The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
93
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structure length |
93
|
Chain Sequence |
GSSGSSGYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| molecule keywords |
Intersectin 2
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| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of human intersectin2 (KIAA1256)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
6
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| structure length |
93
|
| sequence length |
93
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JM9 A; 3A98 A; 2OI3 A; 1AOJ A; 1UTI A; 4Y92 A; 4AFZ C; 2FPD A; 1RLQ C; 2KRM A; 4F17 A; 2HSP A; 1K1Z A; 2ABL A; 1K76 A; 4RTY A; 1TUD A; 2RF0 A; 1UHF A; 1PWT A; 2JMA A; 1NM7 A; 4HCK A; 1NYF A; 2RQV A; 4OMP A; 2DVJ A; 1ZUK A; 4OML A; 4WCI A; 4OMQ A; 4CC2 A; 4J9E A; 1N5Z A; 3VS4 A; 2MCN A; 5IHI A; 1Z9Z A; 1JO8 A; 1MV0 B; 2KXD A; 2PTK A; 1PRM C; 3PVL A; 2J7I A; 5FWB A; 1GCP A; 2DE0 X; 1M30 A; 1W70 A; 2KEA A; 2LNH B; 3M0U A; 2GTJ A; 4E6R A; 3SHW A; 2FO0 A; 2KYM A; 1I07 A; 5GJW B; 5IXB A; 1K4U S; 4LUE A; 2EGA A; 2LX7 A; 4RTW A; 4JJD A; 1QCF A; 2JMC A; 2C0T A; 1PRL C; 2J6K A; 1AZE A; 2I0N A; 1NEB A; 2AKL A; 2F2V A; 1JEG A; 1AWW A; 1OPL A; 1KJW A; 1WXT A; 3EHR A; 5FWC A; 1T3L A; 1WXB A; 1SHG A; 2EPD A; 3NHN A; 2RPN A; 1K0S A; 2EW3 A; 2M51 A; 1XOV A; 1T3S A; 2K2M A; 2EYY A; 3TVT A; 1M3A A; 2A08 A; 1AWJ A; 3VRZ A; 1AWO A; 2O2O A; 2CH4 W; 4R0K A; 2DL5 A; 2ECZ A; 1HSQ A; 1X6G A; 1K9A A; 1MV3 A; 2VVK A; 1QKX A; 2RMO A; 1CKB A; 3IQL A; 3VS2 A; 2F2W A; 5IHK A; 1UUE A; 4HVV A; 1GFC A; 2O31 A; 2DL7 A; 2E5K A; 2EGE A; 3ULR B; 1SSH A; 1BK2 A; 2KE9 A; 3QWY A; 1IO6 A; 2D8H A; 2DM1 A; 2NWM A; 4Z89 A; 1AD5 A; 1GBR A; 3GBQ A; 3NGP A; 2FRW A; 1WDX A; 2HBW A; 2L3Q A; 3U23 A; 2DRK A; 3FJ5 A; 2CH4 A; 2DMO A; 2KT8 A; 2ED0 A; 1LCK A; 1U5S A; 4JPB W; 3I5R A; 3REA B; 1ZBJ A; 2X3W D; 2J6F A; 3REB B; 3VS0 A; 2W10 A; 4RTU A; 1YWP A; 3PVQ A; 