The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
SLFEQLGGQAAVQAVTAQFYANIQADATVATFFNGIDMPNQTNKTAAFLCAALGGPNAWTGRNLKEVHANMGVSNAQFTTVIGHLRSALTGAGVAAALVEQTVAVAETVRGDVVTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Heme-Ligand Tunneling in Group I Truncated Hemoglobins
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Paramecium caudatum
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| total genus |
43
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01152 | Bac_globin | Bacterial-like globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UHX A; 1J3Z A; 2BLJ M; 1G0B A; 2W31 A; 1HDB A; 4L2M A; 1MWC A; 5KKK A; 2RAO B; 3ECX A; 4YU3 B; 1MLG A; 3PIA B; 5CN6 A; 4ZVA A; 1RQA B; 2QFK A; 3M39 A; 1CO9 A; 1LFQ B; 3G4U A; 1URV A; 3LB3 A; 3WR1 B; 4NK1 A; 2D6C A; 5EQM A; 1XQ5 B; 1NIH A; 3A59 B; 1JF3 A; 1MBI A; 1MLO A; 2VM0 A; 1Y8W A; 2W6X A; 2MHB B; 1OUT B; 3IC2 A; 1YZI B; 1DO1 A; 3A5B A; 4B4Y A; 2B7H B; 2QSS B; 3DHT A; 1C7B B; 3HXN A; 3UHY A; 3EU1 B; 1BZ6 A; 2ZS0 D; 1M9P B; 3WCW C; 1VWT A; 1DO4 A; 2GTL B; 1F5P A; 4U8U A; 1HBS A; 1NEJ B; 2NSS A; 2QU0 B; 1XY0 B; 1S0H A; 1SDL B; 1R1X A; 3U3E A; 5CN5 A; 1PBX A; 1HGC B; 3S48 C; 5KER B; 1HBA B; 2W6V A; 3LHB A; 1LFL B; 2ZT1 A; 1Y09 B; 3WHM A; 5ILP A; 1K0Y B; 1MOB A; 1OFJ A; 1IBE A; 2NRL A; 1Y31 A; 1Y4G A; 4MPM A; 3QJB B; 4UUR A; 2W72 C; 5E6E A; 5IKS A; 1GBU B; 3QM7 A; 1FHJ A; 5CNG A; 3WCU B; 1GLI B; 1Y83 B; 1MBC A; 2AA1 B; 1NS6 A; 1J3F A; 2ZFB A; 2D2N A; 3CIU A; 1YE0 B; 3ZOL A; 2FRJ X; 4DC8 A; 3GQG A; 5EUI A; 2SPO A; 4B3W A; 2FAM A; 3PT7 A; 4GZG A; 3EOK A; 4MBN A; 1SHR A; 4OF9 A; 2O58 X; 2MGH A; 3LR9 A; 4F6I A; 1Y4P B; 2HBS A; 1B86 B; 1FLP A; 1MLH A; 3DHR B; 3M38 A; 4MXL A; 3D1K B; 3RGK A; 3GQR A; 1R1Y B; 1Y4B A; 1Y45 A; 1J41 B; 4DC7 A; 1HGA B; 2HZ2 A; 2ZT3 A; 1FN3 B; 1N9X A; 3LB2 A; 3ZH0 A; 1T1N A; 1V4U A; 5C6Y A; 1Y8I A; 1GCV B; 3WFU A; 3ZJQ A; 1BIJ A; 5JGG A; 1Y7C B; 2FRK X; 3DR9 A; 4NI0 A; 1MBN A; 1MOD A; 1O1P A; 1H97 A; 2HHB B; 3NMM B; 3D4X A; 1A9W E; 3VRG A; 1SI4 A; 1QI8 A; 3AT5 A; 1HGB B; 1YGF A; 3BCQ A; 1YMB A; 4FWZ A; 2D2M B; 5E29 B; 1YIH B; 2M6Z B; 3QQQ A; 3ARJ A; 5CNF A; 4F6G A; 1IOP A; 1YVQ B; 2V1E A; 1COH A; 1UVX A; 1CP0 A; 3GDJ A; 5HLQ A; 1GDL A; 