1TA3A

Crystal structure of xylanase (gh10) in complex with inhibitor (xip)
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
AGGKTGQVTVFWGRNKAEGSLREACDSGMYTMVTMSFLDVFGANGKYHLDLSGHDLSSVGADIKHCQSKGVPVSLSIGGYGTGYSLPSNRSALDLFDHLWNSYFGGSKPSVPRPFGDAWLDGVDLFLEHGTPADRYDVLALELAKHNIRGGPGKPLHLTATVRCGYPPAAHVGRALATGIFERVHVRTYESDKWCNQNLGWEGSWDKWTAAYPATRFYVGLTADDKSHQWVHPKNVYYGVAPVAQKKDNYGGIMLWDRYFDKQTNYSSLIKYYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
molecule keywords xylanase inhibitor protein I
publication title The Dual Nature of the Wheat Xylanase Protein Inhibitor XIP-I: STRUCTURAL BASIS FOR THE INHIBITION OF FAMILY 10 AND FAMILY 11 XYLANASES.
pubmed doi rcsb
source organism Emericella nidulans
total genus 99
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ta3A00
3BAYA 4A3HA 1I1XA 4PCSA 2NW0A 4UR9A 4EK7A 1OWQA 4KMQA 4AYSA 1MYRA 2Z1KA 1HIZA 3WSUA 4M1RA 1TG7A 4H8VA 1BYAA 2C0HA 1BYBA 4LGXA 2VVNA 4PUDA 4J3UA 4D1JA 1J11A 4PMUA 3VIFA 1SR0A 5CSYA 1SMDA 2WZIA 3OLGA 3ARXA 4M82A 3T2OA 4U31A 4AC1X 2UY4A 2GJXA 3MKKA 1Q6GA 4H41A 2BVTA 3SCQA 1AQHA 4MNJA 3SCVA 4CD4A 2EQDA 2XPKA 2OSWA 1UR0A 2DQXA 3ARWA 3WQWA 2Y8VA 5IFPA 2D0FA 2VI0A 2XFRA 3L4TA 4JCLA 4P7OA 4HZ6A 5BWFA 2OSXA 5A6AA 1JZ7A 2GVYA 4DUWA 3VDAA 1UR2A 1JAKA 2ZUVA 2VO5A 4J3SA 1UH2A 2AOSA 1Q6EA 3OGSA 4AISA 5JBDA 4GI8A 3RJYA 5A2BA 4M8UA 3SCUA 3WL0A 5ABEA 3L4VA 3OLEA 4OZOA 1WNOA 1G01A 3ALFA 2E9MA 1KWKA 3T0BA 3PZIA 1C8QA 4WKHA 5EBAA 2D3NA 1H09A 3O2LA 3N11A 1E73M 1WP6A 3GBEA 1O7AA 5CLTA 4WKAA 1PX3A 3WFLA 5I0DA 3CBWA 3AHYA 2B31A 3CZEA 5IHRA 4ATLA 1HJSA 4JIEA 2ZOXA 1XSIA 1HJQA 5BRPA 1UA7A 1BG9A 3OGRA 4P7QA 1JYVA 3GYCA 4MDOA 4URIA 2JEQA 1E6XM 4AZ5A 1B3VA 1H49A 5HDRA 2XSAA 3IJ8A 4YPJA 3SURA 3G6MA 3OBAA 4YN5A 2IXVA 4AZHA 3GZAA 5A95A 4GINA 3AHVA 5CGMA 3A4AA 1E0XA 4D1IA 3WY1A 2GFTA 3WH6A 1GJUA 3TTOA 5A8PA 5M3WA 