1U2VA

Crystal structure of arp2/3 complex with bound adp and calcium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
418
structure length
402
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-Related Protein 3
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 402
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1u2vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1u2vA04
3EKUA 2UYTA 3D2EA 5KPRA 3MN5A 5AR0A 1NGCA 4IXCA 2D1KA 5ADXA 1LCUA 4C23A 1Y64A 4PL8A 2E2OA 3U9ZA 2CGKA 3DWLA 2ASPA 2F9TA 2HF3A 2NRHA 4BR7A 3W3DA 3QMLA 2YI1A 4K42A 4RTFD 3HBTA 4DB3A 3SK3A 4PKGA 3AAPA 5AQWA 2GTDA 4FPAA 4Y0WA 3VESA 3ATUA 4EAHD 4BROA 2QWPA 3ZX0A 3H1QA 4BREA 1QQMA 2E20A 1TUUA 4CZLA 2AA4A 3VERA 5JLFA 3VENA 2D0PA 5EY4A 2P9LB 5AQKA 1GLFO 5AQMA 4BQLA 1NMDA 3HTVA 4KBOA 2CH5A 2P9LA 5KQ8A 3A8YA 4E1JA 3H6EA 2QWMA 1BA1A 3H1VX 1OKJA 5BPMA 3A5OC 3CERA 3HI0A 3D2FB 3G25A 2VCPA 4BC3A 2PAVA 1IG8A 1E4FT 1NM1A 3H3OB 3QB0A 2GELA 3LM9A 1ATNA 3CJ1A 3D2FA 1D4XA 3C7NB 4FWSA 3U8XA 3M1FA 1XQSC 2HF4A 4BRLA 2H3GX 4M7XA 2Q1NA 3CI5A 3O4WA 5AQQA 5FPMA 2A40A 3SMSA 4BG9A 3I33A 3BF3A 3C7NA 3KZBA 1JCGA 4H0OA 5AQUA 3ZEUB 3WUHA 3LDNA 1SZ2A 4JD2B 1V4SA 3WEEB 4H03B 4H5TA 2ZF5O 3UB5A 4LC9B 5KPZA 4H0VB 1NGAA 2IVNA 2Q2RA 4WQ4A 4YDUC 3ZEUA 1Z6RA 3A5NC 4ISEA 2J4RA 5FPDA 3WEEA 5AQFA 5JMVA 3O5BA 1S22A 4CZMA 3O08A 3BUZB 4O8KA 4BR0A 1U2VB 3QFUA 5LY3A 2ZWHA 5AZIB 3JS6A 1H1VA 1V4TA 2ITMA 1NLVA 4MLHA 3HZ6A 4BR5A 3FZKA 1X3NA 3O8MA 2V7YA 4WQ5C 1J6ZA 4CI6A 1S3XA 5AZIA 4BRIA 1MWKA 5AQTA 1E4GT 4A2AA 2Q36A 4BVPA 4FWPA 1KAXA 5AQJA 4CZEA 1MWMA 3VF6A 4CD1A 1GLJO 3FZFA 3GE1A 2FF3B 3JXUA 2VYPA 2CH6A 1HKCA 3SMPA 5ELZA 2HOEA 3L0QA 1C0GA 1KAZA 3BEXA 4A61A 1QZ5A 1GLCG 2E1YA 3LDQA 5AQIA 2V52B 4FWQA 4I6MB 2FF6A 3FZLA 3VGKA 5BRDA 4JHDB 1ZC6A 5BRFA 4CZHA 3DXKB 3O1BA 2FLOA 