1RBRA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEPCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbrA00
3CQ8A 4XIUA 4C8MA 4FW2A 4BE2A 1LAWA 3QERA 1QE1A 1LWFA 3TAGA 3DOLA 3IRXA 1UA0A 4CIEA 1TK8A 4CECA 3HP6A 3L3UA 1BIUA 3QEIA 3SJJA 1RT6A 1WAJA 2HW3A 4YNQA 2DFEA 4J2DA 1WSGA 3SUPA 1X1PA 1YT3A 4CEQA 4E7LA 1QSLA 3IAYA 4I9QA 1U49A 1KVAA 3NGZA 2P5GA 4CHOA 4FJIA 3KIOA 3LAKA 3NAEA 1NK7A 1RBUA 1D8YA 4DTPA 3NF9A 3ITHA 3SUQA 4BDZA 5HRRA 3VA3A 1HJRA 3KK1A 2PY5A 1VSDA 1A5XA 1IKVA 3V9SA 2E4LA 3RWUA 2X6SA 1NJZA 4FJJA 3VQAA 3QIOA 2HNZA 2G8FA 1NK4A 1B9FA 1ZBIA 4FJ7A 1XHXA 2XY7A 4BWMA 2XHBA 3M8RA 3HVRA 2Y1IA 1C1AA 4PA1A 4CGDA 4MFBA 4Q5VA 4AILC 4Z4IA 3V1QA 5J2PA 4OPKA 1ZBUA 2X6NA 4AHTA 1J5OA 5SWMA 1WLJA 1HMVA 4FLTA 1TGOA 3MXMA 3KLHA 1G15A 3LALA 1J53A 1JXBA 1K6YA 2NUBA 2XRIA 3HT3A 3AV9A 3SQ2A 4E89A 2DFFA 4CEBA 3ZSVA 1C0TA 1EX4A 4GW6A 4B8AB 1YTAA 3V1RA 1IKXA 1VSKA 2RKIA 4O55A 2ZQBA 1U45A 3AVGA 3LPUA 4DTSA 4DFJA 4EZ6A 2RPIA 1VSFA 2IOCA 2KTQA 5KRTA 3V1OA 1S1TA 3F73A 4PQUA 3G0ZA 1NKEA 3TI0A 5FRMA 1JLEA 1KFDA 3AVMA 4EP4A 3WNGA 1J54A 3RRGA 4CHYA 4CFAA 2BE2A 3H08A 3LP3A 1QHTA 1RTHA 2JLEA 4F3TA 3O3HA 4RW9A 4DSIA 2D5RA 3LZJA 1YTUA 3KK2A 3S3MA 4E0DA 2HHWA 3LP0A 4CESA 2D0CA 2YKMA 4DMNA 2PYJA 2F8SA 3CYMA 2Z1JA 4CEFA 3WNHA 4H4OA 2I5JA 1S1WA 3DLKA 4DFPA 3DLHA 4DTUA 1IKYA 1JXEA 3NF6A 4G1QA 5HRPA 3OY9A 1NJWA 4FJXA 5DMRA 2YNGA 1CXUA 4FVMA 1JLQA 3VA0A 4CJWA 4KREA 5HRNA 2IGIA 3LWMA 4CJLA 5CY4A 1S6PA 3ZCMA 3DOKA 1GOCA 3NBPA 4H8KA 4RW7A 4CJSA 3TANA 1SKRA 4PUOA 4AHSA 3HYFA 4LY7A 4DFKA 1HRHA 1RT5A 4NCGA 3VN5A 4CJVA 4CFCA 1C1CA 4M3RA 3HPOA 4ELTA 4HTUA 4DLEA 3QNOA 2ATQA 3E01A 2AJQA 5HROA 3MAQA 4DU3A 2JGUA 3MEEA 4CGJA 4Y1DA 5K14A 2IC3A 5HRSA 4GVMA 3DM2A 3RMCA 5D3GA 1ASVA 4CEEA 3B6PA 4BE1A 5C25A 2HNYA 4RW6A 3BDPA 1XI1A 1T7PA 2OPSA 3O3FA 4NYFA 3LZIA 1KSPA 1MU2A 3KK3A 4CJQA 4DQPA 3AO1A 4B9UA 1HYSA 1FKPA 2RF2A 3LANA 3NFAA 1BHLA 2OPRA 4I7FA 3KKRA 4FJNA 4KHWA 4Z4GA 1WSFA 4IG3A 3C6TA 4C8LA 1WSHA 4EP5A 1NKCA 3AVAA 2G8UA 3JSMA 2EX3A 4Z4CA 3ZSZA 4E7KA 4N76A 1RT3A 3VQ9A 3LWLA 3DLBA 