1KB3A 1KXQA 4W5UA 4KWUA 3FW6A 1EGZA 4P8UA 1UWQA 5CG0A 3AQUA 3FXYA 1QOXA 4QP0A 1XD1A 4AZGA 2WK2A 1W3LA 2WLZA 1C90A 4GIAA 6CGTA 5KEZA 3WNPA 1V02A 4DWSC 4QLJA 1EIBA 1XH0A 1DWIM 5EMYA 6TAAA 4PMNA 1E9LA 3VKKA 4IUGA 2A3HA 1E1EA 3EDFA 1KWGA 3ZJ7A 4GQQA 4UTFA 1M53A 1OIMA 2BHZA 2CERA 5JIWA 2XHYA 3CHFA 1HT6A 3M46A 2BY0A 2VNCA 1PPIA 1VBRA 5DT5A 1E72M 1TUXA 3UR8A 4BF7A 1WPCA 1WZLA 1ISVA 1V08A 3ZJKA 4UFJA 1NARA 4W8BA 1V03A 3BMWA 3BCDA 2VCBA 3VMPA 2CHNA 4TXEA 4JAWA 2EPNA 3B9AA 3WD1A 4H04A 1UWUA 1E40A 2E9LA 2BY1A 1G1YA 3ZO9A 3AHZA 1JZ8A 2OWXA 4AD3A 1Q6CA 1M04A 4ZXOA 3SCTA 4AWEA 1EDQA 3WUEA 3ZQ9A 4OOUA 7CGTA 3WDJA 5JBFA 5GNZA 3WDRA 3DHUA 5C70A 3TTSA 5D8WA 3BAXA 3W37A 1HJVA 3ZSSA 2WVVA 2X2YA 1XCXA 1N82A 2VMFA 3BXWA 5I79A 4AXNA 4P8XA 2XIIA 4UQDA 2CBUA 2DH3A 2W63A 3IANA 3M6DA 4JKLA 4OBSA 1BVNP 1UKPA 4GZJA 3TTYA 5A2CA 1DWHM 2Y5EA 3U7VA 1UH3A 1GVIA 1BFNA 1OGBA 2XIBA 2F2HA 1XSKA 2VVSA 4GKLA 3I3EA 1J0JA 4ZXLA 2BHUA 3AS2A 3PBGA 1C8XA 3AS1A 4CU8A 4PMZA 2DEPA 1NOUA 2E9BA 2WB5A 1H2JA 5CZKA 3FNDA 4CU7A 3GH7A 3OZPA 4JKMA 2VX5A 4U2YA 1X1NA 3NSMA 2PBOA 1H1NA 3AI0A 4ZE5A 1OD8A 2J4GA 1DWJM 3W53A 3RM8A 1HL9A 3SCRA 4X0VA 1PBGA 2A3AA 2NT0A 1ZL1A 1JAEA 2DPEA 3MO4A 2GK1A 5HOSA 2O9PA 3U5YA 4KGLA 2X09A 4W7VA 4NRRA 2CYGA 1GOOA 4LYRA 3BMVA 1HVQA 1MW0A 2OWWA 5LA2A 3WH8A 1WO2A 3NYDA 2WBGA 4Q7NA 1W9PA 4HMCA 3MS8A 1CLXA 4MNMA 1H41A 1H0IA 1BAGA 1ZJAA 3CUJA 4HMEA 1EHNA 3S2CA 5FL0A 3RO8A 1NWRA 3L4ZA 1OGGA 3K8LA 3LMYA 5E9AA 2C8NA 3GXDA 4HA4A 1R86A 1ISYA 3L4YA 4E8DA 1KXHA 3GNOA 4JFUA 3T08A 3QHOA 5AC4A 4ZE4A 2VZVA 3PTKA 4BCEA 1XCWA 1R7AA 3AHTA 1LWJA 3VDHA 2D1ZA 1J0KA 3THCA 1V6YA 1OBAA 2WSKA 2X05A 4NF7A 4DWSD 1HKIA 5LA1A 3VD3A 3MUAA 3EDEA 2GUYA 2ZUTA 4H2CA 1J01A 1E15A 5BXPA 2CCRA 5BRQA 4B15A 5A6SA 1M01A 3VD5A 3WQ8A 5D8ZA 2PB1A 1K9DA 1JGIA 2ZXAA 5ECUA 3VX1A 2YL9A 2JF6A 4RE2A 7A3HA 1Y7VA 3AOFA 1CGTA 1B3ZA 1W32A 