1T44A

Structural basis of actin sequestration by thymosin-b4: implications for arp2/3 activation
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Chimera of Gelsolin domain 1 and C-Terminal domain of thymos
publication title Structural basis of actin sequestration by thymosin-beta4: implications for WH2 proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1t44A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1t44A04
1Q18A 4FWOA 4CZMA 3EKUA 3MK6A 3O1BA 3QBXA 2NZTA 3UKUB 1BA0A 1DEJA 2Q31A 4A2AA 2D1KA 3OHRA 4MO5A 3WQTA 5AZJA 5AQZA 5AQFA 3FZHA 1S22A 2EWSA 1S3XA 4J8FA 3VETA 1NM1A 3QMLA 2NLXA 2WUSA 2ZGZA 1DGKN 5ADXA 4EHTA 3VF2A 3L6QA 1GLDG 2QWRA 1X3MA 3R6MA 1WOQA 3WUHA 4HWIA 3ZX3A 4H0XB 4BRPA 4E1JA 3FZFA 3EKSA 1JCGA 5BRFA 4BRCA 5AQTA 4F9OA 3O6WA 4BR2A 1SAZA 3O80A 1BU6O 3HTVA 3AY9A 2QWQA 5AZJB 4PKIA 1NGAA 2D0OA 3AAPA 5AQXA 2OANA 3G25A 3KVGA 3ID8A 2P9NA 3VESA 5AQVA 5FPNA 3CJCA 1DKGD 3QFUA 5EOYA 4FPBA 1ATRA 2GWJA 2E2OA 3MN6A 3VOVA 3FLCO 2D4WA 3JS6A 1WUAA 3FR0A 1IG8A 2A42A 3HSCA 4BGBA 3SJHA 4WYBA 4FO0A 4AM7A 3GL1A 3KZBA 5AQGA 4EAHD 4A62A 3CQXA 1SZ2A 4FWLA 3LDLA 3DJCA 3H45C 3LDNA 4BRHA 2QWPA 3UE5A 1R59O 1TUYA 3FZLA 3QDKA 3CERA 1LCUA 4FPAA 4BR4A 3CJ9A 2P9NB 4CD1A 3DAWA 4BRNA 4BRQA 2P9UA 2P9LA 5EXWA 4XH5A 2I7NA 2P9KA 3H46O 4JNEA 4QS9A 1NWKA 4CBWA 1HJOA 4K42A 4BC4A 1BO5O 1XC3A 2FLOA 3M1FA 3SMPA 1ATSA 4H5RA 3TU5A 4K25A 4M63C 2ZGYA 3WXIA 5AZIB 4CBXA 1TYQA 3VGMA 4H03B 1H1VA 2Q0UA 4H5TA 4DQ8A 5F1XA 4DCHA 3A5NC 3RSEA 2P9UB 4B1XB 3HZ6A 3IMXA 3ATVA 1QHAA 3SLCA 4FWRA 2P9KB 1YVNA 4MO4A 4JN4A 4H5VA 3AAQA 3VPZA 3VEXA 4BC2A 3IFRA 2QWMA 4BR7A 3LL3A 4BG9A 3H3OB 4FSVA 5ELZA 4BRGA 5AQPA 4EHUA 3SK3A 1TYQB 2V7ZA 4L3QA 4A61A 3H1QA 4FL9A 1BOTO 4DHYA 3U8XA 1MWKA 3RSEB 4BGAA 5AQJA 3DXKA 5AQYA 4YDUC 4NB4A 2H3GX 2E2PA 1GLCG 4FWSA 1NGGA 3AARA 3CI5A 4M7YA 3WXLA 3LDPA 4H0YB 3VENA 4B1YB 5ADXH 2D0PA 2VWBA 2YHYA 5KPRA 2ASPA 2AA4A 3ZEUA 5KPTA 5CE3A 4BVPA 4FWKA 1MWMA 3U9ZA 2FF6A 2E1ZA 3BP8A 3VEVA 3CJ7A 4MLHA 4WQ5A 