1UGBA

Human carbonic anhydrase ii[hcaii] (e.c.4.2.1.1) mutant with ala 65 replaced by gly (a65g)
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHGFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title X-ray crystallographic studies of alanine-65 variants of carbonic anhydrase II reveal the structural basis of compromised proton transfer in catalysis.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1996-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ugbA00
4FIKA 5G0BA 2NNOA 4QSJA 4YGJA 4PYYA 1IF5A 3CAJA 4KAPA 2X7UA 4XZ5A 2ZNCA 3M40A 1BNTA 3M1QA 4E5QA 5DSMA 3BL0A 3OKVA 4CNRA 3KKXA 3M67A 1URTA 2FOUA 3D92A 5E5RA 2W2JA 5CJFA 5JQ0A 4YGFA 1CVHA 1BNVA 2NNSA 2CBCA 2X7SA 2Q1QA 1BNMA 2HOCA 4N0XB 1RZEA 5JQTA 2FOVA 4LHIA 1BNUA 5FL4A 3B4FA 1FSQA 4ZX1A 5JESB 1TG9A 4FU5A 2NMXA 2NWZA 4QK2A 4WUPA 4TWMA 3DAZA 2WEGA 2H15A 1RZCA 3DBUA 5HPJA 2WEJA 3R17B 4JSAA 3KLDB 4QSAA 3MNUA 3OIMA 2NXSA 3MDZA 1YDDA 4R5BA 4K0SA 1DMYA 1UGEA 1JV0A 1JCZA 3MNIA 3TVNX 2IT4A 5FL6A 1LZVA 3RZ7A 5EHVA 1YDBA 1Z97A 4Q78A 1G54A 1G4OA 4CQ0A 1XEVA 3IAIA 1XEGA 4KUVA 1T9NA 5FNIA 5FNJA 3CZVA 1CANA 1CNWA 3PJJA 3BL1A 4CNXA 5EH8A 4G0CA 4HT2A 3D8WA 1CINA 4Q8XA 1LG5A 4Q81A 1HCAA 4YVYA 3Q31A 5AMLA 1CZMA 3JXHC 5L3OA 1I9OA 4Q09A 3SAPA 1IF6A 1FR7A 3EFTA 3M96A 1FR4A 4HT0A 4M2RA 1FSNA 4JSWA 1TB0X 1BNQA 3M1KA 3FE4A 3NJ9A 4CNWA 5DOHA 1CAZA 1YO2A 2FMGA 4PXXA 5FLQA 3QYKA 3OYQA 1MOOA 4X5SA 5L6KA 1RAZA 1CVFA 2CBDA 3SAXA 4YGNA 2EU2A 4KUWA 3ZP9A 4QK1A 4JS6A 1FQLA 3KNEA 4RIVA 5DSKA 1TEQX 5DSLA 3FFPX 1FQMA 3RYVB 4L5VA 5JDVB 1BN3A 5AMDA 1CRMA 1V9EA 5SZ7A 5DSOA 4YGLA 1LGDA 1IF7A 4ILXA 1HEAA 4QJOA 1CAOA 5DSNA 4ZX0A 3M14A 5BRVA 5EIJA 1FLJA 1HEDA 1I90A 3M2XA 1ZSAA 4Q07A 2WEHA 5EHEA 4HU1A 3S73B 3M1JA 3TVOX 3OYSA 1OKMA 4IWZA 2WEOA 3DVCA 4Q7VA 3V3HB 3P5AA 2NWPA 1G52A 1TH9A 5SZ0A 3V2MA 4RFCA 2VVAX 4KNMA 4WW8A 4CA2A 3S71B 5FLRA 1G3ZA 2WD3A 3RZ8A 3S72B 1CAJA 3DC9A 2QO8A 1H9NA 3DC3A 5EKJA 4MLTA 1LG6A 3DD0A 1DCBA 3DCCA 3MWOA 4KP5A 2AX2A 5FNLA 4ZWYA 1CVAA 3SBHA 3KS3A 2FMZA 3KOIA 5DOGA 4QJPA 3K2FA 3UYQA 1CAIA 5E2KA 5C8IA 3GZ0A 1YDAA 1G6VA 2CBAA 1A42A 