1UWTA

Structure of beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with d-galactohydroximo-1,5-lactam
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITREKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
publication title Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwtA00
3BMVA 4TVDA 5D9PA 1W1PA 4QLKA 1BYDA 4W85A 4HA4A 1E6RA 3NSNA 2IXVA 2E3ZA 4U5KA 3M46A 5ABFA 1W9VA 1W1TA 2YJQA 2BVTA 3MMWA 2QV4A 4XV0A 2G3JA 3F5KA 4AY1A 2D0HA 4PMDA 1GOIA 2A3AA 2X8RA 4C7FA 1G1YA 3CPUA 5GNYA 3J7HA 3UR8A 4D6FA 1W9BM 2V5DA 3AXXA 1B1YA 4EKJA 3VGGA 3FY1A 3PZNA 3GNPA 2FGLA 2J7CA 2WZIA 4GKLA 3WEOA 4CU8A 1LWHA 2QMJA 3ZT6A 1E4NA 3WQ5A 5I6SA 1MFUA 3WF2A 1UZ1A 4A3YA 3NYDA 5JIWA 1GOWA 1F4AA 1TG7A 4MPKA 1W1YA 1CBGA 1C3FA 3VIFA 3AHTA 1ZBWA 3VD7A 4R5EA 4UQAA 4GPNA 3OLDA 1J18A 1DWGM 3WQ6A 1ISWA 5AY7A 2Q8XA 5A94A 2XVLA 2PWDA 3WH7A 1BSIA 2UY4A 2V3DA 4MJ2A 4JFWA 5D9MA 4YHEA 1ZJAA 1C91A 4KRTA 3VPLA 2J8GA 3A4WA 4X0VA 3ARRA 4P8WA 1H41A 1H5VA 2WYSA 1HJQA 1BHGA 2JFEX 1MW0A 4WKFA 2PBOA 3ZJ6A 3PTKA 1MXGA 1W9DM 4UR9A 1R7OA 1R85A 1UG6A 3W6MA 3ALFA 4LXFA 1HVQA 4AD5A 4CCEA 3CUGA 3PZQA 1RP8A 3W0KA 2VTFA 5A6KA 4AC1X 2YIHA 1BQCA 1OGGA 1OCQA 3VOCA 3B9AA 2EO7A 8CGTA 1VFUA 3AMGA 3SCQA 4KGLA 5JBEA 1OIFA 3FAXA 3FXYA 4RE4A 3WBAA 3EBVA 2GK1A 2V38A 1U33A 3MUAA 2UY3A 1KGWA 4GI6A 1OT1A 1LG2A 2WVUA 4BCEA 2UY2A 4JKMA 2DDXA 1R86A 4V28A 5HXMA 2AOSA 3AIEA 3G6LA 1QW9A 3KEHA 8A3HA 1JYNA 4HOWA 4WSJA 4PN2A 2VJXA 2CERA 1MW2A 1CGXA 1FP8A 2DSWA 4LPCA 1TA3A 4PMOA 6CGTA 3WD2A 2IXUA 1B30A 4D6DA 4MADA 4JL2A 1VEOA 1EA9C 4WLCA 2J7GA 3WNKA 3AIWA 4BS0A 1JDCA 4PBGA 4Z2GA 5A95A 1WZKA 5I5RA 4J3SA 3PZ9A 5A6BD 2GJPA 1EO7A 1VFFA 2E9LA 2WLZA 2Y8KA 4UOQA 2A3EA 3GH7A 3GH5A 4UFHA 2GUYA 2O9PA 2BY1A 3WQVA 5D8ZA 3DYOA 4PMNA 1UD4A 3AIBA 3AIUA 4IM4A 1JI2A 2J62A 1UA7A 3MMUA 3AHZA 3ALGA 3N1AA 5HPCA 4ZE4A 5FOOA 1GQIA 2VT0A 2E4TA 3GXIA 3BC9A 2WZEA 3WQ4A 5IHRA 3WBEA 5A8PA 1UKTA 1M7XA 1CLXA 3CZKA 1MVYA 4J3WA 1NWSA 4JFUA 3WSUA 4PUDA 3BXWA 5DFAA 