1TVNA

Cellulase cel5g from pseudoalteromonas haloplanktis, a family gh 5-2 enzyme
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
AVEKLTVSGNQILAGGENTSFAGPSLFWSNTGWGAEKFYTAETVAKAKTEFNATLIRAAIGHGTSTGGSLNFDWEGNMSRLDTVVNAAIAEDMYVIIDFHSHEAHTDQATAVRFFEDVATKYGQYDNVIYEIYNEPLQISWVNDIKPYAETVIDKIRAIDPDNLIVVGTPTWSQDVDVASQNPIDRANIAYTLHFYAGTHGQSYRNKAQTALDNGIALFATEWGTVNADGNGGVNINETDAWMAFFKTNNISHANWALNDKNEGASLFTPGGSWNSLTSSGSKVKEIIQGWGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords cellulase
publication title Structure of a Full Length Psychrophilic Cellulase from Pseudoalteromonas haloplanktis revealed by X-ray Diffraction and Small Angle X-ray Scattering
pubmed doi rcsb
source organism Pseudoalteromonas haloplanktis
total genus 120
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1tvnA00
5TD4A 2CIPA 1TA3B 1K9DA 2J79A 3PZMA 3PZTA 1JZ4A 3MMDA 1QI4A 2D24A 2JIWA 1SYTA 1B3WA 4AZGA 1E6RA 1ISZA 3D5HA 3WD3A 3SCWA 3AHXA 1PIGA 1QI2A 1BYCA 1ESWA 4LX4A 2IXVA 1R86A 2VL4A 2J62A 3WD0A 4QAWA 1XSJA 2CBUA 3VGDA 3I3DA 3MUAA 4JHZA 4MDOA 4CD4A 1H4PA 1BPLB 2PWHA 1W9PA 3G6MA 2YA0A 5E6YA 2QPUA 1H0GA 1J18A 1KXQA 1V6XA 3CGTA 1RD6A 1OGSA 4JKKA 2YLLA 3ZO9A 1BYBA 4N42A 1H41A 4PMUA 1CECA 1E9LA 1PZ3A 3L4XA 2TAAA 1R8LA 1JYVA 5A6AA 3VIKA 1JNEA 2VR4A 2WMJA 1KWGA 2CERA 1WCGA 2WMHA 3WSUA 4WLCA 2WMIA 1M7XA 1PBGA 1PZ2A 1QVBA 3PN8A 2PWEA 3RM8A 7TAAA 2WLYA 2XVNA 3SUSA 2HVMA 9CGTA 1EHNA 4WJXA 2V5DA 1EH9A 1UH2A 1JGIA 3AHZA 1NP2A 3VO0A 2GK1A 4H7VA 1Q6EA 1DTUA 2D3LA 3AIEA 3WF0A 1W3KA 2G4FA 1JAEA 2XSBA 3D3AA 4AIUA 3T0BA 3ZSTA 4HOZA 2GSJA 3A4XA 2V3FA 1AQHA 1UD6A 4JFSA 1V3LA 3T08A 2GUYA 4BQ5A 1LLOA 2BHYA 3SUTA 1LQ0A 4AD1A 3VX0A 4CCEA 3OBAA 4TX6A 1L0PA 1KCLA 1UR2A 4JFVA 1HP4A 1HP5A 1MQRA 3B8SA 5ABGA 3APGA 3TTOA 2EPNA 2WK2A 2PBGA 1UKQA 3K8MA 4D6JA 1VF8A 2J74A 2GVYA 3KZSA 4E2OA 1VB9A 1E40A 3CMJA 1XD0A 