1TVPA

Endoglucanase cel5g from pseudoalteromonas haloplanktis in complex with cellobiose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
AVEKLTVSGNQILAGGENTSFAGPSLFWSNTGWGAEKFYTAETVAKAKTEFNATLIRAAIGHGTSTGGSLNFDWEGNMSRLDTVVNAAIAEDMYVIIDFHSHEAHTDQATAVRFFEDVATKYGQYDNVIYEIYNEPLQISWVNDIKPYAETVIDKIRAIDPDNLIVVGTPTWSQDVDVASQNPIDRANIAYTLHFYAGTHGQSYRNKAQTALDNGIALFATEWGTVNADGNGGVNINETDAWMAFFKTNNISHANWALNDKNEGASLFTPGGSWNSLTSSGSKVKEIIQGWGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords cellulase
publication title Structure of a Full Length Psychrophilic Cellulase from Pseudoalteromonas haloplanktis revealed by X-ray Diffraction and Small Angle X-ray Scattering
pubmed doi rcsb
source organism Pseudoalteromonas haloplanktis
total genus 119
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1tvpA00
2CBJA 3PZNA 4PCTA 4XX6A 2ZE0A 1PEZA 2V5CA 2D0GA 3GBEA 1OCQA 1ZS2A 2WC4A 5FOOA 3TONA 1CGYA 1KQZA 4AZCA 5EFFA 3F5JA 3NCOA 4PEEA 5IFTA 5DT7A 1CXEA 4Z2HA 1CXFA 3BAYA 4RE4A 2JALA 1W3HA 3EBVA 4M82A 1QNOA 3O2LA 1ODZA 1ZBCA 2V3GA 1XHGA 4BA0A 3MU7A 5I23A 2WK2A 4W5UA 3BH4A 4M56A 4Q22A 1GQLA 2PC8A 3NDYA 3PN8A 2CBUA 1W9DM 1V03A 2JE8A 4AEFA 1C92A 1Q6DA 3N9KA 1E3ZA 2Y8KA 3WH8A 2VC9A 1PX4A 3VKKA 3G6MA 1EGZA 2HVMA 4JFUA 3T09A 3LPFA 4GQQA 4MDPA 3EDKA 4ATLA 5D9NA 1U33A 1VFUA 3ZJ6A 1WO2A 4GINA 4AZ7A 4ATDA 1MXGA 3L4YA 1E0WA 1QNQA 4AZGA 4LYRA 4IM4A 1KXHA 3AMCA 1H5VA 3WF3A 2BVTA 3L2LA 4U2ZA 1KGXA 3U57A 3VGGA 4CD6A 3AHVA 4XZBA 1L8NA 4H2CA 2XIIA 2E0PA 1UQYA 5AYIA 3MUAA 2WSPA 1HKMA 2D24A 5C71A 3NYDA 3FW6A 1XCWA 3TP4A 2Y2WA 2CKRA 1E6XM 1KGWA 3W37A 4PMVA 2VX6A 3FHAA 5CGTA 1GONA 3KL0A 3F5LA 2VZSA 1NWSA 2D0FA 4MDOA 3POCA 4CGTA 1JZ3A 3AXIA 2E8YA 1QI4A 3CH9A 3U7BA 2ZUMA 1QOXA 3AZSA 3VMNA 5D9OA 1R85A 3THDA 4H8UA 4AD0A 4PMNA 2WYSA 2ZUVA 3ZT7A 4UR9A 1KXQA 1OBAA 1CEOA 3WUBA 1UQZA 3TTOA 1GOIA 1ZB5A 