The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
60
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structure length |
60
|
Chain Sequence |
GSSPKAVALYSFAGEESGDLPFRKGDVITILKKSDSQNDWWTGRVNGREGIFPANYVELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| molecule keywords |
Hypothetical 40.4 kDa protein in PES4-HIS2 intergenic region
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| publication title |
Yeast SH3 domain structural genomics
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QKW A; 1K9A A; 2EBP A; 1X27 A; 2HDA A; 4OMN A; 3H0I A; 3EGU A; 1J3T A; 1X69 A; 2EKH A; 2KRS A; 1QWF A; 2LX7 A; 1ABO A; 1ZUY A; 1AVZ C; 1XOV A; 1YNZ A; 2CH4 W; 4Y92 A; 1SSH A; 1M3B A; 3M0U A; 1NLP C; 5I11 A; 1YWP A; 3JV3 A; 2LP5 A; 3VS2 A; 2GGR A; 1Y0M A; 2LJ3 A; 4GBQ A; 2NWM A; 1UHC A; 2LZ6 B; 1JXM A; 2M51 A; 2J05 A; 1SPK A; 4JJD A; 1MV0 B; 2OJ2 A; 1WYX A; 4LUD A; 1NLO C; 2CRE A; 2O9S A; 1T0J A; 3H0F A; 2AZV A; 4Z88 A; 3U23 A; 2DF6 A; 4ORZ A; 1RLP C; 4OMQ A; 2L3P A; 1T3S A; 2F2V A; 2RQT A; 2EVR A; 1GBR A; 2EYY A; 1WFW A; 1QCF A; 1WX6 A; 1X2K A; 1M3A A; 2ROT A; 4OML A; 2X3W D; 1WI7 A; 1PKS A; 3EG1 A; 3UA7 A; 1UJ0 A; 2W10 A; 5HCK A; 1AD5 A; 2X3X D; 1A0N B; 1NM7 A; 1K0S A; 2O2O A; 1VYV A; 4HVW A; 2KRN A; 2JW4 A; 3NPF A; 4J9D A; 2A08 A; 2O9V A; 1SHF A; 2HCK A; 1Z9Q A; 1AOJ A; 2EGC A; 4J9G A; 2B86 A; 1SEM A; 2QDL A; 3VS5 A; 2KR3 A; 3IQL A; 1FMK A; 4LN2 A; 5IHI A; 1JQQ A; 3REA B; 1UFF A; 1GCQ C; 4ZNX A; 1RUW A; 2RQR A; 5EC7 A; 2F2X A; 4QT7 A; 1KFZ A; 2JM8 A; 1MUZ A; 2DL4 A; 1MV3 A; 2YDL A; 1K4U S; 4WCI A; 1VA7 A; 3I35 A; 4CC2 A; 3VS4 A; 2GTJ A; 1AWJ A; 4F14 A; 1BU1 A; 1JO8 A; 4RTX A; 1BK2 A; 3EHQ A; 2J06 A; 2K2M A; 4J9C A; 5IXB A; 3RBB B; 1IO6 A; 1TG0 A; 2CSI A; 2DVJ A; 2KNB B; 3NHN A; 2L3Q A; 1VYU A; 2GTO A; 2O88 A; 4KRT A; 