1TV5A

Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase with a bound inhibitor
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
409
structure length
371
Chain Sequence
FESYNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase homolog, mitochondrial
publication title Structure of Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase with a bound inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 149
structure length 371
sequence length 409
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2004-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tv5A00
2R8WA 5CZ0A 3QPYA 4E0CA 4BI6A 5HMSA 3KRUA 3CQ0A 3P62A 3QSRA 1JUKA 1QPNA 1WV2A 3PBVA 4HPJA 3DXIA 1T8XA 2PE4A 3G1SA 3P82A 2XN0A 1Z44A 2F7FA 4GRSA 1SSGA 3TROA 3KVMA 2A7PA 5LGZA 1IF2A 4ONVA 1D3HA 5DXYA 3MBDA 1TTQA 4Y90A 5CZTA 3GLCA 3LRKA 2V2DA 2ZZ1A 1C9DA 5IBXC 4G1KA 4JYEA 3DI0A 3L21A 2B4GA 1GVFA 4HKPA 2R94A 5C54A 4LOCA 4A2SA 3DFSA 1G69A 3W22A 2YSWA 3TXZA 1PCWA 1QAPA 1VH7A 4WXYA 1S5VA 4BK9A 1LRQA 2E6DA 3TE9A 2RHGA 5HWNA 3NAVA 2Y62A 3CIXA 4FF7A 4M5PA 3VKJA 6ALDA 3G1YA 3VCRA 4UTMA 3C6CA 2B7PA 4NXKA 3N34A 3M16A 1XI3A 4PA8A 3VE7A 4UTKA 1KM0A 4JIQA 2DZPA 1LBLA 3O6DA 4LRTA 1N8FA 4DQWA 1F05A 4PL1A 3INPA 1O4UA 4QITA 2CLEA 4S1FA 4FNPA 3S1XA 3E12A 3EWUA 4RCXA 2VFFA 2ZQ0A 4ZQOA 1H5YA 4LVDA 4NX5A 4WOZA 3W23A 1L2UA 4UFHA 3FIGA 2C19A 3PF3A 2JK2A 4N4PA 1ZAHA 3CB8A 3LOTA 4CCEA 5D38A 1QR7A 4JR5A 2QJIA 5DBUA 1W5QA 2I9EA 1AW5A 2YPIA 4HIBA 2B7NA 5D2TA 1OYBA 3GXNA 4JTKA 3O8AA 2ISVA 4IPIA 5C2XA 4Z0SA 1H1YA 2NWRA 1EP3A 2WKJA 3LB0A 4K38A 1P4CA 3D0CA 2NXGA 2QAFA 1I2RA 3CLMA 1YTEA 3IVUA 4LY8A 3C61A 3ZWTA 1ME7A 1TJPA 3EEGA 3BGGA 3HPSA 4PCFA 1QDSA 1NVMA 1Z48A 1KM1A 3TFCA 1HO4A 3QQ1A 3SR7A 1G7VA 4M7TA 1IXNA 1F6KA 1KM3A 5E1QA 4NZJA 3LX9A 4DF1A 4Y8FA 3W7GA 1QCWA 