2V1K A; 106M A; 3LQD A; 3LR7 A; 1RSE A; 1DLY A; 2PEG B; 2ZT0 A; 1QPW B; 1A0Z B; 3UHB A; 2LH5 A; 2G12 A; 1YOG A; 1MTJ A; 1O1I B; 3M3A A; 1IT3 A; 1Y35 B; 1JPB A; 4WCH D; 1CBM A; 3BJ3 B; 4WJG A; 2IN4 A; 1A3O B; 1ABW A; 1Y0T A; 2ZSS A; 5JDO C; 1Y5J A; 3BJ1 B; 1NWI A; 3WCW A; 1C40 B; 4XDI A; 1G9V A; 2ZST A; 3WCP B; 1RVW B; 1RTE A; 1V4W A; 1Y0A B; 2CMM A; 3OGB A; 5E83 A; 1CMY B; 4F4O B; 3ECZ A; 1A6K A; 2H35 A; 1MLS A; 2HBC A; 1MOA A; 1A3N B; 1QXE A; 1Y7D A; 2BKM A; 1Y0W B; 4G51 A; 1YEU A; 2GRZ A; 1S6A A; 2GTL D; 1FDH G; 5C6E A; 1BVD A; 3IC0 A; 3PT8 A; 1DO3 A; 2G0R A; 2W72 A; 1MLN A; 1K1K A; 3WCT C; 3DUT B; 3ODQ B; 1QSI A; 4HHB A; 2W6Y A; 2QSP B; 2MYC A; 4FH7 A; 3UHR A; 1MKO A; 4MBA A; 1UX8 A; 1A6M A; 1RQ4 A; 3GK9 A; 4XS0 B; 2HHE B; 1YE2 A; 1NWN A; 2D5Z A; 1YVT B; 2QMB B; 3ZJS A; 3OVU C; 1MYT A; 2AUO A; 3OO4 B; 2D5X A; 1DTM A; 1BZZ A; 1VRE A; 3BOM B; 3VRE A; 3HYU A; 2AV3 A; 1ECA A; 3QJE B; 1UT0 A; 2HBE B; 1KFR A; 3WCU D; 4F6B A; 2H8F A; 1MLM A; 3UHS A; 4H0B A; 4DWU A; 1A6N A; 1MYH A; 5F0B A; 1YCA A; 4MXK A; 1LFT B; 1JL6 A; 3ZJL A; 2VLX A; 1YEO B; 1NAZ A; 1JWN A; 1BZ0 B; 3HF4 B; 3PI4 A; 3VRF A; 1NPG A; 1XZU A; 1Y85 B; 1A00 B; 1OUU B; 1O1N B; 3SZK B; 3P5Q B; 1DUK A; 1J52 A; 1DUO A; 1Y2Z B; 4N7P B; 3ECL A; 4M4B A; 1KD2 A; 3MYM A; 3WFX A; 1IRD B; 1IWH A; 3R5I B; 1LH3 A; 1YHU C; 2G3H A; 2GKM A; 3QJD B; 1YDZ A; 3G4Y A; 3UH6 A; 4FC3 A; 1V4X A; 2YRS A; 1LA6 A; 1JDO A; 3GYS B; 2VLZ A; 4UIQ A; 1GDI A; 3WTG B; 3OO5 B; 1DXU B; 2DN2 B; 1HCO B; 2R80 A; 1MBA A; 2V1I A; 1NZ2 A; 2ZSO A; 1DXC A; 1JEB B; 1NXF A; 3QJC A; 1LHT A; 2D2M D; 1CLS B; 1GCW A; 1LH7 A; 4TYX A; 2HHD B; 1AJ9 B; 1Y46 A; 1MLR A; 4PQ6 A; 1EBT A; 1FCS A; 2Z6T A; 1KR7 A; 105M A; 1LJW A; 1VXA A; 3UHW A; 1NZ4 A; 4MQJ B; 4O1T A; 1SDK A; 1HDA B; 1QSH B; 3CY5 B; 6HBI A; 1U7S A; 5HAV A; 1IDR A; 1VRF A; 1HHO A; 1J7Y B; 5EU2 A; 4NK2 A; 1FSX A; 1A01 B; 2MGL A; 3GKV B; 1YFF B; 3PI9 B; 1YEN A; 1LH6 A; 1G0A A; 2R1H A; 2LH1 A; 3NFE B; 1CH4 A; 2ZLT A; 1A0U A; 4ESA A; 1O1J A; 1BBB B; 3FS4 B; 4G1V A; 5SW7 A; 1MNK A; 103M A; 1XZ2 A; 3GLN A; 1MNH A; 1GBV A; 1HBR A; 1V75 B; 5EET A; 102M A; 1YEV B; 3UGY A; 3A5A A; 4X0L A; 4LPI A; 1YG5 A; 1C7D B; 1YHE B; 2G0Z A; 2R4Z A; 1J7S A; 3PEL B; 1VXE A; 3D7O