1UYQA

Mutated b-glucosidase a from paenibacillus polymyxa showing increased stability
Total Genus 175
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
175
sequence length
447
structure length
447
Chain Sequence
TIFQFPQDFMWGTATAAYQIEGAYQEDGRGLSIWDTFAHTPGKVFNGDNGNVACDSYHRYEEDIRLMKELGIRTYRFSVSWPRIFPNGDGEVNQEGLDYYHRVVDLLNDNGIEPFCTLYHWDLPQALQDAGGWGNRRTIQAFVQFAETMFREFHGKIQHWLTFNEPWCIAFLSNMLGVHAPGLTNLQTAIDVGHHLLVAHGLSVRRFRELGTSGQIGIAPNVSWAVPYSTSEEDKAACARTISLHSDWFLQPIYQGSYPQFLVDWFAEQGATVPIQDGDMDIIGEPIDMIGINYYSMSVNRFNPEAGFLQSEEINMGLPVTDIGWPVESRGLYEVLHYLQKYGNIDIYITENGACINDEVVNGKVQDDRRISYMQQHLVQVHRAIHDGLHVKGYMAWSLLDNFEWAEGYNMRFGMIHVDFRTQVRTPKQSYYWYRNVVGNNWLETRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
publication title Mutated B-Glucosidase a from Paenibacillus Polymyxa Showing Increased Stability
rcsb
source organism Paenibacillus polymyxa
total genus 175
structure length 447
sequence length 447
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2004-03-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uyqA00
5D9MA 4Z2IA 2QF8A 2X2YA 1GHSA 1JD9A 2W62A 2VO5A 3BXWA 3WFZA 4OJYA 1M7XA 3PTMA 3WUGA 3RMEA 4DUXA 4L4OA 1OD0A 2ZX5A 3POCA 3BMVA 2WKLA 1HX0A 3TTOA 3EDFA 4TXEA 3T0BA 3WNNA 2QLYA 3A4XA 1D3CA 5I24A 4D6FA 2YIHA 4B9YA 2WSKA 3TTYA 3AIBA 4H8UA 1E43A 1MW1A 3RJXA 5E6YA 5C70A 1E4MM 4OUEA 4H8HA 3GXIA 5HPOA 1KXVA 3BAWA 2JALA 2FH6A 2X0YA 3CUIA 3NJ3A 4QCFA 5JBDA 4MB4A 1W1TA 4UZUA 2QV4A 4HMEA 3WEZA 2EPLX 3AXXA 2JF7A 2VCCA 2GJXA 4AZGA 2VC9A 1NQ6A 1W9VA 4YHEA 4B9ZA 5ECUA 1BAGA 2W61A 3CZ8A 3OGVA 3VGHA 4J3XA 4P7OA 1H09A 1UR2A 3N9KA 1B2YA 3HJEA 4AD4A 2ZE0A 4AIOA 1CDGA 3MMWA 4CD8A 2WLZA 2YBTA 4OBSA 2FGLA 4W93A 1UR1A 2OWCA 3HMCA 5EFFA 2G3NA 4EANA 5CGMA 2DSZA 3QHMA 1A47A 5I5RA 1CECA 3WELA 2WHMA 1BHGA 5M03A 1ODZA 2WZHA 1OIFA 1ESWA 1JZ7A 3DC0A 1E70M 2VQUA 1BLIA 5AY7A 1RPKA 2PBGA 1V6XA 5A6MA 4WKAA 1H0GA 2WMFA 4NF7A 4Z2GA 4TTGA 1CYGA 4H8VA 1W9UA 1WAWA 2XVNA 5LA1A 3WF3A 4MB5A 1B90A 3VM7A 1V03A 2VL4A 3HN3A 1WE5A 2JEPA 1ISVA 3GH4A 3VIGA 3WN6A 3NSXA 4MJ2A 1GW1A 1LL7A 1JFHA 1GQIA 2VQTA 2C8NA 4MNKA 3PZ9A 3WQ6A 1XSKA 