3ENHA 4GY2B 2Q97A 5AQSA 1QQOA 1YXQA 3LDQA 3DXKB 3VERA 4JHDA 4BRKA 1G99A 1HKBA 2Q2RA 4FWQA 3O08A 4IJNA 3EN9A 1E4FT 3VEOA 1MDUB 3D2EA 5JMVA 2A6AA 4O8KA 1T6DA 1KXPA 3VEYA 3ZEUB 4IO8A 3MDQA 2GEMA 5F2RA 3QB0A 1C0GA 3QFPA 4WQ5C 4BRLA 3D2FB 2Q36A 4I6MA 2V52B 3CJ1A 1GLLO 1QQMA 3WT0A 4AM6A 3FFKB 2QWOA 4JHDB 5BN8A 4H0VB 1U6ZA 3FZKA 1HPMA 2FXUA 2E20A 3A8YA 3D2EB 1BA1A 5AZIA 4FWMA 3CJAA 4BR5A 1RFQA 2QM1A 5E84A 4CZFA 3EL2A 2GTDA 4QS7A 3O8MA 3WEEB 5AQLA 1JCEA 2A41A 1BWFO 2F9WA 1C0FA 2YHXA 3LM9A 4BR9A 3ZX0A 1NGHA 4I6MB 5KQDA 2A3ZA 1E4GT 5FPDA 4CZKA 4XH4A 4CZHA 4CZGA 4IJAA 5AQIA 2HMPA 5AQRA 2A40A 3U4LA 4IZ9A 3A5LC 5EX5A 3MN9A 4BVOA 5AQMA 2A5XA 2FSKA 1BG3A 5BN9A 3VF4A 4BROA 4B1ZA 1LOTB 4KBOA 4BRMA 4RTFD 2YHWA 3EZWA 4JAXA 3R8EA 5AQNA 3BUZB 4YDUA 1NGDA 2QWLA 3CJBA 3CIPA 2P9SA 4K41A 2KHOA 2YJEA 3C0BA 4BRAA 5KQ8A 4H0PA 4M7XA 4CZLA 3O4WA 2IVOA 4FWPA 1NBWA 3I33A 4BRDA 5I9EB 1XQSC 2PBDA 3R9PA 3DXMA 3BEXA 2VYPA 3O5BA 4MLEA 3FGUA 3BF1A 1GLBG 5JICA 1ZC6A 5JLHA 1X3NA 4CD3A 3EO3A 1MA9B 2QW9A 3HM8A 3HBTA 3JXUA 3ULEB 3WXJA 1SQKA 1XUPO 2CGKA 1QQNA 2V7YA 5EY4A 3A5OC 3C7NA 5AQOA 1Z05A 2P9SB 3O1WA 2VCPA 1OKJA 1IJJA 5AQUA 3QICA 1YAGA 4ISEA 4B1WB 1KAZA 2ASMA 2E8AA 3CHWA 3DXMB 4HTLA 4CBUA 2E2NA 2FSNA 2J4RA 3H3NO 1T6CA 2CH6A 3IUCA 1QZ6A 2CGJA 2CH5A 4BRIA 3GOIA 1BUPA 5AR0A 2CGLA 4CZIA 3VGLA 3D2FA 2QXLA 4Y0WA 3H6EA 3C7NB 2ZWHA 2HOEA 4H5WA 5TKYA 1P8ZA 1GLAG 3GDQA 4DB3A 4NO7A 2P9PA 1U2VA 1GLFO 1CZAN 4B9QA 1NGJA 2PAVA 2YJFA 2P9IA 3WEEA 3CQYA 3ZETB 4Z94A 2E2QA 2ZF5O 4JD2B 2IVPA 1K8KA 2W40A 5BPLA 2I7PA 3UKRB 3M3ZA 3GG4A 4CZJA 3F9MA 1GLEG 1J6ZA 2GELA 1V4TA 3A0IX 1NGCA 3BF3A 3WQUA 4C23A 3QBWA 4BRFA 1T44A 1KAYA 3VF6A 1TUUA 2P9PB 4CJ7A 1U2VB 3CETA 4PL8A 3VEZA 5B8HA 2NRHA 5JLFA 3LM2A 3A5MC 5AQQA 3U9DA 1JCFA 2P9IB 4BG8A 5BPNA 4BC5A 3SMSA 1GLJO 3VEWA 4CI6A 5KPZA 3H1VX 5FPEA 3ZX2A 1EQYA 1K8KB 5F0XA 2HF4A 1ESVA 3KHYA 1ZBSA 4B1VA 5LJVA 4PL7A 5BR9A 4PKGA 1D4XA 4O5FA 3B8AX 1RGIA 3GBTA 4PKHA 3P4IA 4IWVA 4A2BA 1YUWA 5AFUH 3S41A 4H0OA 3W3DA 