1RNHA

Structure of ribonuclease h phased at 2 angstroms resolution by mad analysis of the selenomethionyl protein
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
151
structure length
151
Chain Sequence
LKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
publication title Structure of ribonuclease H phased at 2 A resolution by MAD analysis of the selenomethionyl protein.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 43
structure length 151
sequence length 151
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1990-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rnhA00
2YHBA 4RW6A 1JL1A 1S6QA 1Q8IA 3LAMA 3LP3A 4CJRA 3OYBA 3VQQA 1GOAA 3HPGA 4I2QA 3K5NA 1U45A 4B9NA 3KK1A 3NE6A 3HYFA 3LZJA 4W5TA 1A5WA 1BISA 3AVMA 4CJFA 3MAQA 3SJJA 4BE2A 1NJYA 1BQMA 4CJWA 2G8WA 2F8TA 1XHXA 3KJVA 3D45A 1TKZA 1ASWA 3HK2A 4DTRA 4KO0A 4I9QA 1J9AA 4CK1A 4KTZA 1C0UA 4LD0A 4CHPA 4BDYA 3EY1A 1C1AA 4CF0A 1QHTA 4DG1A 3PY8A 1YVUA 2OYQA 1NK0A 4J2EA 2BDPA 2Z1IA 1W0HA 4E89A 4DQSA 4FJGA 4TSXA 4Z4HA 4FXDA 3ZSZA 4JS4A 3LAKA 4M3UA 1X1PA 3RMDA 4PY5A 3OYFA 4DTSA 2HB5A 5I3UA 4PUOA 4PWDA 1JLQA 3HO1A 4N47A 1T03A 2HNYA 3K5LA 3M8SA 3LPUA 3ZT3A 1LWCA 5C24A 1WN7A 1D9DA 2DFFA 3V1QA 4FLUA 4DU4A 3OJUA 3EYZA 1ASVA 4FLXA 3SUPA 1BIZA 1CLQA 1JLFA 3C6TA 3NGYA 3VQBA 2A1RA 4CHYA 1UA0A 4E7KA 4EP4A 3K2PA 2A1SA 2YV0X 4FJNA 4FW2A 1HJRA 1FKPA 3D0PA 1SL1A 3IAYA 2IAJA 4EZ6A 4FZYA 1XHZA 3WNEA 4FJ5A 3ZSWA 2IC3A 4M3XA 1EETA 1S5JA 4OKEA 3V4IA 2O4GA 3V81A 3C95A 4O44A 4EP5A 4C8LA 4IDKA 2YNHA 3CM5A 4FLTA 1KVBA 1RT5A 1VSDA 1Z25A 4HUFA 2W42A 4DS5A 1VSEA 2X6NA 3HP6A 4CCHA 5J2QA 2XRIA 3OYNA 2YNFA 4NCBA 1O1WA 4HUEA 3V1RA 2G8HA 3DLGA 2D0CA 4CJKA 3PX6A 1C0TA 4RW9A 4DS4A 4DU3A 4B08A 4OPJA 3TAFA 3JYTA 