1TYQB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
VLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
total genus 57
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqB02
4MLEA 3FZFA 4FWQA 4QS8A 3WEEA 3D2FA 4WQ4A 4WQ5C 1G99A 2V52B 2A3ZA 2QWLA 3ATUA 4CBWA 1ZBSA 2VYPA 3BF1A 4H5TA 5EVZA 5AQIA 3MN9A 4BRGA 2P9PB 3EKUA 3CJAA 4BREA 3CHWA 2A6AA 4CZEA 3BF3A 5BRHA 4FO0A 3UKUA 2F9TA 3VEYA 4A62A 1GLFO 4CZGA 3RSEA 3LM2A 4JHDB 4YDUC 4BR2A 4Y0WA 4H0TB 3H46O 3S41A 1HLUA 4FOIA 2P9KB 2P9LA 4CBXA 4BC3A 1HKCA 1T44A 2F9WA 4FWLA 3CJBA 5FPMA 4A61A 4BRIA 3TU5A 1HUXA 3MN7A 5BRDA 3A5NC 3QFUA 1J6ZA 3M6GA 4WQ4C 3R9PA 3VEOA 4H0XB 3QICA 3DJCA 3U9ZA 4FWRA 3GG4A 3VGKA 5AQUA 3DXMB 3VERA 1GLJO 4XH4A 4H0OA 2VWBA 2E2NA 3ZEUB 2ZF5O 5KPRA 4K43A 4XH5A 1TYQA 2D0OA 5KQ8A 3GBTA 3GDQA 3H1QA 2W41A 4FWSA 4B9QA 1YVNA 2Q97A 4BRKA 4DCHA 1GLDG 3ULEA 4I6MA 3HSCA 1ESVA 1U2VB 4BGBA 2FSKA 3VF2A 4IZ9A 3H6EA 3C7NB 4CD3A 2NLXA 4H0VB 2IVOA 1Y64A 3UB5A 1JCEA 5AQTA 3VF6A 2QWOA 3B8AX 1R59O 4A2BA 3G25A 1Z05A 5AQJA 3SLCA 2E2OA 4PL7A 1NGHA 2P9UB 4IJNA 5I9EB 5LY3A 2IIRA 4ISFA 3WUHA 2GEMA 2OANA 1V4TA 4C23A 4CZKA 3DXKB 4BRQA 4CZHA 3QMLA 2FSJA 4JAXA 5BREA 3O80A 3R8EA 3FE1A 3I33A 4QS7A 2FLOA 1S3XA 4H03B 1BG3A 3GL1A 2E20A 3FZLA 1MA9B 2FXUA 3CJ1A 2GWJA 3ZETB 1P8ZA 1NGGA 3BP8A 4M7XA 5AR0A 1WUAA 3CI5A 2KHOA 3FLCO 5AQLA 2J4RA 1QHAA 5AQNA 1RDWX 5AZIA 1NGCA 5BN8A 3D2EB 3QBXA 4F9OA 3JXUA 1ATRA 5EOYA 4BC5A 3MN5A 1KAYA 2H3GX 2NZTA 5LJVA 3VGLA 4K25A 1C0FA 4BG9A 3C0BA 1TUUA 1ATSA 3GOIA 1GLCG 4JN4A 2E1YA 5AQOA 2HOEA 1SAZA 3A0IX 2ASMA 3W3DA 4PKIA 4CD1A 3HBTA 4FPBA 2UYTA 1IG8A 1K8KA 3GE1A 3VF4A 5AQSA 4Z94A 3LDOA 2A5XA 2E88A 4H5RA 3DAWA 1T6DA 4WYBA 4IXCA 5BRFA 4BR0A 5EX5A 2YCHA 4QS9A 4LC9B 1NGJA 4B1YB 3ID8A 1ZXOA 1SZ2A 1E4GT 1IJJA 1BO5O 2BUPA 5AQXA 3LDNA 1BWFO 5ADXA 1YXQA 3WT0A 1HKGA 1CZAN 1MWMA 4EAHD 2ZWHA 3VEZA 1EQYA 1MDUB 4JD2B 2QXLA 2D0PA 5AQHA 3WXIA 2QWRA 3EO3A 1TUYA 1BA1A 1KXPA 1X3NA 