1S0FA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type b at ph 7.0
Total Genus 390
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
390
sequence length
1290
structure length
1276
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin, hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
publication title Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins
pubmed doi rcsb
total genus 390
structure length 1276
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2003-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1s0fA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0fA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1s0fA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1s0fA01
5DUUA 1GICA 4GA9A 3O4OA 1AVWB 4YGBA 1AVBA 3I4IA 3VV1A 1LJ7A 3NV3A 1LOFC 3NV4A 3CA4A 5JLVA 1D0HA 3IM0A 4WVVA 3CRGA 5JMCA 1IS4A 2ZKNA 3NWKA 3C88A 1LU1A 5CA6A 1R8OA 4L4IA 4BMEA 1DLLA 5KXBA 1FAYA 3FJCA 4LBNA 3EF2A 2NN8A 2A70A 4XHBA 1QOOA 4I4YA 3MW3A 4YM2A 3OJVA 3DGTA 4Q1RA 4XZPA 1BFBA 3V0AB 4ELCA 4FPLA 4G1RA 2A6XA 1K5UA 5FREA 3IM6A 3VT0A 3ILRA 4USOA 1AVXB 1CVNA 3POWA 2WSVA 3BADA 3OYWA 3FBYA 4XFTA 4AYUA 2EAKA 2Q5TA 1BFFA 2JKBA 1JTCA 2E4MC 2FO1A 1SLLA 4YM1A 3D6EA 4R9BA 3H6RB 4DCKC 1W3FA 4OZXA 4Y1VA 4Z8SB 3VKOA 4D69A 5H9SA 4XHXA 1WW4A 3WCSA 1EV2A 2Y9XE 3ILNA 1QDCA 1TWMA 3INAA 5F9TA 3Q7XA 2UUSA 1J1TA 1N4KA 3WO4A 3KM5A 4ZOTA 1LEDA 2VXRA 3ZC9A 2DURA 1W3AA 2NTDA 2Q3NB 2ZGPA 5BXPA 1MS4A 1V6XA 5GLWA 4GXLA 3ATGA 3C9ZA 3ZYRA 4TYSA 3HALA 1JT5A 1WBCA 1DJSB 5BQMA 3T2TA 5CBLA 3SNMA 5DZUA 3BONA 2G7PA 1JOJA 1ZN3A 4FPYA 4IONA 1LECA 1OFSA 3M3CA 3F1RA 1S0LA 2ZHNA 4XJ9A 2HW9A 2YY1A 1DZQA 4XE9A 3QW7A 1ZA4A 3O4BA 5T5JA 4I4SA 3ZXLA 5H9PA 5BQUC 4HEVA 2FFVA 3RTJB 3O0VA 2R1BA 2YUGA 1IHKA 3ZC8A 1QOTA 4R6UB 1SR4C 1VAVA 2NYYA 1WBAA 1CE7B 4ZFYB 3GNEA 1AJOA 3V0BB 4KC3A 4Y20A 3FIEA 1URXA 3HN1A 1W6QB 3T1MA 3FLTA 3ZUSA 1G82A 1KNMA 3ZXEA 1MVEA 3CA1A 2KLLA 3VUOA 1PUMB 2NVHA 2A97A 3B9UA 4IY8A 2FMDA 4YFZA 4IYBA 3WA1A 1JT3A 4DEPA 2EXHA 3POKA 1RMLA 