2WVSA 3LPFA 1BHGA 4WSJA 4A3YA 1E15A 4QCEA 4NI3A 5I6SA 1NARA 3VIHA 4BQ3A 2G3IA 2XM1A 4ZE4A 4FLQA 4MB4A 3SEPA 1GONA 1UZ1A 1TCMA 1IZKA 3SCSA 1VAHA 3WMSA 1VEMA 2RGLA 2PI6A 3A4WA 1HF6A 3K46A 1JZ2A 2WXDM 3I3BA 1R87A 1WP6A 1XRVA 1E4LA 2QPSA 1DWIM 1JXJA 2CITA 4JCMA 2YDRA 1KB3A 2WZEA 4HA1A 4AZIA 2EPLX 2VRJA 3SCUA 4OZOA 3NSNA 1VEPA 4Q7NA 5FIPA 4KWUA 2A3BA 1D3CA 2GDUA 4D6CA 1MWOA 2CHOA 2VTFA 1OGGA 1PIFA 4RE3A 3CPUA 5F7UA 2O9RA 3SCTA 4TVDA 2J7BA 4D72A 1UR0A 3QGVA 3CBWA 4M29A 2EPKX 1QNOA 3BGAA 3M07A 1W2PA 3PZGA 3ALFA 1UD5A 3A6OA 1B3XA 3IAPA 1E55A 3WENA 5AC4A 4AWEA 5A69A 4HU0A 4QFUA 5CSUA 3O9NA 1BYAA 1LL6A 1C93A 4M8UA 4DM2A 4WKAA 2OSXA 3OZOA 1GQLA 2J8GA 3TONA 4JHOA 3VM5A 1E0WA 3AIRA 1W91A 2W5FA 2VCBA 3WF2A 4YHGA 1EOKA 3OGVA 1LG2A 4W84A 5A2BA 4H8UA 2ZX7A 1FOBA 5CJ5A 2G41A 5BYWA 2YKKA 3WUFA 2A3HA 1TR1A 2PC8A 3T0AA 2FHCA 4OOUA 4PSPA 1LL4A 4P7RA 3WBAA 3WBEA 3UG5A 3VDAA 4DWSD 2VX7A 5I23A 1WAWA 3BAYA 2CKSA 1VFMA 1M01A 4UQDA 4D6IA 2D0GA 3AXIA 1UR8A 5JIWA 1RPKA 2HISA 2Y8VA 4J3WA 5FD0A 3RJYA 2VO5A 4FF5A 3VIFA 1QW9A 2Z1KA 2XFYA 3GBEA 1W1VA 3ZMRA 4PTVA 4MAVA 2W61A 4PTMA 3A47A 3OLEA 5BROA 5JBDA 3KL3A 3AFBA 4AZ7A 1BG9A 3QOMA 2XYLA 5BRPA 4QP0A 1E73M 1JZ3A 3ARRA 2XIBA 3VIIA 1LG1A 5IHSA 4IPLA 1G9HA 3MS8A 4AZ5A 1DEDA 1CLXA 3IJ7A 1V02A 3KL5A 5A8QA 2E9MA 2G3MA 1J10A 3L4UA 4MJ4A 6A3HA 3VIPA 2EBNA 1WDSA 1N82A 1JG9A 2VX5A 3W25A 3AXXA 3PZ9A 1HJQA 3W4RA 7CGTA 2DH3A 3CZ8A 3HJEA 2WC7A 1CYGA 3L4TA 3ARWA 4C7GA 2F61A 3RM9A 1BTCA 1CGYA 4HMDA 1NWSA 4UCFA 3EBVA 4OIFA 2WM0A 2PWGA 2E0PA 3UG4A 2OLHA 4DWSC 4BQ2A 2WZIA 4NRSA 1J11A 4LXFA 4P8UA 1W1YA 3WDHA 1JI1A 2YBTA 2CHNA 1MW2A 1K9TA 3GDBA 1QNSA 3CHDA 3WUBA 3BAXA 1W9XA 4MPKA 3MUZ1 1WZLA 2J7GA 3VIMA 1IZJA 4PMXA 5I77A 3GM8A 1EQCA 2J7CA 2BVDA 3F5LA 3OA5A 4HTYA 2NW0A 4U3AA 4P7OA 2DPEA 5BXPA 3RCNA 2J7EA 1J0HA 5I78A 1OIFA 2FH8A 3BMVA 3U5UA 3WUEA 4MB1A 2FDMA 3OGRA 