1RBUA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADNKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbuA00
1B9FA 1RBRA 1KSPA 3S3MA 3MXJA 4E7HA 4B9LA 2FBTA 2KZMA 1VSHA 4R5PA 4F3OA 5SZTA 2PY5A 3JYTA 4F8RA 4DS4A 2GV9A 4F2RA 1BCMA 1WSEA 3ZCMA 1U47A 3AO4A 3NGYA 4DQSA 4FVMA 3HPOA 4ELTA 1WSFA 3VQ8A 4OPKA 3NAEA 4C8MA 5HRPA 1SV5A 1NJWA 3K5MA 4H4OA 1S1VA 2OZSA 3L2QA 1C0UA 3SUOA 3QNNA 4FZXC 4DU4A 4CF0A 1YT3A 4CJUA 1VSFA 3NGIA 3RMCA 1O1WA 3QIOA 1ZBLA 4CHYA 1U48A 3A2FA 1C0MA 3S3OA 2LSNA 1ZBFA 4O55A 3DYAA 4OGEA 1TK8A 4FLTA 3LP0A 4CJ4A 1B92A 3QLHA 4IFVA 2HVHA 4AHVA 3V4IA 2NUBA 1S9GA 4BE0A 1RDBA 5JS1A 1CZBA 1RDCA 3DLHA 3LZIA 4DSKA 3PY8A 1Y97A 2BDPA 3RR8A 4CJWA 3U3YA 1TGOA 3V9ZA 3QEIA 5I3UA 4FJNA 4O44A 1CLQA 4B9TA 1Q8IA 4H8KA 4KTZA 4O5BA 3OYIA 3ZSOA 4HVJA 4E3SA 3RR7A 3VQQA 3NCIA 2G8IA 3ALYA 1UOCA 4KRFA 2WOMA 3MEEA 3RRGA 2HHSA 4OKKA 4IG0A 4LSLA 4FJMA 3OYGA 3VQ5A 4QAGA 4B3OA 4NYNA 4FLZA 3KK1A 3NHGA 2YNGA 1EP4A 3NF9A 1KVCA 4KB0A 3KLIA 1UA0A 3V1OA 2HNZA 3P1GA 4W5OA 2B5JA 4CEFA 1NK4A 3AVGA 2Z1HA 3NBPA 4M41A 2FBVA 3KK3A 3S3NA 1U4BA 2DTUA 1EKEA 1TAQA 3LAMA 3HP6A 1RNHA 4Z4CA 2BANA 5C42A 4C8KA 4KB1A 3P5JA 2B6AA 4FW2A 5K14A 1S1UA 1C6VA 2Z1GA 3IG1A 4EP4A 2GBZA 4FJ8A 1KTQA 2W42A 3L2RA 1VRUA 3ZSWA 4PWDA 4PY5A 3LAKA 1I39A 3VN5A 4I7FA 4FXDA 3KLEA 3HL8A 2BGGA 2QXFA 4IG3A 3HT3A 4Z4IA 3TR8A 4E1NA 2HVIA 1IKVA 1LAWA 2PZSA 4FLXA 1WSHA 2HNYA 2E6MA 3AVMA 1S6PA 2YNFA 5C25A 3SQ0A 1IG9A 2EX3A 3MECA 1WAFA 4NCGA 4LSNA 1JLFA 2XHBA 4O0IA 4FJ9A 2AJQA 1TAUA 4CF8A 1W9HA 1NK0A 1LW0A 3ZT0A 2DFEA 3L2VA 3EY1A 5DK5A 3QEWA 1QSYA 4FLUA 2E4LA 4LY7A 3VQ4A 4CHPA 2R7YA 1RT2A 4CF1A 1TKDA 3AA2A 4BDZA 1KRPA 3G0ZA 1T03A 1BHLA 1MU2A 1RTHA 1TV6A 3AVKA 1D8YA 2IC3A 4ELUA 1LW2A 1RT6A 4OJRA 1T7PA 3PV8A 3MEGA 1EXQA 2JLEA 3KTQA 5FRMA 4F3TA 5I42A 1TKZA 2VG7A 3KD5E 4EZ9A 4HCCA 5J2MA 1JXBA 3VQ6A 4AILC 4DSIA 4CJ3A 1QTMA 3C94A 4CJVA 5SWMA 3PX6A 3V9XA 4LH4A 3HJFA 3AVFA 2G8VA 3QEVA 1SKSA 4HCBA 3SUPA 3SQ2A 1A5XA 1SKWA 2G8UA 4DTRA 4HTUA 4DTPA 3SQ4A 4CEZA 2I5JA 4JS5A 1XWLA 4W5RA 4KHWA 3VA0A 4FZZA 4CJSA 3KKSA 