The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
AIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| molecule keywords |
Interleukin-1 beta convertase
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| publication title |
Structural analysis of caspase-1 inhibitors derived from Tethering.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
15
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.36: Caspase-1. |
| pdb deposition date | 2003-12-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HBQ B; 1RWN B; 2H65 B; 3GJS B; 2H4Y B; 1RHJ B; 3EDR B; 1IBC B; 2H51 B; 4DCP B; 1RHM B; 3IBC B; 3KJF B; 1RWO B; 1RHR B; 2CJX B; 2QL9 B; 2QLF B; 1RHU B; 2H54 B; 1RWP B; 3P4U B; 1QTN B; 3R7B B; 4LSZ B; 2C2K B; 1QDU B; 1SC4 B; 1SC1 B; 1RWW B; 1RHK B; 2H5I B; 3GJQ B; 2C1E B; 3SIP B; 1I51 B; 4ZVQ B; 2CDR B; 1SC3 B; 2CNK B; 2QLJ B; 1RWK B; 2HBZ B; 1ICE B; 3R6L B; 5IC6 B; 3R6G B; 5K20 B; 2H5J B; 4ZVP B; 1RE1 B; 1RWX B; 1GFW B; 3QNW B; 2H48 B; 4ZVR B; 2XYP B; 3RJM B; 1BMQ B; 1PYO B; 4ZVO B; 3GJR B; 1RWM B; 2HBR B; 2QLB B; 4ZVT B; 3KJN B; 2Y0B B; 4DCJ B; 3R7S B; 4ZVU B; 1PAU B; 2CNL B; 1RHQ B; 3EDQ B; 2CJY B; 3NS7 B; 4DCO B; 2C2M B; 3IBF B; 2P2C B; 5IC4 B; 2DKO B; 3KJQ B; 2H4W B; 2QL7 B; 2FQQ B; 2XZT B; 3D6H B; 3R7N B; 1I3O B; 2XZD B; 1NME B; 1RWV B; 2QL5 B; 4JB8 B; 2C2Z B; 4ZVS B; 1F9E B; 2XYG B; 3GJT B; 2Y1L B; 3D6M B; 2CNO B; 2CNN B; 2XYH B; 2C2O B; 2HBY B; 3R5J B; 3D6F B; 3P45 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3S7R A; 4OZ1 A; 1JLB B; 2HQF A; 2UVR A; 2F40 A; 2GO9 A; 3T6B A; 3DLH A; 5L1J A; 1F2H A; 1K47 A; 1RHU B; 2RUS A; 3V81 A; 1RAA B; 1KEK A; 2MGZ A; 5D0G A; 3BGU A; 1JJC B; 2BQU A; 4ILL A; 4LFB J; 4HHU A; 2GZO A; 4ZJL A; 1UCN A; 1M5H A; 1PBU A; 4GMK A; 4F02 A; 3R6L B; 4RLE A; 1FRJ A; 3HHL A; 2E1M C; 3G6X A; 2ERR A; 1RTJ B; 1SL2 A; 2IM0 A; 3H5X A; 3CCQ S; 1KFD A; 4DQQ A; 4PG6 A; 3CED A; 3DYA B; 5KFO A; 1UET A; 1FWK A; 3KMQ A; 4DV1 J; 1RAG B; 1OY9 A; 4K4Z A; 3DLJ A; 2XUL A; 3OUY B; 5E3R A; 2UVW A; 3O6Q A; 4J9M A; 3SCK E; 3D54 A; 2G2Z A; 3AFG A; 3BQ2 A; 3WC0 A; 2CNO B; 2XMW A; 3FFI A; 1K1S A; 1ZAX A; 5A0Y A; 2J7U A; 1B99 A; 4YDX A; 3C46 A; 2YWW A; 