4ATEA 2DUOA 2M49A 4Q8LA 5GAQA 4U36A 3AKFA 3AKIA 4LO3C 4P0LA 1VCLA 1QKQA 4HJJA 1AF9A 3WDUA 4QBCA 1LHNA 1WLDA 2D23A 2FGFA 1HQLA 2R16A 3DDAA 2W2DB 4OWLA 3AP4A 5CB7A 1RG8A 1Q8PA 2R0FA 3AZYA 1KQRA 1MS5A 4KEKA 1S0IA 1DQ2A 3VWCA 3FIIA 2CL2A 3AP9A 3CA3A 2GDFA 2KH2A 5GLTA 4OW4A 3I29B 5KXDA 3W59A 1V6KA 4FOYA 3BAVA 4K1ZA 4BPZA 1IJTA 4YGEA 4UW4A 1H30A 2VH9A 4ATFA 1J0SA 2GMMA 1QDOA 2GMEA 2ES3A 5L73A 5F90A 4ZGRB 3UJOA 3DEBA 3C89A 3UD8A 3DSEA 1MR5A 1K5VA 2AXMA 3AJZA 3PMEA 2A6WA 1EPWA 4JCKA 2ZHMA 1D2SA 1IRPA 1XG6A 4Y22B 1FX5A 4LO0C 4G6MA 2OUHA 3UJQA 3WO3A 4AVVA 1ZM1A 3WG3A 2PHWA 2BEBA 4OEEA 1WLCA 3QCWA 1S0DA 3QYDA 4TZDA 1C57A 5D63A 5IK7A 1M2TB 1MZ6A 1HCDA 3JRRA 1AX1A 3O4CA 1S0BA 3F62B 3APBA 2D6NA 1BKZA 3SLIA 3V79C 4FQ4A 1O4YA 4I4PA 2H0BA 1FMMS 2ZAAA 4H55A 3LTQA 1TTUA 4GWNA 5T55A 3O5SA 3W9TA 1CJPA 2UU8A 2DUQA 2WT2A 4I1EA 1LGNA 3FUOA 3K3QB 5FZUA 4LO2C 3FJDA 3IM5A 4RA0A 4FGFA 6I1BA 1WD4A 1PZ9A 3ZURA 3POYA 4J23B 1NXD1 4YM0A 1QNYA 1CR7A 3P53A 1JHNA 4HA2A 1WCSA 3H0OA 4AGRA 5GZCA 1MS3A 3ILFA 4HANA 2ZQNA 2ZHKA 1YRZA 4Q1PA 1IS3A 1SLIA 2DVFA 1S0EA 5DUYA 1CPNA 5EHAA 2A6YA 4IZXA 3BWIA 3QJ0A 1N1TA 5DG2A 1W6NA 1DQGA 1HWMB 5GM0A 3U4XA 1V6MA 1AVAC 2AH2A 2Y9WC 4ASMB 3CA0A 4XIKA 1G9FA 3NBNA 1BZWA 4D0ZA 2A3WA 3BA5A 3AZZA 3T8SA 3KMVA 1I1BA 3UJ4A 4I7IA 3I2AA 3BAGA 4IZEA 1IOBA 4K20A 5HCAA 1JYIA 4DPNA 5E24E 2VW1A 1MS9A 4H04A 3BTAA 1YF8B 5BVPI 2ZGSA 1N3OA 4I6IA 2DVGA 1I1EA 1WW6A 2RQ9A 1LOBA 3AP7A 2W39A 5T5OA 2A3XA 1ULCA 3ZXDA 3HR9A 2D3SA 1SFYA 1ISYA 3A23A 5F5QA 1VALA 3OGFA 5DXDA 1BARA 2PELA 4USPA 2AGSA 2KKIA 3IAGC 4Y20B 2ISEA 1LGBA 2AYHA 3IM7A 4YG0A 5E89A 2WJSA 3OJBA 2ETFA 3S8JA 2P34A 1YO8A 2ISHA 1LHOA 3N7LA 2R1DA 3N7MA 3OJ2A 1JXNA 3B3QE 1W0OA 1Y7BA 3UD7A 5IT6A 2QN0A 7I1BA 4DENA 5BXSA 1W6PA 5BYNA 4XJAA 1GZWA 5EG6C 4OWJA 4MYEA 4H9WA 4FPCA 3RMYA 4XFSA 1LU2A 3B9CA 1N1YA 1ULDA 2WKKA 1W6MA 2AREA 4F34A 1HQWA 2OVUA 3CU1B 4BM8A 2V5YA 1FGAA 4C1WA 1NZKA 3WNXA 2P2KA 5JOYA 2FDBM 4L4HA 1QNWA 2AAIB 3PVNA 1Z78A 3KQRA 2D20A 1QXMA 4FPEA 4GAFA 4WV8A 3O4AA 4FPJA 3HSMA 1FATA 