The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
GSSGSSGSEAEGNQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGNTEWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
KIAA1010 protein
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| publication title |
Solution Structure of RSGI RUH-002, a SH3 Domain of KIAA1010 protein [Homo sapiens]
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
79
|
| sequence length |
79
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TUC A; 2DMO A; 2A37 A; 3PVL A; 2KRS A; 2KRM A; 1UEC A; 1AD5 A; 2HSP A; 1H92 A; 3M0Q A; 2F2X A; 1MUZ A; 1BU1 A; 1M30 A; 1CSK A; 2KT1 A; 1LCK A; 1T3S A; 2LNH B; 2GQI A; 2J6F A; 4AFQ C; 2ED1 A; 1FMK A; 1UG1 A; 4F17 A; 1WLP B; 1PKS A; 3RNJ A; 1U06 A; 2RQT A; 2C0O A; 5IHI A; 2YUO A; 5GJV B; 2O88 A; 1QKX A; 4JZ4 A; 4OMO A; 1OOT A; 2MOX A; 2J06 A; 4OML A; 4LUD A; 3VS3 A; 2BZX A; 2ROT A; 1G83 A; 2DVJ A; 2JS0 A; 4RTV A; 2JTE A; 1WDX A; 1ZLM A; 4Z88 A; 2ECZ A; 3EG3 A; 2LJ3 A; 4LNP A; 1MV3 A; 1QWE A; 5IHK A; 2SRC A; 2YDL A; 4RTW A; 2EW3 A; 2NUZ A; 2LZ6 B; 2GGR A; 2AZV A; 4F16 A; 3SEM A; 1OPL A; 2HEQ A; 5ECA A; 1VYT A; 1OEB A; 4EIK A; 3UA7 A; 4OMP A; 2CUB A; 1U5S A; 2BZ8 A; 2FEI A; 2FRY A; 4J9C A; 1X2Q A; 2EQI A; 4KRT A; 3THK A; 2YT6 A; 4HCK A; 4CC7 A; 2RNA A; 1YWO A; 1PHT A; 2MCN A; 1KIK A; 3VS7 A; 4F14 A; 2CT3 A; 2XMF A; 4CC3 A; 4OMM A; 2YUP A; 3SHW A; 2HDA A; 4GBQ A; 3M0S A; 2EYY A; 1HJD A; 1UJ0 A; 3VS6 A; 3VS2 A; 1ABO A; 2G6F X; 3A98 A; 2EGA A; 4J9H A; 2QDL A; 4CC4 B; 2RQR A; 1AWX A; 5IXB A; 2VWF A; 5IXF A; 5L23 A; 2DX1 A; 1UE9 A; 3VRZ A; 1MV0 B; 3REA B; 1T0J A; 2KRO A; 2F2W A; 1NG2 A; 1SPK A; 1GCP A; 1QLY A; 1K4U S; 1PNJ A; 1Y0M A; 1NEG A; 4J9B A; 1GBQ A; 2ABL A; 3I5S A; 2FRW A; 4D8K A; 2A28 A; 4IIM A; 4LN2 A; 1M3B A; 1GFD A; 4K11 A; 3TSW A; 1UJY A; 2X3X D; 2YSQ A; 2KYB A; 1YN8 A; 2L3Q A; 1WA7 A; 2DL3 A; 2F2V A; 3TSZ A; 1NYF A; 2DJQ A; 5EC7 A; 1YNZ A; 4Z89 A; 2CRE A; 3EHR A; 4RTZ A; 1GL5 A; 4QT7 A; 