1VQP S; 4HL9 A; 3F44 A; 1TK0 A; 5EUH A; 3SZ2 A; 3QID A; 1VCT A; 1S1W A; 2JLE A; 3B78 A; 3VAH A; 1HMV A; 2ZWO A; 1U0S A; 2IVF B; 1RT6 A; 2DGV A; 2GVD B; 3JQK A; 2APO A; 3KLI B; 1TKX B; 4K8R A; 4W92 B; 4HH1 A; 3QT7 A; 3PW2 A; 1JKH A; 1ZET A; 4PXD A; 2WTF A; 2Z2L A; 1ZOT A; 3KUG A; 5EGY A; 1GMV A; 3DDK A; 4ZDN A; 3GSI A; 1FNX H; 4I1T A; 4H4M B; 4I2P A; 5KFZ A; 3K17 A; 3PRD A; 1ZAW A; 3R5G A; 2VBW A; 2WK4 A; 2WVE A; 3UCZ P; 2NXJ A; 3IR5 B; 3HVA A; 1BQN A; 4KHP F; 1TFW A; 3K5N A; 4OIX A; 1JLC A; 3M8Y A; 2BZ2 A; 3D6H B; 4CLS A; 4WP8 A; 1Y3J A; 1N32 F; 3R27 A; 4XPE A; 1FJE B; 4R5P B; 3TYT A; 4JI3 J; 3NOG A; 3VAJ A; 2XI2 A; 3IWL A; 4M5G A; 1XMQ J; 1N6Q B; 2UU9 F; 3C6T A; 5AE2 A; 3H90 A; 1IBM F; 2N7C A; 1LEO A; 4JYA F; 4WTO B; 4NLG A; 5LSR A; 2E1A A; 3A12 A; 4K0K F; 4WZM A; 1S59 A; 3OQ2 A; 1NZ8 A; 5KFY A; 5KFN A; 3OR1 A; 4USJ C; 3TZY A; 2BW2 A; 2LP4 A; 5GME A; 2A3J A; 1HD1 A; 2VPY B; 1ZS6 A; 3GR1 A; 3KYL A; 1YRX A; 4OYZ A; 4DV7 J; 1S0N A; 2VFS A; 1SJ3 P; 3DRR B; 3BB5 A; 2RVJ A; 4LVN P; 3NOC A; 4O44 B; 3FBF A; 1VC0 A; 2NSB A; 1JJ4 A; 5K14 A; 4D3G A; 2MKH A; 1RWM B; 2AEM A; 2HQG A; 2QLB B; 4GKK F; 1GMU A; 1FRH A; 4YUD A; 3NS7 B; 3WQP A; 3Q8R B; 4J9O A; 3W3S A; 3ZTP A; 2VFU A; 2XBP A; 2GIR A; 2VAS A; 3AXM A; 4KH0 B; 3BDP A; 4ZLP A; 5J2P B; 2RML A; 1YGY A; 3NNC A; 1KBR A; 4YHH F; 3J80 U; 2DGS A; 2GW8 A; 3TZZ A; 1DLO B; 3W2V A; 3G2X A; 1H38 A; 2ZH7 A; 4EFA C; 3M9M B; 3HX9 A; 4M5D A; 3EDR B; 3GIR A; 1BXN A; 2IDE A; 4PWW A; 4DUT A; 4Q0B A; 3MM8 B; 1QE1 A; 1RT1 A; 4ANE A; 2MY8 A; 3IWX A; 2Z0G A; 2GVZ B; 2C2R A; 4YEA A; 2NUH A; 4ZCI A; 3CD5 A; 3CIM A; 1NRK A; 5KFQ A; 3A8E A; 4QPX A; 3KK1 B; 4GC7 A; 2RF2 A; 1UWB B; 2HBZ B; 4WE1 B; 5A6P A; 1Q53 A; 5F0W A; 1RZM A; 3PO5 A; 5K8N A; 5DQI A; 3K57 A; 2XCP A; 2GA7 A; 2XMM A; 5LJ3 Y; 3DXB A; 4QIW D; 1Q7L B; 2MQL A; 2X51 A; 1O5J A; 2W25 A; 3QLH A; 3GFX A; 2YVS A; 2EBE A; 2EKN A; 3F0N A; 2HGL A; 4J7C A; 2DNL A; 2YWH A; 3JSM B; 5GAG U; 3H42 A; 1HR0 F; 3DHX A; 2B9X A; 4FBU A; 3JTN A; 5BJR A; 3RRG A; 3CC2 S; 4X4Q A; 1T05 B; 4R0J A; 2HVZ A; 4DU7 A; 2AEJ A; 4J9K A; 4DS4 A; 3QJL A; 2GNK A; 4YR0 A; 4ICL B; 1SBR A; 4F26 A; 1RHJ B; 3M7V A; 3AJ2 A; 5HBM B; 