1UR2A

Xylanase xyn10b mutant (e262s) from cellvibrio mixtus in complex with arabinofuranose alpha 1,3 linked to xylotriose
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
351
structure length
351
Chain Sequence
TGLKSAYKDNFLIGAALNATIASGADERLNTLIAKEFNSITPENCMKWGVLRDAQGQWNWKDADAFVAFGTKHNLHMVGHTLVWHSQIHDEVFKNADGSYISKAALQKKMEEHITTLAGRYKGKLAAWDVVNEAVGDDLKMRDSHWYKIMGDDFIYNAFTLANEVDPKAHLMYNDYNIERTGKREATVEMIERLQKRGMPIHGLGIQGHLGIDTPPIAEIEKSIIAFAKLGLRVHFTSLDVDVLPSVWELPVAEVSTRFEYKPERDPYTKGLPQEMQDKLAKRYEDLFKLFIKHSDKIDRATFWGVSDDASWLNGFPIPGRTNYPLLFDRKLQPKDAYFRLLDLKRLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOXYLANASE
publication title The Mechanisms by which Family 10 Glycoside Hydrolases Bind Decorated Substrates
pubmed doi rcsb
source organism Cellvibrio mixtus
total genus 141
structure length 351
sequence length 351
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ur2A00
4H8UA 4HZ7A 3VIJA 1LJYA 3AHZA 3VILA 2F61A 1PX8A 4R5EA 1U33A 1UD8A 3GXDA 4JFUA 2ZICA 3BAYA 3ARSA 3GXMA 5A3HA 4QCFA 1E4MM 1C92A 2ESCA 1J0KA 4P8WA 3SUVA 3ZMRA 3EDKA 4WKAA 3VX1A 4W86A 2ZUVA 2CITA 4JHZA 4PTMA 4D71A 3D3AA 2NSXA 4WLCA 1E4IA 1BGGA 3MKKA 5I78A 2VRJA 1W2PA 3ARXA 1KXHA 4J3TA 2WWDA 3PTMA 5C70A 3GM8A 3A4XA 1NQ6A 4MTVA 2ZX9A 1QHPA 1B3XA 1B3VA 1WO2A 4JKMA 4ZENA 1KWGA 2WPGA 1C8QA 2UY3A 1OT2A 3VDCA 4PMUA 1UA7A 1JFHA 5AYIA 2YOCA 3CUGA 4X0NA 1Q6EA 3UERA 1BYCA 2VRQA 1R7AA 4IM4A 2NW0A 2DSZA 1ZS2A 1US3A 3OIHA 1C8YA 3WD1A 3VO0A 4CCDA 4W7VA 1NARA 4BQ4A 3AZRA 2X0YA 2CKSA 1HN1A 1GZJA 2DEPA 1SMAA 1OCQA 4HOXA 4JFTA 4UOZA 5F7UA 1E3ZA 1MXGA 3OZOA 1E71M 1JZ8A 2ZUSA 4WKHA 5DT5A 4BS0A 2G3IA 2YBTA 3HN3A 1MWOA 1CPUA 4TTUA 4RL3A 3AMKA 5I6SA 3K4AA 2D22A 1B3ZA 2CBJA 2J47A 1XH0A 1FH7A 2XWEA 5CQ1A 1Q6CA 1JAKA 1GJUA 1J0ZA 5I77A 3VGHA 1UWRA 5D9PA 3GXFA 1IT0A 2VR4A 4Z2GA 4AD3A 4OOZA 1GOQA 2YA2A 3WF0A 1KWKA 3ARRA 1FP9A 1V3KA 