1S22A

Absolute stereochemistry of ulapualide a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
356
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
publication title Absolute stereochemistry of ulapualide A
pubmed doi rcsb
total genus 120
structure length 356
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1s22A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1s22A04
1NLVA 3SJHA 4CD1A 5AQSA 3BF3A 2DPNA 3KVGA 4CD3A 3CJ9A 3C7NA 5JMVA 1MA9B 2J4RA 3VEWA 4BRQA 2FSJA 2HF4A 1DEJA 2D1KA 4WYBA 4K43A 4BQZA 1ZC6A 3L6QA 2A41A 5BN8A 2E2PA 3VGKA 3LDNA 4XH5A 4QS9A 2Q97A 3ZX0A 5AQMA 3FZHA 4BR7A 5AQUA 2GTDA 4L3QA 2E2QA 4BG9A 5AQVA 3FZFA 4BRGA 2Q0RA 2YI1A 4H0OA 2CH6A 2CH5A 4BRLA 3OHRA 4H0VB 1GLCG 2GWJA 2Q1NA 4BC5A 2HOEA 4BG8A 3SMPA 3QDKA 2HF3A 5EY4A 2V7ZA 1S3XA 1YAGA 3WQTA 3DJCA 1ATNA 3CETA 3GOIA 4MLHA 1G99A 4NO7A 2FF6A 1ATRA 3UKUA 2H3GX 4FWLA 2NRHA 3H1QA 2AA4A 2A3ZA 2PAVA 3UKUB 4H0XB 4ISGA 3UKRA 5AQXA 3CJCA 2NZTA 1H1VA 5LJVA 2CGKA 5AQIA 4H5WA 4FWKA 3HM8A 3H6EA 3MN7A 2ZGZA 3QMLA 3VGMA 2YJEA 1JCGA 3QBXA 2E8AA 1BDGA 3RSEA 2FLOA 1QZ5A 2P9KA 3A5LC 4QS7A 1NGGA 2ZGYA 2A40A 3TU5A 5JLFA 3P4IA 1Y64A 3VF4A 4B1XB 4BR4A 3WXLA 5AQZA 2P9KB 5AQLA 3VF2A 3GDQA 2QWMA 2I7PA 2W40A 4IXCA 1TYQA 3A5MC 3CJ7A 3VEVA 2QWPA 4CI6A 3U9DA 1E4GT 4BVOA 2QM1A 1C0FA 3VEXA 1TYQB 3O80A 1SQKA 3D2FA 3VEYA 2QXLA 1ZXOA 1NGJA 3WXJA 4JAXA 1NGEA 2HMPA 2A42A 3GE1A 1J6ZA 1T44A 3C0BA 2P9SA 1GLDG 3DXKB 4FPAA 2V7YA 3ZETB 2P9NA 3FLCO 3B8AX 2E2NA 1GLLO 3A0IX 4FO0A 3WQUA 2P9SB 4ISFA 4A2BA 2P9IB 1SAZA 2QWOA 2IVPA 4F9OA 4CBUA 4IWVA 4M7XA 1XQSC 4O5FA 2UYTA 5TKYA 3SMSA 4Z94A 2E1YA 2ASPA 3HZ6A 5AZIA 5AQNA 1DKGD 5AQKA 2GELA 3I33A 2PBDA 3R6MA 1GLFO 3MN6A 3O6WA 3WXKA 4FOIA 4AM6A 4Y0WA 3J8AA 5AQJA 1HKBA 1WOQA 2BUPA 3DXMA 5AR0A 3SLCA 4A62A 3O1WA 1IJJA 2OANA 2IIRA 3QICA 1HX1A 2A6AA 3DXMB 1NGDA 1E4FT 3IFRA 4PKHA 3CJAA 5E26A 3G25A 2ITMA 3AAPA 1U2VA 5EX5A 4BREA 3M6GA 4BRMA 3LL3A 1YUWA 2D4WA 5JLHA 1NBWA 1U2VB 3JXUA 4BRHA 3CERA 3VF6A 