The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from S. cerevisiae Myo3
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
11
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YDL A; 5IHN A; 1NYG A; 2KEA A; 4OML A; 3M0T A; 3RNJ A; 1PRL C; 2JTE A; 2DIL A; 5HCK A; 2KE9 A; 1E6H A; 1W70 A; 1YWP A; 4AFU C; 1FMK A; 2P4R A; 5IHI A; 1M3A A; 4ESR A; 2B86 A; 1PKS A; 1XOV A; 2C0I A; 3REB B; 1BU1 A; 1PNJ A; 4HVW A; 4LUE A; 2JM8 A; 1JU5 C; 2PNI A; 1YN8 A; 1X2K A; 2KRO A; 1GCQ A; 1MV3 A; 1A0N B; 2PTK A; 3EG1 A; 1CKA A; 5GJW B; 2X3X D; 3GBQ A; 1JO8 A; 1KIK A; 1K0X A; 1TUC A; 2KGT A; 2EGE A; 2KR3 A; 2K9G A; 1NLP C; 1U3O A; 2ED0 A; 1WIE A; 2L3S A; 5I11 A; 1VYT A; 1GRI A; 1OPL A; 2RNA A; 2JS0 A; 1X6G A; 1T3L A; 3VS6 A; 2A28 A; 2C0T A; 2QDL A; 1WXU A; 4GLM A; 2DLP A; 4JJD A; 1PRM C; 2DL8 A; 1KJW A; 2DVJ A; 1AVZ C; 2CSQ A; 4RTZ A; 4GBQ A; 3I9Q A; 1M3C A; 1UJ0 A; 1KFZ A; 1HD3 A; 5FWB A; 1GL5 A; 1ZUY A; 2DBK A; 2DRM A; 1NEG A; 1Z9Q A; 5L23 A; 2MCN A; 4RTX A; 1M27 C; 2EYX A; 1M30 A; 2EYY A; 2CT4 A; 2J6K A; 2OI3 A; 1SSH A; 1WA7 A; 1AWX A; 1UG1 A; 1UE9 A; 2EQI A; 1NM7 A; 1KSW A; 2O31 A; 3PVQ A; 1M8M A; 2JS2 A; 1N5Z A; 2EVR A; 1UHC A; 2YUQ A; 2LJ3 A; 1PWT A; 1B07 A; 1SRM A; 4RTW A; 3A98 A; 1ZUU A; 2RPN A; 1W6X A; 3SHW A; 5IH2 A; 2ECZ A; 2VKN A; 2KRN A; 4KRT A; 2D8J A; 3EHR A; 2KYB A; 3THK A; 1WFW A; 2YUN A; 1GFC A; 1QKX A; 2J6F A; 4FSS A; 4AFS C; 2J6O A; 2EBP A; 2NUZ A; 5IXB A; 2RQV A; 3VS5 A; 3PE0 A; 2YUP A; 1X6B A; 2GGR A; 1W1F A; 2MOX A; 1QWE A; 2FPE A; 4AFQ C; 4JJC A; 1Z9Z A; 2KBT A; 3TSZ A; 2EPD A; 1HSQ A; 1MV0 B; 1SEM A; 1I1J A; 1WDX A; 2FG0 A; 2ESW A; 1QKW A; 2F2X A; 4J9I A; 2L3Q A; 4JJB A; 4ZNX A; 2EGA A; 3R6N A; 1JXO A; 1I07 A; 1H92 A; 1RLQ C; 1QLY A; 1WLP B; 1UGV A; 2V1Q A; 4J9C A; 1G2B A; 2IIM A; 2K79 A; 1WX6 A; 1TG0 A; 4Z8A A; 1YWO A; 2RF0 A; 4E6R A; 1ZBJ A; 1AEY A; 1H8K A; 2DL7 A; 3IQL A; 2O2O A; 1NLO C; 2EYW A; 2O9S