The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
WKLPSVTVGNPKVSVFGGPFKIEEGKSGYKDVYSSSKGRDLDDGIEVNKKKEKRLVVKDGNPFIIRFKKSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Kunitz trypsin inhibitor
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| publication title |
Three-dimensional structure of an unusual Kunitz (STI) type trypsin inhibitor from Copaifera langsdorffii.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
9
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-10-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1R8O B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1X6B A; 1U1S A; 3PGG A; 3PFS A; 5KE3 A; 1QMC A; 2J6O A; 2PQW A; 3FB9 A; 1X69 A; 2HMA A; 2WSF E; 2KT1 A; 4PFP A; 1VQ9 T; 2NUP B; 1AVZ C; 4XU1 A; 4LDV A; 1VQ5 T; 2X4Y A; 4MML A; 3UF4 A; 1TXQ A; 1D09 B; 2PVD B; 5LJ3 d; 1VQK A; 1VQM T; 2JT4 A; 2EBP A; 3L2V A; 1FX7 A; 5CR2 A; 4GLK A; 3RUX A; 3OQ5 A; 1Q86 C; 2LTO A; 5GAO r; 1YJ9 Q; 5GAN e; 2QDL A; 2O2O A; 2AHJ B; 2F5K A; 5C0M A; 1QP3 A; 3QWY A; 2QQ9 A; 1Q81 U; 2CP6 A; 2NUZ A; 2DL5 A; 4PLI A; 1K9M R; 3JSC A; 3REB B; 2LQ8 A; 1M1G A; 1MNE A; 2HCK A; 4E7H A; 1D1C A; 2DVJ A; 3HSB A; 2L2P A; 4OGC A; 2CS7 A; 3S3M A; 5GAN d; 4F7U A; 2LMJ A; 2HBW A; 4JS4 A; 2EAY A; 5GAM f; 2CH4 W; 4AMC A; 1K4U S; 4X9D A; 5GAO n; 3F70 A; 1M90 R; 4MMK A; 2IIM A; 2Y4Y A; 2RJF A; 3X26 B; 5C6S A; 1K8A U; 5FLX E; 1HXD A; 2RQU A; 2FRW A; 3FJ5 A; 2EWN A; 2Z0W A; 2EVR A; 3G4S A; 2XDP A; 4LDW A; 3L2U A; 1WJQ A; 2EPD A; 1VQP Q; 1ZA2 B; 1U06 A; 3CCJ Q; 2PTK A; 2V8J A; 3MET A; 4C92 E; 1B3Q A; 1VQN Q; 3VYH B; 4N0A A; 5GAN g; 3V7S A; 5FU6 B; 1KQS P; 3OYF A; 1M3A A; 4JZ3 A; 4V2S A; 3HRS A; 3C95 A; 1UGQ B; 1QKW A; 2MOX A; 1QWF A; 4OMM A; 4GBQ A; 3JCM X; 4CRI A; 1Q81 C; 2YT6 A; 1S72 Q; 3URG A; 1YBY A; 5CKD A; 3M4Y A; 2P0Q A; 1QKX A; 3DB4 A; 2E12 A; 1BCM A; 4CC7 A; 4F16 A; 3L2Z A; 3VS6 A; 1M8M A; 1YFN A; 4PJO B; 1MMG A; 3NFC A; 1VQO Q; 1SG5 A; 1VUB A; 4LXC A; 5EC7 A; 1QLY A; 1BI1 A; 3H9N