3CI5A 5EXWA 4FL9A 4BROA 3CHWA 3GBTA 5AQQA 3ZX3A 4BRAA 1GLEG 1EQYA 4GY2B 1BU6O 1BOTO 4JNEA 5AFUH 2FSKA 3FZLA 4BRPA 4FWQA 4EHUA 4A61A 4C23A 3MDQA 4FWPA 1QQMA 5LY3A 5AQWA 4XH4A 1HUXA 5EOYA 3MN5A 3VESA 4PKIA 1RDWX 4M63C 3AARA 3O5BA 4GNIA 3M3ZA 2QW9A 2YHXA 1GLBG 4FWOA 2GWKA 3FZMA 5AQOA 5FPNA 3QFPA 3EO3A 4B1WB 2ZF5O 4WQ5A 4FWNA 3WT0A 3ZX2A 1KAZA 1GLJO 2CGJA 3EKSA 1X3MA 2A5XA 3GG4A 1LCUA 4PL7A 1WUAA 4JHDB 5AQHA 2E1ZA 2W41A 2IVOA 1NWKA 3W3DA 1SZ2A 3U9ZA 2YJFA 2I7NA 5F1XA 4FWRA 4YDUA 1X9JA 3BEXA 3H3NO 5BPNA 4BVPA 3H3OB 4B1YB 3CJ1A 5KQDA 4BGBA 4EFHA 3WXIA 4FPBA 4EAHD 2AP1A 3ATVA 5BRFA 3AAQA 5AQGA 5BREA 3IUCA 4H0YB 2P9UB 4LC9B 2D0OA 4BC4A 1RFQA 2KHOA 5AZJB 2QWQA 4BC3A 4CZLA 1ZBSA 5FPMA 4WQ5C 3DXKA 2QWNA 1TUUA 4EIAA 4I6MB 4FSVA 3WEEB 3ZETA 5B8HA 1K8KB 1P8ZA 2P9IA 1NGBA 3HTVA 4CZJA 4ISEA 1NGCA 3MN9A 1LOTB 1NGFA 2YHYA 3JS6A 4CZFA 4H0TB 3HI0A 2Q31A 3R9PA 4YDUC 4BRNA 1CZAN 4H03B 1X3NA 2F9WA 1Q18A 5AFUA 3QBWA 4CZGA 4JD2B 2GEMA 3CJBA 3ATUA 3L0QA 1YVNA 1V4SA 3MCPA 3O8MA 2E2OA 1XUPO 1ATSA 4CZIA 3O1BA 2VYPA 3ENHA 4BR2A 4BRKA 4K42A 3VERA 5F0XA 3O4WA 3ULEB 3BP8A 2V52B 4K25A 5BPMA 1RGIA 4XEIA 4IO8A 4M7YA 4CBWA 1V4TA 1BA1A 3AY9A 4CZEA 4BRDA 5EVZA 3LM2A 3I8BA 4DCHA 5AQPA 1IG8A 1MWMA 1KXPA 3F9MA 2YHWA 2Q0UA 1T6CA 4RTFD 2NLXA 3H46O 3CIPA 4H0PA 1U6ZA 3KHYA 3A5NC 5F2RA 2V51B 3A5OC 3D7EO 5BN9A 4DQ8A 4WQ4A 3VENA 3FFKB 3D2EA 4A2AA 3VETA 5ADXH 3VOVA 4BRFA 5BRDA 3UB5A 3H45C 3LDOA 3W0LA 4IJAA 1HLUA 3D2EB 4BQLA 5AQFA 3VPZA 1DGKN 4B1ZA 3ZEUB 1T6DA 3H1VX 4PKGA 3C7NB 1TUYA 1BA0A 4BC2A 4HWIA 1QQNA 2FSNA 5KPTA 2QWLA 1MDUB 1BO5O 3VEZA 1NM1A 4HTLA 4MLEA 4CJ7A 4CZKA 3SK3A 4RCHA 4BGAA 5KPZA 2F9TA 3BF1A 3CQXA 3FGUA 4JHDA 2Q36A 3GL1A 1BWFO 4WQ4C 3VEOA 2P9PA 3HBTA 4J8FA 3IDHA 3R8EA 1JCFA 2P9PB 2VWBA 4MO4A 4B9QA 2FF3B 2EWSA 3FR0A 2IVNA 4BR0A 1QQOA 3A8YA 3U4LA 4RWTA 3QB0A 3S41A 3VGLA 3ENOA 4BR5A 5BRHA 2P9UA 4B1UB 5AZJA 1R59O 1HJOA 2CGLA 4H5NA 4I6MA 3WEEA 3EZWA 3EL2A 2QWRA 4CBXA 3UKRB 4QS8A 1QZ6A 1K8KA 1MWKA 4KBOA 3BUZB 4H5RA 