1UWS | Genus

Total Genus 197

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	197
sequence length	489
structure length	483
Chain Sequence	MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	BETA-GALACTOSIDASE
publication title	Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors. pubmed doi rcsb
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	197
structure length	483
sequence length	489
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date	2004-02-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1uwsA00

1MW1A 1UD6A 4EK7A 1W3JA 4AD0A 3TTSA 3MMDA 2RGMA 3VGDA 4PTVA 1GORA 2CKSA 3BGAA 2AOSA 3SCNA 5A94A 2BV9A 1E6SM 4DM2A 4AD5A 1UD4A 3PZNA 1C8XA 3AROA 4HZ6A 4AD1A 1G5AA 2DT0A 4PTMA 4PUDA 1V6YA 3LPOA 1R8LA 5A6JA 5D9NA 5I24A 1W1TA 1ZBCA 1V02E 2D23A 3TTQA 2CKRA 4MB1A 2CBJA 4BQ4A 2XHYA 5C70A 5FCZA 3FW6A 5HDRA 1Q6GA 1QOXA 3GBEA 5JUVA 1GOMA 5GNXA 1JFHA 1KR0A 4LX4A 1GJWA 4WLCA 2CERA 1BSIA 4OBRA 1HXJA 2GUYA 4UFLA 2QMKA 4CVUA 4D71A 3CUJA 2CHNA 2IUZA 3WQ6A 2EJ1A 4EAMA 1U30A 4X9YA 3HJEA 3B9AA 1UUQA 3VM7A 4Z2JA 3K8LA 2J75A 3SCPA 3BAYA 2PBOA 4PSPA 4NRRA 1CXLA 2D1ZA 3VX1A 5BWFA 3M6DA 3BAXA 4DWSB 4AZIA 1JYXA 1HL8A 5BRQA 4CU7A 3POCA 2WMJA 3WMSA 4BQ2A 2UWFA 4J3WA 3L4XA 1JAKA 3DC0A 2BXZA 3HMCA 4V2XA 2DT1A 4HZ8A 1D2KA 1XYFA 2YA0A 4TX8A 2V3GA 4CD6A 1PX3A 4J3VA 4B15A 2GJXA 3VILA 3N15A 2JEQA 1KR1A 1UH4A 2VX4A 5ABHA 5GPRA 4ACYA 1VAHA 2WBGA 1GVYA 3WDPP 1V0MA 3U5UA 2EQDA 2O92A 1EQCA 1KQYA 2XVPA 3VX0A 1F4HA 1GOIA 1B30A 4A3HA 4OOUA 1UZ1A 2WKGA 1ZBKA 5ABFB 2VNCA 3ARQA 4H8HA 5IFTA 5FD0A 3WDJA 5BYWA 2YL8A 5FOOA 1CGUA 1LL6A 2YA2A 3KL5A 1NWRA 5D9OA 2Y4SA 3WD1A 2E40A 1QI2A 3QHMA 2J7HA 2WKLA 1GJUA 2CBUA 2J7BA 1UQYA 3CZJA 3T0AA 3SEPA 2WW5A 1NQ6A 3OBAA 1E6ZA 2CXGA 4AZCB 2G3NA 1GHRA 2WXDM 2W92A 1QW9A 4PBGA 1UR0A 4MJ2A 1JYVA 1C7TA 2XVKA 4DUVA 3I3EA 1OWQA 4UCFA 4AD2A 5CLWA 3W38A 3AZRA 4AZ6A 1XHGA 3T2PA 3PN8A 4GO8A 5BRPA 3AMCA 4QDMA 2ZUTA 5HOSA 2W62A 2Z1KA 1CZ1A 3VIGA 1E0VA 1WAWA 6TAAA 4JL2A 