4E9OX 3TMJA 1CAKA 1CCTA 3DCWA 3OILA 3T84A 4WR7A 4MDLA 3OKUA 1KEQA 4GL1X 1KOQA 1CNKA 4UOVA 5E28A 1IF4A 5DSJA 2WD2A 1ZGFA 4Q06A 5EHWA 1ZE8A 3W6IA 6CA2A 1CA2A 1THKA 1UGCA 1G53A 4KNJA 4MLXA 4Q7PA 3RYZA 1OQ5A 5G0CA 1ZSBA 1G4JA 4QJ0A 4BF6A 4KNNA 4YX4A 2GD8A 1HVAA 1RZAA 3P3HA 4KUYA 2FNNA 3D0NA 3MHOA 3KIGA 3C7PA 3P5LA 3FW3A 4RUYA 1CVEA 3OY0A 1G48A 2HD6A 1KWQA 3IBLA 3N3JA 3V5GA 2NWOA 1BICA 2QP6A 3MNHA 4Z1KA 1CNBA 2AW1A 4RUZA 4Q90A 1CNJA 3RGEA 3M04A 5JEPB 2FW4A 2POVA 1LUGA 1KOPA 1Y7WA 4C3TA 3PYKA 3RZ0B 4XFWA 5JG5B 4FRCA 2EU3A 5EKMA 3M1WA 1CNYA 1TE3X 1BNWA 1HCBA 4K1QA 4RFDA 3IGPA 4E4AA 4ITPA 4KNIA 3M5TA 1F2WA 3F4XA 2X7TA 4R5AA 4Q99A 5JG3B 1H4NA 3MHIA 3S76A 2HNCA 2POUA 5SZ6A 1DMXA 4MTYA 3P3JA 1I91A 3NI5A 2H4NA 1RZBA 3V3JA 2FNKA 3M5SA 4FVNA 1CVBA 3S97A 1UGBA 1TTMA 4WL4A 2O4ZA 1HUHA 3T5UA 4MO8A 4HEYA 4M2UA 3MHMA 4Q8YA 2QOAA 3S8XA 3RLDA 4XIXA 1ZNCA 3JXGA 4Q87A 2EZ7A 1RZDA 4WW6A 3ML5A 1BCDA 2CBEA 5DVXA 3LXEA 2ILIA 4QTLA 3IBNA 3U7CA 5FLSA 1BZMA 3DVDA 1ZSCA 3HKNA 1Z9YA 5DSPA 1G0EA 4MDMA 1BN1A 3DA2A 3F8EA 4LP6A 4N16A 1CAYA 5BRUA 5CACA 1CNCA 5A6HA 3IBUA 4COQA 4M2WA 4YWPA 5A25A 1HUGA 1FQRA 3DVBA 5AMGA 5SZ2A 3IBIA 4M2VA 4BF1A 4CACA 3DCSA 4L5UA 4Q08A 1AVNA 3OIKA 4XE1A 3M2YA 4ETQC 4BCWA 4Q6EA 4ZWIA 4Z1NA 2NN1A 2HFWA 4Q7WA 4KP8A 1HECA 3KONA 2NWYA 3PO6A 5SZ5A 4RN4A 2CA2A 5CA2A 3KOKA 1CIMA 4YHAA 4PQ7A 5JEGB 4Q49A 4QEFA 1I9NA 3V3FA 4Q6DA 3B1BA 3K7KA 3T5ZA 3D9ZA 3MHCA 5DSIA 1TG3A 3N4BA 5DSRA 1CNIA 1CNGA 4CNVA 4QK3A 3BETA 1CCUA 2NNVA 4QSBA 1CNXA 1AZMA 3CYUA 4XIWA 3V2JA 4YYTA 2ABEA 3RJ7A 4RUXA 4ZWZA 4Z0QA 2FOSA 2NXTA 4Q83A 3JXFA 5FDIA 3D93A 1CCSA 4WUQA 4TWLA 1RAYA 3N2PA 4ITOA 3M2ZA 3CA2A 4LU3A 3T83A 3M5EA 1UGGA 4QIYA 5DSQA 3RYXB 1CRAA 3HS4A 3RZ1B 4YGKA 2NN7A 4YXUA 1ZGEA 2VVBX 4ZWXA 3M3XA 3M2NA 2CBBA 3MNAA 3IEOA 3ZNCA 4Q0LA 1Z93A 4E3FA 5EH5A 4Y0JA 5EKHA 5BNLA 1FSRA 1G46A 3SBIA 3MNJA 4Q9YA 4MDGA 5FLOA 4E3GA 4K0ZA 3K34A 3RG4A 3R16A 3MHLA 4RIUA 1RJ5A 1HEBA 3P55A 5SZ3A 3S74B 1MUAA 4QJMA 3RZ5A 3W6HA 4YXIA 3HKQA 5BYIA 5CLUA 5DRSA 5FLPA 1G0FA 1JD0A 3S78B 1BN4A 1YDCA 5FL5A 5BRWA 4Q8ZA 5E2SA 1J9WA 3M98A 5LMDA 1CILA 1ZH9A 