1UZ1A

Family 1 b-glucosidase from thermotoga maritima in complex with isofagomine lactam
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
443
structure length
439
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
publication title Common Inhibition of Both -Glucosidases and -Mannosidases by Isofagomine Lactam Reflects Different Conformational Itineraries for Pyranoside Hydrolysis
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 183
structure length 439
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2004-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uz1A00
5HNNA 3AHTA 2ZX7A 1LF1A 2QPSA 4MAVA 1V6YA 2X2YA 4J28A 4Q7NA 4YPJA 3VGEA 5GNZA 1PPIA 1M01A 5A6JA 5AYBA 2XFRA 4F8XA 4GI6A 5A8OA 3EDDA 2NW0A 4LX4A 3L4ZA 3WUFA 1HVQA 4ML4A 3PZUA 2FH8A 1MVYA 4IPLA 1W91A 4MPKA 1BYAA 1MW3A 2FDMA 2XJ7A 4GIAA 2G3MA 1VFMA 3POHA 1V02A 3W27A 1HVXA 4ATDA 1XYZA 1ISZA 4HOWA 1VBUA 2FGLA 1JDDA 4CU7A 2O9PA 5CLWA 5E0CA 4J27A 2E9BA 1CYGA 1TFVA 2D0HA 1YQ2A 2IXVA 2WXDM 4HZ6A 1ZBWA 1HJXA 1R7OA 4ATWA 5BWFA 1IV8A 1GOKA 3VINA 1V03A 4HTYA 2AMGA 2BY3A 4GQQA 4AC1X 5JIPA 2GVYA 3WBAA 1KBKA 1B3YA 1QI5A 1HF6A 1E6QM 1HX0A 3SCQA 4AEFA 3NUKA 4FF5A 4DWSD 2WM0A 1K9DA 1KXQA 1LJYA 2GFTA 3AI0A 3MMWA 4HPGA 4S3JA 2GK1A 2E4TA 1V3HA 3MSGA 3AFBA 5HBFA 1M53A 1RD6A 1HJUA 3FHQA 9CGTA 1BYCA 3QOKA 1KGUA 1KBBA 1V3IA 3SCOA 3N12A 4EE9A 5I23A 3WD1A 5GQBA 1TUXA 4CKQA 4GZIA 1QNSA 4B16A 1H5VA 4CD4A 1CIUA 3MUZ1 1BG9A 4OKDA 4DUWA 4OOUA 3O9NA 3AIWA 3RILA 4HMEA 3BSGA 1LWHA 3AHZA 4FLQA 5A2BA 3PZIA 1U30A 3AMDA 1UKQA 2CIPA 4PMZA 4E8DA 2VR4A 3CHFA 3QGVA 1WZAA 2OYMA 3N1AA 3VD5A 1UWSA 3CUFA 3WL1A 3W82A 5CZKA 3L4TA 2J8FA 1D7FA 3PTQA 2E40A 2WHLA 2X1IA 3OLEA 4K68A 5I24A 1V3KA 2J7CA 2VQUA 1KCLA 3BMWA 3FAXA 4Z2IA 2ZXQA 1KXHA 2WSPA 1J0IA 1DWAM 3PZOA 3AJ7A 4W89A 1B3XA 4GKLA 