The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
GLLAAERAVSQVLDSLEEIHALTDSSEKDLDFLHSVFQDQHLHTLLDLYDKINTKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Neuropeptide/membrane protein
|
| molecule keywords |
Presynaptic protein SAP97
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| publication title |
The tetrameric L27 domain complex as an organization platform for supramolecular assemblies
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
18
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2003-12-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y74 B; 1Y74 A; 1VF6 C; 3B40 A; 1Y76 B; 1Y76 A; 1ZL8 B; 1RSO B; 1VF6 A; 1ZL8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1OCZ C; 2F1M A; 2JGU A; 2UUA B; 1NT2 B; 1SQF A; 4J7K A; 5IJ9 B; 3ABU A; 1IZ3 A; 3SR2 C; 4LF5 B; 1YVW A; 1YIJ V; 4P9O A; 5EIB D; 5GW7 A; 4MW8 A; 3CHX A; 1WA8 A; 5B1B B; 2YS8 A; 1KP3 A; 3CE2 A; 4FFK A; 4X1K B; 1THZ A; 2W6J G; 5EYP A; 3T1H B; 4GX0 A; 2QJ1 A; 1TVK B; 2DYS C; 4RWU A; 2M7W A; 3KZI Z; 3JAS B; 1Q6U A; 1VMG A; 3JAT A; 1RSO B; 5JH7 B; 2OYQ A; 3CXC U; 5DEC A; 2WLJ A; 4LNU B; 4LFB O; 5H2F Z; 1EN4 A; 2ZE6 A; 3T2M A; 2Q73 A; 1WNS A; 5CA0 A; 1J5E B; 1VEW A; 4PI2 A; 4O4L B; 3ETD A; 3P30 A; 4UV8 A; 1M56 B; 3ETE A; 5DED A; 2HVJ C; 3HKC A; 3R66 A; 4EFB A; 1X59 A; 1Y6X A; 4DR1 O; 3N2K A; 4DUY O; 4H33 A; 4DXW A; 4JI3 B; 4DV3 O; 4FLU A; 1R6N A; 1NR1 A; 3ZRX A; 1M57 C; 3HKB B; 2PZS A; 3UCS C; 1ZLZ A; 2PI5 A; 1P84 F; 1AJN A; 4UCU A; 2ZR2 A; 2UU9 B; 4WFB V; 3ZMT A; 4R7C A; 1XL6 A; 2H94 A; 2RN9 A; 2CDY A; 3C3T A; 1M57 B; 2PUS A; 1MZE A; 4NR1 A; 1IDS A; 4O4H B; 3B09 A; 4KXR A; 1XMQ B; 3D36 A; 1K7D A; 1HNZ B; 2WLI B; 5B5E Z; 4X1Y A; 1HR0 O; 1Q86 W; 2VWK A; 5LHI A; 4FLY A; 2Q4P A; 3CYO A; 2FYU H; 1NTM H; 4I55 B; 1GRJ A; 2W6I G; 4J9Z B; 1BCC H; 1BT8 