2DIJA 3ZJ8A 5I3DA 1CXLA 4WSKA 2WZEA 4ACZB 5BROA 3MV01 2XWDA 2G3IA 2GSJA 4DM1A 2VR4A 1YQ2A 2WPGA 4AIOA 1HKMA 1GNXA 2VX6A 3AS0A 6A3HA 1XH1A 1X6NA 1JXJA 4JFVA 4P8VA 5I23A 4CN4A 1CXKA 4DWSA 3B8SA 1E6PA 1QW8A 3BCFA 2WHKA 5JBEA 4XUYA 1G94A 2W91A 3T0DA 1ISXA 2E8YA 3POCA 4FK9A 4H8HA 1GORA 1JZ6A 4FLQA 2EO7A 2FHCA 2YA2A 5GPRA 5HPOA 2WMKA 4D6GA 1BF2A 2VZUA 4DM2A 2PWHA 1R7OA 5ABFB 1BSIA 1WAWA 4CU6A 3NSXA 2FGZA 1NOWA 4FLOA 1B2YA 3AICA 3UETA 1CTNA 2CKRA 3VGDA 2EXOA 4A3YA 1QHZA 3ARYA 5ABGA 2CXGA 4OOZA 2DSZA 4OIFA 2D0GA 4B9ZA 4GO9A 4E2OA 2VT0A 4TTUA 1UQYA 2OYLA 3OZOA 4M29A 4F66A 5E0FA 2DGAA 5A6BD 3NDZA 4AW7A 5GNXA 3WUBA 2DT3A 2BXYA 1V6UA 3NCOA 5HNNA 1LL4A 5AC5A 1ODUA 3BAWA 1CXFA 4AIEA 1TA3B 3PZNA 3SUVA 3J7HA 2UWFA 1CGYA 2VQTA 2CHOA 2DIEA 3KE0A 3W4RA 3VIGA 1GOKA 4LX4A 3HN3A 4WIWA 1E70M 2V3GA 3CUHA 4F9JA 3WD4A 3QGVA 2DSVA 1JZ3A 1FFQA 1E6QM 1E43A 1TR1A 4B3KA 1PZ3A 4HTYA 3BAIA 4N42A 4KRUA 4W88A 1ODZA 3VINA 3WMBA 1Q6FA 1MFVA 1R8LA 4D6HA 4E4PA 1RP9A 1VF8A 1CENA 3WFZA 5A6BA 1UR8A 1GJWA 3AJ7A 3ARQA 1ESWA 2BY2A 1JF5A 5M5DA 1YHTA 1WB0A 1MXDA 2J77A 1KGWA 4TUFA 2W4XA 3IJ7A 1GQKA 3ARSA 4W8LA 2UY3A 2ZUMA 5GNYA 2A3CA 4BS0A 2E8ZA 2VURA 2VZSA 2QLYA 4CUCA 4UQBA 1XRVA 2A3BA 3AIUA 2WC4A 4AZCA 2PBGA 1EO7A 4J3XA 4ZFMA 3K4DA 3PTQA 3EMQA 4U3CA 5CXPA 1HVXA 3CZLA 4AY1A 3HU7A 2WKGA 3W29A 1EOKA 1OB0A 4GO8A 3GTNA 5HXMA 3KL5A 3ZT5A 3UCQA 1I75A 1V3LA 1UA3A 3GM8A 2ZWYA 3PZUA 1NOFA 1LQ0A 2J78A 1H3GA 1B90A 4CKQA 3GBDA 3DYPA 4PTXA 1JDCA 2O9RA 5CPTA 3QHNA 4UFLA 4GI6A 1VB9A 5LA0A 1CEOA 1ZS2A 3L4UA 3OLIA 4NSBA 3WDIA 2ZX7A 3KL0A 3WF2A 2CIPA 4XV0A 1JFHA 3VUPA 1V6XA 3QHMA 2WSPA 3AZSA 3BSHA 4U5IA 1ZB5A 2JF7A 4F9DA 2YDQA 1PJ9A 2WMJA 4E8CA 1CXEA 3LPOA 3BC9A 4CVUA 2WXDM 4B16A 2YBUA 1ISZA 4MB3A 1E4IA 3WF3A 1JYNA 4OBRA 2C7FA 5M17A 3SUTA 3ARVA 1J0IA 1CGWA 1OM0A 2E0PA 5FKYA 3UG5A 4HOWA 3MMUA 4JCMA 4QAWA 1VFUA 2Z1SA 