2IUZA 1UZ4A 3M07A 1MWOA 1QNRA 1NM9A 2UWFA 1C3FA 2D2OA 3VX1A 2OSWA 3BAKA 5AC5A 5ECUA 2YL8A 4OZOA 1BQCA 4PN2A 2J25A 4MNJA 4D6CA 2WVSA 1CTNA 4HZ7A 1B90A 4LYPA 3CZEA 1J9YA 3OZPA 4GI8A 1AQMA 2GUYA 4U2YA 1VFUA 2WMHA 5HDRA 1AQHA 2VRKA 3U7BA 1PBGA 5HXMA 2EBNA 3FNDA 4GINA 3KL0A 4QP0A 4AY1A 3AIRA 3K4AA 3MMUA 4N0RA 3UG4A 3ZJ6A 2CKSA 1UR1A 4P8VA 3WMBA 2QF8A 1W1VA 4D6FA 1E3XA 4TTUA 3NIYA 4PMQA 4NRSA 1C91A 3PZNA 2XWDA 4IUGA 2VX7A 3OB8A 1OT1A 3FAWA 4H2CA 4TOQA 1ISVA 1VF8A 4U2ZA 3TTOA 5CG0A 1W3KA 4W7UA 2YBUA 1XC6A 4GO8A 3EMZA 1XV8A 2ZUTA 3WMSA 1KWGA 2Y4SA 4CD6A 2UY2A 1B31A 3CUIA 3KZSA 4JHOA 2GK1B 1OGGA 1UD4A 1GORA 3K8LA 1PEZA 2EEXA 4H8UA 3ZSSA 1GPFA 3TA9A 1H2JA 3ZIZA 4KRUA 4QCEA 1JZ7A 2ZX6A 1XYFA 3ARPA 4GZJA 4M1RA 2OSYA 3OLDA 3AXHA 3WIJA 5IXEA 2OWXA 3U7VA 3N04A 7TAAA 4KH2A 3MS8A 1QBBA 2ZX5A 5C70A 3ARRA 3D5HA 1QHZA 1NWRA 3BLKA 1E0XA 3VU2A 4KWUA 2D22A 3PTKA 2WWDA 3HMCA 2PWFA 4AIOA 3W26A 5IHSA 3FY1A 1C8QA 2WC4A 5D9OA 1E6PA 3O2LA 1LG1A 3K8KA 5HPCA 3VD9A 2CBUA 4MADA 4H8HA 4BF7A 1IT0A 1XD0A 3VD4A 3KL5A 4D72A 2W66A 2D24A 1QPKA 5GPRA 2VI0A 3WEMA 5LA2A 1WAWA 4CVUA 3K4DA 2WHJA 2J62A 4CN4A 1JAKA 4MB3A 3VO0A 3GH4A 4M81A 5CPSA 4FLOA 1GOQA 3MANA 2IXUA 4UZSA 4UFMA 1IZJA 1BVNP 1X6LA 4JFVA 1JFHA 3PZMA 1E0VA 1J12A 1NARA 4A4AA 3GNPA 1QBAA 1OSEA 3MUIA 3A3HA 4H41A 3D3AA 1J0JA 3VDBA 2PC8A 4MJ4A 2VR5A 3ZO9A 1LL7A 2VRJA 1E9LA 3UR8A 4D6EA 1W3HA 3AIQA 4LQ1A 4KMQA 3WDJA 2PWGA 3OZOA 1Y7VA 3WBEA 1MYRA 3WMCA 3CBWA 4QDMA 2WVVA 1MXDA 3ARZA 3IK2A 3WH6A 1SR0A 4WK9A 3ARUA 2QLYA 1GZJA 2WLZA 1ISYA 4E2OA 3SUVA 1EDGA 4DM2A 4JFTA 1I1XA 1DEDA 3I3BA 1EDTA 3CZGA 4JFWA 4F79A 1CXEA 1HL8A 4U3CA 1ISWA 1BG4A 3CMJA 3MV01 4TVCA 4MTVA 1HN1A 1SYTA 2BFGA 3PZTA 1KWKA 1YHTA 3CGTA 4M80A 4RE3A 2CNCA 4V28A 2YL9A 2YOCA 1NOFA 3MUAA 2BY2A 2DSWA 1E43A 4E4PA 6A3HA 2BHZA 4F9JA 3SCPA 1WB0A 3ZJ7A 