1UP2A

Structure of the endoglucanase cel6 from mycobacterium tuberculosis in complex with glucose-isofagomine at 1.9 angstrom
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
293
structure length
291
Chain Sequence
ANPLAGKPFYVDPASAAVAARNANPPNAELTSVANTPQSYWLDQAFPPATVGGTVARYTGAAQAAGAMPVLTLYGIPHRDCGSYASGGFATGTDYRGWIDAVASGLGSSPATIIVEPDALAADCLSPDQRQERFDLVRYAVDTLTRDPAAAVYVDAGHSRWLSAEAMAARLNDVGVGRARGFSLNVSNFYTTDEEIGYGEAISGLTNGSHYVIDTSRNGAGPAPDAPLNWCNPSGRALGAPPTTATAGAHADAYLWIKRPGESDGTCGRGEPQAGRFVSQYAIDLAHNAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CELA1 PROTEIN
publication title Mycobacterium Tuberculosis Strains Possess Functional Cellulases.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 108
structure length 291
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1up2A00
3A9BA 3VOGA 1OCNA 2BOEX 3VOFA 1BVWA 1OCBA 4AVOA 1UOZA 3VOHA 2BOFX 4B4FA 4AU0A 3RU8X 4AVNA 1QK0A 1QJWA 1CB2A 3ABXA 4I5UA 1QK2A 4AX7A 1HGWA 1HGYA 4I5RA 1GZ1A 3RPTA 1UP0A 4AX6A 2BVWA 3VOIA 4B4HA 1OC5A 1UP3A 1OC6A 1DYSA 2BOGX 3A64A 4A05A 1OCJA 3VOJA 1TMLA 1OC7A 2BODX 1UP2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VKBA 2XFRA 2DORA 4JEJA 3SEPA 1LWIA 4PE8A 3WLOA 2BSLA 5F2MA 4H8NA 4GWEA 5G5IA 4LU0A 1C90A 5A2CA 1EJSC 3AQUA 3RK8A 1E9IA 4E3TA 2OLHA 1T7LA 3NEHA 3OEXA 1VBRA 2XIQA 4KWVA 4FXFA 4H9YA 4MUPA 4Q8UA 3BGJA 3GIYA 3HFYA 5A6SA 4BF9A 3MMUA 2CCRA 3MUY1 3R12A 3W1QA 2BGSA 5GJMA 4C6KA 1XLJA 3TC7A 3LTYA 3R4IA 3LN3A 3ZSSA 4ROPA 1MYRA 3KRUA 3BQ5A 4D6FA 4L56A 8XIMA 2VWTA 1XIMA 2Q3OA 1Z9AA 2F7FA 1UR1A 1TO3A 3WDHA 3GM8A 1PE1A 1UMLA 2ADAA 1JYXA 4DAIA 3GU2A 4A4AA 4ZQOA 2V67A 1A3XA 4H7VA 4QXIA 4DJFC 2X42A 3BLIA 3M64A 1V03A 3G5EA 2P5NA 2QMKA 4CNOA 3DKJA 2G3JA 3W6MA 1EX5A 1VAHA 5JH1A 4H7ZA 1ZNNA 4WY0A 4ZSTA 2XN2A 4NUWA 1ZS2A 3MI2A 1JUKA 1US0A 5CZKA 4PRTA 3WBEA 2PP0A 5DRCA 1W5MA 3NSNA 