The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
97
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structure length |
97
|
Chain Sequence |
ATYKVTLVRPDGSETTIDVPEDEYILDVAEEQGLDLPFSCRAGACSTCAGKLLEGEVDQSDQSFLDDDQIEKGFVLTCVAYPRSDCKILTNQEEELY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Electron transport
|
| molecule keywords |
FERREDOXIN
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| publication title |
Structure of Synechococcus elongatus [Fe2S2] ferredoxin in solution.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
4
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| structure length |
97
|
| sequence length |
97
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-11-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00111 | Fer2 | 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4C80 A; 2BS3 B; 1VDV A; 3P4P B; 3DWM A; 1EWY C; 4WQM A; 1QOB A; 1A70 A; 1ROE A; 1CJE A; 2Q5W D; 1FXA A; 1FO4 A; 3B2G A; 2WU2 B; 4JWU C; 3AEF B; 3P4S B; 4YXD B; 4N59 A; 5EE9 A; 3NVZ A; 2JQR B; 1ZOY B; 2B76 B; 1WWT A; 3BII D; 3FC4 A; 1AYF A; 3AEB B; 3FAH A; 4ZHP A; 4YTN B; 4US9 A; 4YTP B; 5C3J B; 4A9A A; 2E3T A; 2MH7 A; 2MJE A; 3AE3 B; 1IUE A; 4C7Y A; 3KWL A; 5GXG B; 1JWB D; 2DWQ A; 1GPX A; 4C7Z A; 3P1M A; 1L5P A; 2M19 A; 2AX5 A; 1VJK A; 2WDV B; 2CJN A; 3NVY A; 1E6E B; 2MJ3 A; 2G1E A; 2WS3 B; 2KAJ A; 2WU5 B; 3AE7 B; 2WLB A; 1TJE A; 1JRO A; 1FIQ A; 4YT0 B; 1E0Z A; 1FXI A; 1OQQ A; 1WGK A; 3AEC B; 1NYR A; 3WCQ A; 1E10 A; 1WYG A; 1NVI D; 2WDQ B; 3AV8 A; 1J7A A; 2KMM A; 1E9M A; 5AUK A; 1QF6 A; 1N63 A; 3W5V B; 5MPO A; 1JRP A; 1NI3 A; 2MJD A; 3CWI A; 3NVV A; 4US8 A; 5EE1 A; 1YJI A; 1KF6 B; 1QOF A; 1N62 A; 1RFK A; 5EE0 A; 1YJJ A; 3NRZ A; 2W54 A; 1XLO A; 2WDR B; 2JX5 A; 1NEN B; 1XLP A; 1ZUD 2; 3W9C B; 1FFV A; 1PDX A; 1N61 A; 1SIJ A; 2PVO D; 3PO0 A; 1N60 A; 2EKI A; 3VRA B; 4USA A; 3RPF C; 2PIA A; 3ETR A; 3SFE B; 1AWD A; 1V8C A; 1WXQ A; 1JWA D; 5H8Y E; 3L4P A; 3ZYY X; 2CJO A; 3AB5 A; 3VR8 B; 3AE9 B; 1N5W A; 2N0S B; 1RM6 C; 3VR9 B; 4LTU