The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKVVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGHAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
NEURAL HEMOGLOBIN
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| publication title |
Thr-E11 Regulates O2 Affinity in Cerebratulus Lacteus Mini-Hemoglobin
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
44
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QSS B; 5HLU A; 5E83 B; 1R1X A; 2D2N B; 3IC0 B; 2FRF A; 3EDB A; 2FRK X; 1YIH B; 5EYS A; 1YHU C; 2BLH A; 1THB B; 1G09 A; 2DN2 A; 3RGK A; 4PNJ A; 5CMV A; 5KER B; 3FH9 A; 3UHB A; 1GBU A; 3UHW A; 3OK5 A; 2ZFO A; 1Y8K A; 2O5Q X; 4B3W A; 1A0Z B; 2O5B X; 1CG8 A; 1QI8 B; 3WTG A; 1XZ5 A; 2R50 A; 1MBS A; 1QPW A; 101M A; 1V4U B; 1HSY A; 2D5Z A; 1SPE A; 1HAB A; 1XZV B; 3FS4 B; 4N7O A; 5JGG B; 4HRR B; 2DHB A; 1ECO A; 1OUU A; 1S5X A; 1MBD A; 1M9P B; 1MYT A; 3PI9 A; 1A01 B; 2VLZ A; 3GQP A; 1WVP A; 2BNL A; 1JL6 A; 3OJ1 A; 1LFZ B; 3GDJ B; 4BJA A; 2GL3 A; 2HHB B; 1S0H B; 1GCV B; 2HHE B; 1MYI A; 1YHU B; 1Y0W A; 1VXD A; 1DTM A; 3BJ2 A; 1YE2 A; 1XZ2 A; 1K0Y A; 1FSX B; 4H0B A; 3ZJO A; 1ECN A; 3ED9 A; 1YFF B; 3LB4 A; 1Y4G A; 2JHO A; 4F6B A; 3PT8 A; 1BZR A; 4ROM A; 2BLJ M; 2Z85 A; 2W6X A; 2V1G A; 3D1K B; 1CH9 A; 1Y46 B; 3UBV A; 1CBL A; 1BZP A; 3M38 A; 5CNB A; 1XZU B; 2BW9 M; 3D4X B; 1MBA A; 4HHB A; 1Y8H A; 1V4W B; 1YHE A; 1YVQ A; 2ZSQ A; 2NSS A; 3DHR B; 1WLA A; 1XY0 B; 1URY A; 2AV3 A; 2EB8 A; 2FAM A; 3EOK A; 1SHR B; 4ESA A; 2ZFO C; 1W92 A; 5HY8 B; 4O1T A; 111M A; 1Y4V B; 2O5S X; 1DO4 A; 1NWI A; 5D5R A; 4N7P A; 1UIW B; 1HGA A; 1JY7 A; 1H97 A; 2AUP A; 1VXA A; 1Y0D B; 1TES A; 1CG5 B; 1HBS A; 3ZHW A; 2MGJ A; 105M A; 1MWC A; 1IBE A; 1ABS A; 1DXT A; 1S5Y A; 1VXE A; 3ZH0 A; 2ZLX A; 1B0B A; 5KKK A; 4G1V A; 2QRW A; 1GDK A; 1G0B A; 1CH4 A; 1MLH A; 1CBM A; 2HBD A; 2MHB A; 3A9M A; 1XZ7 B; 1Y4P A; 3E5I A; 1COH B; 3NFE A; 1HJT A; 1VWT B; 2AUR A; 1HV4 B; 2RI4 B; 1LFV A; 2M6Z B; 1J3Y A; 1XYE B; 1J41 A; 2VYY A; 1MKO A; 1GCW B; 3A59 B; 5HBI A; 1BBB B; 1Y8K B; 3S66 A; 2SPO A; 4DWT A; 4ROL B; 1XZ5 B; 2GTL D; 1ITH A; 3HC9 A; 4NI0 A; 1CH2 A; 1RQ4 B; 1MWD A; 1HDA B; 2QMB A; 3UGY A; 3WCV A; 2D5X B; 