1G15A 2ETJA 1SV5A 4C8NA 1VRUA 2WONA 2P1JA 3CG7A 3KIOA 4CEDA 5HLFA 1N6QA 4CEBA 3OYCA 3TAMA 2P5GA 4KPYA 3DLKA 3OS2A 4MQ3A 1S6PA 2G8KA 3DRPA 5CYMA 3L2WA 1J53A 1ZBFA 4KI4A 1U4BA 3SUQA 2FBVA 4GW6A 1TK0A 4N56A 4PA1A 2G8VA 4AHCA 1HYVA 4M41A 3HM9A 1S1XA 1NKCA 3P83D 2B5JA 2YKMA 3QLHA 4CFAA 4CEZA 4CIFA 3HVRA 1JXBA 3HT3A 4N41A 3AO2A 3ULDA 1N5YA 3QEVA 1L3VA 1J5OA 3ZT4A 3WNGA 3IRXA 2NUBA 3AA4A 3ZSRA 4CESA 3RMBA 1LAVA 1RTDA 5HRPA 3AV9A 1B9DA 1DTTA 1UOCA 3ZT0A 1NJZA 1IO2A 2LSNA 3ZSXA 4KHUA 4CK2A 3DRRA 1I39A 1BI4A 1ZBHA 2PY5A 3SNNA 4BDZA 1D9FA 4FK0A 3CM6A 1T05A 4E7LA 2X74A 3AVCA 3NH2A 1TKTA 2QKKA 5FRNA 2HHQA 4OKKA 4KHWA 1SKRA 3L2RA 5J2NA 4DFKA 1BL3A 3KKRA 4FM1A 3NGIA 1SUQA 3CFPA 1JKHA 3M8QA 4ZHRA 1U47A 4M3YA 3SUOA 1BGXT 4C8OA 2KFNA 4H4MA 1HQEA 1BI4B 3OYDA 1NK4A 4Z4GA 1CXUA 1LW2A 3OYIA 3LP1A 2F96A 4ICLA 1JXEA 4M45A 1GOCA 4B9UA 4Z0UA 1HYSA 4OJRA 3CYMA 3KLEA 3RRGA 3TAQA 1ASUA 3RR7A 2GBZA 2ZQBA 3NH0A 3UIQA 4FJLA 1RT2A 3KD5E 3ITHA 3KD1E 2ZD1A 4B9LA 4ELTA 3DOLA 3F9KA 3PX4A 4DSEA 2D0BA 3AVLA 5HRNA 1NJXA 1D8YA 3LZIA 3VQEA 3PV8A 3THVA 1A5XA 1W9HA 3AVIA 4HCBA 1JL2A 2XY6A 1IKYA 4W5QA 1SL2A 4C8MA 2RPIA 3WNFA 1S1UA 2HNDA 1RBSA 5FROA 4DTUA 2ATQA 4E7IA 3OYEA 1IG9A 2KZMA 1YT3A 4H8KA 1EP4A 3NH1A 1L3UA 4CK3A 1CXQA 1EXQA 1VK0A 4FM2A 4F4KA 1Y97A 1C1BA 3CFOA 3NF8A 4NCAA 4AHUA 2RF2A 4CJUA 3ALYA 3KK2A 1T8EA 4R5PA 3I0RA 4CIEA 3TARA 3AVAA 2KZZA 3OY9A 2R7YA 1RTJA 3HPHA 2VG5A 4KHQA 1L3TA 3NDKA 5HBMA 3QEXA 2YKNA 4BACA 3SCXA 4K8ZA 3DM2A 4F3OA 4CGJA 3QEPA 4KREA 3SUNA 4FLYA 4M3RA 4ELVA 3F73A 1J54A 2I5JA 5EU7A 4CF8A 3L2QA 3VA3A 1S1VA 4OGEA 3S3NA 3VQAA 4DSLA 1TVRA 1D5AA 4NYFA 3HL8A 3NHGA 1NK5A 1ZBIA 3DOKA 1YTAA 2EX3A 2FBXA 3T19A 4CGIA 1I3AA 1IH7A 1TV6A 4CEAA 1RT7A 2HHVA 3AVNA 3VQDA 5HRSA 2KTQA 