A; 3RYF A; 4GKJ O; 1I7F A; 4B3S O; 1IX9 A; 1XBL A; 1NBM G; 3IFX A; 5GON A; 4LR3 A; 4DR4 O; 3IC7 A; 4HAM A; 4F6R A; 1Q90 D; 1K34 A; 4JTD B; 3ZHQ A; 1YXB A; 3BCC H; 3K5O A; 2HVK C; 2FB5 A; 3E89 A; 2QWO B; 4FVM A; 1H2S B; 4FM1 A; 4I50 B; 5H5N A; 4J42 A; 2DJV A; 4AQY O; 4TT3 G; 2PTM A; 5LL6 Y; 3CCE V; 1GN4 A; 3BVO A; 5KUK A; 2Q6A A; 3OT7 A; 2P6J A; 1MZF A; 2NNU A; 4PHZ A; 3EXA A; 4IGG A; 3QO5 A; 2N05 A; 2XAQ A; 3JAT B; 1XNR B; 3CC4 V; 2IH3 C; 4GUN A; 3BA8 A; 5LGT A; 3ABT A; 3ZN0 A; 1GN6 A; 4F6E A; 5IJ0 B; 3NR7 A; 1ZAU A; 3ASN B; 4CS3 A; 2KG7 A; 3UO2 A; 3AK1 A; 1JMK C; 3K03 A; 2ZE7 A; 2JDI G; 2QA4 V; 4MSW C; 3OR7 C; 4JI6 O; 1SQP H; 4LF4 O; 2AXT Z; 4FMT A; 5FPR A; 1VQM V; 2BSK B; 3M7M X; 2X6A A; 3AG2 C; 3CS5 A; 2IW5 A; 2Q7H A; 4P2Z A; 1Y74 A; 4FM0 A; 3CCL V; 1NH2 D; 5L3G A; 4MVR A; 1N36 B; 3RFR A; 4GKK O; 3D36 C; 3HKD A; 1Y66 A; 3E83 A; 3LSU A; 3AG2 B; 3K5M A; 1F51 A; 4TUY B; 5IYZ B; 1J95 A; 1ZSP A; 4LF9 B; 1H2N A; 1SQV H; 1AI5 A; 2YIB D; 2YI9 A; 1SC5 B; 3X2Q B; 5C8Y B; 4QNH B; 2DWE C; 4X1Y B; 4JAS A; 1RM1 C; 1PNK A; 1NI8 A; 4JI7 O; 5EZY A; 4WCE V; 3OGI B; 2ARH A; 5IE9 A; 2IJI A; 1GM9 A; 1GO3 F; 2CH7 A; 3OD4 A; 5LMN B; 1RM1 B; 1G1X B; 4FJC C; 1H2L A; 2JRI A; 4JI0 B; 2LGQ A; 2EIK C; 2CUG A; 4F6R B; 1KUQ A; 1W59 A; 3OUS A; 4PA9 A; 2RNB A; 2IU3 A; 4TV8 A; 2WLL B; 2LQT A; 4K35 A; 1R3K C; 2WWW A; 1UJW B; 4N23 A; 1A32 A; 4L8J A; 3L74 H; 5KHH A; 3DC6 A; 3ETG A; 1EBO A; 1YJ9 V; 2MW2 B; 2XOK G; 1N32 O; 2P4V A; 1GN2 A; 2VRZ A; 1Q8I A; 2EUL A; 2YUA A; 2F43 G; 2EIL C; 3OAA G; 2VQF O; 2ZIN A; 1Z2G A; 1WB7 A; 1OCR B; 1WAZ A; 1H38 A; 4LF7 B; 4EKW A; 1W0J G; 1P7B A; 4LF8 B; 4DV7 B; 1NH2 B; 5LOV A; 3SYO A; 2UUC B; 3K0G A; 4UVB A; 5F2V O; 5KHJ A; 3SPI A; 3GWK C; 2CAZ C; 2DQ3 A; 5KHG A; 4J41 A; 4DR7 B; 3CC7 V; 3SYP A; 1S5J A; 2LFS A; 2OIE A; 1VQ9 V; 3K5L A; 