1H0IA 1ZB5A 4WIWA 2X0YA 3AIRA 3UR8A 8CGTA 4H41A 4WKHA 1HJWA 3A4WA 1BYBA 2ZUNA 4WJXA 2NSXA 3VVGA 4ACZA 4P7RA 3I3DA 1JI1A 3VTRA 4FK9A 2PI6A 2GK1A 2E4TA 5IXEA 3SIMA 3PTQA 2BVTA 4NF7A 4UZUA 3CLWA 2JE8A 4OBSA 2XFYA 1RD6A 3PZMA 3B9EA 2JFEX 1EDQA 3TTYA 3F5KA 4UQDA 3WD4A 3W25A 1QNRA 4JHOA 4DWSD 3NYDA 3T2OA 3VGBA 2ZXAA 1V6XA 4HMDA 2EXOA 4Q22A 5AY7A 4N0RA 4KWUA 3IJ7A 3L2MA 2ZOXA 4P8XA 1Q6CA 4WF7A 2VC9A 1V3LA 4UNIA 4MAVA 4P7NA 1IZJA 1WP6A 4M29A 2ZICA 3WNPA 3U5YA 4BA0A 3WN6A 3M7SA 3W27A 4RL3A 4Q7NA 4Z2KA 1SR0A 2NT1A 2WM0A 1PZ2A 3N13A 1EHNA 5HPOA 4W87A 3AHTA 3VGFA 1W9BM 1GONA 3ARVA 3S6TA 4EE9A 4KRTA 4ZE4A 5EBAA 2W67A 2UY5A 1KWKA 2HVMA 4H8UA 3AIUA 3PZ9A 1ISWA 3DHUA 1R7AA 5LA2A 3AXXA 3VDHA 2YBTA 3J7HA 5I78A 2OSWA 1XCXA 1CGYA 4KGLA 2WZEA 4W8BA 1ZS2A 2F8QA 2DH2A 4M56A 1ODUA 3BLKA 3UESA 3TOPA 2OWCA 4XZWA 2XWDA 3AFBA 3GXFA 5A8MA 1UHVA 2XM2A 3AS0A 1UQZA 2PWEA 2PB1A 4MDPA 3RM4A 3VKKA 1LL7A 5E09A 1E6XM 1PAMA 1JXJA 3UERA 4JFUA 3VIMA 1J12A 3VIKA 4W5ZA 3IJ9A 1P6WA 2BY3A 2ZUVA 1D7FA 1PZ3A 4YHGA 1EIBA 3SUTA 4GI9A 1E3ZA 1Q6DA 2VOTA 4UZSA 3VINA 5HPCA 3HN3A 1QI0A 4W84A 4U31A 5GNZA 1KBKA 2Q8XA 1OINA 3AIVA 1V03A 4PRWA 5AC4A 4EKJA 4W89A 5CPQA 1TVPA 3FN9A 5CLTA 3MUY1 2WCAA 3GH7A 3PTKA 3N18A 4F79A 1KWGA 1UKQA 4GKLA 3AHVA 1W9PA 5I2UA 1UD2A 4ZENA 2ZXDA 4HOZA 3AIEA 1B0IA 1UWRA 3CUFA 1HP5A 1E5JA 2GVYA 1V3MA 4JCMA 4A4AA 3UR7A 3VDCA 1J01A 2GK1B 3AZTA 1NWUA 3W82A 1XSKA 2WSPA 1DWGM 5BXPA 4LYPA 5HXMA 6CGTA 1CDGA 1MFVA 3M46A 5A2BA 3NDZA 2E8ZA 2ZX7A 2QMJA 2V3DA 1S46A 5FKYA 2WANA 1D3CA 2AMGA 1V3IA 4D6DA 3WDQA 3AS1A 2J74A 4CKQA 4AYSA 5HNNA 5IHRA 2WHKA 3RJYA 2XGIA 2XVNA 2V5CA 1QHPA 5EB8A 1BYDA 1JAEA 4BQ5A 3VU2A 2YLAA 4C7DA 1CGTA 2WVUA 3ZJKA 3K8MA 1W1VA 1OGGA 3DYOA 4CN4A 1BVNP 3CBWA 4W7VA 5I0DA 3AHYA 1CGWA 2TAAA 3OG2A 1DWJM 3VMNA 1WO2A 1HJSA 3WDIA 3CZKA 4QFUA 4XV0A 1OM0A 2D3NA 4HZ7A 3SCTA 4HPHA 3CH9A 3WQ4A 4V28A 1B3VA 1W2VA 5TD4A 3T0DA 1E4IA 3CMGA 4AISA 4D6JA 1VEPA 3WBAA 1V6UA 1ESWA 3TTOA 3KEHA 1Z32X 3MO4A 5GNYA 4B16A 