2OPPA 4ZTFA 1NJWA 2XO7A 1TAUA 1TKXA 4YNQA 4QAGA 4AHTA 1DLOA 1HQUA 4CECA 1IKWA 2X78A 3SI6A 4FJIA 3HP9A 4IKFA 4CGHA 2VWJA 2HHSA 4DTOA 3RWUA 1B92A 2IDOA 3C6UA 3OS1A 4FCYA 1BCOA 3WNHA 5CYQA 4KV8A 3KLIA 2AJQA 3ZSOA 4ID5A 4K8XA 3NF7A 4OLAA 3O3GA 3L3VA 1BCMA 1FXXA 1VSMA 2G8UA 1VRTA 2BGGA 1ZYQA 3NFAA 1C1CA 1QTMA 3QETA 2YNIA 4F3TA 3QO9A 3LP0A 3RRHA 2G8IA 1RT4A 3AVHA 5HRRA 2Q3SA 1LV5A 4KTWA 4O55A 3SQ1A 3KKSA 3VQ7A 3O4QA 1TGOA 3LANA 4DTXA 2RN2A 3MEEA 2Y1JA 4FJ9A 4CJSA 3DLRA 3TABA 4BWMA 3TAEA 3OYKA 4O4GA 3LALA 3U3GA 3ZCMA 1UWBA 3DLBA 2Z1JA 3QNOA 4OKJA 5KGWA 2XHBA 4B9SA 4M42A 3VQ8A 1BIUA 5CZ2A 3QERA 3BGRA 2E4LA 1F21A 2OPQA 4J2BA 1HRHA 4OVLA 2OPRA 3SPZA 1KCFA 2OPSA 1EX4A 3NF6A 2HVHA 4RW7A 3EZ5A 4DQQA 1VSIA 2VG6A 4E3SA 1WSGA 4FJKA 4CIGA 1KSPA 3A2FA 1BHLA 4CEQA 1RDBA 1SKSA 4RG8A 2YNGA 4B8AB 5J2MA 4B8CA 1RT3A 1S1TA 3RMCA 3TI0A 1ZBUA 1T7PA 4CJEA 4FJHA 5K14A 5T7BA 2IGIA 3MECA 4CJTA 4W5OA 3OYAA 1KLNA 3I0SA 1RDCA 1WSJA 3M8RA 2P5OA 1QS4A 4QCLA 1C0MA 4UQGA 4C8KA 4M3WA 4AHRA 3MXIA 3V1OA 5DMRA 3HXMA 4DTMA 4HTUA 4KB0A 3RR8A 4FK2A 1Z26A 5I42A 1X9WA 1TK8A 4CEOA 4NYNA 4Y1DA 4B9TA 4HCCA 1CZ9A 2HHTA 4KHNA 1NK8A 4IG3A 2VG7A 4AH9A 3S3OA 1S9EA 4DTJA 1RDDA 2DTUA 3VQ5A 3DMJA 5HROA 2P51A 2Z1GA 1TAQA 3VQ6A 1Q9YA 4IFYA 2B6AA 3SV3A 4CFBA 3L3UA 1XWLA 1MU2A 3CQ8A 1SKWA 1NK6A 3K58A 3S9HA 4FJ8A 1RCHA 3SQ2A 4DSFA 1WSIA 1NKBA 4I7FA 4E19A 2JGUA 4DU1A 3VN5A 3JSMA 1KTQA 3NF9A 4F2SA 2RKIA 5FRMA 3LPTA 4DLEA 3QEWA 1REVA 1TL3A 4CGFA 4CHOA 4ELUA 3NGZA 2HHUA 3HPOA 3IG1A 4PQUA 4KHSA 3P5JA 4IFVA 5JS2A 1WAFA 3L2VA 3QEIA 3LDSA 4DF8A 2FBYA 1VSJA 2KQ2A 1WLJA 2VWKA 5KI6A 4CJVA 4G1QA 1NK7A 5CZ1A 4LY7A 3ZSYA 2PZSA 4FJXA 4W5NA 1LWFA 3DRSA 1NKEA 4KB1A 4JLHA 2PYLA 1X9SA 3SV4A 3VQPA 3AA3A 1RT1A 1VSFA 3H08A 4HVJA 1BQNA 