The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
GSSGSSGQKVKTIFPHTAGNNKTLLSFAQGDVLTLLIPEEKDGWLYGEHDTTKARGWFPSSYTKLLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
RIKEN cDNA 1300006M19
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| publication title |
Solution Structure of RSGI RUH-010, an SH3 Domain from Mouse cDNA
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
7
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RI9 A; 3EG1 A; 1YWO A; 2B86 A; 1WX6 A; 2OAW A; 2RNA A; 1MV3 A; 2GQI A; 4JJC A; 3VS4 A; 1GBR A; 2ED1 A; 2MOX A; 4CC2 A; 2LJ1 A; 2ESW A; 1E7O A; 2EBP A; 1X2Q A; 2CH4 A; 1PKT A; 4A63 B; 1H92 A; 1X6B A; 2RQT A; 1UE9 A; 3TSW A; 2ABL A; 2FO0 A; 2BZY A; 2KRO A; 2SRC A; 1AEY A; 2FRW A; 4J9G A; 4J9B A; 1X43 A; 2LQW A; 1VYV A; 1AWO A; 3PE0 A; 4LNP A; 4OMQ A; 3FJ5 A; 2QDL A; 1GCP A; 3REB B; 5IHK A; 1SPK A; 1GFC A; 4F16 A; 1OV3 A; 1N5Z A; 1UTI A; 3UA6 A; 1M27 C; 4RTU A; 4EIK A; 2MCN A; 2EQI A; 2PTK A; 3H0F A; 2O9S A; 1X69 A; 3EGU A; 3UF4 A; 1U5S A; 4CC4 B; 3TSZ A; 4RTZ A; 1Y0M A; 2JXB A; 2A36 A; 2I0N A; 1QWE A; 2G6F X; 2FRY A; 1NEG A; 3I5R A; 2CH4 W; 5IH2 A; 2KRN A; 4F17 A; 3KFV A; 1AWX A; 1JXM A; 2RMO A; 1Y57 A; 1SSH A; 2KBT A; 2ROL A; 2EPD A; 2J6O A; 3NHN A; 2JS0 A; 1GL5 A; 2RQV A; 3H0H A; 1PHT A; 2YSQ A; 3EG3 A; 3M0S A; 2VWF A; 2K7A A; 3TVT A; 3ZL7 C; 3H0I A; 3EG0 A; 1XOV A; 5FWC A; 3SEM A; 2DL8 A; 1K1Z A; 4J9H A; 3UA7 A; 2CT3 A; 1UEC A; 1KSW A; 4AFQ C; 2O9V A; 2EYZ A; 1AWJ A; 1K0X A; 1FYN A; 4D8D A; 5I22 A; 1QCF A; 1W1F A; 2JMC A; 2DBK A; 4IIM A; 3VS6 A; 3GBQ A; 1I07 A; 1ZUY A; 4JZ3 A; 1WDX A; 2DBM A; 4RUG A; 1HJD A; 2P4R A; 3ULR B; 3QWY A; 2KT8 A; 1YCS B; 3REA B; 2KE9 A; 3IQL A; 1E6H A; 3I35 A; 1U06 A; 1TUD A; 2CUD A; 2H8H A; 2L2P A; 2KNB B; 2YUP A; 1BU1 A; 2ED0 A; 4DEY A; 1V1C A; 4Z88 A; 1ZLM A; 5IXF A; 4OMM A; 4JZ4 A; 3I9Q A; 2VVK A; 2LCS A; 2SEM A; 2EVR A; 2YDL A; 5IHN A; 4HVU A; 4AG1 C; 2A08 A; 3VS1 A; 2DF6 A; 1JXO A; 1G2B A; 4LN2 