4AFQ C; 1TG0 A; 1G2B A; 1UJY A; 3NPF A; 3EG2 A; 2LCS A; 4J9D A; 1WFW A; 2K7A A; 1FYN A; 3JV3 A; 2DL4 A; 4RUG A; 3EG0 A; 1GCQ C; 1M3B A; 1NLP C; 2JS2 A; 2B86 A; 1OV3 A; 1ZX6 A; 3ZL7 C; 2JS0 A; 2EYW A; 1AWX A; 2C0I A; 1WXU A; 2CUB A; 2XMF A; 5I11 A; 1YNZ A; 4AFS C; 1VYU A; 2VKN A; 2KR3 A; 2AZV A; 3EG3 A; 2O9V A; 4Z88 A; 1CSK A; 2K79 A; 2C0O A; 1NLO C; 1UEC A; 1X6B A; 3PE0 A; 1Y0M A; 1UFF A; 1MUZ A; 1SHF A; 1QWF A; 4FSS A; 1V1C A; 4HXJ A; 4D8K A; 4KRT A; 2JM8 A; 2PZ1 A; 4J9F A; 2LZ6 B; 4OMM A; 2DL3 A; 3I35 A; 1K0X A; 2J05 A; 2MOX A; 3M0P A; 3UA7 A; 1GBQ A; 1WA7 A; 2A28 A; 2BTT A; 3H0H A; 1X27 A; 1B07 A; 1T0H A; 4A63 B; 4DEX A; 1BBZ A; 2YSQ A; 1S1N A; 1H8K A; 3RNJ A; 2PNI A; 2NUZ A; 4J9B A; 1PKT A; 2GTO A; 2JT4 A; 3M0Q A; 3VS3 A; 3NMZ C; 2EQI A; 2EVR A; 3H0I A; 2L3S A; 3KFV A; 4J9H A; 4LNP A; 2KYB A; 1ARK A; 2SEM A; 2LQW A; 5ECA A; 2D1X A; 1W6X A; 3UA6 A; 1UHC A; 2DLP A; 4ESR A; 1EFN A; 2QDL A; 4OMN A; 2DRM A; 2H8H A; 1ABO A; 1X2K A; 1YP5 A; 4ZNX A; 1QLY A; 2A36 A; 2CSI A; 2O9S A; 4AG1 C; 4X1V A; 1HJD A; 1JU5 C; 2DIL A; 1JQQ A; 1Y57 A; 2KRS A; 2YUQ A; 2MIO A; 3M0T A; 5I22 A; 1CKA A; 2FPF A; 2YT6 A; 2J6O A; 2BZ8 A; 1KSW A; 2HEQ A; 5HCK A; 3C0C A; 4CC7 A; 1QWE A; 2KRO A; 2CT3 A; 1GRI A; 1PKS A; 2ENM A; 1Z9Q A; 2DX1 A; 1ABQ A; 4CC4 B; 1VYT A; 3LH5 A; 2EBP A; 5L23 A; 3I5S A; 3VS7 A; 2LQN A; 2KNB B; 2FG0 A; 2GGR A; 3THK A; 3TSZ A; 2FEI A; 4OMO A; 1RUW A; 1UE9 A; 1VYV A; 1UJ0 A; 1GFD A; 2FPE A; 2KT1 A; 2X3X D; 2J06 A; 2VWF A; 1X2Q A; 1WI7 A; 1UGV A; 2CT4 A; 1WIE A; 3H41 A; 4CC3 A; 1SPK A; 4J9G A; 3VS6 A; 4RTZ A; 2DF6 A; 2RQW A; 2ROT A; 2BZX A; 2EYZ A; 1U06 A; 2CSQ A; 1QKW A; 2KGT A; 2G6F X; 1ZSG A; 1VA7 A; 2DL8 A; 4JJC A; 2DBK A; 1BB9 A; 2GBQ A; 1W1F A; 2D8J A; 3EHQ A; 1OEB A; 1GL5 A; 1NG2 A; 2L3P A; 2CUD A; 2IIM A; 2RQR A; 2LP5 A; 4JZ4 A; 2AZS A; 1KIK A; 1AZG B; 2OJ2 A; 1WYX A; 1PNJ A; 2LJ3 A; 2M0Y A; 2K9G A; 1RLP C; 1J3T A; 5FW9 A; 3VS1 A; 2RNA A; 1M8M A; 4HVU A; 4EIK A; 2YDL A; 1X43 A; 2KRN A; 4RTV A; 2GNC