3ZWSA 2WB5A 3O16A 1HGWA 3KCOA 2G8ZA 4AHQA 1UPMB 3GBDA 3KWXA 4PUEA 3WQPA 1O7AA 4GACA 3UR8A 2OCZA 4YWIA 3FV9A 1VZWA 3G3MA 3VNLA 5I3FA 3CV6A 1OYBA 9XIMA 3WN6A 3NR0A 4WSKA 4D6IA 3A64A 1GK8A 1DL3A 1S2CA 4TTUA 3BICA 3UNTA 1VJZA 4PMVA 2XIMA 2VFDA 3ARPA 2VO5A 4WDTA 4G8TA 2V3EA 2OEKA 3RLGA 1GOOA 2I16A 3WK3A 4F9DA 1KRMA 2P10A 3QC0A 1MWOA 4HNNA 3L4WA 2FYMA 3UR5A 3W29A 1J79A 3K1GA 3RO6A 3QMSA 3THAA 1UR9A 3HGSA 1K7EA 5HNUA 5CBIA 4US5D 3WLLA 1TQXA 1EJVC 1E43A 1FH8A 3PAJA 3FVMA 3APTA 3W1PA 4GYFA 1SZEA 3UJSA 1HKIA 4ERGA 3OJGA 2ZUTA 1WDQA 2DSWA 3A3WA 6REQB 3GHUA 4JTTA 3OGSA 4JEQA 2G5WA 1MUCA 5LSMA 5E0FA 1OFDA 1JPIA 3FSUA 3MZ2A 5XIMA 2XJ7A 5FF4A 3H2AA 4XIMA 1BYCA 3IVUA 1J0JA 4MJ4A 1VFUA 1C8YA 3IIVA 3CPUA 4IQJA 3TQKA 1DIDA 2NSOA 3B0VC 4PMZA 3C2RA 3HURA 1R46A 4FOJA 4ACZA 1OZMA 1UP3A 1UZ4A 3I3EA 4K2SA 3B9AA 2V68A 1FWFC 1HN1A 3CT2A 3R25A 3T0BA 2GGGA 4ZFCA 3USZA 3TIMA 3OA3A 1WZLA 2WHMA 5CJMA 4B5NA 1FDJA 7REQA 3KOXA 1LL4A 2BGNE 4FOUA 1EPVA 5KETA 3FS2A 1NOFA 3RO8A 1OF6A 3R8GA 1JCTA 3GYCA 3P82A 2D0HA 4RV8A 3QF0A 2VC5A 3COTA 3MYOA 3M9YA 3LHYA 4Q6XA 4GKLA 1LBMA 3C0JA 1GVFA 4OT7A 3A5FA 5DBUA 1UUMA 3KRZA 3RCNA 3ZVHA 1NDWA 3GUWA 5A6BD 3FXYA 2JIWA 3DFQA 3WH6A 2VEPA 3WJSA 4O52A 3A12A 1TWDA 2ZC1A 4WHBA 3TNOA 1S5TA 1E9YB 2H6RA 4K7VA 1PO9A 2VZTA 4Z2GA 3I4KA 3KE0A 2DVTA 1GVSA 2I9EA 1NP0A 3W76A 4GH3A 3CHVA 4NZJA 5FJUA 2C14A 1UIOA 1V3JA 2ATMA 3AO0A 2XFFA 1WDRA 5CZTA 1KBLA 1IF2A 4HTYA 4QTGA 3K13A 3QW4B 1VCGA 1X6LA 3WQFA 2QCFA 1MZRA 3CV2A 5CGMA 4NAFB 2IPFA 5LKYA 3BDKA 4RXFA 4QIUA 4AD3A 1GKRA 3WQDA 1M5WA 1EB3A 1EHAA 1F3WA 1E1CA 3AS3A 1QI5A 1DBTA 3G1YA 3GW3A 2ONEA 1XGEA 4GK8A 7TAAA 1TE6A 3OYXA 3OBKA 4M51A 3WK2A 1B31A 3TJXA 2O92A 1MMFA 2QNEA 3N13A 4O8RA 2NV2A 4WJ8A 4AWEA 2ABAA 5I24A 1UC4A 1KRCC 4Q8QA 4H01A 3BJSA 1EO7A 1DQXA 1B3VA 4C6QA 2XVPA 3KS5A 5CSSA 2YW4A 3FOKA 1QHZA 4DJFA 2PFHA 2ZZ5A 3SRHA 