2GDVA 3WIJA 2VRJA 4ATWA 3AIVA 3AFBA 2UY2A 1E71M 1LJYA 3TOPA 5EFDA 1CXIA 5I5RA 2TAAA 3MSGA 5HBFA 1CGVA 3KEHA 1ZU8A 1MW1A 5D9MA 1TCMA 4A4AA 1BVZA 5BCAA 3ARUA 3CUGA 3L4XA 4MB5A 4LPCA 3KL3A 2FHFA 3LPFA 3WNLA 5FIPA 2EJ1A 3N18A 1W9UA 5A8NA 1XH2A 1L8NA 2VTFA 4PMDA 1B3YA 4AD5A 3SCOA 4MPKA 4D6CA 2BVDA 3TA9A 4QDMA 3F4VA 4AD4A 1OIFA 2O9OA 4W84A 3GXIA 4W87A 3RPMA 2XUCA 5A6LA 3GH4A 1UZ1A 4AD1A 4IISA 3ZR6A 1KQZA 1GQJA 4WK9A 3AXHA 3HMCA 3N15A 4MTVA 2GDUA 2YLLA 3NUKA 2QMKA 2W66A 3W6LA 2D3LA 2XTKA 1IZJA 4B3LA 2G4FA 4U5KA 1GHRA 4UQCA 4CCDA 4PMYA 3NDYA 3ARPA 1GW1A 2WVSA 1JZ5A 4NRSA 3OB8A 2VX4A 2J75A 1UR9A 2GJXB 3WQ4A 4CCEA 2V38A 1QVBA 1HKKA 1B9ZA 3FAXA 5IHSA 4WJXA 1V0NA 3WQ5A 3CUFA 1JXKA 4OUEA 3O9NA 4LYQA 1SYTA 3VPLA 1E6ZA 1H4PA 1JL8A 4UFKA 2UY5A 3M7SA 1BGAA 1V0KA 3AIQA 2MANA 2PWDA 1HP5A 4V2XA 5HPCA 1WDQA 3L4WA 3A47A 3ARZA 3N12A 3VDBA 3WUFA 2CKSA 2BNJA 4AD0A 2OSYA 3WQ6A 3ZJ6A 1W9DM 3S6TA 4UQ9A 3PZOA 2ZXQA 4Z2HA 1W9VA 2ZUNA 3WN6A 2GJRA 3SUUA 3CIVA 4HMDA 1JNDA 2YIHA 3NIYA 1J0YA 1CGUA 3UESA 5FL1A 2YLAA 1UG6A 4WSJA 2ZUSA 1CLVA 2J47A 5DMYA 3WDHA 3WUGA 2WCGA 2WC7A 2YL5A 1PAMA 2WYSA 1B3XA 3VMOA 1CECA 4PMOA 1L0PA 1ZJBA 2WCSA 1MQRA 2VX7A 3QR3A 1HP4A 2V3FA 2WHLA 3CUIA 1K9TA 4W86A 1DWGM 4JKKA 2J25A 3WMSA 1FHLA 5GQBA 1VEPA 3FHQA 1HJWA 3WEZA 3WMCA 3FY1A 2J8FA 4RL3A 4PRWA 3IJ9A 2WHJA 2WMFA 2YL6A 3PZMA 2XGBA 3DECA 1WZKA 2VCCA 4W89A 1A3HA 1GQIA 1ECEA 5DO8A 3VMNA 2ZUWA 3PZ9A 3M07A 4HA3A 5CSUA 2E40A 4FMVA 3DC0A 1J0HA 1JI1A 4TX8A 5CPSA 3U5UA 4B9YA 4QLLA 3GXMA 2X0HA 1PIFA 3NJ3A 4FF5A 1E3XA 1E4NA 5KZ6A 1WE5A 1D3CA 3L2LA 8CGTA 2WBKA 2J7CA 3D5HA 5A2AA 5I2UA 1UQZA 5E09A 4JL2A 5A8QA 4HOZA 1EDGA 1KR0A 1E5JA 2E4TA 4ZEPA 3AYSA 5JIPA 4HU0A 2EEXA 3ZT6A 1BYDA 1Z32X 5E6ZA 3ZOAA 1FP9A 4UCFA 3I3DA 1CWYA 2G41A 3W81A 2FH8A 3VD7A 3EBVA 2EPOA 1RD6A 2Y4SA 4Z2JA 1J18A 2J7DA 4HZ7A 4N0RA 4QFUA 1MXGA 1RPKA 2J8GA 