A; 4LN2 A; 2K3B A; 1E7O A; 2JTE A; 2YUP A; 4IIM A; 3TSW A; 1OPK A; 1GCQ A; 3H0F A; 1NYG A; 2D0N A; 2FRY A; 3CQT A; 4GBQ A; 2ESW A; 2LJ0 A; 2OAW A; 3I9Q A; 1M3C A; 2AKK A; 2EKH A; 5IXF A; 2ED1 A; 2YUO A; 2AK5 A; 3EG1 A; 1YWO A; 2LMJ A; 3R6N A; 1A0N B; 1E6G A; 2BZY A; 1U3O A; 1ZUU A; 1SRM A; 4HVW A; 3UAT A; 4ORZ A; 4JZ3 A; 4LE9 A; 5IH2 A; 2W0Z A; 4J9C A; 4RTT A; 1WLP B; 2RQT A; 4GLM A; 1TUC A; 1AEY A; 4RTX A; 2F2X A; 4DEY A; 2EGC A; 1AVZ C; 1YN8 A; 1SRL A; 4K11 A; 1T0J A; 1FMK A; 1RI9 A; 1E6H A; 2DJQ A; 3RBB B; 1NEG A; 2DNU A; 2JXB A; 3M0R A; 2GQI A; 4JJB A; 1ZLM A; 1H92 A; 2CRE A; 2RN8 A; 1JXO A; 1KFZ A; 4F14 A; 2ROL A; 3VS5 A; 3O5Z A; 2KXC A; 4QT7 A; 2HDA A; 3VRY A; 2A37 A; 4AFU C; 1OOT A; 4IIO A; 2L2P A; 1YCS B; 1I0C A; 3QWX X; 2LJ1 A; 5GJV B; 1PHT A; 2DBM A; 1H3H A; 1UDL A; 2V1Q A; 2SRC A; 2CDT A; 2YUN A; 2JW4 A; 2L0A A; 5IHN A; 1WX6 A; 4Z8A A; 4J9I A; 4F16 A; 2O88 A; 2V1R A; 2RQU A; 4AG2 C; 4D8D A; 1UG1 A; 3UF4 A; 1I1J A; 2EYX A; 4LUD A; 1G83 A; 2DYB A; 3SEM A; 1SEM A; 1B3Q A; 4M4Z A; 1HD3 A; 1ZUY A; 3M0S A; 2KBT A; 1M27 C; 2K6D A; 2P4R A; 1JXM A; 3EGU A; 1X69 A; 2DA9 A; 1BU1 A; 5EC7 A; 2HCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JM9 A; 4XU2 A; 3CCM T; 2CP6 A; 2OI3 A; 1KK7 A; 4M78 C; 3UT1 A; 1UTI A; 4Y92 A; 2FPD A; 1XJW B; 4RTY A; 1RAF B; 3HSB A; 1PWT A; 2Z0W A; 1JJ2 P; 4OGC A; 1NM7 A; 4M77 G; 4HCK A; 2RQV A; 2MWO A; 1ZUK A; 2LDM A; 4WCI A; 1Q7Y C; 4CC2 A; 4JRP A; 1PG5 B; 5CKB A; 3VS4 A; 1VQM Q; 1Z9Z A; 2YXY A; 1UGR B; 1YI2 Q; 1OZ3 A; 3LWI A; 4RMO A; 3JCM W; 3PVL A; 2CKK A; 2FYK A; 2PVD B; 2RJD A; 1M30 A; 2EKO A; 3QZ5 B; 3OY9 A; 2RHX A; 1U8R A; 1OU8 A; 2E6N A; 3LX7 A; 1I07 A; 2XU8 A; 5GJW B; 1VQL Q; 3UDC A; 1YIT Q; 2L8D A; 1VQK T; 1ZSZ B; 2KQW A; 4LUE A; 1K9M C; 1VQ5 A; 1FMV A; 1Y96 A; 2JOY A; 3MET A; 4JJD A; 3AT1 B; 2C0T A; 2J6K A; 4E47 A; 1NEB A; 1JEG A; 2BKD N; 4GLK A; 2BIV A; 3PFS A; 3JB9 J; 1OPL A; 1KJW A; 3PIP A; 1YJ9 Q; 1T3L A; 4PJO F; 2WAC A; 4MZP A; 1NBE B; 2OX7 A; 3TU4 