1TMLA

Crystal structure of the catalytic domain of a thermophilic endocellulase
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
286
structure length
286
Chain Sequence
NDSPFYVNPNMSSAEWVRNNPNDPRTPVIRDRIASVPQGTWFAHHNPGQITGQVDALMSAAQAAGKIPILVVYNAPGRDCGNHSSGGAPSHSAYRSWIDEFAAGLKNRPAYIIVEPDLISLMSSCMQHVQQEVLETMAYAGKALKAGSSQARIYFDAGHSAWHSPAQMASWLQQADISNSAHGIATNTSNYRWTADEVAYAKAVLSAIGNPSLRAVIDTSRNGNGPAGNEWCDPSGRAIGTPSTTNTGDPMIDAFLWIKLPGEADGCIAGAGQFVPQAAYEMAIAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Beta-amylase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-GLUCANASE
publication title Crystal structure of the catalytic domain of a thermophilic endocellulase.
pubmed doi rcsb
source organism Thermobifida fusca
total genus 102
structure length 286
sequence length 286
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1993-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1tmlA00
4AVOA 1CB2A 3A64A 1UOZA 1UP0A 1BVWA 2BOGX 3RU8X 3ABXA 4B4HA 3VOFA 2BODX 1UP3A 3VOHA 3VOIA 4AX7A 4AVNA 3A9BA 1OCNA 1HGYA 1GZ1A 1HGWA 4AX6A 1OCBA 1TMLA 3VOGA 1UP2A 1OC7A 3RPTA 4A05A 2BOFX 1OC6A 1QK0A 4AU0A 1QK2A 4B4FA 2BVWA 1OC5A 4I5UA 1QJWA 4I5RA 1OCJA 2BOEX 1DYSA 3VOJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UJPA 1EEPA 1VBHA 1GOIA 2J24A 2J75A 5LHFA 3VIOA 3B8SA 4NHVA 3T2OA 1LBFA 2RHGA 1VBGA 2BHUA 2B7QA 3NAVA 1JRBA 3ZFHA 2DSZA 3VM5A 1EDTA 3N11A 1R46A 3IUIA 1MUCA 4J1OA 4AXNA 3BDKA 1SR9A 1A5LC 3B9NA 1AH3A 1JPKA 3CH9A 2H3BA 2OTDA 1VCVA 3N15A 2ZVRA 4DIAA 4F0MA 1EQPA 2VCCA 2XSAA 3AYRA 3UF9A 1EJWC 2BGSA 5BNKA 1L6WA 1DE5A 1WXYA 1YNYA 1FFQA 1W37A 1D7FA 3EDDA 1EHNA 3F7JA 1TYGA 4EWJA 4XV0A 3ZT7A 4TR9A 1Q6FA 4LX4A 3GYCA 2OVLA 3IVUA 1NTHA 3IANA 2WO5A 1X6UA 1D7KA 2BP1A 3BJTA 1BSLA 1C9DA 4GX8A 1OZQA 1Q6QA 2DSVA 1JYNA 2Q3OA 3VE9A 4Z2LA 2Y5SA 4K8EA 2J8TA 1W3KA 3T08A 2R14A 4M3PA 5M2FX 1QTWA 3OVGA 3CAKA 3S9YA 2BASA 3DC0A 4ZBCA 4QDWA 3GHSA 3KHJA 2D2HA 3DECA 3UBPC 4ZO6A 3TSBA 5L9FA 2ATSA 2PGEA 1H7NA 4XD4A 4ZB5A 3SCOA 3N3TA 4NILA 1LL6A 2RGLA 4QHRA 1TZ7A 2ZZ4A 4FPSA 3S1GA 1A50A 2F8QA 4MMWA 2HS8A 1WO2A 1V7YA 1AD4A 2PDUA 3AU6A 1PVNA 1IEQA 5KZDA 3W2NA 