1E6H A; 1AZE A; 2MIO A; 4OMQ A; 1HD3 A; 4LE9 A; 5I22 A; 4A63 B; 2RQW A; 3I35 A; 1KSW A; 2JMA A; 2RN8 A; 1J3T A; 3NGP A; 1GRI A; 1V1C A; 1X2K A; 2NWM A; 1AZG B; 1OPK A; 2FO0 A; 4FSS A; 1X6G A; 1AEY A; 1YP5 A; 2L2P A; 2K7A A; 2OI3 A; 2IIM A; 1ZUK A; 1UGV A; 2O9S A; 2KE9 A; 1N5Z A; 1H8K A; 1WXB A; 2J7I A; 3IQL A; 3H0I A; 5I11 A; 2KNB B; 2EPD A; 1AVZ C; 2DRM A; 2ENM A; 1H3H A; 2LMJ A; 1UUE A; 1T0H A; 2AK5 A; 1W70 A; 4AG2 C; 4Y92 A; 2VKN A; 1SHF A; 1UHF A; 3PVQ A; 2M51 A; 2DLP A; 2CSI A; 2DRK A; 2AKL A; 2X3W D; 2DIL A; 2O9V A; 1UFF A; 2BTT A; 3M0R A; 3O5Z A; 1VYU A; 2DL8 A; 3EHQ A; 1AWW A; 2V1Q A; 1IO6 A; 3JV3 A; 2CSQ A; 1M3A A; 2E5K A; 3EG0 A; 3C0C A; 3NHN A; 4AFZ C; 3VS0 A; 1Y57 A; 2JM8 A; 2PNI A; 1X27 A; 1K0X A; 2GBQ A; 2DE0 X; 1ABQ A; 1Z9Q A; 1AWJ A; 2BZY A; 2EGE A; 2D8H A; 1RI9 A; 1NEB A; 2J6O A; 2ROL A; 2OAW A; 1GBR A; 2DL5 A; 1EFN A; 3VS4 A; 1PRL C; 1I1J A; 2GTJ A; 2CH4 W; 2A36 A; 4ZNX A; 2CT4 A; 4J9D A; 1SEM A; 5HCK A; 3LH5 A; 2AKK A; 1M3C A; 2EKH A; 3QWY A; 1CKA A; 3ZL7 C; 2JW4 A; 4M4Z A; 2PZ1 A; 3GBQ A; 3M0P A; 1I0C A; 4J9G A; 2A08 A; 1JXO A; 4RTX A; 1GCQ A; 2DL7 A; 2KXD A; 3REB B; 4RTU A; 2I0N A; 1VYV A; 2D0N A; 3QWX X; 1ZUU A; 1RLQ C; 1YCS B; 1JXM A; 2W0Z A; 1PWT A; 2LQN A; 1AOJ A; 4J9F A; 2K9G A; 2OJ2 A; 4Z8A A; 1CKB A; 2KYM A; 1BB9 A; 4HVV A; 2DF6 A; 2CUD A; 1ZBJ A; 2EYW A; 4GLM A; 4LUE A; 1UHC A; 2J05 A; 2JMC A; 4JZ3 A; 1ZSG A; 5IHN A; 1TUD A; 4JJB A; 2W10 A; 1YWP A; 2GTO A; 2KR3 A; 1SRM A; 2KBT A; 1WX6 A; 1S1N A; 4ESR A; 1NYG A; 3M0T A; 4RTT A; 4ORZ A; 1PKT A; 4JJD A; 2JM9 A; 4D8D A; 1UDL A; 1KJW A; 2ED0 A; 3U23 A; 2JT4 A; 2D1X A; 1Z9Z A; 4CC2 A; 1XOV A; 2DBM A; 2AZS A; 3EG1 A; 2HCK A; 2DL4 A; 1WI7 A; 3UAT A; 2EYX A; 2DBK A; 4HVW A; 2RF0 A; 1ZUY A; 1U3O A; 2LX7 A; 1QKW A; 3NMZ C; 4X1V A; 3PE0 A; 5FW9 A; 1JU5 C; 1X43 A; 2LP5 A; 2K79 A; 2RPN A; 2K2M A; 1A0N B; 4WCI A; 1BK2 A; 2V1R A; 1QCF A; 1HSQ A; 2L0A A; 1WXT A; 3ULR B; 3KFV A; 1SSH A; 1RLP C; 2EVR A; 1M8M A; 1E7O