1HX0A 3M46A 1UQYA 4QP0A 1OGBA 2IXVA 1E6XM 1QNPA 2EPNA 4MNKA 2ZOXA 2BXZA 4HMEA 4FK9A 4BA0A 3WH9A 4GIAA 1QNRA 5A8PA 2PI6A 5D4YA 1HJSA 3TTYA 3MSDA 3WH5A 3UG5A 4KWUA 1I75A 3QR3A 2ZE0A 3WSUA 3NDYA 2A3CA 1ISWA 1BGAA 2PWFA 5AC5A 1UG6A 1UR0A 3CO4A 4D6EA 1BSIA 1DHKA 4EE9A 2BVYA 3AIBA 4JZ5A 3WKZA 3CPUA 4TUFA 1YQ2A 2BV9A 2E8ZA 2GJXA 3UESA 1ODZA 4FF5A 4HP5A 1UD6A 1GONA 4BCEA 1RH9A 1UKPA 5A94A 9CGTA 2YDRA 4HA1A 3A3HA 1EOKA 3WFZA 4KGLA 3W4RA 1TVPA 4CD6A 5JBEA 1WCGA 1FHDA 5D8ZA 2GJXB 2XSAA 1V02A 2ZUUA 4M56A 3VKKA 2FHCA 1ITXA 1ECEA 4DWSD 4B15A 1L8NA 3BLKA 4IPNB 1QI2A 1JNEA 5GPRA 1XYZA 5FL1A 3FAWA 2ZX7A 4ML4A 1DWFM 3VM7A 5ABGA 2W67A 3OLDA 5IHRA 3EDEA 1DTUA 1HF6A 4WKFA 1VJSA 3MUZ1 1VB9A 4QFUA 4YHGA 5BXPA 3GTNA 2JF7A 5FIPA 1VFMA 1LWJA 4HPGA 4A4AA 1N82A 1XD0A 2J77A 2JEPA 4LXFA 3TTSA 3AMLA 4W8BA 1E6ZA 1B30A 5A8OA 1HJXA 3WQ4A 5E9AA 3ZM8A 4HOZA 2O9RA 3WMSA 3BCDA 1XRVA 1V6UA 1UZ4A 2VL4A 4TVUA 5HDRA 3L4WA 2FGLA 1EO7A 3WNPA 4H7VA 1EDTA 8A3HA 1DEDA 2XIIA 4MJ4A 3VD4A 1K6AA 3T0BA 4GO9A 3AIQA 2WBGA 1XSIA 3IJ9A 2XJ7A 3K1DA 3PZOA 5BCAA 1XHGA 2OSYA 1TVNA 3SCWA 4WK9A 4ZFMA 1W2VA 4K68A 4WF7A 4OUEA 1V08A 3ARYA 3OGSA 1CEOA 4M29A 3KL5A 1KCLA 3PZIA 3OLIA 2XPKA 3B9AA 1ESWA 1SR0A 4GPNA 3NCOA 3BC9A 3WDPP 2OSXA 1QHZA 3OLEA 4JKKA 3APGA 1KB3A 2A3BA 2XFFA 3F5JA 5ABHA 1W32A 4UFMA 1E55A 1KXQA 2NT1A 4F79A 5EBAA 2YJQA 5HPOA 4AZBA 1H11A 4MPKA 3ZJKA 2ZX8A 3PZUA 3BAKA 3CBWA 4W5UA 2X2YA 3WQ6A 3GXIA 3AXXA 1X6LA 2PWEA 2E9BA 4MDPA 1EQPA 1HP4A 3AZSA 1TA3A 3BXWA 2WMJA 4TXEA 2FGZA 4CU6A 4DUVA 3EMZA 5LA1A 4Z2IA 3WFLA 1XV8A 5DT7A 3VDAA 1UD3A 2QMJA 3PZQA 1R87A 2WC4A 3KL0A 1MYRA 4H2CA 3CZEA 3POCA 4W8LA 4AIOA 4CGTA 1OT1A 1NOWA 1XGZA 3LMYA 1HKIA 2WVUA 1BLIA 1NM9A 3BAIA 4QLLA 1UR1A 3B9EA 3PZ9A 1H5VA 3DYMA 2BFGA 1G94A 1JGIA 1NWRA 2Z1KA 1NWSA 3MUAA 1KCKA 2WMIB 1MQQA 1GOKA 2UWFA 4U5IA 1HKJA 1LL7A 2W91A 3I3BA 1LF1A 1M7XA 4PEEA 1OIFA 2DT3A 1FH9A 