1TUX | Genus

Total Genus 116

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	116
sequence length	301
structure length	301
Chain Sequence	AAAQSVDQLIDARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVVSITDKNTLTNVMKNHITTIMTRYIGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFNNVIGEDYIPIAFRTARAADPNAKLYINDYNLDSASKPKTSAIVKRVKKWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGASIDAALPNLASAGTPEVAITELDIAGATSTDYVDVVNACLDVDSCIGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQLL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	XYLANASE
publication title	Crystal structure at 1.8 A resolution and proposed amino acid sequence of a thermostable xylanase from Thermoascus aurantiacus. pubmed doi rcsb
total genus	116
structure length	301
sequence length	301
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	1998-10-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1tuxA00

3NCOA 3F5LA 1R7AA 4YHGA 1W9BM 9CGTA 2ZUVA 2PWGA 2O92A 1V0KA 3L4UA 4DM2A 1CXEA 1EH9A 4WKFA 4JFSA 3GXMA 1E4IA 3WIJA 3AS3A 1E70M 1MVYA 3WF2A 2J62A 3SCTA 3L4VA 4XZWA 4M8UA 1ISYA 4R27A 1OT2A 3IAPA 3PZ9A 4AD2A 3WH7A 1G5AA 1W9DM 2VCCA 4D6HA 2X0YA 1RP8A 5CSUA 4BZYA 1EXPA 1CENA 2OWXA 3THDA 1DWJM 1CGYA 2VRJA 2VZVA 3VX0A 4ZFMA 3SCOA 1MW1A 2WZHA 4HTYA 4CCDA 1EOKA 2GJPA 2ZWYA 3L4TA 5A6KA 1C91A 1V3KA 3ARXA 2PBGA 2WLZA 4IISA 4KH2A 3KE0A 3TTQA 1QI5A 1MWOA 4HMEA 5IXEA 1TA3B 3VUPA 4GPNA 2VZOA 4KWUA 1PX3A 3VGFA 2UY3A 3ZJ8A 4TTGA 1GQJA 1XH0A 1MYRA 4TOQA 1D2KA 1KR1A 5M5DA 4ZXOA 3OG2A 3W29A 1E5NA 2IUZA 2CKRA 3E1F1 2VR4A 3AS1A 3DHUA 1KGWA 4MDOA 4M24A 5DEZA 4UZUA 4NRRA 3SCRA 3WFZA 4P8XA 3ZT7A 2VTFA 4JKMA 1KGXA 5HPCA 5I5RA 5I77A 3VD4A 4JL2A 3BXWA 1B30A 5KZ6A 1J0YA 2DT3A 2W67A 1CXHA 1XH2A 2WAGA 4H8VA 1ZBKA 3GDBA 1CNVA 4HPHA 3VMNA 4AZCA 4CVUA 1E3ZA 2WC4A 1OM0A 1M04A 4EAMA 2WWDA 1O6IA 4UOZA 3ZOAA 1ECEA 2WKLA 2VNCA 3POHA 4A3HA 3ARRA 3T0AA 4FLRA 7TAAA 4M80A 1V0LA 1CPUA 4J3VA 3RMEA 4AD0A 1LWJA 4FLOA 2VZSA 5E0CA 3U7VA 1H3GA 2E8YA 5A2AA 3OB8A 4OBSA 1ISXA 3VIGA 3FW6A 5FOOA 1HXJA 1LJYA 1ZS2A 8A3HA 2Y4SA 4JHOA 