A; 2JXB A; 5FWB A; 1FYN A; 2FPD A; 2EGC A; 3R6N A; 2D8J A; 1QWF A; 2RMO A; 2C0T A; 1M27 C; 4HXJ A; 1T3L A; 1JQQ A; 3EGU A; 1NLO C; 4DEY A; 4DEX A; 3M0U A; 1NM7 A; 1ZX6 A; 1W1F A; 3UA6 A; 2P4R A; 2JS2 A; 4J9E A; 2LJ0 A; 3NPF A; 1E6G A; 2KEA A; 3TVT A; 3VRY A; 2CDT A; 1X6B A; 2KXC A; 2YUN A; 2K3B A; 2FPE A; 4RUG A; 4JPB W; 2H8H A; 1BBZ A; 2L3P A; 1K9A A; 1ARK A; 1PRM C; 1B3Q A; 2SEM A; 4E6R A; 2HBW A; 2L3S A; 3VS1 A; 3I5R A; 1W6X A; 2YUQ A; 2DYB A; 2LCS A; 1SRL A; 2ESW A; 4AFS C; 2PTK A; 2RQV A; 1GCQ C; 4AFU C; 2DM1 A; 3H0F A; 5IH2 A; 3VS5 A; 4AG1 C; 1I07 A; 2KT8 A; 2LQW A; 1TG0 A; 4OMN A; 1JO8 A; 1RUW A; 3H0H A; 2KGT A; 1VA7 A; 1AWO A; 2O31 A; 1OV3 A; 1WXU A; 2EBP A; 2KRN A; 1B07 A; 1JEG A; 1NLP C; 1SHG A; 1WIE A; 3EG2 A; 4J9I A; 1WFW A; 4HVU A; 2CH4 A; 4R0K A; 1GFC A; 2FPF A; 1K1Z A; 2C0I A; 3RBB B; 2J6K A; 1K0S A; 3UF4 A; 3H41 A; 3FJ5 A; 1G2B A; 4IIO A; 1K76 A; 2K6D A; 2B86 A; 4JJC A; 2VVK A; 2EYZ A; 2GNC A; 4RTY A; 3CQT A; 2LJ1 A; 3I9Q A; 2RQU A; 1X69 A; 2FG0 A; 5FWC A; 1UTI A; 2DA9 A; 5GJW B; 1WYX A; 2O2O A; 2M0Y A; 2DNU A; 1KFZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3PVL A; 2CP3 A; 8ATC B; 2OTJ Q; 2E3H A; 2BKD N; 3GP8 A; 3OMG A; 3JCM Q; 4MZT A; 4C5H A; 1WHH A; 1MND A; 3L2Z A; 4M78 G; 2QXF A; 4C8Q B; 1M30 A; 1D1A A; 2DEQ A; 1CSK A; 4FIB A; 2V8K A; 3H9N A; 1WHM A; 1FMK A; 2LT4 A; 5GMK m; 2JZ2 A; 2QA4 Q; 4M7A G; 2XHC A; 2RQT A; 1MHN A; 5IHI A; 1X6O A; 3SD4 A; 3CXC A; 3CC7 Q; 2V26 A; 5GJV B; 4JZ4 A; 1JB0 E; 3CCE A; 4LUD A; 3GOX A; 2E10 A; 2ROT A; 4N0A C; 4NL3 A; 1G83 A; 2JTE A; 3SWN B; 2CP6 A; 2HZY A; 2ECZ A; 5CR2 A; 4KGV B; 3NTK A; 1QWE A; 5IHK A; 2SRC A; 3CPW P; 4RTW A; 2LX9 A; 4KH0 B; 5GAO p; 5KE2 A; 1OPL A; 1VYT A; 5FU6 B; 4M75 F; 2E41 A; 4OMP A; 1LPL A; 2L89 A; 1K9M C; 2CZ7 B; 2BZ8 A; 3OMC A; 2P0K A; 2PUO B; 3L2U A; 3THK A; 4HCK A; 3URG A; 3S3M A; 1JJ2 S; 4J6X A; 5KYX B; 2MCN A; 3VS7 A; 1N9S A; 3G1J A; 4B6M A; 1G8X A; 1PD0 A; 1G3W A; 2EYY A; 3X28 B; 1UJ0 A; 