3VMOA 5BXTA 1WZMA 1BPLB 2VZOA 4TVDA 3ZJ8A 3KEHA 1UWIA 1H4PA 4CCCA 3SCNA 2OYKA 5JBFA 4D6HA 1VFOA 1LWJA 2DGAA 3OG2A 5KZ6A 4B3LA 4ATLA 3VDHA 2FGZA 1WDQA 4J3XA 1EQCA 5BXRA 5EFDA 1TMQA 2OLHA 1XSJA 1R86A 2WWCA 2ZUMA 3BMVA 5ABEA 5DO8A 2GSJA 3BC9A 4PMNA 1CLXA 1BVZA 1UR8A 3WNOA 4M82A 1B3WA 2EJ1A 1BF2A 1VBRA 1W3JA 4AYSA 1E4IA 2DEPA 2WC7A 2W92A 4LYQA 2ZXAA 2G3NA 2CPUA 4CD7A 5A1AA 1Q6CA 4IM4A 3IJ8A 2XGBA 1CXIA 3L4YA 1IZKA 4EAMA 1JYNA 3BGAA 1OD0A 2CXGA 5CSYA 3MO4A 1VJSA 2J7EA 2VX5A 4HA1A 3WQ5A 4R5EA 2ZXBA 1EGZA 1LLOA 1W9VA 2GJPA 1JXKA 3WD4A 1E1EA 3WQ4A 2VOTA 4GI9A 4B9YA 1HJQA 3BAIA 1UA3A 1JL8A 3AS1A 4ZXOA 5I5RA 3U5YA 1CZ1A 1UKTA 5D8WA 4H8VA 4WLCA 5A6MA 4P7OA 1NP0A 2PF0A 2BV9A 4PCTA 2WVVB 4PMXA 4ZFMA 3WEOA 4J3WA 3K1DA 4YHGA 2WCGA 3B9AA 3GH5A 1KQZA 2ZOXA 3KWXA 1ZBCA 1JAEA 3BCDA 1W3LA 5A2CA 2NT1A 4QLLA 3WH7A 2CBVA 4XX6A 2X0YA 2BXZA 4B15A 1XH1A 2DPEA 4CVWA 1CLVA 3N9KA 3GZAA 4HZ8A 5I79A 4PBGA 2DT3A 2XWEA 3AXXA 4P8WA 4CN1A 4URIA 3HU7A 2YL5A 3VPLA 1VFFA 4M24A 4Z2KA 5CGTA 3LPPA 5BYWA 3CHCA 2EQDA 5E6YA 2DT0A 1F4HA 1ZL1A 1DWHM 4UFJA 5E9AA 2VZSA 3ALGA 1DWJM 1JI1A 3F4VA 1ZJAA 1UZ1A 3QHNA 1QNQA 4OUEA 1ODZA 1R7AA 3N13A 3RMEA 3UETA 3WF2A 4ACYA 4UZUA 2W67A 4XB3A 1WO2A 2G3JA 1GOOA 1R8LA 1VRXA 1HKMA 1WDSA 3N18A 3BAWA 3RJYA 1HIZA 4J3TA 1X1NA 2JEQA 2WHKA 1W9XA 2WANA 1VJZA 3BXWA 1JD7A 2ZUNA 3WDQA 1LG2A 2O9RA 3ARYA 1QI0A 3RIKA 3AXIA 1JYXA 3SEPA 3W6MA 1KR0A 1VENA 3L2LA 2XVLA 1E1FA 3M6DA 2YKKA 3WD2A 1KB3A 3DHPA 5D4YA 2C7FA 1BFNA 1GONA 3T2PA 1FHDA 1W1PA 5CJ5A 3AIUA 2ZIDA 3OA5A 3L4VA 1G01A 5BRQA 1MW0A 4TX8A 1UD3A 1G5AA 2DSKA 4EKJA 5C71A 2V5DA 2PWHA 4MDPA 4X0VA 4AIUA 1FP9A 3WDRA 5ABFA 1EOMA 2FHFA 1NP2A 3ZR6A 2WCAA 5JUVA 1OGSA 2PBOA 4W5UA 1G94A 3TONA 3W37A 1E73M 6TAAA 2JIWA 3TP4A 3LMYA 2G8ZA 3QHOA 4ACZA 2JF7A 1UD8A 3N17A 5ABHA 3RDKA 5DFAA 2D23A 2W63A 1V6UA 