4QDMA 4HOXA 3BAIA 3CZ8A 1J18A 2WVVB 3WMBA 3OBAA 1I1WA 4JCLA 3EDEA 4W87A 4Z2IA 2J77A 3WNOA 3AISA 4HOWA 1ISWA 3VIOA 1TVNA 5BXRA 2EO7A 5DMYA 5E0FA 4NZCA 1QNQA 3TA9A 3CGTA 1G01A 5E6ZA 2QPUA 3MSGA 2W63A 1PJ9A 1U33A 2CERA 4H2CA 4UQCA 1ISZA 3WDJA 2W66A 4H04A 1W1VA 1H4PA 1WZMA 4ATWA 1GW1A 1MW2A 2WHJA 1K9FA 1GJWA 4J7RA 1JDDA 2CBJA 2GJXB 4PMOA 2FH6A 2Y2WA 4B15A 4XB3A 2NW0A 4DWSD 3LPOA 3WD3A 1MW0A 2DH3A 4UFJA 3AICA 1VBRA 5F7UA 1ZBVA 2CETA 2XFFA 2D24A 1OB0A 4ZXLA 1UG6A 3OGSA 3WL1A 1V6XA 3GXFA 4JFUA 2ZXDA 1RPKA 2PWDA 3MMUA 3GXIA 2FHBA 2MANA 5IHSA 5ABFB 1M01A 4FF5A 3VGBA 1QBBA 2VT0A 1HIZA 3NJ3A 4LPCA 1UA3A 2V5CA 4DM1A 4PTWA 4W5ZA 2PB1A 1A47A 2VC9A 5A2BA 3WKZA 1JNEA 4J3TA 1NWUA 2W91A 3T2OA 5A6JA 1J01A 2FGZA 4BQ2A 3FAXA 3IJ9A 4PUEA 1E73M 5A8NA 3VTRA 2IXUA 4S3KA 3AFBA 3WN6A 1E6RA 3GNOA 2YL5A 1WZLA 1GOKA 4H8UA 1GOQA 3GYCA 3AZTA 1OD8A 1RD6A 3AZRA 2BV9A 1KR0A 4JFTA 4J28A 3AMLA 3S2CA 3PZIA 3WMSA 1ZBCA 1BG9A 1KQYA 3CZEA 3FAWA 2ZXAA 1NARA 3FHQA 4HA1A 5M17A 2WVUA 2RGMA 2DSKA 2J74A 5CPQA 3PN8A 3TONA 1E6XM 4W5UA 2CKSA 4U3AA 3WF3A 3EMQA 3DYPA 4W84A 1HP4A 3GNPA 4F9JA 4CN4A 1V3JA 4A4AA 3KZSA 1KBKA 1V3MA 1CGVA 4MAVA 3WELA 3BAJA 1K9TA 2PWHA 1LLOA 1PEZA 3RDKA 1JZ2A 1FH9A 2GUYA 1Q6GA 2WVVA 1WNOA 2WWCA 3IJ8A 4URIA 3ZT5A 1BYDA 3VDBA 4Z2LA 4MB3A 3VIJA 5HOSA 1E0WA 2PBOA 4P7RA 1BLIA 1UH2A 1JL8A 1VEMA 3HJEA 2EEXA 4A3YA 1CECA 2X1IA 3SCVA 4AZGA 3N18A 4QLJA 4U3CA 5CGTA 3PTMA 2OSWA 3NUKA 1W9PA 1Q6DA 4D1JA 2QLYA 3KEHA 1UYQA 3VMOA 1CWYA 2VVSA 2GJXA 3VO0A 1IZKA 2J7BA 1LWHA 2XM2A 1JFXA 1JNDA 3RO8A 2WC7A 2WHLA 2HVMA 3WF1A 4LYQA 4P7LA 1L0PA 3VNYA 1UD2A 3BAXA 5A6BD 4MADA 3CMGA 2WMKA 1H5VA 1F4AA 2PF0A 3K8LA 2ZIDA 3CO4A 2Y8VA 1MQQA 1VENA 2YLLA 1C8QA 4AD1A 2J25A 4V2XA 4U31A 1GORA 1UOKA 1CDGA 3A4WA 4PMNA 3AYSA 2V3EA 4JAWA 4D72A 3ARTA 1XHGA 1HJWA 1XYFA 1GQLA 1GVIA 4W88A 3CPUA 1JFHA 5CJ5A 1UR2A 4UFLA 4AZ6A 4P8VA 3QGVA 2X0HA 5JBFA 1BYAA 1DEDA 2E40A 3WH6A 1EDTA 1UWTA 2ZX5A 3PZQA 2WHKA 1V0MA 3EYPA 4B3KA 2Z1KA 3MV11 5DF0A 1JYWA 1FP8A 2DPEA 1IZJA 1FOBA 4WSJA 4B16A 3VIFA 4MAZA 4AXNA 4H41A 4PMQA 1OGSA 3RJXA 3BLPX 3ZR5A 