A; 1TKE A; 2BS2 B; 1JAL A; 2QJL A; 2WQY B; 3AE5 B; 3AE1 B; 4IDI A; 1I7H A; 1XLN A; 4P6V F; 1DOY A; 1J7B A; 3AEG B; 3AE6 B; 1FM0 D; 2LEK A; 3LB8 C; 1QOA A; 3P4R B; 4ITK A; 4JWS C; 1L6V A; 2BS4 B; 1PUT A; 1L6U A; 1F0Z A; 1OFF A; 3SR6 A; 3AN1 A; 2PVG C; 2FBW B; 2QIE B; 4YSX B; 3CIR B; 3AMZ A; 1GAQ B; 3AEA B; 3HUI A; 1YQ3 B; 4HRS A; 2M56 B; 3HRD D; 3AM9 A; 2ACZ B; 5EE3 A; 2WP9 B; 1R7S A; 5G5H A; 1OQR A; 2W3S A; 1NYQ A; 3P63 A; 1KRH A; 4N6E B; 1DOI A; 4FXC A; 3DWG C; 1JQ4 A; 3HVZ A; 2L52 A; 1RYJ A; 3AEE B; 1WRI A; 2W3R A; 4ZOH C; 2H89 B; 1L0V B; 2CU3 A; 4YSY B; 1N5X A; 1XLQ A; 5AUI A; 1FMA D; 3AE4 B; 1XO3 A; 2OHF A; 1QOG A; 1TKY A; 1YQ4 B; 4JX1 C; 1DGJ A; 1SF0 A; 1ZP0 B; 2BT6 A; 1TYG B; 1UWM A; 1QT9 A; 1FRD A; 1SB3 C; 4WWM A; 2K9X A; 1E7P B; 3NS1 A; 2DBY A; 3NVW A; 2H88 B; 1RWS A; 5C2T B; 1TKG A; 3AE8 B; 1FRR A; 2HTM E; 3AH7 A; 3SFD B; 5G5G A; 1ZXI A; 3B9J A; 4ZHO A; 3ABV B; 1B9R A; 1CZP A; 1T3Q A; 3AE2 B; 5H92 C; 4N58 A; 1DOX A; 4HRO A; 3B2F A; 3EUB 2; 2W55 A; 1PFD A; 1NEK B; 3P4Q B; 3VRB B; 3W5U B; 1J7C A; 2Y5C A; 4YSZ B; 1V97 A; 3LXF A; 2K22 A; 1VLB A; 1KFY B; 1QLB B; 3AED B; 4YTM B; 1JW9 D; 2PKO A; 2L83 A; 1FFU A; 2K5P A; 4KX6 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BS3 B; 2HD5 B; 4WQM A; 1CJE A; 3UIO B; 2JZZ A; 2LRU A; 1MHX A; 3FAH A; 2WWZ A; 3APC A; 5JHB A; 1P3Q U; 1L5P A; 5HI1 A; 2WDV B; 5KHQ A; 2KC2 A; 4IWP A; 2J4X A; 3DQV A; 1OQQ A; 3V60 A; 3AV8 A; 1J7A A; 2J52 A; 1E9M A; 2IO3 B; 4JPS A; 1N63 A; 2V9H A; 5EE1 A; 3W1S C; 1NBF C; 4FJY A; 4WAF A; 2JX5 A; 2WXO A; 2NMQ A; 1P7E A; 3PPA A; 4PYU A; 3DBL I; 4OVU A; 1M94 A; 4P6V F; 4DWF A; 1YNT E; 3BZD B; 2V3S A; 1PUT A; 1OFF A; 5DPS A; 4YSX B; 5D94 A; 2C7N B; 1ZDX A; 2QSD A; 2KQ4 X; 5G5H A; 1OQR A; 3P63 A; 1Z5S B; 1L4D B; 5BMG A; 4N6E B; 4ANW A; 3HVD A; 1PYW D; 2MQJ A; 4RNA A; 1C78 A; 2GMI C; 3ZNZ B; 2ICI A; 3NJT A; 2NVU I; 1YQ4 B; 4IC7 B; 4G0N B; 2PJH A; 2KT7 A; 3SFD B; 1DOX A; 1V6E A; 4M8M A; 2X8X X; 3VFK A; 1PQS A; 1KFY B; 2MX2 A; 1MI0 A; 3VQI A; 4W9E A; 2BKF A; 2KJH B; 4N9F 4; 3Q2A