1QR7A

Crystal structure of phenylalanine-regulated 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from escherichia coli complexed with pb2+ and pep
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
343
structure length
338
Chain Sequence
LRIKEIKELLPPVALLEKFPATENAANTVAHARKAIHKILKGNDDRLLVVIGPCSIHDPVAAKEYATRLLALREELKDELEIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHMDNSFQINDGLRIARKLLLDINDSGLPAAGEFLDMITPQYLADLMSWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGTIKVAIDAINAAGAPHCFLSVTKWGHSAIVNTSGNGDCHIILRGGKEPNYSAKHVAEVKEGLNKAGLPAQVMIDFSHANSSKQFKKQMDVCADVCQQIAGGEKAIIGVMVESHLVEGNQSLLAYGKSITDACIGWEDTDALLRQLANAVKARRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords PHENYLALANINE-REGULATED 3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE-7-PH
publication title Crystal structure of phenylalanine-regulated 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 338
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 1999-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qr7A00
4RZ4A 1IIGA 4JNMA 5D05A 2BWGA 4DPQA 3LHVA 4NZFA 2VFEA 3IGXA 5TIMA 3FIGA 2YZRA 3I6RA 2VEPA 3LBMA 4NT0A 5AB3A 4O11A 3NVTA 4A2RA 4FNTA 1EUNA 1KV8A 4UTWA 1Z41A 3THQA 2ZZ4A 2H8XA 3TH6A 5CKSA 4CCDA 4MUZA 3DI0A 2TYSA 3KOFA 2VFHA 3SGUA 3DFQA 3BLEA 4M7SA 4RZ5A 4UTLA 3ZWSA 1LBFA 1GVOA 4FX8A 4FO4A 3LI0A 5I3JA 4ZQOA 3DFTA 1XKYA 2VFGA 4JYDA 3CEPA 2X1SA 1IXPA 4RZ6A 3B0VC 2ZRZA 2V30A 4MY8A 1KFCA 4I7UA 1W31A 1KTNA 5U7SA 1ZFJA 2GJLA 1ZALA 1ZAIA 2YW3A 4O0ZA 2W6RA 5FF7A 4TIMA 1IXNA 3LV5A 4DQWA 4PFMA 1JVNA 3BLFA 1BWLA 3O63A 3PS7A 1EPXA 3QSTA 1TCDA 1C9DA 1WBJA 3UWQA 2Y62A 1KM6A 2X2GA 3N3MA 5LHEA 4ZQNA 4LTSA 3GYEA 3DHDA 4Y9AA 1B4EA 3WK0A 3M5YA 3MI3A 1G7UA 1ZENA 2QEZA 1VYPX 3O06A 1TMHA 1TIMA 4CQAA 5CZ0A 2A21A 4TMBA 5D37A 1A5CA 2ZRWA 3LI1A 1C29A 3N14A 1I2OA 2D73A 3TAKA 1YXDA 4Q4KA 1N55A 3FA5A 3LCWA 1NSJA 3U2OA 3HB9A 3O6CA 1WV2A 2YXGA 3P84A 4DF1A 1KFJA 4QITA 3W23A 4ZZ9A 2A6NA 3EX4A 1QR7A 3GDRA 4O1DA 1AL7A 1YDNA 2E09A 1KFBA 4LS1A 3W7CA 1GYNA 5D09A 4W9TA 3W7HA 1JCXA 1TRDA 3VI2A 4PTNA 2GQ9A 3S6DA 1KA9F 3UNDA 2WPBA 