4KV0A 1I8ZA 1OKLA 5J8ZA 3DV7A 4Z1JA 5E2RA 4DZ7A 1I9MA 5SZ4A 1G1DA 3L14A 3S75B 5JEHB 1IF8A 1UGDA 5FNKA 1ZFKA 4JSZA 1ZFQA 3HKTA 7CA2A 3T85A 5JGTB 5FNHA 1FQNA 4QIZA 4K13A 1CAMA 2FOQA 4HEWA 2NNGA 4IDRX 4K0TA 3RYYA 4FL7A 1G45A 1CALA 2FNMA 5E2MA 2HL4A 3HLJA 5G01A 3S77B 2F14A 3RYJB 3VBDA 1OKNA 3HKUA 4E3HA 4Q7SA 4HBAA 5EZTX 4HEZA 5E2NA 3V3GB 8CA2A 1UGFA 1TBTX 3P58A 5EOIA 1I9QA 3P44A 5FNGA 3MMFA 3U45X 5FLTA 2Q38A 4FVOA 4E49A 4ZAOA 2FOYA 1IF9A 2OSMA 4E3DA 3UYNA 4QY3A 1KWRA 12CAA 1CNHA 1EOUA 3F7UA 2HKKA 3NB5A 1BNNA 5IPZA 4QSIA 1RJ6A 4Z1EA 1YO1A 4QJXA 3U47A 1I9PA 3HFPA 5EH7A 4PZHA 2OSFA 3EFIA 1BV3A 2POWA 2NXRA 4FPTA 1CAHA 5G03A 4DZ9A 3S9TA 1DCAA 3DD8A 5E5UA 3P4VA 3V7XA 4R59A 3KWAA 1AM6A 4L5WA 3MNKA 1CVDA 3RG3A 5JGSB 4HF3A 2CABA 4YXOA 3F7BA 3V3IB 3U3AX 5SZ1A 1YO0A 4JSSA 1XQ0A 2Q1BA 3N0NA 5FNMA 9CA2A 3ML2A 3MYQA 1XPZA 2GEHA 4G7AA 3MZCA 4QJWA 1H9QA 1I9LA 1V9IC 1UGAA 4PYXA 1CA3A 3T82A 5FDCA 1CVCA 1TEUX 4RH2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FIK A;  5G0B A;  2NNO A;  4QSJ A;  4YGJ A;  4PYY A;  1IF5 A;  3CAJ A;  4KAP A;  2X7U A;  4XZ5 A;  2ZNC A;  3M40 A;  1BNT A;  3M1Q A;  4E5Q A;  5DSM A;  3BL0 A;  3OKV A;  4CNR A;  3KKX A;  3M67 A;  1URT A;  2FOU A;  3D92 A;  5E5R A;  2W2J A;  5CJF A;  5JQ0 A;  4YGF A;  1CVH A;  1BNV A;  2NNS A;  2CBC A;  2X7S A;  2Q1Q A;  1BNM A;  2HOC A;  4N0X B;  1RZE A;  5JQT A;  2FOV A;  4LHI A;  1BNU A;  5FL4 A;  3B4F A;  1FSQ A;  4ZX1 A;  5JES B;  1TG9 A;  4FU5 A;  2NMX A;  2NWZ A;  4QK2 A;  4WUP A;  4TWM A;  3DAZ A;  2WEG A;  2H15 A;  1RZC A;  3DBU A;  5HPJ A;  2WEJ A;  3R17 B;  4JSA A;  3KLD B;  4QSA A;  3MNU A;  3OIM A;  2NXS A;  3MDZ A;  1YDD A;  4R5B A;  4K0S A;  1DMY A;  1UGE A;  1JV0 A;  1JCZ A;  3MNI A;  3TVN X;  2IT4 A;  5FL6 A;  1LZV A;  3RZ7 A;  5EHV A;  1YDB A;  1Z97 A;  4Q78 A;  1G54 A;  1G4O A;  4CQ0 A;  1XEV A;  3IAI A;  1XEG A;  4KUV A;  1T9N A;  5FNI A;  5FNJ A;  3CZV A;  1CAN A;  1CNW A;  3PJJ A;  3BL1 A;  4CNX A;  5EH8 A;  4G0C A;  4HT2 A;  3D8W A;  1CIN A;  4Q8X A;  1LG5 A;  4Q81 A; 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