A; 1I81 A; 3PIO A; 3LGL A; 1VQ8 A; 1JEG A; 3UA7 A; 2AZS A; 3PMI A; 4Z88 A; 2QK0 A; 2DZC A; 3OYL A; 1OU8 A; 2M0O A; 2XDD A; 1S1N A; 4FSX A; 3CME A; 2VWF A; 3CD6 Q; 4PFO A; 2OTJ A; 1RI9 A; 2X4W A; 1TUC A; 3X25 B; 1WZO A; 1VIF A; 3MEU A; 3THK A; 4IUT A; 1YJ9 T; 3CCR Q; 1ZUY A; 4F7U G; 1QVP A; 5GJV B; 3QWX X; 4OMP A; 3JCM f; 4NL2 A; 4ZN3 A; 2RI2 A; 1OEB A; 3JB9 F; 1ZHI A; 2XU8 A; 1KSW A; 5I22 A; 3EH2 A; 1OPK A; 3EG2 A; 4KUL A; 4X34 A; 4XTV A; 1G3T A; 3U23 A; 1KQ1 A; 2DXB A; 2RHY A; 1M2V B; 3G71 Q; 4AFZ C; 1NPR A; 4QQ6 A; 4M75 F; 3CC4 A; 2VAS A; 3J80 E; 1JXO A; 4FW1 A; 3CPW S; 2AIR B; 5LJ3 h; 1G83 A; 2E5K A; 1PSE A; 2LT4 A; 3E9F A; 2PVO B; 4C8Q F; 3PMT A; 1MHN A; 1JBM A; 1RLP C; 3OS0 A; 2VGM A; 2I0N A; 1M1K R; 2RO0 A; 2RQV A; 1WHK A; 3MJX A; 2RK1 A; 2JNG A; 4Z89 A; 5LJ5 f; 1GBQ A; 1PSF A; 4Y28 E; 1VQP T; 2EYX A; 2QGF B; 3CCJ T; 3JCM Q; 3RR6 A; 2KYM A; 1VQN T; 3GBQ A; 1YIT A; 1NE8 A; 1Y57 A; 1G3Y A; 2YXY A; 3OYB A; 3G6E A; 4C8Q C; 1AD5 A; 1UGV A; 2KQW A; 2M16 A; 3GP8 A; 4HKE A; 5GAN h; 1ZUK A; 3VS1 A; 4M77 G; 2NUT B; 1S72 T; 4OB1 B; 1M5Q 1; 5GAN 6; 4EMK B; 3EFR A; 2A08 A; 1T3S A; 4RCC A; 2RHI A; 2RI3 A; 3RBB B; 3WXM B; 4KGZ B; 1OOT A; 4AT1 B; 3QUI A; 5L23 A; 5FWB A; 4RCB A; 1X75 C; 4HA8 A; 2CP0 A; 1VQO T; 2ED0 A; 2DFU A; 2KDS A; 4II1 A; 2KRN A; 4IUQ A; 2O4X A; 1VYV A; 4QVZ A; 1KD1 U; 3EH1 A; 3OS2 A; 3I5R A; 1X6O A; 3CC7 Q; 3PNW C; 1YI2 Q; 2DXU A; 5I2S A; 1IB8 A; 1VQ7 A; 5CQX A; 3NTI A; 3QZ5 B; 3CMA A; 3CD6 T; 4F7U E; 3CCQ A; 4M77 B; 1N8R R; 3SWN B; 5IHK A; 2JVV A; 4ANJ A; 1UGR B; 2VKN A; 4Z02 A; 3L42 A; 2FO0 A; 2RK2 A; 1UHF A; 1NJI U; 4M7D B; 3RES A; 3CCM Q; 2MYS A; 4BI8 B; 1V1C A; 3GF5 A; 5HK3 A; 4KGV B; 3CCR T; 1M3C A; 3I5S A; 2L8D A; 5A0G A; 1GRI A; 1Q95 G; 4CI0 C; 1NM7 A; 4DBH A; 2BZX A; 1WXB A; 3A8M B; 1WXU A; 1XQH A; 3LW5 E; 3OBW A; 2YUN A; 3SEM A; 1W6X A; 2J7I A; 5GAM j; 2EKO A; 1VOM A; 4JJD A; 3G71 T; 3PVQ A; 4AFU C; 1KQS A; 1UGP B; 1FMK A; 3RKX A; 4EMH A; 1I07 A; 4BAC A; 2CGH A; 2DBK A; 