1QUTA

The soluble lytic transglycosylase slt35 from escherichia coli in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
publication title Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 108
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1qutA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qutA02
4N1CC 2BQMA 4H9FA 1UIEA 1XFPL 4J1BA 4R6CA 2BPUA 4M6DA 4GCEA 4C5FA 1J1XY 1A2YC 1LZ6A 1JJ0A 3LZTA 3WVXA 1DXJA 4MCKA 5ILFA 4I8SA 5ILCA 4ZFPA 5APEA 1CNSA 2F4GA 4GN3A 4UWVA 1SQ2L 3ZEKA 1GFUA 2CWIA 5I4XA 1LSPA 4N9RA 3T36A 3J4GA 5HLLA 1HMLA 1VEDA 1KIPC 2D4JA 2YBNA 4B49A 3RU5A 2F4AA 3AZ5A 3RW8A 4L41A 1GB8A 1LSDA 1BB6A 1FLUA 133LA 1GAZA 1HFZA 1RI8B 3M3UA 4G4BA 4XJIA 5KXSA 3T6UA 2BAAA 3IWRA 4BADA 5L3HA 1LYSA 2EKSC 3N9EA 1GXXA 1JSEA 3B72A 1CJ6A 4TX7A 1N4FA 1GDWA 4LT0A 2B5ZA 1WQNA 1QUTA 1QSAA 1C08C 2ZILA 5DLAA 2BQHA 2BQEA 1LHMA 2HTXA 3A3RX 5D5CA 4II8A 4H9BA 1GF6A 4ETDA 3KAMA 1B5VA 2HU1A 5J7CA 1JTPL 2YBJA 1OUDA 1F10A 4NGOA 5LVGA 1QTKA 4TWSA 1F6SA 4ET8A 1BWJA 1VATA 2DQEY 1JTOL 3WH1A 2FBBA 1HSXA 3M18B 1B0DA 1GB7A 3LHMA 2BLXA 1NWGA 2BQGA 2LZTA 1TEWA 2BQKA 3CT0A 4GCFA 4RW2A 4CHXA 5KXTA 2BQFA 5A3ZA 1JHLA 1HEMA 2G4PA 1J1PY 1GB9A 4LGKA 5DM9A 4H1PA 153LA 3FE0A 3LZ2A 1LJKA 2F2NA 1BB4A 1GB6A 4G4HA 2Z19A 1LSMA 4WMGA 5I53A 3WPLA 1OUEA 3ZVQB 4ETCA 5KXLA 2DQGY 1GFAA 2DQAA 3TXKA 3SP3A 1LZ8A 2HEBA 4HJVA 3AYQA 4NGZA 5C6JA 1IC4Y 4QEQA 5LYMA 1XEKA 3TXJA 4WM4A 5LA8A 1JJ1A 3E3DA 1D9UA 2HEAA 1LSEA 4Z46A 1LZSA 2BQDA 4H8ZA 1UIAA 4DD1A 4IATA 4LYZA 4HV2A 5B05A 5I5QA 4TUNA 1GAYA 1LHHA 1EQ5A 5F14A 2W1LA 4H94A 1B5WA 1JWRA 4WL7A 2MEAA 3BKVA 3CT1A 4HTNA 2DQCY 4ANRA 5LVKA 3WW6A 4DT3A 5APDA 1QUSA 4CGEA 1GFHA 1GF4A 1VFBC 1DKKA 1YL0X 2YBMA 1PZYA 4NWHA 4OWEA 5FDJA 4LT3A 4LYCA 4RW1A 4NEBA 4XJBA 1FKVA 2BQOA 5T3FA 3A6CY 1A4VA 3AW7A 4WL6A 2XBSA 1BWIA 4N1EI 3N9CA 3RNXA 2DQHY 4NGWA 1GHLA 4WO9A 1B5XA 1YANA 3AB6A 1IWUA 1LSNA 1LJ4A 3TMXA 4LYMA 3AZ7A 1LSAA 1LMQA 4U3XB 5KXPA 2ZYPA 1LSGA 1YKZX 2ZNXY 1H87A 3N9AA 3W6DA 5KKJA 1IWTA 4WM2A 1B7LA 1HMKA 