2ASPA 1RFQA 1NGIA 3O8MA 3OHRA 4XEIA 1X9JA 3JS6A 5E84A 4BRCA 2P9SA 2YI1A 4B1ZA 3A5OC 2CH6A 2PBDA 3UE5A 5KQDA 5AQPA 5F0XA 3ZX2A 1QQOA 3HI0A 3WXKA 5ELZA 2Q0UA 1BDGA 2GUPA 5AQYA 3VESA 1X3MA 1V4SA 1H1VA 3A5LC 2P9PA 1BU6O 4EHTA 5AQWA 4ISEA 5AZJB 4AM7A 4FL9A 3ZX3A 4H0YB 5AFUA 3U9DA 4MO5A 3ZX0A 2P9NB 3O5BA 4JHDA 3WQTA 2HF3A 3SK3A 2P9KA 5CE3A 4BGAA 1XUPO 1DKGD 4FPAA 1GLLO 5TKYA 3O1BA 3HZ6A 5F1XA 2YHYA 4CI6A 4BRPA 2ZGYA 3UKRB 1GLBG 3VEXA 2AP1A 5B8HA 4NO7A 3VENA 4A2AA 2PAVA 4MLHA 1T6CA 4AM6A 4EIAA 2FF6A 4FWNA 3HTVA 4XH1A 3DXMA 2W40A 3HM8A 3EKSA 2QWNA 2AA4A 3A8YA 4IO8A 3EL2A 5LJWA 3M1FA 5BPNA 1NBWA 1QZ6A 2Q0RA 4FWPA 3MK6A 3DWLA 5JICA 4M63C 2D4WA 4CZFA 3WXLA 4BRMA 5KPTA 4BROA 1LCUA 3WXJA 1NGFA 5JMVA 3LDLA 3IDHA 1XQSC 1U2VA 5FPDA 4BR4A 3SJHA 4L3QA 3D2FB 3C7NA 3WEEB 5AQMA 2IVPA 3CQYA 1QQMA 4BR7A 1ATNA 2HF4A 3U8XA 3FZMA 5F2RA 4O5FA 3VEVA 3H1VX 2P9UA 1K8KB 4CBUA 2E2QA 2CGLA 3AY9A 4DQ8A 3UKUB 2CGKA 3DXKA 3M3ZA 4KBOA 3RSEB 4BRAA 3A5MC 5AQFA 5ADXH 1Z6RA 2P9LB 4CJ7A 3KZBA 2Q2RA 2QWMA 1DGKN 1E4FT 2E1ZA 1HKBA 3L4IA 3ZETA 2P9IA 3MMVA 1XC3A 3O08A 4H0PA 3H3OB 4CZIA 2P9SB 4BRFA 3L6QA 1LOTB 4BQZA 4J8FA 3SMSA 2FSNA 1NGEA 1TYQB 3FGUA 2V7YA 2I7PA 3D2EA 2E2PA 3KVGA 5FPNA 4BRLA 3D7EO 2GWKA 4BQLA 1YAGA 2IVNA 3CJ7A 5AQRA 3U4LA 4GNIA 4BR9A 2WUSA 3O4WA 5AFUH 4BVOA 2ASOA 2YHXA 2QM1A 4CZMA 1NGAA 3VPZA 3BEXA 4HTLA 3ULEB 1D4XA 4I6MB 1BUPA 2HMPA 3FZKA 1BOTO 3QB0A 4PKGA 2YJEA 2A41A 1SQKA 1JCFA 1C0GA 1BA0A 1HX1A 3J8AA 5EXWA 5AQZA 3O1WA 3H3NO 5BPLA 4ISGA 4GY2B 3AAQA 2ITMA 3VETA 4B1UB 1ZC6A 3ENOA 1NGBA 1NMDA 5E26A 3VGMA 4BRHA 1S22A 4BC2A 3AAPA 4H5NA 4FOEA 1WOQA 3CETA 4BR5A 2QW9A 3VEWA 4M7YA 2CGJA 3H45C 3LDPA 4BRDA 4JD2A 3QDKA 4IJAA 3IFRA 3WQUA 3CIPA 3ENHA 4H5VA 4BG8A 2A40A 4EHUA 2NRHA 2VCPA 1QZ5A 3P4IA 3SMPA 2YJFA 3LM9A 3IMXA 4JNEA 5AQQA 2A42A 2I7NA 1MWKA 4CZJA 1JCGA 3FZHA 3ZEUA 1GLEG 5AQKA 5JLFA 3MN6A 1NLVA 4RCHA 1QQNA 5AQGA 2V51B 4E1JA 5BN9A 4BC4A 1OKJA 4EFHA 