1UUO | Genus

Total Genus 133

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	133
sequence length	363
structure length	351
Chain Sequence	DDHFYAEYLMPGLQRLLDPESAHRLAVRVTSLGLLPQDSDMLEVKVLGHKFRNPVGIAAGFDKNGEAVDGLYKLGFGFVEVGSVTPQPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAQLTADGLPLGINLGKNKTSEDAAADYAEGVRTLGPLADYLVVNVSSPQGKTELRHLLSKVLQERDALKGTRKPAVLVKIAPDLTAQDKEDIASVARELGIDGLIVTNTTVSRPVGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRIPIIGVGGVSSGQDALEKIQAGASLVQLYTALIFLGPPVVVRVKRELEALLKERGFTTVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
publication title	Inhibitor Binding in a Class 2 Dihydroorotate Dehydrogenase Causes Variations in the Membrane-Associated N-Terminal Domain pubmed doi rcsb
source organism	Rattus rattus
total genus	133
structure length	351
sequence length	363
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2004-01-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1uuoA00

2Z1BA 3EXRA 4RKAA 4U28A 2B0MA 5K9CA 4QQ3A 1LOQA 1L6YA 1XC4A 2A0NA 5HWNA 3UNDA 1FBAA 4O1BA 5HNRA 2QR6A 5AHMA 4O50A 1SFLA 2FFCA 3CLMA 4LV9A 2Q8ZA 2YXGA 1F5ZA 2CLHA 1O5KA 1SU5A 4GUGA 1YDOA 3O07A 2BX7A 2E77A 1EA0A 1IXQA 1AW1A 4J9JA 2Y61A 2V2CA 3M6YA 5HJLA 3PB0A 4YXGA 3KHJA 1SPQA 2CW6A 4N02A 3PBWA 3UD6A 4HPJA 3W7MA 3GZ3A 4NQ1A 2ZRZA 3W85A 2C3ZA 3B04A 3BK0A 3NQDA 1DVJA 2QCDB 1OFDA 2XN2A 2R94A 3IRDA 3Q94A 4PC8A 2ZDRA 3LHWA 1R30A 5CZSA 1H62A 5DLCA 2W79A 3EWUA 4KKXA 1FWNA 5U4NA 3W71A 3W83A 2P10A 1YADA 2EAWA 3LCLA 1AL7A 4KWVA 4O0ZA 5HQEA 1JCYA 4DBDA 1QFEA 4TU1A 2H3DA 3C2VA 5FI8A 4FNRA 1W5MA 1M5WA 1VYRA 2I14A 4ZQPA 2Y7EA 1OK4A 2OZ0A 4DO5A 2A85A 3M5XA 3UQNA 2B7NA 3NA8A 1BWKA 5D38A 5LKYA 4K6AA 2G95A 3GXTA 3E9AA 4MZ8A 4NZJA 3JRKA 3W7OA 1PHWA 1P1XA 3G22A 3DBPA 3NM1A 3IIXA 1WX0A 3FYPA 3DFOA 2BSLA 4BI5A 4RX0A 3R89A 4A22A 5BNKA 1OFQA 4LRSA 1LBLA 1OX5A 2H90A 4N9EA 2DJLA 3NL2A 4NT0A 