5GJV B; 4J9E A; 2VKN A; 5L23 A; 2A36 A; 3NGP A; 4RUG A; 2RN8 A; 1JEG A; 4RTY A; 3NMZ C; 2LQN A; 2FO0 A; 3I9Q A; 1I1J A; 1UEC A; 2JXB A; 1NYG A; 3UA6 A; 1I0C A; 4D8D A; 2RQV A; 2RMO A; 3M0T A; 3M0Q A; 2EW3 A; 3VS7 A; 2KBT A; 5FWC A; 1HD3 A; 1OPK A; 2NUZ A; 2J6K A; 2KT1 A; 1RI9 A; 1G2B A; 1UE9 A; 1X43 A; 3C0C A; 4K11 A; 3M0R A; 3VRY A; 5GJW B; 2DX1 A; 2CDT A; 4Z8A A; 2D8H A; 2LMJ A; 1M3C A; 3ULR B; 2OI3 A; 4LNP A; 2AKK A; 4A63 B; 1UTI A; 2J6O A; 2YT6 A; 2DIL A; 1N5Z A; 1M30 A; 1ZX6 A; 2PNI A; 2FG0 A; 4RTT A; 1W70 A; 2IIM A; 1WXT A; 2JM9 A; 2DA9 A; 4LUE A; 4HXJ A; 2J6F A; 3QWX X; 3KFV A; 2KE9 A; 1ARK A; 2D0N A; 2MIO A; 3PVL A; 4J9B A; 4RTZ A; 1KJW A; 4JZ3 A; 1FYN A; 2O31 A; 2LCS A; 2LJ1 A; 1B07 A; 2DL7 A; 2EGA A; 1K1Z A; 2KYM A; 1GCP A; 2KT8 A; 2HSP A; 2CSQ A; 1SHG A; 1Y57 A; 2RNA A; 2VVK A; 2CUD A; 2KYB A; 3UAT A; 2E5K A; 3LH5 A; 1GL5 A; 1PNJ A; 1YCS B; 3A98 A; 3M0P A; 2KGT A; 2MOX A; 3ZL7 C; 1GRI A; 2ED1 A; 2KRM A; 2EPD A; 1WA7 A; 1UHF A; 2DL8 A; 3H41 A; 1X6G A; 4E6R A; 1X2Q A; 1RLQ C; 1OEB A; 2ESW A; 2CT4 A; 3RNJ A; 2EYZ A; 1AWO A; 1KSW A; 2FPD A; 2K79 A; 1B3Q A; 1GFC A; 4F17 A; 3FJ5 A; 4JZ4 A; 1KIK A; 2V1Q A; 2JS2 A; 1AWW A; 4F16 A; 1AZE A; 2KXC A; 1UUE A; 2SEM A; 3VRZ A; 2DBM A; 2D8J A; 4HVV A; 2I0N A; 1H8K A; 3REB B; 1K76 A; 4OMO A; 2H8H A; 4Z89 A; 2L2P A; 1YN8 A; 2F2W A; 4GLM A; 2CH4 A; 1K0X A; 2YSQ A; 2PTK A; 1X6B A; 1PRM C; 3SHW A; 4AG2 C; 4AFU C; 1GCQ A; 1M27 C; 2AZS A; 1CSK A; 4M4Z A; 1OPL A; 1YWO A; 2M0Y A; 2DLP A; 2ROL A; 3VS3 A; 2EYW A; 2SRC A; 2C0O A; 2BZ8 A; 3EG3 A; 1H3H A; 1E6G A; 1OV3 A; 2FRW A; 1PKT A; 2PZ1 A; 4HVU A; 2CUB A; 1SRM A; 2MCN A; 1CKA A; 4HCK A; 4FSS A; 2JTE A; 2DBK A; 3VS6 A; 4AFZ C; 1NYF A; 4IIO A; 1W6X A; 1OOT A; 1GBQ A; 1BB9 A; 2K3B A; 2CT3 A; 2JMA A; 1U5S A; 2C0T A; 3CQT A; 4AG1 C; 1NEB