3E96A 2YCEA 4NJJA 1J2WA 4RR4A 3WJXA 1YPIA 1DHPA 1YYAA 3DFTA 1XFBA 2HSAA 4EF8A 4EF9A 1OK6A 2VFGA 1G6CA 2ZRYA 3P81A 2OT1A 2QCLA 1OK4A 3HJZA 3QF0A 3RLUA 1A5SA 3CTLA 3TW6A 3NQDA 4NU7A 3W1PA 5I3HA 3F1QA 3W83A 4LV4A 3G1VA 5H91A 5I3FA 3R2GA 2YFNA 3S6DA 1GWJA 5AB3A 5F4WA 2Z1BA 1OX5A 4O8RA 3W2LA 1QPOA 2F84A 2CZ5A 3P5ZA 2VEIA 4IMCA 4GXMA 4KFPA 3OVPA 3C56A 1H51A 1I2NA 1QO5A 1FCQA 5F2GA 5KSWA 3BV4A 4J9JA 1O95A 3NO5A 3P8IA 1VPXA 3LBMA 1DBTA 2WO5A 1R30A 3LXBA 3HBLA 3GAYA 4QNEA 2E68A 3HO8A 4AF0A 1YDOA 3LLDA 1JR1A 2ZA1A 3STCA 5HNRA 1QPRA 2C18A 2XN2A 3SJ3A 4A2RA 1DJNA 3CPRA 3YPIA 1LOQA 1QMLA 2Y89A 1KFEA 2Y85A 3MUXA 3P67A 2H8ZA 5K2ZA 1TPWA 4K8EA 1SFJA 4MY1A 5GVJA 3DAQA 4UMBA 1JJKA 5DY2A 3DI1A 5BMWA 4P2VA 4LC8A 2EPHA 2VEPA 5AHIA 1VGAA 5TBOA 2AGKA 1NSJA 3P84A 3GXPA 5CKSA 1G4EA 3PB2A 4D2JA 4ORIA 1PE1A 3TAKA 4DELA 3TC7A 1VS1A 1MO0A 3THAA 1R46A 3TFXA 5BRBA 3FJLA 1XKYA 4WY0F 3CIWA 1L6YA 2CZEA 1A50A 3B04A 1D3GA 4JTGA 1TYGA 5LKYA 1FXPA 4O4WA 4X9SA 2GVLA 1KTCA 3L5MA 3LCFA 3W87A 3GX9A 4NJHA 1EB3A 1B4EA 3LDVA 3E0IA 1YTDA 1H60A 2NWSA 3KRZA 3UWQA 3V1PA 1TMHA 3N2XA 1VCGA 3VI2A 5AYYA 1L6WA 2A7NA 4ZQPA 4IJBA 3KVKA 3CWOX 3O15A 3MI6A 3FFSA 3FS2A 4AAJA 3WK1A 3A5FA 3W75A 3MYPA 2X1RA 1T96A 3C52A 3VNDA 4DEFA 5IM51 2FPYA 1N7KA 3PG9A 1TJRA 2QR6A 4TU1A 2X1SA 3MW7A 1H61A 4O17A 5AC6A 1O5XA 1H7XA 3STEA 1O5KA 3GDLA 2PURA 3JRKA 3GIYA 3BLIA 4ZZ9A 3OVRA 4N9EA 2Y6ZA 5FF3A 1BWKA 2NX9A 1EIXA 1ZNNA 5HULA 3W7IA 4O15A 3G1DA 1YDNA 3MO7A 4B5NA 3NNTA 4JGDA 3SGUA 1FX6A 4O52A 1OYAA 2ZTKA 3O06A 4ZQMA 2ZTJA 3W76A 1UUOA 2A5HA 3W7OA 2KZHA 2JKAA 1W3IA 1EX5A 1LLWA 4IX0A 3NQ6A 3GDRA 3E49A 5D30A 1ICSA 3KOFA 2NUWA 4DO6A 2C1HA 4LW7A 4JN6A 1OF8A 1RR2A 4R34A 3UPWA 3E02A 2CU0A 3GZ3A 5CGQA 1WQ5A 4M6QA 4O54A 3L5LA 3W2NA 3N3MA 3UWVA 5F4SA 1QFEA 1WBHA 1TRDA 3KFTA 4IUOA 3MI2A 5F1VA 