1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
3M6GA 4BRHA 3LM9A 2VWBA 1NGFA 4H5NA 4L3QA 3QB0A 4WYBA 3HM8A 3VEVA 3O80A 1Z6RA 3FGUA 2ZWHA 1EQYA 4CBWA 4EHTA 2CH5A 3CJ9A 2YI1A 1LCUA 5AQOA 3U9DA 4CD1A 5BREA 1U6ZA 3CJAA 1GLLO 3IFRA 1Y64A 4CD3A 2CGKA 2YJEA 3U9ZA 4B1YB 4FPAA 5BN8A 1KXPA 1D4XA 1S22A 4BR2A 1DEJA 3O4WA 4BVPA 1HX1A 1HUXA 1GLEG 4IZ9A 1QHAA 4CZIA 4IWVA 5EY4A 5BRFA 4JN4A 5AQQA 4CZHA 1KAZA 4FL9A 3VF4A 4BRAA 2CGLA 3GG4A 3J8AA 4HTLA 2ZGYA 4Y0WA 4FWRA 1C0FA 1RGIA 1ESVA 4BC2A 4B1VA 3D2FB 4M63C 2YHYA 3WQUA 2HOEA 3FZMA 3BEXA 4XH1A 2EWSA 2Q2RA 5AR0A 4IJAA 1NMDA 4CBXA 4A61A 3WT0A 4FWLA 1YXQA 5BRHA 5EOYA 4FWPA 1R59O 1QQOA 2E1ZA 3FZKA 3O1BA 1TUYA 2P9LA 4PKGA 4YDUC 2DPNA 3UKRB 4H5TA 5B8HA 2BUPA 4BRIA 1QZ6A 4CBUA 3ZEUB 5JLFA 5AZJB 1S3XA 1CZAN 3WEEB 4B1UB 2QWPA 3ZEUA 5AQYA 5AZJA 3QFPA 1XUPO 1JCFA 3UB5A 3WUHA 1NM1A 2A40A 2E2QA 2YHWA 4CZFA 1SZ2A 3EN9A 5AQXA 3FE1A 3LDLA 3IDHA 3O1WA 4FOEA 2A42A 3UKUB 5AQPA 4BQZA 2P9SB 4WQ4C 4FWKA 3C7NB 1BG3A 3ULEB 1XQSC 3UKUA 4F9OA 1ZBSA 4GNIA 2P9PA 3VEWA 1RDWX 3O08A 3GL1A 1MWKA 3ULEA 5AQWA 1HKBA 4BRLA 3CI5A 4O8KA 5KPZA 3CERA 3HTVA 4JD2A 5JMVA 3WXLA 4I6MA 4EAHD 2D0OA 4J8FA 5AQKA 4JHDB 1WOQA 1NGBA 2FLOA 1TYQB 3ENOA 5ELZA 4MLEA 3TPQA 2NLXA 3EKSA 3M3ZA 4PL7A 4JHDA 5KPTA 2P9NB 3JS6A 3KVGA 1P8ZA 2ASOA 2OANA 4IXCA 3VEYA 3DXKB 2IVNA 4FWOA 4NO7A 4H0OA 1U2VB 2FF3B 3LDQA 4MLHA 3BUZB 4FWMA 5CE3A 3B8AX 5AQSA 4QS9A 1HLUA 4CZMA 1E4GT 1ATRA 1G99A 5FPNA 2F9WA 1GLJO 2A5XA 1T6CA 1HKGA 3I33A 4HWIA 2GWJA 2Q97A 3VENA 1DGKN 3RSEA 3QDKA 2E2OA 4BRCA 4H0YB 4BG8A 3WQTA 3TU5A 5AFUH 4CZJA 1IJJA 1OKJA 2FSNA 4BC4A 3MMVA 3GOIA 4BREA 3QICA 3VESA 5F0XA 1ATNA 4H0TB 3CIPA 4XEIA 2WUSA 3VEZA 1NWKA 3U8XA 3P4IA 3ENHA 3L0QA 1NGEA 3AARA 2PAVA 3FFKB 5BRDA 4IO8A 4Z94A 2Q0UA 3MN5A 4GY2B 4CJ7A 3SLCA 4M7XA 5LJVA 1NGIA 5EXWA 1BA0A 4BROA 5AQJA 2P9IA 3A5LC 3O8MA 4BRQA 4JAXA 2F9TA 2J4RA 3R9PA 2NRHA 4PL8A 5ADXA 