4Z2IA 1OWQA 5EFDA 3BLKA 1WE5A 5D9OA 1BGAA 1C8XA 1CXHA 2DGAA 2Y5EA 4GINA 4CD5A 1CXIA 3AHTA 3GNRA 8A3HA 1KQYA 2XVPA 1Y7VA 3GYCA 2FGZA 2PBOA 3F4VA 2YLAA 1H11A 1ZL1A 3OB8A 1JNDA 1NWUA 3ECQA 2XVKA 3NIYA 1PJ9A 1CGUA 2OYKA 4MNKA 2QMJA 4OBSA 1UKOA 1V0LA 1OD8A 5M5DA 2EEXA 2WVTA 3VD3A 1J0JA 4J3XA 4B16A 1E5JA 3CZJA 4HZ6A 5HBFA 3M6DA 4W87A 5IFTA 2CYGA 5CGTA 1V6WA 5CLTA 1JDDA 2JEQA 5A3HA 2WMFA 4EE9A 1U2YA 1OGBA 3EMCA 2PWDA 3VD4A 3WNLA 4UFLA 1TFVA 2VQUA 2ZXDA 3IJ8A 3WIJA 1KXTA 1MXDA 3TOPA 3VGHA 1CNVA 5IFPA 1KR1A 5FL0A 1RP8A 1MFVA 1QI3A 1QBBA 5CPQA 3ZJKA 1A47A 1LWJA 1W9DM 3WKZA 1JXKA 4FLRA 4W89A 1W1TA 4HMCA 3BCFA 3TTYA 2O9TA 2BNJA 2A3EA 1ISYA 5C71A 5EB8A 1WZAA 1B2YA 3QR3A 2BHZA 4AZBA 4FLOA 3WH6A 3PHAA 1DWAM 2YIHA 4LPCA 3GH5A 2WC3A 1GCYA 4OKDA 4AZCA 4HPHA 2BY1A 1YQ2A 1FH9A 1GOWA 1TMQA 1WZMA 1E4NA 2D0FA 4KMQA 3CO4A 1GQJA 4W93A 4W86A 1KXVA 1E6SM 3AXHA 3BSGA 2AOSA 3WH7A 1UHVA 3AHYA 4IM4A 1J01A 1E6PA 2QMKA 5A8OA 1PX3A 1WNOA 1UKSA 3W53A 3VDHA 1EIBA 1WDPA 1OM0A 3VMNA 2VJXA 4TTUA 3WQWA 3K4AA 5CQ1A 4DWSB 1JFXA 3FNDA 3UR7A 4Z2HA 1V6YA 3UG3A 2WYSA 3WDPP 4S3KA 1GW1A 3EDEA 4U33A 3WH8A 2G3JA 2YBUA 1P6WA 2O92A 4CD8A 3FAXA 3WEOA 3BAWA 2WC4A 3PZVA 5D8ZA 3WQ8A 3MO4A 2BS9A 4AD3A 2W66A 2WANA 4E4PA 5I79A 3LPGA 1E6NA 1HX0A 3OIHA 3ZJ8A 2ZUWA 2CBIA 2QV4A 3AHVA 5BXSA 3DYPA 3RO8A 1W3JA 2CBJA 1BFNA 1EDQA 1UD4A 2EJ1A 1UKTA 3CZGA 4W85A 3VX1A 4HA4A 1NOWA 2ZUMA 2VZSA 4Q22A 1FH7A 4CD6A 5BWFA 3ZR5A 1EDGA 3QHOA 4AEEA 1V0MA 3N15A 1UR1A 3DHUA 4BCEA 5IXEA 4B9ZA 1CGTA 5BXRA 3VD5A 1JF6A 4MB3A 2VQTA 4DM1A 2QHAA 4D71A 1E70M 2DT3A 1HKJA 4UQ9A 1G0CA 5A2CA 4MNMA 5FOOA 2Y8KA 1E6XM 3UESA 3AS3A 4K68A 5EFFA 1TA3A 5CPTA 4FK9A 3CZKA 1XGZA 3B9EA 3GNOA 4HA3A 1HKIA 4M81A 3WEMA 1BQCA 3VDBA 1QW8A 4PMVA 4PEEA 1V3JA 3WMCA 4D6DA 4EKJA 1YHTA 3ARZA 3EYPA 5GQBA 3W6MA 1G1YA 4R27A 4DWSA 2Y24A 1UG6A 4S3JA 1FHLA 4B9YA 1R7OA 5A6SA 2ZOXA 