A; 1UFF A; 2O88 A; 1UGV A; 1HD3 A; 2IIM A; 2RN8 A; 1GFD A; 1CKA A; 1YP5 A; 1J3T A; 2LNH B; 1SHF A; 1T0H A; 4JJD A; 1UHC A; 1NEB A; 4ESR A; 2GTJ A; 5IXB A; 2DL3 A; 1S1N A; 4LUE A; 2BZX A; 4Z8A A; 2GGR A; 2DLP A; 2FEI A; 1RLQ C; 1WI7 A; 1AZE A; 3RNJ A; 3A98 A; 4LUD A; 3RBB B; 2K3B A; 2W10 A; 2DIL A; 1OOT A; 2EGA A; 1PRM C; 2PZ1 A; 3I5S A; 4FSS A; 2PNI A; 4D8K A; 1KIK A; 4DEX A; 4Y92 A; 2ENM A; 5HCK A; 1PKS A; 1HSQ A; 2BZ8 A; 2HEQ A; 1ZSG A; 1QLY A; 2L3Q A; 1NG2 A; 2DL5 A; 2KXD A; 2KRS A; 1KFZ A; 4JPB W; 1M3C A; 1UJ0 A; 4OMP A; 5EC7 A; 4ZNX A; 2A28 A; 2EYW A; 1VA7 A; 2CT4 A; 1K4U S; 2W0Z A; 2J6F A; 2DMO A; 1Z9Z A; 2CUB A; 1FMK A; 1Z9Q A; 2K6D A; 2MIO A; 1SHG A; 2D8H A; 2DL7 A; 1E6G A; 1BBZ A; 1WYX A; 1M3A A; 2L3P A; 1W70 A; 2LJ3 A; 5FWB A; 1GBQ A; 2KR3 A; 1T3S A; 1ABQ A; 3NPF A; 1AWW A; 2DRK A; 2DVJ A; 2M51 A; 1I1J A; 4RTV A; 1TUC A; 5IHI A; 2YUQ A; 2LQN A; 1UG1 A; 1X6G A; 3EHR A; 4J9E A; 1PWT A; 2FPD A; 2KYM A; 1PRL C; 4RTX A; 4Z89 A; 1ZX6 A; 4GBQ A; 1WLP B; 2JTE A; 1BB9 A; 2FPE A; 1SRL A; 1KJW A; 3QWX X; 1RUW A; 4X1V A; 1NLO C; 1NYG A; 2FPF A; 2E5K A; 1A0N B; 2DL4 A; 1RLP C; 2VKN A; 1W6X A; 1M8M A; 2K79 A; 3M0T A; 3SHW A; 3VS5 A; 2J7I A; 2FG0 A; 5GJV B; 2RF0 A; 1JO8 A; 1LCK A; 2GBQ A; 5I11 A; 2RQU A; 4KRT A; 1M30 A; 4E6R A; 1WIE A; 5ECA A; 1NLP C; 2JM8 A; 2AKL A; 1JQQ A; 1K9A A; 2KT1 A; 2EKH A; 2JS2 A; 1IO6 A; 1K0S A; 3JV3 A; 2RQR A; 1GCQ A; 3VRY A; 2RPN A; 2EYY A; 3UAT A; 2J6K A; 4AFZ C; 2CRE A; 1NM7 A; 5GJW B; 1OPK A; 1I0C A; 2JW4 A; 3CQT A; 2K9G A; 4JJB A; 1WA7 A; 2DRM A; 2EGE A; 3EG2 A; 4CC3 A; 1OPL A; 1AOJ A; 1GCQ C; 4J9F A; 3H41 A; 1NYF A; 2V1R A; 2AK5 A; 2KEA A; 4LE9 A; 1OEB A; 2J05 A; 1PNJ A; 2D8J A; 4RTY A; 2KXC A; 1CKB A; 1UHF A; 2X3X D; 2LX7 A; 2JM9 A; 2HBW A; 2CSQ A; 1SRM A; 2X3W D; 4F14 A; 2XMF A; 2HDA A; 2NWM A; 2DM1 A; 4IIO A; 1K76 A; 1ZUK A; 2O2O A; 1H3H A; 1G83 A; 2EYX A; 1YWP A; 3PVQ A; 3M0P A; 2GTO A; 3R6N A; 1MUZ A; 1T0J A; 2ROT A; 1UDL A; 2NUZ A; 