UCGA 1FWWA 3TMQA 3W2MA 1KFJA 4WXZA 1S3HA 3GXTA 2I14A 3ZWSA 1F6PA 3W88A 3DKJA 2NV1A 5AHEA 3RLVA 1WBJA 1TPFA 2YZRA 1UB3A 4D2JA 1K8YA 4FXRA 3G1DA 1RR2A 3PG9A 2NV2A 4M7TA 2DJXA 2ZZ6A 2FJKA 1VPXA 2GJLA 4LC8A 3NG3A 2W6RA 1HG3A 1FX6A 1TTIA 2P10A 4K6AA 5CGQA 3SW6A 3G1AA 3UPBA 4YLWA 1FWTA 2DZTA 2Y85A 3M6YA 1RVGA 1QO2A 2QJIA 4LOCA 1U5JA 4JYFA 3E02A 1VCVA 5FF2A 1PHQA 2Y88A 3GKFA 3N14A 2A2IA 2Y89A 2BLEA 2WOQA 3PUOA 1XC4A 1LTDA 1OJXA 1W0MA 5D37A 2B7QA 3LDVA 4K38A 5K4ZA 4AWUA 3MJYA 3LERA 3TNOA 4AXKA 1VLIA 3TCEA 1KFBA 1TPDA 2E09A 2WSRA 2YSWA 4LUIA 1GOXA 3DFPA 1WQ5A 4FX7A 1P0NA 4JTIA 5C6MA 4MIMA 2ZCGA 3HIJA 2CZEA 3TU9A 5BMXA 1WOBA 5CPNA 4GBUA 1IF2A 3M41A 1W56A 3KVKA 3TW7A 3W3OA 3S0CA 4JDBA 3W1AA 4Q33A 2E68A 2X16A 1R46A 3UWWA 4WY0B 5TIMA 1OYBA 3W1LA 4LS0A 5CPMA 3W6YA 1ICQA 1YTEA 5LHEA 3SECA 4MKNA 4ADTA 1EP1A 4IMDA 3WJSA 4EVZA 3GIYA 3VFLA 4MJMA 1H1YA 4O50A 4DELA 3NQGA 3W83A 1SSDA 1GYNA 1OF6A 4O16A 1TTJA 4R7JA 3W1XA 5LZLA 2ZYFA 3KAOA 3C0JA 5AYXA 3GXNA 1B57A 5CG7A 1FWSA 5HUPA 1DL3A 1NEYA 1EB3A 1LDCA 4ZL1A 1LOQA 5HWMA 3G0XA 1OFAA 1OK6A 1SO5A 4Y90A 1YYAA 3NAVA 4N9EA 5LNVA 3DI1A 3FYPA 5TQLA 4UTJA 1Y0EA 3UZ5A 4GNJA 4K8HA 1Q6RA 1KFCA 2QKFA 3TK7A 4BI5A 1P4CA 1SFJA 2YFNA 3L0NA 3VI2A 3GDLA 3HG4A 1KA9F 4XTDA 5FF0A 2PURA 4IPJA 2ZRZA 3CB8A 2C13A 1DHPA 3QMRA 2CLHA 4NX0A 4LT9A 4DEFA 2CLIA 3FS2A 4H3DA 3B04A 5LGZA 1F05A 1X7FA 4TU1A 1O60A 3BW3A 4ORIA 2Y61A 5I3GA 4GUHA 2H8ZA 2J27A 1WBHA 3W72A 3L9CA 2ABBA 3DZ1A 4S2BA 1K7EA 3UYCA 3FIGA 3DKLA 2VEMA 5I3HA 4UTUA 1ONRA 3LHYA 2Q8ZA 4KFOA 1TRDA 1JCNA 2A1YA 3RNDA 1D3GA 3P61A 1VH7A 1A50A 3S42A 2DZVA 1NF7A 2NXGA 3LB0A 1W3NA 4E38A 4O15A 1IGSA 4UTWC 2YW4A 4JGDA 1I2NA 3JR2A 3BG3A 4O11A 5F1VA 1AW1A 3QQ0A 1B9BA 1FY6A 1TPVA 3SGUA 1I2RA 2RHGA 4NXSA 5CZSA 3QEZA 1JCJA 2XN2A 3L21A 3LXBA 1LOLA 3C56A 3W1MA 5FEXA 3TFCA 3LHVA 4HIBA 4UXDA 1JR1A 3H53A 5D02A 3VE9A 2BWGA 3BGJA 2E6DA 2V5BA 2ZRUA 4O8RA 5K4XA 2CZ5A 4QIUA 4N2YA 4UTTA 3PSVA 4CCDA 1LLZA 4MLRA 3QYQA 3TXZA 1UCWA 1PVNA 1YXYA 3PSWA 4KWWA 4M19A 4Q4KA 3CLMA 1OX6A 1TV7A 