5APCA 1KXXA 1ZMYL 3AGIA 1LJGA 2YVBA 1GFEA 5HNLA 5FEKA 1IP3A 1EQEA 4N5RA 2C8OA 1YAQA 4GLVA 4LT1A 1WQMA 4LYOA 2MEEA 2D4KA 4LZTA 4HPIA 5KJ9A 1QQYA 3QNGA 3WPKA 2DBTA 3CQLA 1H6MA 5F16A 4HSFA 1LMOA 1GB3A 5LINA 2H9KA 1QDRA 4B4JA 1YL1X 3IJUA 5LYZA 2BQAA 1UIDA 1LJ3A 3A6BY 154LA 4UWUA 4GCDA 2Z2FA 1AM7A 2FBDA 4BAFA 135LA 5IELA 4HV1A 2Q0MX 1IORA 1LJNA 4W94A 3A92A 2I25L 1ZVHL 2YBLA 4NWEA 1D6PA 2G4NA 2W1MA 4I0CA 1GPQC 1GE3A 2Z12A 1WQQA 1BVKC 1CJ7A 4KL7A 1GBWA 1REXA 1G7LC 2YBHA 4NHIA 2X0AA 4FDYA 3A90A 4GLAA 5HQ1A 1NQIA 4DDCA 4Z98A 1JJ3A 3TXFA 1FN5A 1GB5A 5LVJA 1WTMA 4H9CA 4H9HA 1IOSA 132LA 1UIGA 1HHLA 1WVUA 1YAMA 1TDYA 3LN2A 4PGJB 2I6ZA 4NGIA 5KXZA 3W6FA 4NGVA 3W6BA 1KIQC 2MEIA 3EMSA 5EBHA 5HNCA 5KXMA 1JKAA 4OW1A 3HBHA 1LJEA 1GFRA 4PRUA 1JPOA 5IHGA 2D6BA 1B5ZA 1G7HC 5DL9A 1YKXX 1ALCA 2BQNA 3P68A 4UWNA 9LYZA 1GE0A 1LCNA 1YROA 4XADA 4XJHA 1RE2A 4C3WA 1LSBA 1LTMA 1IO5A 3WUMA 4NG1A 4QDNA 5E4PA 3OJPA 1LZRA 1XSFA 1OUIA 3WU8A 1LZ1A 1GDXA 4FJRA 1KXWA 3WXUA 1GF7A 1IEEA 1IC5Y 5LA5A 1TCYA 5E9RA 1DI5A 4YEOA 4WM3A 1LZTA 4HP0A 4YENA 2FYCA 4G49A 1LHIA 1IX0A 1GF8A 5B06A 1IWYA 1GFTA 1YQVY 2HUBA 4PRQA 4HTKA 1O23A 4MSTA 4PPOA 1CJ9A 3GXKA 1BB3A 1REMA 4OWCA 4DD0A 1REZA 1GBSA 1GWDA 1NMMA 3LYZA 5IDDA 1NKHA 1NDMC 4XJFA 1XGRC 3CT5A 1GEVA 1LSYA 2ZQ3A 1IC7Y 1W6ZA 3QE8A 2EQLA 5FELA 4GCCA 1CJ8A 1JISA 3RZ4A 1C45A 4OOTA 1D6QA 2A7DA 5DN4A 3AZ6A 5KXRA 3A34A 1CKDA 1GE2A 4H8YA 1UBZA 3AGGG 1GXV2 1IOQA 4WO6A 6LYTA 1LZEA 4NHSA 2BQJA 1I1ZA 1IOCA 1DKJA 1LJJA 1GBYA 1B7OA 1MLCE 4QGZA 4ETBA 4H91A 1B7NA 2G4QA 1DI4A 1GBZA 1IR9A 1UICA 5HMVA 1IP7A 5C6LA 5DN5A 4AXTA 3ATNA 3J6KA 3A67Y 4HJYA 4H93A 1BGIA 4WLXA 1IR7A 5KY1A 4GCBA 1FDLY 5F9XA 1CKGA 1FLYA 2RSCA 2Z2EA 207LA 4H9IA 3WVYA 1XGPC 1LMPA 1ZV5L 2XBRA 3AZ4A 1V7TA 3BKHA 3TMVA 1UCOA 2Y8PA 4E3UA 4YM8A 5AMYA 2BQIA 4P2EA 4XJGA 3TXBA 1VDSA 3HFMY 3P64A 1CKFA 4MR1A 4TSCA 4X3BA 1B7MA 2H9JA 1LSZA 1UC0A 1LHLA 2C8PA 3B6LA 1KIRC 3W6CA 3WXTA 1B7QA 5B59A 4DDBA 1RCMA 1B5UA 3TXGA 1LZAA 4XN6A 1HELA 1NF5A 1RFPA 3W6AA 5FCPA 2NWDX 