4I6MA 1Z05A 4BQZA 4BVOA 4EHUA 4H0PA 4XH5A 3VEWA 1BO5O 4JHDA 1TYQB 4HWIA 3DXKA 4BC5A 1NGIA 1P8ZA 4FWOA 4H5VA 4B1UB 4BC4A 4DHYA 1HUXA 4FO0A 2QXLA 1HKGA 3EL2A 1TYQA 1XUPO 4K25A 4EFHA 3C0BA 5EOYA 5AQPA 1QQNA 5LJWA 4A2BA 2IVOA 3QBWA 4EHTA 1BG3A 1HX1A 4IO8A 5JLHA 2P9IB 3U9DA 5AQNA 4B1VA 1NBWA 4BC2A 1X9JA 1U6ZA 1QZ6A 4JN4A 3WXLA 3CQXA 4NB4A 4O5FA 1EQYA 2YCHA 3MN6A 5AZJB 2W41A 2P9IA 3BP8A 3VGMA 3HSCA 3BF1A 4CZJA 2P9NB 1YUWA 3EO3A 1BA0A 1HKBA 1QQOA 1T6CA 1TUYA 3R8EA 3VF2A 4B1ZA 3KHYA 1HPMA 2YHXA 3MDQA 4BRAA 3CJCA 4FL9A 2NLXA 4H0TB 1RDWX 1DEJA 2P9NA 4BR2A 3A5MC 3CJ9A 2V7ZA 3H45C 4B1WB 1SQKA 1HJOA 4IJNA 1RFQA 4BRGA 4RWTA 1DGKN 3U4LA 4M63C 2YHWA 3WQTA 4BR9A 1R59O 3L6QA 4PKHA 4H0XB 3VEOA 4Z94A 4ISGA 5TKYA 4IZ9A 4J8FA 4QS7A 3QFPA 1BDGA 1BUPA 1NGDA 3DXMB 1Q18A 4H5NA 1HLUA 4FWNA 4BR4A 2Q31A 3M6GA 4M7YA 3SLCA 4CD3A 2CGJA 2I7PA 3EKSA 3H3NO 4WQ5A 3VOVA 4CJ7A 3ZETB 4A62A 1BWFO 4QS9A 5BR9A 3MMVA 3DXMA 2E2NA 1IJJA 4H5RA 2IIRA 2ZGZA 4JD2A 4CBXA 5B8HA 4MO4A 4EIAA 3F9MA 4XEIA 3ZETA 5AFUH 2ASOA 3GBTA 4IWVA 2A3ZA 1C0FA 3SJHA 5AQOA 3ID8A 5BREA 3A5LC 2FXUA 2Q97A 3ZX2A 3ENHA 3CQYA 1U2VA 5AQLA 2FSKA 5JICA 5LJVA 3A0IX 1NGBA 3MCPA 4QS8A 1T44A 2A41A 3IMXA 3FZMA 2D4WA 1GLAG 2V51B 4BRPA 4FOIA 2D0OA 4MLEA 5I9EB 3UKUB 4CZIA 3J8AA 1JCFA 2GWKA 5BPLA 2CGLA 2ZGYA 4FWKA 2E8AA 4RCHA 4BGBA 1KAYA 4H5WA 1BU6O 3L4IA 1GLLO 4CBWA 2GEMA 2P9KB 1RGIA 2QWNA 3CJ7A 4WQ4C 2EWSA 1LOTB 3OHRA 5FPNA 2QW9A 5E84A 2QM1A 4BG8A 5AQXA 1ZXOA 4BRFA 4B9QA 5AQHA 2P9KA 5F1XA 5KQDA 3O6WA 3GL1A 4CZGA 3WXJA 3FFKB 2HMPA 3EN9A 3HM8A 3IUCA 2P9SB 1X3MA 3LL3A 1YXQA 3FE1A 1KXPA 5AQYA 3VEYA 3LDLA 4BRHA 1YVNA 3TU5A 3FR0A 3R9PA 2P9SA 5BN8A 1ATSA 4BRQA 1GLDG 2IVPA 1YAGA 3IFRA 4FPBA 2BUPA 5CE3A 1ZBSA 3CJBA 2P9PB 5E26A 2E2QA 1WUAA 1SAZA 3O80A 1ATRA 3UE5A 3VEZA 3VEXA 4FOEA 2P9PA 3S41A 3WT0A 