1E4IA 1HXJA 1PX4A 4M81A 1W2PA 1XD1A 2G3JA 4LYRA 1RD6A 2BVDA 1CXFA 1K9FA 1J12A 3T2QA 2J7EA 1W3JA 3AROA 1SMDA 3PZMA 3VGGA 3VD7A 1JI1A 2D24A 4MDPA 1DWJM 2W67A 2WVTA 2WPGA 2ZUNA 1XSJA 1GOWA 1JFXA 1CLXA 4W8AA 3L2LA 2A3AA 2GK1B 4GKLA 2VJXA 3NDYA 3VIJA 5A8NA 2QMJA 3AS0A 5FD0A 1FA2A 3I3BA 2XVGA 2Y2WA 1UHVA 4B3LA 1JZ2A 1ZL1A 5I79A 4YPJA 1JDAA 3WD1A 3MV11 4HU8A 1TVNA 1UH4A 3SCPA 2TAAA 4HZ6A 1G5AA 4XZWA 1MQPA 2YLLA 5IDIA 5EBAA 3VGFA 3DECA 2D0FA 3EDJA 5JBEA 2CYGA 3AHZA 4HA3A 3UCQA 4U31A 4HPHA 3BSHA 3AMKA 3PZUA 1E0VA 1UH3A 3A6OA 5LA0A 1GOOA 1HJUA 3CUGA 2DIEA 1KWKA 1OT1A 4E8DA 2ZXQA 3SCRA 4CD6A 3GNRA 3ZIZA 3VUPA 3ZQ9A 1V02E 3B9DA 2VURA 4R27A 2J7HA 3JUGA 2JEQA 1UUQA 1KQZA 4OOZA 2XM2A 2W4XA 4JFTA 5I77A 3OLGA 4V28A 2ZX7A 2VZSA 4MJ4A 1CWYA 2GK1A 3DYMA 5CSUA 5GNXA 4OZOA 1E55A 3L4WA 1RP9A 1OSEA 4WIWA 3S6TA 2DDXA 3VOCA 1RP8A 4ZE4A 1E6ZA 1US2A 3VILA 3ARVA 3L4UA 1G0CA 3CZEA 1ZBVA 3PZTA 4Q7NA 3TA9A 3VTRA 1V02A 3MUY1 2BS9A 1QW9A 3D3AA 2UY5A 2EPNA 1PX8A 1Q6GA 1MFVA 3RILA 1B0IA 5D4YA 3VKKA 2YJQA 2IXUA 1GPFA 3FAWA 5GQBA 2BY3A 2DSKA 1V3JA 4AC1X 3CTTA 1ISYA 4AD5A 1EDGA 2XGIA 3FHAA 4J3SA 4PMQA 2J77A 3EMCA 1DTUA 2X1IA 4AMCA 5DF0A 5I0DA 3CHDA 1LLOA 4DWSD 1BPLB 3IAPA 1BG4A 1EXPA 1IV8A 1LWHA 1UQYA 5ABHA 4C7FA 1UWUA 1VF8A 3WQWA 3VD3A 2CBJA 2VR4A 4QLLA 1E56A 2GDVA 3WF1A 1CLVA 4AZ7A 4H04A 2WCGA 1BVNP 4EAMA 2PC8A 4MNLA 3PZOA 4U2ZA 1VFFA 2EJ1A 1RH9A 4H41A 4D6GA 3AS1A 2WCAA 1PPIA 2E8ZA 3L2MA 4BF7A 2DGAA 3NUKA 1LL4A 2O9OA 3WIJA 4HP5A 2PWHA 4L4PA 2XIIA 1H4PA 2ZUTA 5A2CA 1UA3A 1M03A 1R87A 1VRXA 1W3KA 3ARSA 2W5FA 2D0GA 4P8XA 3EYPA 3MU7A 3WQ4A 1GOIA 4A3HA 1W91A 5C8BB 2ZUVA 5AYIA 4PTMA 2V3EA 2WK2A 5E6ZA 4U5IA 1PAMA 2VZVA 3M6DA 5E0FA 4AZBA 1KXQA 4CCCA 1UR4A 3DHUA 1CGXA 3O2LA 4MB3A 2WBGA 4PBGA 3BAYA 3MUIA 3U5UA 1A3HA 4NZCA 3WY1A 4E8CA 3WH7A 3KL5A 1NM9A 3GXFA 1JG9A 2E40A 3AMGA 1QNQA 1E6RA 4PSRA 3IJ7A 2GVYA 8CGTA 2HISA 3IK2A 3K8LA 1FP9A 1W1YA 2BHZA 3ARTA 5M5DA 3UERA 3GBDA 3EMQA 3W29A 4NRRA 2XVLA 2VVNA 2V5DA 5EFDA 2PB1A 3RM9A 7A3HA 4D72A 2WLYA 4ZE5A 3UR7A 3MO4A 3GZAA 1Q6DA 3NSMA 3QHOA 3W25A 2X0HA 2CCRA 1QI5A 4W87A 3ZSTA 4PTXA 3B9AA 4ZENA 3LMYA 2DQXA 