2WMIA 1LQ0A 5JUVA 4NZCA 4RE3A 4HOZA 2BY0A 2X0HA 3CHDA 2UWFA 3RMEA 3AMKA 1VENA 3QGVA 4AEEA 3GXFA 3L4UA 3KL3A 1ECEA 4PTXA 1XCXA 2VRKA 1EH9A 1EDQA 3K4DA 1KCKA 2E9BA 2YBTA 5A6LA 4MAZA 3RCNA 1ZBKA 5EMYA 3UERA 2PWHA 1GUVA 2GSJA 1UH2A 2OYMA 3L4VA 2VUYA 3BLPX 1KGXA 2W4XA 1W9PA 1MQRA 4AZIA 3U57A 1WPCA 1X6NA 1BVZA 2XUCA 1E9LA 2ZUVA 1JYWA 3ZOAA 4UQ9A 1G01A 5BWFA 7A3HA 5AYBA 3SUUA 3MUZ1 1FA2A 3PZIA 4TOQA 4OJYA 1B31A 4MB3A 1GQJA 1DWAM 3VDAA 4CD6A 5FCZA 4XB3A 3WUFA 2WKLA 1PPIA 5BCAA 3T0BA 3VD4A 5CJ5A 4ZXOA 5CPQA 5FD0A 5CGTA 5CLTA 1CENA 2WVSA 2OWXA 3KL0A 3RJYA 1E3XA 1IT0A 4H7VA 3ZMRA 5F7UA 2CETA 4AZGA 3SUWA 4GO9A 3ARVA 3AMDA 5ECUA 2BV9A 4Q7NA 2VX6A 1UHVA 1J0KA 2OYKA 3ZR6A 1WZMA 1UR2A 2J4GA 2XIIA 4AZHA 3RILA 4LGXA 4RE2A 2WHJA 1UUQA 1VFOA 4MDOA 2BHUA 2A3HA 5DEZA 1Z32X 1FFQA 3VIJA 3G6MA 1QI0A 2VL4A 1ZB5A 1CXHA 4MB1A 4CD4A 5CQ1A 1BAGA 3I3EA 4AD2A 4E4PA 1J01A 4J7RA 3LPGA 2IUZA 3MMDA 3W81A 2JE8A 4W5ZA 1Q6DA 3AZSA 1WDSA 1NP2A 1DWHM 2JF7A 3IAPA 2ZX6A 1NH6A 4QFUA 3AXIA 5A6AA 1NWTA 2BY3A 3GDBA 3VIMA 4DUWA 4B3LA 2NT0A 1WDPA 2WNWA 2OLHA 2F8QA 2WWCA 1E4LA 2YL8A 2X05A 2XHYA 3ARXA 2XFYA 1PAMA 4OOZA 3BAYA 3L4WA 1NQ6A 1V3IA 4N0RA 2WVVA 4M29A 3JUGA 3UESA 3NDZA 1YQ2A 4ZENA 1NOFA 3OA5A 1M03A 4AISA 4JFVA 4OOUA 2DT1A 1I1WA 3FN9A 2PI6A 1XC6A 2CBUA 1UH3A 2Y2WA 4A3HA 1UZ4A 2YA1A 3VMPA 3BMWA 4HMEA 1GHRA 2C0HA 2VVNA 4PSRA 1EDGA 2CYGA 3ZIZA 3WDQA 1UR8A 3PHAA 4DWSA 3A6OA 1EGZA 5DMYA 3MSDA 4UFLA 1HJVA 4BQ5A 3OG2A 3WDJA 4YPJA 4AZ5A 4F9JA 2VC9A 1E6QM 4Z2IA 4F9DA 3KE0A 3CHEA 2GJRA 3M7SA 4S3JA 1QBAA 3S6TA 1JZ4A 1XSJA 1SMAA 3K8MA 1W3JA 4MJ4A 4P7QA 4W84A 1C7TA 2JIEA 1LG1A 1E1FA 2VZUA 1UQYA 1EHAA 4FF5A 4JZ5A 1DWIM 4B15A 4Z2JA 1JD7A 4CCDA 3CZ8A 5D8WA 4QDMA 2GDVA 2E8YA 1E6PA 3N13A 4P8VA 3U7VA 2BXZA 4HMDA 2J75A 3MSGA 3T08A 4AW7A 2NSXA 3EMQA 4AZ7A 1PIGA 5A1AA 1XV8A 2D3NA 5ABFB 4P7LA 4M24A 4H2CA 1ITXA 1V6VA 4A4AA 3AS3A 2VRQA 3ARQA 3RO8A 1K9DA 2W63A 1ZL1A 1XRVA 3WY1A 1TMQA 1E5JA 1ZBVA 2YLAA 4LYQA 1FP9A 4TTUA 5ABGA 4D72A 