1OYCA 2FQIA 1H1ZA 2G5WA 3PUEA 2ZRYA 3NQ6A 3HG2A 4N02A 4JDBA 4N2YA 3A24A 2G96A 4O13A 4WX2A 1AMKA 5CSSA 3TROA 3QSRA 1GWJA 3IV3A 3WJXA 1JCYA 4JTIA 4JTSA 1KFLA 2WNQA 4O10A 5CZSA 2F84A 2C0AA 4L4LA 1F74A 4H6KA 4ADUA 2JBMA 4IUOA 3E49A 2CFFA 1ZHAA 3TC7A 4XUGA 3HO8A 1A53A 3KFTA 3OEXA 3P80A 1OFPA 4UUIA 4GFSA 3HPSA 4OV4A 4BI7A 4IX2A 1TRIA 3HG4A 2BZNA 3KRZA 4HNVA 5G1TA 3KAOA 1VPXA 4HNUA 4ZQMA 2J9ZA 2Q8ZA 3EXTA 3STEA 2RDTA 5FEXA 5K4ZA 1PS9A 1UJPA 3N9SA 4E0CA 4POCA 3LHZA 4JN6A 2A4AA 1UUOA 3MI6A 4QIUA 2E5BA 3WJSA 3W1LA 1NVMA 3O6DA 4UTWC 4WXYA 3LLFA 1TPC1 4O12A 3W73A 4IXHA 4MJZA 4NUWA 5EPDA 2YYTA 2RDWA 2ZRUA 4LY8A 2GVGA 3KRUA 2DP3A 3U8GA 5L9FA 1VYRA 2JKAA 3NQFA 5C2XA 3JR2A 2A85A 1Y0EA 2VEMA 2E5DA 2P10A 3LRMA 1LLWA 2VFFA 5I3GA 1G4EA 3W7RA 2FDSA 2C13A 1H51A 3N2MA 3HOJA 4BR1A 1Z42A 2E77A 5J5DA 1SO5A 4M6PA 5HWMA 2OX1A 1IF2A 3C61A 4MIMA 5HMSA 1SPQA 2FB3A 1VRDA 1SQ7A 1XBYA 3L67A 5C54A 2YR1A 5LGZA 4U28A 3DU0A 3W9ZA 2Y7DA 4R7JA 5LZLA 1WX0A 4UNLA 1KBJA 1KM5A 2Y7GA 3QYQA 3LOTA 4K38A 6ALDA 1TSIA 3W7EA 1CW2A 3HPXA 4O53A 2DU2A 5FI8A 4FXRA 2CLOA 3W2NA 3RFAA 3HPZA 5A8GA 3S1XA 4Z1AA 5BMXA 3W86A 2A0NA 3C56A 3W7NA 1O4UA 4CQ8A 3EWXA 1MXSA 2B7PA 2C6QA 3UQNA 1KW1A 4AEOA 3HG3A 2V2HA 3QMTA 1LM1A 5G5IA 1TPDA 2BXVA 1YTEA 2CLFA 4NNBA 3PC0A 3HIJA 3O16A 3NQ2A 1KFKA 4GBUA 3HGSA 3TCEA 1KTCA 3NOEA 3MBFA 5AFDA 2V9DA 3M7WA 4O15A 5AC8A 1AG1O 4AWTA 2ISSA 5DLCA 2LLEA 4IMGA 3BVJA 1FXPA 3G1AA 3YPIA 5EMUA 2YPIA 3EWBX 3GDTA 4QSHA 4AAJA 3TE9A 3N19B 4ALDA 2BTMA 4LS0A 3P8JA 2C15A 4GJ1A 4GNJA 2AAMA 1J4EA 4C1KA 3OG3A 2DZSA 3I7QA 3M5VA 4HPJA 2ZBTA 2NX3A 3DAQA 5BNKA 1Q6LA 1W5PA 2FB2A 2NXIA 2X1TA 3CC1A 5AYYA 4NJIA 1FWNA 1H7NA 4JX6A 1J2WA 1OFOA 1DKWA 1B4KA 5EL1A 4AF0A 2ZCGA 3LB0A 4BWLA 1C8VA 3PM6A 5AHFA 3W2KA 1KM3A 1XBZA 4O16A 1TO3A 2TRSA 3W1UA 3SR7A 1G4TA 4LWWA 5KZMA 4NX0A 2GVLA 3HQ1A 4YMZA 4WD0A 5CPNA 3LV6A 3EWYA 1FDZA 2VEIA 1EEPA 3B0UX 2V2CA 1YDOA 1OX5A 3W7QA 3TQ0A 3W2LA 1ICQA 1JRCA 1OK6A 3ZFHA 5HULA 2H3BA 4PCFA 1B3OA 4QISA 5CZJA 3RLUA 1R2TA 1TTIA 5C6MA 1JCMP 1S3HA 3CIXA 4UTTA 2Y7EA 1H62A 4N4PA 2Y70A 1IIHA 4RLIA 1UASA 2NXHA 3W88A 4FNQA 4JTGA 3ATYA 