1QZ5A

Structure of rabbit actin in complex with kabiramide c
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
total genus 129
structure length 358
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz5A04
1OKJA 1BO5O 4IWVA 3VENA 1T44A 2A6AA 1RDWX 5AQFA 4CZJA 5AQHA 3EZWA 3FZLA 1JCGA 4LC9B 5AQLA 1ATNA 1C0GA 5BPLA 4JD2B 5AQZA 4H03B 1GLAG 3AAQA 5F0XA 1NGAA 4H0YB 4NO7A 2YHXA 3DJCA 4HTLA 2ASPA 3CJAA 3VPZA 3CJCA 5KQ8A 1JCEA 3EN9A 1JCFA 5BRFA 2Q97A 5BN8A 3ENOA 5AQNA 2CH6A 3ZETB 3BF3A 4K43A 3WXIA 2FF6A 2YHYA 4BR9A 3ATVA 2A3ZA 3VEXA 5AFUH 2D0OA 2W41A 2P9LB 1QZ6A 5AZIA 1GLFO 5AQQA 4H5WA 4IXCA 3JXUA 1ESVA 3CQYA 2Q1NA 3MN5A 4H5RA 3SJHA 1U2VA 3AARA 4B1ZA 2HMPA 4EAHD 3SMPA 4CZEA 4H0TB 4BVOA 4BG8A 5JMVA 4JN4A 3ZX0A 3SK3A 2P9PA 3M1FA 4CD1A 1BA0A 2YI1A 1BUPA 3H3OB 2P9UA 1G99A 3QB0A 4FPAA 3FGUA 3GBTA 3WXKA 4RCHA 3JS6A 2P9IA 1BDGA 5AQWA 5AZJA 5AQTA 4DQ8A 4I6MB 2GTDA 3QBXA 1GLLO 3HTVA 4BC3A 3KZBA 2F9WA 4DHYA 5BPNA 2YCHA 3DXKA 4A2BA 3QFUA 3LDLA 1GLCG 4L3QA 4M7YA 5FPNA 2H3GX 3S41A 3ULEA 4CD3A 1SAZA 3CJ1A 5JLFA 5FPEA 3GG4A 1S3XA 2P9NB 3FR0A 3ID8A 2I7PA 3J8AA 1U6ZA 2FF3B 3BUZB 3A5OC 4RTFD 2QWNA 3A5LC 3O5BA 4O5FA 4FWQA 1E4GT 4PKHA 3BEXA 3U9DA 2GELA 2FSNA 2ZWHA 1E4FT 2E2PA 4WQ5A 4DCHA 1QQOA 5AQUA 4BR2A 1ZBSA 4J8FA 4BQLA 3TU5A 1TUYA 4BGAA 4FO0A 1BA1A 2EWSA 5KPRA 2ASOA 2QXLA 4WYBA 1YAGA 1GLEG 4BRMA 2QWOA 4MO4A 3H3NO 4H5VA 1IJJA 4PKGA 4BRQA 1R59O 4B9QA 1XUPO 1H1VA 3VF2A 2GWJA 5BRDA 2HOEA 4CBWA 5ADXA 4FWLA 4JNEA 3VEYA 3LL3A 3VERA 5AQOA 2PAVA 3L0QA 5E84A 3ZEUB 3ZX2A 1HKCA 1KAXA 3G25A 3IDHA 5JICA 1Q18A 3F9MA 4GY2B 5BRHA 1X3MA 2E1ZA 4BVPA 2W40A 4PL7A 2GEMA 1T6CA 4B1VA 3VETA 1ZXOA 2QWLA 3AY9A 4H0PA 3MN9A 2P9KB 3R8EA 5AR0A 4CZFA 4CI6A 2A41A 3A8YA 5B8HA 1NGIA 2V51B 4KBOA 4CJ7A 2FXUA 3CIPA 2IIRA 2HF4A 4BC5A 1GLJO 2QWMA 1NGHA 2A5XA 3VEVA 2VYPA 1KAYA 3WUHA 1KXPA 1TUUA 2YHWA 4BRGA 1NLVA 3LDQA 1KAZA 5EXWA 3H1VX 4FPBA 2A42A 3TPQA 4I6MA 4WQ4C 3WEEB 5AQRA 3GOIA 