4CFBA 4E89A 3K57A 1X9SA 4B9NA 3MAQA 3L8BA 1TK0A 4FM2A 4E7IA 3AVLA 3VQ9A 4CK3A 2FC0A 3V9UA 4DQQA 4M3XA 3MXIA 3AVBA 4CGHA 3THVA 3AVCA 5DMRA 4DLGA 1R0AA 4CHZA 4CCHA 3DMJA 4FJ5A 1J5OA 4FJHA 2D0BA 4K8XA 1Z26A 3T3FA 1ZBHA 1RT1A 3ZT3A 4FZYA 1U45A 3L3UA 5CYQA 4O0JA 3QINA 3TANA 3AVAA 1T05A 3NF8A 3OYFA 1WAJA 3LP3A 4BE2A 1HQUA 5HRNA 4B08A 4L8RB 1RBTA 4LH5A 1WSJA 4M3TA 2PYLA 2XY8A 3DLRA 4KV8A 3SI6A 3OYBA 1RTJA 5CY4A 3DRPA 4CE9A 3V1RA 4QCLA 5FDLA 4AHTA 4OLBA 4CIGA 2OPPA 4MFBA 3LZJA 1L5UA 1XHXA 4IDKA 4ID5A 1QHTA 3FFIA 4CFCA 2EHGA 3TABA 3RMAA 4KI4A 3NF6A 1BCOA 1RDDA 3AA5X 4DWIA 4KKOA 3VQ7A 1XHZA 4B9MA 5KGXA 1WN7A 3SJJA 1NKBA 3OS0A 3OS1A 1XC9A 1Z25A 4B9SA 3NDKA 3JSMA 3TARA 4JRPA 1CXUA 3OJSA 2G8WA 4Y1CA 4FJKA 4M45A 4CHOA 3SNNA 1NK8A 4FM0A 3HVRA 3ZSXA 4J2EA 2HHXA 3QETA 2HNDA 2XY7A 1GOAA 3LANA 1VSIA 3EZ5A 3WNHA 3DLEA 1VK0A 4HUFA 1TK5A 3CFRA 3VQCA 1BI4A 1SKRA 3KK2A 3B6PA 3L2WA 1NJXA 1QS4A 2YNIA 4H4MA 3TAFA 1NK9A 3BDPA 4E7JA 3LP2A 4Z4FA 1LWEA 3K5NA 4J2DA 4KI6A 1JLGA 4CIFA 4I9LA 4M3YA 3LPUA 3DRRA 4EP5A 4Z0UA 3K59A 1LV5A 2RN2A 4W5NA 1S5JA 1NK7A 1IH7A 3PUFA 1D9DA 4DFPA 1BQMA 2G8FA 1JLBA 2X6NA 1C1CA 3MEDA 3PO5A 5CZ1A 1N6QA 4CJKA 4CFAA 4CK2A 4JLHA 3M8RA 1BGXT 3CFOA 3HK2A 1K6YA 4XIUA 2HB5A 3TAGA 2DFHA 3RRHA 4FJGA 1DTQA 3CM6A 1XI1A 2YV0X 4B8CA 4DLEA 4Q0BA 2O4GA 1QSLA 1J54A 3T1AA 4DU3A 1T8EA 4Z4GA 2KTQA 3S9HA 3ITHA 2VG5A 4C8NA 2BE2A 4E19A 3O3HA 1UWBA 2DY4A 3NGZA 2D5RA 3CG7A 3O4NA 1SL2A 4BDPA 3BGRA 4AH9A 3LWMA 4FJXA 2A1SA 3NF7A 4DTMA 4MQ3A 3V1QA 1NK5A 1NJYA 1RILA 1VSLA 1EX4A 2WONA 1BI4B 3K58A 4CHQA 3V9SA 4QOZB 3LDSA 1NKEA 3OVNA 4CJQA 3HPHA 3OYDA 1NKCA 4IKFA 4FJLA 3O3FA 2HMIA 3OYAA 3DLKA 3ZSZA 1W0HA 4RW4A 2X78A 3O3GA 4DSFA 1A5VA 4W5TA 4CF2A 4FK2A 4OKEA 3QNOA 2YKNA 3RWUA 1LWCA 4F2SA 1KFDA 1JLQA 1WSIA 4OVLA 2IGIA 4OLAA 5FRNA 1FKOA 4C8LA 5D3GA 4CJFA 4M42A 2ATQA 1FXXA 3KIOA 1L3TA 3P83D 2PYJA 2P5OA 5KRTA 1KLMA 3VQDA 1S1XA 2YHAA 3SV4A 3RMBA 3QEXA 3AVIA 4C8OA 1HQEA 1LWFA 1TVRA 3AA3A 4M3WA 3OY9A 4IBNA 4HUGA 1C1BA 1ASUA 3ULDA 2XRIA 4WE1A 1SUQA 3F9KA 2B4JA 4AHRA 1QSSA 3CM5A 1HYVA 