A; 5I22 A; 4J9I A; 2GBQ A; 1QWE A; 2FEI A; 2AKL A; 1QKX A; 2FPE A; 3EHR A; 2GNC A; 2DYB A; 4DEX A; 1AWX A; 2L3S A; 4IIM A; 2FRY A; 2A37 A; 3EG0 A; 2DRK A; 4OMP A; 3TVT A; 1W1F A; 2RPN A; 4CC7 A; 2C0I A; 1EFN A; 2OAW A; 1WXU A; 1M8M A; 1LCK A; 1E7O A; 1TUC A; 3M0S A; 2AK5 A; 3THK A; 5FW9 A; 4X1V A; 4ESR A; 2JT4 A; 2YUQ A; 1I07 A; 2HEQ A; 1WXB A; 2BTT A; 2KXD A; 3H0H A; 3O5Z A; 1WIE A; 2P4R A; 2DNU A; 5IH2 A; 1WLP B; 2GQI A; 1E6H A; 2DRM A; 1PRL C; 1ZUK A; 1AEY A; 2YUO A; 2DMO A; 1JXO A; 2V1R A; 4AFS C; 2BZX A; 4D8K A; 1ZSG A; 4OMM A; 2RQU A; 3UF4 A; 3QWY A; 4RTU A; 5IHN A; 2HBW A; 3PVQ A; 2LNH B; 2EGE A; 2DL5 A; 2DM1 A; 2LJ0 A; 3PE0 A; 1PHT A; 3VS0 A; 2J7I A; 3TSW A; 2EYX A; 5IXF A; 1BBZ A; 1UGV A; 4CC3 A; 2K9G A; 2RF0 A; 2KEA A; 1NG2 A; 2LQW A; 2RQW A; 1SRL A; 2FPF A; 1HJD A; 4AFQ C; 3EG2 A; 1UDL A; 5ECA A; 3SEM A; 1ABQ A; 2DL3 A; 2KRO A; 2A28 A; 2JS0 A; 3VS1 A; 2ED0 A; 3I5R A; 1QLY A; 2ENM A; 2D1X A; 2K7A A; 2BZY A; 2W0Z A; 1T0H A; 2JMC A; 2ECZ A; 1UG1 A; 2ABL A; 2VWF A; 2YUP A; 3TSZ A; 4RTW A; 1HSQ A; 1WDX A; 1ZUU A; 4EIK A; 1G83 A; 2XMF A; 1U06 A; 2DE0 X; 1ZLM A; 4JPB W; 1PWT A; 1JU5 C; 1H92 A; 2G6F X; 4LE9 A; 2L0A A; 4J9H A; 1U3O A; 5IHK A; 1Z9Z A; 4JJB A; 3GBQ A; 1VYT A; 3I5S A; 4R0K A; 3R6N A; 1V1C A; 2DJQ A; 4JJC A; 4DEY A; 1T3L A; 4CC4 B; 1UJY A; 1S1N A; 1YP5 A; 1AZG B; 1ZBJ A; 2YUN A; 4J9F A; 1GFD A; 4RTV A; 2EQI A; 1CKB A; 1NEG A; 1TUD A; 2K6D A; 5FWB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FJP A; 4OMN A; 4C8Q G; 4PJO B; 3CD6 Q; 1QQJ A; 4L59 A; 2C06 A; 1QWF A; 1KQ2 A; 2OTL T; 1Y96 B; 2KDS A; 3CC2 A; 1JB0 E; 3CCU Q; 1ABO A; 2MPX C; 4C8Q E; 1FMV A; 1I5L A; 4MML A; 1AVZ C; 1D3B B; 1XOV A; 4Y92 A; 3L1A A; 3WVE B; 4M7D B; 1NLP C; 1YWP A; 3AT1 B; 4C5E A; 3EG9 B; 1N8R U; 3QYG B; 1UHC A; 3X28 B; 5CO7 A; 2PUO