5AZJA 5AZIB 4B1XB 3R6MA 3VOVA 5KPZA 3MCPA 4FWOA 2EWSA 3BUZB 3L0QA 3LDQA 5JLHA 3AARA 4B1WB 2P9NA 1RGIA 3O6WA 2ZGZA 3IUCA 2GTDA 2DPNA 1U6ZA 1KAXA 4PL8A 4DB3A 3FR0A 3CJ9A 2CH5A 4FWKA 1YUWA 4O8KA 3CERA 2Q36A 4MO4A 2GELA 1NM1A 4FWMA 1HJOA 4WQ5A 3EZWA 4RWTA 4K42A 4FSVA 4K41A 3EN9A 3I8BA 1KAZA 4BVPA 3UKRA 2Q31A 3QFPA 1Q18A 2P9IB 3CQXA 3FFKB 3QBWA 5BR9A 1DEJA 4DHYA 4B1VA 2Q1NA 4IWVA 4NB4A 3ATVA 1HPMA 3W0LA 1GLAG 1NGDA 3CJCA 5EY4A 2FF3B 3LL3A 4CZLA 3F9MA 4YDUA 3TPQA 2QWPA 2QWQA 2BTFA 5FPEA 2D1KA 4RTFD 2YHWA 5BPMA 4PKHA 2V7ZA 4H5WA 3MDQA 4HWIA 3KHYA 4BRNA 2E8AA 5AQVA 1NWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWQA 4QS8A 4JKDA 1BL3A 3MXMA 4RG8A 3E9OA 4PA1A 3NE6A 4JKEA 5CYMA 1ZBSA 4CBWA 5EVZA 5M1NA 2HMIA 4C8NA 2P9PB 3EKUA 2W6LA 4DV2K 4CGHA 4DFPA 1E3MA 4KH6A 3IG1A 2NNWA 4DWIA 2F9TA 4A62A 4KTWA 4CHOA 3LM2A 2YNGA 4YDUC 4BR2A 3WNGA 4Y0WA 4U67L 1VQ4N 4KPYA 4UY8O 3TR8A 2P9LA 4CBXA 4EP4A 1KSPA 1KFDA 4DTJA 1T44A 4BE2A 3TTCA 3OW2M 2YKMA 3A5NC 4ZTFA 4FZZA 4H0XB 3R3LA 5C24A 3U9ZA 2ZJPL 1R0AA 3CC7N 5AQUA 2PY5A 3DXMB 4Q5VA 1HRHA 4H8KA 1HR0K 4O8UA 2G8UA 4XH4A 4H0OA 1VQKN 3WNHA 3O4NA 4DSFA 2ZF5O 1TKTA 5KPRA 3CM6A 3D6RA 2D0OA 3O3FA 3GBTA 3GDQA 4DR1K 4CHYA 4B9QA 4B08A 4M3RA 2B5JA 1YVNA 3QIOA 4NLBA 4BRKA 3MEEA 4FLUA 4DQPA 3DRSA 3E9LA 1NK8A 2JWLA 3NBPA 4I6MA 1ESVA 3DLLL 3VQEA 3ZYYX 3C7NB 3DMJA 1SL2A 2HVIA 4CD3A 5BR8K 2NLXA 3UB5A 4C8KA 3P5JA 3ALYA 4A2BA 2UUCK 1HNIA 3SLCA 1KVAA 2HBJA 2P9UB 4E72A 1V4TA 3LPUA 5DM7L 3SQ4A 4E7LA 1YTAA 3I33A 3HM9A 1BG3A 5IT9O 2RE2A 2KZZA 1MA9B 2FXUA 1CZ9A 2GWJA 3SAHA 3ZETB 1NGGA 3SUNA 1LWEA 2Y1IA 3BP8A 1JJ2M 5KTQA 4PY5A 2G8WA 3CI5A 2KFNA 2HHQA 1QHAA 5AQNA 1RDWX 5AZIA 3LWMA 3N4PA 4DTPA 1TKXA 3TAMA 3J80O 4DR6K 1BCOA 4BDPA 1J54A 1UWBA 3LDSA 4CEBA 3UIQA 3HOTA 2BGGA 4K25A 4BDYA 4BG9A 4HUEA 1TUUA 1CXQA 3J81O 4E1MA 2Z1GA 2ATQA 3LZIA 4CD1A 4FPBA 1K8KA 1EETA 1RT6A 4KI4A 4CEEA 3PSFA 4Z4GA 2E88A 1NK7A 2W6KA 1ITGA 1RDCA 4F3TA 