1VENA 2CBIA 4W85A 1XCWA 1C8QA 3E1F1 2J8GA 1K6AA 1LF1A 1JZ3A 3WDJA 1UYQA 2JE8A 3WEOA 5DT7A 1E1FA 1WZAA 5A69A 3WMSA 1GOMA 1FH7A 3T09A 2JF6A 4URIA 1MW3A 3OIHA 2EPMX 1CEOA 1JF6A 3D5HA 4ATDA 3PZNA 3WDPP 1B31A 4DM2A 4D6HA 2CBVA 1QNOA 1ZBCA 3CBWA 2OSXA 1MWOA 1CZ1A 4PMOA 4UTFA 2WC3A 4GZEA 2PF0A 4B15A 2Y8VA 2YOCA 1H5VA 4Z2KA 1FH9A 4PN2A 1HJXA 1XH1A 2D0HA 4QP0A 4D6EA 3OGRA 4AXNA 1HNYA 5M17A 4RE4A 2B31A 1J01A 3W53A 3CZJA 2VI0A 3CPUA 1VAHA 4X9YA 1UA7A 4AZIA 2A3HA 3B9EA 1OCQA 3KEHA 4W7WA 3ZJ6A 1KXTA 1R7AA 2DIJA 4PMUA 3WL1A 5I23A 4PMXA 1JF5A 3EMZA 2QPSA 5FKYA 1J18A 4DUVA 5CPQA 3WNKA 1HKJA 4MAZA 1R86A 1GOKA 4A3YA 1IT0A 1E1EA 2WKGA 3VMPA 1ITCA 4GXPA 1WP6A 3ZOAA 3NCOA 1E15A 4NI3A 6CGTA 3M7SA 5JBFA 4GO9A 1BYAA 2ZUMA 3IJ9A 3WNLA 5A2AA 4M80A 2NT1A 1G1YA 3ARZA 2XGBA 4LYPA 1R7OA 3MKKA 4JFSA 1TG7A 4K68A 2WHLA 2DEPA 1UR9A 3VD5A 3MSGA 4D6CA 1VEPA 1EOMA 3ZT7A 1VEOA 1HKMA 3WQ5A 5A6LA 2ZUSA 4W84A 4JFWA 4BS0A 4GO8A 1X6NA 4PMZA 1J11A 4ZFMA 1EO5A 3SCNA 4FLSA 2PWEA 1HIZA 4AD0A 3ZR5A 2GUYA 1E9LA 4AW7A 3W81A 5F7UA 1WZLA 1XHGA 4D71A 1GCYA 3L4XA 1E5NA 1Q6FA 3G6MA 2XSBA 1KQYA 4RE2A 1UKSA 1NOFA 1ZJAA 2PWFA 1UKTA 1Q4NX 5BRPA 1J0YA 1DWHM 3AHTA 2Y8KA 1KBBA 2UY2A 1V6WA 4U5KA 4QCEA 3WNPA 4J3UA 3GXMA 3WD3A 1H3GA 1BFNA 1W2VA 4TX6A 4MNMA 2Y4SA 3SCWA 1E72M 2Y5EA 4W89A 1KR1A 1NARA 1HN1A 1JI2A 2XTKA 3BAKA 3GXDA 2VZOA 3FN9A 5AC5A 1GJWA 1PIGA 5HBFA 2X09A 1HJQA 3SUVA 5FCZA 3SCTA 1MW0A 1KFWA 3VIIA 1HP4A 5CLWA 1CNVA 2WZEA 1EIBA 1EQCA 1E6QM 2DT3A 2J7GA 1EDQA 2YL9A 3RM8A 3VIFA 1DWFM 1HJVA 5A8PA 4W88A 3LPPA 4CU8A 2HVMA 1WZMA 5ABFB 1CXLA 3N1AA 4JZ5A 1XCXA 2E9BA 3WEMA 4B3KA 3W27A 5BRQA 1JL8A 3ALFA 4V27A 2J7CA 4S3JA 4LYQA 3WFLA 3WKZA 2D22A 2DT2A 5E0CA 1JZ8A 4MB1A 1L8NA 4TUFA 3GNOA 5A6AA 3MUAA 2VX5A 4JHZA 2MANA 4FK9A 3M46A 2C0HA 4CD4A 4P7QA 5EB8A 4XV0A 2BY0A 1JYWA 3GBEA 5AYBA 4AD3A 4B16A 4UNIA 1VIWA 1PEZA 1FFQA 2WM0A 5HDRA 4F79A 3VNZA 1GZJA 2O9TA 2XJ7A 3VINA 2FH8A 4HTYA 2YA1A 3VIMA 2JFEX 1BVZA 7TAAA 1ZU8A 4QLKA 4UFKA 3WMBA 2GJRA 3VIHA 2EEXA 3RCNA 2E8YA 1MQQA 4CVWA 1SFSA 2PWDA 4OKDA 4HOXA 2D3LA 3G6LA 5AC4A 1QOXA 2YL8A 3BLPX 3RO8A 5ABFA 3WBEA 3EDKA 4JIEA 3VIOA 2QPUA 