B; 2M51 A; 1VQ7 T; 1PCX A; 1SPK A; 4L6V 5; 1QCO A; 3OYF A; 2XDD A; 2O9S A; 4Z88 A; 4RCC A; 1WPY A; 2L3P A; 4KGV B; 2F2V A; 2RQT A; 3JCM f; 2DZC A; 1OZ3 A; 4RG2 A; 1WFW A; 1WZO A; 4OMF B; 2LQ8 A; 4FT2 A; 1PKS A; 1KQS A; 3EG1 A; 3UA7 A; 3C95 A; 1UJ0 A; 4XTY A; 2O2O A; 2JW4 A; 2ZPF B; 1KD1 U; 1QP3 A; 4EMK B; 3QPH A; 3CD6 A; 3PGG A; 1AOJ A; 2EGC A; 3OS2 A; 3CCU A; 2K57 A; 2LCC A; 2YRV A; 4LN2 A; 1JQQ A; 4QW2 A; 2VUB A; 3REA B; 2R5M A; 2RI5 A; 1UFF A; 3OW2 P; 1ZQ1 A; 1VQ6 T; 3HSB A; 3L2W A; 1VQL T; 2CP3 A; 3FDR A; 2F2X A; 2L8D A; 3I56 T; 4QT7 A; 2JM8 A; 4ZGJ B; 1MV3 A; 2COZ A; 4WCI A; 4M78 A; 5J26 A; 3OYM A; 3OYC A; 2GTJ A; 4F14 A; 1BU1 A; 3D7S B; 3EGD A; 1DJ7 B; 1I4K 1; 2HKQ B; 2BUD A; 4J9C A; 2GFU A; 5M9O A; 5KE2 A; 2LC4 A; 1M5Q 1; 3RKX A; 3RBB B; 1W2B S; 3QZ5 B; 2LQK A; 1N27 A; 4LD6 A; 1TG0 A; 2CSI A; 5GAM j; 4C0D C; 2ATC B; 2L3Q A; 2EQJ A; 1UGS B; 3JCM e; 5GAM g; 5FRM A; 3CBM A; 1OI1 A; 2VKN A; 3H9N A; 1EIF A; 3HFN A; 2RN8 A; 1JEG A; 5CR2 A; 3CPW A; 5FRN A; 3CCJ Q; 1BCM A; 4RTY A; 2PVG B; 3CCR Q; 3NMZ C; 4FM4 B; 3I9Q A; 4FT4 A; 1I1J A; 3UA6 A; 1I0C A; 3LWI A; 2RQV A; 2EW3 A; 1Q95 G; 2RD1 A; 2DD4 A; 4A4E A; 2EQK A; 2EWN A; 1PD0 A; 5CQX A; 4A4F A; 4BDY A; 3TCJ A; 4OGC A; 1OPK A; 3DB3 A; 1RAA B; 4C92 F; 5CKE A; 3EGX A; 3L42 A; 4C0F A; 5FRO A; 2RJD A; 5GJW B; 2CDT A; 3QXE B; 3V8K A; 4JLI A; 4M7A C; 2WSF E; 1M9S A; 4PJO G; 4QVC A; 2PNI A; 2FG0 A; 1ZA1 B; 2ZPH B; 3I55 T; 1WXT A; 2FHD A; 4LUE A; 3CCV Q; 1Y07 A; 4N4G A; 5DLO A; 5LJ5 d; 2D0N A; 2PVD B; 4M78 B; 1VQ8 Q; 3PVL A; 2DEQ A; 3OYB A; 3PT9 A; 4J9B A; 1KJW A; 4D6W A; 1FYN A; 2LX9 A; 1TOV A; 2LCS A; 3OYL A; 1B07 A; 3CCJ A; 1RAF B; 2KYM A; 3JB9 J; 3CCR A; 4C5I A; 2HSP A; 1SHG A; 1MMD A; 5GAN 8; 1YCS B; 3A98 A; 2ED1 A; 5IT9 E; 2KRM A; 1WA7 A; 2HQE A; 4GLK A; 4XTX A; 2K3Y A; 4E6R