A; 2SRC A; 1K76 A; 3ZL7 C; 1E7O A; 2FEI A; 3VS3 A; 1K9A A; 3M0U A; 1Y57 A; 1YNZ A; 2AKK A; 2V1R A; 1U5S A; 2DYB A; 2J06 A; 1ABO A; 2E5K A; 3UA7 A; 1AZE A; 1RUW A; 1B3Q A; 1OPK A; 2DJQ A; 1AWW A; 2LQW A; 2JXB A; 1IO6 A; 2K7A A; 1UJY A; 1NG2 A; 2G6F X; 4LE9 A; 1EFN A; 1RI9 A; 4X1V A; 2GTJ A; 2M0Y A; 3EG3 A; 1K4U S; 2LNH B; 2EKH A; 3QWX X; 2DE0 X; 2ABL A; 4AG2 C; 2DA9 A; 4DEY A; 1CKB A; 2F2W A; 4Z88 A; 1VYU A; 2KT1 A; 4JZ3 A; 2CDT A; 3M0P A; 2K3B A; 1BB9 A; 2ED1 A; 1I0C A; 1JXM A; 2YT6 A; 3VS2 A; 2D0N A; 1T0H A; 1NEB A; 2OAW A; 1WXT A; 4RTT A; 4LNP A; 2LCS A; 2CT3 A; 2KXC A; 1TUD A; 2ENM A; 2GBQ A; 4D8K A; 2FPD A; 2HCK A; 4Y92 A; 2DX1 A; 3I5R A; 2RQW A; 4HVV A; 1GBQ A; 3H0I A; 3H0H A; 2HDA A; 4J9G A; 2GNC A; 1AOJ A; 4J9H A; 1S1N A; 2NWM A; 2J7I A; 4Z89 A; 2D1X A; 1BK2 A; 1GCP A; 2JMA A; 2DRK A; 2I0N A; 1YCS B; 4J9E A; 3EG2 A; 2O88 A; 4RTY A; 1AZG B; 1UUE A; 4JZ4 A; 1K1Z A; 1SHF A; 1UFF A; 1X2Q A; 2ROT A; 1PHT A; 5GJV B; 2O9V A; 1ZUK A; 2DF6 A; 2KT8 A; 3UAT A; 2LMJ A; 1BBZ A; 2KXD A; 2L3P A; 1ZLM A; 2LZ6 B; 1GCQ C; 2LJ0 A; 2FRW A; 2H8H A; 2J05 A; 1G83 A; 2CUB A; 3RBB B; 2KYM A; 2DBM A; 1X69 A; 1SHG A; 4IIM A; 4D8D A; 1WXB A; 4CC2 A; 1AWO A; 4WCI A; 1LCK A; 4RUG A; 2BZX A; 3M0R A; 2LX7 A; 3EGU A; 2DL5 A; 4OMO A; 1QWF A; 4A63 B; 1AD5 A; 4J9F A; 1MUZ A; 3VS1 A; 2K2M A; 3H0F A; 5I22 A; 3JV3 A; 1X43 A; 1WYX A; 4ORZ A; 5IXF A; 4JPB W; 3U23 A; 1FYN A; 2LQN A; 2RQU A; 1PKT A; 2JW4 A; 4DEX A; 3NMZ C; 4K11 A; 1E6G A; 1SRL A; 2ROL A; 1YP5 A; 2DL3 A; 5ECA A; 2EYZ A; 3LH5 A; 2PZ1 A; 4IIO A; 4R0K A; 3EG0 A; 5FWC A; 2EW3 A; 2DM1 A; 3CQT A; 2A36 A; 4CC3 A; 2VVK A; 3NPF A; 3VRZ A; 3VS7 A; 2AK5 A; 2A08 A; 4OMQ A; 1V1C A; 1J3T A; 4HXJ A; 1VYV A; 2CSI A; 5EC7 A; 2KRS A; 2M51 A; 2MIO A; 1ZX6 A; 2GTO A; 3VRY A; 1WI7 A; 4AG1 C; 1OOT A; 2VWF A; 2LP5 A; 1GBR A; 2RQT A; 3REA B; 4RTU A; 4F17 A; 2L2P A; 2W10 A; 1UTI A; 4QT7 A; 2SEM A; 4LUD A; 3KFV