4NNCA 4ZQOA 4DF2A 4OWGA 1JVNA 3O16A 2G5WA 4GFSA 5FEWA 4FNPA 2GJNA 2C6QA 3I65A 4S1FA 4GE8A 3MWAA 2AAMA 3TSBA 5GVJA 2Z0IA 2Q3OA 4LUJA 4QM1A 2LLEA 2V5BA 2WSYA 3F03K 2QCHA 1LTDA 4RJEA 5EYWA 3LTYA 4Z1AA 1FY6A 4R7JA 3R13A 4NX5A 5LNUA 3G0XA 2DU2A 1C9DA 1I4NA 3LBCA 2RFGA 4I9AA 4UTWA 2JGYA 4ZZ9A 1RD5A 1NFBA 4QAIA 3LERA 1OX4A 2VC6A 1EP3A 4Z1DA 3G24A 1SO3A 3UPBA 2YYUA 1EP2A 2FLIA 3IV3A 3VKJA 2E6DA 2QDGA 2ABAA 1TB3A 1EX5A 4N6EA 4PTNA 3U8GA 3NL3A 4M6QA 1BWLA 4UTTA 2JGQA 5HUOA 2I1OA 5L6UA 1TRDA 3NL6A 1OX6A 5I3FA 1WV2A 2ZYFA 4UMCA 2H6RA 3W1RA 1JQXA 1TPDA 3NYZA 3LM7A 1SO4A 3OG3A 3KX6A 4IMDA 3C8FA 3VCRA 1GTHA 5F1UA 3QZEA 3TAKA 3FYOA 3I7QA 4NVTA 4CNPA 1TPVA 3S1UA 3UWZA 4BWLC 1K03A 2CLOA 1OF8A 1VCFA 2O7QA 4Y90A 3LRMA 2ZZ7A 5F4XA 3CM4A 4HSOA 2ZRVA 1LYXA 2V81A 3HPXA 3I68A 3TSDA 4O10A 4GJ1A 5HWJA 1OABA 1Y0EA 2RDUA 4NZFA 5K9DA 3CC1A 4CLMA 3LHTA 1RV8A 2ATMA 2VFGA 1W56A 1TTPA 1X8FA 4H4IA 1XBVA 5EL1A 1H61A 3TW7A 4Y96A 3O06A 1JCNA 3B8DA 1YYAA 1VYSX 1QR7A 1TSIA 4EF9A 3N9RA 4HPXA 3W1XA 3DZ1A 3M41A 1W37A 2QCGA 4O18A 3PUOA 3STFA 1K7EA 4IX0A 4WY0B 5DCBA 3CEUA 5I3HA 1GYNA 3TQ0A 3HG5A 1TPWA 1M7PA 1H7XA 2HTMA 4XBSA 3W72A 5LNWA 4FNQA 5DXXA 4BI6A 3PG8A 2H8ZA 3BW4A 4NUWA 3DFQA 5G1TA 3M43A 3TW6A 4UUIA 5CZ0A 4DO6A 4UR8A 3L0KA 4A29A 4MZYA 3VNDA 5KINA 1RZMA 2VENA 5HULA 2DJXA 3S8HA 3S1VA 1ML1A 3P62A 3RF9A 1YTEA 1QAPA 2V5LA 5AC6A 2QAPA 4AWTA 1YPIA 4O13A 4UFJA 3W1AA 3IEBA 3OVQA 4IWWA 4JS3A 1WBHA 2DORA 2R8WA 3QPYA 4PFMA 5LNVA 3T55A 1OYBA 3WK0A 1P4CA 2NXGA 4EOUA 1GQNA 4DPPA 4PCFA 2CFFA 1TV5A 3M5ZA 5LGXA 2V0TA 3SJ3A 1ICPA 3KVLA 1D9EA 3NVTA 1MSSA 1GWJA 4K8HA 2WSQA 3PF3A 3IIZA 3W7DA 4IQLA 2YFNA 3LI1A 3QMSA 2ATSA 1VLIA 3TV8A 1YLVA 2FQIA 3QJAA 1KTCA 1W5NA 3GLCA 3BW3A 5AYYA 3ABRA 1TQJA 3ATYA 1XDLA 2VEKA 5G2WA 4PODA 1OFEA 3ZFHA 3PBVA 3IVSA 1TIMA 3L65A 3NZ1A 4O1AA 3HMJG 2TMDA 3QF0A 3W2UA 3TR2A 4K7VA 2DZWA 2OT0A 1ZAIA 4UCGA 3W87A 3W07A 3NPUA 