5A8MA 1B2YA 2O9TA 3MU7A 1XYZA 2J79A 3ARSA 3AYRA 3WDIA 3F4VA 3PZTA 1H0GA 1K9TA 4FLQA 3PN8A 1VJZA 4KRUA 1G94A 2G3MA 1W9XA 1UWRA 3VDHA 3CUFA 5KEZA 3EYPA 5GPRA 2YKKA 4GZIA 5M03A 2YL5A 3GBDA 3AMLA 2XTKA 1BG9A 3DHPA 3BAJA 4IPLA 5CPSA 4YHGA 4NI3A 3VU2A 3M07A 2VZSA 2WBKA 3ZO9A 1IV8A 3CZJA 1QI2A 3W29A 3ARTA 4UFMA 2F61A 3B8SA 3BGAA 3ARPA 1JFHA 2A3BA 4HU8A 4L4OA 4D6CA 3AHVA 3E1F1 4PCSA 4U2YA 1V3HA 3UETA 3KWXA 1W2VA 1HL8A 2VMFA 4AZ6A 4CKQA 2XFRA 3WENA 4UTFA 3VVGA 5IFTA 4W87A 4AIOA 3EDDA 1JG9A 2XVPA 3VUPA 5E6YA 2CHNA 3U5YA 1NM9A 1EHNA 5I23A 3VGHA 2XVNA 3FW6A 2J7FA 4H8HA 4AYSA 1UWQA 4CN1A 3WUGA 3S2CA 4E8CA 2XFFA 4UFJA 2GK1B 3RDKA 1CGWA 2WHLA 1QNSA 4B9YA 2O92A 1CNVA 4ZFMA 1UR9A 2BY2A 3SCWA 2MANA 4GI9A 1WKYA 2VQUA 3SCUA 1TVNA 1FFRA 1PJ9A 3CLWA 3MS8A 5CSYA 2WMKA 1CXIA 4B3KA 1RD6A 1CXKA 1E6SM 4HPHA 3U7BA 1JI1A 1TA3B 4V2XA 1V0LA 2ZUNA 1C8QA 1V02E 3W25A 4QAWA 4Y7EA 3ZT5A 3TP4A 2Z1KA 2CKSA 2WMGA 3VMOA 3DYMA 1WE5A 2E9MA 4W8LA 3WEZA 4BQ2A 4LYPA 3T09A 1C93A 5M5DA 2PC8A 3AS2A 1FH9A 1AQ0A 2BFGA 1HJXA 2DH2A 4W8AA 3WMBA 1BLIA 1EXPA 3N17A 3AISA 4TTGA 3IJ7A 4P7NA 3SURA 3QHNA 4PYSA 3AHXA 1B3ZA 3ARYA 1NWUA 1JF5A 1KXTA 3IANA 4H04A 1B3YA 1W3HA 1JZ2A 3AS0A 1KXVA 4GQRA 3HMCA 4NRSA 3VO0A 1V6UA 4UQEA 1VEPA 1VJSA 1CXEA 4M81A 1E72M 4BZYA 5A8NA 2DSZA 3VM7A 3WL0A 2GDUA 2WMIB 2WMJA 3N11A 1E43A 3VX1A 4H8VA 9CGTA 1DTUA 3AYSA 3EDKA 2W62A 1QHZA 3T2OA 1VEMA 2WSKA 1HJSA 4E8DA 3WMCA 1GORA 3CIVA 3VNZA 2W67A 2WM0A 5C71A 3PZOA 1XYFA 1JXKA 1WDQA 3LMYA 4GZEA 1LL7A 3QOKA 1E73M 4JHOA 1HKJA 1B9ZA 1F4HA 1QNRA 1E6XM 1RP9A 3GNOA 2EPLX 3L2LA 3WH5A 1XH0A 2CPUA 3CMGA 2Y5EA 1JYXA 1CGVA 1ODUA 2ZXBA 3SUSA 1H09A 5HDRA 3SUVA 3TA9A 3POHA 3VMNA 4XUYA 3WDPP 4U33A 3FHAA 3ZT7A 4HZ6A 1W9UA 1XCWA 4M8UA 4TVCA 3GM8A 4PSPA 5A6JA 3OGRA 3AS1A 4NF7A 4UFKA 1FH7A 1J11A 1UKQA 2YDSA 2XWEA 1UD2A 1D2KA 4M80A 1JZ6A 1KFWA 2D0GA 1K9EA 1HP5A 2WC3A 2J7DA 1EQCA 3L4ZA 1QHOA 1BPLB 3GXMA 2HVMA 1M53A 1L8NA 2DQXA 1CGTA 4W89A 3W38A 3AMCA 1HF6A 3K8KA 3AICA 5JIPA 