1ZUU A; 3VRZ A; 4WCI A; 1ARK A; 1GRI A; 2L3S A; 4QT7 A; 2KYB A; 2AKK A; 2BTT A; 2F2X A; 1H8K A; 2DE0 X; 4R0K A; 1B07 A; 2YUN A; 1B3Q A; 2OJ2 A; 1AZG B; 2HCK A; 2J06 A; 2DX1 A; 1YN8 A; 4J9D A; 2HSP A; 2C0O A; 1EFN A; 4OML A; 4AFS C; 3M0Q A; 2KGT A; 2V1Q A; 1TG0 A; 4M4Z A; 2C0I A; 3THK A; 3U23 A; 4RTW A; 4GLM A; 3O5Z A; 4AFU C; 2M0Y A; 2EGC A; 1WXB A; 4HXJ A; 4OMN A; 1QWF A; 2LZ6 B; 1ABO A; 2YUO A; 1VYT A; 2DNU A; 3LH5 A; 1VYU A; 4K11 A; 2LP5 A; 3VS7 A; 1X27 A; 4AG2 C; 3VS3 A; 3PVL A; 5FW9 A; 4HVW A; 2DA9 A; 2LJ0 A; 4HCK A; 3M0R A; 2C0T A; 1CSK A; 1AD5 A; 1UUE A; 2K2M A; 4ORZ A; 1MV0 B; 1QKX A; 1JU5 C; 4J9C A; 2D0N A; 4CC7 A; 1M3B A; 2LMJ A; 2DJQ A; 1SEM A; 2KRM A; 3M0U A; 1WXT A; 2CDT A; 2F2W A; 2OI3 A; 1UJY A; 1JEG A; 2AZV A; 2D1X A; 2YT6 A; 1T3L A; 2A37 A; 2ECZ A; 2O31 A; 3NGP A; 3NMZ C; 4J9I A; 2JT4 A; 3C0C A; 1QKW A; 2EW3 A; 1BK2 A; 3VS0 A; 2AZS A; 4RTT A; 2RQW A; 2CSI A; 2JMA A; 4HVV A; 3VS2 A; 5L23 A; 1AVZ C; 2GNC A; 1X2K A; 3EHQ A; 1WFW A; 1YNZ A; 2DYB A; 4OMO A; 2L0A A; 1ZBJ A; 1WXU A; 2F2V A; 1U3O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RI9 A; 2CP3 A; 1ZSZ C; 2RNA A; 2DET A; 3CPW P; 4JJC A; 2LNV A; 2VAS A; 3TCJ A; 1VQ8 T; 2ED1 A; 2BUD A; 5LJ5 g; 1E7O A; 3G6E Q; 1X2Q A; 2O01 E; 4EMK B; 4J6W A; 1WHL A; 1X6B A; 2RQT A; 1UE9 A; 5GAN e; 4C92 B; 4ZN1 A; 2ABL A; 1VQ9 A; 1R0C B; 2FRW A; 2L89 A; 1YJ9 A; 3CCJ Q; 3G6E T; 1B34 B; 3PE0 A; 2RHX A; 3SB2 A; 2O4X B; 2AIR B; 4XTV A; 2QDL A; 5GAM j; 2QQR A; 2NUP A; 3CC2 A; 4EIK A; 1VQM Q; 3JSC A; 3I55 Q; 2MCN A; 1FMV A; 3CCJ T; 1X69 A; 3BDL A; 3UF4 A; 4RCC A; 4FIB A; 4CC4 B; 5GAN 6; 4ZN3 A; 4JDS A; 2E64 A; 2JXB A; 3M55 A; 3JCM X; 5IH2 A; 2KRN A; 3I55 T; 1AWX A; 1D09 B; 2JUF A; 2JS0 A; 1D0Z A; 2QG9 B; 3QYH B; 3H0H A; 2YSQ A; 2M02 A; 3TVT A; 3LWI A; 2RI3 A; 4A4F A; 4C92 E; 3V7C A; 3SEM A; 1VQP A; 1UEC A; 2EYZ A; 4E47 A; 5I22 A; 1QCF A; 2XID A; 3VKI A; 1W1F A; 3FC3 A; 1ZUY A; 2EYQ A; 3OYH A; 2MK5 A; 1N9S A; 5CO7 A; 3WXM