1I75A 1UQZA 4WIWA 4OJYA 5CLTA 3F5LA 1H3GA 2WMJA 2WMFA 4WKAA 2GDVA 3A4AA 4PCSA 4JKKA 1GJUA 1OGBA 2XGIA 3VIGA 4NF7A 4XV0A 1H1NA 1GHSA 2J77A 2CKRA 3AZSA 1PIGA 1GQKA 4AZ6A 6CGTA 1KGWA 4L4PA 1W2PA 2WZEA 3VM5A 3SUUA 4P7LA 4CN6A 1FH7A 1K6AA 1PIFA 1UR9A 2V38A 4OIFA 3A4WA 5I3DA 2BS9A 2EPKX 4JCLA 1C8YA 2WC3A 1DHKA 1EO7A 3CZ8A 7CGTA 2TAAA 4RE2A 4P7NA 5BRPA 2Q8XA 3SURA 3M7SA 1CBGA 1WE5A 3AMLA 2BNJA 1PZ2A 1HNYA 3KL3A 1CXFA 5E0FA 4ZENA 3WN6A 4WSJA 1UWQA 2XVGA 2GJXB 2EO7A 3CH9A 4ZE4A 3WF1A 1XGZA 4UOQA 2JIEA 4FLRA 2W61A 4BS0A 1AQ0A 3RM4A 3AHXA 3I3DA 5IFPA 1UWTA 4HA4A 1PX3A 1JFXA 4U31A 2VZUA 1AMYA 2X0HA 1UR2A 1JD9A 1J0HA 5EFFA 3UG3A 3ARTA 4TX6A 1TZ7A 4PTXA 3ZSTA 1JYVA 5I2UA 2J7FA 3I3EA 3NDZA 4AISA 3AHVA 4NSBA 2YLAA 3AZRA 1JZ8A 1R85A 2QMKA 3ZOAA 1TG7A 4L4OA 1DWGM 4TTGA 1V0KA 3MSDA 2BVTA 3CMGA 4AD2A 5FL1A 1CENA 3VIHA 2VNCA 1Q6EA 3QR3A 2QHAA 4PMOA 4Q22A 3N11A 2XHYA 1RH9A 5ABFB 3VD7A 1B0IA 1UA7A 3NDYA 1JF5A 3WF0A 3A4XA 1H11A 5DT5A 1JG9A 1UUQA 2F61A 4S3KA 1CXLA 2WNWA 3WF4A 3DYPA 2D3NA 2EXOA 4ACZB 1QI3A 1SMDA 1E70M 3WF3A 5ABGA 3EDKA 4UQCA 4AZ5A 3WEZA 4GPNA 1KGXA 2WCSA 1C92A 4W84A 3FXYA 2XPKA 1XRVA 2OSXA 1OT2A 1ZU8A 1BGAA 1BYDA 2O9OA 2J7DA 1HJVA 2D0GA 3VOCA 3WQ6A 5A8MA 2A3HA 2J78A 1VEOA 2V3FA 2CEQA 2CBIA 1O6IA 4UQBA 3VDCA 1JNDA 1MQRA 4MJ2A 1B30A 1MFUA 4CGTA 4HMDA 1OIFA 4DWSC 1ZBKA 1W9PA 5EBAA 3GXFA 4JKMA 2ESCA 3G6LA 3BAJA 4AZCB 2Y2WA 4BQ4A 2YBTA 1H09A 3HN3A 1E71M 1OBAA 1R87A 1C90A 3AS2A 3WNKA 3BSHA 3QOMA 1WDRA 1HKKA 3ARWA 2Z1SA 4PMDA 2CITA 1XH2A 2CYGA 3WFLA 1GOIA 1QW9A 2WAGA 3HJEA 5DF0A 3EMCA 1BYBA 3RO8A 4WKFA 1CGTA 4ZE5A 2NT0A 3W38A 4NI3A 1WCGA 3OGRA 1V08A 5A6BA 2ZE0A 1QNOA 4YHEA 5M17A 4HOZA 4M56A 1RP8A 2WW5A 3JUGA 3CHEA 3WNMA 4EANA 2BHUA 5LA0A 1TVNA 5F7UA 3PHAA 4HOXA 4QAWA 4U5IA 1U2YA 5AC4A 5BCAA 1L8NA 2VC9A 3BCFA 1GW1A 3ALFA 5M03A 