3L8BA 4F2RA 4KI4A 2VG6A 4E7IA 4CFBA 3D0PA 4AHCA 1RBTA 5JS1A 4W5QA 1VRUA 3BGRA 3HL8A 3B6OA 4HUFA 3SQ1A 3VQ5A 3P83D 2FBVA 4E1MA 3V81A 4KB1A 4M3XA 4AHRA 4N47A 4M3YA 3PV8A 4DWIA 2EHGA 4FLZA 2OZMA 2HHVA 5FROA 1ZBLA 4ZTFA 3I0SA 4KKOA 3PO4A 3VQEA 3VQPA 3AO3A 1RCHA 1C6VA 4AHUA 5KRSA 3V9ZA 1JL2A 4E7HA 1L5UA 3V9UA 4NCBA 2FBYA 4N56A 4C8OA 4CJUA 1RTIA 3SZ2A 1WSEA 3U3GA 4FLYA 1QSSA 4Z0UA 3MEDA 1YVUA 4CIFA 4CJRA 4DLGA 1LW2A 3NH1A 3O4QA 4FZZA 1KCFA 2G8IA 3HO1A 3OYLA 4HHTA 5C24A 1I3AA 3EZ5A 1TL1A 1J9AA 2HHXA 4AH9A 1BI4B 2YNIA 3U6FA 4FM1A 1NK6A 4AHVA 1LWEA 1A5WA 3VQBA 2QK9A 4HVJA 5J2NA 1TK5A 4Y1CA 3PX4A 3K5MA 1TKDA 3V4IA 3SI6A 3MXJA 1QS4A 4CE9A 3SQ4A 2P5OA 2FBTA 3NGYA 1F21A 1LV5A 1QQCA 3QINA 4B9VA 2O4IA 4N5SA 2VWKA 3ZSYA 4CJKA 4E3SA 1BI4A 4JRPA 4B9SA 4DSFA 4KAZA 3AO4A 1HNIA 4BWJA 3LDSA 4RW8A 1NOZA 4E1NA 4LSNA 4CEAA 3TARA 1RT4A 4N41A 3KLEA 4FK0A 3RMAA 5KGXA 3EY1A 2A1RA 2KQ2A 3UIQA 3AVFA 5CYMA 4IFVA 4CK2A 1KTQA 1RBVA 3QESA 3QNNA 5KGWA 3HK2A 2ZD1A 4DTNA 1S9EA 2X78A 5HP1A 4FLWA 4CK1A 2R7YA 4FZXC 4FK4A 3PX0A 4OVLA 4FXDA 4I2PA 1L3VA 4NCAA 4CEOA 3VQ6A 1ASUA 3SCXA 4DQIA 2FC0A 3V9WA 3OYBA 3CFRA 2GV9A 2VWJA 5KI6A 1LW0A 4KTWA 2G8HA 4KTQA 5T7BA 4FCYA 3RTVA 2XY5A 1ASWA 1TL3A 4CGFA 2E6MA 3CFOA 1U4BA 3TWHA 3QIPA 4CHNA 4BACA 3ISNC 4KO0A 1A5VA 1UAXA 1EP4A 1KVBA 2D0BA 1JLBA 3KLIA 3OS0A 1QTMA 1GOAA 4IBNA 4M3UA 4CIGA 1VSHA 1JLCA 4CF9A 3RMBA 2P51A 3VQ7A 1Q9YA 4B8CA 2LSNA 1O1WA 4FJ5A 1CZBA 1C0MA 4B08A 1IH7A 5KTQA 4ZHRA 1T03A 2DTUA 3O4NA 2OPPA 4HUEA 1NJYA 2ETJA 3TAPA 4CFDA 1L3TA 2P1JA 1U04A 1VSLA 4NYNA 1IG9A 4DSKA 4FJKA 2F8TA 3PX6A 1W0HA 3I0RA 3C95A 4JS5A 1KLNA 1BQNA 2HHQA 2G8VA 4O5BA 3P1GA 1Z26A 3ZT1A 2HMIA 4FK2A 4DF4A 2ITGA 1VSEA 4KHSA 1RDAA 4DG1A 1CLQA 4Q0BA 1WNSA 3HXMA 3M8PA 3KD1E 2IS3A 4FLXA 3TAEA 1S1XA 5EU7A 2F96A 4B9NA 1CZ9A 2Z1IA 3NHGA 1HQUA 5J2MA 4CHQA 1RT2A 4JS4A 4KFBA 4CHZA 1JLFA 3D45A 3ULDA 4O44A 5J1EA 4FM2A 1S9GA 5I42A 4DSEA 1T8EA 1ZBHA 3QEWA 3IG1A 3L2WA 3KJVA 3HPHA 3S9HA 1SKSA 4HUGA 1XC9A 2IDOA 3ZSXA 4DS4A 4KB0A 5SZTA 2PYLA 3OYFA 1ZBFA 1VK0A 2B5JA 4CHPA 3DLGA 4DTJA 