K; 2RPN A; 4F7U E; 4FW2 A; 2M9U A; 1IHV A; 2YLB A; 2QA4 A; 4KT0 E; 2E64 A; 4M77 D; 1AWJ A; 2BE9 B; 1U1S A; 3GOX A; 2CH4 W; 5A0L A; 4R0K A; 3CD6 Q; 1NPP A; 2LC4 A; 2X51 A; 3V8J A; 4ZGD B; 1CKB A; 5IHK A; 4HVV A; 1GFC A; 2K3X A; 3CEY A; 2QGF B; 1D0Y A; 3L2R A; 1AD5 A; 3INZ A; 1TWB A; 2R58 A; 1JJ2 A; 2AHJ B; 2E4H A; 1X01 A; 1ZSZ A; 3UPU A; 1U1T A; 5LJ3 f; 2CH4 A; 2DMO A; 1WHJ A; 2R5M A; 3I5R A; 5LJ3 e; 3FRN A; 2X3W D; 3REB B; 3HPW A; 1WZO A; 2JTF A; 3VS0 A; 4M77 F; 3RMQ A; 3BDL A; 3H6Z A; 3PVQ A; 1G2B A; 4PNO A; 2DEU A; 3BE3 A; 1MMN A; 4C92 C; 3X28 B; 2PUO B; 1OU9 A; 4EPC A; 4O5V A; 1TU0 B; 4QKU A; 1FYN A; 4BDZ A; 4M7A E; 2B86 A; 3FB9 A; 1OV3 A; 2EAY A; 2KY9 A; 2CUB A; 3CCR A; 4KGZ B; 3GPL A; 2LCC A; 3OS2 A; 2KR3 A; 2E5Q A; 2O9V A; 2A0F B; 1KD1 C; 1CSK A; 5GAN d; 2C0O A; 2X35 A; 1MUZ A; 1AHJ B; 4D8K A; 2PZ1 A; 3J80 E; 2K5L A; 4BY6 C; 1K0X A; 2MWP A; 1VQ8 A; 1PCX A; 3L42 A; 2FZG B; 3UA7 A; 5M9O A; 2RK2 A; 4HT9 A; 2LT1 A; 1VQM T; 1K9M R; 2OTL A; 1S72 A; 1YI2 T; 5D7U A; 1PSF A; 2E3I A; 2CZ1 B; 1MND A; 4IUV A; 3RNJ A; 2PNI A; 3QPH A; 4XTW A; 4KUI A; 3LYI A; 3M0Q A; 4EMK C; 2RHI A; 4A4H A; 3H0I A; 2CYZ B; 3KFV A; 3RES A; 3J81 E; 4J9H A; 1RAI B; 3NTH A; 1VQL T; 3NTI A; 3I56 A; 2LQW A; 1YIT T; 3LH0 A; 3TQ7 P; 1VQ5 Q; 1UHC A; 1EFN A; 4B9X A; 1X2K A; 4ZNX A; 1X6O A; 5GMK h; 1HJD A; 3M55 A; 1YJ9 T; 2CZ6 B; 1JQQ A; 1Y57 A; 3HL8 A; 1D1C A; 1EX4 A; 2KRS A; 4MMK A; 1CKA A; 2FPF A; 5GAN 4; 3EAE A; 3CD6 T; 2HEQ A; 2ZCF B; 4MZT A; 3C0C A; 3P8H A; 4M75 A; 4ZGE B; 2KRO A; 5GAO r; 1PKS A; 2E6Z A; 1TH7 A; 1VYT A; 3LH5 A; 7AT1 B; 3A8O B; 2LQN A; 5GAM j; 3TSZ A; 2E65 A; 3M58 A; 3S6W A; 2LTO A; 4OMO A; 1GXI E; 2RI2 A; 1SSF A; 2EQU A; 5GMK i; 1VQ9 A; 1UJ0 A; 4JS5 A; 3QO3 A; 2RD1 A; 3CCM A; 2CT4 A; 1WI7 A; 3H41 A; 2BE7 D; 1SPK A; 3CC4 Q; 5KH6 A; 3OYA A; 1EZZ B; 4A4E A; 4A4G A; 4IUQ A; 4JLI A; 2HKQ B; 2EYZ A; 4XTY A; 4PLL A; 2PU9 B; 2VV5 A; 2KGT A; 1YJW Q; 5I2S A; 1ZSG A; 2DBK A; 2D8J A; 1OEB A; 2RQR A; 2CUD A; 2Y90 A; 4IUT A; 