A; 1YIJ T; 3OW2 S; 3CBP A; 1RLQ C; 4E7I A; 2ESW A; 3RNJ A; 2EYZ A; 4M77 F; 1KSW A; 2K79 A; 2XHC A; 4JLG A; 4XU3 A; 1XJW B; 5A0L A; 3PIP A; 2O4X A; 1G3W A; 2QDY B; 4F16 A; 2L5Q A; 2SEM A; 1K8A R; 5AT1 B; 3E9F A; 2E64 A; 5L8R E; 2L2P A; 3G7Z A; 3EGX B; 1C0M A; 3CCV A; 1X6B A; 1PRM C; 2E6N A; 2RHI A; 3L2R A; 4AG2 C; 4AFU C; 3PTA A; 4BE0 A; 2VB6 A; 1VQN T; 1M27 C; 2AZS A; 3ASK A; 4XK8 E; 4J6X A; 1YWO A; 3M57 A; 2EYW A; 2C0O A; 4PKC C; 2AT1 B; 2DPP B; 1E6G A; 1V76 A; 1VQK Q; 3KBG A; 1PM3 A; 2Z0W A; 2PZ1 A; 4IUU A; 2KAF A; 2IVW A; 2CUB A; 4IUP A; 1SSF A; 3CCS T; 3PMT A; 2RJF A; 2QEX T; 2JTE A; 4KGX B; 1JJ2 P; 2R58 A; 3TRE A; 2CT3 A; 3CQT A; 2FL7 A; 5I22 A; 1QWE A; 2FEI A; 1VUB A; 2AKL A; 1QKX A; 3EHR A; 4DEX A; 4C92 C; 4MDW A; 3NFC A; 2QQ9 A; 3FRN A; 1MHN A; 3CME Q; 3JCM g; 2RPN A; 4CC7 A; 2C0I A; 2XDB A; 1WXU A; 3V8L A; 2MMP A; 2QA4 Q; 1WHJ A; 3THK A; 3CBO A; 3OS1 A; 3SDZ A; 1BI2 A; 1O75 A; 4ME7 A; 1I07 A; 5GAO l; 3TU4 K; 4BUG A; 4DBR A; 1D1C A; 2PVO B; 2O4X B; 2P4R A; 5IH2 A; 2IG0 A; 2L89 A; 5GMK m; 2DET A; 1IGQ A; 2GQI A; 3G6E Q; 3V7S A; 2DXU A; 2DRM A; 1BI3 A; 3S6W A; 2EQM A; 2DMO A; 4BY6 C; 4AFS C; 2YXY A; 4D8K A; 3FB9 A; 4M7A A; 1VQK A; 4M75 C; 3G71 Q; 4RTU A; 1VQ8 T; 4C92 D; 3PE0 A; 2OTJ T; 3NTK A; 2EYX A; 2LTO A; 3HPW A; 4M78 G; 4N4I A; 2KEA A; 1SRL A; 4M78 E; 5GAO n; 2XID A; 3SEM A; 1MGQ A; 4M77 C; 2HL5 C; 2VC8 A; 2A28 A; 3HRS A; 3M59 A; 1C6V X; 3CME A; 4KH1 B; 4ZTF A; 2QA4 A; 1M1K R; 2DYI A; 2JMC A; 4PLI A; 2ABL A; 1FWZ A; 1PD1 A; 4RTW A; 1WDX A; 1QMC A; 4EIK A; 1G83 A; 3M53 A; 4JPB W; 5FU7 C; 1M1K C; 4LE9 A; 3X25 B; 3NTI A; 3RR6 A; 3G6E A; 1G8X A; 4YTL A; 2JTF A; 4A54 A; 3GBQ A; 1VYT A; 3R6N A; 3KXT A; 1V1C A; 5C0M A; 1W4S A; 3G71 A; 4DBQ A; 3SFM A; 2RJE A; 5GAN j; 4MZM A; 1I81 A; 4PL6 A; 1ZBJ A; 3CC4 T; 5A0D A; 3OYE