1TYQA

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
417
structure length
399
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
total genus 126
structure length 399
sequence length 417
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1tyqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqA04
2IIRA 1TUUA 3CIPA 1KAYA 1S3XA 2NZTA 3UKUB 5AQFA 4CD1A 2UYTA 2P9LB 4WQ5A 4BG8A 5EX5A 3D2EA 2PAVA 1DEJA 4FSVA 4BRDA 1WUAA 4MO5A 3O08A 2P9IB 2YHYA 3H3OB 3BP8A 3F9MA 1R59O 2E8AA 5AQPA 2D0PA 3CERA 1QQNA 1NGDA 3M3ZA 3ZX0A 1J6ZA 4FWPA 3P4IA 5AZJA 3MN6A 1HUXA 4BRLA 3DJCA 3UE5A 4BRPA 5AFUA 1NGBA 1U2VB 2ASPA 4EHTA 3QBWA 2FF3B 3BUZB 4JNEA 3O4WA 4WQ4A 3RSEB 5AZIB 1YVNA 4BRAA 1Y64A 5BREA 1C0FA 3ZETA 1TYQB 1U6ZA 4BC4A 4WQ5C 4BR5A 4CBWA 2FXUA 3MDQA 3O5BA 5BN8A 1BUPA 4FWOA 3WXLA 2IVNA 3UKRA 1GLDG 3I33A 5B8HA 5BPMA 1MWMA 4H0PA 3QMLA 4K43A 4RTFD 5AQRA 2F9TA 4XH5A 4JD2B 3AAPA 3JXUA 1GLFO 1HX1A 1ZBSA 3LDNA 2CGLA 2E88A 1QZ5A 2GUPA 5AQYA 4FWSA 4A2AA 3FZLA 4WQ4C 4BR7A 3OHRA 2P9IA 3R8EA 4CZMA 3HSCA 4BRGA 3SJHA 4RWTA 1NGGA 3HTVA 5AQLA 4I6MA 4BREA 4B1VA 4FPBA 2P9SB 5FPEA 3VGLA 1C0GA 5BR9A 1T44A 2QM1A 4MLHA 4H5WA 4EAHD 4CZJA 4DQ8A 3WEEB 2AP1A 3CQXA 3VF4A 2IVPA 4CZKA 5AQMA 2GELA 1NM1A 3W3DA 1GLBG 4DCHA 3ENOA 4CZGA 3D7EO 5JLFA 4XH4A 1DGKN 2A41A 3WXIA 1MA9B 3O8MA 5AQSA 3CJBA 4ISEA 5AQIA 4H5VA 5AQUA 5BRDA 1HPMA 3KHYA 1G99A 5TKYA 3SMPA 4GY2B 5KQ8A 1D4XA 2ASOA 4Y0WA 2GWKA 4A62A 3VENA 1GLCG 3SMSA 2P9UB 2E1YA 3GBTA 3MN5A 3KVGA 4FWMA 3H1VX 2Q97A 2A42A 3L6QA 3EKSA 4JN4A 3A5MC 1E4GT 2ZF5O 3LDOA 4BROA 1NGFA 1Z05A 4MLEA 4H0XB 4YDUA 1ATNA 3D2FA 2J4RA 2E2QA 3WEEA 5AQOA 4BRQA 2QXLA 3G25A 4JAXA 3ZEUA 1V4TA 1MWKA 2A40A 3H46O 1QHAA 3C7NB 4CZEA 4JHDB 4L3QA 5JMVA 4QS7A 3VEXA 4K25A 4QS8A 2E2NA 3VF6A 4BRKA 5AQGA 4PKGA 5AQNA 1Q18A 1JCFA 1BO5O 1IG8A 2YJFA 3VEOA 3IMXA 2D0OA 3WQUA 2KHOA 2FF6A 2QWLA 5E26A 3GG4A 2A5XA 1SQKA 4PL7A 4EHUA 5I9EB 4YDUC 2E20A 4BQZA 5AQVA 3ATUA 3BF1A 2CH6A 5KQDA 3FZKA 2P9UA 