2ZE2A 2GBZA 3QEPA 3IS9A 4LD0A 3KLFA 4IDKA 3LPTA 1X9MA 2OA8A 4FM0A 1LAVA 2KZZA 3MEGA 3NDKA 1L3SA 1RT1A 3T19A 3NF8A 4DQRA 4ICLA 1RDBA 1TAQA 1EXQA 3SYZA 3K5OA 1JKHA 3OYMA 3WNFA 1TVRA 1HNVA 2YNHA 1TKZA 1VRTA 3NE6A 3HJFA 3AA2A 2HB5A 4KPYA 3HM9A 2Z1HA 3L2UA 3DI6A 4MQ3A 2WOMA 4M45A 1RNHA 4C8KA 1JLGA 2W42A 3QETA 4O0JA 2PZSA 1DTQA 1VSJA 1SUQA 3SNNA 3JYTA 3AO2A 3L3VA 1N6QA 1NOYA 3TAMA 4CCHA 1FXXA 3LP1A 4B9MA 3AVLA 4GMJB 4YFUA 1TV6A 1S1UA 4OKEA 3OYKA 3OJUA 4I2QA 4O4GA 4DTMA 1BGXT 5C42A 1ITGA 1C1BA 1LWCA 3P5JA 4OKJA 1W9HA 3OS2A 3CFPA 4DF8A 2HHTA 4KRFA 2KFZA 1Z25A 4B3OA 2D0AA 2XO7A 3ZSWA 4W5OA 4CJ4A 1S5JA 3OYGA 4Z4HA 3RR8A 1WAFA 3KLGA 3SV4A 2G8WA 5HBMA 4M3TA 1XWLA 1B9DA 2DY4A 3VQDA 3PY8A 3HPGA 4BDPA 1IO2A 3CG7A 1FKOA 1L3UA 3CM5A 2FBXA 3S3NA 1QSYA 1SV5A 1RILA 3O3GA 3LP2A 4OGCA 3MXIA 1WN7A 3QEXA 2GUIA 3CM6A 4DU1A 1WSIA 3AA5X 3NH0A 4Z4FA 4LH4A 3DYAA 1RTJA 4DQQA 1RTDA 4CJ5A 3OYIA 3V6DA 4J2AA 3DRPA 3RRHA 3AVNA 4CF1A 2HVHA 2OYQA 4KHQA 3OYAA 4OGEA 4DTXA 1HYZA 2YNFA 3OYCA 1D9FA 2BDPA 1UA1A 2YV0X 4DFMA 1HPZA 4CGIA 4FZYA 1C0UA 3A2FA 1JLAA 3ZT4A 1XHZA 4FJLA 4F8RA 1TKTA 4CEZA 1BCMA 1D5AA 1X9SA 4HCCA 3QO9A 3AVKA 5I3UA 4QAGA 3PO5A 4DU4A 4E19A 3K57A 1KLMA 1IKWA 1JL1A 4IG0A 3HP9A 4RW4A 4RG8A 3SV3A 3DLEA 4ID5A 3TR8A 4J2EA 1U47A 3MECA 4OLAA 1R0AA 1S6QA 4ELVA 2IAJA 3V9XA 1RBSA 1UWBA 5CYQA 3ZSOA 1GOBA 3ZSRA 2QKKA 2VG5A 5FRNA 3OYHA 4CGGA 4DSLA 1CXQA 3K58A 4F2SA 4CJEA 4JLHA 4O0IA 3T3FA 4B9TA 4F3OA 3TABA 3HVTA 3VQ4A 1NK5A 3T1AA 1X9WA 4M42A 3OVNA 3OYJA 3AO5A 4LSLA 3KKSA 2YHAA 5JS2A 1KRPA 1RBRA 2A1SA 4J2BA 2HNDA 4B9LA 3K59A 4CJTA 2HVIA 4KTZA 3C94A 4CJPA 2E6LA 1KVCA 3QEVA 3KD5E 4BDYA 4KHYA 1Y97A 2Y1JA 2QKBA 1EETA 4CERA 5CZ1A 3L2VA 4DTRA 2OZSA 4HCBA 2HHSA 3ZT3A 1DTTA 2G8KA 1VSIA 2RN2A 4ZTJA 1DLOA 4FJ9A 3AA4A 4CF2A 4M3ZA 2XY8A 2KZMA 4KV8A 4KHUA 3DLRA 1U48A 1Q8IA 4FJGA 3KTQA 3L2RA 4FJ8A 2WONA 3DMJA 3VQQA 1NK8A 3G10A 3AVHA 3DRSA 4OKKA 1RT7A 4JRQA 1TKXA 1BIZA 4CK3A 3OYNA 5J2QA 1KFSA 3L2QA 4KHNA 4KI6A 5DK5A 1Q9XA 3QLHA 1SL1A 2VG7A 4C8NA 2KW4A 3FFIA 3PUFA 1TAUA 3RR7A 4K8XA 5FDLA 5E41A 