4DMNA 1QSYA 3AVGA 3P1GA 2GUIA 3OYLA 1KLMA 1KVAA 1JLEA 4CF1A 1NK9A 4FJJA 4N5SA 4CF9A 4W5RA 3V9UA 4CHNA 1KFDA 1WSFA 2WOMA 4F2RA 3U3YA 1QQCA 5E41A 3O4NA 4H4OA 3G10A 4O0IA 3S3MA 2D0AA 4M3ZA 4J2AA 2IOCA 4CJLA 1JLGA 3AO3A 4CJPA 4KHYA 3HJFA 2HMIA 1RBUA 5KRTA 4AHSA 4CJ4A 3O3HA 4OLBA 1RTHA 1IKXA 1EKEA 1L5UA 2OZSA 4B9VA 1RDAA 1NOYA 4KKOA 1QE1A 2KW4A 3V6DA 3K5MA 3I8DA 4DTPA 1R0AA 3NCIA 3HSTB 1Q9XA 2HNZA 3KLFA 4AILC 1VSLA 4CGDA 1TK5A 3ISNC 1U04A 1B9FA 3K5OA 4FJ7A 4DSKA 1HNVA 4JRPA 3OYHA 4FLZA 2DFEA 4HHTA 1WAJA 4Z4IA 1VSKA 3VQ9A 3SPYA 4F8RA 4DQPA 4Y1CA 3LP2A 2QXFA 3DI6A 1TKDA 2X6SA 1HYZA 3ASMA 1WSEA 3AVJA 4CHQA 3PUFA 4FM0A 4ZTJA 2Z1HA 4FK4A 1HMVA 3TAPA 4KFBA 1IKVA 3M8PA 2ITGA 3QESA 4EZ9A 1XI1A 3OS0A 4GVMA 3FFIA 5J2PA 5JS1A 3OVNA 3AO4A 4DQRA 3KLHA 4DQIA 4E1MA 4CJ3A 3LWLA 3SZ2A 4CERA 4Z4CA 3VQ4A 3K59A 2FC0A 3VA0A 4KAZA 1A5VA 3AO1A 4HUGA 3DLHA 4BDPA 4DFPA 4NCGA 4FZZA 3IS9A 1TL1A 1QSSA 3PO4A 3B6OA 3E01A 4ID1A 5DK5A 2F8SA 4DTNA 4CEEA 4YFUA 5FDLA 2O4IA 1HPZA 3TWHA 4CFDA 4DFMA 3QIPA 2BE2A 4B3OA 4E1NA 4OPKA 3C94A 1VSHA 4AHVA 5KGXA 3L2UA 4BE0A 4DLGA 3V9SA 4WE1A 3OYGA 3KLGA 3U6FA 3ZT1A 3K57A 4CE9A 4L8RB 4M3TA 4FLVA 1RNHA 1S1WA 1JLAA 4FW1A 1ITGA 3TANA 2HHXA 2HVIA 4CEFA 3OYMA 4N76A 4XIUA 3AA2A 2JLEA 1RTIA 4FYDA 4CGGA 2KFZA 4FLWA 4RW4A 2E6LA 3PX0A 1KRPA 3NBPA 3HVTA 3AO5A 4DSIA 3SQ0A 4KTQA 2QK9A 3AA5X 1K6YA 4FVMA 5J1EA 1FK9A 4J2DA 3QIOA 3MEGA 4KI6A 4IBNA 4JRQA 4IG0A 3QINA 2D5RA 3V9ZA 3BDPA 2GV9A 1HNIA 3V9XA 1RBTA 4DFJA 1RBVA 3V9WA 2OA8A 3T3FA 1WNSA 1U49A 5KTQA 1RT6A 3TAGA 4DF4A 2HHWA 5D3GA 3RMAA 3MXJA 1KFSA 4CHZA 4BE1A 2HW3A 4DSJA 2QKBA 1CZBA 3L8BA 2B4JA 4CFCA 4CJQA 4Q5VA 1LAWA 1LW0A 1S9GA 1JLBA 2PYJA 4Z4EA 4DWIA 4FZXC 3AVKA 2DY4A 3O3FA 4JS5A 3MXMA 4KRFA 3AVBA 4OGCA 5SZTA 