1TPVA

S96p change is a second-site suppressor for h95n sluggish mutant triosephosphate isomerase
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
RKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGNPERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKTHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title The structural basis for pseudoreversion of the H95N lesion by the secondary S96P mutation in triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 92
structure length 245
sequence length 245
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tpvA00
1TTIA 3NO5A 2HTMA 2ISVA 2RDUA 4RZ6A 1WYIA 1LM1A 1M6JA 4AHPA 1DOSA 5EKYA 5HINA 3DH7A 3DFQA 3S5YA 5LNSA 1F73A 5I3FA 4NU7A 3G3MA 4MY8A 4DPQA 1VQTA 3O05A 1IIGA 2NX3A 4MZ1A 1FDZA 3BVJA 1VYPX 3F4WA 1P0KA 2C16A 4GWEA 4E2DA 4UCGA 3WJYA 3LHWA 2NXIA 1JRBA 5KZDA 1TV5A 3R2GA 2E6AA 2V9DA 4UFHA 3B0UX 3EKZA 1VRDA 1L6WA 1DORA 2CZDA 2FDSA 4BI7A 3MUXA 1RZMA 3LHVA 2W79A 5AC8A 3NQ2A 4QNEA 5DCEA 3KOFA 5D37A 2BZNA 3T7VA 4GUHA 2JBMA 3BARA 3OVPA 5U7SA 2RFGA 3S0CA 3HGSA 3S1XA 3SSJA 3LLFA 4OV4A 5KZMA 4GUJA 2YYTA 2H6RA 4YXGA 5BNKA 4RLIA 4LU0A 5TBOA 1GT8A 1FCUA 4WXYA 3T4CA 3GDRA 1ZAHA 2YFNA 4WJEA 4L4MA 4NZFA 1SUXA 5BW6A 4BI6A 1G4TA 3M6YA 4JTJA 1Q45A 3GDLA 1ALDA 4UTHA 3W7KA 3P74A 1PL9A 2G96A 4TR9A 3C3NA 1PE1A 1H7NA 3HBLA 4M5PA 4Y6GA 1FWSA 1H63A 4UMCA 4PEKA 5LGXA 1QOQA 3DXIA 3B0VC 3O8AA 4YLWA 4FX7A 5CPNA 3E9AA 2ZZ3A 4O10A 1HFBA 2A0NA 2EKCA 5A5WA 2QKFA 3W22A 1XC4A 4XQ6A 1MZHA 1AW5A 3SR7A 5D05A 2ZRUA 3W7EA 2X2GA 3WJZA 4HT3A 3C2FA 2TYSA 3A21A 2YX0A 3LTPA 2YR1A 1SO3A 4LC6A 5BRBA 2F7FA 4JTUA 4UMBA 2KZHA 4XWUA 1TV7A 3W2LA 1I2QA 4N6FA 5DXXA 2C15A 2A4AA 5K9DA 3EX1A 3W72A 1P0NA 3JRKA 3P7YA 4NVTA 3TJXA 3TXZA 1LZOA 5L6UA 4BF9A 1KFKA 3GK0A 3L68A 4HNTA 2QUTA 4MYXA 4DF2A 5KINA 1I4NA 3E02A 2FQIA 2E77A 4GE8A 3I7SA 3QMRA 1ZAIA 1XCFA 3NQCA 3P82A 1TTJA 4S2CA 2A1YA 3HPSA 4JTGA 1SZFA 1MSSA 2RDWA 1S5VA 3BO9A 1GTEA 4WOZA 2A7PA 5DELA 2C1HA 1SPQA 4PODA 5H2ZA 3DENA 