4HEA 9; 2IBK A; 3BPS P; 1D8Y A; 2RU9 A; 2HMI A; 1PJ6 A; 3GJQ B; 2SXL A; 3H5S A; 1WF1 A; 4QYZ K; 2LVW A; 3DU6 A; 5DM6 Q; 3G6Y A; 1HNV B; 1VQS A; 3R2C J; 2D9O A; 1TL7 A; 4BHQ A; 2IJR A; 2XTJ P; 1C0U A; 4C0O C; 1GTH A; 1K8A T; 3GIJ A; 4JI1 J; 5HVH A; 3C2P A; 4C8M A; 2DD8 S; 4RNH A; 4RUA A; 1I1G A; 3I5B A; 4PPZ A; 2BX6 A; 4X65 J; 1QAX A; 2BAN B; 2LXI A; 1UPM B; 2RRA A; 2MLY A; 5IT4 A; 5AE3 A; 3M9N B; 4HTI A; 1EET B; 2NYH A; 4ZKA A; 2M4M A; 2KJV A; 2NR0 A; 4B02 A; 4ED1 A; 4WKY A; 3VWS A; 4QW9 A; 3ILJ A; 3O5T B; 3RU0 A; 5K8O A; 4X62 J; 1MWY A; 1MW7 A; 4CCH A; 2IA0 A; 2ADC A; 3CCT A; 4JI2 F; 5KFS A; 2CQC A; 3UDV A; 1JLQ A; 3GIM A; 3DOL B; 5CYQ A; 3SCI E; 3PFO A; 4HYK A; 3R7B B; 5E3P A; 2VG7 B; 1J5O A; 3GYX B; 1MN9 A; 4HTJ A; 4X4P A; 3SYZ A; 1F2G A; 1OY8 A; 4QR1 A; 2IIH A; 1JNR B; 4RL1 A; 3IXQ A; 4LF8 F; 1N0V C; 1RT7 A; 3K59 A; 1Q5V A; 3KNG A; 1VGY A; 1YBT A; 4LBH A; 2DNR A; 2CIM A; 1ZA2 B; 4ZVO B; 2W7O A; 4ECV A; 3LAL A; 5F8N A; 2JEG A; 3M2U B; 4WU2 A; 1NEE A; 2ROE A; 2Z4P A; 3MOJ B; 3QO9 B; 4RW9 B; 1P27 B; 3HKZ D; 1HNI B; 2R8G A; 3KK3 A; 2AX0 A; 3GV7 B; 4CLP A; 4L73 A; 1M1H A; 2BE9 B; 2EFG A; 2OFH X; 3L09 A; 2VA2 A; 3VGS A; 3ZZP A; 1PC4 A; 4LFC J; 4EU0 A; 3QRQ A; 1HW9 A; 5J2M B; 4MKB A; 4DS5 A; 1N5S A; 3M2V A; 4FDF A; 2AYM A; 4G3I A; 1DZ5 A; 2N4D A; 3PFE A; 3GIL A; 5HQL A; 1SKR A; 5FD1 A; 3DN9 A; 3OR2 B; 3KJF B; 1RWO B; 4GVL A; 3OD2 A; 3UN3 A; 1M1G A; 4DV5 F; 1EAR A; 2HS0 A; 2F4V J; 2WB4 A; 1HBM A; 5F8I A; 3VGU A; 5E3Q A; 1OQ3 A; 4WFB Q; 3CCJ S; 4QPT A; 4J9S A; 5HAN A; 3RZA A; 2FGO A; 1TUW A; 4TLR A; 3CO9 A; 2YKA A; 2R8I A; 3A8K A; 3FK4 A; 4GKJ F; 4G65 A; 5CAB A; 3DI6 B; 2ZOM A; 3QQC D; 3SI8 A; 3HFZ B; 4B9U A; 1FVS A; 3PYD A; 1N5T A; 3KG0 A; 2UXD F; 1VBY A; 4TNO A; 4ID5 B; 4WP3 A; 4PG4 A; 4FXV A; 3QIP A; 1R8C A; 2X1G A; 2H5E A; 4R8U A; 1KVJ A; 2DY1 A; 2NXC A; 4CLT A; 2E5L F; 1S6P B; 1U1M A; 2M7S A; 1WKJ A; 3MM7 A; 1C0T A; 2P5V A; 3EYZ A; 1YIJ S; 1LFP A; 2V2V A; 3GTY X; 5HJX A; 3ELH A; 1MRO B; 1NK7 A; 3I0S B; 5J1N A; 3KLF B; 4EZ9 A; 4F3Q A; 1TKZ B; 4U7U K; 2MJU A; 1WC3 A; 2ALZ A; 1OJ4 A; 3PX0 A; 1F0X A; 3KHL A; 1LW0 A; 5B7W A; 1QM9 A; 4ZPW R; 4U7C A; 5MLC V; 3OLA A; 1CJK