3TU9A 4GUHA 3CHVA 1PCWA 2PRHA 2Y7GA 1VHNA 3L68A 3WJWA 1I45A 3TJXA 3UXDA 1N7KA 2X1SA 4N4QA 3THQA 3NPVA 2VEIA 4MZ1A 5A8GA 5EMUA 4RXFA 3H54A 1UASA 1WOAA 1W3TA 3IIVA 1VR6A 1QWGA 3SFKA 3E49A 3G18A 2OJPA 3M44A 4MKNA 4EVZA 4TR9A 2DZVA 1XUUA 3L2IA 2QJGA 5D03A 3JS3A 1Q45A 2QCEA 3WJYA 2CLMA 2PURA 4ADTA 1PL9A 3C0JA 4D2JA 4QSHA 1KTNA 1FWSA 4JD4A 5CZJA 1W5PA 3FLUA 3USBA 3DKLA 1YPFA 3TSMA 3EWXA 5EKYA 5J5RA 3KRZA 3W7GA 1KM6A 1KV5A 3SI9A 4X22A 1QO2A 4CQ8A 3UXAA 4MJZA 4ONVA 1PCKA 2GQ9A 1WYIA 2CZEA 2TPSA 4JTGA 1KFLA 1YDNA 2XN1A 3C4UA 1JUBA 5K2ZA 3E02A 1M6JA 2ZZ5A 5D05A 4YWIA 1KV8A 3EXSA 2EKCA 4EIVA 3NZRA 4LY8A 2BXVA 2ZRUA 1W54A 3E96A 3M1ZA 2V2DA 5D2WA 3TMQA 3FKRA 1SW3A 4AMAA 1QPQA 4XTIA 3KRUA 5LHFA 3QSRA 3W88A 4AB4A 4CQ9A 2HS8A 4O8RA 3EB2A 3GB6A 3B06A 3PY2A 1DKWA 3EX6A 3LB0A 2VFFA 2VFHA 2DZUA 2CZFA 3S5YA 2EPHA 5ABTA 3B0UX 2XN0A 3NQVA 1F74A 1KFBA 4IXXA 1GT8A 1W31A 3NXFA 5D2VA 1SZNA 4FX7A 1KM3A 3MP5A 4O53A 3GDLA 3PS7A 3SZ8A 4DQWA 3W76A 5DXYA 2Y7FA 4HN4A 2QAFA 3W75A 5AC8A 3MHGA 1LOLA 3A5VA 1YXDA 3N2XA 2X1RA 4JTFA 4HNUA 3P5ZA 3QSTA 5A5WA 2BTMA 3LXAA 3HGSA 3MP4A 4UTIA 4HNNA 2QCFA 3B03A 1KM5A 4WY0A 5DCEA 1LRNA 1JCJA 3DFPA 5IM51 3MO7A 2NXHA 5D2XA 3MHFA 3DAQA 4DF0A 1P0KA 1K8YA 4OBTA 4DELA 3MI6A 1RR2A 4GC4A 4RK8A 4O4VA 1WAUA 4ADSA 1O4UA 1NF7A 3PUDA 3ZWSA 1BEUA 2Z2UA 1ZAHA 2RDWA 2VFEA 2WO5A 4MFDA 2J27A 3TKFA 2JBMA 4LC8A 2P0OA 3PR2A 4GXMA 4JTSA 2QUVA 1HG3A 4XKYB 4CCDA 3P5YA 5K4ZA 4JTHA 1HUVA 4JIQA 1XL9A 3CWOX 2VEMA 4IPJA 4NX0A 5L9FA 4M19A 3O8AA 2C16A 1S5WA 2B7QA 1TPC1 3IVTA 3W1LA 4KFNA 5TBOA 2ZZ1A 3SR7A 4ZMGA 4JTJA 2ZA1A 2C1HA 1T8XA 3MW7A 2OT1A 4LTSA 3GDKA 5CPMA 5DBTA 2E1DA 1MEIA 3NM3A 1B4KA 4TMBA 1TYGA 4JYFA 4JTKA 4JX5A 2ZCGA 3LLFA 4FXRA 2CZDA 4MIMA 3OBKA 3MYPA 3RU6A 3LV5A 3BG3A 1Z44A 3LDVA 5D32A 1I2OA 1ME9A 1G4SA 1OFOA 1TRIA 4IX2A 7TIMA 2JK2A 4UTMA 1H63A 3IGUA 4ML9A 4HNTA 2ZZ4A 1WQ5A 3O1NA 3N2MA 4M7TA 2PCQA 