4QPK A; 3EFF K; 4DR2 B; 3ZMV A; 5IT9 N; 3AEI A; 4CZZ A; 5CBH A; 1IBL B; 2BCC H; 2VQE B; 1F7Y A; 1Q43 A; 1CP9 A; 3C90 A; 4UVC A; 3AK3 A; 3L75 H; 4JYA O; 1DK1 A; 4KHP B; 2Q0O C; 1PNM A; 1EN6 A; 3P3N A; 1Y76 A; 4PA3 A; 2YID A; 3ICX A; 4MVQ A; 2QM7 A; 4TQD A; 1KC8 W; 2ADP A; 2HFE C; 1AJQ A; 3K9S A; 4DK0 A; 2Q5Z A; 4MVM A; 3AG3 C; 3GVM A; 5KHI A; 1M1K W; 5LP6 A; 4IYI A; 5LYJ A; 1VQ6 V; 1KKD A; 3CME V; 3ZHU A; 3ZHS A; 2HEP A; 4GLX A; 1FXV A; 2DN9 A; 5JVD B; 4J7Z A; 2OTL V; 4B3M O; 2Y69 C; 5KHK A; 4MW3 A; 3AG3 B; 3FAV B; 3K58 A; 2CH7 B; 4H37 A; 4RAI A; 1SF9 A; 2AW9 A; 5E79 Z; 3ABM B; 2WLN A; 1H2G A; 3SYQ A; 3K79 A; 4ZHQ A; 3F7Y C; 1B6Q A; 2QTO A; 4DRX A; 4JF3 A; 4O2B A; 1R3J C; 1GAX A; 1UFI A; 1QCE A; 2ZM6 B; 1OHH G; 3BAA A; 1SKV A; 1Q6I A; 1K97 A; 2M6Y A; 4DYL A; 2G38 A; 1VF7 A; 2GDS A; 1KP2 A; 4A5U B; 4WBN B; 2MK3 A; 3T1C A; 2ZNI A; 4GX5 A; 1QBZ A; 4DV5 O; 3QO7 A; 1BL8 A; 4YHH O; 2ZDI A; 4OXS A; 2V7Q G; 5A2Q N; 1S76 D; 4OX9 B; 2N04 A; 4DW0 A; 3STL C; 4LF6 O; 2FTK A; 5IJ9 A; 3LNN A; 2EIN B; 5FLX N; 1R73 A; 1RPO A; 5IYC O; 3SYC A; 4DR6 O; 4MVZ A; 5EBW C; 1YJW V; 4X1K A; 1D5A A; 4G28 B; 3OTF A; 3JD2 A; 5LGU A; 1TVK A; 1NVP D; 1PV0 A; 4MTG A; 3JAS A; 1V54 C; 1RSO A; 4X65 B; 3D8C A; 3A8T A; 4LNU A; 2NN4 A; 1BE3 H; 1AJP A; 2KQX A; 4PA7 A; 5B3S B; 1MAB G; 2RCV A; 3CCM V; 4BW9 A; 2EIJ B; 1ZUQ A; 4X88 A; 3ETQ A; 1EZJ A; 4O4L A; 3RWR D; 2F93 B; 1Y4M A; 5HFL A; 4R6Z A; 1MOF A; 4FM2 A; 4EEQ A; 3H9V A; 2QKS A; 2QDO A; 4YJ3 A; 4YY3 O; 3CCQ V; 3PJS K; 2ZIO A; 5LP6 B; 4X66 O; 4RQE A; 2CTW A; 1D2D A; 1B06 A; 1JOY A; 3O9O A; 4DR3 O; 1KMI Z; 1N33 O; 1DTO A; 4JI1 B; 1ZX3 A; 1YI2 V; 2UUB B; 3ZS8 C; 2F4V O; 3JD0 A; 2CGN A; 2Y0I A; 1TUB B; 3E8B A; 1SQB H; 5E1A C; 2YC0 A; 1PP9 H; 1JVM A; 1CXZ B; 3VQY A; 4DV4 O; 4DV6 O; 2WLI A; 3AG1 C; 2CK3 G; 5L3B A; 3VQX A; 3WB0 