1YTAA 1TL1A 4RW8A 4N5SA 3OS2A 3KLHA 2XO7A 4RW6A 4CJEA 1KVAA 2JGUA 1NK6A 4M3RA 3CFPA 4FLVA 4DSLA 1JXEA 3ZT2A 1RT4A 3IS9A 2IS3A 2FBYA 3C6TA 3K5OA 3VQEA 4CJTA 1F21A 2O4IA 4FLWA 4AHUA 4DQIA 3NH0A 4ELVA 4DTSA 2VG6A 2ZQBA 4CESA 2OYQA 5KI6A 5HRSA 4KPYA 2HHQA 3HM9A 2X74A 2HHWA 5EU7A 1VSKA 3VQBA 1QE1A 1IKXA 4CEOA 3PX4A 2X6SA 2ZE2A 3KKRA 3AO3A 3WNEA 2Y1IA 4B8AB 3E01A 4CHNA 4DTNA 4KTQA 2HHVA 1NOYA 1RT5A 2KW4A 4KHNA 2D0CA 4AHCA 3VQPA 2P1JA 4AHSA 4OKJA 4HUEA 5J2QA 2YNHA 1RTDA 5CZ2A 1RCHA 4RG8A 4CJ5A 4I2QA 3MXMA 4DTJA 4NCAA 2IDOA 4IFYA 1WNSA 4Z4HA 2KQ2A 3EYZA 4BDYA 4FLYA 1JL2A 3VQAA 4CEAA 2XY5A 4FJ7A 3I0SA 4DTXA 1S1WA 1ZBIA 1J9AA 2KFZA 5CYMA 1U49A 3SPZA 3OYLA 3OYMA 3AVJA 3U3GA 4CK1A 3O4QA 3IAYA 3I0RA 4N76A 1TL3A 2Z1IA 4DMNA 5FROA 3V9WA 3VA3A 4KHUA 5C24A 4FYDA 2RKIA 4K8ZA 1YTUA 1B9DA 4CGFA 1DLOA 4OGCA 4RW9A 1IO2A 1LAVA 2OPRA 4CERA 1VSMA 3AO2A 1TKXA 4BWMA 3LWLA 4DS5A 3DRSA 3SPYA 2DFFA 1JLAA 3M8PA 1N5YA 1BIUA 4O4GA 3QO9A 3DI6A 4ZHRA 1A5WA 1WSGA 1GOBA 5HRRA 1UAXA 3RTVA 4DTUA 1X9WA 3UIQA 3HPGA 3AVNA 1VRTA 4PQUA 4YNQA 1ASVA 2GUIA 4KAZA 3LALA 4RW7A 1KLNA 4KFBA 4DQPA 1RBUA 4LD0A 4I2PA 5J2NA 3ZT4A 4UQGA 3OJUA 2HHTA 1I3AA 4CEEA 4KO0A 1ASWA 1D5AA 1JKHA 4Z4EA 4FK0A 1ITGA 2Z1JA 1TKTA 1KVBA 5J2PA 3NFAA 4E1MA 3D45A 4I9QA 4FJIA 1BISA 3OYNA 1S1TA 4G1QA 3DLGA 3NH2A 4CIEA 4J2BA 2ZD1A 4BWJA 4DQRA 3NE6A 2OA8A 2KFNA 1RDAA 4DSEA 4EZ6A 4NYFA 4DF8A 4B9UA 4E7LA 2P5GA 1HNIA 3M8SA 3SZ2A 1WLJA 2VWJA 3H08A 4DFJA 3TAPA 4FW1A 1IKWA 4GW6A 3PX0A 1QQCA 2OPSA 3DLBA 3M8QA 3ZSRA 3C6UA 3SV3A 4NCBA 3DOLA 5JS2A 3KJVA 4CEBA 1Q9YA 5J1EA 5KRSA 1S9EA 4JS4A 4FCYA 3QERA 1L3VA 1L3UA 4CJLA 1Q9XA 4DSJA 2RF2A 4CFDA 1S6QA 3L2UA 3RMDA 2QKBA 3AV9A 4CEQA 4DFMA 4KREA 1CXQA 5KGWA 3WNFA 3NH1A 3ASMA 3WNGA 3IRXA 4CF9A 3OYEA 3HYFA 1C0TA 1ZBUA 3HP9A 3KD1E 1HNVA 1RT7A 2E6LA 3F73A 4TSXA 4YFUA 4PA1A 3TI0A 3T19A 1HPZA 3QESA 3I8DA 3V81A 1ZYQA 4GVMA 4ZTJA 4DTOA 3SYZA 1VSDA 1BQNA 4M3UA 2IOCA 4FM1A 4KTWA 4DU1A 4FK4A 2OPQA 3OYHA 4ICLA 2G8HA 4CGIA 2HHUA 2YKMA 1J53A 3PO4A 2ITGA 3DM2A 1NJZA 4KHSA 1KCFA 1VSEA 2D0AA 4N41A 4Q5VA 