3AQ9 A; 4XS0 A; 1NIH B; 2VM0 A; 2EB9 A; 2QFN A; 1MLR A; 2R80 B; 1EMY A; 2BWH A; 3UHE A; 1V4X A; 2DXM A; 3ZJM A; 4OF9 A; 2HCO B; 1PBX B; 1YGF B; 3K8B B; 1YG5 A; 1IRD A; 2ZFB A; 3OGB A; 3U3E A; 3ARL A; 2ZS0 D; 1JPB A; 3DUT A; 2MGL A; 4L7Y B; 4NS2 A; 3P5Q B; 1LFL B; 1UX9 A; 1YHR B; 3OZV A; 1LH2 A; 3MBA A; 2QLS B; 1Y7D A; 1O1I B; 1Y4G B; 3QJB A; 1B86 B; 3WFW A; 4FWX A; 5CNG A; 3KMF A; 1RQ3 A; 3ASE A; 1YEV B; 3OO4 A; 3WCT B; 1BUW A; 5AB8 A; 1YVQ B; 109M A; 3ECZ A; 1Y09 A; 3BOM A; 1WMU B; 2PEG A; 1HBI A; 3ARK A; 1QSI A; 2G3H A; 3ZOM A; 3A5G A; 5E6E A; 1XZ4 A; 3LR9 A; 3SZK B; 1BVC A; 1CLS B; 4N8T A; 1HGC B; 5EE4 D; 3WCV C; 4O35 A; 1LHT A; 4U8U D; 1Y2Z A; 3HXN B; 2ZSR A; 2G0R A; 1G08 A; 1JWN A; 3AT5 A; 4KMW A; 4DWU A; 5SW7 B; 1G9V A; 1A6M A; 3R5I A; 1IDR A; 1GBV B; 5EET A; 1FAW A; 1G0B B; 4MQI B; 3HRW B; 112M A; 2HZ1 A; 1MLJ A; 4MQJ B; 1Y4P B; 3TM3 A; 4F6F A; 1SI4 A; 3QMA A; 1J7W A; 2MYB A; 5HLQ A; 1VXH A; 4MAX A; 4F4O A; 1MOA A; 2ZWJ A; 1MKO B; 1Y0C B; 1Y8I B; 1O1J B; 1HAC B; 1Y83 A; 1F63 A; 1O1L B; 1YEQ A; 1DTI A; 5JDO E; 1J7S A; 1SDL A; 3G52 A; 3MJU A; 2PGH B; 4MQG A; 1LA6 A; 1Y31 B; 1MBO A; 4FH6 A; 3WCV B; 1YEN A; 2MGI A; 2HHD A; 1DXC A; 1DXU A; 3O7N A; 3M3B A; 1NZ5 A; 3VRE B; 3ZJR A; 1HBH B; 4H2L B; 1YG5 B; 1C40 B; 1V75 B; 1Y7Z B; 1SDK B; 2ZFB B; 3S1J A; 1Y5J B; 1LH6 A; 4PQB A; 5KDQ B; 3ONZ A; 3VHB A; 1MLM A; 3B75 B; 3S48 C; 3A5A A; 3ZJJ A; 3UH5 A; 1PMB A; 5CN9 A; 1BJE A; 1MTK A; 2V1E A; 1KD2 B; 3DR9 A; 4UZV A; 1A6N A; 1A0U A; 1CMY B; 1ECD A; 3IA3 B; 2Z6N B; 5B84 A; 1K1K B; 1IOP A; 1A4F A; 1GLI B; 4ODC B; 3LQD B; 3ZJN A; 2H35 A; 2EVK A; 1VXB A; 1MYG A; 2DN1 B; 2MGG A; 4O4T A; 1CP0 A; 1CIO A; 1LFT B; 2ZFO D; 2HBE A; 1Y5F B; 1AJH A; 1NZ3 A; 1KR7 A; 5CN4 A; 3TLD A; 1URV A; 1JF3 A; 2D2M A; 1CH1 A; 5HLX A; 4YU3 A; 3DHT A; 1AZI A; 4YU4 A; 1QXD A; 2XKG A; 5ILE A; 3D7O A; 1JL7 A; 4M4B A; 1Y45 B; 1IT3 A; 4OOD A; 2W6W A; 3ODQ B; 2GTL B; 1R1Y B; 4F6G A; 5EUI A; 4TWU A; 3QJE B; 1MGN A; 1IWH A; 3GKV B; 3M3A A; 1VXG A; 1HBB B; 3GOU A; 5E29 A; 4NXC A; 1DXV B; 1MLF A; 3IXF A; 3UHS A; 1YEO A; 4MQK B; 1V9Q A; 4NI1 B; 1S6A A; 3ECX A; 2IG3 A; 2ZSS A; 3G4W A; 5ILM A; 3GKT A; 3PI8 A; 1HBR B; 2B7H A; 2MYE A; 3MJP