B; 1HJD A; 2P4R A; 3ULR B; 2PVG B; 2BKD N; 3REA B; 3PIO A; 4HCZ A; 2KE9 A; 3OA6 A; 5KE2 A; 1U06 A; 2CUD A; 1M1G A; 2H8H A; 4XTW A; 3V8K A; 2KNB B; 2X4W A; 1N8R C; 1VQL Q; 1C0M A; 3CME A; 4KGV B; 2QQA A; 4Z88 A; 4A4E A; 4OMM A; 3QO3 A; 4JZ4 A; 2LCS A; 2YDL A; 5IHN A; 3HSB A; 2DVE A; 1YJW Q; 1YJN A; 1UGV A; 2RN8 A; 4L6V 5; 3M4G A; 3G71 T; 4XK8 E; 4BDY A; 1Y07 A; 1NPR A; 4JJD A; 1UHC A; 2E6N A; 2X51 A; 3CCR Q; 5KYY A; 1WQW A; 1RLQ C; 3OYA A; 2K3B A; 3F70 A; 3CC7 A; 5LJ5 d; 1VQ5 Q; 2W10 A; 2DIL A; 3H8Z A; 7AT1 B; 2CP6 A; 3FLG A; 1X75 C; 5CK9 A; 1VQK Q; 4FSS A; 2OTL Q; 5DM7 R; 1K73 C; 2ZZD A; 4JUV A; 1M9S A; 4D8K A; 1YI2 Q; 1VQ5 T; 2P0P A; 4Y92 A; 4BI4 A; 3OSS C; 4FW1 A; 5LJ3 h; 4HKE A; 1HSQ A; 2HEQ A; 2HL3 A; 1QLY A; 3MEW A; 2L3Q A; 1VQK T; 2DL5 A; 3KBG A; 4LDX A; 2OTL T; 3OW2 P; 1KFZ A; 2DIG A; 4JPB W; 1TSF A; 1UJ0 A; 3LW5 E; 1YI2 T; 1D1C A; 2WSC E; 1KC8 R; 4O6J A; 2IG0 A; 2DER A; 4M78 D; 1K4U S; 1AT1 B; 2W0Z A; 4JRQ A; 2CZ7 B; 5GMK l; 1GXI E; 4M77 F; 1UEB A; 5AYF A; 2RK2 A; 4C0D C; 1YHQ A; 4X9C A; 1Q7Y R; 1VQ9 Q; 4M75 A; 2LJ3 A; 1YJ9 Q; 3KXT A; 3RMQ A; 5GAM f; 2QGF B; 2KR3 A; 2HBP A; 1T3S A; 1Q86 R; 2P4T A; 1D0Y A; 2GQV A; 5FU7 C; 1AWW A; 2DVJ A; 2D6F A; 1KG1 A; 1I1J A; 4RTV A; 5KCO A; 3G4S T; 1WJS A; 2YUQ A; 3CC2 Q; 1JB0 E; 5DLQ E; 1PWT A; 1VQ9 T; 1D3B B; 4E7Z A; 1YJ9 T; 5GAN d; 1SKU B; 1FMW A; 1PRL C; 4RTX A; 1UGR B; 2OAU A; 4C5I A; 5KYW B; 1WLP B; 1SRL A; 3QWX X; 3CC2 T; 1NLO C; 4XTX A; 4A53 A; 1RLP C; 2VKN A; 1M8M A; 2E70 A; 2K79 A; 3M0T A; 3OS5 A; 4BE2 A; 2FG0 A; 2PVO B; 2CZ0 B; 1TWB A; 4KRT A; 1KD1 C; 4E6R A; 4OGE A; 4M7A A; 4DA4 A; 1K9A A; 1N8R U; 2EKH A; 5DY9 A; 2RQR A; 5IT9 E; 1VQP Q; 4DBQ A; 3HRT A; 1W4S A; 2J6K A; 5IN1 A; 4AFZ C; 1PG5 B; 3RER A; 2CRE A; 1OPK A; 4EMH A; 3L1A A; 1VQO A; 3RDV A; 1OYX A; 3VUB A; 5HK3 A; 1VQP T; 4ZGE B; 2EGE A; 3EG2 A; 1MMD A; 1GCQ C; 1F1B B; 4X34 A; 4NL3 A; 4EPC A; 1VQ4 A; 4M75 D; 1PNJ A; 3OBW A; 2RK1 A; 3HFO A; 1UHF A; 2X3X