1QZ6A

Structure of rabbit actin in complex with jaspisamide a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz6A04
4GNIA 2P9NA 4H5NA 3BEXA 3SMPA 5JICA 4EFHA 4EIAA 4H5VA 1KAZA 3ULEA 2Q36A 3WXIA 4BQZA 3VENA 2YHWA 4H03B 2QWNA 5BRDA 4BC2A 3IDHA 3QICA 3MN7A 4BR4A 3O8MA 4M7XA 2W41A 3R6MA 4K42A 3ZEUA 4CZFA 3HZ6A 2FXUA 1R59O 3MN9A 3VF4A 2D1KA 2Q1NA 3D2FB 3ZETA 4E1JA 4EHUA 3IUCA 4AM7A 3D2EB 2QWQA 5AZIB 2GWKA 4B1UB 3FZHA 3SJHA 3RSEA 3W3DA 1BDGA 3HTVA 3R9PA 1IJJA 3WXJA 3DXMA 3LDLA 4CI6A 3I8BA 1NGCA 2BUPA 3WXKA 1SQKA 3O6WA 1LCUA 3D2FA 4CBWA 2A6AA 2ZGYA 4K43A 5AQHA 5LJWA 4RWTA 5AZIA 4C23A 4CJ7A 4ISEA 2QW9A 4FOEA 4QS7A 2P9LA 3VGMA 4JD2B 1BOTO 2ASPA 5AZJB 1DEJA 2ITMA 3H45C 1NGGA 4CZKA 4BRIA 5ADXH 3MN6A 3CERA 1MA9B 4FWRA 4FWNA 1X9JA 3H3NO 2I7PA 4BRHA 5KPRA 1WOQA 2V52B 5AQVA 5F2RA 1NLVA 3LM9A 5AZJA 5FPEA 2A41A 4BROA 3VEXA 1RDWX 2PBDA 1YVNA 1X3MA 2FSNA 3CI5A 1GLAG 2CH6A 2VCPA 4HTLA 3WQUA 3FE1A 3FLCO 3GOIA 4LC9B 3EO3A 4GY2B 4PKHA 3A5OC 1SZ2A 1GLJO 1ESVA 2E1YA 2Q31A 4H0TB 1GLEG 3BP8A 3QBXA 5AQTA 2E2OA 3O1BA 3O5BA 4FPBA 5BRHA 2FSKA 4BVOA 2A5XA 4XH5A 2KHOA 3H1VX 4BRPA 2V7YA 4IJNA 2PAVA 4CBUA 4O5FA 4BG9A 4FOIA 1NMDA 3A5MC 1HPMA 2FF3B 3H6EA 4B9QA 2A3ZA 4FWSA 4BR5A 2FSJA 1HKGA 4CZIA 4BRKA 4A61A 4FWMA 4IO8A 3VOVA 5EOYA 1CZAN 3H3OB 3GBTA 4ISFA 3A8YA 2QWPA 2WUSA 4BRAA 1EQYA 4H0XB 2P9KB 3ID8A 2CH5A 3QMLA 5KQ8A 2P9SB 1DKGD 3UE5A 4XEIA 2HOEA 4FO0A 1Q18A 4CD3A 2VYPA 1NGJA 4CD1A 3VEWA 2P9NB 1BWFO 1HJOA 1DGKN 2AA4A 2D0PA 2QM1A 1E4FT 4BREA 3ULEB 2P9UB 1LOTB 1QQNA 3UKRA 3VF6A 5EY4A 1JCEA 2E8AA 2J4RA 3WXLA 3CETA 1QHAA 4FWPA 1NBWA 3ZEUB 2EWSA 2P9UA 3DXKB 4MO5A 4B1XB 4A62A 4H0YB 4B1ZA 3VEYA 3A5NC 2UYTA 1HKCA 4BVPA 1GLDG 5AQWA 3ZETB 3CJCA 5AQOA 5E26A 3CHWA 3DXKA 1ZBSA 3EKSA 3RSEB 3ZX2A 3SK3A 4IXCA 4JAXA 1BO5O 2IIRA 1GLBG 5AQSA 3UB5A 4BGBA 2VWBA 4PKIA 4CZHA 3DXMB 3U9ZA 4FWLA 3IMXA 3AARA 4M63C 4XH1A 3GE1A 5ADXA 2HF3A 4DB3A 5BPNA 2QWOA 4WQ4A 