1QWG | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	251
structure length	251
Chain Sequence	MKAFEFLYEDFQRGLTVVLDKGLPPKFVEDYLKVCGDYIDFVKFGWGTSAVIDRDVVKEKINYYKDWGIKVYPGGTLFEYAYSKGKFDEFLNECEKLGFEAVEISDGSSDISLEERNNAIKRAKDNGFMVLTEVGKKMPDKDKQLTIDDRIKLINFDLDAGADYVIIEGRESGKGKGLFDKEGKVKENELDVLAKNVDINKVIFEAPQKSQQVAFILKFGSSVNLANIAFDEVISLETLRRGLRGDTFGKV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	(2R)-phospho-3-sulfolactate synthase
publication title	The structural determination of phosphosulfolactate synthase from Methanococcus jannaschii at 1.7-A resolution: an enolase that is not an enolase pubmed doi rcsb
source organism	Methanocaldococcus jannaschii
total genus	94
structure length	251
sequence length	251
ec nomenclature	ec 4.4.1.19: Phosphosulfolactate synthase.
pdb deposition date	2003-09-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02679	ComA	(2R)-phospho-3-sulfolactate synthase (ComA)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1qwgA00

1TB3A 3BV4A 5HR7A 3ZR4A 1LDCA 4K38A 5HMSA 5K9DA 2Y7GA 1C29A 2VEKA 1H7OA 2DZUA 4GC4A 5LHEA 4A3UA 2OCZA 2GQAA 4NJJA 3FLUA 2ZZ5A 5HUPA 4A29A 3LDVA 5U4NA 4O14A 2ZDRA 1X1OA 2EGZA 1TPEA 3BGGA 2VEPA 1XC4A 3NQ7A 5LGXA 5BRBA 2GVLA 1KLZA 1SUXA 3BG5A 3O8AA 3QC3A 1W0MA 4HNUA 3N14A 2YCEA 1O94A 2H8ZA 4TIMA 4IX0A 2E6FA 4ZQMA 3WK0A 5LNUA 1F2JA 3PBUA 3W75A 3M5ZA 1OYBA 1QMLA 3FJLA 1I45A 3L21A 4Z1DA 1Q45A 3MI3A 1UCWA 3LTPA 1TMHA 4C1LA 2TPSA 1H1YA 1VYSX 4YMZA 1OFRA 3G1AA 1PVNA 1WBJA 2E6AA 3LX9A 2ZZ3A 4K7VA 5HWJA 3WK1A 4BWLC 5AFDA 5FESA 5ABTA 3S1XA 4X22A 2CZFA 3W1TA 1FDYA 3LCHA 1GG1A 4QIUA 3MMTA 3UD6A 3P8JA 3LHTA 3L67A 3IGXA 4CNOA 1FUYA 4MZ1A 3B0UX 3TX9A 2HSAA 2G5WA 2YW3A 1MSSA 3L9CA 4HT3A 1S3HA 3W1AA 1LTDA 3W7JA 3T7VA 3O63A 3GK0A 3WJSA 1SO6A 2ZRUA 3G0XA 3GKAA 3Q2DA 2CLFA 4TU1A 3V75A 3P61A 3WFAA 1G4EA 4X2RA 1WOAA 3RLVA 4O15A 4UFHA 4NQ1A 2QCDA 3W7CA 1TYGA 1ML1A 2QCMA 1C9DA 3DFQA 5LNRA 4BK9A 4LWWA 4IWWA 3CM4A 5CPOA 1EIXA 3SIZA 3PSWA 3W86A 2I1OA 3HG2A 1Q6QA 2O7QA 3O06A 5D03A 4DXVA 1VH7A 3NXFA 4LVGA 4JTGA 4PODA 4NX5A 1R47A 4RKAA 2JK2A 4UC5A 