1D4XA 5BR9A 1YXQA 2WUSA 4IZ9A 3EN9A 3DAWA 5BPLA 4H5VA 3IMXA 2ASMA 3RSEB 1NGHA 2GUPA 3CQYA 1NMDA 4H5TA 4NB4A 4JD2A 4JN4A 4MO5A 5FPDA 3MMVA 4FOEA 4AM7A 4B1VA 4BR9A 1NGAA 3LDQA 5KPRA 2VCPA 2BTFA 3LM9A 4IJNA 2E20A 3MK6A 5ADXA 4FWSA 3WUHA 1KAYA 1OKJA 3ULEA 1GLAG 2ASOA 3D2FB 3QFUA 1JCEA 5ELZA 1BG3A 2P9LA 1KAXA 4O8KA 1HKGA 5CE3A 3LDPA 4DHYA 5I9EB 4PL8A 1HPMA 5AQRA 4BRIA 2P9NB 2ZWHA 2P9LB 1XC3A 5AQYA 4E1JA 1NGIA 1Z6RA 1BUPA 1S22A 4K41A 1ESVA 4FWMA 2D0PA 3L4IA 5E84A 3O08A 3UE5A 4CZMA 4BRCA 2YCHA 4XH1A 5FPEA 5AZIB 5LJWA 1QHAA 3DWLA 1C0GA 5AQTA 1HKCA 2E88A 4DB3A 2Q2RA 5JICA 3LDLA 1Z05A 3ID8A 4CZHA 3FE1A 3M1FA 4EHTA 3U8XA 3FZKA 3KZBA 3TPQA 3HSCA 3EKUA 2FXUA 3ZEUA 5KQ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SJHA 3AVMA 4CD3A 3KVGA 3O9RA 2J4RA 3VEWA 5J2NA 2GV9A 3C65A 5C2DA 3LAKA 4F8RA 3OYLA 3RMCA 4FJ7A 3F2KA 3L6QA 4HUEA 2A41A 2E2PA 3LDNA 3TAFA 4A5BA 1YITN 1ZBFA 4FJ8A 1W0HA 4BG9A 2O4IA 3FFIA 1S9EA 2CH5A 3OHRA 3E1YA 2NUBA 4FJXA 4BG8A 5JS1A 3QDKA 1A5XA 2HF3A 5CY4A 5CZ1A 2Z1HA 1HMVA 3CETA 3CPWM 4MLHA 5GAHP 4NO7A 2FF6A 2VG7A 3HRGA 1ATRA 5HRRA 3VQ6A 1IKYA 2GBZA 2BGGA 4OGEA 4WE1A 2A3ZA 1N5YA 2YX6A 3CCUN 1WB9A 4ISGA 1SKWA 3MX5A 3UKRA 4LF5K 2NZTA 5LJVA 3AVIA 3TAMA 4H5WA 4FWKA 3H6EA 4DS5A 2HHHK 1XHXA 3VGMA 3VQBA 3BGRA 1HNXK 4OVLA 4LFAK 3NVKA 4IG0A 3RSEA 1YVUA 3WXLA 4FJJA 2X74A 1QSYA 2P9KB 4IXCA 3A5MC 1IKXA 1VQMN 4C8KA 1HNVA 1RDUA 1FKOA 4G9ZA 4JRPA 2QM1A 3VEXA 3O80A 2W00A 3D2FA 3CC4N 2QXLA 4DR5K 3WXJA 4B08A 4JAXA 3ZSVA 2O8DA 4LH5A 1TGOA 3C0BA 3M5RA 3CPEA 3B8AX 3D0PA 4CGJA 4JKFA 5DK5A 2QWOA 4FZYA 4ID1A 4IWVA 5FRMA 5TKYA 4AHUA 1JLFA 2E1YA 4I2QA 4CF9A 3T19A 1DKGD 1KC8O 3R6MA 1KFDA 1GLFO 1WSFA 2G8FA 3O6WA 3WXKA 1WAFA 4FOIA 4AM6A 3ZSOA 1SKSA 1Z25A 2ZQBA 2BUPA 1C1BA 3AA3A 3LAMA 1KLMA 1IJJA 2Z1JA 2OANA 3SUQA 4K8XA 4FK2A 1WBDA 3AVLA 2HBLA 1HX1A 1NGDA 4FJ5A 3IFRA 4PKHA 2IDOA 2XHBA 3HM9A 3SZ2A 3AAPA 3SPYA 1SL0A 3M6GA 4OLBA 2ZM6K 4KRFA 1IO2A 1CXQA 2KTQA 1X1PA 2D4WA 5JLHA 4BWJA 1NBWA 1WSHA 3CERA 