3TXDA 2HEEA 5D5FA 1CKCA 1C7PA 2A7FA 1GF3A 2VB1A 1DPWA 1LYOA 2WARA 3AW6A 2HU3A 1LZGA 3GXRA 4TTDA 1LPIA 1OUAA 1B7SA 1CKHA 1HERA 1MELL 1XEJA 2DKVA 4G4CA 4RDSA 1HEOA 1JITA 1T3PA 3RT5X 5KXKA 3D3DA 5LAGA 2BLYA 5F9UA 5K7OA 2ZQ4A 1JKDA 5KXXA 1IY4A 4HJZA 1GFGA 1LZ9A 4LT2A 4NHTA 1EQ4A 4YOPA 1GB2A 194LA 2ZNWY 4NGYA 5FSTA 3WU9A 1VDQA 2LHMA 1KXYA 4NY5A 5LIOA 1UACY 1GF5A 1WQPA 2LYOA 1UA6Y 1VAUA 2MEBA 4DDAA 3K3TA 1BVXA 2I26L 1FKQA 5I4WA 1FLQA 4LYTA 3G3BB 4N8ZA 8LYZA 2YSSC 4H92A 3FI7A 2H5ZA 2LYZA 4YF2A 5LXWA 1AT6A 5LYTA 1G7MC 5B1FA 4J1AA 3TXEA 1JIYA 1NBYC 4WOAA 1NDGC 1LKSA 1OQMA 1LHJA 2ZYCA 2YDGA 4B0DA 4QY9A 1GFKA 1WTNA 1XGTC 3A93A 4H8XA 4M4OA 4EMNA 1IP2A 2YBIA 3TXHA 2BQLA 3W3EA 1HFYA 1B9OA 2HEFA 1HFXA 1IWXA 7LYZA 4KT3A 4ETAA 1YAPA 1IP5A 1LSFA 4LYBA 3LYOA 5M1YA 2Z37A 4NSIA 1NHEA 4NSGA 1INUA 4LFPA 1QSWA 1YKYX 4BAPA 2GV0A 2XJWA 3IJVA 1B5YA 4XENA 1LZBA 1IOTA 1C46A 4G9SA 4DD7A 5KXNA 1JKBA 3A95A 1VDPA 3LYMA 4WLDA 134LA 2EPEA 1TBYA 3EBAB 2BQCA 1HSWA 1YAOA 1GFJA 1GD6A 1ZVYB 2FYDA 2N5ZA 4CFPA 1IY3A 208LA 1IP1A 1LJFA 1FBIX 1V7SA 2W1YA 4HTQA 1OP9B 4DD2A 2HECA 4WLYA 5B1GA 2ZWBA 1VDTA 1AZFA 1BB7A 4B1AA 4H90A 1F0WA 4ET9A 5KXWA 1G7JC 1LZ5A 3CSRA 2BQBA 4WG1A 1LMAA 3WMKA 1DQJC 1I20A 1IR8A 2MEDA 3WL2A 6LYZA 5II3A 4XJDA 1HC0A 1HEWA 3WULA 1E8LA 2D4IA 1IWZA 1GBXA 4WLTA 2MEHA 2AUBA 2LYMA 2CDSA 2DQIY 2F30A 2CGIA 4DYGA 5FHWA 1OUBA 1C10A 4ETEA 4WM6A 4D9ZA 1B7PA 1BWHA 2XTHA 1QIOA 3B0KA 3P66A 4ML7A 4W96A 4XYYA 1GFVA 4PHIA 3CB7A 3AGHA 1DZBX 1LMNA 3F6ZA 4J0LA 1GE4A 3HBEX 4WM1A 1GB0A 1LZYA 1LZNA 3HBDA 4GN5C 2CJLA 2Z18A 4AGAA 1Z55A 3ZVQA 1LOZA 1JSFA 2W1XA 4GN4A 1OUFA 1UIFA 3TMUA 1WQRA 2Z38A 1BHZA 3MGWA 1B2KA 5LAFA 1HEPA 1GF9A 3WUAA 4KPMA 2DQDY 3WUNA 2ZIKA 4YEMA 4NG8A 4DD3A 3D9AC 4NSJA 1BQLY 4WM5A 4BS7A 1J1OY 2D91A 1REYA 1P2CC 4OOOA 4DWXA 1LSCA 3A91A 5F81A 2ZIJA 4NGLA 4DD9A 3A3QA 4WG7A 4J7VA 3B0IA 4NHQA 5KXYA 4B4IA 2Z39A 1OUJA 1DPXA 5I54A 3CSQA 3WPJA 1LMCA 1I56A 1D0KA 1HENA 1IIZA 1LYYA 1UIBA 4A7DA 1XGQC 3B0OA 4OWBA 4PJ2C 1IVMA 3VWOA 3A94A 4DC4A 3AJNA 