1WZAA 1V3JA 4URIA 3IK2A 3BMWA 3VUPA 4PCTA 3OA5A 3IJ8A 3MANA 3ZMRA 4JFVA 2D22A 3AJ7A 4AY1A 1FH9A 1MXGA 4FLQA 2YL9A 5CG0A 1VIWA 1TUXA 3MUAA 3WUFA 3AS3A 1WDRA 4PEEA 4KRUA 1GUVA 1JZ5A 4ML4A 3EDDA 2ZWZA 1QHOA 4P7QA 5A8OA 1KGWA 2YL5A 2A3AA 1PX8A 4P8UA 2VRKA 4MAZA 4UOJA 1CBGA 3MU7A 3ARZA 4AIEA 4AWEA 4QAWA 1AQMA 1KXTA 2WK2A 3ZR5A 1H41A 4DWSA 1M53A 2O9OA 3E1F1 2X8RA 4M24A 1C3FA 3WKZA 4UQCA 2G3IA 4XB3A 3VIHA 5M03A 2D2OA 5KEZA 4W88A 2VL4A 5A6LA 3W6MA 4PMVA 2WSKA 2XGBA 1TE1A 2XYLA 1MW0A 4S3KA 5JBDA 1JL8A 1ZU8A 1KGUA 1B3XA 1EDTA 2VZTA 2EPKX 1BFNA 2YDSA 5BXSA 2VX6A 4RE4A 5I79A 2PWHA 3WNMA 2EPMX 5LYRA 5JBEA 3U57A 2E9LA 4J7RA 1KGXA 3WF4A 1OGSA 2EBNA 2CNCA 3TP4A 5ABFA 4J3UA 1VENA 2FHBA 3VM5A 1DHKA 5A8PA 3GDBA 1BYAA 2UY4A 2QF8A 3AISA 4AZBA 5A6KA 3WNNA 1FH7A 4D72A 1V0NA 3THDA 1MFUA 1UH3A 7CGTA 3QOMA 1E15A 2BVDA 4FMVA 4CD4A 4CU8A 1UOKA 4AZCA 1UKOA 2E3ZA 1XV8A 1W91A 1FA2A 3RDKA 4FLRA 1A47A 1NP2A 1JF6A 3PZGA 1E1FA 4EANA 4U5KA 2VZOA 3VDBA 1UWIA 1X1NA 2ZUUA 3OB8A 1HJVA 2XUCA 1CXHA 3B8SA 4ZE5A 1UR1A 1J18A 1V02A 1E5NA 3T0BA 1B3YA 4TVDA 1WZLA 4W8AA 1H3GA 3OIHA 4U2ZA 4LGXA 3OLEA 4M81A 4X0NA 1B3WA 1O7AA 2VQTA 3WH8A 3W24A 1EA9C 3AIWA 1E3XA 3GXMA 2AAAA 1KXQA 1JF5A 2WCGA 3VPLA 1XSIA 5C71A 1ZJBA 4PTWA 1MQPA 1E72M 4LYQA 1O6IA 2BFGA 1HKIA 4PMNA 4QCFA 2DSWA 3SURA 2CETA 3CGTA 4J3XA 2YA1A 2BY1A 3CHCA 3ZSTA 3F5JA 1JDDA 4GIAA 4AIUA 1MYRA 4UFJA 2D0GA 2WHJA 1H1NA 1M7XA 3VGHA 3K46A 2JIWA 4MB4A 1EDGA 4JFSA 1E70M 3DYPA 4M8UA 1E4MM 1DTUA 1W3HA 1V0LA 4QLLA 3FHQA 5GQBA 3CPUA 1UA7A 4HP5A 1M01A 2XG9A 3F5LA 2ZXBA 2PC8A 2EPNA 3CIVA 3WDHA 3CZLA 3KL0A 2F2HA 4CVWA 2CESA 3AICA 3RJXA 2BVYA 5A6MA 7A3HA 1EOKA 1C7SA 1W1PA 4GI8A 4RE3A 1W9XA 2YIHA 1WKYA 5FL0A 1BVZA 4UQ9A 4DWSC 3WF3A 1C92A 1VRXA 3JUGA 4WKAA 1ISXA 3EMZA 4UR9A 2WNWA 2EPLX 1C8QA 3MUZ1 4PTXA 1UKTA 2UY2A 2OSYA 3IAQA 2CHOA 1CNVA 4TXEA 5D9PA 5DFAA 2VZSA 2XSBA 3BLPX 2ZIDA 2WAGA 1NH6A 4MADA 2ZWYA 1GW1A 1PX4A 4B3LA 3NSNA 2VURA 4YN5A 4KH2A 4PMQA 4J3TA 4PN2A 5JIWA 4F66A 2WZHA 