2CU0A 3H54A 3W7GA 5IBXC 3PUDA 4PH6A 1HG3A 1QOQA 3KRUA 3JS3A 4Q33A 3M16A 5FF0A 1QR7A 2PRLA 2NWSA 2A5HA 3GX9A 2ZZ1A 5I3KA 4K7YA 3IVTA 4ZQNA 1T0OA 2EHHA 4DPQA 3L0NA 4HSNA 4U28A 3E02A 3LLDA 2YXGA 1TPWA 1F5ZA 1RQHA 1EUAA 3H55A 5G4EA 1SZGA 5LNSA 2Q3OA 4MOZA 3KHJA 1V5XA 1DQXA 2ZA2A 3UXDA 1ZALA 2QR6A 1P1XA 4K39A 1PHQA 3CEPA 3A21A 2QCFA 4CLMA 2ZRYA 1KM2A 4NJGA 1F05A 1FCBA 4R33A 3W6YA 3ABQA 2V2CA 3GDRA 1OVDA 3FKRA 3W2MA 1I2PA 2WNNA 4K6AA 3GXNA 4EOUA 1G7VA 3AO0A 5J5DA 2VFIA 3KVMA 1MEHA 1B3OA 2PRHA 5FEZA 3CLMA 3SFKA 2VFDA 1K03A 3C52A 1TQXA 5SWUA 1QFEA 1MO0A 3EX3A 1LLZA 3NQEA 5C54A 5C55A 4O54A 5K4ZA 5LGZA 1VCVA 3STEA 1QWGA 3W1NA 5CKSA 3G3MA 2Y7EA 3DFSA 3DKJA 1AK5A 1VS1A 3G0SA 3W83A 3PB2A 3QEZA 2BXVA 2TMDA 1XBVA 1A53A 3UWYA 4OQVA 4GUIA 1P5BA 4JYEA 5KITA 2OMAA 4ZL1A 3SGZA 4DO6A 1M6JA 5D2YA 3RNDA 4UTUA 2QCEA 2GUUA 1JJKA 3MP4A 3LRKA 4UFLA 4BR1A 4C1KA 4PC8A 1K3UA 1QPOA 3EXTA 1TCDA 1Z44A 4FNSA 3KVJA 4JEQA 1JQXA 3NOEA 1KFKA 3W7IA 3HG3A 1L6SA 4O1BA 4AWTA 4GXMA 2WSYA 4P2VA 3U8GA 4PA8A 3NQCA 4QJ1A 1F7BA 1OFQA 3B06A 3W84A 2NUWA 4TR9A 2PE4A 3NG3A 5F2GA 3UY7A 4JTSA 3A24A 2QCDB 1TJPA 3LHWA 1JCXA 2E6YA 3GLCA 4JD4A 3T55A 4LS2A 3CPRA 3BW4A 3OVPA 1HO1A 4IXXA 3KX6A 4Z1CA 4DF1A 4ZMGA 1I2RA 2I14A 2Y7DA 3EWUA 4DPPA 2FQIA 5D33A 1KFCA 3G1DA 5K9CA 1FXPA 2DZSA 4ORMA 2Q3RA 4E2DA 4JTTA 4N2YA 3A5FA 1LCOA 1QO2A 1YXCA 4JS3A 3MBDA 3P8IA 3IGSA 5MHBA 1BKSA 3C2OA 1LBFA 1DL3A 1JUKA 1RR2A 4R7JA 1VPXA 1G4PA 3VKJA 4IJBA 5G2HA 4BI6A 3N19B 2LLEA 2ZZ4A 5BOOA 4IMGA 2BX7A 3S5OA 5G5IA 3CWNA 5KINA 4MLRA 4OWGA 1DOSA 3NM1A 1TTPA 5AC6A 3LXAA 1KV8A 4MYAA 3HPSA 3LI1A 3TMLA 3HMJG 1WXJA 2ZRXA 3N3MA 4MY1A 3E96A 1XBYA 1TPH1 2CWNA 3C6CA 1SO4A 1A5CA 5LZLA 4GUHA 4BF9A 3Q37A 1OYCA 1LP6A 3OA3A 2GJLA 4JX4A 4LVDA 4P61A 4I7WA 1FCQA 1FWRA 3KVKA 3G0UA 2NLIA 3O1NA 1H1ZA 1A50A 3EB2A 1Q6RA 2C15A 5C6MA 2A7PA 3UZ5A 3LCGA 1YYAA 4HPXA 3NEVA 1XCFA 3NPVA 2PRMA 3M0ZA 1XDMA 5AB3A 4QM1A 4LU0A 4MUZA 1RV8A 4OV9A 1TIMA 2Q8LA 4M7TA 1L6WA 1IGSA 2FLIA 1A5SA 1XKYA 4IXHA 3G1XA 3SSJA 3DFPA 4WQ6A 2VELA 4UTWC 1LOSA 1O60A 3NDOA 1SZFA 3NA8A 5AHMA 1N7KA 2OZ0A 2V82A 3PY2A 1D3HA 2GPTA 