A; 2LT1 A; 4OF1 A; 1JJ2 S; 2EQI A; 1NEG A; 5LJ3 d; 4KUD K; 1YIT T; 4A4K A; 1QKW A; 4HKE A; 1K9A A; 3M9Q A; 2HDA A; 1J3T A; 1X69 A; 1WQ7 A; 2KRS A; 2QGF B; 2RJC A; 4RKU E; 3LYI A; 5I21 A; 4PK4 A; 1X01 A; 4NS5 A; 3MEV A; 1YCY A; 1SSH A; 3EH1 A; 3V8J A; 3JV3 A; 3VS2 A; 4BI3 A; 5DY9 A; 1RAC B; 2GGR A; 1Y0M A; 4GBQ A; 5GAN 4; 1ZSZ B; 4E47 A; 1Q82 U; 2LZ6 B; 2M0O A; 1G3T A; 4C0Z A; 1JXM A; 3MCA B; 2J05 A; 5KYY B; 1WYX A; 3EAE A; 4NL2 A; 1BYM A; 3WXM B; 1NLO C; 2CRE A; 3U23 A; 1RLP C; 1T3S A; 2XIC A; 5LJ3 h; 4B6M A; 1QCF A; 1TTH B; 1K73 U; 1M3A A; 1W2B A; 1AT1 B; 4HCB A; 3SWN A; 4B9X A; 1YJW Q; 1S72 T; 5HCK A; 1NM7 A; 1VYV A; 4F7U F; 1M1F A; 1RI0 A; 5LL6 S; 1NJI R; 1TWB A; 5GAN h; 3OYJ A; 2O9V A; 1SHF A; 2HCK A; 4GY5 A; 2MK5 A; 4KUL A; 3CCM T; 4PJN A; 2QDL A; 1OQK A; 1FMK A; 3SB2 A; 1GCQ C; 2HNI A; 3O8V A; 4II1 A; 1NJI C; 3HHT B; 3VKI A; 2F5K A; 4M75 A; 2F69 A; 1MUZ A; 2DL4 A; 4JS5 A; 3JB9 F; 4CC2 A; 1K9M U; 3QO3 A; 1BK2 A; 1IHV A; 4M78 D; 5CVI A; 2R5A A; 5IXB A; 1B34 A; 3LW5 E; 1U8R A; 8ATC B; 3JCM W; 2FZK B; 2DVJ A; 2KNB B; 3NHN A; 3OYY A; 2EFI A; 2O88 A; 1EZZ B; 1MMA A; 2VGM A; 5L23 A; 4LD9 K; 3MP1 A; 3NGP A; 3JCM J; 2X4J A; 2DD5 A; 1PG5 B; 3M4G A; 3BDU A; 1YJW A; 2MAM A; 4MZT A; 2VAS A; 4XTW A; 2EQU A; 3J80 E; 2FO0 A; 1OX9 A; 1NPR A; 2JXB A; 1NYG A; 4C92 B; 1D0Y A; 3M0T A; 3M0Q A; 3LLR A; 3PMI A; 2KBT A; 3GPL A; 4OVA A; 2NUZ A; 2KY9 A; 2DXT A; 4M7A F; 2HZY A; 1WHG A; 3MEA A; 3ME9 A; 2P0K A; 2RH2 A; 1X43 A; 2QQB A; 4K11 A; 2XD0 A; 2JJ9 A; 3M0R A; 3OW2 A; 2CYZ B; 2DX1 A; 1GXI E; 2M1H A; 2CP0 A; 2JNG A; 1M2O A; 3WVD B; 1MMN A; 2JZ2 A; 1AHJ B; 1N5Z A; 2DIL A; 4M7A G; 4RTT A; 1Q86 U; 1VQ5 T; 3FIF A; 1G3S A; 2JOY A; 4M7A E; 4QQG A; 3KFV A; 3VUZ A; 2K5I A; 3CMA Q; 3CXC P; 5KYU A; 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