A; 1JQQ A; 2YUO A; 4OMM A; 4OMP A; 2RN8 A; 1NYF A; 3O5Z A; 3UF4 A; 2X3W D; 2C0O A; 2BTT A; 2CH4 A; 2RQR A; 1X27 A; 1OEB A; 3NHN A; 1OV3 A; 2JMC A; 2DMO A; 2K6D A; 3H41 A; 1SPK A; 2FPF A; 1UHF A; 4OMN A; 2CUD A; 2FO0 A; 1QCF A; 1HJD A; 2FRY A; 3C0C A; 1JEG A; 4F16 A; 4J9B A; 3NGP A; 1CSK A; 2XMF A; 2L0A A; 2W0Z A; 2AZS A; 1K0S A; 3I5S A; 4AFZ C; 1T3S A; 1H3H A; 4EIK A; 2AKL A; 2EGC A; 2JM9 A; 1U06 A; 4CC4 B; 4CC7 A; 4HVU A; 3ULR B; 1ARK A; 2HBW A; 1UEC A; 2DNU A; 4J9D A; 5IHK A; 4RTV A; 2CH4 W; 5FW9 A; 3M0S A; 1RLP C; 2YSQ A; 3M0Q A; 2A37 A; 2BZ8 A; 4F14 A; 2AZV A; 1GFD A; 3EHQ A; 2BZY A; 3QWY A; 1AWJ A; 3I35 A; 3FJ5 A; 3VS4 A; 2DL4 A; 3UA6 A; 4HCK A; 1VA7 A; 2F2V A; 2GQI A; 1ABQ A; 3TSW A; 2OJ2 A; 2KRM A; 4LN2 A; 3SEM A; 2KNB B; 4M4Z A; 3VS0 A; 1M3B A; 2D8H A; 1UDL A; 2JT4 A; 1ZSG A; 2CRE A; 2HSP A; 2HEQ A; 3TVT A; 2RMO A; 1Y0M A; 3PVL A; 2LJ1 A; 1T0J A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RMS A; 2KEA A; 5KH6 A; 1VQ5 A; 2DZC A; 2YWW A; 4J5Y A; 1WNL A; 3BFM A; 1PRL C; 1Y71 A; 3P8B B; 2P84 A; 3AHU A; 4M7A C; 2KE9 A; 1VQP A; 3F70 A; 1MMD A; 2YLB A; 1QW1 A; 4M77 B; 4A4E A; 4AFU C; 1FMK A; 2M9U A; 3BDU A; 2DEU A; 4MZM A; 3X26 B; 2P4R A; 1M3A A; 1PD0 A; 2B86 A; 3V7R A; 4C5I A; 4M7D F; 1UGR B; 1PNJ A; 3PTA A; 2X4Y A; 4HT9 A; 2JM8 A; 1G3T A; 4C0D C; 4IUR A; 1YCY A; 1CKA A; 5GJW B; 3DB3 A; 3UPU A; 5GAN g; 2RD1 A; 3GBQ A; 3OS1 A; 4XU2 A; 1G3S A; 3S3O A; 1TUC A; 2HZY A; 2K9G A; 3X20 B; 2F5T X; 1U3O A; 1WIE A; 4PLL A; 3CPW S; 4JRP A; 1VQ7 A; 3GOX A; 1T3L A; 2EQJ A; 2A28 A; 4JRK A; 4GLM A; 1QVF S; 1VQ4 Q; 3CCQ A; 5GAO l; 5A2Q E; 2DL8 A; 3V7C A; 2D9T A; 3M4G A; 2DVJ A; 3OYE A; 1AVZ C; 4M78 B; 2RH2 A; 5AYF A; 5A0L A; 1M3C A; 4KUL A; 5FWB A; 4QVC A; 2DKG A; 4L59 A; 2YRV A; 1ZUY A; 3NTI A; 2DRM A; 4XU3 A; 2XID A; 2MCN A; 2EYX A; 2M1H A; 2J6K A; 3LWH A; 2OI3 A; 3JCM P; 3RR6 A; 1PCX A; 1AWX A; 1UE9 A; 1Y07 A; 1TUG B; 