4HCZ A; 4FT4 A; 4LDX A; 2PUK B; 2M0Y A; 1G3Y A; 1OX8 A; 1RLP C; 5FW9 A; 3VS1 A; 2RNA A; 1VQK A; 2YUP A; 4M78 G; 4XTZ A; 3HRT A; 3RDV A; 4GBQ A; 2ESW A; 1BCO A; 2RK1 A; 1N8R C; 3NTK A; 3EG1 A; 1E6G A; 3QJY A; 1SRM A; 3UAT A; 2RJC A; 4PLI A; 1IXD A; 4JZ3 A; 1BYM A; 2W0Z A; 2MF2 A; 4EMH A; 2RM4 A; 3E1S A; 3HRU A; 3L2U A; 5AT1 B; 1WJR A; 4DEY A; 1YN8 A; 3WVE B; 1Q95 G; 4X34 A; 3E9G A; 5GAN g; 3CXC S; 8ATC B; 4C8Q B; 1VQ5 T; 1IGQ A; 3OW2 A; 4DOV A; 3L1A A; 5KCH A; 5KE2 A; 2DJQ A; 3RBB B; 3CME Q; 2JXB A; 2F5K A; 2RHY A; 4HT8 A; 4M7A C; 4FYX B; 4M78 D; 4C0D B; 3BDU A; 1JXO A; 3FEO A; 4QW2 A; 4F14 A; 1N9R A; 2ZPG B; 2WSC E; 3VS5 A; 3M4G A; 2QDY B; 4B9W A; 4ANJ A; 2NUT B; 3G4S Q; 3O5Z A; 4QT7 A; 1QVG S; 3L2V A; 1KQS S; 2GF7 A; 1WJQ A; 4IIO A; 2L2P A; 1YCS B; 1I0C A; 3QWX X; 4QQG A; 1NJI C; 1AT1 B; 2E41 A; 1H3H A; 3CCL Q; 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2E3H A; 3GLX A; 3GP8 A; 4ZTF A; 4JJN K; 3OS0 A; 1R0C B; 2ECZ A; 1X6G A; 1YJN A; 4J7F A; 5GMK m; 3VS2 A; 2X9H A; 2ATC B; 1UUE A; 2VYT A; 3RER A; 3CXC P; 2F5T X; 3CME T; 2A7Y A; 2O31 A; 2EGE A; 1SSH A; 4XTU A; 1BK2 A; 1PD1 A; 1IO6 A; 2D8H A; 4Z89 A; 5DLO A; 2FL7 A; 1SG5 A; 5LL6 S; 3GNF B; 1DJ7 B; 2FRW A; 1G3T A; 1WDX A; 2HBW A; 3G4S T; 2CZ7 B; 1X75 C; 3FJ5 A; 3QKJ A; 2KT8 A; 1JRI A; 2ED0 A; 1LCK A; 3QDR B; 8AT1 B; 1QVG P; 4C92 F; 1FXX A; 2J6F A; 4DQ2 A; 1KQS P; 2EIF A; 3CCL T; 5GAO q; 4RTU A; 2HAX A; 4XTX A; 2P84 A; 1TG0 A; 3JCM J; 3LLR A; 1UJY A; 3NPF A; 3JB9 G; 1FX7 A; 1KD1 U; 1VQ9 T; 5GAN 8; 2ZPI B; 1QW1 A; 2QG9 B; 5KE3 A; 2CP7 A; 1Q81 R; 1D0X A; 1GCQ C; 2EQJ A; 3VUZ A; 1ZX6 A; 3SWN C; 3CBP A; 1EIF A; 2XMF A; 2DTI A; 1VQ4 Q; 3OSV A; 4AFS C; 1VIE A; 2VKN A; 3HFO A; 3UWN A; 1MNE A; 2D9T A; 1X6B A; 5KYY A; 4IUP A; 1SHF A; 4PFP A; 4KRT A; 2JM8 A; 2H3J A; 4OVA A; 4BE2 A; 4LDW A; 4OMM A; 3CMA Q; 2XIC A; 3G71 Q; 3H0H A; 1B07 A; 2V8K A; 2P0Q A; 2V26 A; 4F7U G; 4A63 B; 1M90 C; 2QQR A; 4BAC A; 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