2GUPA 2W40A 4K43A 2OANA 4FWLA 2A42A 4B1XB 3VF4A 4CBUA 3DJCA 2NZTA 5KPTA 3CETA 4GNIA 5AZJA 1CZAN 3LM2A 2YJFA 3O1WA 4FWRA 5AQGA 4DQ8A 5AFUA 3IDHA 3VEVA 2E2PA 3MN7A 4YDUA 3ZX3A 3FGUA 3VGLA 3LDPA 5ADXH 5BPNA 4JNEA 2QWOA 3UKRB 3QICA 3ATVA 3B8AX 4K41A 3VETA 2Q0UA 4MO5A 4XH1A 3QDKA 5EVZA 4XH4A 4IJAA 1K8KB 3UKRA 4F9OA 4H0YB 2YHYA 5EX5A 2FSNA 4BGAA 3AARA 4HTLA 3R6MA 2PBDA 3CIPA 1MA9B 3GOIA 4AM6A 1K8KA 3RSEB 5AQRA 4AM7A 1BOTO 2QWLA 3EZWA 5AQSA 3KVGA 1G99A 5EXWA 4DCHA 1GLEG 1NWKA 3RSEA 2P9UB 2I7NA 3CJAA 1NGJA 4BRMA 2ASMA 3FZHA 2BTFA 4GY2B 4PL7A 1NGGA 4BRDA 3ENOA 1QHAA 3W0LA 2VWBA 2P9UA 3AAQA 1GLBG 1XC3A 5FPEA 3GG4A 2A6AA 5F0XA 3MN9A 2QWQA 3MK6A 4B1YB 4BRCA 4CZKA 3LDOA 1NGEA 4NO7A 3ULEB 1DKGD 3CHWA 1WOQA 5BRHA 3AY9A 1JCEA 4BRNA 2KHOA 5BN9A 1NGFA 2E88A 4ISFA 4PKIA 2A5XA 5AQVA 3TPQA 3WXIA 3WQUA 3WXKA 4FWMA 2FSJA 3ULEA 3M3ZA 3DAWA 4JAXA 3UKUA 3QBXA 1ESVA 3H46O 2YJEA 2Q0RA 4WYBA 2DPNA 4BRKA 5F2RA 2WUSA 3FLCO 3GDQA 3VPZA 2GWJA 3D7EO 1T6DA 2QWRA 3D2EB 1NGHA 2E1ZA 3P4IA 2AP1A 2F9WA 3I8BA 5AQZA 1MDUB 4FSVA 4L3QA 4CZFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KPRA 3SPZA 3CYGA 3MN5A 4KPYA 4PL8A 2RF2A 3OYHA 4FK0A 2NUBA 1BQNA 2BH1A 3T1YK 3DWLA 1SKRA 1S9GA 4Z4FA 1TKZA 1LW2A 4BR7A 5M1PA 4RTFD 3QERA 1XC9A 1RDCA 5HP1A 3HBTA 3HPHA 2KTQA 3SK3A 3AAPA 4CF9A 3QIOA 4RG8A 3RRHA 3TTFA 2ITGA 2GTDA 4ELVA 3P5JA 5DM6L 2JWLA 4EAHD 4K8ZA 1EXQA 3CCEN 5CZ1A 4BROA 3VTHA 3JYTA 4ILHA 3RMAA 1TUUA 4X62K 2HB5A 2AA4A 2UUCK 3CD6N 5EY4A 4B3RK 1IKVA 4BQLA 1C0TA 4KBOA 1ASUA 3C94A 4E7IA 1GOAA 1JLEA 4O5BA 1ZBUA 1NK5A 1Q82O 1FK9A 3H1VX 1SUQA 3SZ2A 4DTUA 4AQYK 3L3VA 4CJTA 4CJEA 5I3UA 1NK7A 1E4FT 1KSPA 3H3OB 3KKSA 3QB0A 4NXMK 4KHPK 1K9MO 3LM9A 1J53A 2D0AA 3DI6A 2IC3A 3C6HA 3LWLA 3RR7A 1TKDA 3HVRA 2JGUA 5GIPA 4FLUA 3M1FA 2HF4A 3P39A 4M7XA 2Q1NA 3CI5A 3O4NA 