4IPJA 3BG3A 3STFA 4N9BA 1ONRA 1OF8A 1JULA 1FY6A 4HNNA 1NF0A 3M41A 2HS6A 4JTHA 5KZDA 1W5PA 1DBTA 4NNBA 1VLWA 3N2MA 4M6QA 3NL2A 3W7HA 2CLOA 5F2LA 5DBTA 3LB0A 1VRDA 1W5NA 1WV2A 2XFWA 1VGAA 4AXKA 1B57A 4KWWA 2VKZG 3W72A 5CSSA 2Z0IA 3P82A 1KFBA 2F84A 1I8JA 4Y8FA 3S1WA 2NUYA 4O0ZA 3S42A 2YFNA 1TJRA 2CLIA 2JGYA 5EA9A 5DBUA 2G95A 3SECA 4AWUA 1W3NA 1XUUA 3RK8A 3U6WA 3PR2A 5C5YA 3W7RA 4IOTA 2ZQ0A 3AJXA 1GZGA 5AYYA 5D2VA 3FA5A 4ADUA 2E6DA 3KXQA 1EWDA 3PSVA 4FIQA 3DZ1A 4LW7A 1FDZA 2E5DA 2C14A 4YCPA 1FWSA 1LBLA 4O28A 2JKAA 1SR9A 4FX6M 5A5WA 1QAPA 3ANYA 4NZJA 1MZHA 3QQ0A 5CPLA 3BLIA 4DEFA 5F1UA 3QRHA 1V7YA 4FNRA 1W54A 5CZJA 3P5ZA 3PB0A 3W7LA 3TQ0A 4PFMA 3G18A 3KRZA 3D0CA 4DBDA 1OFAA 2R14A 3W2JA 4JNMA 4GUFA 1F76A 2E09A 3NVTA 4MVAA 4CNNA 1H7PA 1YXYA 1S5VA 3NO5A 2NX1A 4WX2A 1IIGA 2A0NA 3M5VA 4MJMA 1ICQA 3M1ZA 1IF2A 3L2IA 2DZXA 3G3DA 2C1HA 2V2HA 2V30A 2VEIA 4LVFA 3ABSA 3TFXA 3TAKA 3L5MA 1EA0A 3K30A 1TRDA 1K8YA 3UXAA 4UMBA 4JY8A 3TFCA 3O6DA 3P67A 3HG4A 5TIMA 3LXBA 4OU1A 4HNVA 1YDOA 3PWAA 2X30A 4FNUA 3LLFA 3EXRA 3GR7A 3E0IA 5EYWA 4IMCA 5U7SA 1ZY9A 1TREA 4NX0A 2B7OA 3QMSA 2A7NA 3YPIA 1VR6A 1OX4A 2Y62A 4AWSA 4RCXA 3LCFA 3WJYA 4J9JA 1TQJA 4JIQA 4O8RA 5I3FA 3OVQA 3M6YA 3P81A 3MW7A 1Q3NA 4XUGA 3QSTA 1K8ZA 3DI1A 5H91A 4WZHA 2ZCGA 4R53A 3GDTA 3MBFA 2ZA1A 4U4MA 4O16A 3QJAA 1VHCA 3LGEA 2R8WA 1UASA 1W56A 2AAMA 3W1RA 2VOMA 1NF7A 1KM3A 1GPWA 2WJZA 2TYSA 4L4MA 4QAIA 4NJHA 1H7WA 3PBYA 3P84A 4BI5A 3SY5A 5D2TA 4Z1BA 4Z1AA 3GB6A 5A8GA 2X2GA 5I3HA 2C16A 4UMAA 3F03K 5BMWA 4ONVA 3RF9A 2DORA 4FNPA 4JDYA 3TE9A 1BEUA 3G1HA 3G1FA 3R2GA 1GWJA 3O6YX 3TMQA 2ZRVA 1SZEA 3NM3A 3HF3A 1BTMA 2VFHA 3BW3A 3M5XA 2VC6A 4UTWA 3HGJA 4H6KA 5D02A 1TPC1 2GVGA 1GTHA 3QYQA 2DZTA 1O5KA 4H3DA 3PC0A 3R5EA 2ISVA 5F4SA 1F6PA 1DHPA 4WXYA 4EWND 3BPWA 1YDVA 3N34A 2CLEA 1OX5A 4GFSA 3CEUA 1KM4A 4EF8A 1G7UA 1GVSA 3TDFA 4TX9A 2B7QA 2BWGA 1ZAHA 1H60A 3F4NA 2ZRZA 1G67A 3HGRA 4D2JA 1DVJA 2C18A 4AHOA 2C6QA 1T8XA 3I7RA 3LCWA 2NX9A 1RZMA 1JUEA 1NVMA 5DCBA 3H53A 1D3GA 2PURA 3GDMA 2ATSA 4JXCA 4QISA 3WJZA 3W87A 2R94A 4YXGA 2G97A 3EX6A 5F2IA 1S5TA 4I7UA 4TMCA 2B0MA 