4FJMA 1SL0A 2ZE2A 1KVCA 4I2PA 3B6PA 3AVFA 1LWEA 5HP1A 1L3SA 2DFHA 5SWMA 1ZBLA 3RTVA 3SYZA 3DLEA 4LH5A 5KRSA 2XY8A 2FBTA 1FKOA 2EHGA 3MEDA 2E6MA 4LH4A 4I9LA 3OJSA 3LWMA 3DYAA 3PO5A 2XY7A 3QNNA 1X9MA 1U48A 5C42A 5CY4A 4O5BA 4LSNA 1DTQA 4O0JA 4RW8A 4CF2A 3T1AA 3NAEA 2Y1IA 2G8FA 1RILA 4E0DA 1YTUA 4B9MA 1XC9A 1RBRA 2XY5A 2BANA 1WSHA 1GOBA 3ZSQA 3OYJA 4GMJB 4BWJA 3G0ZA 1C6VA 4E7HA 2IS3A 2YHAA 1UA1A 4MFBA 3CFRA 4E7JA 3TR8A 3ZT2A 1UAXA 1NOZA 3ZSVA 1QSLA 3VQCA 4LSLA 2OZMA 4Z4FA 5C25A 3SQ4A 3KK3A 1JLCA 3KTQA 4Q0BA 4CJ5A 4QOZB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHBA 4RW6A 3JXUA 3O5BA 3VQQA 3HPGA 4I2QA 3R8EA 4W5TA 3SJJA 1BQMA 4CJWA 2FF6A 3TPQA 4JKCA 3CC4N 4BDYA 4BVPA 4J2EA 4B1UB 3MX2A 2IIRA 3U9ZA 4B3SK 2E2QA 4TSXA 3ZSZA 3MWTA 3LAKA 4JS4A 4PY5A 4PUOA 4PWDA 3EO3A 3K0SA 3CCEN 3K5LA 3LPUA 4WQ5A 1LWCA 5C24A 3VF4A 2RHKA 1QVFM 1CLQA 3NGYA 3VQBA 2A1RA 3BZCA 3WXMB 3VEWA 2NRVA 1SL1A 4DR4K 2IAJA 3LDPA 1XHZA 4FJ5A 2IC3A 4OKEA 5MLCQ 4O44A 2NNWA 4DV3K 3A8YA 2V7YA 1RT5A 2X6NA 2GWJA 5TKWA 4NCBA 3SMPA 3VEOA 2D0CA 2QWLA 5AQSA 2FLOA 3ZEUB 4B1XB 3JYTA 2E2OA 4JKEA 3CG7A 3WT0A 1QZ6A 2P1JA 1QQNA 3OYCA 3OS2A 4MQ3A 5IWAK 3L2WA 1J53A 3QMLA 4JI0K 4GW6A 4PA1A 3SK3A 4K41A 4CEZA 1XC3A 3ULDA 1ILYA 1HKGA 1IG8A 4DR7K 1L3VA 3VEXA 2VWBA 1DGKN 3ZT4A 4BRAA 4BVOA 4A5AA 4CESA 4O8UA 3GL1A 4EFHA 4PKGA 5HRPA 1DTTA 3DRRA 1I39A 2PY5A 1D9FA 3F2KA 4GV6A 4E7LA 3AVCA 4PKIA 4UY8O 4OKKA 3L2RA 5J2NA 1BL3A 3KKRA 4FM1A 4YOYA 3O9UA 1JKHA 4Z94A 3CETA 1HQEA 3HSCA 3LP1A 4JHDB 4Z0UA 4CBUA 4NXMK 3TAQA 1ASUA 2GBZA 3NH0A 3KD5E 3KD1E 5BRHA 2FSNA 1YJNN 1GLLO 5HRNA 2ZF5O 2NRXA 3Q7CA 3SJHA 1A5XA 2Q36A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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