B; 1MYF A; 1J3Y B; 1OFK A; 1F65 A; 2ZLX A; 1QXD B; 1O16 A; 1J3Z B; 1Y4V A; 1G0B B; 1Y7Z A; 2ZLU A; 1HDB B; 1CH5 A; 2VYY A; 2BWH A; 3MJU A; 1Y0C A; 2BMM A; 1XZV B; 3ZJJ A; 4MU5 A; 4NXA A; 3QZX A; 5CN9 A; 1LH5 A; 3UHG A; 3ZJN A; 1CP5 A; 1NIH B; 2EKU A; 2PGH A; 3D1A A; 4F6J A; 2G10 A; 1ABY A; 1MWD A; 1XXT B; 1BZ1 A; 4KMV A; 4FH6 A; 4F6D A; 4YU4 A; 3UHH A; 2MB5 A; 3V2V A; 3IC2 B; 1YHU A; 3O7N A; 1HAB A; 4F69 A; 2MGD A; 1JP9 A; 2G11 A; 5CN4 A; 3ZJM A; 3R0G A; 3QM8 A; 3A2G A; 1SPE A; 3HXN B; 2G0X A; 4NXC A; 1SPG A; 2ZFO C; 1VWT B; 1Y7G A; 3WCV C; 4U8U B; 1HBS B; 6HBW A; 1S0H B; 1R1X B; 2Z8A A; 3UHT A; 1Y4F A; 1PBX B; 4G1B A; 5KDQ A; 1Y8K A; 1MLJ A; 4MQH A; 2DN1 A; 1HV4 A; 112M A; 2LH2 A; 3D17 B; 3S1J A; 3WHM B; 1N9H A; 1IT2 A; 1IBE B; 3S65 A; 5JDO F; 1Y4G B; 1FDH A; 3UBC A; 3AQ5 A; 3ZOM A; 1OUT A; 3OZU A; 1L2K A; 3GQP A; 5E6E B; 1FHJ B; 1O1O A; 5AB8 A; 2ZS1 C; 1O1L A; 1CH7 A; 1NS6 B; 2ZFB B; 2D2N B; 3SDH A; 3HHB B; 4ROL B; 3EU1 A; 3G4Q A; 3GQG B; 5EUI B; 2Z85 A; 1I3D A; 1AZI A; 3PT7 B; 1SDL A; 1CIK A; 3IXF A; 1OBM A; 3EOK B; 2ZSQ A; 1SHR B; 1X9F C; 4NI1 A; 1CG8 A; 2MGJ A; 1Y5F A; 2LH7 A; 1LFL A; 1A6G A; 2E2Y A; 1NS9 B; 2DN3 A; 2O5M X; 3GQR B; 1Y4B B; 1Y45 B; 1UC3 A; 4UZV A; 2V1H A; 4HRR A; 5EYJ A; 2SPM A; 1Y4R A; 1Y8I B; 1EMY A; 1C7C B; 4N8T B; 2FAL A; 2O5B X; 1DKE B; 1Y83 A; 1BIJ B; 3SDN A; 3UHK A; 2OH9 A; 1X46 A; 4MQC A; 1YEQ B; 2GL3 A; 4NI0 B; 3D4X B; 4IT8 A; 3VRG B; 1B0B A; 1QI8 B; 1URY A; 3AT5 B; 1YGF B; 1N9F A; 1MOC A; 2RI4 A; 4TWV A; 1WMU A; 3G4V A; 2V1J A; 4N7N A; 3HRW B; 3AQ7 A; 1CH9 A; 2FRF A; 4SDH A; 1NGK A; 2GDM A; 3G4W A; 3V2Z A; 3B75 A; 1COH B; 1J7W A; 3GDJ B; 4JYQ A; 3D1K A; 3LQD B; 1F63 A; 5CN8 A; 1LFZ A; 2MYB A; 5B84 A; 1LH1 A; 3QZZ A; 2R4X A; 3M3B A; 3UH7 A; 1AJH A; 1NZ3 A; 3A0G A; 1YIE A; 3WFT A; 2MGA A; 1XZ4 A; 1MNI A; 5D5R A; 1HDS A; 3WI8 A; 3G4R A; 1ABW B; 1Y0T B; 5HU6 A; 1Y7C A; 5HBI A; 3G53 A; 3AG0 A; 2G0V A; 1YHR A; 1Y5J B; 2XKG A; 1HAC A; 3EDB A; 3WCW B; 1LFY B; 3MVC A; 1YOH A; 2ZFO A; 1FAW B; 3ZHW A; 1BUW B; 3WCV A; 2ZS0 C; 1G9V B; 3UHE A; 2WTH A; 2XKH A; 2HBD A; 1ECD A; 5E83 B; 1MDN A; 1YVQ A; 1XZ7 B; 1DWR A; 5EOH A; 2VRY A; 1D8U A; 1N9I A; 1MZ0 A; 2H8D A; 2HBC B; 4MQI A; 1MLK A; 3BJ2 A; 1Y7D B; 