3TAQA 1VQMN 3TI0A 1HMVA 3I0SA 5C12A 3KD5E 5AQUA 3ZT4A 1Q8IA 4UY8O 3LDNA 5HRNA 3MWPA 1DTQA 3WEEB 1BL3A 4H5TA 2ZF5O 3UB5A 3KLGA 1QSSA 1RDAA 1CXUA 1X9MA 1Z6RA 2J4RA 4B9MA 5FPDA 3Q7BA 3NFAA 4DQRA 5JMVA 1S22A 4YOTA 4JI2K 4CFBA 3HM9A 4XJXA 4CEBA 4LD0A 4CGHA 2ZWHA 1M90O 3L4QA 4G9ZA 4LF5K 1LAVA 4O55A 2YNGA 3HZ6A 3FZKA 1X3NA 4IOCL 4ILGB 5GAGP 1J6ZA 4C1NI 3MECA 3ZT0A 3ITHA 1E4GT 3BGRA 4OPHA 4A2AA 2OCEA 3TAPA 1KAXA 5AQJA 4CD1A 2NRRA 1VQ8N 4KB1A 4AHUA 2HOEA 3L0QA 1C0GA 4DTNA 4A61A 2E1YA 1S6PA 4DSKA 4E0DA 2RE2A 2GV9A 5BRDA 4I6MB 3FZLA 4FM0A 4M3XA 4YFUA 1KTQA 3HT3A 3AVAA 1ZC6A 1WN7A 3LDSA 4FYDA 3DXKB 2O8BB 1IV0A 4JK7A 4BQZA 3KK7A 1HNWK 4XH5A 1HR0K 4JHDA 1P90A 1TYQB 3Q7CA 1KQSM 4H5VA 4B1UB 3VQAA 3RTVA 4FO0A 3RMDA 1D5AA 2EX3A 4ZTJA 1QQNA 1JXEA 5LJWA 3L2QA 4NYFA 2IVOA 3WXMB 2P5OA 4EHTA 1HX1A 2XY5A 4CHZA 3K2PA 3UIQA 5M1FA 1QZ6A 4CIEA 4O5FA 4J2AA 1VSFA 3ALYA 3G4SN 3PO4A 3HSCA 1JLQA 1BGXT 3PO5A 3QIPA 1SKWA 4DF8A 2E4LA 3KHYA 2ZD1A 4DR1K 2NLXA 1YJNN 1RDWX 2D0CA 4FJ8A 3OJUA 3CCUN 3QEXA 3CJ9A 1RT5A 2V7ZA 1SQKA 1YTAA 4W5TA 4BRGA 1NKCA 1JLGA 1DGKN 4DU1A 1OH5A 2YHWA 3RRGA 1R59O 3DRRA 4EP5A 4H0XB 4FZZA 4Z94A 4AHCA 1WAJA 4IZ9A 4J8FA 5HLFA 3QFPA 4R79A 2XHBA 1HJRA 3L2VA 2YNIA 1FW6A 4M7YA 4CD3A 2DFEA 2CGJA 1KLMA 3F5TA 1D8YA 4WQ5A 3G71N 1S9EA 3O9QA 4QS9A 4DSJA 3KK1A 3MMVA 3DXMA 2ZGZA 3ISNC 4JD2A 3U6FA 4ELTA 1UWBA 3DMJA 4I7FA 1VQ4N 1JXBA 4KHUA 2NRTA 1K73O 2O8EA 5I42A 1RTIA 4DFJA 3NF8A 5FRNA 3NGYA 3U3YA 2D5RA 2FXUA 1NKEA 3ENHA 3QEIA 3CQYA 1NG9A 5AQLA 5C0YA 3PSIA 4C1NK 3MCPA 4QS8A 4KH5A 2UUAK 1DTTA 2D4WA 2D0OA 3SI6A 3F2KA 1Z25A 3LAMA 4CF8A 2CGLA 3OYEA 1S1WA 1KAYA 4OJRA 2B5JA 4CHYA 4H4MA 4H5WA 4KB0A 2YHAA 3O3FA 1FXXA 1QSYA 3CJ7A 1RGIA 4WQ4C 4IEIA 1LOTB 5FPNA 4DG1A 4K8XA 4B8AB 3RMBA 1VRUA 5AQXA 1ZXOA 5AQHA 2P9KA 5KQDA 3GL1A 4DTMA 4CJQA 4RW4A 