1QHPA 2EQDA 1O7AA 1MQPA 2D23A 3MMUA 2WVSA 3OGRA 1ISVA 1V6UA 2XGBA 3VILA 1OIFA 1QHOA 2VCBA 2GJRA 5KEZA 3WH7A 1GOKA 1CXIA 2AAAA 4OJYA 3ZSSA 1AVAA 1V6XA 4UQ9A 4B9YA 1UWIA 1JIBA 1ZBWA 3SURA 8CGTA 1JZ6A 3TOPA 2YL5A 1Y7VA 3AS2A 4AD3A 2BNJA 3AHTA 1WZAA 1MXDA 4PMRA 2D3LA 1JXJA 1E4MM 4J3WA 5ABGA 2ZUNA 3A3HA 3WQ6A 1CNVA 1TFVA 2V38A 4XV0A 4CN4A 3WMBA 2J7DA 1IZKA 3RM8A 2QV4A 3ARQA 2ZX6A 4V27A 3FAWA 3OG2A 1H1NA 2CBVA 1C91A 1HL8A 4P8XA 4UZSA 3DYOA 3N18A 3CIVA 1BGGA 1QI2A 4J3SA 4NZCA 5D4YA 2J75A 1RD6A 1VBRA 1BG4A 3F4VA 3ARTA 3MMDA 3NJ3A 1UD6A 3B9EA 1JL8A 1ZL1A 1PPIA 1CXHA 1UZ1A 1C3FA 2XM1A 2OLHA 2YL6A 2OSYA 3L4VA 1IT0A 4D6IA 3WENA 5LA1A 1AQHA 4P7OA 1B90A 4F9DA 3IANA 3CZJA 4AIEA 1NOFA 3AIQA 1G9HA 1CLVA 4PMXA 1PZ3A 1WCGA 3WF2A 1TE1A 1EDTA 1W1PA 2QMJA 1HJWA 2XWDA 1G01A 2WZEA 4GPNA 4DM1A 3IJ7A 3BCFA 2GJPA 2O9RA 2YDSA 3IJ8A 3VIMA 4WSKA 3VIPA 3GH4A 4MPKA 4JZ5A 3W82A 1JYXA 3A4WA 3WDRA 2J25A 2VMFA 3N17A 4OBSA 3AMLA 1KR0A 2JEPA 2E3ZA 4L4OA 4EANA 1E4NA 4W88A 3SIMA 1X6NA 2WMIA 1WDPA 5HXMA 5BXPA 5JUVA 1HJSA 4AD5A 4D1IA 4AIUA 4JCLA 4D71A 4PMOA 2A3CA 3WNOA 4H8VA 5BXSA 4YHEA 1V02A 1BAGA 2WBGA 3WF0A 3MS8A 5CGMA 4W7VA 2DSUA 2WB5A 1E4IA 3GNRA 3SCUA 5C8BB 2Y5EA 3F5KA 4AYSA 4EAMA 2YOCA 3K4DA 3VUPA 2VQUA 3BAKA 3IJ9A 5IXEA 4EK7A 4AD4A 4HPGA 4W87A 4J3XA 1AMYA 5HBFA 5HPOA 1FFQA 2E40A 4EKJA 4AW7A 3DHUA 3HU7A 5GPRA 1EDGA 4D1JA 2PBOA 3MKKA 1H0IA 3N04A 5GNZA 2E9BA 3RM4A 5A8NA 1G1YA 2YLLA 2VO5A 1XH2A 1C8XA 3MUZ1 3WELA 1JNDA 1UR4A 5E09A 2JEQA 1OGGA 4XB3A 1MQQA 1V02E 1JNEA 1LL4A 3AHZA 1SFSA 2PB1A 3RJXA 2E4TA 3UG5A 2J74A 4JCMA 2J7BA 4E8CA 4D6FA 4FLOA 3UETA 1JFHA 4KGJA 5HOSA 1CZ1A 1CECA 3VINA 2WVUA 4W89A 1U30A 5JIPA 2XVPA 4B16A 4BQ3A 2BVDA 3WNKA 2RGMA 2NT1A 2WAGA 3BMVA 1UZ4A 1WDRA 4CN6A 1CXLA 4FK9A 1QPKA 4UNIA 2JIWA 4HTYA 2ZX5A 1CGUA 3LPGA 4WKAA 3DHPA 4WSJA 1XH1A 2OWWA 1E6ZA 1FOBA 1LL7A 4QAWA 1UYQA 4FLSA 