3PB0A 2O7SA 2WO5A 3W7GA 4GRSA 1H7PA 1L2UA 2J24A 4YCPA 4O16A 3NM3A 4A2RA 3L9CA 3CT7A 4Z08A 1F76A 1GYLA 3IV3A 2CLIA 2ZBTA 1U5JA 5E0KA 1KLYA 4YL2A 2Y7GA 5HUOA 4JEQA 1QAPA 3P8IA 3RMJA 5CZ0A 1TPVA 3OVRA 3PSVA 5HR6A 3H55A 1PIIA 3LCGA 4DXVA 3IIZA 5E93A 2ZZ6A 3BW3A 3O6YX 1GJPA 1I8JA 1RVGA 1U83A 3H54A 1TREA 1VCVA 4XKYA 3OEXA 4C1LA 1KFBA 2V30A 3T78A 5K4XA 2CLOA 2QCDB 2YSWA 2B4GA 5EPDA 3P81A 2A7NA 2R14A 5CGQA 3IIXA 1SZNA 3C52A 3ABOA 4AMAA 3G8RA 1K8ZA 3G1AA 3SZ8A 2ATMA 4QQ3A 5FF2A 5CZSA 3PS7A 4R34A 3IIVA 1PCWA 5HWJA 3GB6A 3DAQA 4XTDA 4N02A 3MYPA 4PC8A 2Y61A 4I7WA 2VOMA 4LVAA 1JUKA 5AHFA 4DELA 1ICPA 5J5RA 4QITA 2WNZA 1KA9F 4IOTA 4JTTA 4AF0B 3RLUA 1KFCA 4FIQA 1ZJIA 4LRTA 1DL3A 2QCNA 4TMBA 3G1SA 1YTKA 1KM3A 1L6YA 2J27A 2DZXA 3N73A 1LROA 5CG7A 3ZS4A 3HIJA 2OCZA 4UXDA 3G0SA 5EMUA 3NL5A 2VFIA 3TU9A 2YZRA 2ZRZA 2QCCA 4JTKA 3O06A 5FF4A 3MP4A 1FQ0A 5G2WA 2X1RA 4JXCA 4A29A 2W6RA 3B0PA 4NZJA 5F4XA 3QM3A 8TIMA 2FTPA 4MPQA 3HF3A 3K30A 5MHBA 4ZQMA 4EOUA 3G1VA 1R2RA 4JYEA 1ONRA 4JDBA 3PF3A 1GVSA 3IGSA 1YDVA 3M5YA 1IIHA 2WJZA 5G4EA 2Q8LA 4MY9A 4LV4A 1TPWA 3C8FA 2CLHA 5K4ZA 1BTMA 3LGEA 5HQEA 3TFXA 2EHHA 1G6CA 5I3JA 4CLMA 4GUGA 4HSNA 1IF2A 4UTJA 5D09A 1LDCA 4PL2A 1ZHAA 5FF3A 1WA3A 3NL6A 1HO1A 4ADSA 4JX5A 5F4SA 4HIBA 4O53A 3UQNA 4CCEA 4KFOA 3PG8A 3GLCA 5D2VA 2NWSA 4BFAA 4UTKA 4JTSA 3A5VA 3G1DA 5J5DA 2X1SA 5HWMA 2PURA 1AL7A 4UTWC 3TCEA 3LV6A 2V2CA 1JJKA 2GQAA 3NPWA 3W1XA 3W1MA 2J88A 4QAIA 3S9YA 3DU0A 4HSOA 3GYEA 4M6VA 1TPFA 4M6PA 2VFGA 1XKYA 3PB2A 3I7RA 4RV8A 4RCXA 5LNRA 2GQ9A 3QJAA 1DQXA 1LYXA 3F1QA 3LXAA 3SJ3A 1FBAA 1WOBA 1VPXA 4ZQCA 2Z1BA 4ALDA 2OZ0A 4E0CA 2E5CA 3QFEA 1EX5A 5F2IA 4XUGA 3L2IA 3UYCA 5K7JA 4AHQA 1EEPA 4TO8A 2NV1A 3M1ZA 2J9XA 3TH6A 1H50A 3ZWSA 3G0XA 2CLKA 5C55A 1LCOA 2WOQA 3M5ZA 1RPXA 2RDTA 2VELA 2ZTJA 2QEZA 5E1QA 1MEIA 1X1OA 4AH7A 1TRIA 3KVMA 2A6LA 3NQAA 2CU0A 4UTIA 2OT0A 3EXRA 5LNVA 2P10A 4NJKA 2A2IA 4EF8A 4Z0JA 3LTSA 1XXXA 4FNQA 2CLEA 3Q94A 3UWZA 5CPOA 1H7XA 4JY8A 4FXSA 3STCA 1OHLA 1RQHA 5EYWA 