A; 4TSF G; 4KP4 A; 5CA1 B; 4I55 A; 1YIT V; 1IBK O; 5JJN B; 3ZRW B; 3E86 A; 2GBO A; 1N4C A; 1VQO V; 2WA4 A; 2ZDI C; 4DV0 B; 3CRA A; 3N27 A; 4ZOL B; 1NVP B; 1LUW A; 2QWQ B; 3QNE A; 4AHC A; 3DSQ A; 3JSN A; 5LMU O; 4UVA A; 2EZP A; 3E8F A; 4DK1 A; 1FFX B; 2P67 A; 3QO8 A; 2ETN A; 3CP1 A; 4I50 A; 5B1B C; 1XNQ B; 3NXS A; 2YIA A; 1OCO B; 1L1F A; 1BQZ A; 1R3I C; 1YZB A; 3H1J H; 1GTO A; 4O2A A; 2QKA A; 2EJR A; 2Q9L A; 3TGU H; 2JEX A; 4DV2 O; 1B04 A; 4MTX A; 1S72 V; 3SPG A; 3WG7 C; 2ZCE A; 2QR4 A; 2ZXW B; 3ZN1 A; 2KB1 A; 1XEQ A; 3HKE B; 2YXL A; 4JI4 O; 3KKY A; 1M56 C; 2WLH A; 3ZJZ A; 2ZE8 A; 3A2F A; 3RN4 A; 3FKS G; 3WG7 B; 4DUZ O; 2YEV B; 2P22 C; 4FLV A; 4BAY A; 5BMV B; 4PDM A; 1SA0 B; 5IJ0 A; 3L73 H; 1H2M A; 3LDC A; 3S3W A; 5KA5 A; 1SQQ H; 1U96 A; 4JI2 O; 4ABM A; 4NXN O; 4YJ3 B; 5KX5 B; 2BSK A; 1W0K G; 1M9N A; 1KU9 A; 3L70 H; 3STZ C; 1FJG O; 4X64 O; 2CE4 A; 5AG2 A; 1R1B A; 4I0X A; 4DUY B; 3FB5 C; 4DR1 B; 1TA8 A; 4DV3 B; 1M5I A; 3DGE A; 3W7W A; 3K5N A; 4MVO A; 4TUY A; 2P06 A; 3BPZ A; 5IYZ A; 1JPX A; 1ZL8 B; 2JGD A; 4D6T H; 3HPL C; 4RO2 A; 4FLW A; 1SER A; 4CH4 A; 3SPJ A; 4CH3 A; 3O65 A; 4B7K A; 1KEC A; 2X0L A; 5C8Y A; 4NVP A; 5EIB C; 1HNX O; 3RYH B; 2WA3 A; 1N8R W; 2K1E A; 2DYR B; 4R50 A; 4IHJ B; 3ZRV A; 3FX7 A; 1D5N A; 1HR0 B; 5TIS Z; 1GM8 A; 3JD4 A; 3ASO C; 1XRE A; 4GCZ A; 5LXT B; 4JYB A; 1BZK A; 3L72 H; 3DTU B; 2IH1 C; 4OGQ B; 2YIC A; 1NR7 A; 4GKJ B; 1YF2 A; 1IXM A; 3G6B A; 3B8N A; 3W7U A; 3JCU Z; 3FFQ A; 3ASO B; 2WLL A; 2C2A A; 4DR4 B; 5BY1 A; 4I5S A; 4K8X A; 3AK2 A; 2LP7 A; 1URF A; 4I9W A; 1P4R A; 1SZT A; 4IL6 Z; 4NXM O; 3D3I A; 4O2A B; 1N34 O; 3FB6 C; 1FXK B; 1CPY A; 3QTC A; 3U11 A; 1BMF G; 4AQY B; 2RJZ A; 2QWN B; 1QLN A; 3M99 B; 3U0Z A; 3CD6 V; 1K33 A; 3ASN C; 4CH6 A; 5BZB A; 3W7X A; 1Q7Y W; 1TUE B; 2XAS A; 5IY5 C; 5B1O A; 4X62 O; 2HJF