1BSIA 3WBAA 3WQ5A 1FH9A 1UWUA 3WN6A 4BCEA 1J01A 1OM0A 3OLDA 2VQTA 4Z2JA 4AZHA 5A6BA 3PTQA 5BYWA 2CESA 5I2UA 1CENA 2W67A 2YA1A 5M17A 3MUIA 3RDKA 2W62A 3CZGA 2G4FA 2NW0A 3U5YA 1R7OA 1KWGA 3PZTA 1ZU8A 5A6JA 1KCLA 1J0KA 1HP4A 1JAKA 4CCCA 5JIWA 1NARA 3VNZA 3BSHA 5D8ZA 4PMUA 2OYLA 4MB4A 3NSXA 4U5KA 1UHVA 1X1NA 3SCWA 3QOMA 5HDRA 1E9LA 3WY1A 1W1TA 2J7GA 4TX6A 3PZUA 2UY5A 4DUXA 2OSWA 3ARYA 1J18A 4GI6A 4URIA 4E8DA 5A6LA 1VIWA 1JDCA 3L4XA 1MW2A 1OD0A 4BF7A 3K1DA 3WUEA 3WF4A 4C7FA 6CGTA 5DEZA 2VOTA 3TA9A 3M46A 3SCOA 4X0VA 1PX3A 7A3HA 3PTKA 4P7RA 3UERA 1W3LA 2XUCA 2CCRA 3AXHA 4R27A 5A95A 2WBKA 4Z2IA 2QF8A 4UFJA 1H49A 1FP9A 4ZXLA 4OZOA 2B31A 5I77A 2GUYA 4P7QA 1ZBKA 4A4AA 3WNMA 4GZJA 5CSYA 1WKYA 1EHAA 1XCXA 1D7FA 4U33A 5BRPA 4YPJA 4CUCA 3FY1A 1EQPA 4J28A 4B15A 1HNYA 5DFAA 1J12A 2W61A 5A1AA 1JYWA 1AQMA 3ZR5A 3SCRA 1VF8A 2W5FA 4P8VA 3VGEA 1W3JA 1W1YA 5I79A 3CGTA 2VZTA 2WPGA 2WZIA 4UTFA 1EO7A 1E1FA 3WFZA 1GHRA 6TAAA 2DSVA 4BZYA 1HVQA 4UQAA 2CITA 2IXUA 2OSXA 3BLKA 3MSGA 1A3HA 2YLAA 4DWSC 3WUGA 4EE9A 2BV9A 4ZE5A 2ZIDA 3AYSA 5I78A 3AROA 2CPUA 3T0DA 3GZAA 4BQ2A 1UD3A 5GNXA 4AZBA 4MNKA 2FH6A 2WKLA 4W86A 4RE3A 3SCVA 1E5JA 1TCMA 1HP5A 3CTTA 1VAHA 3NUKA 1GVYA 1BYCA 4TTUA 2YA0A 3W38A 4C7DA 1HF6A 4B3KA 4YHGA 1GOQA 1C90A 2YL9A 5AC5A 4CD5A 5GQBA 1V08A 1NH6A 4TVDA 1VEOA 4PUEA 4PSRA 1JG9A 1QI5A 5A8QA 1KXTA 4KGLA 1UR2A 3E1F1 4AZCB 3GBDA 5LYRA 4B9ZA 3JUGA 2DGAA 3PBGA 2X0HA 3K46A 5CXPA 1UKOA 4D6EA 4CD7A 1BGAA 2J4GA 2PWFA 3UEQA 1E15A 1NWRA 3WL0A 4WJXA 1UOKA 5M03A 1XGZA 5A2AA 1B2YA 4HOWA 4PCSA 3SUSA 2DT3A 1I75A 4XZWA 1MYRA 2WHJA 4J3UA 3I3EA 5CLWA 3WF1A 5IHRA 4TUFA 1E6SM 3WEMA 2YDRA 1LLOA 4OOZA 2XFRA 5ABEA 1KXVA 2UWFA 1VEMA 2A3AA 3OLIA 4A3HA 3MV01 2XIBA 1ZJAA 4C7GA 2DT1A 2W91A 2C0HA 1QVBA 4LYQA 7CGTA 3TTQA 2EO7A 2PBGA 4UZUA 2J7EA 1JI2A 4N42A 7TAAA 5A8OA 4UFMA 3ZT6A 1R86A 4TXEA 1KFWA 4DM2A 1V0MA 