3TMLA 2QCGA 2QCHA 3DH7A 3B06A 4XTDA 1VLIA 4JY8A 1F5ZA 5CZJA 3W1QA 4MPQA 2Z2UA 5KZEA 4HHPA 1LOSA 3ATYA 3WK0A 1W5OA 3ABRA 5L6UA 4AHQA 4Y6GA 4XKYB 4IOTA 1TB3A 5D03A 1OFAA 4DO5A 3WK2A 2CW6A 3SSJA 5AHNA 2E77A 1EUAA 3FKRA 4JTHA 4E2BA 2VEMA 5AC7A 4DF0A 5HR7A 4L4MA 4UNKA 4PH6A 3EX6A 2HMCA 3AJXA 1GVSA 1FDJA 1KW1A 3A23A 2VOMA 3FLUA 1VYRA 3W7HA 3FJ6A 1TPVA 1WXJA 3IGUA 5F1UA 5CPLA 4NT0A 2J9YA 3MYOA 4GE8A 2V2HA 3KVLA 3CM4A 1H63A 5LNSA 1P1XA 1VR6A 1OX4A 2DZSA 1DJQA 1SZFA 1TQXA 3NQAA 1HG3A 3W2UA 2Y70A 2HS8A 4GNJA 3LI0A 3OA3A 4WY0B 3UWUA 3WK3A 4UCGA 1G4SA 3L66A 3T78A 1FWSA 3WJSA 4RK8A 1ALDA 2Z6IA 2WQPA 4HSOA 3ABSA 5CPOA 1PCKA 5E0KA 1FDYA 1JQXA 3HIJA 3EKZA 1HUVA 3TH6A 1BWLA 4NNCA 2ABBA 4OBTA 4E2DA 4E38A 3PWAA 3IRDA 2YR1A 3LRMA 4PL2A 1TIMA 3T4CA 4O50A 1OJXA 2Y63A 3I6RA 2RH9A 1KFBA 3M9YA 3I7RA 1LBFA 3NQ2A 2IQTA 4JTEA 3TKFA 1LLZA 1ZENA 1TPB1 4JTLA 3EXRA 4QQ3A 4Z1BA 4MYAA 4M6PA 3IIPA 3L68A 3QZEA 1XDLA 3L0KA 5I3IA 4JYDA 1LYXA 1G4PA 2XFWA 3I7QA 1VHNA 3WJWA 3R5EA 4ICNA 4KKXA 4JTIA 3TW7A 1LRTA 4DO4A 4ORMA 2ZDRA 4FXSA 3BW2A 5LSMA 2VFIA 4NZFA 3RFAA 4DF2A 1GYNA 3BG5A 2FPVA 1Y0EA 3GVGA 4K39A 4CLMA 2V8ZA 3S42A 4LUIA 1H7RA 3PB0A 1KM6A 2TRSA 4HNUA 3TUUA 3RLVA 3G1HA 1SO5A 5FF4A 2ISWA 3DKLA 4XBKA 4XUGA 5DBTA 3DZ1A 1M5WA 4M6VA 1YDVA 4GUFA 2B7QA 3SIZA 4O16A 4DPPA 1PS9A 3NGJA 1FXQA 3MP5A 3STFA 4A3UA 3EX3A 2X2GA 6TIMA 3G24A 4FNTA 1VHCA 4UTHA 2A85A 4MVAA 4UTUA 1JCYA 4CNOA 2EF9A 2TMDA 2VFEA 1KTNA 3A9IA 3O1NA 3USBA 3W86A 3LCHA 4FX6M 4GUGA 3LHUA 3O05A 1AK5A 3QFEA 2V81A 3P60A 3GR8A 2VC6A 1KBJA 3QW3A 4EWND 3BW4A 5CSSA 2JKPA 5CSRA 1X1ZA 5K9DA 4Q4KA 1H7OA 3VFLA 4UR7A 1MXSA 4IWWA 4AMAA 3LHWA 2VFDA 1XCFA 3M1ZA 4JY9A 1GVRA 4PODA 3PUOA 1O94A 4UR8A 4HN4A 3ZS4A 1RQEA 3P80A 4CNNA 3QJAA 4JXCA 3NQ7A 4QNWA 2HTMA 2ATSA 3JS3A 1FBAA 4IGHA 4MY9A 5A5WA 5AOUA 3N73A 