C; 2AYO B; 3I57 A; 1QZE A; 1C4P A; 4NQL B; 3RZW C; 4K3B A; 1KLG D; 3V05 A; 5CHW A; 3P1M A; 2LGX A; 2M1M A; 2WS3 B; 4ANU A; 2WXM A; 4ZDV A; 1WGK A; 3QAR A; 1NVI D; 2WDQ B; 3RUI B; 1IYF A; 1YOV B; 3VUX A; 1MPE A; 2IJ0 A; 4DK5 A; 2KMA A; 4L1B A; 1D5M C; 2D2Q A; 4ICU A; 3RPF C; 2WXJ A; 1V8C A; 2XN9 C; 1JWA D; 2WXQ A; 5KHO A; 2IND C; 3W2D A; 1R4M I; 2Z0E B; 5BYQ A; 5D6J B; 2ZPY A; 3DDC B; 4C4V B; 1P98 A; 1PGX A; 2GI9 A; 4FBJ B; 4BOZ B; 3N1X C; 2LMC A; 2QC8 A; 3NHE B; 3MJW A; 4HRS A; 3NZU A; 3QA8 A; 2W3S A; 2PLP A; 4DDI D; 1E8X A; 4G3X B; 1SE3 A; 2OJW A; 4NZL B; 4MSQ B; 4X57 B; 1QOG A; 2LRW A; 3Q3J A; 1E7V A; 1FRD A; 1WJ4 A; 1WI0 A; 3NS1 A; 3ONS A; 4TV3 A; 2H88 B; 5TR5 A; 2VZK B; 4FAD A; 5C1Z A; 1XCQ L; 4HRO A; 1WMH A; 1UH6 A; 1ET9 A; 1XXG A; 2YEP B; 2G9H D; 3OLM D; 3C0R B; 3PSE B; 3I3T B; 4IM3 A; 1HTQ A; 4LNN A; 3DBH I; 3OAW A; 1FXA A; 4PYZ A; 1VR9 A; 4N59 A; 1YN3 A; 2Y5B B; 1WMH B; 1D6E C; 2JF5 A; 2KFK A; 3U30 A; 4LJP B; 2PE6 B; 4CO7 A; 2I1K A; 4TQ0 A; 3AEB B; 2RSU A; 4KGS A; 3FIL A; 3AE3 B; 3RNF C; 3V61 A; 4RM9 A; 4TUU A; 4WWP A; 3EEC A; 3ZNG C; 3IT4 B; 1EU4 A; 2KAJ A; 2WLB A; 2V1Y A; 1S3S G; 3KUZ A; 3EFC A; 1RRB A; 1ZW7 A; 4FA6 A; 1WE7 A; 2NBV B; 1F1H A; 5MPO A; 3FIL B; 3GE8 C; 2N1W A; 2M4N A; 2VZK D; 3QQ8 B; 3M62 B; 2K3U A; 1ZUD 2; 1XLP A; 1PDX A; 1N61 A; 2PW9 A; 3VRA B; 3DHG C; 4ZRQ A; 2D3A A; 4C00 A; 2ZZP B; 4A55 A; 2G3Q B; 2V0G A; 3NZS A; 4PS8 A; 3FKY A; 1V9J A; 2NTT A; 1R4N B; 1XLN A; 2L7R A; 4BBN C; 2KWU B; 1BT0 A; 2GB1 A; 1CQV A; 2D10 A; 3D32 A; 2HJ1 A; 1KLV A; 1TT5 B; 2QIE B; 3X0W A; 5IOI A; 4XDD A; 2WNM A; 4WIP A; 1WX8 A; 4NJ7 A; 1D3Z A; 1SJE D; 1M4V A; 3X23 A; 3VTW A; 3A9K A; 4I6N B; 4YSY B; 2M0A A; 2ZVO A; 1SF0 A; 2BT6 A; 1GB1 A; 2UU7 A; 3GZN B; 3BY4 B; 3QWZ B; 5C2T B; 1CK1 A; 3AE8 B; 3RNC C; 5D7G A; 2Y3A A; 4FLH A; 3A9K B; 5DPW A; 1LFD A; 1XEE A; 2EMS A; 3UGB B; 3CSF A; 4NJC A; 1GOZ A; 4JWU C; 1TS2 A; 2KDI A; 3R7Q A; 3URY A; 3V62 A; 1ZOY B; 4A3P A; 3PRP B; 4GB9 A; 4ZHP A; 2JXT A; 4US9 A; 2FCS A; 1IBX B; 4LNO A; 3NVY A; 2MJ3 A; 1UBI A; 