5ABFB 5E0FA 2BHUA 3L4UA 1W3KA 1DHKA 3BAJA 4PTMA 4AZ6A 2OWXA 2VUYA 1DWGM 5CSUA 1UWTA 5ABFA 2WXDM 1CLXA 1ZBVA 2X09A 4XUYA 2EJ1A 1VEPA 3OGVA 3WDPP 1AQ0A 2A3EA 4FLQA 5BWFA 4WIWA 1W1VA 4TX8A 1DWHM 3SCPA 3OLEA 1J0JA 1HJUA 1W2VA 3AS0A 4WKHA 2X1IA 2VNCA 4FF5A 1FH7A 3WDJA 1UKSA 3WEOA 3VDCA 3SCSA 1CGXA 4J3VA 4J27A 2XJ7A 4HA1A 1N82A 3GDBA 1J0YA 4U2YA 3ZSTA 2E9LA 3QHOA 1SMAA 1JXKA 4ZEPA 1OINA 3KE0A 4CVWA 1Q4NX 4A3YA 1QW8A 2BY3A 1O6IA 1KR1A 1OGSA 3ZJ7A 3WH6A 3U5UA 1B9ZA 1BYAA 3ZM8A 3M7SA 1CGVA 2XFYA 2VX5A 3WNLA 3SCNA 3VGDA 1P6WA 2PWGA 2YDQA 3M6DA 4GZEA 3CUGA 3BLPX 4MAVA 3WNPA 2WMGA 2XWEA 4MB5A 2CNCA 5A69A 1HKIA 3VVGA 5LA2A 4AWEA 2ZUWA 2J8GA 4JAWA 1TUXA 3W28A 4DUWA 3APGA 4Z2GA 3AZRA 3CUIA 5A2BA 3AIEA 2DIEA 5ECUA 3MUY1 1WAWA 4JFSA 3AHYA 1H09A 1QBBA 4GXPA 2WMKA 3QOKA 3SUTA 2FH8A 2W66A 1VFMA 2WM0A 3O6AA 4LGXA 3MO4A 3M07A 3A6OA 2VURA 3OGSA 3AXXA 4QLJA 1E72M 4BQ4A 1TG7A 4LPCA 5CJ5A 4NSBA 3VD5A 1GPFA 4QCEA 2DH3A 2FHFA 2WCGA 2AMGA 4E4PA 4KH2A 1B1YA 2F2HA 3CLWA 3VM5A 1HT6A 4WKFA 1W9UA 3CZ8A 3VDAA 3PZIA 1YHTA 1BVZA 3VIHA 1GZJA 1UWSA 2WHLA 5CG0A 1JZ2A 4ML4A 1EOMA 2GVYA 3DC0A 3PZOA 4HZ7A 1M53A 3RM9A 1JD9A 1W91A 4M29A 4CU7A 3WDQA 5GNYA 1UG6A 2WMIB 3VDBA 2WMFA 1MWOA 3ARWA 1G5AA 2Z1SA 3KL3A 1D2KA 3WQVA 2JF7A 2CIPA 2EBNA 3GNOA 2X8RA 1RP8A 4HA4A 4HU0A 5I24A 3UCQA 3N13A 3ALFA 3D5HA 4GI9A 4TOQA 1MW3A 2DT2A 1OWQA 3BMWA 3ZR6A 1W2PA 3AQUA 4M81A 2CKSA 1UR0A 3BCDA 3N15A 4W8BA 5I6SA 1MW0A 5BROA 1NP0A 1ISZA 2J8FA 3W25A 3HN3A 2ZICA 2XSBA 1JAEA 3CMJA 1XSJA 3FAXA 4FLRA 4N0RA 1M04A 2WZHA 3T08A 2VTFA 3UR7A 4W7UA 3LPOA 3WFLA 1OT2A 2YL8A 1GNXA 4LQ1A 1UKPA 1VBUA 1E43A 4PMQA 2XVLA 2V3FA 1LL6A 1WZKA 2EPOA 5BCAA 4UFKA 4AIOA 4MNMA 1CWYA 2BY1A 1UH3A 5A6AA 3SUUA 4JL2A 1JZ8A 1F4AA 1US2A 2CEQA 2Q8XA 1HJQA 4K68A 4KRTA 4P8WA 1IZJA 2YA2A 1QW9A 5FKYA 1Q6CA 4HZ6A 1I1WA 4X0NA 4H8HA 4RE2A 1XH0A 2JFEX 1CDGA 5CZKA 3CUHA 