1BA0A 3VGKA 3DXKB 1XQSC 3GE1A 3H6EA 4H5NA 3W0LA 3TPQA 2V52B 2P9KA 2Q31A 5BPNA 5JICA 1NLVA 4B9QA 2Q36A 1ATRA 5F1XA 4BRIA 2FSNA 3UB5A 4GNIA 3VPZA 5LJVA 1ATSA 2Q0RA 2QWPA 3ZX3A 5BRHA 4NB4A 3DXMB 2YHWA 1HLUA 3L4IA 4PKHA 4EIAA 4CZFA 5FPDA 3ENHA 4BRCA 1OKJA 1KAZA 2P9PA 5AQJA 3GL1A 1KXPA 4CZHA 4KBOA 3CHWA 4E1JA 1E4FT 2ZWHA 3UKUA 4JHDA 5F2RA 3AY9A 2QWOA 3MN7A 3QICA 2P9LA 3O1WA 3LDPA 3JS6A 2VYPA 3IDHA 3HM8A 3MK6A 3A8YA 2QW9A 1GLEG 5ADXH 2P9NB 3WXJA 3FR0A 4BVPA 1ZXOA 4CBUA 1NGJA 3A5NC 1BOTO 5BRFA 3VOVA 3CJ1A 4M63C 2BUPA 4H03B 1X3MA 2QWRA 4IJAA 1KAXA 3R6MA 1HKBA 1XUPO 4BR0A 4CD3A 1U2VA 4B1UB 2YI1A 3IFRA 4FWLA 4BG9A 3RSEA 5AZIA 3FLCO 3I8BA 1YUWA 1TYQA 4XH1A 5LJWA 1V4SA 2W40A 3DWLA 2IVOA 4O8KA 3DXMA 1EQYA 1X9JA 3J8AA 3B8AX 3FZFA 3VEZA 1T6DA 3C0BA 2VCPA 4DB3A 3A5OC 5LY3A 3VGMA 4QS9A 4JD2A 2F9WA 4H0YB 2V7YA 1P8ZA 4CZLA 5AQTA 4CJ7A 2V7ZA 2FSKA 2ITMA 1QZ6A 1TUYA 1YXQA 1NGEA 3D2EB 2Q1NA 1S22A 3CJ9A 3LL3A 3FFKB 1ESVA 2P9SA 4MO4A 3CJAA 5KPTA 3MCPA 3O80A 1NGIA 3SLCA 5AQZA 3HZ6A 2CGKA 1BU6O 4AM6A 4IXCA 3QB0A 1BA1A 2NRHA 2ZGYA 3CETA 2EWSA 1GLLO 4A61A 3HI0A 2WUSA 5AZJB 5JLHA 3FGUA 1RDWX 4BRMA 4DHYA 3SK3A 3KZBA 4HWIA 2D4WA 4B1WB 3ZETB 5EY4A 1NGHA 1CZAN 1GLJO 3WQTA 3CI5A 4CZIA 5BPLA 1YAGA 2I7NA 1NGCA 2A3ZA 3VF2A 3UKRB 1DKGD 1NWKA 1SAZA 4H5TA 3U9DA 4Z94A 3GOIA 2HF4A 4FWNA 4PL8A 3VEWA 1QQMA 5F0XA 4CBXA 4PKIA 1WOQA 4B1YB 3FZHA 4B1ZA 5EVZA 3H3NO 4BR2A 3WUHA 2A6AA 3BF3A 2FLOA 5AQXA 4K41A 2D1KA 2AA4A 4F9OA 3ATVA 2E2PA 4IWVA 3ID8A 4I6MB 4BC5A 4BQLA 2PBDA 3AAQA 4AM7A 4IZ9A 2Q2RA 3IUCA 3MMVA 2YHXA 3WT0A 5AQKA 2I7PA 3LM2A 4A2BA 4FOIA 3H45C 3M6GA 2E2OA 3ULEB 5ADXA 3TU5A 1QQOA 4BRFA 4BVOA 5CE3A 3C7NA 1NBWA 2HF3A 1BG3A 3FZMA 4RCHA 3ZX2A 1XC3A 4ISGA 4LC9B 4BR9A 2YJEA 4O5FA 5FPMA 3DAWA 2QWNA 1HKGA 3O1BA 4FWKA 4CI6A 4BGAA 3R9PA 5AFUH 4M7YA 1RFQA 3A5LC 3QFUA 1MDUB 3BEXA 3MN9A 3S41A 1JCEA 2VWBA 3CJ7A 2CH5A 4BR4A 4FO0A 1LCUA 1K8KB 3DXKA 4FL9A 1H1VA 4H0OA 4NO7A 2FSJA 3U8XA 2ZGZA 1BDGA 3FE1A 4XEIA 