D; 3CBM A; 1D1A A; 2F69 A; 1RAA B; 1SRM A; 3CME Q; 1Q82 R; 5GAN 2; 2XMF A; 2HDA A; 1QVG S; 1K76 A; 1OZ3 A; 2CZ6 B; 1K73 U; 4IUT A; 2O2O A; 2D0Q B; 2EYX A; 3MEV A; 4A4H A; 4BDZ A; 2CP0 A; 1UDL A; 1YJN Q; 2DAQ A; 2RH2 A; 4C0D B; 3CME T; 1ARK A; 3QXE B; 1GRI A; 4JS4 A; 5M9O A; 2BTT A; 5GAM e; 4IUQ A; 3MEU A; 2K3X A; 2DE0 X; 4JS5 A; 5FU7 B; 4ELY C; 2DD5 A; 3LGF A; 1YJN T; 2OJ2 A; 2QEX T; 3CC7 Q; 2DJZ A; 3SWN A; 4OF1 A; 1O9S A; 2DX1 A; 3FRN A; 3A8H B; 2LQK A; 1EFN A; 4E2F B; 1KQ1 A; 2DZC A; 3U23 A; 1TG0 A; 2C0I A; 3THK A; 3SWN B; 2XHC A; 3X24 B; 4RTW A; 3V7S A; 3CC7 T; 2M0Y A; 3OYE A; 2LZ6 B; 1VQ8 A; 4F7U A; 3CBP A; 3LH5 A; 2MWP A; 4K11 A; 3JCM h; 1KHI A; 2XDP A; 3PVL A; 5FW9 A; 2DEU A; 2EJG A; 3GIB A; 3FEO A; 3JCM f; 1G5V A; 1KQS A; 1SG5 A; 4M77 G; 3QG1 A; 3WVD B; 1JU5 C; 4J5Y A; 2LMJ A; 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1VQ4 T; 1M90 C; 3M0S A; 3CC4 T; 3TEE A; 2K7A A; 1G3Y A; 4KUL A; 5CKF A; 1ZA1 B; 3H0I A; 1QVP A; 2DL8 A; 2O9V A; 4WF2 A; 1JBM A; 4PJL A; 4ZGD B; 3NTH A; 2CP7 A; 1QVF S; 4IIM A; 1RI0 A; 1D0X A; 1LPL A; 4JZ3 A; 1TTH B; 3LLR A; 4KT0 E; 1NJI R; 3QWY A; 5AT1 B; 1O75 A; 2RD1 A; 4KH1 B; 3UDC A; 3IQL A; 3ASK A; 3I35 A; 5HKC A; 4MZT A; 3MET A; 1RAD B; 5CCA A; 5HK0 A; 1WHK A; 2ED0 A; 2QK0 A; 5GAM d; 2KY9 A; 5KCH A; 1VQ8 Q; 3M53 A; 2CP2 A; 2XDD A; 2SEM A; 4OVA A; 2QYZ A; 4M7A F; 4LN2 A; 1GFD A; 4MMK A; 1YP5 A; 2KVQ G; 1SHF A; 2OTJ A; 1T0H A; 5LJ3 j; 4ESR A; 3GOX A; 5CAI A; 4M77 D; 2DL3 A; 4LUE A; 3CCL A; 2BZX A; 4Z8A A; 2FEI A; 3G4S A; 1AZE A; 3RNJ A; 3A8G B; 3CD6 A; 1Q81 R; 4JLI A; 2RHI A; 3NTK A; 3QUI A; 4LD9 K; 4QVC A; 1BI1 A; 3I5S A; 1FX7 A; 2GFU A; 1BCO A; 2PNI A; 4KGX B; 3SD4 A; 2ENM A; 5CQX A; 4OB2 B; 3OYY A; 5HCK A; 2H3J A; 2NUP B; 2QQS A; 4MZP A; 5I21 A; 2CKK A; 4C5E A; 4X9D A; 2VYT A; 4ZNX A; 2KAF A; 2A28 A; 3PT9 A; 1G3W A; 2EQK A; 2EYW A; 3M58 A; 4LDV A; 3L2Q A; 1SSF A; 3JB9 F; 3JCM b; 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