1TH9A

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFHVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1th9A00
1CCUA 1G0FA 1DCAA 3D0NA 1CNXA 3R16A 3V3JA 1HCAA 3MDZA 5FNIA 4L5VA 1KEQA 4YYTA 1Z93A 1UGEA 2FOVA 5EHEA 3CYUA 3HKNA 1RAYA 1RZCA 4Z1NA 3DBUA 5FLPA 3U47A 3UYNA 3M3XA 2CABA 1G53A 3P3HA 4N16A 4MTYA 3M2ZA 2VVAX 1RJ5A 4QTLA 3KKXA 4BCWA 2ZNCA 3SBIA 4E3FA 1LG6A 3ML2A 4TWMA 1XEGA 4MLTA 4WL4A 3S76A 4CNXA 5CACA 1BNVA 2QOAA 3D93A 3MNKA 4KNMA 3MZCA 4YWPA 4MDMA 1TG3A 4PYXA 5DSOA 4GL1X 1ZFKA 4YGJA 1OKLA 3T82A 4YGLA 1CANA 4WR7A 3HFPA 3SAXA 1ZE8A 4PZHA 1RZEA 2POUA 3DD0A 3P3JA 4K0SA 3EFTA 2OSMA 4K1QA 4Y0JA 4QJMA 4WUPA 5E2KA 1ZSCA 4QSIA 3V3IB 4Q8XA 3PYKA 5JQTA 4UOVA 4N0XB 4QJPA 3RZ8A 4RFDA 1YO1A 2X7UA 1Z97A 5E5RA 1CAIA 1LG5A 3HLJA 3KONA 1CAYA 5DSMA 3M5SA 1JCZA 3GZ0A 1FQNA 1FQMA 3DVDA 5EKJA 3BETA 3BL1A 4ETQC 1CA2A 5L3OA 5AMDA 1FR4A 3TVOX 1CNWA 1LZVA 4HEZA 4ITPA 4M2VA 1CVFA 4E3GA 1CVHA 4CNWA 4QJ0A 5CA2A 4RN4A 5DSQA 2EZ7A 1ZGFA 4Q9YA 5LMDA 1BZMA 4M2RA 4FU5A 2FOYA 1RJ6A 2POWA 4FPTA 4QEFA 2WD3A 5DSIA 4Q0LA 3T85A 2POVA 3MNIA 1G45A 3IBUA 2FMGA 3M14A 5JEPB 4YVYA 3DC9A 1BN3A 4KV0A 5DSRA 4BF1A 3OYSA 3VBDA 1IF6A 1EOUA 2Q1QA 3CAJA 2FOUA 3MMFA 1HCBA 1BICA 1KWQA 1MUAA 4QSJA 1RZAA 2HKKA 3RZ7A 5DSKA 1BN1A 4MDGA 3DVBA 4LP6A 5JGTB 1Z9YA 4DZ7A 5EZTX 5FL6A 1CRMA 1KOPA 4E5QA 3S9TA 2GD8A 4QK3A 4YGNA 3KOKA 1ZSAA 3MWOA 4E3DA 4Q08A 1AVNA 1CAHA 3MYQA 4C3TA 3M98A 3QYKA 3SBHA 3IGPA 2AX2A 1FQLA 4X5SA 3IAIA 1TEQX 2HL4A 3MNJA 4TWLA 1JV0A 2H15A 1CCSA 3CZVA 7CA2A 3C7PA 1BV3A 2NWPA 2FOSA 2WEOA 1UGDA 3HKTA 4JSSA 4R5AA 3MHMA 3P55A 5FNMA 1BN4A 1CVCA 5DRSA 3RG3A 3RJ7A 3M1WA 3T5UA 1THKA 2HOCA 3U7CA 3BL0A 1OQ5A 2NWZA 3D92A 3M04A 2OSFA 3W6IA 4YXOA 3S78B 1H9QA 3HS4A 1RZDA 2Q1BA 3RG4A 5BRWA 2NXRA 4HT0A 3OKUA 2WEGA 3P58A 3N3JA 3FFPX 1G0EA 3S73B 3MHOA 5EHVA 1BNWA 1J9WA 2NXTA 4HEWA 5JEHB 1FLJA 1CAOA 3JXGA 4QIYA 1CNYA 5A25A 1TG9A 3P5AA 5EH5A 1H4NA 4ZX0A 1G52A 2WEHA 1UGFA 5SZ6A 2HNCA 1JD0A 2WD2A 2EU3A 4R5BA 5JEGB 