4LRSA 1GVRA 1Q6OA 4UFHA 2XN1A 2QUTA 3L66A 3EKZA 1KBIA 4WOZA 1VHNA 2CLKA 3IIZA 4AHOA 1XFBA 2VENA 3A23A 5U4NA 1SZEA 2GVJA 3KRSA 1KM2A 3GAYA 3EX6A 5HQEA 3C2VA 5HNRA 1SO6A 1I2PA 3L5AA 3GNDA 5D2WA 3NPXA 1ZJIA 1LBLA 4OWGA 2R8WA 1ZAJA 2JGYA 2NUYA 5IM51 4ZL1A 1O5KA 5DELA 3LCHA 1R46A 5KZEA 2B7QA 1L2UA 4JR5A 2ISVA 1DJNA 1GVQA 5BRBA 1LRQA 1H63A 2JKEA 3TFXA 3W84A 1O94A 5D2TA 3OVPA 1TQJA 5D2VA 2RH9A 4PL2A 3P74A 1H1YA 2HS6A 1UUMA 1M7PA 4YL2A 3M0ZA 4O17A 5F1VA 2C3ZA 1FWWA 5IBXA 3DZ1A 1LRNA 3G0UA 4A3UA 3G3DA 3W76A 1EP3A 3QQ1A 2QUVA 3NQEA 3C2OA 4XTIA 5F2LA 4N9BA 4DO4A 1S5VA 3B0PA 1SO4A 1XDLA 4A2SA 4NXKA 4DEFA 4ZQRA 4M19A 2E6DA 5E1QA 2I9EA 1Q6RA 2QCFA 1E51A 3C2RA 4GUFA 3E0IA 4LNYA 3TQVA 1UBSA 2NX1A 1WDWA 1RVGA 4XKYB 3WJYA 1J5TA 5K9XA 3W7JA 5LNUA 4S1FA 3BGJA 5AYXA 3LTYA 3T40A 5AC6A 2ATSA 3OA3A 1LOQA 2ZA1A 1LTDA 3AJXA 3BW4A 2J27A 4JY9A 1TPUA 4WOQA 3DKLA 2V8ZA 2WSRA 3C6CA 1SFJA 5HUOA 4AWSA 3CHVA 2Z2UA 4KFPA 1BWKA 2JKPA 3IIXA 1LROA 1EA0A 1SUXA 1LDCA 3DFSA 3GIYA 2RDUA 1W5NA 4A21A 4A29A 3NZRA 3FFSA 3LBCA 1WOBA 3GB6A 3GAKA 3FKKA 2WQPA 4FXSA 1SW0A 4S2BA 4Y96A 1W5MA 3FEMA 3DKJA 1EWDA 3QFEA 3TFCA 3W2JA 1A50A 1JUBA 1Q6QA 3NGJA 1GVFA 1VHCA 5F4WA 3CQ0A 3C52A 4FNUA 3CM4A 1O5XA 1TPVA 4UFKA 3SSJA 1JR1A 4MZ1A 4MOZA 1A5SA 3CWNA 2YYUA 1YXYA 4BWLC 1VYSX 3MJYA 3MWAA 1FUYA 1XCFA 3W75A 3STCA 1QOPA 5D2XA 1FCUA 1RPXA 2CZEA 4YLWA 3NA8A 5D2YA 3PSVA 4FNRA 1H7OA 2QKFA 1PCWA 4N6FA 3W2MA 3BLIA 5I3FA 1YTDA 3IVUA 5DCEA 3L21A 1K8YA 1OYBA 3A21A 4EOUA 1PHWA 2HMCA 4LS2A 5D02A 2X16A 1QPNA 2OT1A 3M9YA 1SSDA 1MEHA 5G2IA 3SY5A 3PBVA 4QJ1A 4UTTC 1BKSA 4JGDA 5AYZA 3LM7A 2WV8A 3W1PA 2ZA3A 4NNAA 4UCGA 2Y7FA 4FB7A 3L2IA 3O15A 1AW5A 2B4GA 1JJKA 3LTSA 3ZR4A 5F4XA 1VGAA 3LLDA 5D33A 1WYIA 5LNWA 2A7PA 1GJPA 1FY6A 2I1OA 4R53A 2B7NA 3GKFA 4WY0A 3N9RA 4L4MA 3IVTA 2PURA 1XL9A 2YFOA 5SWUA 1I8JA 1TPB1 4ML9A 4PODA 4IJBA 2CLLA 1G4SA 2VOMA 2G95A 4XBSA 1F05A 1FX6A 3GKAA 4MFDA 7TIMA 1QO5A 4FNPA 4LRTA 3W7OA 4LV9A 2NUXA 3DBPA 4OU1A 3A5FA 3LHUA 1HTIA 3ABSA 1D3GA 3EKLA 1ME8A 1SZGA 1JUKA 3NQCA 3ABRA 3Q58A 1GTEA 2ATMA 3NM1A 3HGRA 4DO5A 3S1VA 1ZY9A 3TSDA 1ML1A 1XDMA 2QCHA 4ORIA 