2BHZA 3FNDA 5CPTA 3WFZA 1KGUA 3BSGA 3L4TA 4QCEA 3TTOA 2X1IA 3UG4A 2XG9A 1AMYA 4EE9A 2QPSA 1WB0A 1V0NA 4CN6A 2EXOA 3WKZA 4TVUA 3WF1A 4B9ZA 2Y8VA 1V08A 4W7WA 5KZ6A 1VAHA 1PEZA 1C92A 1U2YA 4AD1A 5A69A 2VR4A 5IDIA 3OZOA 1EOMA 1E56A 1RPKA 2WHMA 5LYRA 3IAQA 1CLVA 3I3DA 4ACZB 2VURA 1C90A 3ZQ9A 1E6ZA 2Y4SA 4Z2LA 1D3CA 3CMJA 2OYLA 5E0CA 2ZUTA 4P8UA 2ZUWA 1E6NA 3AQUA 1U30A 2WAGA 2VX7A 1PX3A 1MQQA 2AAAA 1UWSA 5HOSA 5FL0A 3A4XA 1OT2A 6TAAA 2V5CA 3WNOA 4AD0A 2WSPA 5HBFA 3CBWA 4BQ3A 1GNXA 1UKPA 2GJXB 4J3VA 2DSVA 4NRRA 5I0DA 1JNEA 2QMKA 3SCOA 2J47A 1OM0A 1VBUA 2DH3A 1L0PA 4LYRA 3THCA 5BXRA 3MANA 2XM1A 4ACYA 4ATDA 4JIEA 3UEQA 3MO4A 4W7VA 2WVVB 1W91A 2F2HA 1CDGA 1HVXA 4J3XA 5CSUA 3WD3A 1XH2A 5A6MA 2ZUMA 4JL1A 1JAKA 2CCRA 4BF7A 4XZWA 1HX0A 4AEFA 1GVYA 4D71A 1JL8A 1R87A 1H11A 1NOUA 2WZHA 4UQDA 3UR7A 3RJXA 4XZBA 5A2BA 1HN1A 4W5UA 1TVPA 4L4PA 3THDA 4C7DA 1GOMA 3NCOA 3BAIA 3VGFA 3ZJ7A 1GPFA 4F66A 1UR4A 3ZJKA 2PF0A 3PZUA 5CGMA 2ZUUA 1MXDA 4OUEA 4F79A 4DWSB 4MNKA 1KR0A 3SCRA 1BF2A 3ARWA 4J3TA 3WNLA 3TTSA 2DEPA 5FIPA 2EPKX 3T0AA 1NARA 3N04A 2DT3A 5M3WA 3BSHA 4DM2A 1TFVA 2BXYA 2J25A 1DHKA 1ZJBA 3VGDA 1QNPA 4AWEA 1J0ZA 2OWWA 1Q4NX 5A6BA 2EEXA 3QHOA 4D6IA 1XSKA 5CG0A 4CU6A 4H8UA 1XHGA 1JIBA 2VR5A 4ZEPA 5HNNA 1WP6A 4ATLA 3BAKA 1SMDA 2BVYA 1KR1A 1V3JA 2G8ZA 4HA3A 1H4PA 4PRWA 3GXDA 4PMQA 4URIA 1CGUA 2OWCA 1MQPA 4PTWA 2YDQA 3W4RA 5A2AA 1S46A 1LL6A 3VD3A 1K9FA 2W92A 1WDRA 4PCTA 1Q6GA 2OSXA 1WO2A 3O6AA 4HZ7A 1WCGA 4AZCA 1Q6FA 3WDRA 2XIBA 1KXQA 3VGEA 3ZSTA 4GO8A 4FLSA 1J0HA 3WFLA 5A8QA 3A3HA 4UOZA 3L4YA 4U5IA 5DT5A 5I79A 4CN4A 1KBBA 1HXJA 2XM2A 3OLIA 5FKYA 1DWJM 1QNOA 1SR0A 1HJUA 1HNYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3BMV A;  4TVD A;  5D9P A;  1W1P A;  4QLK A;  1BYD A;  4W85 A;  4HA4 A;  1E6R A;  3NSN A;  2IXV A;  2E3Z A;  4U5K A;  3M46 A;  5ABF A;  1W9V A;  1W1T A;  2YJQ A;  2BVT A;  3MMW A;  2QV4 A;  4XV0 A;  2G3J A;  3F5K A;  4AY1 A;  2D0H A;  4PMD A;  1GOI A;  2A3A A;  2X8R A;  