4PJO F; 1B34 A; 5FU6 C; 5GAO m; 3OYK A; 2P0P A; 3OYE A; 1AWJ A; 1M4Z A; 1ZBJ A; 2OAW A; 2IG0 A; 1G5V A; 4J6X A; 2PZ1 A; 2M1H A; 2LZ6 B; 1HD3 A; 4PFZ A; 4M77 E; 5J39 A; 2MPX C; 4ZGD B; 3L1A A; 1NLO C; 3CPW P; 3OYG A; 4CC3 A; 2EQJ A; 4PJO C; 2RPN A; 4NL3 A; 4XU3 A; 3VUB A; 1UEB A; 1KC8 U; 3NGP A; 4AFQ C; 3SD4 A; 5I21 A; 3UDC A; 1HK9 A; 1NZ9 A; 1TOV A; 4XQ3 A; 1YHQ A; 4C5H A; 1R0B G; 4RG2 A; 5KE2 A; 1K73 R; 1Z9Z A; 2L3S A; 2QTX A; 1K8A R; 3RKY A; 5A0L A; 1VQ4 A; 4HCZ A; 4C8Q A; 1MV0 B; 3HHT B; 2OI3 A; 4PJL A; 3ZEH A; 4E6R A; 1G8X A; 2HSP A; 2DYB A; 3CC7 T; 4FU6 A; 2L3R A; 2CDT A; 2DTH A; 2NUP A; 3CBM A; 4L6V 5; 2YUO A; 4HVU A; 1SEM A; 5AYF A; 1BU1 A; 2RJC A; 3CCV A; 1VQ6 A; 2HKQ B; 4C92 A; 4KBM B; 5D6Y A; 8ATC B; 2GF7 A; 3CCM T; 2E41 A; 2QDY B; 1AHJ B; 2HNI A; 4XTZ A; 1Z9Q A; 2DAQ A; 2BKD N; 2HDA A; 1JJ2 S; 1WJR A; 4QVC A; 2JXB A; 3MO8 A; 1LJO A; 3ULR B; 1EFN A; 5AT1 B; 1I4K 1; 1TUD A; 2EJF A; 1WX6 A; 3V7C A; 1VQ9 A; 4RTU A; 3BFM A; 2DF6 A; 4XK8 E; 1GL5 A; 2G3R A; 2KYB A; 5GAN 2; 1YJW Q; 1VQ5 A; 1WYX A; 4E7J A; 1G3S A; 2EW3 A; 3A98 A; 4AG1 C; 2DX1 A; 1O9S A; 2GFA A; 5KYN A; 2KE9 A; 4RTW A; 3GNG A; 1YIJ Q; 6AT1 B; 1VQM A; 5GAO p; 2YRD A; 2ZPI B; 5GMK j; 1I0C A; 4FT2 A; 4N4I A; 4HVV A; 3A5Z B; 2RM4 A; 2LNH B; 4FL6 A; 5LJ5 j; 4OMN A; 4DEX A; 3EG9 B; 1LCK A; 3JB9 G; 1Y96 B; 2K79 A; 2GTJ A; 2VV5 A; 1QVF S; 3OYC A; 2B86 A; 4AG2 C; 5IXB A; 2DL3 A; 4JRP A; 1GCQ A; 2LCC A; 1ZX6 A; 4EMK C; 1OYX A; 2K2M A; 5KCH A; 3HPW A; 2QA4 T; 1EZZ B; 2HKN A; 2DZ9 A; 4M75 G; 3G7Z A; 3VS4 A; 3ZL7 C; 3OYM A; 2KVQ G; 2KMT A; 2KAF A; 2O88 A; 4C8Q G; 4OMO A; 4M7D F; 1ZSZ B; 3TEE A; 4M7A B; 4LDU A; 2LX7 A; 5IN1 A; 2DEU A; 5LJ3 f; 1N9S A; 3EGD B; 4C0Z A; 2YSQ A; 3CCE A; 1WPY A; 3AHU A; 4F04 B; 2ZPF B; 2M9U A; 1F1B B; 2V1Q A; 1YWP A; 2CT4 A; 3M0U A; 4M77 C; 3SWN C; 2D8J A; 2XMF A; 1JRI A; 4PJO A; 3MP1 A; 2FPE A; 1BI0 A; 4RTV A; 4M7D C; 1JO8 A; 4M75 B; 4JZ4 A; 4TVR A; 3VUZ A; 5D7U A; 3NHN A; 1YN8 A; 3M59 A; 1P92 A; 1PC0 A; 