1CLXA 1FFRA 5FIPA 2A3BA 1E55A 1QVBA 3WQ5A 5A6SA 3VNYA 4GINA 1I1WA 2VZUA 3BXWA 5A2AA 1XRVA 1ZJAA 2CBIA 1JNEA 3UG5A 1JNDA 5CJ5A 3GNRA 1NWSA 2DGAA 2VX7A 3O6AA 1CEOA 2C7FA 3GXDA 3ZT7A 3A4AA 1XD0A 4DM1A 1VB9A 4D1IA 1B31A 4U33A 2X2YA 2PWDA 4CN1A 5M17A 4WK9A 4R5EA 1SMAA 1BYCA 4IPLA 2DT2A 4L4PA 4MNLA 1E4NA 3POHA 1WNOA 4LPCA 4C7FA 1PIFA 4OKDA 1GVIA 4C7GA 2FH6A 1V0KA 1KB3A 1CYGA 3MMWA 2HISA 5JBFA 1E40A 1DWIM 3ARRA 1GHSA 1KCKA 3TA9A 2BHZA 1MWOA 1EOMA 3PZUA 3WMBA 3PZQA 4OUEA 2YBUA 3VD3A 1EO5A 1VBUA 3NJ3A 2XSAA 3WL1A 4CD8A 5A69A 5CSYA 3K4AA 3SUSA 4ATLA 4JKKA 3CZEA 1BHGA 1PBGA 3L4WA 2W63A 3AYRA 1EO7A 2DPEA 1OB0A 3PHAA 2A3EA 4W8LA 3L4VA 7TAAA 4IM4A 3SCSA 1ZBWA 3GZAA 4OZOA 1US2A 3FXYA 2XVGA 2VZVA 3EMCA 5DEZA 2OLHA 4D6HA 4AD3A 3ZSSA 3AIQA 1B9ZA 1HJXA 1BG4A 1OGBA 1EH9A 3S2CA 2YDQA 3PZVA 1MW3A 4PMXA 1G0CA 2Z1SA 4TOQA 4DUWA 2VR4A 1TA3B 3CO4A 2GSJA 3MUIA 3QGVA 5A6BD 2IXVA 2ZX8A 1XCWA 2A3HA 4AZHA 2D20A 2DEPA 1K9DA 4U2YA 2W66A 4GI6A 1JZ7A 3WQWA 3KL3A 1I75A 1GQIA 4PMOA 1L0PA 9CGTA 4J28A 3ARXA 2WB5A 1JZ3A 1M04A 5KZ6A 2JALA 1QPKA 2WC7A 3ZJ8A 3CUIA 3WBEA 1TMQA 3GXIA 4HOWA 1JZ6A 4GQRA 3HU7A 3AMDA 3SCUA 1J10A 3CHFA 2FHCA 5BXTA 2XPKA 1V6VA 2XFRA 1JYWA 3AYSA 4B9YA 1TR1A 1VEMA 4ATDA 4UFMA 4Z2IA 4JFTA 3WL0A 4F9DA 2PF0A 1U2YA 3N12A 4PYSA 5E6ZA 4F9JA 4W86A 1CXEA 5DT5A 3GYCA 3ARWA 1LL4A 3AMLA 3ZJ7A 3NCOA 4WSJA 4PMYA 4IUGA 5M3WA 1J9YA 3WIJA 2VUYA 2MANA 3WUBA 2DT3A 3QHOA 2FGLA 1MXDA 1RP8A 1QI5A 1OT1A 5LA1A 2O9TA 2WVVB 1QNQA 2BS9A 4UFKA 1BG9A 2XM1A 2VO5A 2GDVA 4H8VA 4AW7A 1CECA 1C93A 4WKFA 1K9EA 1HX0A 1JYNA 1FP8A 2CPUA 5I77A 3FAWA 3VD7A 2WVSA 1VFUA 3AMKA 3NUKA 1ZL1A 5I6SA 3RM8A 1CPUA 3D5HA 5CPSA 1Q6FA 4UFIA 4UFHA 1A3HA 1SFSA 5DT7A 1FH8A 1R87A 1UR4A 4ZFMA 4A3YA 1KFWA 1WDQA 3PBGA 1J0IA 2VI0A 3NSXA 2W4XA 3WH6A 4MNMA 2VCBA 1PIGA 1OCQA 3WNKA 3L4TA 1J0YA 2G3JA 3MV11 2J8FA 3WD3A 1OIMA 5C8BB 1BAGA 1LWHA 1QI3A 3AZSA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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