1UWU | Genus

Total Genus 199

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	199
sequence length	489
structure length	483
Chain Sequence	MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	BETA-GALACTOSIDASE
publication title	Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors. pubmed doi rcsb
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	199
structure length	483
sequence length	489
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date	2004-02-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1uwuA00

1QNPA 1Y7VA 4HZ6A 1Q6DA 2ZIDA 3NYDA 2J7HA 1Q6CA 3PTQA 4CVUA 1KBKA 4PMYA 4QLJA 2VT0A 2J7BA 5DT5A 3O2LA 2CIPA 3IAPA 3VGEA 3ARWA 4HP5A 1NP2A 2YA1A 1UR8A 1XSJA 4CD8A 1C7TA 1VB9A 4XV0A 3ZR6A 3GBEA 4PMXA 2EPOA 5DT7A 1EOMA 1ESWA 4AEEA 1MW1A 2PB1A 2GK1A 5HDRA 4DWSC 2VURA 3TOPA 5ABEA 4AXNA 3FXYA 3LPGA 3WIJA 4V28A 5EFFA 2DSWA 1NWSA 1CXLA 2GJXB 1UD3A 5DMYA 2VZVA 3SUVA 4CD7A 4BQ3A 2WVSA 1UUQA 4DWSD 2ZE0A 1CECA 4C7FA 3MS8A 1UWUA 2CEQA 1HJXA 3OLIA 5FKYA 4HPGA 1Q6FA 3GXMA 1OD8A 4MJ2A 3CHDA 4CCEA 3WFZA 5A6SA 4BZYA 3PZGA 2PBOA 3AYSA 1GOQA 2O9TA 1X6LA 3AICA 3WEMA 1XYZA 3HU7A 4PTVA 3A6OA 3VMPA 1SMDA 1PIFA 3VGHA 3TONA 4J7RA 2BXYA 3W38A 4L4OA 5TD4A 3SUUA 2OSXA 1V0MA 3EMZA 1XH2A 1UD6A 4OIFA 1GQLA 3UERA 5D9NA 2UY3A 2D23A 3AIQA 1C8QA 4CKQA 4DUXA 2E40A 1CXHA 1ZBWA 1B3ZA 2TAAA 3QHOA 3J7HA 3WDJA 1CGTA 3HN3A 2AMGA 1IZKA 3QHMA 1M03A 3VU2A 4WK9A 2JEQA 1HNYA 3OLEA 2J47A 3MUAA 1E3ZA 4D6IA 1DEDA 3AIVA 2ZUNA 2GK1B 1H0IA 4MJ4A 3B9AA 1NWRA 2O9PA 1CPUA 2BNJA 3RCNA 3WF1A 3AHTA 4R27A 1JYVA 1KGUA 4ZENA 5CPTA 1ZU8A 4PN2A 4AY1A 3GNPA 3AJ7A 2EEXA 1QVBA 4CN1A 3SCPA 1F4HA 1CWYA 2GFTA 4BQ4A 3ZQ9A 1RPKA 1VFMA 5LA2A 2A3CA 1V08A 1V3IA 3PZUA 3BXWA 3OIHA 3BGAA 1OIMA 2D24A 3ZSSA 2CKSA 1QW8A 3MUZ1 3L4UA 1ODUA 3PN8A 4P8XA 1E5NA 1QOXA 1GORA 2D3NA 1GPFA 3K8KA 4CUCA 1L8NA 1OD0A 2D0GA 1PIGA 2X8RA 3VGBA 4F9JA 3AMGA 1HL8A 3VIPA 5HBFA 1J0HA 1FA2A 1HKIA 3AFBA 5I5RA 2WANA 1QNRA 4H8UA 4P7QA 2XHYA 1A3HA 1OIFA 