3AXHA 1IXPA 1PKLA 2YLAA 4CQCA 1KBJA 3QMSA 4NAFA 4Q8VA 3L4TA 4GUHA 2WHJA 2NSOA 3ZYZA 2QUNA 1B3OA 4O15A 1UZDA 3BJFA 2BLEA 3FW6A 3LXBA 3L4XA 3W7IA 4E4UA 3BAIA 4J28A 2WXDM 1NF7A 4S3KA 4LAMA 1VJIA 4JN7A 3CT2A 5T9BG 2J66A 2WAGA 1JULA 8RUCA 3CPGA 1X7FA 2TRSA 2ZC1A 4ASTA 1QNPA 4B5UA 2XINA 1E51A 3KOZA 4V27A 3TXZA 4YTUA 5EMMA 1OQFA 2PU0A 1V0KA 1XLJA 4V15A 3TOYA 3VUPA 4U3AA 1K6WA 3TEVA 5DELA 4M51A 3W7DA 2YW3A 4ZO8A 2VNCA 3I68A 2FZBA 2REQA 3W84A 5J04A 3GUWA 3NO3A 4I8DA 1M9HA 2TPSA 4MYAA 1PCKA 5DQPA 4D71A 1I6NA 3THCA 1JUKA 1KBLA 3DG7A 1AW2A 3OYXA 3CM4A 3MHGA 1QCWA 2Y24A 1P6WA 3QMTA 2OG9A 2OYMA 5CJMA 1V51A 3M7WA 2W63A 3SGUA 3G0XA 3W6MA 4FALA 1UD4A 3OLGA 3DFYA 1P6CA 4MNLA 3QKEA 3VI2A 4CD6A 3A4JA 3H12A 3S5YA 5A95A 3AICA 1Z41A 3H2CA 3GNXA 3RMEA 3S47A 4ZOBA 1LOSA 1X97A 3KVMA 1YXDA 4GVIA 3R10A 3VGBA 3REQB 4YYCA 5AC6A 3GD6A 1RBOB 3GXPA 1MQPA 1KTBA 4NYUA 1DWAM 4M8UA 4CKQA 4I5UA 4GXWA 3UA4A 3PVFA 1CXEA 1EJSC 3BWWA 3BK0A 3EPOA 5D37A 1OCNA 3QY7A 3TU9A 5IOBA 4HOWA 2DP3A 1NP2A 2HROA 2X0YA 3VGGA 1E43A 1UA7A 3UY7A 1K7XA 3T81A 1JR1A 3SUSA 1VBRA 1WDPA 1KNWA 2CITA 3WQGA 4DUXA 3EWZA 2QIIA 3RILA 2X2GA 1LJYA 2CYGA 3GU9A 3KTSA 2CC0A 4Q22A 4JTEA 4Q8QA 3WH9A 4DLFA 3G1VA 2PGRA 3L9CA 2XDFA 4DJDD 5MF5A 3GNDA 3P5YA 1RCXB 3M0YA 4HPJA 2DW6A 2GDQA 4UTUA 5D32A 1KO0A 1FWJC 1V6WA 2XSBA 3LCWA 4O8RA 4B16A 1XLFA 3LSBA 3OVQA 4AFYA 2J77A 3NWRA 3W72A 1UUQA 2PBOA 3GE7A 1EUNA 2VVSA 3M0MA 4UTTA 1L9WA 4H01A 1WNOA 3QY6A 4PUWA 1DYSA 4FOKA 4DQWA 3EX6A 4O1CA 1XRVA 2FB3A 1IEVA 2Y7DA 1S5MA 3E3HA 3W7MA 1QNSA 3UWZA 4UOJA 4HN4A 3W4RA 3A4XA 3SFKA 4MG4A 1A5BA 3NZRA 4WR3A 1TTPA 1J0ZA 4WDWA 2ODOA 4Y9NA 2Z0IA 2V63A 3LDVA 4JIIX 4UBPC 3FJNA 3T6CA 3TIMA 1F3EA 2UWFA 1KRAC 1YPFA 2CHOA 2C1IA 4XZBA 1OC6A 2ISWA 4E38A 2VQTA 3NQDA 3ZMRA 3ABZA 3BSMA 3L21A 1JPIA 3GTNA 5HOSA 4KT2A 3IWPA 1PKMA 3B8VA 2GVJA 3UZ5A 2DVTA 4FLQA 5KZEA 4LF2A 3AYTA 4TQTA 2EG6A 4MZ1A 4M1RA 3M64A 4ICNA 4O13A 3HGOA 5C55A 1B54A 1TX2A 4A29A 2JF6A 3A4WA 2VQUA 2E09A 3NQMA 2PPGA 2CHRA 3FKKA 1FHVA 3MKVA 2FYMA 4NNAA 3R12A 3T42A 3V36A 1SW0A 1YLVA 4BY3A 3W7KA 4XB3A 1EB3A 3CPRA 4N6FA 2C3ZA 5I2UA 1VCFA 1XPYA 2Y70A 4TTUA 1KXHA 4MADA 4D8AA 1WOAA 3I6RA 