1QVG A; 2JS2 A; 1N5Z A; 2EVR A; 4M75 A; 1B07 A; 3LGF A; 3QII A; 3EFO A; 2EAY A; 1SRM A; 3A98 A; 1ZUU A; 3CCL T; 2RHI A; 1JJ2 S; 1WJQ A; 5LJ3 f; 4ELZ C; 2KRN A; 3OQ5 A; 3CME T; 3THK A; 1HXD A; 4TVR A; 4C92 F; 4XQ3 A; 4XTU A; 3QPH A; 1VQ8 Q; 3JSC A; 1Q81 C; 3GLX A; 3EFR A; 1W1F A; 2MWP A; 2FPE A; 4AFQ C; 5LJ3 g; 2E5Q A; 1Q7Y R; 2FZK B; 3JCM e; 1K9M R; 3L42 A; 2FG0 A; 1VQ9 T; 2PUO B; 2CZ6 B; 2EFI A; 3H6Z A; 1NJI U; 3G4S A; 1PSE A; 5D6W A; 1YIJ T; 4YTL A; 1S72 A; 2EGA A; 2QXF A; 5GAN 2; 3MKD A; 2EJF A; 4LDX A; 1RLQ C; 1QLY A; 3CCM T; 2HNI A; 5GAN 4; 1WX6 A; 3P8H A; 4OMF B; 4Z8A A; 1MHN A; 2K57 A; 2RF0 A; 1MND A; 1AEY A; 2E4H A; 1H8K A; 3CMA T; 3NFC A; 3RMQ A; 2I2L A; 2O2O A; 4XAX B; 2HAX A; 2EYW A; 1OU9 A; 1K76 A; 2FEI A; 3VS3 A; 2DXU A; 2E70 A; 2V1R A; 3GNF B; 3HFO A; 5LJ3 e; 2E5K A; 1QVG P; 3L2Q A; 2DPP B; 2RJD A; 2X9H A; 3G6E T; 3JAM E; 5KCO A; 2XIC A; 2G6F X; 2M0Y A; 3CBO A; 1O75 A; 2LNH B; 4M75 C; 1BI0 A; 5GAN d; 2DE0 X; 3TCJ A; 2YXY A; 4AG2 C; 1SG5 A; 2DTI A; 4DEY A; 1VYU A; 4DBQ A; 4C8Q E; 4JZ3 A; 2LT4 A; 2IPO B; 3CC4 A; 2ED1 A; 4M7D D; 2HL3 A; 1VIE A; 1Y96 B; 1K73 C; 5KYY A; 4RTT A; 2VB6 A; 2LCS A; 2CT3 A; 2K5L A; 3VU3 C; 2JJ9 A; 4D8K A; 4Y92 A; 4M7A G; 3VUB A; 1GBQ A; 4RG8 A; 3H0I A; 2HDA A; 2E3H A; 2NUP A; 2PVD B; 4RCC A; 3OYB A; 3CC7 Q; 5LJ5 f; 2ZAE A; 4RKU E; 2RHU A; 1RAB B; 4O5V A; 4C8Q G; 2O88 A; 3EG2 A; 3FIF A; 4JZ4 A; 4LD9 K; 2KY9 A; 2WSC E; 3MET A; 2DXT A; 1PHT A; 3N5B B; 5GJV B; 2RB6 A; 4BUG A; 1SSF A; 1K8A R; 3QKJ A; 1AHJ B; 4N4G A; 1BBZ A; 4BI3 A; 1AT1 B; 2QA4 T; 1G3W A; 1ZSZ B; 2KYM A; 1KHC A; 2LTO A; 1SHG A; 2BKD N; 2DIG A; 4IIM A; 2K3Y A; 4CC2 A; 5LJ3 d; 1LCK A; 2AHJ B; 1VQL A; 1M2V B; 1JJ2 A; 2GCX A; 4E7H A; 3VS1 A; 3OBY A; 4FYX B; 2K2M A; 3H0F A; 5LJ5 e; 4PJO C; 3LX7 A; 4A53 A; 1Q82 C; 4C92 D; 4JPB W; 2CS7 A; 3VV0 A; 4DEX A; 2M16 A; 2PVO B; 1TS9 A; 4QVZ A; 5D6Y A; 5FWC A; 4DBR A; 2DM1 A; 3RKY A; 