5CJ5A 2CKRA 2BY2A 1UUQA 3QGVA 4AZCB 2E9MA 4P7QA 1W1YA 3F5KA 2A3AA 1DWGM 1HJQA 4Z2KA 1E40A 1FP8A 3IJ8A 3G6LA 2CBIA 3ZT7A 1UKTA 2XHYA 3MU7A 3WH8A 3NSXA 2VX5A 5JIPA 1CLVA 4NRSA 3AS0A 3EMCA 4AD1A 3VPLA 4XUYA 2XTKA 2D3NA 2VCCA 3DECA 4QLKA 2WHJA 4Y7EA 3N18A 3OLGA 4X0VA 3SUWA 1BAGA 1EQCA 4AZ6A 1QBAA 4P8UA 3WF4A 5HNNA 1QW8A 2GK1A 4M1RA 2DT2A 3FY1A 2GDVA 2WZHA 4F8XA 1JXJA 4AW7A 2VCAA 3D5HA 4P7OA 3LPFA 3U5UA 1OSEA 2Y24A 1AMYA 2J8GA 2DSKA 3BCFA 3VD3A 4LGXA 4PSPA 1H4PA 4UQ9A 5EB8A 4UQAA 4RE4A 1I1XA 5ABFB 2GK1B 4R27A 3IJ7A 3VNYA 2QV4A 3VIIA 1J0HA 3CZKA 4ZE4A 1TMQA 1EHNA 3EMQA 1Q6DA 3W81A 3A4WA 2YDSA 4OKDA 3MUIA 5LA2A 2VZTA 4BQ2A 4ZXOA 4JFVA 1JG9A 3WH7A 3NUKA 1QI0A 2F2HA 3MS8A 4JFWA 1JXKA 3RM9A 1TUXA 1KR1A 4PMYA 3QHNA 4E2OA 5TD4A 2YL8A 5C71A 3U7VA 1W9PA 2Y8VA 4EANA 3TOPA 3CZGA 3WDJA 1QOXA 3IANA 1E72M 1R8LA 4PMDA 2HVMA 2WMKA 1JL8A 1ZBCA 3AISA 4Z2HA 3POHA 1X1NA 2DH3A 3VM5A 2D1ZA 1UZ1A 4DUWA 1RP9A 4KH2A 3VIOA 2VZSA 4GZEA 2BY1A 4J3VA 4N0RA 3GH5A 3VD5A 3T0AA 4CKQA 1VIWA 4W89A 1EHAA 3PZNA 2ZUNA 1ISYA 2BXYA 2XM1A 3WDHA 3FHAA 2YBUA 1UD2A 2EPLX 1V6WA 3DHUA 3VUPA 3ZJ7A 4P7NA 2BHYA 2PBOA 3GBDA 4UZUA 3RJYA 2O9TA 3T09A 1ISZA 4UTFA 1B3WA 1KGXA 4U5KA 2V3DA 1DWHM 2WLYA 4DWSB 1WZKA 3KE0A 3LPOA 3ZOAA 6CGTA 2WMFA 3AIEA 3L4VA 3CTTA 3NSMA 5DFAA 1W9DM 2BVDA 3IAQA 3ZJ6A 2VX6A 2XM2A 3SCSA 4ATDA 3ALGA 3WNMA 1E6SM 2DQXA 1EIBA 2DIJA 1OB0A 7TAAA 3VIKA 2VX7A 4UZSA 1PEZA 4PCSA 1HKMA 1GQLA 4FMVA 3ZIZA 2ZIDA 3BAJA 3EBVA 4MB5A 2WHMA 1UH2A 3L4ZA 1E1EA 2FHBA 3AMGA 3A47A 1F4HA 4W84A 3CUIA 4HA3A 2J25A 3HMCA 3UEQA 1E4LA 1OINA 1W9UA 3ZR6A 4P8XA 4B3LA 3T08A 3SCNA 2XVPA 4ZEPA 2JFEX 7A3HA 2J62A 4JKLA 2VURA 2WK2A 1JYVA 2C8NA 3W53A 3PZVA 3ARVA 2G3MA 1QNQA 1BG9A 1A3HA 3AHVA 1E0WA 2VMFA 5BXTA 1E9LA 1HVQA 5FL0A 5I0DA 2GDUA 4MB1A 4HOWA 2V38A 1V3IA 3QHMA 4MDOA 2E8YA 2UY5A 2Y8KA 4IPLA 1EXPA 1XSJA 2PWGA 3CGTA 5HBFA 3W37A 2JEQA 1BVZA 