4ISGA 4BG9A 1GLAG 4BVOA 1Q18A 3R6MA 3SMSA 4EIAA 4BR7A 3MN7A 5AQMA 5JLHA 3BP8A 4O5FA 2QWLA 3CQXA 3WXJA 1GLCG 3EKUA 2HF3A 2P9LB 5AQRA 3UE5A 2YCHA 2E2PA 4BRMA 3VGMA 1BUPA 4CI6A 3FR0A 1BO5O 3ATVA 2QWRA 2HMPA 1ATSA 1YUWA 4QS7A 4YDUA 4EFHA 5AQVA 3DWLA 1NGCA 1KAYA 1V4TA 2IIRA 2CGJA 3SJHA 4BRDA 3D2EB 2GELA 5E26A 1QQNA 5AZIB 5BPNA 4IJNA 3MK6A 3WXKA 5EX5A 2ZGZA 3D2EA 3VPZA 5AZIA 4RTFD 1H1VA 4C23A 2AA4A 2CH6A 2I7NA 1HKCA 3S41A 1X9JA 2P9PB 3KHYA 1MWMA 4WQ4A 4DCHA 5FPEA 4B1XB 1DKGD 4DB3A 4MO4A 2FXUA 2FSJA 4JD2B 3BF1A 3LDNA 2A3ZA 4I6MB 5AQTA 1KAXA 1T6DA 1RFQA 3WXIA 5AQFA 3O5BA 3A5MC 2ASPA 1IG8A 4PKHA 3CJ7A 3MN9A 3EO3A 4K43A 1J6ZA 5BPLA 1X3MA 4BR0A 4KBOA 3H1QA 4BGBA 4B1WB 3AY9A 3A0IX 3GE1A 1SAZA 2VCPA 2GTDA 4XH4A 1K8KA 3VF2A 3D7EO 3VF6A 4BRNA 3ZX3A 1BWFO 2W40A 2QWQA 4RCHA 2W41A 4BC5A 2P9UA 1WUAA 3RSEB 3H46O 5AQGA 3DXMA 1X3NA 3CQYA 3IMXA 1XC3A 3MCPA 4K42A 1HPMA 5I9EB 4WQ5A 1BU6O 4WQ5C 5AFUA 2QWOA 3VETA 2IVOA 1E4FT 1QZ5A 5JICA 1NBWA 5AQIA 2Q1NA 3DJCA 3H6EA 1V4SA 3QFUA 4A2BA 3W3DA 4E1JA 4QS8A 4H5VA 3AAQA 4BC3A 3SMPA 2HF4A 5BR9A 4A62A 3FZLA 3H3NO 2NZTA 4BR5A 2D4WA 3IUCA 5BN9A 3F9MA 2ZF5O 5LY3A 2YHXA 1BDGA 1Z05A 2GUPA 2Q0RA 4H03B 3W0LA 4CZEA 2ITMA 3HI0A 3LDPA 2P9IB 1JCEA 3H3OB 1MA9B 1NGHA 4DHYA 5KQ8A 1NGAA 4FWNA 5AQZA 5AQHA 5AQUA 2QWNA 2QW9A 4ISFA 4EHUA 3DAWA 4FSVA 3L4IA 3MDQA 3H45C 3O6WA 3ATUA 4JNEA 5F2RA 1ZXOA 5EVZA 3U4LA 4XH5A 5TKYA 4BRPA 1T44A 4BQLA 4ISEA 3A8YA 1ZC6A 3ID8A 3ZETB 3ZX2A 2GWKA 1GLFO 1BOTO 4FWSA 4FO0A 5FPMA 1NGJA 4PKIA 2E8AA 1HJOA 3ZETA 3LM2A 4M7YA 2QWMA 3VGKA 4H5WA 5AQNA 5ADXH 4LC9B 3VGLA 1NGGA 2QM1A 4H0VB 3HBTA 4AM6A 3D2FA 4H5RA 5LJWA 3VEOA 3HZ6A 3M1FA 1GLDG 5KQDA 3EZWA 3I8BA 3LL3A 1JCGA 4FOIA 2VYPA 2E20A 1SQKA 3GDQA 3A5OC 2E1YA 1MDUB 3GBTA 4CZKA 2FSKA 2A41A 2PBDA 2Q36A 3UKRA 1GLBG 2P9KB 5AQLA 3H1VX 1LOTB 1NGDA 3KZBA 4FPBA 3WEEA 4CZGA 4BR9A 2P9KA 2BTFA 2AP1A 4BRFA 2V51B 2GEMA 3VERA 2QXLA 4CZLA 