3ENOA 3M6GA 4GNIA 1NGFA 2BUPA 4RCHA 3MN7A 1ZXOA 5EVZA 5BRHA 3D7EO 5AQHA 3WXKA 2FSJA 4XEIA 4FOEA 2YCHA 1X9JA 1HUXA 2ASOA 1HLUA 5AFUA 3ULEA 5BRDA 5E26A 5LJWA 1Z6RA 2F9TA 2Q0RA 2QWNA 1BDGA 3LDOA 2E1YA 3ATUA 3MN5A 1V4SA 3GE1A 5AQKA 1HKGA 4XH1A 1NMDA 4QS8A 1RDWX 3IDHA 3FZMA 2BTFA 4FWNA 4K43A 1HX1A 1Y64A 2AP1A 4H0TB 4BREA 1NGBA 4BQLA 4WQ4A 1ATNA 3L4IA 3MCPA 3I8BA 3UB5A 2DPNA 1QZ5A 2GWKA 3J8AA 4FOIA 5BPMA 2P9LB 2UYTA 2V51B 3TPQA 4CZEA 4H5NA 2YI1A 2W41A 3UKUA 4B1UB 5BREA 4RWTA 5AQWA 1NGIA 4BR0A 5LY3A 2Q1NA 4BQZA 3HI0A 2ITMA 3DWLA 4LC9B 3L0QA 2HF3A 4EIAA 1KAXA 4EFHA 4IXCA 1NLVA 4WQ4C 4BC3A 3W0LA 3ZETA 3VGKA 4ISGA 2GUPA 4ISFA 4JD2A 2E88A 2IVNA 5FPMA 3UKRA 3FE1A 1NGEA 2IIRA 3MMVA 2FF3B 1HKCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZMA 4KH4A 3QBXA 3LZJA 2NZTA 2PY5A 2Q31A 4A2AA 3MWPA 4EP4A 5H1SQ 1SKRA 3WQTA 5AQZA 1S22A 5J2PA 1NM1A 3QMLA 2NLXA 4DFMA 1DGKN 3PUFA 5ADXA 4EHTA 2HHTA 3VF2A 3L6QA 1M1KO 3SQ4A 1OVYA 3CCRN 1X3MA 3QESA 3K57A 1VRUA 3VQEA 4ILHA 4CJ5A 3ZSQA 1ZBFA 3P5JA 4E0DA 3K5LA 5AQTA 4F9OA 1JLBA 3SQ2A 2EHGA 3SZ2A 1TK8A 1SAZA 1NK0A 4CJRA 1BU6O 3HTVA 3AY9A 2BANA 1NGAA 1D5AA 4CCHA 4LFBK 4CJTA 4E7KA 3J7AP 3ID8A 3EEQA 3VOVA 3OJUA 3FLCO 3I0SA 3QEIA 1ZYQA 4C8MA 2KZZA 1S5JA 3CFPA 2A42A 3HSCA 1TV6A 3SJHA 4FO0A 4I2PA 4JRQA 2ATQA 4EAHD 4A62A 5HP1A 4FWLA 4FJMA 3SI6A 5C10A 2OA8A 2ZQBA 2OPPA 1SL2A 4B9MA 4JKEA 4BR4A 5HL7L 4X64K 4BRNA 3MXMA 3SYZA 1BISA 1VSMA 4YORA 4DS4A 1NOYA 5HBMA 1QSLA 4DU3A 2O8EB 3IAYA 4QS9A 4CBWA 1RDAA 1BO5O 3KD5E 3SMPA 4FK4A 4NCGA 1N8RO 4B8CA 1UAXA 4CHQA 3CQ8A 3LPTA 4CGGA 5I42A 4CIEA 3A5NC 4FVUA 4BE2A 5C12A 4JI0K 2FBYA 1BIZA 3THXB 3HYFA 3A2FA 4BG9A 3H3OB 2VWJA 3TWHA 2W42A 5ELZA 5AQPA 4NYFA 4R79A 3SK3A 3PO5A 3OYIA 2WFBA 4ELUA 2UU9K 4F8RA 4CEBA 2WOMA 3U8XA 2HHXA 2F4VK 4BE7B 3HXMA 3DXKA 4AH9A 4NXMK 2UUCK 4CEQA 2KKZA 4FWSA 1NGGA 3WXLA 3CMEN 2W6LA 1NJYA 3DLLL 4B1YB 1QTMA 3JSMA 4CFCA 2X78A 2YHYA 3SAHA 1HNVA 1MU2A 2IGIA 2X74A 3DLEA 3EY1A 4Q5VA 3VQAA 4FWKA 3HRGA 4FJGA 3ENHA 3OY9A 