4CZIA 4CZMA 5AFUA 3RSEB 4MLHA 5KPTA 4A61A 1NGCA 4CZKA 1XC3A 5LJVA 3DXMB 2PBDA 2AA4A 1Z6RA 2IVOA 4XH1A 5LY3A 1K8KB 1YVNA 4NB4A 2DPNA 2VCPA 4K25A 3O6WA 2P9NA 3HZ6A 4Z94A 1ATSA 2UYTA 3D2EB 3VGLA 3L4IA 2Q0UA 4JHDB 3U8XA 1P8ZA 2I7NA 1J6ZA 5TKYA 3D2FB 5BPMA 3EO3A 5AQXA 4B1WB 3U4LA 1NMDA 4FWNA 1MA9B 3HBTA 2ZGYA 1LCUA 3KHYA 1MDUB 3HI0A 4FL9A 4K41A 3IFRA 3MN6A 2AP1A 1V4SA 4FWSA 4FOIA 4IO8A 3O8MA 1NGEA 3CJ7A 1Z05A 4BRDA 4PKIA 2D1KA 2V7YA 2E8AA 2YJFA 3FLCO 1Y64A 2E20A 3MK6A 3QMLA 3MDQA 1NGGA 5EX5A 3UKUB 1U2VB 1XQSC 1BU6O 2OANA 3ZEUA 4FWKA 5BREA 4BRFA 5KQDA 1WOQA 2ZGZA 5EOYA 3GL1A 2Q0RA 3I8BA 1NBWA 3B8AX 4JD2A 1HUXA 3ATUA 4F9OA 3M6GA 3O80A 3O4WA 4BR0A 2FLOA 5CE3A 3VGMA 1HX1A 4H5NA 1TYQB 4QS9A 2P9KA 4BG9A 4XEIA 5AZJB 3WXLA 1NM1A 3VGKA 2E2QA 3EKUA 3BP8A 4BRPA 5I9EB 3UE5A 3ZETA 3H45C 4AM6A 4RWTA 4H0OA 1WUAA 3AAPA 4XH4A 4BRKA 3DXKB 4CBXA 3UKRB 5ADXH 1LOTB 5AQGA 1QZ5A 3ULEB 2D4WA 1YXQA 2WUSA 3QDKA 3KVGA 2P9LA 2CGLA 1NGDA 3FZHA 2IVNA 4EIAA 2QW9A 3MN7A 1NGFA 1DEJA 5AQJA 3WXJA 5AQKA 2QWRA 4M7XA 4CZHA 4O8KA 4B1UB 3RSEA 4BRLA 1DKGD 4BQZA 3D7EO 1CZAN 4FWPA 4CZGA 4BR4A 5EVZA 3DXMA 1GLDG 3H1QA 5AQIA 5EY4A 3ZX3A 1K8KA 4BGBA 3CJ9A 2NZTA 3A0IX 4BR7A 2GWKA 2YJEA 4Y0WA 4DB3A 5LJWA 3C7NB 1NWKA 3L6QA 3MMVA 2ZF5O 1NGBA 4ISGA 1DGKN 3VESA 3FZMA 3MCPA 2V52B 3D2EA 4IJNA 3SMSA 1HLUA 3C0BA 4EHTA 4BRHA 2P9SB 3R6MA 4BREA 4JHDA 1D4XA 4H0XB 3GDQA 3D2FA 5FPMA 3VF6A 1S22A 4H0VB 1SQKA 3VF4A 3VEWA 1C0FA 3ENHA 1EQYA 3LDNA 3OHRA 3M3ZA 3WT0A 3DAWA 2ITMA 5AQYA 3LM9A 2CH5A 2NLXA 2QWQA 3IMXA 5FPDA 3DWLA 4AM7A 1HKBA 2KHOA 4H5TA 4EHUA 1RFQA 3QFPA 2E1YA 4YDUC 4EFHA 1BOTO 1V4TA 3CQXA 2Q2RA 3UKUA 5JLHA 3LDPA 2Q36A 1YUWA 2D0PA 3GE1A 4QS7A 2QM1A 2BUPA 3WQUA 1RGIA 3CERA 3WQTA 4A62A 4BC4A 3U9ZA 1ZC6A 1BG3A 2GUPA 4WQ5C 2BTFA 3I33A 3CJBA 2FSKA 4K42A 2QWPA 2A40A 1QQMA 1X3NA 3EKSA 5AZIB 2NRHA 5KPZA 2HF3A 4IJAA 4GNIA 1GLBG 3CI5A 4XH5A 1TYQA 4M63C 4WQ4A 4FWOA 4JAXA 5AQPA 3FFKB 3BF1A 4FWRA 5AQSA 