2X7SA 5EKHA 1RZBA 4WUQA 5JDVB 1CVDA 5E28A 4MLXA 5JG3B 5AMGA 3NJ9A 3T84A 3CA2A 3V3GB 5FLSA 1CNKA 4ZWZA 1AZMA 4M2UA 4RH2A 1CNCA 1HEAA 3M96A 5AMLA 1BNTA 5E2RA 4FIKA 1UGBA 2WEJA 5SZ5A 4Z1JA 4COQA 4MO8A 5HPJA 4KNNA 4PQ7A 5FL5A 2QP6A 5BRVA 3IBLA 1HVAA 1IF5A 3LXEA 4Q6DA 1HUHA 4RFCA 4QJWA 1YDAA 3OY0A 4Q87A 5FLOA 5EHWA 4ILXA 4G7AA 5CLUA 5EH8A 3EFIA 1MOOA 3DCWA 1ZH9A 5G01A 4YGKA 3V2MA 1T9NA 2CBAA 3HKQA 3DC3A 3PO6A 4QJXA 3V5GA 2EU2A 1G54A 2IT4A 3N2PA 5G03A 1CALA 1XPZA 3D8WA 1ZSBA 3DAZA 2NNOA 5FNGA 4YXIA 1CAKA 4Q06A 3IBIA 4PXXA 3F4XA 4E4AA 3RZ5A 3HKUA 3DV7A 3U45X 5FNKA 1CVBA 4JSWA 4KNJA 1TH9A 5BYIA 2FW4A 5BNLA 3RYXB 3T83A 3MNUA 1TEUX 3KS3A 1I9NA 3OILA 1OKMA 3RYZA 5SZ4A 3IEOA 5CJFA 5FLRA 3RGEA 1URTA 2HD6A 4L5WA 5DVXA 2FNMA 1CNHA 1BNUA 4ZX1A 5FNHA 1OKNA 1HEBA 3R17B 3OKVA 1UGGA 1I9LA 3KOIA 1HEDA 1I9PA 3OYQA 4KNIA 5SZ0A 2HFWA 1DMYA 3D9ZA 1YDBA 4HT2A 4ZWIA 5JESB 3RYYA 1BNNA 2CBBA 2NWOA 3MNHA 1G46A 1G4JA 2QO8A 4K0ZA 5IPZA 1TB0X 3RYVB 2NN1A 3S75B 4K13A 1RAZA 5SZ3A 3UYQA 4FL7A 3NI5A 2FOQA 1TE3X 3OIKA 4LHIA 3JXHC 1LUGA 4KAPA 4Q6EA 5FDCA 3M1QA 1ZFQA 3K7KA 4BF6A 4E9OX 1CINA 1IF7A 3JXFA 3ML5A 4ZWXA 1CILA 4Q8ZA 5FL4A 4E3HA 3RYJB 3V7XA 4Z1KA 2H4NA 1KWRA 3ZNCA 2ABEA 1I9QA 4QJOA 2CBDA 2NXSA 4KUWA 5JG5B 1CZMA 3DA2A 1G3ZA 3B1BA 4KUVA 4KUYA 4FVOA 5A6HA 5E2MA 2CBCA 3M5TA 3M40A 4JSAA 4Q90A 1AM6A 4QSBA 1CVEA 5SZ2A 3KNEA 1ZNCA 3K2FA 4M2WA 4WW8A 1HECA 3Q31A 3PJJA 5JQ0A 5SZ7A 3P5LA 2NNVA 5JGSB 9CA2A 1I9MA 2Q38A 4HBAA 2CBEA 3TMJA 3SAPA 3N0NA 4RUZA 2FNKA 5FLQA 5BRUA 1FSQA 6CA2A 5FDIA 3M2YA 2GEHA 1TTMA 3FW3A 5SZ1A 1G48A 1CNIA 1V9IC 3V3HB 1G6VA 4FVNA 4QSAA 1CNGA 4XFWA 4XIWA 5J8ZA 3DVCA 1XQ0A 4QK2A 4E49A 3TVNX 1TBTX 3P4VA 3MHCA 1BNQA 3RZ1B 4CQ0A 4XZ5A 4LU3A 1CCTA 2AW1A 3L14A 1I90A 5C8IA 3S74B 1FR7A 4XE1A 1Y7WA 1UGCA 8CA2A 1LGDA 4ZAOA 1BCDA 3U3AX 3IBNA 3S8XA 4RUYA 3DCCA 1CAMA 4DZ9A 1CAJA 3F8EA 5G0CA 3KLDB 1UGAA 1G4OA 4QY3A 3MNAA 3S97A 2NNSA 1CNJA 1BNMA 2O4ZA 3KIGA 3OIMA 4Q8YA 3M2XA 4R59A 2FNNA 3F7BA 1CAZA 