3QLLA 3MHUA 4UTJA 3UEQA 4UQAA 3S6OA 3VMNA 4M0XA 3W7NA 3PPGA 1RALA 1TCMA 1UWTA 1H1NA 4MJMA 4U3CA 3EDFA 3D0CA 4FX6M 3W6LA 5MHBA 1EUAA 4QITA 1JFXA 4B16A 4GXWA 2X16A 3O1NA 3R5EA 4C7FA 4JY8A 4MF4A 4MFDA 2IPGA 1JRBA 4IQEA 5FOOA 3OYZA 6TAAA 2XN0A 4BQ4A 2RH9A 2A3EA 2JF6A 3K8MA 4L6HA 1YNPA 3KBJA 3ZMRA 1U1UA 3BMWA 3PZVA 4UTWC 1JRCA 4IT1A 5AC6A 4FF7A 2VZVA 3BMVA 4Z2IA 3ZO9A 4AZCB 5A6JA 4S1FA 4GFSA 2PLMA 4QEEA 5CZSA 1ODZA 3PC0A 2DV0A 2IPWA 3VX1A 2NWSA 3LUTA 5EBUA 3CHEA 3H2FA 2J6VA 2W66A 5BU6A 2QVNA 3BAWA 4ZE5A 3QYQA 2XSXA 1M9HA 2VVSA 3VDHA 3E0VA 1YW1A 1Y65A 5EY5A 1ZHAA 3M0KA 1SW7A 4XO7A 4XTDA 4A05A 3CZEA 4L65A 1W8SA 3VDGA 1J4EA 3GR4A 2ZOXA 1TX0A 1QTWA 4ZOCA 4H2HA 2I1OA 3WL1A 2PWDA 3LGGA 3MVIA 4KGLA 2G3IA 2V81A 4L80A 4DI8A 3U2OA 3CL8A 3GRIA 3A6OA 3G24A 3W2NA 3N2TA 3EWUA 1GVOA 4GNJA 5CG7A 4WDWA 3MUIA 4RE0A 3G6LA 3BV4A 3GG7A 2Y2WA 5DFAA 4GGBA 1KV8A 2EPNA 2BOGX 2QAPA 2HROA 2VX7A 5MKGB 3ES7A 4HPNA 4AYGA 1OY0A 2GUBA 1TV5A 1NSJA 2XU2A 2X2YA 2ZICA 3O6DA 1Z32X 2C19A 1KXQA 4JN6A 3C2FA 1UCWA 5LZLA 3CUJA 3SCOA 4GPNA 3N4EA 3OIXA 1VEMA 5LIKX 1W9DM 4HA3A 1XRVA 4LWWA 3M7WA 2PDUA 2HXTA 1TB3A 3VC5A 4ZB5A 2BS9A 1FWJC 2CW6A 1ME8A 4O18A 3BE7A 2X7VA 4M82A 4AX7A 3CUXA 4Q4SA 1EBHA 4K8HA 3LHWA 3W0KA 3WJWA 4DZAA 4I6KA 4UOZA 1CT5A 4XX6A 3BAJA 3LCWA 1YNYA 3M6YA 3CZKA 3MUZ1 4UNKA 1UIPA 3NGFA 3TH6A 4HNVA 1IT8A 2WZHA 1AW2A 1VIZA 5HOSA 1Q2SA 1IEVA 4W93A 2OZ0A 4FI4A 1OK6A 5CG0A 2DSKA 4FSAA 3WZ0E 2D22A 1RBAA 3QLDA 4DO5A 2W62A 1K6AA 1YIXA 4AEFA 4W8LA 5A2AA 4K8GA 2YXOA 4MB3A 2JF7A 3GG8A 4HCHA 3UWEA 4Z1AA 1ZP4A 2PLKA 1JI2A 4QSHA 3MTWA 5KZMA 4JHZA 2V5BA 4LAUA 2GPTA 2ZX7A 3VPLA 4PODA 2YPIA 3RDKA 2YCEA 4FIRA 3HM7A 4R5EA 4NHVA 5F1UA 2BY3A 3ARRA 2QF8A 2JKPA 5F1VA 2WC4A 2WHLA 4CCCA 1UZDA 3WDRA 2FVMA 4LY8A 3Q94A 5ECUA 1RCOB 1EXPA 3BK0A 3SCNA 3IGUA 1GHRA 1A4MA 1BVZA 2VQTA 3VC6A 1VRDA 4XD6A 2XIOA 2JFEX 2FJKA 1XINA 