2QWQA 3VEYA 1T6CA 2W41A 4H0VB 4IJNA 3CJCA 1SZ2A 4FPAA 4K42A 5KPZA 4M7XA 5AQHA 4FOEA 3O6WA 2Q0UA 5AQQA 2GWJA 5AR0A 3A0IX 4BC2A 2YCHA 5AQWA 3D2FB 3M1FA 4B1XB 3L0QA 3VESA 5FPNA 3ULEA 3EZWA 4H5RA 3ZEUB 3U9ZA 1HKCA 2V51B 2HOEA 3H1QA 1GLAG 2ASMA 2NLXA 5ELZA 3LDQA 3HBTA 1Z6RA 3AARA 4J8FA 1X3NA 5KPRA 5EXWA 2P9NA 3VETA 2HMPA 4BRNA 2E1ZA 3QFPA 1HJOA 4BRHA 3EKUA 3EO3A 1NGAA 5EOYA 2DPNA 1K8KA 1NMDA 4BGBA 2CGJA 3CQYA 3U4LA 3LM9A 2GEMA 4WYBA 1JCGA 2P9KB 4IO8A 4BC3A 4C23A 5BN9A 3EN9A 3WXKA 3LDLA 3VERA 1RGIA 1BWFO 2H3GX 2OANA 3QBXA 1LOTB 4HTLA 4FWRA 1ZC6A 3EL2A 1IJJA 2GTDA 4FWQA 4ISFA 4EFHA 2BTFA 2P9PB 4H0TB 5E84A 3VEVA 3GDQA 3QDKA 2QWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TUUA 3CIPA 4FK2A 2E6MA 2PFUA 3UKUB 1S1XA 4W5RA 4CD1A 3AVLA 2QEXN 3DLGA 4JKFA 3D2EA 1DEJA 4FSVA 2RKIA 4AHUA 4MO5A 3O08A 3DLHA 2YHYA 2JGUA 4N41A 3H3OB 1LV5A 4JS5A 4PUOA 3C6TA 4IBNA 4M3ZA 3S3NA 1QSYA 4FLXA 4ZHRA 1VSMA 4FWPA 1HUXA 4BRLA 3J7YP 3KTQA 1U2VB 2O8DB 4PWDA 3BUZB 3ZSWA 4GV9A 1YVNA 5LL6Z 1TYQB 1U6ZA 4BR5A 4WQ5C 4CBWA 1HNXK 1XWLA 5DK5A 3NVMA 2W6KA 4BY9C 4FWOA 4GVMA 4IG0A 2QI2A 4KO0A 1DTTA 3HP6A 4DUYK 4DSFA 5BPMA 3TAEA 1REVA 2KTQA 1MWMA 4H0PA 3QMLA 1J53A 5GINA 1JLBA 3AAPA 2VWKA 1VQON 3ZT2A 3EY1A 1NJZA 5KGXA 1TKZA 4CEQA 5AQYA 3FZLA 1N6QA 3OYLA 4BRGA 4RWTA 1FKPA 2P1JA 3VA0A 4FPBA 2W42A 1VQ6N 1C0GA 3K0SA 2QM1A 2YV0X 1NKBA 4CZJA 4DQ8A 3SI6A 4LFCK 1QHTA 4DU3A 3LALA 3VF4A 5CYQA 2IVPA 5AQMA 3ZSRA 1GLBG 2G8KA 2QXFA 1UA0A 3ZYYX 4CZGA 2BANA 4XH4A 3RMAA 1UOCA 3HPGA 2XY6A 4KB1A 1X9SA 5AQSA 2QKKA 4ISEA 3ZSQA 5KQ8A 3KHYA 3A2FA 4HVJA 1IH7A 5H1SQ 1RDUA 3KK2A 1C1BA 4E89A 4Y0WA 5I3UA 2XY7A 4A62A 2OTLN 5GAGP 3GBTA 3MN5A 4FWMA 3H1VX 4LSLA 3TWHA 4YOWA 3EKSA 1S72N 1C6VA 4W5TA 2XO7A 1E4GT 4JRPA 1Z05A 4H0XB 4YDUA 1CXQA 1RT6A 1JLCA 5JS1A 2E2QA 2NRWA 3WEEA 3L2RA 3ZEUA 3KWIA 2F8TA 3CM5A 1VQPN 2O8BB 1HNVA 3THXB 2HBKA 3V9ZA 3MEEA 3C65A 3C7NB 5JMVA 3PIOL 3VF6A 3F2KA 3NAEA 3PX4A 3C6UA 4E7JA 3OYIA 1XMQK 3QLHA 4ICLA 