1ZA1 B; 2WAC A; 3BW1 A; 2O9V A; 2RH2 A; 2A3L A; 4A54 A; 1SHG A; 2J06 A; 3OYD A; 5KH6 A; 2CZ7 B; 5FRM A; 3CC2 Q; 2X4X A; 5CK9 A; 3EG1 A; 2YUP A; 1UG1 A; 1X43 A; 4FM4 B; 3JCM P; 4Z8A A; 2MWP A; 4C8Q D; 1X6G A; 1UDL A; 2SEM A; 4C0F A; 4B6M A; 1N5Z A; 1RUW A; 1AEY A; 1KD1 R; 2ZGW A; 3X20 B; 1IXD A; 4O5V A; 2VYT A; 3LYI A; 1YJW T; 1HJD A; 5FW9 A; 2L3Q A; 4NS5 A; 1PKS A; 2DK3 A; 4KRT A; 3UA6 A; 3I55 Q; 4FYX B; 3S3N A; 4C92 D; 3MP6 A; 1RAD B; 1Y07 A; 2JTM A; 4KH1 B; 1YIJ T; 3CPW A; 1BB9 A; 2K57 A; 1JJ2 P; 1YJ9 A; 1NJI R; 5CQY A; 2EFI A; 1WA7 A; 3S6W A; 4ZGJ B; 2V8I A; 3HKS A; 2EQK A; 1B7T A; 4M75 E; 2K3X A; 4RMO A; 2ZAE A; 1QP2 A; 1RAB B; 2JM9 A; 3FIF A; 2FEI A; 4C8Q E; 2MCN A; 1UE9 A; 1Q82 U; 3C4S A; 4QT7 A; 4LUD A; 3CPF A; 2RJE A; 2BE9 B; 1ABQ A; 1RAF B; 2KY9 A; 2YRV A; 2BUD A; 4PJO G; 1KG1 A; 3AT1 B; 1C1A A; 1I5O B; 3M58 A; 3QYG B; 4J8O A; 4XU0 A; 4C5I A; 1QVF P; 2RN8 A; 5IH2 A; 4EMK A; 1WXT A; 2DLP A; 3GOX A; 5KYW A; 1OUL A; 2OTL Q; 1VQP A; 3CCJ A; 1GCP A; 4E7S A; 1VQN A; 2H3E B; 3BDL A; 4HCK A; 5DM7 R; 5GAM e; 4A53 A; 1WHL A; 3C0C A; 4N4H A; 1LOJ A; 3OYH A; 2C0I A; 2K7A A; 4XTX A; 5CO7 A; 1U8R A; 4FYW B; 2F69 A; 1S72 A; 3UPU A; 2EYZ A; 3VYG A; 1KC8 R; 1PKT A; 1TS9 A; 3TRE A; 1KHC A; 3CC2 T; 2J6F A; 2DL7 A; 4M77 A; 3SWN A; 1Q82 C; 1MMN A; 2PU9 B; 1IZ6 A; 5KYU A; 5LL6 S; 5GAM d; 1VQO A; 4M7D A; 3OS1 A; 2EGE A; 4PJO D; 2V26 A; 2E1H A; 1XJW B; 1SHF A; 3PT9 A; 5A0D A; 5HK0 A; 2C0T A; 4JUV A; 3MPU B; 1UHC A; 4M7A F; 4BDZ A; 2ROL A; 2LP5 A; 4J9B A; 2JTE A; 5GAN 3; 1AT1 B; 3I55 T; 3OYJ A; 4HXJ A; 2W0Z A; 1MMA A; 1RI0 A; 5FU7 B; 3I56 Q; 3CD6 A; 1W2B S; 1R8O B; 1MV3 A; 3HFO A; 1Q7Y R; 3O8V A; 3GPL A; 1RLQ C; 5GAM g; 2RD1 A; 4IUU A; 1R0C B; 4LD6 A; 4JJB A; 2ZPE B; 3CCR A; 2R57 A; 3EGU A; 1PD1 A; 3FJP A; 3RDV A; 3QDF A; 3EAE A; 4C5E A; 4B9W A; 1W4S A; 2RI5 A; 1ZSZ C; 4M7A C; 2YLC A; 3C94 A; 4KUD K; 1SKU B; 4RG8 A; 2K5I A; 4PJO E; 1WHJ A; 3TVT A; 2EGA A; 3NTH A; 1Y71 A; 5D6W A; 1U3O A; 4WCI A; 3HRT A; 