2BVTA 2E40A 3OZPA 4W88A 4UFJA 3VGBA 1KFWA 1WKYA 4PRWA 1H3GA 4GI9A 3RIKA 5A8NA 1FA2A 1KBKA 3AMDA 2D2OA 3SUSA 1WB0A 3CHEA 4RE3A 1GQJA 4GQRA 5D8WA 5I24A 4OOUA 2B31A 2CXGA 5FKYA 1CGUA 1FFQA 1XC6A 4D6GA 1MQRA 4AEFA 3QHOA 3WDQA 3AICA 3S2CA 3UCQA 3T2QA 3WQWA 4L4OA 3MO4A 3THCA 3AIWA 4HZ6A 2VUYA 3AS2A 2VQTA 2VOTA 1VBUA 3UG4A 2FH8A 1E6PA 4P8VA 1G9HA 4NI3A 2FDMA 2GJPA 4WIWA 3PBGA 4CD5A 1CZ1A 5IXEA 2ZUWA 3AI0A 2J7EA 1O7AA 1IZKA 5IDIA 2VI0A 3SCVA 2D0GA 1Q4NX 5I5RA 3VIFA 3BGAA 2G4FA 1BTCA 4TVCA 1JZ7A 3RILA 4D1JA 3ARUA 3WD3A 4A3YA 1BHGA 4UQBA 4GO8A 4HMCA 3WEZA 3KEHA 4PN2A 1KGUA 2PF0A 1J18A 4D6HA 3W38A 4DM1A 4QCEA 3CHDA 4NSBA 2WHLA 1JZ6A 2EPMX 3RDKA 4OBRA 1JF5A 4GKLA 3FW6A 5DMYA 3K8KA 5A95A 1Q6GA 1C91A 3ARWA 4AC1X 4CN6A 4J7RA 1UWSA 5FD0A 1V3MA 3AYSA 1Z32X 2YLLA 5AY7A 2GFTA 1UQZA 2VO5A 2BY0A 1JZ5A 4TOQA 4PMXA 2JE8A 2ZWZA 1UH3A 4FLQA 3VMNA 4S3JA 3OBAA 3GNRA 1G0CA 1H09A 4C7DA 3AQUA 3N1AA 3WN6A 3ZJ8A 1C7SA 2WC3A 4BQ3A 5A6JA 4Z2LA 4FLRA 2DSWA 4XZWA 1VRXA 3O2LA 1E15A 2DDXA 5CXPA 1PBGA 5A6BD 2Y5EA 3O9NA 3JUGA 3ARQA 5A6MA 1EDGA 3N13A 4QLJA 3NYDA 2ZX6A 1DWJM 2W5FA 2DH2A 1UWIA 1V0MA 4C7FA 1ZBKA 1HJUA 1VEPA 2VVSA 2WCSA 4CCEA 3VIGA 5IFTA 4TTGA 2QF8A 4KMQA 1HIZA 2QMKA 1E6QM 3VNZA 5A8MA 1BPLB 3N15A 2IXUA 3U57A 2XVNA 1WZMA 5EFDA 1GUVA 5I79A 1SMDA 2WWCA 3W24A 2WNWA 2UY2A 1WPCA 4ACZA 3O6AA 2WSKA 4AD4A 4DWSC 5E0CA 1V03A 1ISXA 1ZBWA 3L4YA 5CSYA 1XD1A 2WLZA 3WIJA 1GOOA 2Y2WA 3FNDA 2WCGA 2G8ZA 3ZO9A 3DC0A 4AMCA 5M03A 3UETA 1AQ0A 5AC4A 3OB8A 2XFRA 3VX0A 4ACZB 1PZ3A 1UWTA 4LYPA 5A8QA 3KWXA 1BYDA 4AZ7A 2WVVB 1H2JA 3CMJA 3WDIA 3MUY1 4EKJA 1QVBA 1TZ7A 5IFPA 1WDPA 3CUJA 2XGIA 4LQ1A 4P7RA 4CUCA 1PIGA 5CPSA 4D6DA 2D3LA 2W63A 6TAAA 1V6YA 2CBVA 2OWWA 2D0HA 3E1F1 4E8CA 1HKKA 1EA9C 4GINA 1H41A 1TR1A 1J9YA 2OLHA 1AQMA 4UFKA 5A6LA 1MW3A 3GBEA 4U31A 5E0FA 2J7CA 3ZR5A 1HL8A 1WAWA 4X9YA 4CN4A 4MNMA 3K8MA 1XH1A 4AZHA 2PC8A 2ZXDA 