2VVK A; 3NPF A; 1M1K C; 1VQ8 T; 3MEA A; 2AK5 A; 2A08 A; 2DD4 A; 1ZQ1 A; 2RK1 A; 2DTO A; 4M77 A; 1KC8 R; 3A1P A; 1VQ6 Q; 4HXJ A; 1M90 R; 2KRS A; 1MMG A; 2LDM A; 2GTO A; 3JCM V; 1VQO T; 1YHQ A; 1JBM A; 3CCE A; 3FLG A; 3MJX A; 1KD1 C; 1M1F A; 2V8J A; 3REA B; 4RTU A; 2L2P A; 1YI2 Q; 2FYK A; 2SEM A; 4E7Z A; 3M54 A; 1VQK Q; 1OZ2 A; 5HKC A; 3UWN A; 3JRZ A; 5CK9 A; 5GAN h; 2C06 A; 2H3J A; 2DTH A; 2P0Q A; 2RN8 A; 3ZFJ A; 2MK5 A; 3G71 A; 3JB9 F; 4EMG A; 1JJ2 P; 1TWB A; 2L89 A; 4DBF A; 1I81 A; 3NHN A; 1C6V X; 1QMC A; 2JMC A; 3LLR A; 4EPC A; 1VQ5 Q; 2D6F A; 2QAZ A; 2XU8 A; 3HRT A; 2F69 A; 1UHF A; 2CUD A; 1UGQ B; 2FRY A; 2RI2 A; 1B7T A; 2EQK A; 3C0C A; 4ZGE B; 5GAN 5; 1JEG A; 3PNW C; 3OYN A; 4M78 A; 2CZ1 B; 2HQX A; 1CSK A; 3HRU A; 1VQP Q; 3OYD A; 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4LD6 A; 5I2S A; 5FU7 B; 1TH7 A; 2ED0 A; 2L3S A; 3BY7 A; 5I11 A; 1VYT A; 1YJW T; 2JS0 A; 3CCS Q; 2O4X B; 2E64 A; 4E2F B; 1N8R R; 3G4S Q; 1WXU A; 1WQW A; 1SKU B; 1XJW B; 1R77 A; 3JCM W; 1PRM C; 1Y96 A; 4RTZ A; 2DYI A; 1KFZ A; 3SWN A; 4ZGJ B; 1NEG A; 3UT1 A; 5L23 A; 4RTX A; 1QQJ A; 2CT4 A; 3OYI A; 1RAF B; 1UGS B; 4BD3 A; 2X4X A; 1D0Y A; 1DJ7 B; 1UHC A; 2QTX A; 3CCR A; 1M1K U; 1W6X A; 4E7K A; 3URG A; 4DOW A; 2ECZ A; 5GAM f; 2R5M A; 2D8J A; 1YI2 A; 4C5E A; 4BY6 B; 2HQE A; 2WSF E; 4AFS C; 1VQ5 T; 5IXB A; 2EBP A; 5CAI A; 3QDR B; 2EJ9 A; 3CC4 Q; 3TRE A; 5GMK e; 8ATC B; 2YUP A; 3CD6 A; 4HCC A; 2MOX A; 1ZSZ A; 1FWZ A; 4RCB A; 1Z9Z A; 5AT1 B; 1VQP T; 3EFS A; 1I1J A; 4P5N A; 2EYQ A; 2EKO A; 1QKW A; 2RHZ A; 1HK9 A; 1RL2 A; 4OB0 B; 5DLO A; 3J80 E; 1RAC B; 4J9I A; 1B34 B; 2X35 A; 1JXO A; 1M2V A; 1GXI E; 1P92 A; 1N27 A; 2DER A; 1H92 A; 3MEV A; 1WLP B; 1UGV A; 4J9C A; 1G2B A; 5KCH A; 1TG0 A; 2XDP A; 3BW1 A; 2KK4 A; 2SRC A; 5GAN f; 2OTJ A; 3M0U A; 1M1G A; 3CCU A; 3JB9 J; 1YNZ A; 1U5S A; 2XKO C; 4C8Q C; 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