4C7F A;  1G1Y A;  3CPU A;  5GNY A;  3J7H A;  3UR8 A;  4D6F A;  1W9B M;  2V5D A;  3AXX A;  1B1Y A;  4EKJ A;  3VGG A;  3FY1 A;  3PZN A;  3GNP A;  2FGL A;  2J7C A;  2WZI A;  4GKL A;  3WEO A;  4CU8 A;  1LWH A;  2QMJ A;  3ZT6 A;  1E4N A;  3WQ5 A;  5I6S A;  1MFU A;  3WF2 A;  1UZ1 A;  4A3Y A;  3NYD A;  5JIW A;  1GOW A;  1F4A A;  1TG7 A;  4MPK A;  1W1Y A;  1CBG A;  1C3F A;  3VIF A;  3AHT A;  1ZBW A;  3VD7 A;  4R5E A;  4UQA A;  4GPN A;  3OLD A;  1J18 A;  1DWG M;  3WQ6 A;  1ISW A;  5AY7 A;  2Q8X A;  5A94 A;  2XVL A;  2PWD A;  3WH7 A;  1BSI A;  2UY4 A;  2V3D A;  4MJ2 A;  4JFW A;  5D9M A;  4YHE A;  1ZJA A;  1C91 A;  4KRT A;  3VPL A;  2J8G A;  3A4W A;  4X0V A;  3ARR A;  4P8W A;  1H41 A;  1H5V A;  2WYS A;  1HJQ A;  1BHG A;  2JFE X;  1MW0 A; 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 2GUY A;  2O9P A;  2BY1 A;  3WQV A;  5D8Z A;  3DYO A;  4PMN A;  1UD4 A;  3AIB A;  3AIU A;  4IM4 A;  1JI2 A;  2J62 A;  1UA7 A;  3MMU A;  3AHZ A;  3ALG A;  3N1A A;  5HPC A;  4ZE4 A;  5FOO A;  1GQI A;  2VT0 A;  2E4T A;  3GXI A;  3BC9 A;  2WZE A;  3WQ4 A;  5IHR A;  3WBE A;  5A8P A;  1UKT A;  1M7X A;  1CLX A;  3CZK A;  1MVY A;  4J3W A;  1NWS A;  4JFU A;  3WSU A;  4PUD A;  3BXW A;  5DFA A;  2WMI A;  1LQ0 A;  5JUV A;  4NZC A;  4RE3 A;  4HOZ A;  2BY0 A;  2X0H A;  3CHD A;  2UWF A;  3RME A;  3AMK A;  1VEN A;  3QGV A;  4AEE A;  3GXF A;  3L4U A;  3KL3 A;  1ECE A;  4PTX A;  1XCX A;  2VRK A;  1EH9 A;  1EDQ A;  3K4D A;  1KCK A;  2E9B A;  2YBT A;  5A6L A;  4MAZ A;  3RCN A;  1ZBK A;  5EMY A;  3UER A;  2PWH A;  1GUV A;  2GSJ A;  1UH2 A;  2OYM A;  3L4V A;  2VUY A;  3BLP X;  1KGX A;  2W4X A;  1W9P A;  1MQR A;  4AZI A;  3U57 A;  1WPC A;  1X6N A;  1BVZ A;  2XUC A;  1E9L A;  2ZUV A;  1JYW A;  3ZOA A;  4UQ9 A;  1G01 A;  5BWF A;  7A3H A;  5AYB A;  3SUU A;  3MUZ 1;  1FA2 A;  3PZI A;  4TOQ A;  4OJY A;  1B31 A;  4MB3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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