1C8YA 4ZE5A 3MANA 2X05A 3MV01 4MTVA 3AI0A 1W1TA 4PMZA 1HJSA 3BCDA 2XVPA 3WD0A 2GSJA 2NT0A 1XSJA 5BRPA 4MB1A 3L4WA 2ZICA 3W4RA 1R85A 4EKJA 1D3CA 3FNDA 4K68A 4ML4A 3QOMA 1GONA 3BLKA 4PMXA 4C7FA 4PTVA 5I0DA 3DECA 1QHZA 3AHYA 1VEOA 1JYVA 1X6NA 5A8MA 1HN1A 1R7OA 2X8RA 3KL0A 2BHUA 3TTOA 4X9YA 3B9AA 1V6YA 2WW5A 4B9ZA 2XWEA 4P8WA 1XSKA 3AHVA 1UD6A 1CGXA 1UD5A 3K4DA 4U5KA 2BFGA 2ZX7A 5FL1A 5A69A 1SYTA 4HP5A 4EE9A 2CNCA 1S46A 1GHRA 3T09A 5AYIA 3ZQ9A 3BAYA 1H41A 5D9NA 2W5FA 1E4LA 1HVQA 4AZ5A 1HKJA 1QNOA 2O9PA 2YA2A 1CTNA 2XWDA 4CCCA 3IJ7A 5CGMA 1M53A 1CLXA 1DHKA 4PCTA 5IHRA 5LYRA 3AROA 4OZOA 1NP0A 2E9MA 3DC0A 2OWCA 2JEQA 3WDPP 1WDRA 3VKKA 3K1DA 1CZ1A 2WB5A 4E4PA 4UQAA 3EBVA 7A3HA 4RE4A 2G3MA 3G6LA 3POCA 3WSUA 2XUCA 2XVGA 4WKAA 3RM9A 5CLTA 4JFVA 1HNYA 3SUUA 3JUGA 2W92A 4J3UA 5EMYA 3UESA 2ZX6A 3WH5A 3IK2A 5E09A 2WMGA 1J12A 1EO5A 3WF0A 1JZ4A 1CXIA 1B2YA 2ESCA 1E6QM 1BQCA 5BCAA 5HPOA 1OSEA 2DT1A 1E71M 4UQ9A 3VD5A 1B1YA 1MFUA 1W9VA 2FHFA 3CIVA 2VURA 4L4OA 3A4XA 2NT1A 3F4VA 2JFEX 3OZOA 2JIWA 1GQKA 3SUWA 2WSPA 3U5UA 3LPGA 2CITA 4V28A 1DTUA 4UFHA 1I1XA 5EFFA 4HZ8A 4DWSB 3N11A 1HKMA 4HZ6A 1J0JA 2BY1A 2VMFA 3WY1A 1VAHA 1V08A 3CUIA 1VF8A 2CHNA 1ODUA 3RIKA 1C93A 4QLLA 5BXPA 4PTXA 4XZBA 1C7SA 3GH7A 2WYSA 2WBGA 4CD6A 2VI0A 5I24A 4JZ5A 2DH2A 1RH9A 2J8GA 1UQYA 2G41A 1E43A 1GCYA 3BGAA 3B8SA 2DQXA 3AMKA 1BTCA 2VCAA 1Z32X 3N12A 1SR0A 1BYBA 4AZ7A 5D8ZA 1LQ0A 3O9NA 2F61A 1MFVA 1E55A 1US2A 1H0GA 2WKGA 3VNZA 4D1IA 1G0CA 4Z2HA 1KFWA 4LGXA 1CIUA 1UKTA 4F79A 1UR9A 3NSXA 2WCGA 5I23A 1SFSA 1WDPA 1QI3A 2J75A 4BQ4A 4CGTA 2V3GA 1UR1A 2BVTA 2C7FA 2O9OA 1E6NA 3M07A 1W32A 2OYMA 3VGEA 4ATLA 2QMKA 4UZSA 3AIEA 4AIUA 2J7CA 5A1AA 1NOUA 2EPKX 2VO5A 2ZWZA 3RILA 3TTYA 4ZE4A 3WD1A 1UR8A 4J3XA 5BRQA 1LL6A 2WXDM 4CU8A 3AQUA 2CESA 2PWEA 1I75A 2QPSA 5GPRA 5A6AA 1SMAA 3RPMA 2O9TA 3FY1A 1C8XA 1TE1A 5DFAA 1FP9A 1R86A 4UOJA 2V3DA 1DWAM 1OINA 3WH9A 2FGLA 4MB4A 1J0ZA 3ZJ6A 3OA5A 2UY4A 3WDQA 5C70A 3ALGA 5D8WA 5CLWA 1GNXA 3CLWA 1UD3A 3VX1A 1ZJAA 3AXXA 2G8ZA 1K9DA 3GBDA 4GXPA 1M03A 2FH8A 2ZXBA 3OLIA 5BROA 3WD4A 1TUXA 2BVDA 4CN6A 