C; 4D7S A; 3H1L H; 2B1G A; 2DW4 A; 2LO1 A; 1VAR A; 2DOS A; 2Q69 A; 2YIB A; 1ENV A; 3K06 A; 1V55 B; 4JAV A; 2E5L O; 1HNW O; 5IY5 B; 2UXD O; 2QTS A; 2E3C A; 2Z0A A; 3M8A A; 2WAM A; 2Q68 A; 2X6B A; 1NKD A; 4JI6 B; 1E1R G; 3S3X A; 4LF4 B; 4MVU A; 4JTC B; 2Q7E A; 4J10 A; 3CMA V; 3X2Q C; 4I0X B; 5CB4 B; 3G67 A; 3OEH G; 3QVN A; 5LGN A; 2JVD A; 1FYJ A; 1XOU A; 2HP8 A; 1VQ8 V; 4GKK B; 1K8A W; 1QQC A; 2JGD B; 2GHY A; 3OTO O; 4X9Q A; 2QWR B; 3B8M A; 4JI5 O; 1N0N A; 1DF5 A; 3VQV A; 1ROP A; 4QE7 A; 3OUF A; 2FKX A; 4QE9 A; 4ZKI A; 2BOC C; 5JVD A; 4QIW F; 3IC9 A; 3CX5 F; 3WFV A; 4O4I A; 3OEE G; 5L3D A; 3FAV A; 5K1X A; 3J80 N; 4JI7 B; 1H2K A; 4DR5 O; 2HKO A; 5FPO A; 4J7J A; 1KD1 W; 2GUZ B; 4JV5 O; 2HJD A; 2Y0P A; 4GZR B; 4PA6 A; 3ABK B; 1OJH A; 4UCV A; 1VQ5 V; 4CC5 A; 2A79 B; 2PF4 E; 3L71 H; 3G6E V; 4IT5 A; 4XDL A; 5L3F A; 1QNM A; 3K9A A; 1OCR C; 2X7R B; 3LSQ A; 1M90 W; 2IM9 A; 4NYK A; 4WBN A; 3OMN B; 1I5Y A; 1N32 B; 1KQS U; 2P7T C; 3JAW B; 1E79 G; 1FFT B; 1BGY H; 1QVF U; 2CTQ A; 4WFA V; 4HNA A; 1IUR A; 2CTP A; 1PKX A; 3UQ8 A; 4JI8 O; 2JS5 A; 3SPC A; 3ZMS A; 3QG5 A; 4LFA O; 2PI4 A; 3JD1 A; 2VQF B; 4PD4 F; 4LF7 O; 3CWB H; 5H6R A; 2KKW A; 1OV9 A; 3H1K H; 4B3T O; 3K08 A; 3FYI B; 4WFG A; 5JJE B; 3OMI B; 1S3J A; 4Q6G A; 1O9G A; 5K1P A; 1S5H C; 1LUV A; 4TQF A; 4W4K A; 1HW7 A; 1GH6 A; 4IYH A; 1XIL A; 2AHY A; 1XHZ A; 5IYB O; 1I94 O; 4H13 B; 5EK0 A; 4LWS B; 1JQ0 A; 3MHH C; 4OPA A; 2UXB O; 1NS1 A; 2LJ2 A; 4PEL A; 5IWA O; 4UCR A; 4B3R O; 4JYA B; 1VIB A; 2R9R B; 2VWJ A; 4K3A A; 2RDC A; 4R8C A; 4QGP A; 2OCC B; 4UCS A; 1N0J A; 1SES A; 4GX2 A; 3LDD A; 1AIL A; 3ABM C; 1S77 D; 2AHZ A; 4O4I B; 3RT3 C; 5B1N A; 1Q3E A; 2ILM A; 1ARO P; 3H01 A; 4FFB B; 3AG7 A; 1TUB A; 3F5T A; 2P5O A; 2IJH A; 3I5D A; 4B3M B; 2HHH B; 2UXC O; 2XTA A; 5KAI Z; 1JR9 A; 2PYL A; 1Q82 W; 2Q8V A; 