1TB0X

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Structural and kinetic characterization of active-site histidine as a proton shuttle in catalysis by human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1tb0X00
1DMYA 3F7UA 2QP6A 1BV3A 2FMZA 1UGGA 3RYYA 4JSSA 3HFPA 1IF7A 3RZ7A 1JCZA 2GD8A 4E9OX 3FW3A 3C7PA 2W2JA 2HOCA 4Q8XA 4YGJA 1UGCA 4RIUA 4YXIA 4ZWZA 2POVA 1H9QA 1F2WA 1Z9YA 1CILA 1H4NA 2WD2A 1TBTX 3JXHC 9CA2A 3W6IA 3EFIA 4N0XB 4R59A 1RJ5A 2AW1A 2HFWA 4KUYA 4M2RA 4QIZA 4IWZA 1BN1A 3DVBA 3M5EA 2FW4A 4QJOA 1I9QA 4KV0A 1KOPA 1HEDA 2QO8A 4QY3A 2FNMA 1CANA 4YWPA 3M1WA 3RZ0B 3S9TA 1CNCA 3QYKA 5FDIA 2NWZA 5FNHA 4Q07A 3OYQA 3D8WA 4QJPA 2POUA 3OIMA 4Q7VA 4PYYA 1HCAA 4ZWYA 2CBDA 3V5GA 2NNSA 5E2NA 5E2MA 4QSBA 3M5TA 3V3JA 1CCSA 4WUPA 4QK2A 5DOGA 3K2FA 3S71B 1I9LA 3MHOA 4BCWA 3OILA 4Z1NA 2EZ7A 4L5WA 3KWAA 3OIKA 5AMLA 3N3JA 4RN4A 4QSIA 5JQ0A 4YGFA 3RYZA 3SAXA 7CA2A 4K13A 1BICA 5EZTX 1CZMA 3T5ZA 1RJ6A 4HF3A 1UGEA 5JEGB 1CAHA 3KOKA 3P4VA 1FQNA 4Q99A 4M2UA 4QSAA 2X7TA 3RYVB 3SAPA 3MZCA 3F4XA 1FQRA 5SZ0A 4HU1A 1YO1A 4BF6A 5BNLA 1CCUA 5CACA 5JDVB 5FNMA 1HCBA 2X7SA 1THKA 1ZGFA 1H9NA 2VVBX 1RZAA 5SZ3A 1MUAA 3JXFA 3P3HA 1OQ5A 2CABA 2POWA 1TE3X 2FOVA 1CA2A 3DCSA 1G52A 4KAPA 1FQMA 4FL7A 1RZBA 1FSRA 4YYTA 4LU3A 2WD3A 2HNCA 1UGDA 5DSKA 4MTYA 5DRSA 5EKJA 1XEVA 3T5UA 4MO8A 1HEBA 3HS4A 4LP6A 4XIWA 3U47A 3DD0A 1UGAA 1CNGA 6CA2A 1TG9A 3B4FA 2HKKA 1YDBA 4MDMA 4WW8A 1I90A 3JXGA 4E4AA 3SBHA 4Z1EA 3M5SA 4ILXA 5EKHA 5EHWA 3MNHA 4MLXA 2NN7A 4FPTA 1KWRA 5FNJA 1KWQA 4R5AA 5BYIA 3RGEA 3S8XA 1YO0A 3MHMA 4QSJA 1G4JA 3HKTA 3OY0A 2NNGA 5DSPA 4ETQC 3S74B 1CNJA 5LMDA 1URTA 4BF1A 2CBAA 4KUVA 4HEWA 3MHCA 1ZSAA 3IBIA 4HBAA 4ZAOA 1CAOA 5BRUA 1RZDA 3M96A 3S77B 2WEOA 4QTLA 1TTMA 3MNJA 2ZNCA 5J8ZA 1CAMA 1HUHA 2EU3A 2AX2A 4FVNA 1G4OA 2GEHA 4ITPA 4ZX0A 3HLJA 3M14A 3DAZA 1LZVA 3UYNA 3RZ1B 1G46A 1V9IC 4Q78A 5EIJA 4MDGA 4Q87A 4X5SA 2EU2A 1LG5A 1G54A 4XE1A 4QIYA 3R16A 3ML5A 1I91A 1HECA 5CLUA 1CIMA 2X7UA 3F8EA 3RLDA 3U3AX 4N16A 4YXUA 3IAIA 