3V3WA 2O0TA 4KRTA 3TW6A 4KWOA 4BHYA 2X09A 2Y5JA 4WQ6A 5M17A 2VURA 2PDQA 4V1YA 4MGGA 2TPSA 1YKWA 3CPRA 1FOBA 4CCZA 5LXEA 5EMLA 1GVIA 1CPUA 1KTNA 3Q4DA 4ONVA 4CLMA 3QOKA 3UZ5A 1TX2A 2DJXA 3EWCA 1QOPA 1XRTA 3DFYA 3O2LA 3RX2A 4KBXA 2J7BA 2ZYFA 3M6DA 1JXJA 2POZA 1E3ZA 3ONCA 1W31A 3IJLA 3FHQA 2GQ3A 3WX7A 5DMLA 1CXHA 3CPGA 3RXZA 3LG3A 2GVJA 4O8AA 3L5LA 3G2GA 1PKYA 1BAGA 1DQWA 4GI4A 4QE4A 4C5ZA 1M04A 3CH0A 3ABOA 3VVGA 4A8RA 1FVPA 3IJ9A 2CWXA 1HF6A 2YB4A 2VEIA 3LENA 1E4IA 2XH2A 3PWIA 3WLKX 1UWRA 4ZEPA 2OQYA 4ZOAA 3POCA 2V2DA 4D1JA 1OFPA 4HCLA 2EEXA 4Y6GA 5FEPA 5KZDA 1D8WA 4ASTA 3W9ZA 4ZMGA 1AL8A 4R33A 4A8IA 1MW2A 1F4AA 3HU7A 1G4EA 4GI6A 4PA8A 4O1CA 3WLRA 3C61A 3M0IA 3GKAA 4UTWA 4DWDA 4M3PA 1BGGA 4CD8A 4R88A 4IP5A 1LM1A 5JUVA 3DYMA 3LCIA 4FHAA 2HTMA 3SCSA 3GO2A 3URQA 3RM4A 1KM2A 4NJHA 3RITA 2HDJA 3SY1A 4H9MA 1H11A 4IL0A 1KCKA 3P74A 2P3EA 1VFHA 5C54A 1EDGA 2BMBA 1QPOA 3L4YA 2YDQA 1CNVA 3AICA 4HNUA 2W4XA 1HTIA 1O6IA 3G0UA 1V5XA 4A6GA 4IIFA 1W32A 4XAZA 1G9HA 3STPA 3L7RA 1BXBA 4M29A 4HOWA 4GG9A 3MKVA 1R9YA 4NRSA 4US5A 5I00A 2OGJA 4I3GA 2OYMA 2WQPA 4X22A 3GS6A 1XISA 3WQVA 4UFJA 3F5LA 3BJFA 2E6FA 5IFPA 3CB3A 4A21A 4C1LA 3IANA 3WENA 2C15A 3AZTA 4DWSC 1R87A 5EU9A 3CHDA 1KC7A 1UH3A 3AIVA 4JTSA 2V0TA 5AHLA 3B0UX 4Z42C 3NQ6A 3AUOA 4DYJA 2EJ1A 4B5VA 5F2GA 1CGUA 1XIEA 3VD5A 5ABHA 1SO5A 4MDPA 4U3AA 1RQEA 4FMVA 1IIGA 2CIPA 3EB4A 4H04A 3N15A 3URAA 4GNKB 1WX0A 3TNBA 5I79A 3WBYA 1NF7A 1TUXA 2D2JA 2BB0A 2QIIA 4HNTA 5I06A 3TTEA 4WX2A 3W3OA 2XIBA 2BWGA 4ZB2A 4YTUA 1K8XA 4MNKA 1JUBA 1PL9A 2WK2A 1I2NA 3E2RA 1GW1A 1O5KA 3UA4A 2VCAA 3S5ZA 4RDVA 4YVPA 2REQB 1W17A 4NVTA 4LYQA 1HJUA 1B3OA 4K7YA 1IYXA 2UBPC 1M65A 3VYLA 1UKTA 2R1KA 5LIXX 2QCHA 3KL0A 2DQWA 3LCGA 3DC8A 5EL1A 1FWDC 2WCAA 4CNUA 4EWND 1HKVA 3PSWA 3KP0A 4FNQA 2FGBA 1W8GA 2YW3A 1NP2A 3TKFA 1P6WA 1C7TA 3PJTA 4PCSA 2GK1B 2FTPA 2YSWA 