4IWQ A; 3ZKJ C; 3IVF A; 4MGY E; 3AEC B; 3H8H A; 4AP4 C; 2JWZ A; 3AXC A; 1B1Z A; 3QAQ A; 2OOB B; 4HDQ A; 1EO6 A; 5LXH A; 3N1Y C; 2FAZ A; 2K8H A; 2FID A; 2HTH A; 3H9D A; 1UF0 A; 1N5W A; 2LHE A; 2K1F A; 1OQY A; 4K1R B; 1E7U A; 3PV1 A; 1Z2M A; 3B1L X; 3CMM B; 3AEA B; 3DHH C; 2M56 B; 2XK5 A; 2DAJ A; 3VH4 B; 2KHW B; 5EE3 A; 4ZRK A; 4LNK A; 2GBJ A; 4FXC A; 5J17 A; 3HVZ A; 5BO4 B; 4DDG D; 4RFB A; 2Z59 B; 2BBC A; 5FR3 A; 2N7E A; 1UWX A; 2MCN B; 1ET6 A; 2V3N A; 1QT9 A; 3Q3M C; 2XK5 B; 3PZ7 A; 1I4Q A; 2AEH A; 5J2R A; 4AJY B; 4ARC A; 3L16 A; 4JL9 A; 1NEK B; 2NBW B; 5DPR A; 1RFA A; 1VLB A; 4OZB A; 4IG7 B; 1Q0W B; 1JW9 D; 1FFU A; 1YX6 B; 2IGG A; 1YN5 A; 3DBR B; 3ENE A; 4MJS B; 2JRH A; 1MJD A; 5L95 C; 2MSE D; 1YQB A; 3BK2 A; 4XC2 A; 4XGA B; 1XQQ A; 1WZ0 A; 1WR1 A; 4LLG M; 1J0G A; 4GIV A; 1JCK B; 2RDH A; 1NI2 A; 4OVV A; 2ZEQ A; 1LM8 B; 2LVQ A; 2KQS A; 3MHZ A; 1AAR A; 2REX A; 1GC7 A; 4R3D A; 2CU1 A; 4AUQ C; 2V4I B; 2AQ2 B; 2IY1 B; 5D3D A; 1WGR A; 4GMV A; 4A3O A; 3UQB A; 4FJZ A; 1YX5 B; 3RNA C; 4BZA A; 4S0R A; 2KDB A; 2I2Y A; 1MFW A; 5E6O A; 1UBQ A; 2IYD B; 2L00 B; 4RH6 A; 5L83 A; 3IFW B; 4WJN A; 2C7H A; 4GGQ A; 4FJV B; 1FPY A; 2C5L C; 4K7S A; 5LLI A; 1Q1O A; 3DVG X; 4ANV A; 5E6J A; 2KN5 A; 3R2T A; 3OJ3 A; 2AWT A; 3EFU A; 1WF9 A; 3K9P B; 3ZJT A; 2JU6 X; 1JML A; 2DZI A; 1N5X A; 1E8W A; 1QIL A; 2ZW0 A; 1XO3 A; 2LZ6 A; 4XZ4 A; 1V1O A; 2JUO A; 2D07 B; 3PT2 B; 2KYW A; 1FCL A; 1RWS A; 2DAF A; 3C8Y A; 3ZDM C; 3AH7 A; 3DBL B; 2YVC A; 2ZVN A; 1WM2 A; 2N1V A; 1SBB B; 4YTM B; 2WYQ A; 2JVC A; 5AEK B; 3P4P B; 2LGS A; 3PZ8 A; 1WSP A; 1FO4 A; 3EGR A; 2KDE B; 1D5Z C; 4M02 A; 3DVN U; 2FUG 1; 4WJO A; 2IZV B; 4JE3 B; 2JSV X; 1V49 A; 3T3O A; 4BAX A; 2M19 A; 3MC8 A; 2AX5 A; 1MVK A; 1TJE A; 1F9J A; 2WXP A; 4IUM B; 4OZA A; 3ZXR A; 2DYM A; 1E10 A; 1Y8R C; 1K53 A; 3KVF B; 5AUK A; 1KLU D; 1JRP A; 5AZH A; 2I1J A; 3NS8 A; 2W54 A; 3WAL A; 4DHJ B; 2PVO D; 1IPG A; 2GRI A; 3V3X A; 4USA A; 1LQB A; 2J53 A; 3ETR A; 3DVG Y; 2BYF A; 3ML9 A; 3ZYY X; 2KVR A; 2KWC A; 3ZLZ A; 4ASW C; 1ENF A; 3LB8 C; 