4AN6A 3AKHA 5DZGA 1GYKA 4I4QA 3R4SA 2HZ9A 3A07A 1GV9A 4ISQA 3Q9OA 4CTEA 1PC8B 1FNZA 4ZA3B 1IKPA 3I2XA 4QD2C 21BIA 2UURA 1BASA 3AK0A 1TOOA 1W0PA 1G86A 1ENQA 3TC2A 2ZBJA 2GMPA 1DQ4A 4M3CB 3Q7WA 4GOYA 3AXEA 4IQPA 1ONAA 4EKXB 3AKGA 4F83A 2ZGUA 1HIBA 3AYEA 2VXTI 2P3JA 1E1HA 1HKDA 1JUIA 5EXOA 2NM1A 1R8NA 4Y26A 1HCEA 1A3KA 1C1LA 3BOKA 2A8AA 2BQPA 4ZKTB 1V6JA 3POSA 2I1BA 3OBTA 2DTWA 1SLTA 3AX4A 4II0A 1MZ5A 1MACA 4R9DA 3OY8A 1AJKA 2Q9XA 2ZACA 4I1BA 4R9CA 4EFQA 1MVQA 1GLHA 3ILAA 1L2HA 1MC9A 2WLQA 2F2FC 1ISWA 1ITBA 2E7TA 4P0JA 3SH5A 3DDBA 5DG1A 1LCLA 2LTNA 1I3HA 4JPZA 3OGGA 1CQ9A 2NP0A 3QR5A 5FZYA 3MW4A 2QN4A 2GNDA 1OQLB 5BP5A 3WINA 2XOAA 3USUA 1G8WA 2BFHA 3LLPA 3AYAA 2NMNA 3O0XA 1IT0A 1F31A 5IK8A 4JP0A 3E8LC 1DGLA 2P3KA 4OEFA 5FZZA 1YYNA 4Y1YA 3ASIA 3AJ5A 1RITA 2TEPA 4GOVA 1AVUA 3CA5A 2ZMNA 1FYUA 4I0YA 2DYCA 4M01A 3CRHA 1GZCA 1W6NB 4JQ0A 2ZZJA 1ISXA 3RRDA 2A5ZA 4GAIA 4HL0A 3IIRA 1JLXA 4I4XA 5BXTA 4PQ9A 3QW6A 1GSLA 2EXJA 4KTXA 4RL7A 2R9KB 4CZSA 5F8SA 1LOCA 4BQ1A 2NZ9A 1NUNA 1KITA 3GALA 3WLUA 4YG3A 1YI7A 2C5DA 5DZFA 2YROA 4LO1A 3DS9A 3CNAA 3P6IA 1DYPA 2IMCA 4OUJA 3FJAA 1SACA 3BOOA 4PC4A 1QF3A 4Q2FA 3FJJA 3O3QA 3VKMA 1MS1A 4YW3A 1APNA 2Z48A 1QQKA 4J2XA 1BFCA 4AVSA 3FLPA 1BLAA 1TIEA 4AN7B 3R05A 5D62A 3BA7A 3HBWA 1WW5A 1SBEA 3AZXA 4FVVA 3AYDA 1DBNA 4GWMA 1F9KA 3SNVA 4YM3A 4J2KA 5KXCA 1SCRA 4ZXKA 1ONKB 3PG0A 3AXDA 3ZSJA 1H9PA 1XHBA 2AUYA 2ET2A 3IMNA 4R9AA 4YZ1A 2A6ZA 1JYCA 4QKSA 2ZQOA 1T3CA 2ENRA 2HWAA 4PF5A 1BYHA 2ZGNA 2D6PA 4YZ2A 4XJUA 4YZ5A 3VSZA 2IWTB 4I4UA 3C8BA 3N7KA 4EL4A 3FGMA 3N35A 1WBLA 1LTEA 3UL2A 3B69A 2GNMA 1HLCA 3FFZA 4XBQA 2MC2A 3K1XA 4DS0A 3S8KA 3WOGA 1YVGA 1T9FA 5JOXA 4WBCA 4K21A 1E0OA 2Z42A 4UW3A 2K8RA 41BIA 3NF3A 4LBMA 3R4UA 4HR6C 1N3PA 5EYYA 1ISVA 3OPZA 4I37A 3AH1A 3A21A 4XOGA 3UK9A 2VSAA 4LBKA 3HOMA 2FHRA 3NJ5A 4DQAA 3MPPG 5IK5A 4IY9A 2DRYA 1II4A 3V0AA 5JOWA 2E4MA 2A75A 1RIRA 3WUCA 2J3PA 1DZCA 3NV1A 3O5WB 4KS6A 3IPVA 3PHZA 3QIXA 3M3QA 1CIWA 3QLQA 4Q9GA 2JDZA 3FUQA 1SZ6B 1MS8A 4A7KA 4L8QA 2DV9A 2L5XA 3NBDA 3M3OA 