2BANA 3SUNA 3TAFA 2XY6A 5CZ2A 3THVA 4BE0A 3AVIA 4ELUA 4WE1A 3ZT0A 3NGIA 2DFHA 4DTOA 2Z1GA 3AVCA 4CF8A 4I9LA 4PWDA 3K5LA 2YKNA 3TAQA 4DS5A 3SQ0A 4EZ9A 3NCIA 3RMDA 1BL3A 3K2PA 3SPZA 1D9DA 1UOCA 3ASMA 2O4GA 2BGGA 3OS1A 4H4MA 1TK0A 3ZSQA 4DSJA 4FJMA 3AA3A 3DRRA 4LH5A 4DQSA 3EYZA 1I39A 1EKEA 2B4JA 3LAMA 4W5TA 4QOZB 1BISA 4R5PA 4UQGA 3OYDA 1T05A 1RDCA 1SL0A 3M8SA 1N5YA 4TSXA 4CGHA 3AVBA 1SL2A 1SKWA 4M41A 4QCLA 1BQMA 3I8DA 1WSJA 4IKFA 3F9KA 1HQEA 4PY5A 2YHBA 1ZYQA 4ID1A 4IFYA 3VQ8A 4OLBA 1VSMA 3SUOA 4L8RB 3U3YA 4CJ3A 5HLFA 3ALYA 4CF0A 2B6AA 3M8QA 3NF7A 3S3OA 4K8ZA 4Z4EA 2HHUA 3WNEA 4CJFA 4OPJA 4W5NA 3OYEA 1RDDA 4M3WA 1REVA 3ZT2A 1BCOA 4E7JA 1NKBA 3SPYA 3AVJA 1NK0A 1NJXA 2QXFA 3VQCA 4OJRA 3NH2A 3OJSA 3K5NA 1NK9A 2KFNA 2Q3SA 1HYVA 1B92A 4W5RA 2OPQA 2X74A 4FW1A 1S1VA 1FK9A 4CEDA 4FLUA 4FLVA 3HSTB 4FJHA 4FYDA 4F4KA 3C6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WUHA 4FW2A 3CCEN 4JHDB 1T44A 5IWAK 1LWFA 3THWA 1TK8A 1BIUA 4JI1K 3SJJA 5GIOA 4CZFA 4H0XB 4JHDA 3O1BA 5AQPA 1KVAA 3LAKA 3NAEA 3ITHA 3JS6A 3SUQA 4BDZA 5HRRA 4A59A 1IBKK 3VEZA 3QFUA 3RWUA 3FFKB 1NK4A 1B9FA 1H1VA 4JKCA 3O80A 2XY7A 1ATSA 1W2BM 4PA1A 2ZGZA 3HTVA 4MFBA 4Q5VA 4BRCA 3EN9A 5AQHA 2GUPA 5J2PA 1WLJA 2A41A 1NG9A 2Q31A 1G15A 3LALA 1K6YA 2NUBA 3MN6A 4CEBA 1EX4A 4GW6A 1YTAA 2KLAA 3IMXA 3MCAB 4C23A 4O55A 2ZQBA 3FR0A 4DV2K 3LPUA 4DTSA 4KHPK 3QDKA 3AY9A 4BGBA 1VSFA 2KTQA 3V1OA 3G0ZA 5AZIB 3CCMN 3TI0A 3N4PA 1IBLK 5FPDA 1J54A 4CHYA 1RTHA 2JLEA 4F3TA 4DSIA 4GKKK 1YTUA 3KK2A 3DWLA 4CESA 2D0CA 5AZIA 2JWLA 2F8SA 2RE2A 3WNHA 5MLCQ 4DFPA 3DLHA 1N8RO 5GAGP 1IKYA 4ISFA 3NF6A 4CBWA 2ZJPL 3NMUA 2CGJA 1NGAA 2D0OA 3LWMA 5DM7L 2Q36A 2NRWA 4RW7A 4CJSA 4DV1K 4H5TA 4PUOA 3LDPA 3VN5A 4CFCA 4H5WA 4FPBA 4GNIA 3WXIA 3E01A 4O8UA 3MAQA 4DU3A 4Y1DA 5AQLA 3RMCA 3DM2A 3A5MC 5D3GA 4BE1A 4RW6A 3BDPA 3QBWA 4WQ5C 2E2OA 1BO5O 5ADXA 1D4XA 3O3FA 3KK3A 1RDUA 4MDAA 1FKPA 3LANA 1BHLA 4JEPA 1HPMA 1WSFA 3AVAA 5LY3A 5JVGL 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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