4UFMA 4AD1A 2VT0A 3AFBA 1W1PA 2Q8XA 2Z1KA 4KRUA 5IFTA 3SCOA 3WF4A 3AMCA 4W7VA 4UR9A 5HOSA 1Z32X 2PI6A 3LPOA 1EQPA 3SURA 4UQ9A 4XUYA 5A95A 4CN4A 5DO8A 1FHLA 4HMDA 1S46A 1AVAA 1CGWA 1D2KA 1UKPA 3ZMRA 2FDMA 3PTKA 3L4VA 4CU6A 4PSPA 5I6SA 3PTQA 3WNMA 1KCKA 3BMWA 3CIVA 3SEPA 1DWGM 4Z2JA 1AQMA 1E6SM 3DYPA 4UQEA 1GJUA 2EO7A 2WVVB 1P6WA 1CXIA 2XIBA 3W38A 2WVSA 2X8RA 1IZKA 1JYXA 1BG9A 4E2OA 1CENA 2QMKA 4EE9A 1U30A 2WCSA 2NW0A 4WSKA 3GYCA 3U7BA 5JIPA 3WDIA 1J0HA 2XYLA 1JYNA 4UQCA 4AZHA 2J8FA 4HOZA 1V6YA 2BVTA 5CSYA 1H49A 1H1NA 4Z2HA 2CEQA 3CZGA 3F5LA 5CPTA 3WSUA 1UQZA 1UD4A 5D9NA 4W5ZA 1UD8A 2ZWYA 1XV8A 2F2HA 1MW2A 4LXFA 4J28A 1DHKA 5GNYA 3PZGA 1CTNA 2PBOA 3OLIA 4GZIA 2XFFA 1VFOA 4J7RA 4E4PA 3RM4A 2BNJA 1U2YA 4P8WA 1CPUA 2G3MA 1E6PA 5KZ6A 2D1ZA 1C7TA 3AMDA 3WMCA 3T2OA 3WBAA 1OT2A 4PUDA 3OZOA 3VX0A 1JYVA 4R5EA 4F8XA 1CIUA 2CERA 2IXVA 2VUYA 4J3WA 1GOQA 1BGAA 4C7DA 1UD6A 3UG4A 3BAXA 5A1AA 1UR8A 2OYLA 1VJZA 1QHOA 3K8MA 3THCA 2ZXDA 3A3HA 4PYSA 1E0WA 3PHAA 1HL8A 5TD4A 1WDSA 3U7VA 2A3CA 1TR1A 2WAGA 3VDAA 1WB0A 4GI9A 4PCTA 2WC4A 4FLOA 1UR0A 4W8BA 4P7LA 3UG5A 2WVVA 4QLJA 1XC6A 3SUUA 5CJ5A 1LWJA 3AZRA 1HKIA 1CGTA 3IANA 3CMJA 1SMAA 5IHSA 1C92A 4V2XA 3L4TA 2C7FA 4WKFA 1HP5A 3WDHA 1LG2A 3VVGA 2WB5A 4PTVA 1E5JA 4RL3A 4U33A 4JKKA 4CKQA 4KMQA 3BC9A 2XPKA 1F4HA 1CXHA 1WNOA 2DSUA 1BYDA 1FP8A 3CZLA 5A2BA 3PZQA 1EHNA 3VPLA 1I1WA 2J79A 4QDMA 5EMYA 4PMYA 1EGZA 3ZT5A 3W28A 5DEZA 2JIWA 1KGXA 3FW6A 3IJ8A 4OIFA 1JD7A 2CNCA 4XB3A 3K1DA 4HZ7A 2E9MA 1JZ5A 3LPFA 4CD7A 1UWQA 2D23A 3WENA 1B3XA 3ECQA 2NT0A 4DM1A 3TTSA 4HMCA 4F66A 3GH7A 1NOUA 3MV01 1MFUA 1HJSA 3AS3A 3ZT6A 1NWUA 3THDA 3N18A 3W24A 3N11A 3WH6A 2O92A 1SR0A 2VRJA 3M07A 3RIKA 3WL0A 4CN6A 3EDDA 1ISXA 3VDCA 4TOQA 1BTCA 3T2PA 4WKHA 5E70A 1IZJA 2FHBA 3FAXA 3FY1A 4ZXOA 1HVXA 2G4FA 2BY2A 2AAAA 2YDRA 1E3ZA 4W86A 1LL6A 1QW8A 3DHPA 4KWUA 4C7GA 3GH5A 4AIUA 2Y24A 3UG3A 4YN5A 2WWCA 4ATWA 1GHRA 1W9PA 4FLQA 1NP0A 1PZ2A 1XYFA 2G41A 2J47A 3IAQA 1E6NA 2XVPA 1V3LA 1G9HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5D9M A;  4Z2I A;  2QF8 A;  2X2Y A;  1GHS A;  1JD9 A;  2W62 A;  2VO5 A;  3BXW A;  