1JD9A 2VOTA 4X9YA 1C92A 2E3ZA 4LYRA 4GQRA 1H2JA 4P7QA 4JL2A 2DIEA 2WHMA 2WNWA 2XWDA 3U57A 1W9UA 2XWEA 5HPCA 4PSRA 4CN6A 2ZWYA 3OLGA 4B3LA 1JYXA 5I0DA 3WNNA 1CLVA 1JIBA 2V5CA 4DUXA 2WLZA 2YJQA 4UQEA 3W38A 3MV01 4Z2KA 3PTQA 3VD7A 3WF3A 5A6JA 1I1WA 4QDMA 3T2QA 4TVUA 2BY2A 4AC1X 4ATLA 5D4YA 1JL8A 2E4TA 2DSWA 4CD7A 2X09A 5D8WA 5ABFB 4P8VA 4CCDA 1GJUA 1V3KA 3N13A 3OZPA 3DHPA 3VIJA 2DIJA 3W27A 5A6KA 2GJXB 3FHAA 1E6QM 5HPOA 3AS2A 5A6BD 3THDA 4L4OA 1AQMA 1M04A 2O9OA 4FMVA 2D1ZA 4IISA 3WFZA 4P7LA 4QLKA 3W37A 1H09A 4ATDA 5GNZA 2ZUTA 3I3EA 4EK7A 2VCAA 1G01A 1CDGA 2JALA 3POHA 4GI6A 4WKFA 2BXYA 3SCRA 2X05A 3IAQA 3M7SA 4X0NA 4W8BA 1KFWA 4ACZB 2G8ZA 2EXOA 4PMNA 1EQPA 3BLPX 3SCPA 3WFLA 5FL1A 3ARVA 4KRTA 3ARPA 4ZXOA 4PUEA 2Z1SA 5FCZA 4H8HA 1KR0A 2XHYA 4TTGA 4ZXLA 5CLWA 3N1AA 1C7TA 4GIAA 1GPFA 4PN2A 1OD0A 1C8YA 2CNCA 2QLYA 3CHFA 2OWWA 2BXZA 1GOMA 1NOUA 2DT2A 2QF8A 5A94A 4Y7EA 2ZX5A 3AZTA 4MNLA 5HNNA 4UZSA 1JZ8A 3CUJA 2RGMA 1Z32X 3CZEA 4W88A 4PTWA 1E0VA 2X8RA 1V03A 2F2HA 3AYSA 5KEZA 1XSIA 4J7RA 4WKHA 2UY4A 4BZYA 1V0NA 1ZBKA 2YDSA 1FH8A 1JF5A 1K9EA 1E56A 5DFAA 3WQ5A 4JCLA 4MAZA 3GXFA 1NP0A 2GJXA 4W8LA 3ARXA 2IXUA 3VIOA 3K8LA 2DEPA 2F8QA 3AMGA 3K8KA 4GZEA 1JI2A 1XHGA 2UWFA 5I3DA 3AOFA 4WK9A 5JUVA 3NSXA 4UNIA 1V3IA 3MMUA 1OIMA 4GPNA 3WDIA 3WEZA 2GFTA 1H5VA 3N18A 3MV11 1CWYA 2UY2A 1J0ZA 2Y2WA 4NSBA 1TUXA 1XH2A 1RH9A 1V08A 4C7DA 5E70A 3E1F1 3VKKA 1PEZA 1X6NA 4B15A 1EO7A 3L4VA 1VBRA 4ACZA 1GOIA 1NWRA 2J7DA 2E9BA 3EDKA 4URIA 1ITXA 1ISVA 4CN4A 3J7HA 1J12A 2ESCA 4CN1A 4UFKA 1W3LA 1UOKA 2W63A 3UCQA 2JF6A 5A6LA 3GXIA 1JZ6A 1HNYA 3RIKA 4JKMA 4NZCA 1JYWA 2XG9A 4CVWA 1B1YA 3OGSA 3WY1A 1SR0A 3TP4A 5EBAA 4BQ4A 3GZAA 4HMEA 1UUQA 1KGXA 1F4HA 3NYDA 1UA3A 3BAIA 5ABHA 2J75A 1QNPA 1XCXA 3CUFA 3EDJA 1NOFA 3BCDA 1KBBA 3KWXA 2GDVA 1XYFA 1R7AA 4P7NA 1BVNP 1OT1A 1QHPA 1BYDA 1B9ZA 1JDCA 2D0HA 3JUGA 