3G71 A; 1H64 1; 2CP3 A; 1PWT A; 2X35 A; 3H41 A; 3OA6 A; 2EYW A; 4EIK A; 3JCM e; 1PG5 B; 2X51 A; 1LNX A; 3G4S T; 1RAG B; 4YTL A; 4M75 C; 2RQT A; 3ER0 A; 4OMQ A; 1IHW A; 2DJZ A; 1D0X A; 1NBE B; 2DXC A; 2A37 A; 2BTT A; 1WJS A; 2OTL T; 5KYX B; 1XOV A; 3ASK A; 2DO3 A; 5EG2 A; 1X2K A; 3H8Z A; 2RQR A; 3OMC A; 1QVG S; 4IKF A; 4FSS A; 2QQA A; 1EIF A; 5CKH A; 3JCM d; 1RAI B; 1G2B A; 4M7D G; 2DEQ A; 3PE0 A; 1WHG A; 2ED1 A; 2E3I A; 3VJP A; 2DRK A; 3EGX A; 1M30 A; 3UT1 A; 2ECZ A; 5GMK e; 1FMW A; 2DL4 A; 4PKC C; 1AWX A; 1Q86 R; 5LJ5 e; 2QAS A; 4KGX B; 1N9R A; 4IIO A; 4XTY A; 4M4Z A; 3E1S A; 2HQE A; 2F1L A; 1GXI E; 2K3Y A; 1JJ2 A; 2HQX A; 3JCM g; 4J9G A; 3REA B; 1LPL A; 1OZ3 A; 2RHZ A; 5FRN A; 3CC7 A; 5LJ5 d; 5KYY B; 1YI2 A; 4HT8 A; 1HSQ A; 3BY7 A; 4IUP A; 2ZPG B; 1O75 A; 2KEA A; 3QZ9 B; 1FYN A; 4XTU A; 3I56 T; 2HL3 A; 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4A4G A; 1MND A; 4DQ2 A; 3GLX A; 1B07 A; 1VYT A; 4GY5 A; 1M90 C; 1UGS B; 1QVG P; 1NYF A; 5FU7 C; 4MDX A; 1C6V X; 4QQD A; 4KH0 B; 4RTT A; 2DIG A; 3NMZ C; 1VQ7 T; 9ATC B; 4C0G A; 2F2X A; 1BBZ A; 2VXF A; 4CC2 A; 1N6A A; 2L5Q A; 4L59 A; 3OMG A; 3EFO B; 1UJY A; 3JCM h; 2L0A A; 3JCM J; 5A2Q E; 2COZ A; 1YJN Q; 4KUI A; 5IAY A; 2CP2 A; 1GFD A; 2BE7 D; 2FPD A; 3FC3 A; 4XU2 A; 3KFV A; 4XAX B; 2VGN A; 2LC4 A; 1M1F A; 3NTK A; 1AZG B; 4BY6 B; 3CCL T; 1AWW A; 2KRM A; 2ATC B; 5CIU A; 4RUG A; 3P8B B; 2CZ0 B; 1TU0 B; 3OYI A; 1XTD A; 2X3X D; 3IQL A; 5CKE A; 3JCM b; 2X9H A; 1YCS B; 1M9S A; 2YUQ A; 2E65 A; 4QVD A; 3QKJ A; 4M7A G; 2K2V A; 4J9F A; 4OML A; 5J26 A; 3NPF A; 3TCJ A; 1YJW A; 1H3Z A; 3M0S A; 3A8O B; 3LH0 A; 2L89 A; 1VQL T; 5FRO A; 4ATO A; 1YIJ A; 2O31 A; 4D8D A; 2DD5 A; 3FDR A; 3JAM E; 4FYV B; 5GAO l; 2QEX Q; 2KGT A; 5GMK i; 3R6N A; 3VRY A; 1SSF A; 2D0Q B; 2K6D A; 3RMQ A; 4XTW A; 4BI4 A; 3QSU A; 2DIQ A; 4UC4 A; 1PM3 A; 5IXF A; 3CCU Q; 2QYZ A; 4E47 A; 1ACM B; 4QKU A; 4R56 A; 4N0A C; 1B34 B; 3M56 A; 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