2YCHA 4QS9A 1BI4A 4ILGB 3CCLN 2XHBA 1IJJA 1BO5O 3HPOA 3ZSQA 1YXQA 3WT0A 3OYIA 3PX4A 1TL3A 4EAHD 4W5RA 4B9TA 1MDUB 4JD2B 3VA0A 4E89A 3AVAA 4IKFA 3L4QA 2QWRA 3KTQA 3KLFA 3O8MA 4XEIA 4CEFA 3JS6A 2FBTA 4FJ5A 3SBGA 4E7JA 4JEPA 3CCEN 2OCEA 4AHUA 4Z4IA 4RW8A 2XRIA 5ELZA 3VESA 3ZSWA 3A5LC 5E41A 4JI1K 4ISEA 3J7ZO 5AZJB 4AM7A 4WF9L 1Q9XA 3VTHA 4Q0BA 2O8EA 1SS6A 4FJMA 1W97L 3OYFA 4MO5A 3K5NA 1C0TA 5HLFA 3VQ9A 1X9SA 4J2DA 2OPRA 3DOLA 3LPTA 4IG0A 4FVUA 3O9SA 4BE0A 3RMCA 1GLLO 4E1NA 5F1XA 3CM5A 5FDLA 3M8QA 3VQ8A 2YHBA 4NXNK 2C1GA 2IOCA 2YKNA 4B9MA 4EIAA 2AJQA 4FWNA 3QESA 2W40A 4ILHA 1A5XA 3EKSA 2AA4A 3MEDA 3ZCMA 1HYVA 3QNNA 4DV5K 3LAKA 3SQ1A 3Q7CA 3DWLA 1NK6A 4B3TK 2D4WA 3WXLA 4BRMA 1LCUA 5JMVA 1NOYA 3IDHA 1D9DA 5C42A 1EO1A 3N4QA 5M1PA 4L3QA 5AQMA 5K14A 2C1IA 5I3UA 4BR7A 3U8XA 3FZMA 3ZSXA 4CF9A 1O13A 4O5FA 5J2QA 1KFSA 4DTOA 5GAEP 1UOCA 1QVFM 1Z6RA 3SAGA 2P9LB 3QO9A 2ZJRL 2QWMA 1NJXA 1VQPN 2F7TA 4KRFA 3NGYA 3L4IA 2P5OA 2G8VA 1NNEA 4CZIA 4BRFA 4BQZA 3U3YA 2KW4A 1U48A 3HT3A 4CFAA 1S1VA 1VSMA 4X65K 2V7YA 2E2PA 1OVQA 4CVNE 1YAGA 2IVNA 4NYNA 3M8RA 5FRMA 1HQEA 4GNIA 3O4WA 3CMEN 5JS2A 3OJUA 1RDAA 4K8XA 4JV5K 1KTQA 4DU3A 2R7YA 4CZMA 1YJNN 3WNFA 4IFYA 3LP0A 1VHXA 4I6MB 3CMAN 1X9MA 2HMPA 3FZKA 4PKGA 3AVIA 1HX1A 1JCFA 2HHSA 4W5NA 5BPLA 4B1UB 3V1OA 2HBMA 5SZTA 2WBNA 4DSKA 3KWGA 4LSNA 4BC2A 1BHLA 1L3SA 3AAPA 2Q3SA 4K8ZA 4LF9K 4JS4A 3CETA 3BZCA 4KO0A 4M7YA 4E7KA 4KHSA 3H45C 2DTUA 3OYKA 3CPWM 4FLWA 1M1KO 4BRDA 3I55N 3CIPA 3ENHA 1EWRA 4F2SA 2A40A 3LP1A 4JS5A 4IFVA 3CG7A 1VQ8N 1YVUA 1QZ5A 1LAWA 1RBUA 2YJFA 3IMXA 5AQQA 1KVCA 2I7NA 1RT7A 4CZJA 3KLIA 5AQKA 3LP3A 5JLFA 3RVCA 4RCHA 2HNZA 1OKJA 5AZIB 4B3RK 4B1XB 3MCPA 4LY7A 4DFJA 4JI2K 4ELVA 3SCXA 1QVGM 2RPIA 3ZT1A 3HPHA 3O6WA 2GTDA 3M5RA 4ILJA 1B92A 4PL8A 4DB3A 3FR0A 3K9KA 4FWKA 4O8KA 2Q36A 4MO4A 1B9DA 4ICLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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