3VS6 A; 2WSE E; 5CVI A; 3VS2 A; 3CPF A; 3CCU A; 4AT1 B; 3LWH A; 1H64 1; 1U1T A; 2CZ6 B; 5GAM e; 1M2V B; 1BIB A; 2RHZ A; 2DX1 A; 3QSU A; 5DM7 R; 2JOY A; 5GAN 6; 2GQV A; 2F2W A; 3A8M B; 1Q81 C; 4MMK A; 1K4U S; 2XDD A; 4IIM A; 5GMK i; 1M3B A; 2VAS A; 3TSW A; 2AIR B; 3A8L B; 2X3X D; 1IZ6 A; 1IRX A; 1VIF A; 2L3Q A; 3E9F A; 2F2V A; 1NYF A; 2DK3 A; 2RB6 A; 3G71 Q; 4OMF B; 2QA4 A; 3LYI A; 1VQ7 T; 2MIO A; 1N8R C; 1D1C A; 2RQW A; 4M77 A; 1KSW A; 1J3T A; 3FRN A; 3NGP A; 1D3B A; 5LJ3 f; 3LGL A; 4ATO A; 2BE9 B; 1V1C A; 2HMA A; 4F04 B; 3JCM f; 1YJ9 Q; 2L2P A; 4V2S A; 2OI3 A; 1V29 B; 2KE9 A; 4J7F A; 2DFU A; 3H0I A; 3M55 A; 4OB3 B; 1AVZ C; 3MP6 A; 3CMA Q; 1VQL Q; 2RK2 A; 3WVD B; 2VKN A; 3F70 A; 1SHF A; 4FM4 B; 3J80 E; 2M51 A; 1VQM Q; 2CSI A; 4A4F A; 2DRK A; 3QPH A; 1VQP T; 2X3W D; 2O9V A; 4EPC A; 1TH7 A; 1UFF A; 4PL6 A; 3CCQ T; 1VQN T; 1R0C B; 4M78 D; 1N27 A; 4II1 A; 4BUG A; 2V1Q A; 1IO6 A; 1IB8 A; 2E5K A; 3V7R A; 1JJ2 A; 3VS0 A; 1BIA A; 3CCM Q; 4M7A D; 2GBQ A; 2DE0 X; 2YXY A; 2QEX Q; 1M90 R; 5CKE A; 4D6W A; 1AWJ A; 5LJ5 d; 2JNG A; 5LJ5 h; 1B34 B; 2RI5 A; 3ASK A; 2EWN A; 2OAW A; 2DL5 A; 5FU7 B; 4ZTF A; 3CCV Q; 4EMK B; 2OTL Q; 2E12 A; 2RJF A; 4J9D A; 1MMG A; 4F7U A; 2EKH A; 2QGG A; 2EFI A; 4DA4 A; 4A53 A; 4BD3 A; 2FZK B; 3MET A; 4PLI A; 4M78 F; 2MMP A; 3CCE T; 3OYF A; 5FLX E; 1YIJ A; 3OYB A; 1M90 U; 1RLQ C; 5GAN 5; 1JXM A; 4ZTJ A; 1PWT A; 2E64 A; 2QI2 A; 4J9F A; 4M7A F; 2DKG A; 2L3R A; 2R58 A; 5GAN j; 2OJ2 A; 4C0D B; 2QK0 A; 1ZBJ A; 2HBP A; 1M1K C; 2JMC A; 4JZ3 A; 3QUI A; 1YFN A; 4OB2 B; 2KVQ G; 2CGH A; 4QVZ A; 2DXC A; 3CEY A; 5GMK e; 2E6N A; 1VQK T; 4N4I A; 4ESR A; 1YIT A; 4GLK A; 4ORZ A; 3JCM P; 1PKT A; 4FW2 A; 4PJO A; 3MPU B; 4JJD A; 3M5A A; 4YTL A; 3U23 A; 2R5M A; 1QVF S; 4CC2 A; 1KQ2 A; 4PJO E; 1VQL A; 2E5Q A; 2ZGW A; 2DBM A; 2O4X A; 3PNW C; 3L2Q A; 2RF0 A; 5LJ3 d; 1QKW A; 4DOV A; 4HT9 A; 3OBY A; 4IUV A; 3MO8 A; 2HD0 A; 3CCU T; 3JCM d; 1KD1 C; 1BK2 A; 3KBG A; 1PCX A; 5CAI A; 3QZ5 B; 1SSH