3G25A 2IVPA 3AAPA 3CJCA 3L6QA 2I7PA 5F1XA 2A6AA 1QQMA 4NB4A 4BRKA 5FPDA 2ASMA 2D1KA 3FLCO 2H3GX 2E88A 1K8KB 3FZFA 2D0PA 2UYTA 4RWTA 1C0GA 3CJ1A 2P9SA 3MN6A 4DQ8A 3C7NA 1TUUA 3QBWA 2P9UB 2YJFA 3SK3A 3JXUA 4B1ZA 2V7YA 3DXMB 2V7ZA 4BGAA 3QBXA 3C0BA 4BR4A 3QMLA 2FF6A 1BA1A 4K41A 3BF3A 5BPMA 1TYQA 3CETA 2V52B 4H0XB 4A2AA 1NLVA 4MO5A 3R8EA 1YAGA 2E2NA 3ZX0A 4H0PA 2KHOA 5KPRA 2P9NA 4BRGA 3A5NC 3VOVA 4B9QA 2Q31A 3EL2A 3DXKA 5E84A 4K25A 3LDOA 3CHWA 3FZHA 1U2VA 3HSCA 1YVNA 3OHRA 3CJBA 4FWQA 4AM7A 3VEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LF6K 1SS6A 3KK7A 5AJ3K 3O80A 3FGUA 2ZWHA 4AHSA 4M41A 2CH5A 2YI1A 4RW7A 1S6QA 3RMCA 4FK0A 2XY6A 5BREA 1U6ZA 4KHWA 1GLLO 3AGRA 1YTAA 3K57A 2O8CA 3OYIA 4OKEA 1ZBFA 1XMQK 5IWAK 2QKKA 4B9MA 2CGKA 2X74A 1YITN 4CJLA 1B9FA 4M45A 1S22A 4XIUA 2A1RA 4E1NA 4BR2A 1DEJA 2KFZA 2OPSA 4JKBA 5BRFA 1TK0A 4LH4A 3GG4A 5IT9O 2OZMA 4OO1J 4F8RA 2NNWA 1FW6A 1C0FA 3AO3A 5K14A 2YNGA 4BC2A 3SNNA 1U48A 2X6NA 4AHVA 2UUAK 2YHYA 1LW2A 1SKWA 5GAEP 3BEXA 2EWSA 4DTJA 2RF2A 1NMDA 3AA3A 4IEIA 3CYMA 5EOYA 5KTQA 3OTOK 3OVNA 3UKRB 1B9DA 4H5TA 1QZ6A 3MXIA 4WCEL 4DR5K 5CZ1A 2O8BA 2QWPA 3U3YA 3S3MA 3OYDA 3KD1E 1KVAA 1XUPO 2OA8A 2E2QA 3J80O 4WFBL 2KZMA 1SZ2A 5AQXA 3O4QA 2A42A 5C2FA 3AA2A 3HT3A 4YOXA 3E01A 4E7KA 3G10A 2DFFA 4F9OA 4GNIA 3T1YK 1TAQA 4I2QA 4H8KA 5SWMA 4DU3A 5AQWA 1HKBA 3OBYA 4BRLA 3G6EN 2KW4A 4JKDA 3K58A 4JI3K 1RBUA 2FLOA 3LWLA 4E19A 2HBKA 2NLXA 2VG7A 4N47A 5KGWA 5KPTA 4DR6K 3KVGA 2ASOA 1BI4A 4IXCA 2IVNA 3M5RA 5J2PA 4CIGA 1U2VB 2GV9A 3THVA 4EP4A 1KVBA 1S6PA 3BUZB 4MLHA 3B8AX 1HLUA 1UOCA 2BH1A 4CZMA 1RTIA 3MEEA 1RDBA 3DM2A 4FZYA 2A5XA 3CXCM 3OYBA 3F2KA 3JSMA 3VENA 3CPEA 3AVMA 1X9WA 3WQTA 1IJJA 2FSNA 4BC4A 3TTCA 4BREA 3QICA 4Z4GA 3QEIA 2P51A 4KH5A 3I56N 3P38A 4CF8A 4H0TB 3HOSA 1J54A 3L4QA 1IO2A 1JXBA 1NG9A 4XEIA 3VEZA 3HK2A 3D0PA 4B08A 3SQ0A 3V1RA 1VQMN 4DR3K 3L0QA 3L8BA 3AARA 1ZYQA 