4FJJA 4CJRA 2Y1JA 3AO1A 3TWHA 4CGGA 4B9VA 1GOCA 1VSJA 1C1AA 4DF4A 4ID1A 2KZZA 1U04A 4CGJA 2HW3A 1HRHA 3CQ8A 2F8SA 3AA4A 4OPJA 1JLCA 4JRQA 1G15A 4F4KA 1SL1A 1DTTA 3KLGA 1D9FA 2P51A 3KLFA 4DG1A 3SUQA 1REVA 2IAJA 2OZMA 4BACA 3K5LA 3TAMA 4KHYA 3ZSQA 5KTQA 4HHTA 1KFSA 1BL3A 1X1PA 3G10A 4CEDA 3V6DA 1L3SA 4E0DA 3QEPA 4KHQA 2F8TA 1HYSA 2XY6A 3AO5A 3LP1A 1HYZA 4GMJB 5HBMA 3SUNA 4J2AA 1NOZA 2ETJA 4BE1A 1IKYA 4M3ZA 4CGDA 1BIZA 3HXMA 1JLEA 3HVTA 4PUOA 1RBVA 2RPIA 4E7KA 1RT3A 3AVHA 1YVUA 3ISNC 2VWKA 3L3VA 5T7BA 3LPTA 3TAEA 2Q3SA 3OYKA 4CJPA 5E41A 3C95A 3ZSYA 3QIPA 3D0PA 5HROA 1UA1A 1HJRA 2A1RA 3HO1A 1SL0A 3U6FA 1JL1A 3SQ1A 1RBSA 3K2PA 3SCXA 2FBXA 1RTIA 4CECA 3ZSVA 2G8KA 3OYCA 1X9MA 4W5QA 4N47A 4N56A 4ZTFA 5HLFA 1CZ9A 1HMVA 4Y1DA 2F96A 3HSTB 3B6OA 1FKPA 3OYJA 3TAQA 3ZT1A 2QKKA 2QK9A 1EETA 5HP1A 3CYMA 3DOKA 1FK9A 2YHBA 4DFKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A0IX 5KQDA 2FBTA 2W41A 1VSHA 4R5PA 2KZMA 5SZTA 3BEXA 3BF1A 1KQSM 3NGYA 4RTFD 1WSFA 4OPKA 2YX6A 3T7ZA 5HRPA 3OTOK 2QWRA 1S1VA 1XMOK 1HPMA 2UXCK 4CJUA 1VSFA 3NGIA 3WQUA 3QIOA 1ZBLA 4CHYA 3A2FA 5BPNA 1YJWN 4JKDA 2LSNA 1ZBFA 3U8XA 1ZXOA 4BRAA 1B92A 4BVPA 1FJGK 4A2BA 4NLCA 3ATUA 4BRHA 3WEEA 3U3YA 1TGOA 1WUAA 3V9ZA 2WC9A 5EY4A 1Q8IA 5EX5A 5FPMA 3VGKA 1OH8A 1UOCA 1NM1A 2NRZA 4KRFA 2HHSA 4H5VA 1XQSC 4IG0A 4IOAL 4FJMA 3L0QA 3NHGA 2O8EB 2YNGA 1EP4A 5AQVA 3OBWA 2CGJA 1NK4A 3AVGA 3NBPA 1U4BA 2FBVA 1P90A 4YDUC 4CZMA 1EKEA 4IO8A 4Z4CA 4WF9L 4G9ZA 3OA9A 3P5JA 3ZEUA 3O9RA 4BGBA 3FZHA 2W42A 4PWDA 1VQ4N 4IFEA 5TKYA 1I39A 3VN5A 2UU9K 4I7FA 3VEZA 3AGRA 1IKVA 1LAWA 3M6GA 2D1KA 5C25A 2EX3A 1WAFA 1BA0A 3CI5A 4FWMA 5IWAK 4LSNA 3CCLN 1TAUA 2I7PA 2DFEA 3J80O 3QEWA 2E4LA 4LY7A 3VQ4A 1RT2A 4CF1A 3AA2A 3G0ZA 1W2BM 2I7NA 1MU2A 5BRDA 4ELUA 1N36K 3MEGA 2EWSA 2QWNA 1VQ9N 2Q36A 5FRMA 5I42A 3J8AA 4BQLA 2VG7A 3VOVA 3AAPA 5J2MA 3MN5A 4AILC 5SWMA 4JI6K 4HCBA 1A5XA 4HTUA 1SZ2A 3ZX3A 4R79A 3EL2A 4E89A 3K57A 1VHXA 2CGLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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