3M46A 2FHBA 2A3BA 4P8XA 5I0DA 2J7BA 4OOZA 3DYMA 4W7VA 1E15A 1LL6A 3W53A 5A6LA 4W7WA 4RE4A 2VCBA 3N15A 1H0GA 2BY1A 2O92A 1CPUA 1CECA 1BSIA 2WK2A 4OBRA 3SCTA 3GBEA 5KEZA 2YDSA 3CLWA 4MB1A 1CEOA 1E4MM 1UWUA 1Z32X 4CU8A 3J7HA 5IHRA 4UQDA 2E8YA 1EH9A 4W8BA 4UQ9A 3WNPA 4JL1A 4PMUA 4MAZA 3GYCA 1N82A 3AS3A 1E6ZA 2VCCA 1B9ZA 2YIHA 3GXMA 1OM0A 2A3CA 5EB8A 3AICA 4V2XA 5FIPA 3VUPA 3K46A 3KE0A 4W88A 1UD5A 1EXPA 1WP6A 1EHAA 2WMIA 8A3HA 2WKGA 5AYIA 2CERA 2HVMA 1J01A 2QV4A 2XYLA 4PMVA 2GDUA 2VX6A 2VX4A 4P7RA 1SMAA 1ITCA 3VIMA 5LYRA 2AAAA 3VGDA 1ECEA 2Y8KA 1NQ6A 1B2YA 4PTMA 1JZ3A 1MXGA 2WYSA 5JBDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HNN A;  3AHT A;  2ZX7 A;  1LF1 A;  2QPS A;  4MAV A;  1V6Y A;  2X2Y A;  4J28 A;  4Q7N A;  4YPJ A;  3VGE A;  5GNZ A;  1PPI A;  1M01 A;  5A6J A;  5AYB A;  2XFR A;  4F8X A;  4GI6 A;  5A8O A;  3EDD A;  2NW0 A;  4LX4 A;  3L4Z A;  3WUF A;  1HVQ A;  4ML4 A;  3PZU A;  2FH8 A;  1MVY A;  4IPL A;  1W91 A;  4MPK A;  1BYA A;  1MW3 A;  2FDM A;  2XJ7 A;  4GIA A;  2G3M A;  1VFM A;  3POH A;  1V02 A;  3W27 A;  1HVX A;  4ATD A;  1XYZ A;  1ISZ A;  4HOW A;  1VBU A;  2FGL A;  1JDD A;  4CU7 A;  2O9P A;  5CLW A;  5E0C A;  4J27 A;  2E9B A;  1CYG A;  1TFV A;  2D0H A;  1YQ2 A;  2IXV A;  2WXD M;  4HZ6 A;  1ZBW A;  1HJX A;  1R7O A;  4ATW A;  5BWF A;  1IV8 A;  1GOK A;  3VIN A;  1V03 A;  4HTY A;  2AMG A;  2BY3 A;  4GQQ A;  4AC1 X;  5JIP A;  2GVY A;  3WBA A;  1KBK A;  1B3Y A;  1QI5 A;  1HF6 A;  1E6Q M;  1HX0 A;  3SCQ A;  4AEF A;  3NUK A;  4FF5 A;  4DWS D;  2WM0 A;  1K9D A;  1KXQ A;  1LJY A;  2GFT A;  3AI0 A;  3MMW A;  4HPG A;  4S3J A;  2GK1 A;  2E4T A;  1V3H A;  3MSG A;  3AFB A;  5HBF A;  1M53 A;  1RD6 A;  1HJU A;  3FHQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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