4HPGA 2Y2WA 1FH7A 1CYGA 4W5ZA 1QI3A 1W3JA 3WD2A 2QMJA 1FP8A 2VUYA 2DSKA 1EDTA 3D3AA 1BHGA 2ZIDA 3N17A 3RM4A 1OGSA 1H5VA 1AVAA 4J28A 3T0AA 2BS9A 2ZX9A 4S3KA 2BY3A 3VIJA 3EYPA 3AROA 4Z2KA 2G8ZA 1KQYA 1UH4A 4AZ6A 5DF0A 2XWEA 3BH4A 3WF4A 2WVVB 3KWXA 3OG2A 4DUXA 3WL1A 1V3MA 4UFHA 4TVCA 3OIHA 2D24A 4GPNA 2DT2A 4YHEA 1DWAM 3AMDA 2G3NA 4QCEA 3WD3A 4Z2GA 1XSJA 2WMIA 3BGAA 3SIMA 4EE9A 1KR1A 3CMJA 4J3TA 4CD5A 1EQCA 4J7RA 1LG2A 1EQPA 4W7UA 4K68A 4AD2A 1J0ZA 2XVNA 3MSDA 3I3BA 5CQ1A 2CBVA 2EPKX 3F5LA 1ZBKA 2VRKA 2Y24A 1XV8A 1C7TA 3A4XA 1I1WA 1AQMA 2PI6A 3EMCA 5IDIA 3CPUA 4TVDA 1BTCA 1NP2A 1KGXA 2DT1A 5CPQA 3UEQA 1ITXA 2A3EA 3TP4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3BAY A;  4A3H A;  1I1X A;  4PCS A;  2NW0 A;  4UR9 A;  4EK7 A;  1OWQ A;  4KMQ A;  4AYS A;  1MYR A;  2Z1K A;  1HIZ A;  3WSU A;  4M1R A;  1TG7 A;  4H8V A;  1BYA A;  2C0H A;  1BYB A;  4LGX A;  2VVN A;  4PUD A;  4J3U A;  4D1J A;  1J11 A;  4PMU A;  3VIF A;  1SR0 A;  5CSY A;  1SMD A;  2WZI A;  3OLG A;  3ARX A;  4M82 A;  3T2O A;  4U31 A;  4AC1 X;  2UY4 A;  2GJX A;  3MKK A;  1Q6G A;  4H41 A;  2BVT A;  3SCQ A;  1AQH A;  4MNJ A;  3SCV A;  4CD4 A;  2EQD A;  2XPK A;  2OSW A;  1UR0 A;  2DQX A;  3ARW A;  3WQW A;  2Y8V A;  5IFP A;  2D0F A;  2VI0 A;  2XFR A;  3L4T A;  4JCL A;  4P7O A;  4HZ6 A;  5BWF A;  2OSX A;  5A6A A;  1JZ7 A;  2GVY A;  4DUW A;  3VDA A;  1UR2 A;  1JAK A;  2ZUV A;  2VO5 A;  4J3S A;  1UH2 A;  2AOS A;  1Q6E A;  3OGS A;  4AIS A;  5JBD A;  4GI8 A;  3RJY A;  5A2B A;  4M8U A;  3SCU A;  3WL0 A;  5ABE A;  3L4V A;  3OLE A;  4OZO A;  1WNO A;  1G01 A;  3ALF A;  2E9M A;  1KWK A;  3T0B A;  3PZI A;  1C8Q A;  4WKH A;  5EBA A;  2D3N A;  1H09 A;  3O2L A;  3N11 A;  1E73 M;  1WP6 A;  3GBE A;  1O7A A;  5CLT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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