4GBUA 3T4CA 4JTLA 2FB3A 3NR0A 5F4XA 4RJEA 3QPZA 1TTIA 3IIZA 4N6FA 1IXNA 1QPRA 2X1TA 3TW7A 4LUJA 3R13A 3O16A 4UFIA 1ZAIA 3GVGA 4FB7A 1TPUA 4WOZA 2AQWA 2AGKA 3QZEA 4KFNA 1NSJA 1WDWA 5DCEA 1GG0A 2GQ9A 2CZDA 1WA3A 3CC1A 4OE7A 3NQAA 2RDUA 4JY9A 5DLCA 1EP3A 2A7RA 3INPA 3NQDA 1VZWA 4NVTA 2QCCA 2JBMA 1PS9A 1SFJA 4KKXA 3L68A 3EXSA 3M7WA 4XTIA 2FJKA 1GT8A 2V0TA 1EPXA 1PCKA 1AW5A 1OX4B 1ICPA 3BW2A 1VHNA 2BTMA 4ALDA 4L4LA 3ABOA 5K4XA 1BWLA 1JCMP 2QDHA 4XBSA 4CQAA 2QCHA 3OBKA 1AG1O 2Y89A 1DJNA 4RZ6A 1JRBA 1I2NA 1SZNA 2FTPA 4O50A 4ADSA 3I6RA 3RFAA 2DP3A 2E5CA 1LYXA 5K2ZA 4UR7A 4DELA 1W37A 1HTIA 3DAQA 4GE8A 3S5NA 1ZJIA 3MHUA 1L2UA 1KLYA 1H62A 2O7SA 3DXIA 1SW7A 4IX2A 1YLVA 2V5BA 3C4UA 2UV8G 5CPNA 5AOUA 3L5AA 3OVRA 4A22A 3W9ZA 2H90A 3W74A 4AHQA 3P80A 1GOXA 3LV6A 5AN7A 1LOQA 3QFEA 4DF0A 1TV8A 2JGQA 1AMKA 5D32A 3LBMA 3TROA 3TQKA 2KZHA 3VE9A 1IIHA 2RHGA 3HPXA 1TPFA 4DBEA 3BARA 2Y7FA 2JKPA 3W7PA 4AVFA 2HMCA 3UPBA 3L0KA 1KTCA 3GNNA 4UUIA 4KWVA 3W88A 1H7XA 4UMCA 1I2OA 4M7SA 4MY9A 1PL9A 4RV8A 3W7QA 2VEMA 2JKEA 3W1MA 3FEMA 2CLKA 2XN2A 3G24A 4GNJA 4H4IA 4HSOA 3SGUA 3M47A 4Q4KA 4XTDA 4FX7A 2NXIA 3TKFA 2HS8A 3LM7A 5AYZA 2CFFA 3HBLA 1EEPA 1MXSA 2QCGA 2E68A 2GQ8A 3C2VA 3MP5A 3C2FA 3IV3A 2H6RA 1A5AA 4LT9A 1OFBA 1DJQA 4S2BA 2QUVA 4JTIA 1YPIA 2NV1A 1I4NA 2E77A 3HQ1A 3LBCA 3TSBA 5HWNA 3KRSA 1GVOA 2WSRA 2A1YA 2WOQA 4FX8A 5LKYA 3FJ6A 1F73A 3C2EA 4E38A 4K37A 3ZWSA 3DU0A 5HULA 4TMBA 3SJ3A 3IVUA 4Y90A 2HTMA 4CCEA 5D30A 5FEWA 4LS0A 4BWLA 3C56A 4W9TA 2YFOA 5T26A 5FEXA 2QAFA 5DCDA 3W1UA 3NQMA 4LVBA 1W5OA 3L5LA 4O17A 2QAPA 2ZYFA 3HG5A 3UWZA 1N8FA 2ZZ2A 5D2XA 1W31A 4N02A 4K36A 5AHEA 4Z08A 5DY2A 4JIPA 1FCVA 3W7DA 1EX5A 3I65A 3SZ8A 3CT7A 1MEIA 4UTKA 3GDLA 3P5YA 3MJYA 1W3TA 5D09A 1LBMA 2QUTA 2B7PA 3LCXA 3C2RA 5K9XA 3NL3A 3P60A 4AHPA 3ZFHA 3B0VC 5CZTA 1WQ5A 1YTKA 2DJLA 2NXHA 2Y63A 3USBA 1OFOA 2B7NA 1OFDA 3UYCA 1B4EA 1VYRA 1TSIA 1LRNA 2EPHA 1R2TA 4OV4A 1GVFA 1RQBA 2DZVA 4LTSA 4CNPA 3CU2A 4BFAA 5TQLA 3Q58A 4WY0B 3ELFA 4MLJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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