3ARZA 3NCOA 2Y24A 3W26A 5A1AA 2XUCA 4PUEA 5A8MA 3AMKA 2EBNA 1M7XA 3CZJA 3VIKA 3WF3A 3U5UA 2DEPA 4AEFA 1ITXA 3D5HA 5KZ6A 1PAMA 3W53A 4UOQA 4GQQA 1C91A 2EPMX 3PHAA 2X0HA 2GJRA 4Z2IA 1VAHA 1LL4A 5I77A 2VTFA 3OZOA 3M46A 1KBBA 2WMFA 4ZXOA 1MW0A 1AVAA 4TX8A 1DHKA 3MO4A 4U33A 5I3DA 1EH9A 3AS0A 1I1WA 4M1RA 1CGVA 1JYWA 2VVNA 1W9BM 2WYSA 2C0HA 2FDMA 4U5KA 2WVVA 4ZE5A 4HTYA 1ISVA 1O7AA 3CUHA 4EK7A 3AXHA 1HVXA 2BHZA 3RO8A 1UKTA 1QBAA 1EOKA 2CXGA 3ARSA 3QOMA 5A6MA 1CTNA 2MANA 2PWHA 2YL9A 5A95A 1CIUA 1BLIA 2CCRA 5JIWA 3APGA 1QHZA 4Z2LA 3CHCA 1LWHA 2EPNA 4JZ5A 2RGLA 4N42A 4CCDA 5E6YA 1GJWA 2XVGA 5D9MA 2CBIA 3WENA 1VBRA 3VUPA 1LWJA 1R86A 2G41A 4E4PA 3VGGA 1V3MA 1WCGA 3EDEA 2QMJA 2VRQA 1C92A 3IJ8A 4JFSA 4J3TA 4J3WA 4AIEA 3A4AA 2XFFA 3ALFA 2CBJA 2VR4A 3DECA 3BAXA 1XSKA 1UWSA 4ACZA 3HJEA 4FLRA 3T2PA 5JBFA 1QNOA 3DHUA 2VL4A 3LMYA 2JFEX 3VKKA 4EE9A 3AHYA 1E0VA 4P8WA 1JFHA 4V27A 3SIMA 1BYCA 4TVCA 1W3KA 4OOUA 1WO2A 5BXPA 3CPUA 2WVVB 4F79A 1E1FA 1W91A 3VNZA 1CLXA 3M07A 1HX0A 1K9EA 1XSIA 1QI3A 2VX6A 1XCXA 3IAQA 2BS9A 4P7OA 1WZKA 3W27A 5IHRA 3EDKA 2XG9A 5D9PA 3UEQA 5DFAA 2WSKA 3OGSA 1BG9A 3WDPP 1V02E 3W37A 2XWEA 1FH8A 3MMUA 3WNOA 1CGWA 3OB8A 4HMDA 3DHPA 2VX4A 2XM2A 3QGVA 4PMNA 1ODZA 3W28A 3KL5A 2YBTA 1OCQA 4HMCA 3BAYA 1J0JA 4WJXA 1WZAA 2YDSA 4D6DA 1QI4A 3T0BA 5CXPA 1R87A 2NT0A 2V3GA 4UQDA 2WMIA 3IANA 3KL3A 2DT1A 2HISA 1YHTA 3CZEA 1DP0A 4UFIA 3WUFA 1SR0A 3K8MA 1JAEA 3MMWA 3MKKA 2WMGA 2VX7A 1E3XA 2E9LA 3ARRA 2ZUTA 3CBWA 3VDAA 5M03A 1OSEA 2DGAA 1W3HA 6A3HA 4GI8A 2WZEA 1KXTA 2XVLA 2EPKX 3LPOA 1VF8A 2PWEA 2OYLA 3ZT5A 2E0PA 3SCQA 3SCWA 1DWFM 5A8QA 1LQ0A 1BF2A 1HXJA 4W89A 4HZ8A 2V3FA 3GXIA 1QHPA 1G9HA 3THDA 1TFVA 5FOOA 1JYXA 3DC0A 4PEEA 5HNNA 2HVMA 4D6CA 3PZ9A 3M7SA 4AC1X 4K68A 1BSIA 2ZUVA 1H3GA 2PWDA 5KEZA 3LPPA 4AD4A 1W1PA 4RE2A 3VDHA 2WCGA 3EDDA 3UESA 2Y8KA 1E55A 1PBGA 4CU7A 3CHEA 2Y5EA 2WM0A 1B9ZA 4DUWA 3PBGA 2W63A 5A8NA 1JGIA 4QAWA 1LG1A 3N12A 4BCEA 1U2YA 3ARQA 1PZ2A 2V5CA 4FLSA 3EYPA 4FLQA 2V38A 