1LG6A 1LUGA 2FOSA 4Q7WA 4WL4A 2FOQA 8CA2A 3V2MA 1MOOA 2FOUA 1IF4A 3S78B 3VBDA 3MHIA 1TEUX 1IF8A 3M04A 3KIGA 4YGLA 4Q08A 1CA3A 5DSRA 3P5AA 1CNHA 1ZGEA 5SZ1A 2HL4A 1CVAA 3D0NA 2FNKA 2ILIA 3MNUA 3MNIA 5EOIA 3KLDB 4E5QA 3V3HB 4ITOA 5CA2A 1ZSBA 3S97A 2CA2A 5JEPB 3DBUA 1TG3A 1CAKA 3S75B 1IF6A 2ABEA 1KOQA 4FRCA 5E2SA 1FSNA 2OSFA 2NN1A 3KNEA 1IF9A 3CZVA 4E3GA 5FLTA 1ZSCA 1BNMA 1CCTA 1BNUA 1UGBA 1ZNCA 4QEFA 5SZ7A 5DSQA 2FMGA 5AMGA 3BETA 3M2XA 4QJMA 3MNKA 4R5BA 4M2VA 5DSNA 2QOAA 5JEHB 4COQA 4YXOA 2NMXA 2F14A 3D92A 4E3FA 4KUWA 4RH2A 3DCCA 1BN3A 4RUXA 3M2NA 4MLTA 4XZ5A 4HT2A 1CVFA 2Q1QA 4Q09A 4K1QA 3GZ0A 1AVNA 4Q9YA 1FR4A 4YVYA 4E49A 3DVCA 1Z97A 4Q49A 5EH5A 5G01A 1XPZA 3U45X 3PO6A 4FVOA 4WUQA 4CQ0A 4HEYA 4JSAA 3IBLA 3P44A 4HEZA 4Q7PA 1CNXA 4Q6EA 5EHVA 4L5UA 5EH8A 5SZ4A 3UYQA 2H4NA 5DOHA 5A25A 1I9NA 3CYUA 4ZX1A 4Q6DA 5FDCA 3K34A 4TWLA 3M67A 1A42A 5FLSA 1T9NA 3V3IB 3MHLA 2VVAX 1DCBA 4KNJA 4Q7SA 1I8ZA 4YGKA 1TB0X 3BL0A 3DC3A 5E5RA 5JQTA 4JSWA 3PJJA 3F7BA 3M98A 3S72B 2CBCA 1FSQA 3P3JA 4K0TA 3W6HA 3CAJA 1I9MA 1KEQA 2Q1BA 1CRMA 1ZH9A 1FR7A 1XEGA 1CVBA 4MDLA 3HKQA 1ZE8A 3P55A 4RFCA 5E2KA 3T83A 1JV0A 4RIVA 3D93A 4CACA 1BNTA 3D9ZA 3RZ8A 3IBNA 1UGFA 3OYSA 1CAIA 1YDCA 4Q06A 5FL6A 4PQ7A 5BRWA 3KKXA 3L14A 4RFDA 4Q90A 5BRVA 4Q8YA 4CNXA 4YHAA 5DVXA 4HT0A 3N2PA 3S73B 5E2RA 5DSMA 3CA2A 4K0SA 3NI5A 1DMXA 4Q83A 3KS3A 3HKUA 3IBUA 1YDAA 1RAZA 2CBBA 3FFPX 4IDRX 3U7CA 1G48A 5JG5B 1YDDA 1OKNA 3M2YA 5FNIA 3RG3A 5AMDA 1J9WA 4K0ZA 1TH9A 3NJ9A 4QJXA 5FLPA 1G45A 5FNKA 3V3FA 5FLOA 4LHIA 2NWOA 3KOIA 3MWOA 1OKMA 1G3ZA 5E28A 4C3TA 4XFWA 1G1DA 5FL5A 4RUYA 3T85A 5L6KA 3M1KA 3N0NA 4E3DA 4YX4A 3DC9A 3R17B 1CNKA 1CAJA 5L3OA 4KNNA 3T84A 4Q0LA 2FOYA 3S76A 5CJFA 1CVDA 1Z93A 5EH7A 2WEJA 4CNVA 4WW6A 5FNLA 3P5LA 3OKVA 1G53A 3TVNX 4PXXA 5G0BA 4JS6A 4QK1A 4ZWXA 3IGPA 5FL4A 1BNWA 1BN4A 1EOUA 4KNMA 3RYXB 2NXSA 4KNIA 3TVOX 4WR7A 5FNGA 4Q81A 4Y0JA 4E3HA 1Y7WA 3TMJA 5DSLA 4QK3A 1RZCA 3K7KA 5JG3B 4Q8ZA 4UOVA 3DA2A 1RZEA 4FU5A 4XIXA 5SZ6A 1BCDA 1ZFKA 3PYKA 4DZ9A 