2RDTA 2NLIA 2F7FA 4M5PA 3B0VC 1TMHA 3PBYA 3VE9A 1O60A 3HO8A 4MFEA 2A7NA 3NOEA 4LVFA 3M9YA 1XKYA 2CZ5A 4Z08A 3QFEA 1F73A 5U7SA 2F84A 2ISVA 2NX1A 3G1AA 5AYZA 3W2LA 2X1TA 2WNQA 4MUZA 4O15A 3CB8A 3DFSA 3HGJA 4JTEA 5AHFA 3LX9A 2HS6A 4FF7A 1V5XA 4PL2A 1B4EA 3HIJA 4E2BA 3S1XA 2NZLA 2Z6IA 3G3DA 5KMYA 4E2DA 1X1ZA 1KM4A 3U6WA 1KLZA 5BRBA 3P61A 3TC7A 4JXCA 1LDCA 1KLYA 1TV8A 1B57A 2A6NA 2Y89A 3MBDA 4AXKA 4LV4A 2WV8A 3QW3A 4BK9A 4PA8A 2QF7A 2ZA2A 1Q3NA 2WOQA 2A4AA 4Y6GA 2FB3A 4IMFA 1EIXA 4YCOA 2FPTA 3DGRA 3NQMA 4MY1A 3E12A 3W9ZA 1UB3A 5KITA 4AF0B 4JNMA 4QNEA 3IGSA 4RZ6A 5EA9A 1JRBA 4LRTA 3NL5A 3WK1A 3LCXA 2E5CA 3L67A 1GG0A 1LRTA 1XBXA 1FXPA 1W8SA 3UWYA 1FWRA 1SSGA 3GNDA 1WBJA 4UTKA 2A7PA 3TX9A 3PSWA 1H7OA 4PL1A 3W7RA 2ISWA 3P80A 1WDWA 4UTWC 1XM3A 2E5BA 2ZRWA 1SQ7A 1GPWA 2CLLA 5CG7A 2ZRXA 4AHOA 1ZCOA 4XQ6A 1FCBA 3CPRA 4N9BA 2Y70A 8TIMA 3G0UA 2WQPA 1VPXA 1MEHA 3NPWA 3EXTA 4BI7A 1PIIA 3KVMA 3O15A 3G1HA 4NJHA 4R34A 3MP3A 3U2OA 1UUMA 2FIQA 2NUYA 3M0ZA 4IPIA 5F2GA 3TQKA 5BOOA 1AL8A 4UTTC 3STCA 2VFIA 3NQ6A 3EX1A 4O17A 5LGZA 3RK8A 4GBUA 3DFNA 1ICQA 4IMCA 5K4XA 3P82A 4K37A 4I7WA 4TO8A 1DBTA 5CKSA 3TQVA 3IVUA 1PHQA 1QNVA 4O19A 3K30A 3P7YA 4K7YA 5HINA 5F2LA 5H91A 1JCXA 3CIWA 3W1UA 4Q33A 2PE4A 2Y85A 2NX9A 3G8RA 3UY7A 4UIOA 4H6KA 3KVKA 1TCDA 1SW7A 3FA5A 2JKPA 2NV2A 2OCZA 3NG3A 3BLFA 3GDRA 1G6CA 1Z41A 5C54A 1ZHAA 3W3OA 1A50A 3NQ8A 3A24A 1TPFA 3BG5A 3NDOA 2OX1A 3RLVA 1L6WA 3S0CA 4JTLA 4WZHA 4CCEA 1UBSA 2Y6ZA 1XFBA 3M16A 2BLEA 1TTQA 2A6LA 3G0SA 4FXSA 5G2HA 5LSMA 2QCLA 4BF9A 3P81A 1Q6LA 2QJHA 1TREA 5E1QA 4TMCA 4XKYA 1VYPX 1W5QA 3MYOA 4NJIA 4AWUA 1TPUA 3G1DA 1G4PA 4YL2A 3EKZA 3WK3A 1GG1A 4JEQA 2DZXA 1SW0A 1SO5A 4YCPA 3GDTA 1TJRA 3GAYA 2JKEA 3HG2A 3P8JA 4UR7A 2EGZA 2FB2A 3W7IA 2A1YA 3ZWTA 1MO0A 5FEZA 5AN7A 1E51A 1KFEA 4Y8FA 1AW5A 1RVGA 5LNSA 1H51A 1TPH1 2G97A 4LS0A 4L4LA 4OV4A 1N8FA 5TQLA 3BO9A 2QCCA 2X30A 3F1QA 