A; 1UEB A; 1VOM A; 3O8V A; 3OYD A; 4JRP A; 2EVR A; 1O75 A; 1E7O A; 5LJ5 g; 1K8A R; 3FJP A; 5CQY A; 3MCA B; 1B34 A; 1WHG A; 2EGC A; 2FPD A; 2ZPF B; 1G3S A; 3HRS A; 4DBQ A; 3BW1 A; 3V8K A; 2AT1 B; 2RJC A; 1ZSZ C; 4M75 C; 1W1F A; 2QQR A; 3UA6 A; 1TXQ A; 2P4R A; 3V8J A; 3CPW S; 2EYQ A; 3OS0 A; 1WGS A; 3MEW A; 2LJ0 A; 3NPF A; 1E6G A; 2QA4 T; 2CDT A; 1GXI E; 2FPE A; 3FEO A; 3M53 A; 1XTD A; 2DTH A; 3JCM J; 2MPX C; 1WHK A; 1QCN A; 1K8A U; 3JAM E; 3C94 A; 2LCS A; 2ESW A; 4AFS C; 2RQV A; 3SDZ A; 3H0F A; 5IH2 A; 4OMN A; 1JO8 A; 1VQ7 Q; 2KGT A; 1FMV A; 2PU9 B; 4J6W A; 4M77 D; 3RR6 A; 2O31 A; 1OV3 A; 1NE8 A; 1PM3 A; 1QVG P; 4FSX A; 2K5I A; 2KRN A; 4FYW B; 4M7D A; 2QTV A; 1NLP C; 4KT0 E; 2P4T A; 1IGQ A; 4M7D E; 4R0K A; 1GFC A; 2FPF A; 2DER A; 1K1Z A; 5AT1 B; 2CYZ B; 1RL2 A; 2J6K A; 1QP2 A; 3H41 A; 4HA8 A; 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2HDA A; 3PGG A; 1VQK Q; 4M78 C; 4C0G A; 4PJO D; 2VV5 A; 4MDX A; 2NUT A; 2VB6 A; 2FHD A; 2EGA A; 4J9H A; 4CC4 B; 3PIP A; 1YHQ T; 4WTO B; 3CCL Q; 4M7A C; 1WQ7 A; 1Y96 A; 1WJR A; 1UGP B; 2YWW A; 5GAM h; 1ACM B; 2V8I A; 5IXF A; 5L23 A; 1XNI A; 1MV0 B; 1VQP A; 3OYY A; 1NG2 A; 1SPK A; 1GCP A; 3CCQ A; 1VQN A; 1Y0M A; 1NEG A; 4J9B A; 1K9M U; 5LJ5 j; 4C92 A; 1WZO A; 2ABL A; 2FRW A; 3RMQ A; 3A8H B; 1B7T A; 1UJY A; 2KYB A; 3SFM A; 2VGN A; 2YLC A; 1SF9 A; 3KXT A; 1OX9 A; 3TSZ A; 1Q81 R; 4PJO F; 3CC4 A; 3EHR A; 1RAB B; 1GL5 A; 4PJM A; 2HQX A; 1E6H A; 4OMQ A; 1LJO A; 4A63 B; 2EJG A; 1GRI A; 1NJI C; 1AZG B; 5AYF A; 1OPK A; 4FSS A; 3WVE B; 1YP5 A; 1W2B P; 2IIM A; 1ZUK A; 2K2V A; 1N8R R; 1UGV A; 2DAQ A; 3X25 B; 2LNV A; 1N5Z A; 1MMA A; 1WXB A; 2E70 A; 4IKF A; 2NUP B; 2EPD A; 2DRM A; 3HFN A; 2XK0 A; 1Q81 U; 2P84 A; 2EKO A; 1T0H A; 2AK5 A; 2E3I A; 1TU0 B; 4AG2 C; 2H3E B; 4O6J A; 2JN0 A; 5I2S A; 3PVQ A; 2VXE A; 2DLP A; 1C1A A; 2MK5 A; 2VXF A; 3FB9 A; 4FYV B; 2DIL A; 5A2Q E; 5EG2 A; 3M58 A; 3M0R A; 5LJ5 f; 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