5JLHA 2A40A 3MK6A 1ATSA 2P9LB 2ZF5O 5AQXA 3H1QA 1SAZA 1BA1A 4IJAA 5FPMA 5FPNA 2GUPA 3DJCA 4H0VB 3QB0A 3UKUA 3VEVA 5F0XA 5AQUA 5TKYA 1XUPO 1C0FA 2F9TA 3WEEB 3HI0A 3DWLA 3I33A 5BRFA 5AQPA 3ZX0A 4BRQA 2E2QA 4BR9A 4JHDA 3LDOA 3U8XA 4B1VA 1D4XA 3FZFA 5ELZA 5AQZA 4EAHD 1XQSC 3WEEA 3LL3A 5B8HA 1MWKA 1U2VA 1WUAA 5BR9A 2ASOA 4BRCA 3QFPA 4YDUA 5AQJA 3DAWA 2CGJA 3MDQA 3L0QA 3SLCA 4M7YA 1GLFO 3VESA 2YCHA 4IZ9A 2V7ZA 5AQNA 2GELA 2QWMA 2QXLA 3VEZA 3J8AA 2NZTA 3VGKA 4FWKA 1S22A 3CJBA 3HBTA 5AQKA 1NWKA 3JXUA 5AQLA 3GDQA 2Q0UA 1C0GA 2FLOA 2YHYA 4WQ5A 4CZEA 2E88A 1JCFA 4MLHA 3AAQA 3JS6A 4MO4A 3LM2A 1QQMA 4A2BA 4H0PA 3WT0A 3CQXA 4FPAA 4B1YB 5BPMA 2YI1A 4NO7A 2V51B 4BC4A 3LDPA 1OKJA 4RCHA 1Z05A 3P4IA 4A2AA 4L3QA 5AQMA 5EVZA 1E4GT 2H3GX 2CGKA 5BN8A 1NGDA 5EXWA 4BG8A 4BRLA 3C7NA 2QWRA 4BC5A 3W0LA 4EHTA 5AQIA 3VF2A 5LY3A 3C0BA 3OHRA 2QWLA 4BRMA 1TUYA 3HM8A 4Z94A 5AR0A 2E1ZA 1K8KA 2YJFA 4H5RA 4PL7A 1TUUA 5KPZA 3UKRB 4FWOA 5I9EB 3H46O 1TYQA 2Q97A 3BF1A 3CJ9A 4J8FA 1HKBA 1ATRA 3HSCA 2YJEA 3KHYA 4JN4A 4DQ8A 2NRHA 2GTDA 1IG8A 2E2NA 4BR7A 5LJVA 2AP1A 2BTFA 1RGIA 2ZWHA 5JMVA 1NM1A 2OANA 3U4LA 4I6MB 4PL8A 1NGHA 4DCHA 1H1VA 2W40A 4Y0WA 3EKUA 4CZJA 5BREA 3FFKB 4HWIA 5JLFA 3CJAA 3ENHA 3R8EA 4BC3A 2E20A 3VETA 1RFQA 1NGFA 4DHYA 4I6MA 1YUWA 1X3NA 3MCPA 5CE3A 1YAGA 3CIPA 3O1WA 4H5TA 2P9IA 1GLCG 2Q2RA 3UKUB 3VERA 1BUPA 3EZWA 5AFUH 1V4SA 4H0OA 2I7NA 3M3ZA 4H5WA 3D7EO 3FZLA 4QS9A 5E84A 4JHDB 3WQTA 1KAXA 4WQ4C 3O4WA 2Q0RA 5F1XA 3FZKA 3QFUA 5AQRA 4XH4A 1U2VB 3ENOA 2ZGZA 1QZ6A 1KAYA 4KBOA 4ISGA 1S3XA 5BPLA 4MLEA 3TU5A 4K41A 4BGAA 3FZMA 5EX5A 3VPZA 4BRNA 5AQFA 2YHXA 2P9PB 1T6CA 2GEMA 3LDNA 2HF4A 3G25A 1NGIA 2GWJA 4CZMA 3WUHA 4BRFA 3A0IX 3D2EA 1XC3A 1MWMA 4YDUC 1V4TA 1JCGA 4BRGA 2P9PA 3VGLA 2D4WA 2DPNA 4BQLA 3LDQA 5AQGA 4AM6A 3MN5A 4PKGA 4B1WB 3AY9A 1P8ZA 2FF6A 2IVOA 3ATUA 2ASMA 2D0OA 4WQ5C 3KZBA 4CZGA 1GLLO 4JD2A 3L4IA 3CQYA 4K25A 3M6GA 3BF3A 3TPQA 