3OK0A 3TMWA 1IP6A 4NSHA 1YIKA 2MEFA 1JEFA 1EL1A 2HEDA 3G3AB 3QY4A 4NHPA 1NBZC 4IJ4A 1QTEA 2LZ2A 1XEIA 1LJHA 2EIZC 1JTTL 2MECA 1LZCA 3ATOA 3EO5A 3WYHA 1F6RA 1FLWA 1LHKA 2DQFC 2IFFY 3LYTA 4IASA 4LFXA 4OWHA 5LVIA 3ULRA 3WU7A 1B7RA 1JKCA 1WVVA 3W6EA 1XGUC 4OWAA 1IWVA 1LMTA 1OUCA 5HMJA 4Z41A 1SLYA 193LA 5LVHA 1HEQA 1UIHA 4NFVA 5A3EA 4CFOA 1OUGA 1GBOA 1LYZA 3A8ZA 1IP4A 1LZDA 4NGJA 3A96A 1LAAA 4NGKA 4CJ2A 2PC2A 2DQJY 4EOFA 1AKIA 1OUHA 4TSBA 5APFA 5KXOA 1T6VL 1HF4A 1AT5A 2MEGA 4RLNA 4ZIXA 5C6IA 4H9AA 5L3IA 1D0LA 1UUZC 1QDTA 1WQOA 1GF0A 3P65A 3EXDA 4NIJA 1G7IC 1LKRA 2IHLA 4KXIA 4N0JA 3TXIA 1D0MA 1YILA 4H9EA 4R0FA 1JUGA 1PS5A 1HNLA 5I4YA 1LJIA 5KKIA 4B4EA 4Z3MA 1IWWA 5JENB 1BB5A 5B07A 1TAYA 3WW5A 1LZ4A 4RLMA 5L9JA 1RJCB 1DI3A 4O34A 4HPEA 1GEZA 1W08A 3CSZA 3P4ZA 1C43A 4ZEEA 1GE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
118LA 1C60A 4YXAC 4H9FA 1UIEA 2BPUA 4GCEA 1JQUA 4LF4M 1Y8GA 1DXJA 1QT3A 2F4GA 5ITUA 4LRTA 1L45A 3ZEKA 3AOEA 1PQJA 2CWIA 260LA 5HLLA 2RAYX 4TUWA 3RW8A 4L41A 1N77A 1LSDA 4EJ4A 1R2YA 1FLUA 3KXEC 1PQOA 3HT8A 5L3HA 1C6FA 3N9EA 1GXXA 1N4FA 1GDWA 1L48A 3FTCA 1IN6A 2ZILA 5DLAA 4I4LA 4GHLA 4II8A 3VW7A 2QZ4A 3L25A 3SB9A 1B5VA 2HU1A 1Z5BA 1OIZA 1C62A 1CU6A 1D9WA 5LVGA 4TWSA 1L14A 1L13A 1L89A 1VATA 2DQEY 3HU8A 1DYGA 3WH1A 4DQ5A 2R6FA 151LA 2BLXA 2BQGA 2BQKA 4FVMA 3KVWA 3CT0A 1CV6A 4RW2A 2CHGA 2FH0A 2QENA 2BQFA 2B6TA 1L83A 2VDBB 3TWMA 173LA 1GB9A 2RKOA 188LA 3QWLA 2YFQA 3M6AA 2APLA 3CDQA 1BB4A 3SYKA 2Z19A 1LSMA 239LA 1GFAA 2DQAA 4CGYB 4DQ7A 3KFUG 1VEJA 4NGZA 1IC4Y 5LYMA 4W53A 1D9UA 4B7HA 5I5QA 2RGHA 1GAYA 2BWEA 1EQ5A 4H94A 4PCZA 5LVKA 3KS4A 196LA 5APDA 1C61A 1G4AE 3EMLA 4P17A 4LT3A 232LA 4D80A 3CF0A 3HU9A 107LA 2B75A 4XJBA 1QQWA 5T3FA 3U60B 4WL6A 2XBSA 4ITQA 1B5XA 1IWUA 3GUNA 1LSAA 1LMQA 5KXPA 5LZMA 5KKJA 4WM2A 4EKRA 1IY2A 2R4EA 4LRSA 5EXTA 5HNLA 2ZTCA 2OU9A 4N5RA 1YAQA 4GLVA 4LT1A 3L2XA 4LYOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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