3RLHA 1RALA 1HJSA 1KRBC 3FJ6A 3A3XA 1KM2A 3AU2A 1NDZA 7TIMA 2Z6JA 1KR1A 4HGXA 4M19A 4O16A 5AC7A 3P84A 3PUGA 3IGXA 2EHHA 2ZWZA 1O5RA 2I5QA 1LYXA 1UBSA 4FR6A 5AKQA 3W26A 2FZDA 4JEQA 4WSJA 5AHMA 4LF1A 3R89A 5HNRA 3FYPA 1TVNA 4H7CA 1NP0A 3GB6A 1NDWA 4UCGA 4Z1AA 1QWGA 1M5WA 3UFYA 4NZ1A 1W1TA 3A22A 2DZWA 1YDOA 1M53A 3E5BA 2ALDA 4OTKA 3KVJA 3GH5A 3RU6A 2Y6ZA 4GD0A 1Q6EA 1FXPA 3WMBA 2O7QA 2BVWA 2CXGA 2QAFA 3QHNA 3ZR6A 3A3HA 2PTYA 4TX6A 4W8AA 4ZR8A 1E9YB 2Y4SA 1JQXA 5IBXC 3E5PA 3UY8A 1JUEA 3B9DA 3IJDA 1S2AA 1JD7A 3AIWA 1X8FA 1P0EA 4FX7A 1A0CA 4KWOA 2ZDRA 2QEZA 4GQRA 4BZYA 2QCGA 1QOXA 1DJIA 3TW7A 3VKJA 4R34A 2G5WA 4L64A 5K3VA 3BGJA 3MUY1 5FJPA 4US5A 4ZVJA 4RNIA 5CZSA 5J8LA 1RBAA 4GQQA 2NQLA 3CQIA 1B3WA 3NGJA 4ONVA 1U2YA 4A8RA 2X05A 3GKFA 1OG6A 4DZAA 1VCGA 4H19A 4C5ZA 4QJ1A 1O6IA 4W88A 5FEWA 3QSTA 3IJ8A 3GY1A 4PBFA 1XFCA 3TZFA 4HIBA 2WB5A 1UWSA 3KCLA 2R1NA 2QJMA 2J9YA 4PTVA 1IT7A 1G01A 4LFYA 4O0KA 2BOGX 4Q8MA 1UD2A 2X1TA 3B8UA 4BR1A 5I3KA 2AKZA 3DFSA 1K8ZA 2BVTA 3F2BA 4NT0A 4Q4KA 2XZ9A 4NRSA 5F4XA 4OQVA 3SW6A 4ECLA 1PXGA 4UR8A 2CERA 1QI2A 4WSHA 1SM9A 3JUGA 5GNZA 4F0HA 2XUCA 3GW0A 3D0CA 1KFCA 4LOCA 2Y7GA 4GHRA 2AGTA 2WBKA 4NX0A 5CSYA 4BKNA 3RX2A 4JYDA 5GQBA 3WL0A 4I6KA 1E9ZB 5IBXA 1W91A 1UR0A 4HYWA 4H8NA 4LW7A 3VD4A 1TPB1 4FP1A 3M16A 3REQA 2INEA 1SJDA 1YKWA 1RAKA 1W1IE 1S2WA 1OSEA 4HZ8A 3WD3A 3A13A 1QPKA 3E12A 4JTFA 3W7LA 3R7MA 1OYAA 4BK9A 2P8BA 4R7WA 3N18A 1ZHAA 3CZGA 4DXVA 2V3FA 4B5XA 3N73A 2VC9A 4V1YA 5LGZA 4AZCA 1RHCA 4ZOCA 4HJFA 4RXFA 4ZQCA 1E6ZA 1JCYA 1ICQA 2V8ZA 5FKYA 1UD6A 2ASHA 1JDFA 3GXMA 1EOKA 2HSAA 3KLLA 1H63A 4ML4A 3NVDA 2HBVA 3THAA 4H7ZA 4O8AA 3CZLA 1R3SA 4DYKA 1LF1A 1TB3A 2V81A 4Z2JA 2A6LA 1JZ7A 4INFA 2NVAA 3NOEA 3BJSA 4HNLA 3R1ZA 1XICA 3S1UA 3TXVA 3OHMB 3U2ZA 3W83A 3T8QA 1AG1O 1HKVA 5FJUA 4Q4OA 2VEMA 1SJBA 2HNHA 2W91A 3MCNA 2WC3A 5D9PA 3H24A 1R86A 4GRSA 3VO0A 4MUPA 3PSVA 1YNPA 2NWRA 3VTRA 4JTJA 3RHGA 3MUXA 4QG9A 3SSZA 3CUGA 1XG3A 3IUDA 4ZXOA 3SEPA 3KS5A 1EBGA 2DZBA 4HZ7A 2QCCA 1F3TA 3MQTA 2QDGA 4C6KA 3WNLA 5HULA 4OE7A 2WPBA 3N6QA 3EMZA 3PUOA 2RDWA 4IPLA 2VFIA 2A7NA 3MJMA 1Q45A 4WY0B 1R3YA 2VX6A 2FJUB 1EEXA 1N55A 3CHDA 3EKGA 