1LBFA 1W5OA 1NVMA 3TC6A 1FX6A 4ZQPA 3HGRA 1CW2A 4UNKA 1D9EA 2PCQA 1LLZA 2D73A 1G4PA 2PRMA 3QZEA 3LBCA 1ZNNA 2WSQA 1XM3A 1TCDA 4O52A 1W5NA 3FJ6A 3GXTA 4YCOA 1PHQA 3C2VA 2V5BA 1KBIA 2AQWA 2DZTA 3RFAA 1IGSA 3G0UA 3IVTA 2Y85A 3TMLA 4M19A 4UC5A 1R46A 3R89A 1JCNA 3G22A 1UASA 2FJKA 3SFKA 3IVSA 1K3UA 1QPRA 3C2OA 4N2YA 1O5XA 5HR7A 1AG1O 3CEPA 3LI0A 3M7WA 4GBUA 3MW7A 1H51A 2F84A 2YXGA 4Z1BA 3W2MA 4O19A 2NX9A 1IXQA 4RJEA 3W7RA 3BGJA 3N14A 1OFEA 4O17A 1SO4A 1MXSA 2VEMA 1UJPA 4I7UA 3HG5A 1T8XA 5G1TA 4IMEA 4K7VA 3SI9A 3P5YA 4FB7A 5K9XA 4RXGA 1B4EA 1S3HA 5U4NA 2B7PA 3STFA 1R47A 1OFPA 2X1UA 3NZ1A 4O54A 2Y63A 4JR5A 1OFDA 1FWTA 2B7NA 5FF0A 1W3NA 1UCWA 3GVGA 1GEQA 1W3TA 4OT7A 2A7RA 5HJLA 5F2MA 1O60A 2XN0A 3HG4A 3SECA 3SW6A 1KV5A 3W85A 1WDWA 4XZ9A 1B9BA 2G97A 3E96A 5D02A 4NNAA 2YFOA 2B7OA 3NPXA 3FYPA 3W6YA 4UNLA 3W2JA 3LX9A 2DZVA 3LCFA 3L65A 1H7WA 1F7BA 2JK2A 2YW3A 3IRDA 4FIRA 3QQ0A 3LV5A 4IMDA 1YADA 2DZWA 3VE7A 3TUUA 1JUEA 3LI1A 4GNJA 4WD0A 3UZ5A 3TFCA 4HPJA 4UTUA 5LNWA 2VFEA 3QYQA 4PFMA 2C3ZA 3PUOA 4OU1A 4OWGA 3TW6A 3U6WA 5C54A 2WV8A 4NJGA 2QCHA 3DZ1A 1B57A 4O4WA 4XBKA 1TRDA 1I2RA 1M5WA 3QW4B 3HJZA 4FNSA 2CZ5A 1ME9A 3UD6A 1BWKA 2R94A 7TIMA 1VCGA 1JCYA 5LHEA 1KW1A 3JR2A 3NXFA 5CPMA 1GOXA 3W1LA 1RQBA 2CWNA 1LOQA 3MHGA 3W7MA 1SW3A 3M5VA 1FXQA 2TPSA 1SR9A 4JICA 4R7JA 3W07A 3LHUA 5DN1A 4FNUA 3BLIA 2ZYFA 1AK5A 3I7QA 2V81A 1ICQA 4IX0A 4DF0A 2Z2UA 1WBHA 4W9TA 4ORIA 2CZFA 2QUUA 4A22A 1TPUA 3VCRA 3NYZA 3EWUA 3W87A 3DI1A 4AWSA 1P5BA 4DBDA 1JVNA 4D2JA 5D33A 3W23A 2E6FA 3ATZA 1ME8A 4AAJA 4LVBA 1NEYA 1Z48A 2Z6IA 4EWND 4KWVA 2DZPA 4NUWA 3PBVA 2GVLA 1E51A 4TX9A 1QOPA 1IXPA 4ZZ9A 3O6DA 3W7OA 1QDSA 1JCJA 1PCKA 3CTLA 3W1AA 2WQPA 2QJIA 3M5XA 3CIWA 4NT0A 3L66A 5LNUA 1VCFA 3KX6A 2ISSA 4JGDA 2ZA3A 1K7XA 2CLMA 1PV8A 2NUXA 4JTEA 4DF1A 2QCFA 5DCBA 3ZR4A 3TQ0A 3G1HA 3C2RA 2RH9A 2EF9A 1W5MA 3P67A 3FKKA 3DFNA 4M6QA 3A24A 2Z6JA 3IGUA 1CX9A 3LCHA 4CCCA 3ATYA 4IJBA 5G1YA 2G5WA 1DV7A 4ZQRA 3CHVA 2R91A 4DPPA 4WY0F 4TU1A 3PBYA 1OG0A 