1KYO F; 2BTQ B; 2F95 B; 3B2E E; 4RUF A; 4LFC O; 4RUE A; 3EHB B; 4NTX A; 2WPD G; 1W2B U; 5CA1 A; 1KBH A; 2ODM A; 3TXQ A; 4DV1 O; 3ZRW A; 3R65 A; 4E4E A; 4ICG A; 3CCS V; 3MHS C; 5LHG A; 5J9P C; 3E8H A; 3AG4 C; 3CXH F; 4JYC A; 3SDL A; 4EFE A; 2Q67 A; 3ZCC A; 1VQ7 V; 4JTA B; 4ZOL A; 2ZKO A; 2JIZ G; 2IBZ H; 5CN0 A; 2EIN C; 4X20 B; 1TGO A; 1WP7 A; 3AG4 B; 4PI0 A; 1ORQ C; 1FFX A; 4DO2 A; 2ZR3 A; 4HNA B; 2QM4 A; 1WB8 A; 3HR0 A; 1BS3 A; 2A0L A; 4DV5 B; 1SRY A; 4YHH B; 4TV9 A; 1F4M A; 2AZ0 A; 4WFF A; 1FPO A; 4YIP A; 3BFR A; 4JGS A; 4CS4 A; 2WLK A; 1WPX A; 3KG2 A; 5B3S C; 4LF6 B; 4K0K O; 4K8Z A; 1MSW D; 1ZTE A; 4P30 A; 4FZ0 A; 1K92 A; 2EIJ C; 4DR6 B; 2R9A A; 4JPR A; 2R70 A; 5CBG A; 3HKE A; 1US6 A; 3TK1 A; 4G2K A; 2EX3 A; 2IJK A; 3L9D A; 4ZI7 B; 2OWO A; 5EC2 C; 3CEI A; 4GYC B; 5J2T A; 3UT5 A; 1EM1 A; 2YEV A; 1GMG A; 2XAF A; 5BMV A; 2Y48 A; 3B77 A; 1SA0 A; 3CCU V; 1E1Q G; 1XQ8 A; 3P32 A; 5LP6 C; 1PL0 A; 5GTH Z; 2CTR A; 3N2G B; 2IJJ A; 3B4S A; 3MDS A; 3BY6 A; 1QLE B; 5KX5 A; 2H8P C; 3T1Y O; 1XUQ A; 2A3Q A; 3K04 A; 1DLB A; 3IAY A; 1G8M A; 2B9Z A; 1SQX H; 4XDK A; 3CRR A; 1M4U A; 2DWD C; 2K9P A; 4YY3 B; 5BR8 O; 4X66 B; 2HG5 C; 1ZL8 A; 5A9G A; 3SJA C; 4DR3 B; 2F66 C; 1N33 B; 3WB1 A; 4JZG A; 4YJ2 A; 3WU2 Z; 4NB5 A; 3W7T A; 2F4V B; 3RYH A; 4UV9 A; 4WF9 V; 4MS2 A; 4DV6 B; 4IHJ A; 1T5E A; 3UKM A; 2ZT9 B; 1XMO O; 4RQF A; 3G71 V; 4PJ0 Z; 4PDV A; 3C3S A; 3JAR B; 4U7N A; 3GWO A; 5LXT A; 1JJ2 U; 1IBK B; 2OIG A; 5L3C A; 1OCO C; 1UPG A; 3UO3 A; 4L87 A; 2ITD C; 2B1I A; 2Q0A A; 3RVZ A; 2W0F C; 4BWA A; 2D2C B; 4H44 B; 1CEZ A; 3GB7 C; 2NLJ C; 2XAH A; 3W7S A; 3SJC C; 5LMU B; 1R3L C; 1IBM O; 2ZXW C; 1RFY A; 2JK5 C; 3JCZ A; 2DMX A; 1K4C C; 4TV9 B; 3LNM B; 2YSU B; 2UUA O; 3ZED A; 4HBN A; 1FXK A; 1PM9 A; 1QVG U; 4LF5 O; 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