1GQKA 3ARVA 1I75A 3GYCA 1NP0A 2VCBA 3KWXA 1V3KA 4TTGA 3EBVA 3AIUA 4CU6A 3WNMA 3AISA 3F4VA 1V3LA 1E43A 5FL0A 4HOWA 1QPKA 1ISXA 1K6AA 1GOWA 1GVIA 2ZX8A 5BRPA 1JD9A 1NM9A 4H7VA 1XD1A 3ZJ8A 4UFKA 1V0KA 4B3KA 3OA5A 4MADA 3EMQA 4OBSA 2FH8A 3SURA 4TVUA 2OLHA 3ZOAA 1D2KA 3VMOA 2JF7A 5CZKA 4XZWA 3WH7A 4GZJA 4MAZA 1MQRA 4AZBA 1GNXA 4JCLA 1CXFA 3W82A 3BH4A 5DEZA 1UWIA 2GUYA 5BXRA 3CLWA 2C8NA 1TVNA 4XUYA 1XC6A 4HPHA 5GNXA 5C70A 1QBBA 1C8XA 1GZJA 4U2ZA 2F2HA 3WDRA 4EANA 3VPLA 1GOOA 3QHNA 4P7LA 3ARPA 3SCVA 1J0YA 4PMDA 3AIWA 1HL9A 2W61A 1W1YA 2IUZA 2W66A 2DH2A 3THCA 5CSUA 2GDUA 1NOFA 1FFQA 3WD0A 3BSGA 4M56A 4PTXA 3TTYA 3VGDA 4JHOA 4UCFA 1EIBA 3A47A 2BHUA 1EO7A 4H41A 4MB5A 3CZGA 2IXUA 2VRJA 8CGTA 3PTMA 4Z2JA 1UD2A 3CMGA 2VJXA 1VFUA 5ECUA 4WSKA 1V02A 2YL5A 3N9KA 1GOMA 1R7AA 3GH7A 1HKKA 4AZCA 4U5IA 1WP6A 2G3JA 5HOSA 3QR3A 3EDJA 1WDPA 1S46A 4JFUA 4PMRA 2YDRA 4AW7A 4AIOA 1E6QM 4NRRA 5I0DA 3BLPX 4WKHA 1B90A 1TUXA 1XGZA 5FCZA 2YLLA 4QCEA 1UR2A 2VVSA 3NSMA 1KR1A 3VX1A 1E4NA 2BVDA 1E6XM 1J01A 1UZ1A 3RMEA 1HKMA 4B9ZA 4QLKA 1E56A 2V3EA 4Z2HA 4PMQA 4NZCA 3N17A 4EAMA 1TR1A 2WHKA 1H0GA 4JHZA 1UZ4A 1K9DA 2ZXDA 4FLOA 3WBAA 4LXFA 2ZXAA 5CGMA 2BHYA 4UZSA 4UR9A 1X1NA 3VIHA 4X9YA 1ITCA 4L4PA 1NOUA 1JZ3A 1C8YA 1RP9A 1TMQA 1V6VA 2BFGA 4AD5A 2OSYA 4ZXLA 3I3BA 1RD6A 2ZXBA 1BFNA 2C7FA 3RM4A 1NQ6A 4GO9A 4W5UA 1B0IA 5M3WA 2PI6A 5FD0A 2UY2A 3VM7A 1OGGA 3BSHA 1IZJA 2J8FA 4AZCB 2EXOA 4LPCA 2XVPA 4HU8A 3AS2A 2G3IA 3FNDA 4UZUA 4ZE4A 3AHZA 2YA0A 1MXDA 1W1VA 4JL1A 2WBGA 3VX0A 3VIMA 4D6GA 1V6UA 3GXDA 1W2VA 1H1NA 1OB0A 1QI2A 1VIWA 2VQTA 3G6LA 1US3A 1Q4NX 2WC7A 3TTQA 3TP4A 1E72M 1VENA 4AIUA 1UD4A 5IHSA 4P8UA 3VIGA 1NARA 2Q8XA 1W3LA 3F5JA 1PX3A 3ARXA 3VIFA 1ISWA 3VM5A 4Z2KA 4J3XA 4NRSA 1B3YA 3W6LA 2XVNA 1EGZA 3HMCA 4CN6A 4N0RA 3GTNA 1E0XA 2VQUA 2E8YA 1KWGA 4JKKA 1JNEA 2D0FA 2WSPA 1M01A 3L4WA 1UWTA 1KQZA 3VILA 3AHXA 1AQMA 1BYBA 2WZHA 3SEPA 2D1ZA 2AAAA 4Q22A 1G5AA 5BROA 4X0VA 2JIWA 1G94A 1TCMA 2YIHA 1KXVA 4ML4A 2VC9A 3WF0A 