1QZ5A 3ZX3A 5KQDA 3EN9A 3S41A 3C7NB 4CZLA 2E2PA 1HUXA 4QS8A 5BN9A 1KXPA 3GL1A 1NGEA 4CBXA 4F9OA 1K8KB 4FWQA 2IVNA 1ZXOA 3AAPA 3IFRA 4RTFD 3GG4A 1TYQB 1Z6RA 3MMVA 3CJ7A 4BRDA 1NGAA 3L6QA 3M1FA 4FL9A 4NB4A 1MDUB 3ATVA 3FR0A 3F9MA 1U6ZA 1HX1A 3BUZB 2IVPA 4BR0A 1HLUA 4JNEA 1G99A 1Y64A 4O8KA 3FGUA 3O08A 1T6DA 3KVGA 5AQYA 3QDKA 5AFUA 1YXQA 4BR2A 3U9DA 3EL2A 2A42A 5AQQA 1BU6O 4IWVA 3SMSA 2HMPA 5KPTA 1QQOA 3A5LC 3O80A 3VEOA 1NGBA 3B8AX 5FPDA 2NLXA 2P9IB 3QBWA 1T44A 1BA0A 2CGLA 2P9KA 4FSVA 1ATNA 4WYBA 2F9WA 2P9SA 1BG3A 1J6ZA 3CJ1A 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YV0X 2HHWA 4IFVA 3SMPA 3C95A 3HPHA 3TAEA 4H03B 4FXDA 3QO9A 5GIPA 5BRDA 1BIUA 3IDHA 3QICA 2W42A 3HK2A 1ZBFA 4M7XA 3I56N 4W5TA 3TABA 3HZ6A 4Z4GA 2FXUA 2OTJN 4LH4A 3SYZA 1N34K 4W5OA 3D2FB 4W5NA 3SAHA 4EHUA 3IUCA 4NLCA 4DR2K 3RSEA 1UAXA 3R9PA 3C65A 2ETJA 3K58A 4IDHA 3KK3A 1Q9YA 1LCUA 2RPIA 2ZGYA 4FYDA 1SUQA 4RWTA 5AZIA 4C23A 4B9TA 2YHBA 3MXMA 2C1IA 2FBYA 4JI8K 4FOEA 3VGMA 3TTCA 4CGIA 2ZJQL 3G10A 3DYAA 3H45C 1NGGA 1RT7A 3MX5A 2HBLA 5ADXH 2EX3A 1MA9B 2YKNA 1VQ8N 4KTQA 2I7PA 4BRHA 3ZSQA 1C6VA 1WOQA 1JXBA 2V52B 4JI7K 5AZJA 5FPEA 1NK5A 3VEXA 3JSMA 3TTFA 3ISNC 1REVA 3SUQA 3SPZA 1X3MA 3K9JA 4IO9L 3CI5A 4IOAL 2KKZA 3OJUA 4KI4A 3FE1A 1SL1A 1W97L 2QK9A 1YI2N 3EO3A 1GLJO 1ESVA 5GAHP 5AQTA 3O5BA 3TAMA 2YX6A 2X6NA 4CHPA 3DLEA 2A5XA 4XH5A 2DTUA 1RDAA 1YJWN 3AVBA 4IEIA 4JYAK 3CPWM 2PAVA 4PUOA 1YHQN 2PFUA 4KHUA 1S9EA 5CY4A 3A5MC 4CJEA 3TARA 1HPMA 1D5AA 3TAQA 4B9QA 2KZZA 4FWSA 3P5JA 3HXMA 4A61A 4JI1K 4I9LA 3TR8A 1RT6A 2NRVA 4W5QA 3GBTA 4ISFA 4Z4EA 4O0JA 3THYB 2PY5A 1VQ9N 5KQ8A 2VQFK 3T1HK 1IKVA 2VYPA 1YTAA 5SWMA 4JKEA 1G15A 2P9NB 3G6EN 3OS0A 2AA4A 4OKKA 1E4FT 5FROA 1LOTB 4F2RA 2QEXN 1GOBA 4FLYA 3UKRA 5CHIA 3O4QA 1WLJA 3ZT0A 4CJWA 1JCEA 4CJTA 2E8AA 3ZEUB 1NBWA 3Q7BA 2P9UA 4CJPA 4DU4A 4LFBK 4B1ZA 3VQAA 2IGIA 4YY3K 4LSNA 3A5NC 3VEYA 1ZBIA 1VHXA 1HKCA 3I8DA 