B; 5B0B A; 2D74 B; 1SKU B; 2PA3 A; 5HRO B; 2L9W A; 1ICE B; 4J9U E; 1TV6 B; 4PQU B; 2FZG B; 3HJV A; 2ACY A; 4X4R A; 1FD8 A; 3HKW A; 4AUK A; 2VIC A; 3M30 A; 4WWS A; 4RJV A; 3EXC X; 4NOH A; 2MHE A; 1IN0 A; 2M3D A; 3JQM A; 2EI5 A; 5IM0 B; 1S1T A; 3I96 A; 4ECQ A; 2EK1 A; 3F41 A; 3TUZ C; 4LF5 J; 2D3Z A; 3PCO B; 2XY5 A; 4N77 A; 4DMZ A; 4YOE A; 4YR2 A; 1BQM A; 2XYH B; 3R5A A; 4LRD A; 2QSF A; 2FHO B; 1FA0 A; 1U02 A; 2CG8 A; 1H2T Z; 1Q1K A; 1XR6 A; 2RKI B; 3NWR A; 4ECS A; 3O1L A; 3FCH A; 2O01 C; 4WFX A; 2BE2 A; 3OVB A; 3OVA A; 4XK8 C; 4ZP9 A; 3CDU A; 1QTN B; 1R6Y A; 1SIW B; 4LSZ B; 3HUL A; 3UD4 P; 1H72 C; 2FY1 A; 2BYC A; 4FF1 A; 3TAQ A; 2IMW P; 2V50 A; 2L41 A; 2HLU A; 3TVK A; 1G1X A; 2O67 A; 4OHX A; 3JYT A; 1FEH A; 2UUT A; 2HHW A; 4WIQ A; 2H48 B; 4NWB A; 5D4L A; 3ZZT A; 3HHN B; 4DUY J; 4USM A; 2MQQ A; 3MPD A; 2FUG 9; 4USI A; 4TXS A; 3QAU A; 4OHV A; 5LMU J; 2UUC F; 5I3U A; 2DO0 A; 2H4W B; 1LK5 A; 1IKV B; 2VA3 A; 2OPP B; 1YJV A; 2K3K A; 1AB8 A; 1S76 D; 3NCR A; 5D4O A; 4M5K A; 3PW0 A; 1AA1 B; 2XLK A; 2OSQ A; 1HHQ A; 1R0C B; 2I2Y A; 3IBW A; 3UW1 A; 1MMD A; 3MR5 A; 4AL5 A; 3AAW B; 4X66 F; 2B0G A; 1Y5L B; 1R7I A; 1JLG A; 3MD3 A; 2HQC A; 2ZDP A; 1IBC B; 3OTC A; 1RCO B; 2KH9 A; 2LQ8 A; 3OXG A; 4I64 A; 2NPF A; 3CCZ A; 1G2E A; 2R7Q A; 3LP1 B; 1K73 T; 4C8K A; 4NI2 B; 4EMD A; 2F65 A; 1VQ7 S; 5DLF A; 2CQD A; 4L76 A; 2R7U A; 4Q45 A; 1S1V B; 4NLT A; 4OJ1 A; 2AT1 B; 3HFK A; 2P9G A; 3CB4 A; 2ILY A; 4NEY A; 4ATN A; 2CNL B; 4KHR A; 1IBK J; 1HBO B; 5AXL A; 2NRE A; 1LWX A; 4WP9 A; 5IQ6 A; 4J9R A; 1FK9 B; 1R6V A; 3ENQ A; 2KM8 B; 4LF7 F; 1S1U B; 3ITH B; 1BWV A; 4ELU A; 4JI7 J; 1N0U A; 3Q8Q B; 2OUG A; 3AQO A; 2C2N A; 1N88 A; 1YJ7 A; 1NB2 A; 5EWF A; 1H74 A; 2FJX A; 4PAA A; 1PO6 A; 3WX4 A; 1N36 F; 3B8H A; 1KWM A; 4ANC A; 4A8Q A; 3FCW A; 1VQO S; 1RP5 A; 4I0W A; 3OTB A; 2W8K A; 2YXL A; 1RK8 A; 1Q95 G; 4JI6 F; 1HWU A; 4MIW A; 3Q23 A; 4QR2 A; 1X7V A; 1UEK A; 3WIV A; 5HVF A; 4K4W A; 4DL4 A; 3AXK A; 4AE5 A; 4QCL A; 4I2Q A; 3FUY A; 1SC3 B; 1WJ9 A; 3D66 A; 4NLU A; 2VKZ G; 1BHN A; 5A8R B; 1WF0 A; 5KFT A; 1WI8 A; 1V5I B; 3ZZ0 A; 3ETM A; 4DPY A; 5IV4 A; 1PIE A; 5ADZ A; 3MOZ A; 2YX1 A; 4L75 A; 1SIZ A; 2LU1 A; 2E7V