3NL2A 1CX9A 4Z1DA 4LT9A 4GWEA 4JYFA 3QEZA 2E6FA 2JGQA 1XXXA 5FI8A 1Q6OA 1SO3A 2ZFAA 3U6WA 1OABA 3HB9A 3SECA 3UXAA 4DPQA 1JCMP 3C2OA 1SZGA 3LM7A 2GJNA 2DJLA 1AL7A 2YGYA 4JX4A 3NDOA 2DZTA 1Q45A 4LU0A 3UWZA 2Y61A 4Z1AA 5LHFA 1ZJIA 1K8YA 3KX6A 1NF0A 2Q8LA 1EWDA 4UFLA 2YZRA 3WJZA 2GOUA 1DQXA 3PG8A 1NEYA 4CNPA 3HG2A 1K02A 4O11A 3FYOA 2G5WA 3BG9A 2GVJA 3TX9A 3M6YA 2BWGA 4LTSA 1G7UA 2FLIA 4JDBA 2ZRVA 3NM3A 4QJ1A 3NQ8A 5HINA 4IMDA 3CHVA 3MHFA 1VZWA 1E51A 1VLWA 3UWWA 1YXCA 2VELA 5LHEA 1TCDA 2XN1A 5EY5A 3TV8A 1LTDA 1VYSX 3I65A 3SW6A 1GJPA 1M7OA 3PSWA 4N9DA 1Z41A 5FF7A 5F2LA 1LM1A 3M0ZA 3JR2A 3ZR4A 1W37A 3W6YA 2VFHA 4OGZA 2QJGA 4FEZA 3S5ZA 3DBPA 3KAOA 2YW4A 1ML1A 2QCNA 2CZFA 2P10A 3NZ1A 4IPJA 1J4EA 3PM6A 3L65A 2I1OA 1CI1A 4TIMA 3SI9A 1AMKA 1HFBA 1H50A 2HS6A 3LCWA 4YCPA 4XBSA 2VEKA 3EXTA 2BTMA 4UTLA 3UD6A 3UZ5A 1H7PA 2ZZ2A 5F2IA 2D73A 3Q94A 3NQFA 3WJYA 3O6CA 3SFKA 3M41A 3NXFA 4POCA 1QWGA 1BEUA 4KFNA 1LBMA 4O14A 1P0KA 3G1AA 2ZA2A 3STGA 1GPWA 4I7VA 4UFKA 4CQ8A 1SU5A 2G96A 2VKZG 1G67A 2C6QA 8TIMA 5KZMA 3B05A 4JICA 1TV5A 1TV8A 1SZEA 3KRSA 3W1AA 4MZ1A 4EIVA 1MZHA 3W7KA 1GYLA 2ZZ3A 3EKLA 2DU2A 2H6RA 2G97A 3NOEA 1KM5A 4KWVA 5D09A 5I3JA 1WBJA 2TYSA 3PBWA 2V2CA 2X30A 3CT7A 5AYZA 5AHMA 3C2FA 1K8ZA 3RNDA 3UYCA 3N19B 2Q3RA 2LLEA 1U83A 3GDMA 4UNLA 1CW2A 1VQTA 1FCBA 2GQ8A 2CLIA 1NAL1 5D2WA 3B8DA 3LCLA 1TTPA 2EGZA 4U28A 4L4LA 3W1LA 3BPWA 2RDWA 3GKAA 4Q33A 2Z6JA 2E5DA 4JX5A 1FWRA 5TIMA 3G0SA 2ZZ7A 3BGJA 4KWWA 4JTJA 5G2HA 3R8RA 1I4NA 3UWYA 3W2MA 4BR1A 4JEQA 3IIXA 1K7FA 3T55A 3LERA 3QC3A 4UFMA 4OT7A 3LBCA 1KLZA 2A0NA 2ABAA 3P5YA 1RQHA 4NJGA 2J24A 3MBFA 2PC4A 3GNNA 4UFIA 4LWWA 3DFPA 1BKSA 5D32A 4YWIA 4WUIA 2FFCA 5DCEA 5D37A 1O60A 3NPUA 2FB2A 4CCDA 3N14A 1DQWA 2ALDA 4O18A 4Y96A 3PAJA 3LLFA 4O1BA 1YADA 3B03A 3HF3A 1X6UA 2R14A 1K8XA 5G4WA 