4MO5A 5BN9A 5F1XA 3FZKA 2E88A 4MLEA 1SZ2A 3LM2A 4CZLA 4A2AA 1NGJA 4B1YB 3EL2A 3UKRA 1T6DA 4HWIA 4IZ9A 1X9JA 3QICA 3FE1A 3QBWA 2CGJA 5AQVA 2P9PB 4BROA 4BRNA 3O1BA 4BRIA 3A5MC 2P9UB 3HM8A 4YDUA 4QS8A 3A5NC 2P9IB 3R9PA 1BWFO 3LDOA 1HJOA 1IG8A 3O1WA 3CHWA 4FSVA 5E26A 1HKGA 4E1JA 2E2OA 5BR9A 2FSJA 4FWMA 4FOEA 5AQMA 2E2NA 4BC2A 4ISFA 1MWMA 2V7ZA 4PL8A 3P4IA 3UB5A 1MWKA 5F2RA 3SLCA 4C23A 2ASMA 3IUCA 4B1XB 5ELZA 3C7NA 2Q31A 1HPMA 2CGKA 2IVPA 3VEZA 2J4RA 4BRAA 4BR5A 1ATRA 3O08A 4BRCA 4ISEA 2VWBA 2P9SA 3VOVA 3FZFA 3H6EA 2F9TA 3VEOA 3W0LA 3HSCA 1QHAA 3CETA 3W3DA 1QQNA 3WEEA 4CBUA 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KH5A 1T44A 1OVQA 3LPTA 4DQRA 3EZWA 4LC9B 3AO3A 2JLEA 2O8EB 4JD2B 1GLAG 3AAQA 1NGAA 4H0YB 1RBVA 3NAEA 3QEXA 2DFHA 3HPGA 5I42A 4ELTA 1RT1A 3DJCA 3CJAA 4B9SA 3CJCA 5KQ8A 4FJ7A 4LF7K 5BRFA 1UOCA 4IEEA 5AQNA 2CH6A 1B9FA 3HYFA 3TSUA 3ZETB 4Z0UA 4ID1A 1S1VA 4K43A 4AILC 1VAZA 4N76A 3Q7BA 3VEXA 5AFUH 1ZBUA 2YV0X 2P9LB 4YOWA 5AZIA 4FZYA 4LF9K 4DU1A 1CZBA 3CCSN 4CGIA 2HHSA 3AVJA 1EP4A 3MN5A 4Z4EA 2Q3SA 3BZCA 4B1ZA 4EAHD 4I2PA 3CFPA 4CJPA 4H0TB 4C8KA 3SI6A 4BDYA 2P9PA 4JK9A 3M1FA 1BA0A 2P51A 2P9UA 3KLHA 3HRGA 3FGUA 3GBTA 2P9IA 3SJJA 4LFCK 4JI5K 4W5QA 3K2PA 5CYQA 4JI0K 4FK4A 1LV5A 1VHXA 3IKMA 1GLLO 2IS3A 3HTVA 3KZBA 2F9WA 1IBLK 3QFUA 1GLCG 5E41A 3O4QA 4ID5A 5FPNA 5LL6Z 5JLFA 3GG4A 3TTCA 1S3XA 3FR0A 3ID8A 1VSIA 3MXMA 3LP0A 3OYEA 2QWNA 1REVA 4O5FA 2QK9A 5KI6A 1VSJA 4UY8O 2ZWHA 3KD1E 1MU2A 3SZ2A 5AQUA 4J8FA 4CEDA 4CEBA 4BGAA 4TSXA 4CHQA 4QCLA 1HNZK 4MO4A 3ASMA 3G6EN 1WBBA 1TGOA 4B9QA 3V9SA 3OYFA 1S5JA 1WLJA 3L3UA 2O8BA 3QERA 2NNWA 2HOEA 4FWLA 4HUGA 4M3ZA 4K0KK 3L0QA 3J7AP 1LWCA 1HKCA 3AVAA 3CM5A 1KFDA 3EZ5A 2HHTA 1T05A 3ZT0A 4EP4A 4AHTA 4KTZA 1J5OA 3OYIA 4DQSA 4FJXA 1JLCA 3MN9A 3R8EA 1YF5L 4DV4K 5KGWA 3OYCA 1NGIA 1TL3A 3AVGA 3BY5A 4CJ7A 3DLRA 5HOOA 3CIPA 4FM1A 1YHQN 2HBJA 3E9PA 2UUCK 2QWMA 1WAFA 4OLAA 1M90O 1KAYA 1KXPA 4BRGA 