3VF6A 3CI5A 3ZSYA 4FL9A 4BROA 3AO2A 3BZKA 2YNHA 2O8CB 4UQGA 1Q86O 4KHYA 4IOXA 1JL1A 1GLEG 3LWMA 1EQYA 4BDYA 1T05A 4FVUA 1S1XA 1QVGM 3LP3A 4JNEA 4ZTFA 3FZLA 3PX6A 5GINA 4Z4FA 5SZTA 3MDQA 1XMQK 1JLBA 5LY3A 3PSFA 3OA9A 5DM6L 4E1NA 2VG6A 1T7PA 3SBGA 4Z4GA 1KD1O 4KH4A 3QETA 2F8TA 4GNIA 3HXMA 5AQOA 3WNEA 1MU2A 3QFPA 4I9QA 2DFEA 3UIQA 3MXIA 2ZF5O 3TR8A 1GOAA 3V9ZA 3ZX2A 1KAZA 3OYBA 1GLJO 4R79A 2VWKA 1QVFM 3N4QA 2A1SA 4X62K 2W41A 2IVOA 4CJFA 1L3SA 4CHNA 4GVEA 2HNYA 4C8OA 2YJFA 3P5JA 5F1XA 4FWRA 3KD5E 3PO4A 1QSSA 3F9KA 4B1YB 1HRHA 3SV3A 1RT4A 2DFHA 2PY5A 2O8EA 3AGRA 3TAGA 3ZT2A 5BREA 3AV9A 3IUCA 1BISA 3K5NA 2KHOA 5AZJB 4BE0A 2D0CA 3NVMA 5FPMA 3WEEB 2W6KA 5I3UA 5B8HA 1NKBA 4CGGA 1K8KB 2W6LA 4B8AB 3SAGA 1U4BA 1NGCA 5M1PA 4CZFA 3THXA 4FJIA 3HI0A 2F7TA 4YDUC 3PO5A 1J54A 2F9WA 3C95A 4JD2B 1BIZA 2GEMA 4DV0K 3L0QA 2HNZA 3O9UA 3THYB 1XUPO 4CZIA 3O1BA 3QEXA 1KFSA 1HPZA 3ULEB 4K25A 1KTQA 5BPMA 1RGIA 1TK5A 1BCOA 4O8UA 1IKVA 3VQEA 1TL3A 4BRDA 3SJJA 1TV6A 4FK0A 1NOZA 4M41A 4O44A 4C8NA 2E6LA 3K58A 1KXPA 5HRNA 1T6CA 1I39A 1DT9A 4F3TA 4DSKA 1U6ZA 5C0YA 3RMAA 2HHQA 1KVCA 3D7EO 4BDZA 4JEPA 4OPJA 4CIEA 2AJQA 1UAXA 4CEAA 1VAZA 1HQUA 3VETA 2HVIA 5ADXH 3OBWA 3H45C 4CEOA 3MEGA 3W0LA 5HP1A 1HLUA 1N6QA 3D2EB 4GKKK 3T1YK 4ZHRA 3ZEUB 3L2QA 1T6DA 3NCIA 1ASUA 3I8DA 1VQ6N 2B4JA 1BA0A 4CJEA 4CJWA 2IOCA 4JKDA 1QQNA 4IBNA 5KPTA 1RTHA 1BO5O 4PUOA 4CJ7A 3SK3A 4RCHA 4DLGA 1TK0A 4RW8A 3BF1A 4GV9A 4DV5K 4JHDA 4W5QA 1BWFO 3OBYA 3MCAB 1VQON 4K8ZA 2QXFA 4CJKA 1JCFA 2FF3B 1VSDA 2IVNA 1CLQA 3QEIA 4JI8K 3SCXA 4A5AA 2P5GA 1VSHA 1R59O 2NNWA 1BQNA 3CFPA 1LV5A 1SS6A 4QAGA 3A2FA 2QWRA 4CBXA 3UKRB 3IAYA 3HP6A 5KTQA 3LZJA 3VQQA 1YXQA 2WUSA 1TL1A 3EN9A 3Q7CA 4NYFA 3IMXA 1LWCA 3J80O 3RSEB 3MWTA 2GUPA 4DF8A 5M1OA 5FPDA 4AM7A 4AQYK 1NGAA 3NF6A 5KPRA 3QEWA 4LF8K 1ITGA 4CEDA 1N32K 2G8IA 1OKJA 5JENA 3D2FB 4CHPA 5FDLA 1KAXA 5M1NA 2O8DB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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