3LL3A 2PYJA 3MEEA 4MFBA 3CCQN 4OKKA 1YVNA 1OVQA 1CLQA 2UU9K 2IVPA 3IFRA 4CFCA 1JLCA 1ZBSA 1WSHA 4DU3A 4B3SK 3T19A 5E26A 3CCLN 2RN2A 1FKPA 3LAKA 3D45A 3TTDA 1ATRA 3DLHA 2BE2A 4X66K 1RT4A 4FOEA 2P9PA 2QTDA 4CJWA 3LZJA 5HRPA 3J7AP 2HHWA 1TKTA 1LWEA 3OVNA 4CEOA 3CETA 1CZAN 3LM2A 2YJFA 2R7YA 4OX9K 4KAZA 3AVNA 3IDHA 3PY8A 3QNOA 3MN7A 1J5OA 1J5EK 4YDUA 4DSEA 4AF1A 3NMUA 3AGRA 3IAYA 4DR2K 3VGLA 4DUZK 4O8UA 4F4KA 3QEPA 3HPGA 2E6MA 3VETA 3NHGA 3T7ZA 3QDKA 2XRIA 4G1QA 5EVZA 2OPRA 4JI4K 4IJAA 1K8KB 3UKRA 5C42A 4JRPA 1NJIO 1NK4A 1GOCA 2O4IA 3ZSZA 2PBDA 3CIPA 3GOIA 2HSTA 5KTQA 4DV2K 3DM2A 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4FWSA 3THYB 5AQQA 4BG9A 3CCMN 3CPEA 3KZBA 4B9NA 3NVMA 1JCGA 4H0OA 1WSIA 4JKEA 3D6RA 3WUHA 4DR4K 4BEBA 1V4SA 5GINA 4CHNA 1RDBA 4LC9B 2QKKA 1ITGA 1NGAA 1K8AO 3MXJA 3NH2A 1BIZA 3VQ4A 2OZSA 3A5NC 4ISEA 4E7JA 3WEEA 5AQFA 5CY4A 4EZ9A 4CJ5A 4N41A 4CZMA 3M8RA 4BR0A 4FK4A 1VQ7N 3QFUA 2XY8A 4DUYK 1XI1A 4CESA 3NH0A 4Y1DA 1A5WA 3QINA 4OGCA 2HHUA 4FVMA 2ITMA 4MLHA 1W97L 4BR5A 3I55N 3CM6A 4W5OA 3O8MA 1L3SA 3ULDA 3G0ZA 4IDHA 4BRIA 3OYDA 5AQTA 4Q5VA 4JI0K 4KTZA 2RPIA 4CFDA 4BVPA 4FWPA 4CJKA 1IH7A 4CZEA 3VF6A 1VSDA 2OZMA 1GLJO 1JL2A 2CH6A 3SUNA 3S3OA 3SYZA 4LF6K 4CEZA 1KAZA 1QZ5A 3G10A 5CR4A 4CGDA 2KZZA 2NRWA 3VQEA 2VG6A 3FFIA 1RT7A 4R5PA 1RT1A 3M8PA 4I2PA 4B08A 4XIUA 4GV3A 1SL1A 4CZHA 1C0MA 2FLOA 4FW2A 4I6MA 1NJWA 2YNFA 4RW8A 4HCBA 4Q0BA 2IAJA 3KLEA 3P83D 4EHUA 1ZYQA 4H0PA 1TVRA 3OS0A 3DXKA 4BC5A 2O8BA 3CCVN 1NGIA 3SQ0A 1N6QA 3ZSRA 4BC4A 2A1SA 4DHYA 2QXLA 1S1XA 2O8DB 1HKGA 3PLAA 4CJSA 1TYQA 1XUPO 4EFHA 4HUFA 1WB9A 3C0BA 5J2MA 3VQBA 3QBWA 4F8RA 5HROA 2O4GA 1BG3A 4CF2A 2IOCA 3V1RA 5JVHL 1S1TA 4JN4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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