4DFJA 3CFRA 3ZLJA 1EWRA 2F8TA 5GADP 2O4GA 4FJIA 3THXB 3SCXA 1JXBA 4DTPA 4ZTJA 1J9AA 3T3FA 3WEEB 3GOIA 4CZMA 4MLHA 1SKRA 4A61A 3OW2M 5LJVA 2PBDA 2DTUA 4DV2K 4XH1A 1YVNA 2VCPA 1EXQA 3SAHA 1XC9A 4E1NA 2P9NA 4NYFA 4KHQA 4Z94A 2HSTA 1ATSA 2UYTA 3D2EB 4DG1A 5C42A 4OKEA 3L4IA 4DTSA 4NLCA 3U8XA 1P8ZA 1J6ZA 5BPMA 1ZYQA 3EO3A 4B1WB 3U4LA 1FKPA 1TAQA 1MA9B 3V1RA 2HHUA 1NOYA 1LCUA 3HT3A 4FL9A 3IFRA 4EP5A 1V4SA 2X74A 4FWSA 4MDAA 3V9XA 2YHBA 3KTQA 1K8AO 1SL1A 2D5RA 1X9SA 2RHKA 4FJNA 2WBNA 3O9RA 2XO7A 3OYMA 4I7FA 1Y64A 4BDPA 4KO0A 1U2VB 3ZEUA 5CY4A 4BRFA 2YNGA 4YY3K 4B08A 1WOQA 1IKVA 4CJEA 3I8BA 4JD2A 3QINA 3PX4A 3OY9A 2DFFA 3M6GA 2G8UA 2JWLA 3VQBA 4IOXA 4H5NA 2P9KA 1BQMA 3WXLA 1BL3A 4ZHRA 4KKOA 3K58A 4BRPA 4JI1K 5I9EB 1JLAA 3UE5A 3H45C 3ZETA 4DTRA 1Q9YA 1Q9XA 1YJ9N 4XH4A 3DXKB 4LY7A 3VQCA 4JV5K 4GV3A 1QZ5A 3CYMA 3PX6A 4IBNA 3HSTB 3ULEB 2D4WA 5JS2A 2WUSA 4M3UA 1C1AA 2P9LA 3CG7A 2B6AA 4B9TA 3FZHA 4WE1A 3E66A 3TSQA 3O3FA 4O8KA 3RSEA 3C95A 4CEOA 1N6QA 4BRLA 4E19A 4BQZA 1ZBFA 3I0RA 4B3MK 1O13A 5EY4A 2KTQA 1CXQA 2YJEA 4QAGA 3F5TA 1ZBHA 1IV0A 3QEVA 4FM2A 2ZF5O 3KWGA 5J2PA 1RCHA 4R79A 1RTHA 4BE0A 4IJNA 4OPHA 1UAXA 5HBMA 4BREA 4JHDA 3M5RA 3KLFA 3GDQA 2OPSA 5FPMA 1NJXA 4YNQA 1J54A 1S22A 3C6AA 3VEWA 3WNFA 3TAPA 3ENHA 3AO1A 2ITMA 3LM9A 2CH5A 3SV3A 4ELUA 3ZT2A 3AVNA 3QEPA 4B3SK 5FROA 4H5TA 4EHUA 3T1HK 1NNEA 3DM2A 2F96A 2Q2RA 1U45A 3UKUA 4CFAA 2KFZA 4BE1A 2Q36A 1YUWA 4CFDA 3NFAA 4DLGA 4CJFA 5AJ3K 4RW6A 2PFUA 2GUPA 4AHVA 5JVGL 3SUPA 2OCEA 3CJBA 1C0UA 1IKXA 4KV8A 2VQFK 4K42A 1B9DA 4CJWA 1QQMA 1NK7A 1X3NA 3EKSA 2UXCK 5AZIB 5KPZA 2HF3A 4IJAA 2XY7A 1NK0A 3M8RA 4LF4K 4GNIA 4KHNA 4M63C 1JLGA 4JKAA 3PO4A 4WQ4A 4JAXA 4DLEA 1EETA 3OJUA 5AQSA 4AHRA 3G4SN 3ZSQA 4DTOA 5BN9A 2NUBA 4CCHA 4HWIA 4KAZA 3M8PA 2P9PB 4KHYA 3VTHA 4BRNA 1QQCA 3VQ5A 3O1BA 4BRIA 2P9UB 3HM8A 3EY1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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