1KM5A 3CQ0A 3PAJA 5FESA 3N3MA 4RKAA 4MZYA 1CI1A 5AHEA 2NXGA 3B06A 1ZY9A 4OV9A 1W5PA 2WNQA 4POCA 3KHJA 1MEWA 3N34A 3V1PA 1X1ZA 3LOTA 2OMAA 1OFRA 2EAWA 2Z0IA 4RZ5A 3PR2A 1VZWA 3TJLA 1F74A 1J4EA 3Q58A 1WAUA 4N9DA 1OX4B 1PVNA 4FNPA 5F4WA 5I3HA 3W7QA 5DLCA 1KTNA 1EP1A 1O95A 2H8XA 1VHCA 1J5TA 4K39A 2FB3A 5AN7A 4Y96A 1DKWA 1KM6A 5FEXA 1Q6OA 4UTWA 1VGAA 3U8GA 2DP3A 1A50A 3S1VA 4NXSA 4UFIA 5AHMA 2CLFA 2LLEA 4X22A 3KRSA 4WXZA 3KVLA 5G2HA 3FJLA 2O7QA 2C13A 2J9ZA 3LCWA 3UWVA 5LGZA 1FCQA 1A5CA 3UPWA 3MHFA 4AHOA 2IQTA 4O13A 3PY2A 3PBUA 3QMTA 1WQ5A 1GG0A 3WFAA 3N9SA 2E1DA 1O5KA 2Q8ZA 4DO4A 4A3UA 3HGJA 4XTIA 1TB3A 1SU5A 1EP2A 1L9WA 3PUEA 1H62A 2XFWA 3HPXA 2E09A 1YPFA 3BG5A 3QPYA 3PWAA 4RX0A 3PBWA 3KVKA 1I2OA 1GZGA 1C9DA 5F2LA 3P84A 3W2KA 3UZJA 2E5DA 3KRUA 4UR7A 5AHLA 3TSDA 1OK6A 1SZGA 3NQDA 3NZRA 5DCDA 2V2DA 1IXNA 3TNOA 1AMKA 3R13A 3W74A 4O12A 1J2WA 4BWLA 5D30A 2JKEA 3M41A 3L67A 1OFQA 1H60A 4CNOA 3LLDA 2YCEA 3ABQA 3HG2A 4UTMA 3R12A 4HHPA 5EY5A 1RR2A 2J9YA 5TQLA 2PC4A 1WXJA 3UXDA 3PULA 3DKJA 3LTYA 5KZEA 3L5MA 3QSTA 2H3BA 4HNUA 2NUYA 1K8YA 2DJXA 3GKAA 3SY5A 3EX2A 1ICSA 4LUIA 1OJXA 2A21A 2ZCGA 3W7PA 4MVAA 4N9CA 4FX6M 4GJ1A 1QCWA 4ML9A 1BEUA 4I9AA 4RK8A 1OYCA 3MYOA 4ZVJA 3W7LA 1H1YA 4JIPA 1G69A 5A8GA 1JCXA 1F6PA 3LCLA 3T40A 3VE9A 1EIXA 3RK8A 1C8VA 4JIQA 3DI0A 3RNDA 1GWJA 3NQ8A 5BOOA 2DZUA 1W5QA 1EWDA 1ZALA 3LHYA 1TTQA 3O15A 2VEIA 1X8FA 4MZ8A 4DQWA 4CQ9A 4M7TA 3W75A 4IMCA 3WK0A 2QCGA 2ZRVA 1W1ZA 4ZMGA 5I3GA 4FXRA 3KXQA 3S42A 2AAMA 4LS2A 2PRHA 2ZTKA 5L9FA 4OGZA 5KTLA 1GG1A 3GDTA 3RLVA 4I7VA 3HGOA 3CC1A 1WBJA 3ELFA 5DBUA 2I1OA 1LTDA 4N4PA 3NQGA 3W7IA 3NQFA 1O4UA 1W31A 3OG3A 3EWYA 3W1PA 2HSAA 3W7CA 3ZWTA 3GIYA 1P1XA 4UR8A 2V2HA 1TPEA 3W2UA 1C29A 3VI2A 1TQXA 2QCDA 4R53A 3UWUA 4A2SA 1JQVA 1XL9A 4BK9A 3FOKA 4HPXA 3FS2A 1EA0A 4K37A 3LRLA 3MI2A 5FI8A 1N8FA 1AL8A 2ZZ1A 3N9RA 3W1UA 2E6YA 5FEPA 1QR7A 1YDOA 2BXVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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