2WMJA 6PTDA 3M0HA 3ARQA 1GTHA 5FI8A 5DCEA 1AL7A 3DG7A 4PMQA 8TIMA 2XM2A 4LBRA 5D9MA 2GGIA 5REQA 5FA5A 3RR1A 2JE8A 4AH7A 5D05A 4DLFA 4RL3A 1IGSA 1EKOA 4F0KA 1DQUA 2A1YA 3W4RA 1YPIA 3SUVA 1OB0A 3DFSA 4UTTA 5FF7A 2D24A 1ZSXA 2Z1VA 4JN8A 1ZAJA 4N2YA 4D6CA 2XFYA 1UQYA 3AXHA 4RCXA 1AK5A 1JI1A 1M7OA 3CMJA 1KM1A 1DWIM 3VIFA 1M03A 2YLLA 4O14A 1XYAA 1GOKA 2HVNA 1K9FA 4JKKA 3BOFA 2F61A 1H4PA 1EBGA 2Z28A 2E8ZA 3QKEA 3WF3A 3WMBA 4MAZA 4PMYA 4Y96A 1CXIA 4NJJA 2C0HA 4ZENA 2Z6IA 4CGTA 1FH7A 1UOZA 5ENLA 2WYSA 4O19A 5IBXC 2E3ZA 3DFOA 1B9ZA 3L5AA 3FA4A 3V16A 4LF1A 4B4HA 1YDOA 4HU3A 4AEOA 5K2ZA 1QHOA 2ATSA 3G1FA 5CAKA 3H55A 3WF4A 2BHUA 1GYLA 1LOQA 1JDFA 1X7FA 4GINA 3LRLA 4OUEA 2FIQA 4J3XA 9CGTA 3LNPA 5HQMA 1OGSA 3CLMA 5F2IA 4W5UA 3OO2A 5JVLA 2BP1A 4EACA 5DRIA 4OJYA 3I7RA 3M44A 4LFYA 3VMPA 1H7RA 1QNVA 2PB1A 3W7GA 4PN2A 1H7OA 2ZTKA 3QZAA 4IZGA 4B5WA 2HV5A 4PUNA 2UWFA 4ILSA 3T42A 3MW7A 3CV1A 2V63A 2B7OA 4MNMA 2Y5SA 4CQ9A 4X2PA 3ITLA 3F4DA 3NAVA 4P7LA 2XFWA 1SMAA 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3A9BA 3VOGA 1OCNA 2BOEX 3VOFA 1BVWA 1OCBA 4AVOA 1UOZA 3VOHA 2BOFX 4B4FA 4AU0A 3RU8X 4AVNA 1QK0A 1QJWA 1CB2A 3ABXA 4I5UA 1QK2A 4AX7A 1HGWA 1HGYA 4I5RA 1GZ1A 3RPTA 1UP0A 4AX6A 2BVWA 3VOIA 4B4HA 1OC5A 1UP3A 1OC6A 1DYSA 2BOGX 3A64A 4A05A 1OCJA 3VOJA 1TMLA 1OC7A 2BODX 1UP2A
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 3A9B A;  3VOG A;  1OCN A;  2BOE X;  3VOF A;  1BVW A;  1OCB A;  4AVO A;  1UOZ A;  3VOH A;  2BOF X;  4B4F A;  4AU0 A;  3RU8 X;  4AVN A;  1QK0 A;  1QJW A;  1CB2 A;  3ABX A;  4I5U A;  1QK2 A;  4AX7 A;  1HGW A;  1HGY A;  4I5R A;  1GZ1 A;  3RPT A;  1UP0 A;  4AX6 A;  2BVW A;  3VOI A;  4B4H A;  1OC5 A;  1UP3 A;  1OC6 A;  1DYS A;  2BOG X;  3A64 A;  4A05 A;  1OCJ A;  3VOJ A;  1TML A;  1OC7 A;  2BOD X;  1UP2 A;
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