3ZETB 3CJCA 4WE1A 3CHWA 3DXKA 3ZX2A 3AO4A 4CEAA 4JAXA 2IOCA 1BO5O 1ZBUA 3TANA 2VWBA 4PKIA 3ZT4A 3NH0A 3GE1A 4CGFA 4Z0UA 1TVRA 2O8DB 4KTZA 1QS4A 1FKOA 5M1NA 2ZF5O 1LWEA 3H1QA 1BA1A 5FPMA 3QB0A 4GMJB 3V1QA 5TKYA 4GV9A 5C0YA 3AA4A 2F9TA 1WBBA 3I33A 5BRFA 5AQPA 3ZX0A 3OYLA 1S1XA 4DSKA 2D0BA 4OVLA 4DV7K 3RMAA 3LDOA 4EZ9A 4KB1A 5I3UA 3KK1A 3U3YA 3SI6A 3U8XA 2P5GA 4CIGA 3F2KA 4E0DA 1WSIA 4DV0K 4DG1A 1RDBA 1IG9A 4BRCA 3KWIA 5AQJA 5KI6A 3OYMA 3NF8A 4KO0A 2GV9A 4CW7B 1LAWA 4IZ9A 1LWCA 2V7ZA 1NK7A 4IOCL 3VEZA 2NZTA 3AVMA 4AHSA 3HBTA 3K5NA 2O8CB 3JXUA 4C8NA 2Q0UA 1Z26A 2FLOA 4CZEA 4KI6A 4BDZA 3AAQA 4AHUA 4F3TA 2W6LA 4Q5VA 2HMIA 1EETA 2HHQA 4A2BA 3HSTB 4CERA 3HPOA 3CQXA 4FPAA 4RW9A 1RTIA 3P4IA 4A2AA 4L3QA 1E4GT 2CGKA 1NGDA 5EXWA 2O4IA 3AVIA 1GOAA 2UU9K 2DFFA 3C7NA 4OGEA 4FLXA 4ICLA 3OBWA 5J2PA 3LZIA 4CK3A 1TKDA 2E5LK 3CJ9A 3SBTA 3KHYA 4E72A 3HSCA 2YJEA 4DQ8A 2HNYA 3ID6A 1IG8A 4A57A 4BR7A 1ASWA 3NF6A 1BGXT 3OYHA 1NM1A 3U4LA 1RBSA 4PL8A 4Z4IA 4DCHA 2W40A 4Y0WA 4HVJA 4HCBA 1TKTA 4IBNA 5HBMA 4J2BA 3FFKB 1Q81O 5LMUK 5JLFA 3CJAA 2F8SA 5LL6Z 4BC3A 1X3NA 4O55A 5JVGL 4CEEA 3O1WA 3AO2A 2P9IA 3AVHA 3PIOL 4JI0K 1ITGA 1O1WA 2I7NA 3CM5A 3LP3A 4FJ9A 3FFIA 4CFDA 4RW4A 3TAFA 3PUFA 4DF8A 4DTMA 1HR0K 4CJ4A 4WQ4C 1IH7A 2Q0RA 3QFUA 2G8UA 4CHYA 2YNGA 4QCLA 3L2RA 1QVGM 5AQRA 4E7IA 2ZGZA 1KVCA 3PX6A 1NK9A 4B9LA 1S3XA 1CXQA 4HUEA 4MLEA 4OPAA 2GBZA 3VPZA 4UQGA 3CQ8A 5J2QA 2P9PB 4DU1A 2KZMA 4CEFA 4CGGA 4DV3K 2WTUA 2HF4A 2GWJA 1JLGA 1U04A 3WUHA 4BRFA 3NGZA 4XIUA 3D2EA 4OKJA 4YDUC 1V4TA 2B5JA 3WNEA 4O44A 3DRPA 4M3RA 2KFZA 1RT5A 1NK0A 4O5BA 3NDKA 2HW3A 2O4GA 1SKSA 4OKEA 1VSIA 3VQ6A 4FJJA 4PKGA 2FBXA 1RBTA 2JLEA 3E1YA 4A59A 4X65K 2D0OA 4WQ5C 3L4IA 3TPQA 1D9FA 2RN2A 1QZ5A 4BDYA 1HUXA 2YNIA 3DLRA 3AVLA 4JI3K 3VQ5A 2HVIA 1N36K 3L3UA 1NGEA 1KLNA 1T3VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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