A; 3A4T A; 3MM9 B; 3G8T A; 3D6F B; 1RAF B; 2ZBI A; 2EC2 A; 1CLF A; 2HIY A; 1ZM4 A; 2DVI A; 4W98 A; 5L8R C; 1RHR B; 4HR2 A; 2JRS A; 1HQE B; 4IFV B; 1SJ1 A; 3H2L A; 3W61 A; 1UPP A; 4MFB B; 4R25 A; 4RUC A; 5I42 B; 3OFG A; 3Q8S B; 3FZ2 A; 3GU0 A; 3NS6 A; 2ZOF A; 3CXC R; 4L3K A; 4AT1 B; 1VQY A; 1PAE X; 3OFE A; 3TQ1 A; 2DPI A; 1H7W A; 3M32 A; 4ZVP B; 1YKW A; 2Y3Y A; 2BMB A; 5C2C A; 4LF9 F; 2XMU A; 3T5L A; 2BEF A; 4CYU B; 3E3X A; 4LF4 F; 2KHD A; 4WBF A; 1T9Y A; 4NXM J; 2E1R A; 5DDQ C; 4KT0 C; 5JUM A; 4WFZ A; 2VQF F; 2G4B A; 2XSJ B; 3EZ5 A; 4P75 A; 2VPX B; 4Y2A A; 1Y7P A; 1A0O B; 3MEK A; 3C14 B; 2VC0 A; 3UR3 C; 1RWU A; 5HLF B; 2DCL A; 3OSN A; 4B9M A; 3EIC A; 1KFS A; 2WW8 A; 3W5X A; 3I4P A; 3GV5 B; 2JNJ A; 3SSR A; 1OQ6 A; 3CJQ A; 3EGV A; 3CCV S; 4KJI A; 3NXZ A; 3CME S; 3TWZ A; 5HI7 A; 1GXL A; 2OPR A; 1XNQ F; 2C2K B; 4X2B A; 4ZIV A; 2DGX A; 2PMZ D; 2YNF A; 4IH6 A; 1KR4 A; 4ED0 A; 5M2U A; 4RWW A; 1VMB A; 3KWM A; 2W9B B; 4NLP A; 1H73 A; 4ECX A; 4DR7 J; 4ETX A; 3CPW R; 3SV4 A; 2LKZ A; 1JLE A; 2M9K A; 2FJE B; 1RAO A; 1XC9 A; 2HHQ A; 4Q8E A; 2DXD A; 3MEG B; 2DEJ A; 1WD6 A; 5DG9 A; 2QX0 A; 3MAA B; 2XZT B; 1OMS A; 4X4N A; 1SC6 A; 1NJZ A; 1OSD A; 4LVO P; 3PKY A; 3L7P A; 4DX7 A; 1TKT B; 3HD2 A; 1JJH A; 1T9T A; 2R3V A; 1WAC A; 2N7Y A; 3RRH A; 4FN5 A; 5D0R A; 5C24 B; 1FKP A; 1PC5 A; 4CLF A; 1H2U X; 2BAC A; 3H2V E; 3PYG A; 4M5I A; 3IO1 A; 3DRX A; 4TKT A; 1NDC A; 2N3O A; 3OL8 A; 1U2C A; 2ZKT A; 3FGV A; 3D68 A; 3C19 A; 1HNW J; 5DJB A; 5THW A; 2JEF A; 1OWX A; 3FSX A; 2DTJ A; 1WG1 A; 2ASL A; 2Z8Q A; 2LDY A; 1KDN A; 2WSC C; 4HVZ A; 4J5O A; 3LP0 A; 2YNI B; 3HZG A; 2EG2 A; 2CNK B; 2KZZ A; 4FYD A; 2GIF A; 1IKX A; 4W4M A; 1XMO F; 4OX9 F; 2O3D A; 3EM1 A; 3G8Q A; 2Z30 B; 1FX4 A; 4LR7 A; 3KJN B; 4CLK A; 3VTI A; 1FWL A; 1HBU A; 3EGN A; 1UTA A; 3IA0 A; 2NZ4 A; 1KLM A; 1X60 A; 4OZJ A; 3NG8 A; 1S9G B; 4DPO A; 3LAN A; 1YDL A; 1KD1 T; 1IWA A; 4KO0 A; 2Q43 A; 3MHY A; 2E1P A; 3EXY A; 2CPE A; 1N33 F; 3MMC A; 1HIY A; 3CCM S; 1VS3 A; 1VR6 A; 3HHL C; 3LGM A; 3RB0 A; 5KFJ A; 1RTI B; 1NHK L; 2AF6 A; 3HF5 A; 4QWC A; 5LXY A; 1Q0N A; 5DQH A; 3I6P A; 3OBI A; 5KT2 A; 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