5IBXC 3AO0A 2WJZA 1R47A 3G3MA 4KKXA 5H2ZA 2ZTJA 5FF4A 3M5XA 2KZHA 1R2SA 3L9CA 2VKZG 1D9EA 2ABBA 5EYWA 4NJHA 3IVSA 3OVRA 3F4WA 3WJWA 1TJPA 3W72A 4LV4A 3THAA 1VLIA 5CSRA 5DY2A 4JYEA 4NXSA 1H7WA 3G1FA 3HF3A 2GQAA 2WKJA 4KFOA 1V7YA 2ALDA 3OIXA 1P0KA 3LDVA 4DELA 1WQ5A 2XFWA 3FJLA 5CPMA 1AW1A 4LVGA 1SZNA 1LORA 1P5BA 3C8FA 2E6FA 1H7PA 1XBXA 4UTMA 1XM3A 1M6JA 4D2JA 1QPOA 1QO2A 1TJRA 1H5YA 1OHLA 4IGHA 3H53A 3BG5A 1NF7A 4MLJA 2OT0A 4O1CA 3MUXA 3TSBA 1KM1A 2TMDA 2VC6A 4OV9A 3G0XA 4K37A 2GPTA 2Q3OA 2ZRXA 4IOTA 4NVTA 4NJJA 4ADTA 3TK7A 1GVSA 1QWGA 4ICNA 3QJAA 3WK3A 3QPZA 1G6CA 1M7OA 3RF9A 5K9DA 3EXSA 1A5AA 1SW3A 1HL2A 4H3DA 2YW4A 3O1NA 2ZZ2A 1VR6A 3DENA 2QCGA 5ABTA 5AOUA 1G69A 2FIQA 1QPQA 3LERA 1YYAA 5HJLA 5MHBA 1ONRA 3CIWA 1RQBA 2QCEA 3NYZA 4K6AA 4ZVJA 3QW3A 4JTUA 5E0KA 5BOOA 5AHLA 4O14A 1Z44A 1F2JA 5HR7A 3RK8A 3NR0A 4K8HA 2CZDA 3QMRA 3UZJA 2J24A 1IXQA 4UXDA 3G1DA 5EBUA 4XBKA 1LBMA 4CLMA 2QCDA 3KXQA 2QJGA 3R13A 2VXNA 1JCNA 1EWEA 1XUUA 1DJQA 3MYOA 4WY0B 1TV5A 3NPUA 1K3UA 4CQ9A 4NU7A 1PIIA 1JUEA 4JXCA 3DH7A 4TR9A 1OJXA 2NX9A 4CNNA 1LP6A 2H6RA 3W1QA 2P0OA 4A22A 5DBTA 1YPIA 3L0KA 3I7SA 4DBEA 4DXVA 3W71A 4HN4A 1TTJA 4IQLA 2CLEA 2H90A 4LC8A 3L0GA 3G1VA 3STFA 1D3HA 1GYLA 3OHIA 1GEQA 3QZEA 5LHFA 2DJXA 2QJIA 4KWVA 2C16A 1QNVA 3PUOA 1X7FA 4IXXA 5AHIA 3GR7A 3NQ8A 3IEBA 2JK2A 1OG0A 1F76A 4HSNA 3W1AA 4DF0A 3R2GA 3EWUA 4YXGA 3I65A 5F1UA 3W74A 2X1RA 3W1XA 4DO6A 3CT7A 3UWWA 4NJKA 4JIPA 4QQ3A 4EF9A 4HNNA 1YPFA 3W6YA 2J9XA 3USBA 5E93A 4FEZA 4JTHA 3ANYA 3L0NA 3UPWA 2HS8A 1GT8A 2R94A 3TXZA 4CNOA 3MP5A 2VELA 5K2ZA 4P61A 1YDVA 3HBLA 3PAJA 5EA9A 3DFNA 4E38A 1M5WA 3UYCA 1K02A 1VCGA 5DCBA 4MKNA 3F4NA 2A7NA 4B5NA 3QM3A 2EKCA 3W7MA 4HNTA 3B04A 3S0CA 3C2EA 4YCPA 2Y85A 3IGSA 4XKYA 3T44A 2V82A 4HT3A 3VNDA 1ADOA 5AHEA 5AHMA 3BW2A 2NV2A 3E9AA 1RV8A 3WJZA 2J6XA 1WA3A 3SW6A 4O4WA 4EVZA 5C5YA 1B9BA 2O7QA 2QDHA 1TTPA 4CCEA 4BF9A 3W70A 1LCOA 2DJLA 1YLVA 5K7JA 3W1RA 4JTFA 3K30A 4K36A 5CZTA 2WNNA 1RQEA 4NQ1A 3TR2A 2VFIA 1LLZA 1TPWA 1GPWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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