2OT1A 4LW7A 2GVJA 4NJHA 2V2DA 4E2BA 4GXMA 3RF9A 4OV4A 4GRSA 2VFIA 3W22A 1BWLA 3W84A 3QFEA 1DORA 1W54A 4I7UA 5I3JA 2ATSA 4PH6A 2Z6IA 1H7NA 4S2CA 2WO5A 2ZZ3A 5AYZA 2Y63A 2AQWA 6TIMA 4NX5A 3QQ1A 1C9DA 4GUJA 1HTIA 5E0KA 3W7NA 1ALDA 2ZFAA 2HS6A 1FWNA 1ME7A 4NVTA 1IXPA 1M5WA 1A5AA 3P7YA 1G4SA 2QCDA 3LXCA 1ZAHA 2VFEA 3EX2A 2QF7A 3FYOA 4DBDA 4O4VA 3W7LA 1YADA 3OHIA 4CQ9A 5A5WA 1KFKA 1N55A 1VHNA 3L5MA 5AHFA 1JRBA 3LLFA 4IQLA 1FCVA 4KFNA 4IXHA 4BFAA 4S1FA 5G4WA 3W2KA 3P84A 5D09A 4HKPA 2FB3A 3NL3A 4QAIA 1OFOA 1P1XA 4JY8A 5C5YA 3LBMA 3W07A 4K39A 1MEHA 2A21A 4UTMA 3N3MA 1N7KA 4OU1A 4FO4A 1ZENA 4DO6A 5BOOA 3NPXA 3G3DA 2JKAA 5D30A 3BLIA 3KVMA 3DH7A 1D3HA 3BPWA 3MUXA 1F76A 3NVTA 4UNLA 3MMTA 4Y6GA 2B7PA 3W7DA 3L65A 1Q3NA 1OK4A 2Y62A 1VYPX 5ABTA 3NZRA 2ZA1A 1QPOA 3L5LA 1GG1A 2WNZA 5F2IA 5CPLA 4AHQA 1H7XA 4RLIA 1LRTA 1SU5A 3EWYA 3HGRA 4AHOA 3GNDA 4DO5A 4Y9AA 3NQFA 3NL5A 3ABRA 1GQNA 1VCFA 3QPYA 3DFTA 4UNKA 1GZGA 4Q32A 1THFD 4BI7A 2CZDA 5K3VA 2C18A 1B4KA 2BX7A 3CT7A 3KFTA 1RPXA 2C14A 2TPSA 5LGXA 2A7PA 4CCEA 2DZUA 2I1OA 3MI6A 3GAYA 3N2XA 1T8XA 2QUTA 3LCFA 4O1AA 5EPDA 1W5OA 1KM3A 2PE4A 4N4QA 1F73A 1LP6A 1IXQA 4ZQNA 1JJKA 4MY8A 2V9DA 4AH7A 3W7CA 3QW3A 4Z1BA 1LOSA 3EWUA 3P5YA 2J88A 3IIPA 2GOUA 5F1UA 4TO8A 1EA0A 3TMLA 1EUNA 3HG5A 4A22A 3DFSA 3V1PA 1J4EA 1V5XA 2I9EA 2NX9A 4GUIA 1JCMP 1NVMA 1TPC1 4MPQA 5F4WA 1XXXA 3L0GA 3N9RA 4OGZA 4LWWA 1Z48A 1ZALA 4KFPA 4BK9A 3UPWA 1DVJA 2DZXA 4WJEA 4LRTA 3EKZA 2A7NA 4O17A 4LS2A 2VC6A 3TSDA 2BZNA 1K8XA 6ALDA 3C52A 2PRLA 4JTEA 4K7YA 1JCLA 3TQ0A 3MHGA 1RD5A 2FDSA 3C2RA 5G1YA 3E12A 5FI8A 5I3FA 3B03A 5CKSA 1JRCA 1XBYA 4TMBA 3A5FA 4R53A 1FUYA 2R8WA 1TTQA 5D33A 5F2MA 2NXIA 3NL2A 4K36A 3S8HA 3NYZA 1BWKA 1MXSA 2QDHA 4MYAA 3LI1A 3NDOA 3B4UA 2J24A 3G24A 3QPZA 5D2YA 1IIHA 1JCYA 4FNRA 1XI3A 5KZMA 2QUVA 2GJNA 4O13A 1TO3A 1VR6A 1S5TA 1VZWA 2A4AA 4Z0JA 3GVGA 4JX6A 1KV5A 3LRMA 5AB3A 1H7PA 4UTLA 4UFMA 3QMSA 5LHFA 4A2SA 2FLIA 2E1DA 3GKAA 2OX1A 3GK0A 2C0AA 5EMUA 3NNTA 3S1VA 2G95A 4BI6A 1UASA 3G8RA 1MEWA 3U2OA 2DORA 4AEOA 