4YOYA 5IWAK 1QQOA 4EZ9A 3LDQA 4HUGA 1P90A 4BRKA 4AHCA 4K8XA 2B4JA 2X6NA 3O08A 4IJNA 3EN9A 4FK0A 3VEOA 3D2EA 4FLXA 3DRPA 2DFFA 3V9XA 1W2BM 4OGCA 2YX6A 2NRXA 3MDQA 1IKYA 3QB0A 1VK0A 4IFVA 2QK9A 2B6AA 3DLKA 4LSLA 3QINA 3D2FB 5CY4A 3FFKB 4KTWA 3OYAA 4JHDB 5BN8A 2RF2A 1HRHA 4CHNA 1HYSA 1JKHA 4E1MA 1N32K 3CJAA 2A1RA 1YITN 5E84A 1O13A 4JI8K 2GTDA 4DQQA 4ID5A 3PIPL 1RDDA 4DFKA 1BWFO 3LM9A 1Q7YO 3I55N 3LP3A 1NGHA 1X9MA 4LF9K 4PUOA 3ASMA 2A3ZA 5FPDA 4CZKA 4IJAA 4CEDA 1S72N 1CXUA 4CERA 4HHTA 1YT3A 5EX5A 2JLEA 3CCLN 2A5XA 4X62K 4FJLA 2FSKA 1K6YA 3PX6A 4JK7A 2OZMA 3R8EA 5AQNA 4YDUA 2QWLA 3CJBA 1SKSA 4E72A 4LF7K 3EZ5A 2YJEA 3C0BA 1NK8A 3BDPA 3O4WA 3VQ4A 1NBWA 3ZSXA 1N6QA 3R9PA 1RILA 4NLCA 4MLEA 5JICA 4N41A 3MEDA 1X3NA 1VSHA 3OS0A 2E5LK 3PX0A 3HBTA 3JXUA 4DTJA 1XUPO 5E41A 4DTRA 4F2SA 4CF1A 3C7NA 1Z05A 1N34K 3CMAN 2P9SB 5D3GA 1IJJA 3VQ7A 3QICA 3F5TA 4ISEA 4HCBA 4I9QA 1KAZA 2E8AA 4HUFA 1B9DA 1JLFA 4O0IA 2E2NA 3K58A 2CH6A 1A5VA 3O9TA 3IUCA 1VSKA 4RW6A 5J2NA 2Z1HA 3GOIA 5AR0A 2DTUA 3E9OA 1QSSA 3NAEA 4BDYA 3S3NA 3Q7BA 2F7TA 4KHPK 1JLAA 4H5WA 4JS5A 1J5OA 4DV1K 2HHUA 4JI3K 3TABA 1QE1A 4YNQA 1HMVA 4DTOA 1U2VA 1HJRA 1NGJA 3OS2A 2P9IA 4U7BA 3CQYA 1VQ9N 4FM0A 4KI4A 4DSIA 1GOAA 2ZF5O 4JD2B 2W40A 5BPLA 4O44A 1WBDA 4XIUA 4CJWA 1XNRK 1U4BA 4CZJA 3F9MA 1GLEG 1J6ZA 2HHWA 5C42A 1V4TA 3IG1A 2JWKA 5KI6A 1KVCA 4W5OA 3QBWA 1YJNN 4N5SA 3V9SA 4KPYA 3NH2A 1VHXA 4PL8A 4LH4A 3MX2A 3SMSA 2PYLA 1CZBA 4OLAA 2PFUA 3ZX2A 3AVKA 1OVQA 3KHYA 1ZBSA 4B1VA 3K0SA 2NRVA 1KLMA 3T1YK 1W0HA 3TSQA 1TAQA 5AFUH 5FRMA 4H0OA 4IEIA 3M6GA 1NGFA 1RCHA 2BUPA 4FLYA 3IRXA 4WF9L 3CC7N 5AQHA 3AVJA 2FSJA 4FOEA 1X9JA 3T3FA 3NGIA 3ULEA 3SUOA 2WC9A 5KGWA 5E26A 3DYAA 4J2BA 4LFCK 4CFBA 1IV0A 3TSPA 4DQSA 2E1YA 3ENBA 3ATUA 3K9KA 5A2QO 3QEVA 5J1EA 2A1SA 1IKWA 4FWNA 4K43A 3O4NA 1Y64A 4A57A 2OCEA 3NF9A 2QKKA 4CGIA 4GW6A 4BQLA 3QIOA 4KHUA 3ZT3A 3L4IA 3AVNA 4KKOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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