3PUDA 2V30A 1P0NA 3HG5A 4K7VA 1EP1A 1QNVA 3G22A 1L6SA 3W1XA 3M5ZA 1W1ZA 4AEOA 4DBEA 1OFPA 2DZWA 2QCDB 4BFAA 1H7NA 1WDWA 5BMXA 1EPXA 4NXSA 3W7QA 3EB2A 3M44A 2ZZ6A 1JRCA 1W0MA 4QSHA 1EA0A 5SWUA 3KVJA 1ZCOA 2RDTA 3W7DA 3RMJA 3DGRA 1EP2A 3S1WA 3HOJA 4O0ZA 5D05A 3TSMA 4AB4A 3TAOA 4AWSA 4DBDA 4TX9A 3DHDA 4EOUA 1OG0A 3RU6A 3IIOA 4WXZA 3SGZA 4LRSA 4OE7A 3TXVA 1QOPA 1OFEA 3P7YA 1ME9A 3C3NA 4O10A 2P0OA 4LS1A 4UXDA 3TQ0A 4AWTA 3CEPA 2E5BA 2A1YA 4TMCA 5D2VA 4JTFA 3ANYA 2H3DA 2FIQA 3W85A 5FEPA 3HG4A 3OBKA 2A6NA 2GJLA 1Q6RA 5CPMA 2FPTA 5LNWA 1TPH1 2J88A 1ME8A 3QYQA 4MFDA 3LCGA 1WYIA 1XL9A 5I3KA 2QKFA 5F2MA 2Y88A 4JIPA 4MJMA 1QOQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2R8W A;  5CZ0 A;  3QPY A;  5HMS A;  2Z4G A;  4LBS A;  4GYP C;  4WDU A;  3QSR A;  2WHK A;  1DE6 A;  3PBV A;  1S2C A;  4LYQ A;  3DXI A;  1XLK A;  2D1Z A;  4QQU A;  3GZA A;  4D8L A;  3TRO A;  4TUF A;  4NAE A;  1OM0 A;  4LAO A;  3PPH A;  5CZT A;  5C2C A;  2DUA A;  5IBX C;  1IQ8 A;  4FXF A;  4MG4 A;  3DI0 A;  2B4G A;  2R94 A;  3ONB A;  1TEL A;  4L64 A;  1T6M A;  3M0X A;  1VH7 A;  4ZFM A;  2V5D A;  1NWR A;  2Y62 A;  3CIX A;  4F0M A;  3CL8 A;  6REQ B;  3B9E A;  2X40 A;  3W53 A;  3QR3 A;  4LCQ A;  4PMO A;  3M16 A;  1M7J A;  2GGJ A;  2DZP A;  2A3C A;  3EDE A;  1LBL A;  4LRT A;  7REQ B;  4CKQ A;  4AY8 A;  1XLB A;  3SM0 A;  3W0K A;  3FHQ A;  4S1F A;  4D1J A;  2VQT A;  1YRR A;  3K1D A;  2ZQ0 A;  3SQS A;  2IKJ A;  4ZQO A;  1H5Y A;  4NX5 A;  4WOZ A;  4XK2 A;  4YJ5 A;  1XW8 A;  4CCZ A;  1WB0 A;  3FIG A;  3QV8 A;  3K4A A;  1OD8 A;  2JK2 A;  5CJ5 A;  3MCM A;  4CCE A;  3ITC A;  3UVA A;  1QR7 A;  1A5L C;  1RY8 A;  5DBU A;  3WL0 A;  1AOD A;  2Z1K A;  2B7N A;  2G4J A;  4JTK A;  4DUX A;  2ISV A;  2V5J A;  1YNQ A; 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