4UTFA 3J7HA 4WJXA 3WQ8A 5A6SA 3II1A 3BAWA 4GINA 4MPKA 5ABGA 4UFIA 3EMCA 2VQTA 2DT0A 4NRSA 4DWSA 4WK9A 2BY2A 2WPGA 2Z1SA 1C7TA 3AS0A 1IV8A 3WL0A 4E2OA 1XC6A 2GK1B 4Z2GA 3CUFA 1QHPA 4F8XA 1KXQA 3RJYA 2DT2A 3ZR6A 1PX8A 2DSWA 3GXDA 5CSYA 5FL0A 3SCPA 4J27A 1VFMA 2WMIB 3N17A 4MNJA 3AOFA 4UFMA 3TTSA 1CXKA 1BAGA 3MMWA 4DUWA 2J4GA 4AY1A 3VDAA 4GO9A 1UWUA 5BXTA 4KMQA 5A6MA 1WAWA 3LMYA 3WDHA 3M6DA 3WH8A 4PMRA 1E4MM 4TTUA 3VIKA 3CBWA 5FD0A 1DWFM 2A3EA 1UKSA 4UQBA 1PBGA 4R5EA 4P7NA 4HMDA 4EK7A 4P8UA 4JIEA 1TVPA 3OLGA 3AMCA 3PBGA 3WEZA 4HU8A 3W37A 3FN9A 1TA3A 4W8AA 5I6SA 3GZAA 2D23A 4M81A 1JG9A 4P7QA 6CGTA 3NSMA 4TVDA 2JIEA 1LG2A 1OGBA 3KL3A 3AJ7A 4PSPA 1LL4A 4J3SA 4PN2A 4AEFA 3ARZA 4QAWA 2CBUA 4MJ2A 4GKLA 2J79A 1J11A 3CMJA 1UWRA 5AY7A 2Q8XA 3I3EA 3VVGA 1KWGA 1UZ1A 2OYLA 5FKYA 1Q6EA 3VM5A 5A8PA 2O9RA 4NF7A 5IFTA 3PZVA 2Y24A 1GOWA 4WLCA 1JDAA 2JALA 2VR5A 4YPJA 3NDYA 3MMDA 4KGLA 2XFYA 2B31A 2E3ZA 2EPMX 2C0HA 2XSBA 3PZGA 1E5JA 4ACZB 1AVAA 5KEZA 2D22A 1W3HA 4B3LA 3LPPA 1J0IA 3L4YA 3VDCA 1E0VA 1VB9A 3T08A 1OCQA 3VD3A 2XVLA 1GUVA 4MDPA 1E3XA 3EDFA 5GQBA 3PZNA 1BYCA 2E4TA 4UFKA 3U7BA 1UWSA 2EPLX 3OGRA 1J10A 1PX4A 4BS0A 2V3FA 1FH7A 5A6BA 3AIVA 5D9PA 5CPSA 2BHYA 4XUYA 3WBAA 1JIBA 1UKOA 3SCSA 1H1NA 2CBVA 3ALFA 4LYRA 1D7FA 1JAKA 2WMIA 4WF7A 1DWHM 3N9KA 1CXFA 1JF5A 3W53A 1UHVA 1UWQA 1KXTA 2CEQA 8CGTA 3GH5A 3RM4A 4H7VA 3SUSA 4KRUA 1ZBWA 1BSIA 2A3BA 2J7EA 1JI2A 2YBUA 3WNMA 2AOSA 2YA1A 5CQ1A 1J0KA 2ZUMA 1LG1A 2GJRA 1FFQA 4QFUA 1W2PA 3VMPA 3F5KA 2EXOA 2WMFA 5TD4A 1M7XA 2DIJA 2VCBA 5AC5A 5A94A 3T2PA 5ABEA 4HA4A 5ABFA 2WVTA 2YDRA 3AIBA 1BG4A 2D20A 4QCEA 3WNKA 3KWXA 2WANA 1KXVA 1U30A 1KGUA 1MQPA 2JF7A 4TVCA 1HP5A 1Y7VA 2CPUA 3ZSTA 2QHAA 3L4ZA 3IANA 1F4HA 3CHEA 1KB3A 1LL7A 1V6UA 1WKYA 3MUZ1 1H49A 3AXHA 1CGTA 3BSGA 2XGIA 3QOKA 3ARQA 3T0BA 3AIRA 3CZGA 2YJQA 1E1FA 3ZJKA 3B9DA 4E8DA 1VJSA 1JXKA 4AEEA 2J7FA 1QI2A 1V3LA 1B0IA 1AQMA 1TZ7A 3CHDA 2VUYA 2ZX9A 1HL8A 2CHOA 2WK2A 1JZ7A 1XCXA 2YL6A 1VEPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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