5F2MA 1OYAA 2RKXA 3W1NA 5G4WA 1JJKA 3M5VA 4GUJA 3PUEA 1H7PA 3MHUA 2UV8G 5HUPA 5HR6A 1NEYA 1U83A 1R46A 1SZGA 4A3UA 3ABOA 1OF6A 2QCDA 3BGJA 3HBLA 3W86A 1F6PA 4DXVA 3EWWA 3NQAA 1VGAA 5D02A 4MLRA 1VHCA 4ZQNA 3TFXA 3KAOA 1OFRA 3NEVA 3LRLA 1JUKA 2E68A 1A5SA 1NSJA 2YGYA 4LOCA 3GX9A 1WOBA 3HGOA 2TSYA 3Q2DA 3M47A 3A23A 3YPIA 2WJZA 3KRSA 4NNBA 1ICSA 3ZS4A 3UZJA 3LXBA 1LZOA 2V9DA 4IMEA 5F1VA 5FF4A 3HOJA 4GWEA 1G4TA 3CEPA 3LCHA 2NWSA 1LLWA 1H50A 1U5JA 1D3GA 3LCIA 2QEZA 3KVJA 3W7KA 1UJPA 3H53A 3O63A 3GKFA 1IXOA 3DHDA 2J9XA 1K02A 5D09A 5H2ZA 2FPVA 2YYTA 4FEZA 3RLUA 4OU1A 1YDVA 5BW6A 4GRSA 1FCVA 4E38A 4WXYA 4WOZA 1GVFA 2YX0A 5E0KA 1R2SA 4LVDA 4JTTA 4HKPA 3N34A 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3GVGA 3T78A 4HNVA 3HG3A 4UFKA 4OV9A 1GVOA 4UFHA 3LRKA 4UTHA 3SGZA 1N55A 3BARA 4K38A 3C2OA 1W3NA 3WFAA 4ICNA 1GOXA 3UWQA 5HR7A 3TH6A 3STEA 1ONRA 1C29A 3TA6A 1QPOA 3GNNA 1LCOA 4I7UA 1PVNA 5DBUA 1F6KA 3RFAA 2ZZ6A 3S5OA 1ADOA 1JCLA 4MYAA 3FJLA 2DZPA 1QOPA 4JX4A 4WX2A 1ZFJA 2PRLA 2QCMA 2BWGA 3OEXA 1FQ0A 2X1UA 3P74A 2GUUA 4NNAA 1QCWA 5AC7A 5FEXA 3MI3A 3W7NA 5D33A 4ZQCA 3BV4A 1GYLA 4RR4A 2ZFAA 5AHIA 3SSJA 1JCMP 1DJQA 2ISSA 2CLKA 3L9CA 5C6MA 4OHQA 3P67A 2C15A 1S5TA 4O57A 5D30A 4CCCA 2RH9A 3CT7A 2CLEA 5MHBA 3IGXA 3F4WA 5AHEA 3I7SA 2X2GA 3QEZA 5AHNA 3UY8A 5F2IA 3Q58A 4FIQA 2C19A 4Q32A 4UFIA 1ZENA 4XUGA 2QJIA 4NJJA 3G3MA 1SO6A 2E6FA 4A21A 2YFOA 3G1SA 1IGSA 4N2YA 1EWDA 4NJKA 2KZHA 5I3JA 3T44A 3KXQA 3SIZA 3QMTA 4OQVA 2FPYA 1EB3A 3LCWA 3EWBX 3C2EA 1DHPA 1THFD 4RCXA 3T4CA 1AW2A 4JDBA 1O95A 3GK0A 4HIBA 4UNLA 1QPRA 4AHQA 1GTEA 3I6RA 5BMXA 1SR9A 4O52A 1UUOA 2G96A 1QOQA 2I9EA 1HFBA 5CPLA 3W23A 3FIGA 3N9SA 1XCFA 1ZALA 1W3IA 4N4PA 4WUIA 3R2GA 3TUUA 3CWNA 3O6DA 5G2IA 3S5ZA 3L0GA 4AEOA 3G1FA 1B9BA 1LROA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1UUOA

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