3WFZ A;  4OJY A;  1M7X A;  3PTM A;  3WUG A;  3RME A;  4DUX A;  4L4O A;  1OD0 A;  2ZX5 A;  3POC A;  3BMV A;  2WKL A;  1HX0 A;  3TTO A;  3EDF A;  4TXE A;  3T0B A;  3WNN A;  2QLY A;  3A4X A;  1D3C A;  5I24 A;  4D6F A;  2YIH A;  4B9Y A;  2WSK A;  3TTY A;  3AIB A;  4H8U A;  1E43 A;  1MW1 A;  3RJX A;  5E6Y A;  5C70 A;  1E4M M;  4OUE A;  4H8H A;  3GXI A;  5HPO A;  1KXV A;  3BAW A;  2JAL A;  2FH6 A;  2X0Y A;  3CUI A;  3NJ3 A;  4QCF A;  5JBD A;  4MB4 A;  1W1T A;  4UZU A;  2QV4 A;  4HME A;  3WEZ A;  2EPL X;  3AXX A;  2JF7 A;  2VCC A;  2GJX A;  4AZG A;  2VC9 A;  1NQ6 A;  1W9V A;  4YHE A;  4B9Z A;  5ECU A;  1BAG A;  2W61 A;  3CZ8 A;  3OGV A;  3VGH A;  4J3X A;  4P7O A;  1H09 A;  1UR2 A;  3N9K A;  1B2Y A;  3HJE A;  4AD4 A;  2ZE0 A;  4AIO A;  1CDG A;  3MMW A;  4CD8 A;  2WLZ A;  2YBT A;  4OBS A;  2FGL A;  4W93 A;  1UR1 A;  2OWC A;  3HMC A;  5EFF A;  2G3N A;  4EAN A;  5CGM A;  2DSZ A;  3QHM A;  1A47 A;  5I5R A;  1CEC A;  3WEL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ME8 A;  2QQ6 A;  3KRU A;  4AU0 A;  2NVA A;  4A3R A;  1Z48 A;  3QY6 A;  1C91 A;  1V6U A;  1UH2 A;  5BRO A;  3B06 A;  3PJX A;  1RBL A;  3UEQ A;  4L1X A;  3P60 A;  3UD6 A;  3EB4 A;  2DPE A;  1AZ1 A;  3P0W A;  3QQW A;  4H19 A;  3S1W A;  1OFQ A;  1W1V A;  5DMN A;  1H5Y A;  3WLM A;  4J27 A;  4R7J A;  2V2D A;  2E67 A;  5F4X A;  3OOD A;  4I9T A;  1ITX A;  3TWA A;  3LSB A;  3AML A;  3PG9 A;  4WGX A;  5G2H A;  5D8Z A;  3M0Z A;  4KES A;  4QE1 A;  4LAZ A;  3WD2 A;  4KWV A;  1JRC A;  1GEH A;  3UES A;  4F0S A;  1A3X A;  1LRO A;  2VFH A;  4DBW A;  1EX1 A;  4JKM A;  3BLO A;  1WXY A;  3LI0 A;  3AI0 A;  3GVW A;  2NQL A;  4FEZ A;  4QIU A;  1GVF A;  3RR1 A;  4HU3 A;  4RW5 A;  1VBJ A;  1NP2 A;  4U2Y A;  5JIW A;  4GH3 A;  4MZY A;  2C1G A;  4JFU A;  2CWX A;  1YDN A;  2QR6 A;  2C91 A;  3KOY A;  1F05 A;  2DW7 A;  3W7M A;  1S1R A;  2REQ B;  2O9P A;  2OR2 A;  4YU1 A;  4MTV A;  1CXK A;  4QDP A;  2G3I A;  3IS4 A;  3L0G A;  3T08 A;  3U57 A;  1CGU A;  3WQG A;  4JNZ A;  1B5T A;  3LK6 A;  1M5W A;  1RZM A;  1TZZ A;  2HCV A; 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