2KLC A; 4KGT A; 3MFG A; 1VD2 A; 1FD6 A; 4QAY A; 3UI3 A; 2JY6 A; 4MGZ E; 2L05 A; 4TQ1 A; 3DVN V; 1DOI A; 1JQ4 A; 2L52 A; 4KSK C; 3P42 A; 3T3N A; 2CU3 A; 1SE2 A; 2O2V A; 1ZDV A; 1RAX A; 3Q3O C; 4EOY A; 5C3J B; 2K6D B; 1TS4 A; 2DBY A; 3NVW A; 1WM3 A; 4ZHO A; 1R4M B; 3ABV B; 1CZP A; 4DHJ D; 3ZGZ A; 4W9L A; 3RCZ A; 2Y5P A; 1V97 A; 2O2V B; 1WXV A; 3AED B; 3VUW A; 1V1P A; 2N4F A; 2QIL A; 4F7Z A; 5T8I A; 1TY0 A; 4BVU C; 4AWJ A; 2X38 A; 3WAO A; 2QEJ C; 3RN9 C; 1JWB D; 1V1P B; 3ML8 A; 3RNG C; 4GXB A; 3ZJU A; 4HPM B; 4ARI A; 2G4D B; 3BVG A; 4IKG A; 1DYQ A; 3RFZ B; 4BKG A; 1NI3 A; 3NVV A; 4P16 A; 4REZ A; 3V6E B; 2HJ8 A; 1K8R B; 1AN8 A; 4ACF A; 4A90 A; 1YIW A; 4HVB A; 3DBH B; 4NJ6 A; 4B0E A; 4J6I A; 4YWG G; 3PTF C; 4M0W A; 3ECI A; 1T0S C; 2BS2 B; 2M17 A; 1I7H A; 4GSW A; 1DOY A; 2BGF A; 3I5J C; 2BS4 B; 5D2M B; 1UNS A; 2ZNV C; 1ZGU B; 3AN1 A; 2LWP A; 4C4V A; 3AMZ A; 2R2O A; 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2KAC A; 3BWU D; 3H1U A; 2BVC A; 3ZW3 A; 3Q6B A; 1WJU A; 5HKH A; 1KRH A; 3VTU A; 3AEE B; 2GLS A; 4ZOH C; 4F8C B; 4XDC A; 2B3A A; 3N9Y C; 2LGI A; 1FMA D; 2FUH B; 1TBE A; 1TS3 A; 2ZCB A; 1ZP0 B; 1SB3 C; 4WUR A; 2MBE A; 1L0Y B; 1L4Z B; 3SHQ A; 2LXC A; 2GBR A; 4KKI A; 2HDE A; 3DOW A; 4RGO S; 2D3G A; 4W9K A; 1P0R A; 4KX6 B; 1WZ3 A; 2EMT A; 4HKZ E; 3PLU A; 4MGK E; 2BTE A; 4ANX A; 2QHO A; 1ACC A; 3A33 B; 2WU2 B; 1UEL A; 5EE9 A; 3NVZ A; 5DPT A; 2LGY A; 2IBI B; 1SJH D; 2B76 B; 4P1B C; 1P9D U; 4YTP B; 4DXG A; 2MJE A; 1GPX A; 3ZTD A; 3VUY A; 2CJN A; 2WU5 B; 3W1Y A; 2J7Q B; 3TBL D; 1JRO A; 1IBX A; 3UIP B; 4MGI E; 1HEZ E; 1WXA A; 2K39 A; 3EHV A; 2HE7 A; 2WXR A; 4E3C A; 1WR6 E; 3PRZ A; 2JPH A; 4KGR A; 3JYU A; 2C7M B; 3QX1 A; 5JZE B; 1H8C A; 2KK8 A; 3KLS X; 4WWN A; 4RMA A; 2CJO A; 3MHS D; 3VR9 B; 2QJL A; 3KYD D; 2J0M A; 3Q69 A; 3AEG B; 1K51 A; 3AE6 B; 2KDF B; 2KVZ A; 4W9F A; 2D11 A; 2AL6 A; 2LI5 A; 4PK1 A; 4GDL B; 2EEL A; 2FE8 A; 3RZF A; 4BKS A; 3ZIM A; 1GUA B; 3VAW A; 1Q10 A; 4W9I A; 3KUC B; 5BMI A; 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