5DM6L 5BRDA 4IO8A 2HW3A 1ASUA 4Z94A 4FJ9A 4ID5A 3SLCA 4M7XA 3HPOA 4MDBA 3DYAA 5BR8K 4FXDA 4I9LA 4JLHA 4BRQA 2J4RA 1NKBA 1SV5A 1C0UA 1DLOA 5ADXA 4ICLA 1GLAG 4BG9A 1Q18A 4NYNA 2ATQA 4BR7A 4O5FA 1F21A 1HNVA 3OA9A 3CQXA 2RPIA 1YT3A 3EKUA 2G8UA 1YJWN 5KRTA 4BRMA 3SJJA 3CFRA 3SZ2A 2HMPA 3TTDA 2P5OA 3CCQN 4C8OA 4Z4EA 1RTHA 3DLBA 2GELA 5AZIB 2IAJA 4Z0UA 3RMDA 5C25A 1RDUA 2XRIA 2ZGZA 4CIEA 3SQ2A 4LD0A 5AZIA 4RTFD 4CF2A 4C23A 2AA4A 2CH6A 3VQBA 2Z1JA 4PY5A 3S41A 1X9JA 3CCMN 4RW8A 4B1XB 4JYAK 3VN5A 4JRPA 4OX9K 1QSYA 1LWCA 5AQFA 1RDAA 3CMEN 1HPZA 1ITGA 4CGGA 4PKHA 4F3TA 4CHPA 3EO3A 4K43A 2VGMA 3TAMA 1MU2A 4CK2A 4BR0A 4KBOA 3H1QA 1TK8A 3C65A 4B1WB 4O5BA 1JLCA 4JKEA 3SPYA 4XH4A 3T69A 3A2FA 1K8KA 4JV5K 5MLCQ 4BRNA 2QWQA 2W41A 4O44A 3O3FA 3CG7A 4DV4K 3IAYA 2JGUA 3H46O 2NRTA 3MCPA 1X3NA 3CQYA 4CHOA 3OY9A 1NJIO 2KFNA 3O9UA 3K5LA 4WQ5C 1LAWA 3VQ7A 1N8RO 3QEWA 4OPKA 3VETA 3SBTA 4C8KA 4B3TK 1NBWA 4DR1K 3DJCA 4NLCA 3CC4N 1TVRA 1W9HA 1BIZA 3QFUA 3CMAN 1NK4A 2DTUA 2XY8A 4H5VA 3S3NA 3SMPA 4AF1A 4M3ZA 3KKRA 3H3NO 2NZTA 2D4WA 3S3OA 1Z05A 2GUPA 4H03B 4IG3A 3ENBA 3HI0A 3M8PA 3LDPA 4CK1A 1Q81O 1MA9B 3P31A 3KWIA 4FZZA 1WB9A 1NGAA 3PLAA 4KH4A 1TAUA 4KO0A 4EHUA 2G8IA 4AHUA 4QAGA 3JAMO 4DFKA 3O6WA 1VSFA 3H45C 3KIOA 2F8SA 1WSEA 3U4LA 4GVEA 2P5GA 4BRPA 2LSNA 3VQ5A 3ID8A 4CEAA 1IBLK 4DU4A 4FWSA 1YF5L 3NHGA 1NGJA 4DWIA 3HSTB 3LM2A 2QWMA 1YI2N 4JK9A 4LC9B 4YNQA 4N5SA 1RBSA 4CEOA 3HBTA 5H1SQ 4O0IA 4KHYA 2HHUA 5FRNA 4H5RA 2HVHA 1DT9A 3E9LA 3VEOA 3I8BA 2ZJRL 3SV3A 1YHQN 3OYAA 1ASVA 3ZT3A 2YX6A 3A5OC 4DSKA 1VSIA 2E1YA 4CZKA 2GUIA 4ZTJA 3TAFA 4FLVA 2P9KB 4JK8A 4OKKA 3MECA 3ZT0A 4A5AA 2P9KA 4DTMA 3AVKA 2AP1A 3OS2A 4JKGA 3VERA 3L6QA 4JI1K 5F1XA 4ILJA 1W7AA 3FLCO 2E88A 4CJ3A 3O3GA 2D0PA 2B5JA 2P9SA 3THXA 3MN6A 4E1MA 4F4KA 3C7NA 4DTOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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