4Q78A 2ILIA 5E2SA 4YX4A 3S71B 3V2JA 4CNRA 4KP5A 1YDCA 4Z0QA 1CRAA 1G1DA 1CA3A 4JSZA 5DOGA 4FRCA 4XIXA 3NB5A 12CAA 4HEYA 4Q7VA 4KP8A 1IF9A 3K34A 3DD8A 4K0TA 4Q07A 3W6HA 5DSLA 5EH7A 4HU1A 4Q7PA 5EKMA 4IDRX 2NWYA 1DCBA 3N4BA 5DOHA 3T5ZA 2CA2A 1HUGA 4Q83A 3M2NA 4JS6A 1YO2A 5FNLA 1V9EA 5DSJA 4CNVA 1F2WA 4Q99A 4L5UA 4Q7SA 5E2NA 4CA2A 5FNJA 4ZWYA 4Z1EA 1CIMA 2NN7A 2VVBX 3M67A 1FSNA 1DMXA 3F7UA 5EOIA 3P44A 4RIUA 1IF8A 3B4FA 3M5EA 2NMXA 4MDLA 4Q09A 1I9OA 2F14A 1CVAA 3RZ0B 1I8ZA 3KWAA 4WW6A 4IWZA 4QIZA 1FQRA 2NNGA 3S72B 3RLDA 1ZGEA 4QK1A 5DSNA 5FLTA 4Q7WA 4RUXA 1I91A 1KOQA 4ITOA 1H9NA 4YXUA 5EIJA 1XEVA 4CACA 4PYYA 3ZP9A 4HF3A 1FSRA 4YHAA 1YDDA 2X7TA 4Q49A 3S77B 3M1KA 3V3FA 3M1JA 5L6KA 3MHIA 3MHLA 4G0CA 3DCSA 1IF4A 1YO0A 4YGFA 5E5UA 5G0BA 1A42A 2FMZA 4RIVA 4Q81A 1CNBA 3FE4A 2W2JA 5DSPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CCU A;  1G0F A;  1DCA A;  3D0N A;  1CNX A;  3R16 A;  3V3J A;  1HCA A;  3MDZ A;  5FNI A;  4L5V A;  1KEQ A;  4YYT A;  1Z93 A;  1UGE A;  2FOV A;  5EHE A;  3CYU A;  3HKN A;  1RAY A;  1RZC A;  4Z1N A;  3DBU A;  5FLP A;  3U47 A;  3UYN A;  3M3X A;  2CAB A;  1G53 A;  3P3H A;  4N16 A;  4MTY A;  3M2Z A;  2VVA X;  1RJ5 A;  4QTL A;  3KKX A;  4BCW A;  2ZNC A;  3SBI A;  4E3F A;  1LG6 A;  3ML2 A;  4TWM A;  1XEG A;  4MLT A;  4WL4 A;  3S76 A;  4CNX A;  5CAC A;  1BNV A;  2QOA A;  3D93 A;  3MNK A;  4KNM A;  3MZC A;  4YWP A;  4MDM A;  1TG3 A;  4PYX A;  5DSO A;  4GL1 X;  1ZFK A;  4YGJ A;  1OKL A;  3T82 A;  4YGL A;  1CAN A;  4WR7 A;  3HFP A;  3SAX A;  1ZE8 A;  4PZH A;  1RZE A;  2POU A;  3DD0 A;  3P3J A;  4K0S A;  3EFT A;  2OSM A;  4K1Q A;  4Y0J A;  4QJM A;  4WUP A;  5E2K A;  1ZSC A;  4QSI A;  3V3I B;  4Q8X A;  3PYK A;  5JQT A;  4UOV A;  4N0X B;  4QJP A;  3RZ8 A;  4RFD A;  1YO1 A;  2X7U A;  1Z97 A;  5E5R A;  1CAI A;  1LG5 A;  3HLJ A;  3KON A;  1CAY A;  5DSM A;  3M5S A;  1JCZ A;  3GZ0 A;  1FQN A;  1FQM A;  3DVD A; 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