4PA8A 2VFGA 2QUUA 2UV8G 3NQ8A 4L4MA 5BMWA 2B0MA 1JUBA 2WKJA 2ZDRA 2HSAA 5K7JA 3A23A 4NJJA 1I8JA 1SFLA 3C3NA 5E1QA 1WYIA 4O0KA 2YR1A 2QCDB 2EKCA 1W5MA 3MHUA 2E77A 4YCPA 3STCA 3WK1A 1EPXA 2OCZA 1UUMA 2GVGA 3DHFA 2CU0A 3LRKA 2QCNA 4FNTA 2Q8LA 1FDJA 3QZEA 4JIQA 3P8IA 3TDFA 4AMAA 1TSIA 3MYPA 3BO9A 3DFQA 3B8DA 3AO0A 1TMHA 4O18A 2YFOA 3QF0A 2Z6JA 3TIMA 3GX9A 3P8JA 4NNCA 1F5ZA 2DP3A 3KHJA 5H2ZA 3R12A 1ZNNA 1G6CA 1GVRA 4OV9A 2ZZ2A 4N4PA 3BLEA 3CQ0A 4Y8FA 3LGEA 5TBOA 3UZJA 1ADOA 4CNPA 5LKYA 2O7SA 1E51A 1WV2A 4K7VA 2JGYA 3G1VA 4U28A 5HUOA 2TMDA 4JX4A 2V2CA 2HS8A 4JEQA 2VFFA 1VYRA 3PAJA 4NJKA 4AAJA 2YCEA 3W1QA 4WY0F 1RQBA 4A3UA 2YXGA 3E9AA 2C19A 1R30A 1M7OA 1TV8A 3SSJA 1CI1A 2BSLA 1LBLA 3HBLA 3LHUA 1X1OA 4C1LA 1U83A 1VLWA 4CLMA 1UUOA 3LV5A 1X1ZA 3PF3A 3FKKA 4GUFA 2JBMA 4MZYA 4R34A 4HT3A 1AL7A 3QW4B 1W5NA 3OEXA 1M7PA 3W23A 3RMJA 3HB9A 3C61A 1W31A 3PR2A 3S9YA 4C1KA 3C8FA 5G5IA 5T26A 2CW6A 1W1ZA 5CZTA 1FQ0A 4XBSA 1XDLA 4HNUA 3LTSA 2FPVA 2Y7EA 3GXPA 3S6DA 2PRHA 1H61A 3W70A 2HTMA 4JN6A 1WOAA 1O5KA 4MOZA 4LS1A 5BRBA 3NGJA 3W1RA 1AMKA 3ZFHA 4AF0B 1KM4A 3RU6A 4PC8A 4ZVJA 3MP3A 1FWRA 4MZ8A 3EXSA 2Z2UA 2WPBA 1G67A 1XDMA 2OT0A 1DOSA 5F4XA 3I7QA 2V5LA 3A5VA 3NA8A 1XM3A 3G1SA 2C3ZA 2ATMA 1TV5A 5D2XA 3UNDA 1CX9A 1TJRA 2VENA 4UR7A 3P81A 5KINA 2FB2A 4H4IA 1XUUA 3LCIA 3B0VC 1PHWA 4JTTA 4EF8A 2QEZA 4M7SA 3W2UA 3N19B 2H3BA 3R8RA 4ZQPA 1SW7A 5BNKA 1O94A 3SGZA 3LHZA 1H50A 2JKEA 4RXGA 3E0IA 1KTNA 1QO5A 5F4SA 4OBTA 3KVJA 3PM6A 4WOZA 3LLDA 4HNVA 2VKZG 3DFNA 1XL9A 1RQHA 2JGQA 3T44A 1VJIA 3W85A 3F4NA 1HL2A 2Y6ZA 3CIXA 3NM1A 1IIGA 3MI2A 4Z0SA 4AB4A 1PV8A 1DJNA 2CLEA 1FCUA 3PUDA 3KRUA 1YPIA 4L4LA 4Z1DA 1PL9A 2QDGA 1W3IA 4MY9A 4QNWA 2Q3OA 4P61A 3W87A 4UMAA 1TRIA 3IVUA 3P62A 3TH6A 3KRSA 3BGGA 1GTHA 3FFSA 3ATZA 1IXNA 3LCLA 1TPUA 3PC0A 1XBZA 3UQNA 3L67A 3W1NA 3G1YA 3SY5A 3UY8A 4UR8A 3ABOA 2GPTA 5D04C 1A5BA 2NX1A 1LRQA 3TA6A 3W7HA 2ZTJA 1XCFA 3BW4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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