2E9BA 3VD3A 5ABGA 1V0LA 4P7RA 2D22A 2ZOXA 1JDDA 2VO5A 3VOCA 2WHLA 3N11A 1TA3A 4V2XA 3K8LA 1G01A 3IJ7A 2Z1KA 1J12A 2EQDA 4PCTA 3T2QA 4HOXA 4CU8A 3RPMA 1K9FA 1LL7A 2D3LA 5A2AA 2E4TA 5A94A 1TZ7A 4M82A 1BHGA 3RILA 1H09A 3U7BA 1MQPA 4WLCA 1CGYA 3BLKA 1V03A 1GHRA 3WSUA 1EDTA 4D6JA 3NDZA 4F9DA 4PMZA 2CKRA 1G0CA 5CGTA 1WDSA 4GI6A 2ESCA 1GJUA 3PZTA 3T2OA 3ARUA 1JFXA 3A4XA 1X6NA 1E9LA 2EO7A 4AD0A 2YL6A 2YKKA 5JUVA 4U31A 4UTFA 1E5JA 3UR8A 7A3HA 1KR0A 4DUVA 4HOZA 1L0PA 2ZUSA 5JBDA 2YDQA 4YHEA 3NSXA 3VIOA 1RP8A 2E8ZA 1KFWA 3CUGA 3SCTA 3MV01 4HA4A 3T08A 2VOTA 3F5KA 3GH4A 3ALGA 1WZLA 4CD4A 5I6SA 1QHOA 5D9OA 3N18A 3L4XA 3UR7A 5BWFA 3ZR5A 1SMAA 2VRKA 2ZUMA 3U5YA 4KRUA 1WE5A 1V3HA 1HT6A 2ZWZA 2XGIA 4MAVA 2DDXA 3BAKA 5M5DA 4LX4A 1J9YA 3M6DA 4URIA 5BYWA 5LA1A 1H5VA 3N13A 4LGXA 2X2YA 1UOKA 1OWQA 3II1A 1H2JA 2WMJA 2XIIA 1GOIA 2XSAA 1HJVA 3SUWA 4PUDA 2OYKA 3NIYA 5GPRA 4UQ9A 4QP0A 1KGWA 1G1YA 3VNYA 5A6KA 1C3FA 1UH2A 1UWQA 3O6AA 2BXZA 1JI1A 2FGZA 3KE0A 3CMJA 1F4AA 2CHOA 2XPKA 2WW5A 1XD0A 3JUGA 4CD6A 2WVTA 5CJ5A 1KXHA 3CZLA 3WQ8A 3UG3A 1W9XA 1US2A 3BAJA 4AZ6A 4LYPA 3WQWA 3ZJ7A 4AZ7A 2A3EA 2G3MA 1WPCA 4WSJA 3MUY1 3RJXA 1JZ4A 2E3ZA 3PZOA 2CBVA 1HF6A 3MV11 2VCCA 3RM9A 4HMEA 3OGVA 4OZOA 1XYFA 1C7SA 2QPSA 4S3KA 1BTCA 3S6TA 4NI3A 4HZ7A 1V6YA 4KGLA 1PX8A 3OLGA 3IJ9A 5EFDA 3AQUA 3NJ3A 5BCAA 3VGFA 4MNMA 4YPJA 4UQCA 5JIPA 2WKGA 4B3LA 1MWOA 5GQBA 3ZIZA 3CUFA 4UOJA 4J28A 3GXFA 2ZX6A 3AI0A 4GZEA 1E6ZA 2GDVA 4CGTA 3MANA 4TXEA 4BA0A 4ACZB 2D0HA 2A3HA 1CYGA 1HN1A 2RGMA 4GZIA 4PTMA 1ZBVA 3ARYA 2NSXA 3L4TA 3LPFA 4D6EA 1CZ1A 2EJ1A 5CQ1A 4HA3A 3UG4A 4WF7A 2W67A 4LQ1A 4UFJA 3W29A 2D20A 3SCUA 1QI5A 1KB3A 1CNVA 2JF6A 3B9DA 1XRVA 1LF1A 4NF7A 2A3BA 2BY2A 2XFRA 3AZSA 1MVYA 4UFHA 2ZUWA 2YBUA 4W84A 3L2MA 3ZT7A 1MW2A 2DH3A 1VEOA 1HP4A 1LL6A 1K9TA 4W85A 1EO5A 4AZGA 1V6WA 2UY5A 5A6BA 4PMUA 4J3VA 1J11A 2WCSA 4RE4A 3WDQA 3VMNA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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