4G51 B; 1YEU B; 1VXC A; 2PEG A; 1G09 A; 1HBH A; 1A0Z A; 1MOH A; 3ONZ A; 4U8U D; 3IC0 B; 3PT8 B; 2VYZ A; 2OHB A; 1A9W A; 1Y35 A; 2W72 B; 1K1K B; 2QRW A; 1HBI A; 3HEN A; 3HEP A; 4HHB B; 3K8B A; 1DXT B; 1A3O A; 1MYI A; 2ZS1 A; 1MKO B; 1O1M A; 1W92 A; 1RPS A; 2AUP A; 1MGN A; 1RQ4 B; 2MGG A; 3O89 A; 2D5Z B; 1MLQ A; 1UX9 A; 1YH9 B; 2D5X B; 2MGC A; 1BZZ B; 1XZ5 A; 2XYK A; 1TES A; 2ZSY A; 3S66 A; 1X9F A; 3HYU B; 4F4O A; 4QAU A; 2O5Q X; 2D60 A; 5CHR A; 3QM9 A; 2H8F B; 2NX0 A; 1Y01 B; 2D2N D; 3QM6 A; 1CQ2 A; 2GRF A; 3W4U A; 2W6W A; 3TM9 A; 3ARK A; 5CNB A; 3AQ9 A; 3VRF B; 2ZLV A; 3ODQ A; 2QSP A; 2O5O X; 5CND A; 1XZU B; 3MKB A; 5CN7 A; 1XYE A; 4ROM A; 5ILE A; 2AUR A; 4M4B B; 4XS0 A; 1KD2 B; 1HBB A; 2KSC A; 1IWH B; 2MYD A; 4AVD A; 1YDZ B; 1GDJ A; 4FC3 B; 1V4X B; 2YRS B; 2Z6N A; 1LA6 B; 2Z6S A; 5JDO E; 4C0N A; 2ZLW A; 1Y22 A; 5EE4 D; 1CG5 A; 1THB A; 4L7Y A; 2R80 B; 4NZI A; 1RQ3 B; 2QLS A; 1LFV A; 1MNO A; 5AZQ A; 1MYM A; 3NG6 A; 3HF4 A; 5CHQ A; 3QJC B; 4F68 A; 3KMF C; 2DHB A; 1A00 A; 2DXM A; 1O1K A; 1UIW A; 1Y46 B; 2JHO A; 2ZT2 A; 2EB8 A; 4ODC A; 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3K9Z A; 3A5G A; 1JZL A; 3E5O A; 110M A; 3VAU A; 1GJN A; 4JAC A; 4H2L A; 1Y4F B; 2HCO A; 1XZV A; 4MQK A; 3DHT B; 5KDQ B; 1Y8K B; 2DN1 B; 4MQH B; 3KMF A; 1HV4 B; 2LHB A; 1XCH A; 2RAO A; 5ILR A; 4KJT A; 4YU3 A; 2D2M C; 3UHZ A; 3PIA A; 4PQC A; 1OR6 A; 3S65 B; 1RQA A; 1YOI A; 1XXT A; 1LFQ A; 2BW9 M; 2W6V B; 1MTK A; 107M A; 3WR1 A; 3GQP B; 1O1O B; 2EF2 A; 1JP8 A; 1XQ5 A; 2GNW A; 1EBC A; 1O1L B; 3A59 A; 1Y31 B; 2LH3 A; 1LHS A; 1MNJ A; 2MHB A; 3E4N A; 2IG3 A; 3UH5 A; 1WLA A; 1YZI A; 5JDO D; 1VXH A; 3K3U A; 2DC3 A; 2B7H A; 2QSS A; 1HLB A; 1C7B A; 4NI1 B; 1CG8 B; 3CIU B; 1M9P A; 1VXD A; 1Y5F B; 108M A; 3QM5 A; 2GTL A; 3D17 A; 1NEJ A; 2QU0 A; 1XY0 A; 1MYZ A; 2DN3 B; 2R50 A; 1AJG A; 2MGK A; 5EV5 A; 2WY4 A; 1MYG A; 1HGC A; 5KER A; 1HBA A; 2HBS B; 1JL7 A; 4HRR B; 1ASH A; 1BJE A; 3UBV A; 1Y4R B; 3PI3 A; 1Y09 A; 1K0Y A; 1DO7 A; 2EVK A; 1MCY A; 3MOU A; 3WCT D; 2O5L X; 3HHB A; 4ROL A; 4MQC B; 3QJB A; 1HSY A; 1GBU A; 1T1N B; 1V4U B; 1V07 A; 3WCU A; 1GLI A; 3BA2 A; 2AA1 A; 2RI4 B; 3G52 A; 1WMU B; 5JGG B; 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