1UWUA 3UWUA 1U1HA 4J3WA 1XHGA 2Z25A 4PMZA 3RLGA 1HJQA 4HHPA 3E0WA 3TFXA 4QCEA 2PDBA 3RX4A 1HGWA 3PK7A 1OC7A 1I60A 3WJXA 2XIOA 1E1EA 3P8JA 4LVGA 1P1XA 3WK0A 1MDRA 1BQCA 4UFHA 4S3CA 3PNZA 1UQZA 4M0XA 5EL1A 4IIHA 3IK4A 2QNEA 1BQGA 5DO8A 3T78A 1THFD 4NYYA 3VC5A 3VD3A 3F2DA 3B8WA 1XQLA 3WQCA 3A24A 4IXXA 5TBOA 3TYBA 3BSGA 3UWQA 2R1LA 1MYRA 2EG7A 4L9ZA 5ABTA 1E5NA 5D02A 3TTSA 4X63A 2VELA 1FP9A 3HQPA 1RK5A 3V4BA 1V3LA 3TKFA 2QGYA 4DXKA 1X1OA 3IAPA 4K68A 4QQUA 1BF6A 1JPHA 3IGSA 1ALDA 3LSCA 1OFBA 5C70A 4HNOA 1HN1A 2H8ZA 3LEPA 1XYCA 1TPEA 4MAZA 1SJAA 3RCNA 3OB8A 3KCOA 1RLCL 3P2VA 1R87A 1R8LA 2CZDA 4NXKA 5AOUA 5TQLA 4ACZB 1MZHA 1LM1A 5KINA 1KFJA 2B7PA 1I2RA 1VFLA 4FF7A 5D9OA 5A8QA 4TMBA 4PSPA 1XISA 2G95A 2VM8A 5M3WA 3W37A 2R94A 3WBAA 5LIXX 4J40A 4EPEC 1FH9A 1VFMA 3UPMA 3DERA 1LT8A 2NUYA 2OLHA 4B5WA 4IX2A 2RDUA 4I5RA 4K6AA 1ISYA 5JU6A 4ZSTA 3O06A 3WQDA 3MCOA 2DJXA 1G1YA 3G1FA 2BVDA 3NL5A 4W93A 4GKTA 2QT3A 4PMRA 3B0VC 2QGHA 1EP1A 1VFHA 5C9UA 5IRPA 4HVXA 3ZIZA 2BV9A 4KGLA 5K2ZA 1EJVC 3WK3A 2OSYA 1Z32X 4IIBA 4C6DA 3QFWA 3BC9A 4HA0A 3H2AA 3CTLA 1XCFA 4DWSB 4HYRA 4PTNA 1R85A 1V3MA 2Q02A 4JFSA 2A3AA 4A3HA 3CS2A 1MW2A 4X0NA 3LPGA 4AZ6A 4RDYA 4MZ8A 3AYVA 3WDHA 3NG3A 3U57A 1XSIA 3UCDA 1L2UA 3ITGA 4PUNA 4F40A 4HBKA 2R1KA 2Y2WA 2KZHA 5A6AA 3O6AA 5KEZA 4FEZA 2FH6A 3H2OA 2PLCA 2QJGA 2VUNA 3N2XA 2IPGA 4FSAA 3EMCA 3QSRA 4JTRA 3AHZA 3MP5A 4ATLA 1I2OA 3PANA 1H50A 5ENLA 1C7TA 3K1GA 3IJ7A 1J6PA 1SZFA 3EOUA 1WAUA 1R3VA 1ZL1A 3NZPA 3M7SA 4ERGA 1U5JA 2FMNA 3GG7A 1VC4A 1W5MA 4L9XA 4W86A 3UPBA 5T91A 3LV5A 3GFZA 4FF5A 5HQEA 2TODA 4Z1YA 2Y62A 4KPLA 4H8UA 3MWCA 1P4CA 4GABA 3M6DA 3TTEA 1Z3NA 1DE6A 1HP5A 1HW6A 3N14A 2J7FA 4S3FA 3ITYA 4DUOA 1W3JA 1SFTA 3W01A 4AF0B 4FB7A 1ZPTA 4PMNA 5CPSA 3VOHA 3G24A 3VNJA 2ZZ2A 1AZ1A 1OFDA 3SRDA 3IJQA 5A8OA 3KW3A 5DLCA 1TQXA 1WXZA 1X6NA 4UQDA 1WA3A 3HQ1A 4Y9PA 4O52A 1PYFA 1DWFM 2D23A 3T0BA 1PEZA 3UW6A 5KTLA 2UY4A 2DT0A 3A21A 2C16A 1OZMA 4U5KA 3OODA 1F73A 2DQWA 3BLPX 2WMFA 2VMFA 4PR4A 3POCA 2Z7GA 1JG9A 2ZUNA 3DX5A 4GIRA 1VB9A 2Y7EA 4NG3A 5FF3A 2OMAA 3GDKA 1LG2A 1UR2A 5GVJA 5DN1A 1W1B1 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