3DD8A 1CVCA 3EFTA 12CAA 1G0FA 5IPZA 2NWYA 5A6HA 5SZ2A 3ML2A 4Z1KA 1CNBA 3T82A 1YO2A 3M1QA 4Z1JA 1BZMA 1I9PA 3RJ7A 4G0CA 3MNAA 3LXEA 1XQ0A 4CNRA 1CNIA 5EHEA 4CA2A 4M2WA 1FQLA 4PZHA 3DVDA 1AZMA 5JGTB 3V3GB 5G03A 1HUGA 5EKMA 1CINA 1LGDA 1CNYA 1CVHA 1CRAA 1HEAA 3DV7A 3MMFA 4GL1X 5DSOA 1ZFQA 2NNVA 2HD6A 1I9OA 2O4ZA 1CALA 4PYXA 2FNNA 1BNVA 3MYQA 1BNQA 1V9EA 4RUZA 3V7XA 2IT4A 2OSMA 3DCWA 5DSJA 4QJ0A 4CNWA 5HPJA 1CVEA 2WEHA 1DCAA 3M3XA 3B1BA 2NNOA 2NXRA 3FE4A 4DZ7A 3N4BA 4YGNA 1JD0A 4QJWA 1CNWA 3M1JA 3MDZA 4TWMA 3RG4A 4JSZA 3RYJB 4L5VA 1OKLA 1G6VA 5E5UA 5FLRA 3HKNA 5DSIA 3BL1A 2WEGA 5SZ5A 3RZ5A 3NB5A 4Z0QA 1BNNA 5FLQA 3ZNCA 3IEOA 5JESB 3OKUA 1G0EA 2NWPA 5G0CA 1CAZA 1IF5A 3Q31A 5JGSB 3ZP9A 2CBEA 3M2ZA 1FLJA 3P58A 1AM6A 1HVAA 2H15A 2NXTA 3V2JA 3M40A 4KP5A 3SBIA 1TEQX 2Q38A 4G7AA 1CAYA 4FIKA 4KP8A 4ZWIA 3KONA 1RAYA 5C8IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DMY A;  3F7U A;  2QP6 A;  1BV3 A;  2FMZ A;  1UGG A;  3RYY A;  4JSS A;  3HFP A;  1IF7 A;  3RZ7 A;  1JCZ A;  2GD8 A;  4E9O X;  3FW3 A;  3C7P A;  2W2J A;  2HOC A;  4Q8X A;  4YGJ A;  1UGC A;  4RIU A;  4YXI A;  4ZWZ A;  2POV A;  1H9Q A;  1F2W A;  1Z9Y A;  1CIL A;  1H4N A;  2WD2 A;  1TBT X;  3JXH C;  9CA2 A;  3W6I A;  3EFI A;  4N0X B;  4R59 A;  1RJ5 A;  2AW1 A;  2HFW A;  4KUY A;  4M2R A;  4QIZ A;  4IWZ A;  1BN1 A;  3DVB A;  3M5E A;  2FW4 A;  4QJO A;  1I9Q A;  4KV0 A;  1KOP A;  1HED A;  2QO8 A;  4QY3 A;  2FNM A;  1CAN A;  4YWP A;  3M1W A;  3RZ0 B;  3S9T A;  1CNC A;  3QYK A;  5FDI A;  2NWZ A;  5FNH A;  4Q07 A;  3OYQ A;  3D8W A;  4QJP A;  2POU A;  3OIM A;  4Q7V A;  4PYY A;  1HCA A;  4ZWY A;  2CBD A;  3V5G A;  2NNS A;  5E2N A;  5E2M A;  4QSB A;  3M5T A;  3V3J A;  1CCS A;  4WUP A;  4QK2 A;  5DOG A;  3K2F A;  3S71 B;  1I9L A;  3MHO A;  4BCW A;  3OIL A;  4Z1N A;  2EZ7 A;  4L5W A;  3KWA A;  3OIK A;  5AML A;  3N3J A;  4RN4 A;  4QSI A;  5JQ0 A;  4YGF A;  3RYZ A;  3SAX A;  7CA2 A;  4K13 A;  1BIC A;  5EZT X; 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