1ULEA 5FNWA 1TP0A 3A0NA 3WVJA 1BQPA 1V6LA 4P9XA 4YOLA 4FP3A 2R0HA 3OYWB 4EB2B 3H6RA 1UMZA 2R49A 2K4AB 2P23A 4J2SA 2F8XC 4YG6A 3D3XA 4X3AA 2GN3A 3N3HA 2ZA9A 1DQ0A 3ZXFA 3CA6A 2HWMA 2MLLB 1Q8SA 4X39A 2GO2A 3RSJA 4WZFA 4AVTA 2D22A 4ISRA 3BIWE 3VKLA 3VEQA 3VT2A 1UN1A 4I30A 5BQUA 3P6JA 1HKNA 2WRYA 5DZEA 4OWKA 2EXIA 5F8WA 2CY6A 2YZ4A 2DREA 1ZKWA 5GLZA 1SR4A 1IKQA 4YGCA 3M2MA 1JY0A 3O4DA 5GJ6A 1FN0A 2X2SA 5BQMB 2CWMA 4AWDA 4I4RA 2GNTA 4CJMA 5T52A 4ENDA 3M3EA 2BEAA 2ZR1B 3JUUA 2ZGLA 1Q04A 4X38A 2DVBA 5DUXA 3VKNA 4J2YA 3UDAA 1KJLA 2C9AA 1AX2A 4LO7B 3V0BA 2ARXA 1W6QA 3WCRA 4GKXA 4Q91A 2GALA 3N36A 3ZXKA 4FPOB 4Y1XA 4GP3A 2NMOA 4YW2A 2RHPA 1Z0HA 2GN7A 2AFGA 4FPKA 4Q8KA 1DIWA 2YXSA 3ZXJA 3ZSMA 4LO7C 4AGVA 5T50A 3CQAA 1AXZA 2DUPA 3BODA 3QIZA 2LIEA 2WBCA 2D44A 3HMYA 1DQ6A 4XJZA 1GNZA 2ZHLA 4QO3A 5EC5A 4KUFA 4W65A 4ZFUB 1KJRA 4JRAA 5DUVA 4G9MA 1ZL6A 2D7RA 3BAHA 2ISGA 3BRFA 1V6WA 3ZYPA 3A4UA 1UKGA 2W52A 4EJ5A 4Y1UA 2WT1A 3AFKA 1F5FA 2SLIA 4LBJA 31BIA 2D43A 4P14A 1ULGA 1WW7A 3N0KA 1SBFA 4XTMA 1TEIA 2PHRA 1JT4A 1SLCA 4PBOA 4Z8BA 4LO0A 4QALA 3QW8A 1G9AA 3T1LA 2ZGKA 2Y9FA 4YZ3A 4XTPA 3BAQA 5GALA 1YIFA 2GNBA 1PUUB 2RSTA 3BAUA 4I4VA 2KM2A 3O0WA 2ZGTA 3MEPA 4LBOA 5HCFA 2IMBA 1LHUA 3C8AA 3D4KA 4P9WA 1BA7A 1R1ZA 3IN9A 4Q9PA 4Y22A 1C1FA 4K1YA 1EVTA 2E53A 4OEGA 4DRVA 4M3CE 3O12A 2ARBA 4Q26A 1WLWA 3FJKA 1T4QA 1ENSA 2JE7A 5GLVA 1X50A 4FPHA 3AZWA 2CWSA 1W6OA 3W58A 3WG4A 1DZDA 1HWPB 3PVOA 4FPFA 4LO2A 1IS6A 3AZVA 1LHVA 3CAHA 2CNAA 2E51A 1EYLA 3WG1A 4J1LA 4FPGA 4ZLBB 1SLBA 3H6SE 3ZVXA 4BLJA 2YV8A 4Y24A 1QGLA 4FP2A 1LODA 3I8TA 1AFCA 4I8MA 1GGPB 2SBAA 1QMJA 3NBCA 2ZGOA 4XXPA 1G9BA 3TAYA 1V00A 4YW5A 3ZPYA 1S0FA 1FWUA 2LALA 5IUQA 5HCBA 4XKIA 1KDKA 2WNEA 1LOAA 3AJYA 3IPVB 3AH4A 4UW5A 2VLCA 1LHWA 1KRIA 1JT7A 2UWBA 4YLZA 3TB0A 2PHFA 5D61A 2DVDA 1PZZA 4CRQA 4FQZA 3N7JA 4LBQD 3Q7YA 1SLAA 4G9NA 3WV6A 1UPSA 3RS6A 1JN2P 4P6AA 2VUAA 2YMZA 1LESA 3C2UA 5IK4A 3FJBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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