3THCA 1QHOA 3ZR6A 1GOKA 3PTKA 4UTFA 1VRXA 4AD0A 3VUPA 4UFHA 3AQUA 2OWCA 1WDQA 2VRKA 2FGLA 4LGXA 2OSWA 4D1IA 2WZHA 1A3HA 3U5YA 4LYQA 2YL5A 4PTXA 3K4DA 2J4GA 3L4ZA 1B3YA 4P8WA 3GXMA 2WMKA 2XGBA 4BA0A 3AS1A 3HU7A 3L4WA 1LJYA 1HJSA 2D2OA 3UEQA 1LWHA 1W2VA 2YL6A 3ZSSA 4CKQA 4HOWA 5DT5A 3WH9A 4GQQA 1NQ6A 5E0CA 3RDKA 2WPGA 1E1FA 3AMLA 3SUWA 3ZT6A 1GHRA 1H49A 2YA2A 1Q6FA 2VZUA 2YDQA 1ZBWA 3CUIA 1XD1A 2ZX6A 4XX6A 1W32A 2X1IA 1JYNA 3AS0A 3VGBA 1UR4A 5JIPA 2VZVA 2WW5A 3SIMA 4PMOA 1B3ZA 1KCKA 1EGZA 2J78A 1MW0A 2X0HA 3WDQA 5A8PA 1BG4A 1H0IA 2AAAA 1VJSA 1HJWA 4EAMA 3VPLA 2DT1A 4PUDA 4RE2A 1ZBVA 2J7FA 2DSUA 2YOCA 4V27A 5D9MA 4AW7A 3WNMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5TD4 A;  2CIP A;  1TA3 B;  1K9D A;  2J79 A;  3PZM A;  3PZT A;  1JZ4 A;  3MMD A;  1QI4 A;  2D24 A;  2JIW A;  1SYT A;  1B3W A;  4AZG A;  1E6R A;  1ISZ A;  3D5H A;  3WD3 A;  3SCW A;  3AHX A;  1PIG A;  1QI2 A;  1BYC A;  1ESW A;  4LX4 A;  2IXV A;  1R86 A;  2VL4 A;  2J62 A;  3WD0 A;  4QAW A;  1XSJ A;  2CBU A;  3VGD A;  3I3D A;  3MUA A;  4JHZ A;  4MDO A;  4CD4 A;  1H4P A;  1BPL B;  2PWH A;  1W9P A;  3G6M A;  2YA0 A;  5E6Y A;  2QPU A;  1H0G A;  1J18 A;  1KXQ A;  1V6X A;  3CGT A;  1RD6 A;  1OGS A;  4JKK A;  2YLL A;  3ZO9 A;  1BYB A;  4N42 A;  1H41 A;  4PMU A;  1CEC A;  1E9L A;  1PZ3 A;  3L4X A;  2TAA A;  1R8L A;  1JYV A;  5A6A A;  3VIK A;  1JNE A;  2VR4 A;  2WMJ A;  1KWG A;  2CER A;  1WCG A;  2WMH A;  3WSU A;  4WLC A;  2WMI A;  1M7X A;  1PBG A;  1PZ2 A;  1QVB A;  3PN8 A;  2PWE A;  3RM8 A;  7TAA A;  2WLY A;  2XVN A;  3SUS A;  2HVM A;  9CGT A;  1EHN A;  4WJX A;  2V5D A;  1EH9 A;  1UH2 A;  1JGI A;  3AHZ A;  1NP2 A;  3VO0 A;  2GK1 A;  4H7V A;  1Q6E A;  1DTU A;  2D3L A;  3AIE A;  3WF0 A;  1W3K A;  2G4F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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