3WMCA 1C7TA 2GDUA 2WVVB 4W7WA 3U7VA 2DPEA 4ZE4A 3AIUA 2C7FA 3GYCA 2WVVA 2W92A 1TVPA 1L0PA 1E6RA 4D72A 1H3GA 2XSAA 3PTMA 1OD8A 2EXOA 2ZUSA 4UCFA 3N1AA 4P7LA 3QGVA 2XPKA 4MJ2A 2VI0A 4MADA 1BHGA 2J62A 3VGFA 1F4HA 2YKKA 4HMDA 3A47A 4JKMA 4UQCA 1UA3A 2O9PA 3ZMRA 1KGUA 1C8QA 3ZIZA 5AY7A 2ZXAA 3AS3A 2DT0A 3S6TA 1UA7A 1BLIA 2VX4A 2GFTA 2D1ZA 4PMZA 3WH9A 5BXRA 5FIPA 1V3HA 5DO8A 3VGHA 1VRXA 1JI1A 5IFPA 1GQKA 1B31A 2WMJA 1W32A 4CKQA 1GOMA 2VZVA 3W6LA 1W9PA 3VO0A 2FHCA 1WB0A 3SCQA 4RL3A 2V3EA 2X05A 4YN5A 4AMCA 4PN2A 2AOSA 4X9YA 2VRQA 2D20A 2D2OA 2DQXA 1VJZA 3PHAA 2O9OA 4CU6A 1VB9A 3BAXA 1UD8A 3LMYA 2G8ZA 3OZPA 3UR8A 3WD2A 4LX4A 2E9MA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CBJ A;  3PZN A;  4PCT A;  4XX6 A;  2ZE0 A;  1PEZ A;  2V5C A;  2D0G A;  3GBE A;  1OCQ A;  1ZS2 A;  2WC4 A;  5FOO A;  3TON A;  1CGY A;  1KQZ A;  4AZC A;  5EFF A;  3F5J A;  3NCO A;  4PEE A;  5IFT A;  5DT7 A;  1CXE A;  4Z2H A;  1CXF A;  3BAY A;  4RE4 A;  2JAL A;  1W3H A;  3EBV A;  4M82 A;  1QNO A;  3O2L A;  1ODZ A;  1ZBC A;  2V3G A;  1XHG A;  4BA0 A;  3MU7 A;  5I23 A;  2WK2 A;  4W5U A;  3BH4 A;  4M56 A;  4Q22 A;  1GQL A;  2PC8 A;  3NDY A;  3PN8 A;  2CBU A;  1W9D M;  1V03 A;  2JE8 A;  4AEF A;  1C92 A;  1Q6D A;  3N9K A;  1E3Z A;  2Y8K A;  3WH8 A;  2VC9 A;  1PX4 A;  3VKK A;  3G6M A;  1EGZ A;  2HVM A;  4JFU A;  3T09 A;  3LPF A;  4GQQ A;  4MDP A;  3EDK A;  4ATL A;  5D9N A;  1U33 A;  1VFU A;  3ZJ6 A;  1WO2 A;  4GIN A;  4AZ7 A;  4ATD A;  1MXG A;  3L4Y A;  1E0W A;  1QNQ A;  4AZG A;  4LYR A;  4IM4 A;  1KXH A;  3AMC A;  1H5V A;  3WF3 A;  2BVT A;  3L2L A;  4U2Z A;  1KGX A;  3U57 A;  3VGG A;  4CD6 A;  3AHV A;  4XZB A;  1L8N A;  4H2C A;  2XII A;  2E0P A;  1UQY A;  5AYI A;  3MUA A;  2WSP A;  1HKM A;  2D24 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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