2FF6A 2HVIA 5E26A 3GG4A 2A5XA 3NF7A 4BQZA 3KKSA 3ASMA 4WE1A 4FLVA 1BA0A 3F9KA 3VGKA 4E7LA 1YTUA 1XQSC 3PLAA 2P9KA 4IG3A 4HHTA 3KJVA 1NLVA 4B9QA 4OKKA 1WNSA 5F1XA 4DR1K 2FSNA 2WOMA 1SV5A 1LWCA 2I5JA 3DXMB 2YHWA 3DLBA 5J1EA 4LF7K 3TSUA 4BRCA 1ZBUA 4JKHA 1BI4A 2E6LA 5AQJA 2IOCA 1KXPA 3TI0A 3SQ1A 3SPZA 4NXMK 4CERA 4DR2K 3QICA 3ZCMA 4OPAA 2YHAA 4DTOA 3I0RA 1HMVA 3A8YA 3S5TA 1IBMK 5ADXH 3RRHA 1UA1A 4XIUA 3Q7CA 4DR3K 4FM0A 4B9LA 4IFYA 5BRFA 3VOVA 4M63C 1BL3A 3NGYA 3V9XA 4IDHA 1EWQA 4F3OA 3TARA 3DM2A 4CHYA 1HKBA 1XUPO 4BR0A 4WCEL 4BG9A 3RSEA 5AZIA 4IDKA 5C2DA 5A2QO 2QKBA 2HHSA 4DU4A 3SAGA 1V4SA 3DWLA 2IVOA 4FW1A 4FJHA 3J8AA 4MFBA 2VCPA 1I39A 3BZCA 4TSXA 5LY3A 2JWLA 4LF6K 3VGMA 4QS9A 4DR6K 4JD2A 3R1XA 2F9WA 4OO1J 1NJIO 4IO9L 4H0YB 3WXMB 3O9UA 2P5OA 4G9ZA 5AQTA 3QIPA 2ITMA 2FSKA 4N76A 2UUBK 2ZE2A 3HSTB 1KLNA 3MWPA 1NGEA 1S22A 3LL3A 3T1AA 4FLZA 4F4KA 4DV0K 1HRHA 2P9SA 4MO4A 5J2QA 4KTWA 5KPTA 1BIZA 1TKXA 2W6LA 1VSJA 3CCVN 2O8EB 3VQ8A 2NRHA 2GUIA 5SZTA 4KHSA 3CETA 4U7BA 1GLLO 3KLHA 3AO5A 3HI0A 2VWJA 3CCUN 4J2EA 5AZJB 3OS0A 3UIQA 5JENA 5C42A 3OYJA 3VQBA 1EETA 3J7ZO 1U04A 4O8UA 4HWIA 5FRMA 4B1WB 2FBYA 4E19A 1NU0A 4BE2A 1NK6A 3WQTA 1SKRA 4CE9A 1FJGK 1NGCA 4KPYA 3UKRB 3QERA 3SUQA 3LP3A 3U9DA 4FWNA 4PL8A 4DV3K 1QQMA 3D6RA 2G8UA 1SL0A 4CW7B 3MEDA 4DTJA 4DR4K 3FZHA 4I9LA 2WONA 3PIPL 3BF3A 3KK7A 3HP9A 2D1KA 3AA5X 3THWA 2E2PA 4JI6K 4KHNA 1CXUA 4IZ9A 3M8PA 4UQGA 2I7PA 3P1GA 2HHVA 5C0YA 4GV3A 1VRTA 2HNYA 1KVAA 2PYLA 5CE3A 4LFBK 1NBWA 4A5AA 4FJKA 1BG3A 1XC9A 2HHQA 4O0IA 4R5PA 3AVHA 1WLJA 5GIOA 4MDAA 5FPMA 4KB0A 4FLWA 3LZIA 4BGAA 4I2PA 5J2PA 2JWKA 4CFCA 1MDUB 1LWEA 3OYGA 1JCEA 4BR4A 4FO0A 2X6NA 3Q7BA 3BGRA 2KFNA 1K8KB 4JRQA 4NO7A 4H0OA 1S1WA 4DF4A 2QWQA 1T6CA 4H0VB 3CJCA 1J54A 1SZ2A 4CJVA 4DFJA 2O8FB 4E7KA 4FK0A 3K5MA 4DFMA 3KWGA 3NVKA 4FZZA 3M1FA 4DTUA 3ZT1A 1SKWA 3ULEA 3EZWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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