4D6IA 3FHQA 1R7OA 3VGGA 3AOFA 2EJ1A 2O92A 2YA1A 1E6NA 5M17A 1XCWA 2CYGA 2WXDM 3A4AA 5E70A 4CVUA 1I1WA 1E5JA 3N9KA 4YPJA 2D0FA 3AS1A 1JAEA 4DUXA 3F5LA 1J12A 2WMIA 3B9DA 4W7WA 3N12A 4J3WA 5CGTA 1M53A 1NWTA 4MNJA 1W3JA 3BH4A 1HNYA 1CXEA 2WKLA 4AZCA 3AXHA 1LG1A 1Y7VA 4OBSA 2CHOA 3RM4A 5D9MA 1MVYA 3CLWA 2WHKA 3L4XA 3WY1A 3WELA 4WSJA 1JD9A 3CHFA 4AWEA 1V0LA 3SUTA 2VRKA 2YL9A 1JFXA 3EDFA 5A6KA 3W6LA 1V0NA 5JIWA 2A3HA 4M24A 4D72A 4PTWA 4HMDA 4GXPA 4U33A 1E5NA 4UFIA 3GZAA 2DT0A 5HXMA 3WQVA 1WDSA 2W4XA 4PMQA 3HJEA 2DT1A 2OSWA 3WQ8A 1Q6FA 3BMWA 1JZ2A 1J0YA 2VTFA 6A3HA 1CWYA 5A2AA 3CUFA 1CGWA 1V0KA 4AZGA 3WMBA 5CG0A 5M3WA 2UY4A 1DWIM 2J7FA 1JDDA 5A6AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H8U A;  4HZ7 A;  3VIJ A;  1LJY A;  3AHZ A;  3VIL A;  2F61 A;  1PX8 A;  4R5E A;  1U33 A;  1UD8 A;  3GXD A;  4JFU A;  2ZIC A;  3BAY A;  3ARS A;  3GXM A;  5A3H A;  4QCF A;  1E4M M;  1C92 A;  2ESC A;  1J0K A;  4P8W A;  3SUV A;  3ZMR A;  3EDK A;  4WKA A;  3VX1 A;  4W86 A;  2ZUV A;  2CIT A;  4JHZ A;  4PTM A;  4D71 A;  3D3A A;  2NSX A;  4WLC A;  1E4I A;  1BGG A;  3MKK A;  5I78 A;  2VRJ A;  1W2P A;  3ARX A;  1KXH A;  4J3T A;  2WWD A;  3PTM A;  5C70 A;  3GM8 A;  3A4X A;  1NQ6 A;  4MTV A;  2ZX9 A;  1QHP A;  1B3X A;  1B3V A;  1WO2 A;  4JKM A;  4ZEN A;  1KWG A;  2WPG A;  1C8Q A;  2UY3 A;  1OT2 A;  3VDC A;  4PMU A;  1UA7 A;  1JFH A;  5AYI A;  2YOC A;  3CUG A;  4X0N A;  1Q6E A;  3UER A;  1BYC A;  2VRQ A;  1R7A A;  4IM4 A;  2NW0 A;  2DSZ A;  1ZS2 A;  1US3 A;  3OIH A;  1C8Y A;  3WD1 A;  3VO0 A;  4CCD A;  4W7V A;  1NAR A;  4BQ4 A;  3AZR A;  2X0Y A;  2CKS A;  1HN1 A;  1GZJ A;  2DEP A;  1SMA A;  1OCQ A;  4HOX A;  4JFT A;  4UOZ A;  5F7U A;  1E3Z A;  1MXG A;  3OZO A;  1E71 M;  1JZ8 A;  2ZUS A;  4WKH A;  5DT5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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