B; 3ZOL A; 1O1K B; 1ABW A; 1AJ9 A; 3NG6 B; 3G46 A; 1JP8 A; 4MQC A; 2ZS0 B; 2ZLT B; 2WTG A; 3MYM A; 3GQR A; 3GYS A; 1DKE A; 5ILP A; 1FLP A; 1BVD A; 1HCO B; 1Y4B A; 2XKI A; 1OUT B; 1YVT A; 1G0A B; 5JDO F; 1Y7G B; 1O1P B; 1VXF A; 4H07 A; 1J3Z A; 1A3N B; 1OBM A; 4FC3 B; 3LR7 A; 1Y5K A; 3MN0 A; 2ZLU A; 3IC2 A; 3PT7 B; 1X9F A; 1DWS A; 2D2M C; 4JAC A; 3HHB B; 1O16 A; 3UH3 A; 2ZSX A; 1NQP B; 2ZSP A; 2H8D A; 3UHH A; 2ZLV B; 4ZVA A; 1HHO B; 4FWY A; 2ZLW B; 1Y4Q A; 1NS6 B; 2BK9 A; 2IN4 A; 2MGK A; 2OIF A; 3KUO A; 3ONZ B; 4MQH B; 1RPS B; 5EYJ A; 1MTJ A; 1CPW A; 1Y0T B; 2VHB A; 4U8U B; 4O2G A; 3EU1 A; 1BAB B; 3MKB B; 1T1N B; 2GLN A; 1O1M A; 1CP5 A; 3NMM A; 2AA1 B; 3UHU A; 1UVY A; 1A4F B; 1CQ2 A; 3S65 A; 1O1N A; 1EBT A; 3AT6 B; 1A3O A; 1SPG A; 1HDB A; 1JF4 A; 1RVW B; 3ZJI A; 1NPF A; 1FHJ B; 2HBS A; 5CHQ A; 2NSR A; 1YZI A; 2SPM A; 2VLY A; 2GKM A; 1TU9 A; 3EDA A; 3VRF B; 1YEU B; 1LFQ B; 1RQA A; 3WCV D; 1MLO A; 1UFP A; 3QM7 A; 3BJ3 A; 2W31 A; 2O58 X; 4N7N A; 2C0K A; 1MYH A; 1A00 A; 3QZZ A; 4F6J A; 1LJW A; 1MLQ A; 3HEP A; 3PI2 A; 1JZL A; 2VRY A; 1IWH B; 3PEL B; 1NGK A; 1X9F C; 1NEJ A; 3VRG B; 1UT0 A; 1A6K A; 2EKU A; 1LH1 A; 1UMO A; 3GQG B; 1I3D A; 1NS9 A; 3PIA B; 2V1J A; 1LH3 A; 2B7H B; 1Y4F A; 2V1K A; 3LB3 A; 2MGM A; 1M6C A; 4KMV A; 3WHM B; 1MLK A; 5MBA A; 1HBG A; 1Y85 A; 3UH7 A; 1C7C B; 1BZ0 B; 1S56 A; 1C7B B; 1QSH B; 1JP6 A; 1Y0A A; 3A0G A; 3GLN A; 1R1X B; 3O89 A; 2W72 A; 5EV5 A; 4F69 A; 2NRL A; 3QM5 A; 1LH5 A; 2D60 A; 1G09 B; 2MYD A; 2DN2 B; 2VEB A; 1C7D A; 3WCU A; 5CN8 A; 1YCB A; 1X9F B; 1Y8W A; 3FH9 B; 1F5O A; 4X0L A; 1GBU B; 2QFK A; 2LH7 A; 2ZFO B; 1LFY A; 3UHR A; 1MNI A; 2WY4 A; 3WFX A; 1CG8 B; 3D17 A; 1MOC A; 3WTG B; 2BKM A; 1QPW B; 1V07 A; 3K3U A; 2ZT1 A; 2ZSN A; 4DC8 A; 2D5Z B; 1HAB B; 1BZ1 A; 4N7O B; 1MYJ A; 2DHB B; 1OUU B; 1S5X B; 3BCQ A; 1QXE A; 5JDO D; 2R1H A; 5C6E A; 3PI9 B; 2FRJ X; 3QQQ A; 3GQP B; 5AZQ A; 3V2V A; 2W6Y A; 2MBW A; 2HBC A; 3MYN A; 2RAO A; 1Y4R A; 2HBF A; 1Y0W B; 5CNE A; 4F68 A; 1LH7 A; 3BJ2 B; 1YE2 B; 1XZ2 B; 3NL7 A; 3WI8 A; 1XQ5 A; 1HGB A; 4HBI A; 1K0Y B; 4WJG 1; 6HBW A; 2V1H A; 3WFT A; 2SPN A; 3G4R A; 2MYC A; 3PT8 B; 4ROM B; 3CY5 A; 3BJ1 A; 2O5O X; 3ZJQ A; 1Y35 A; 2FAL A; 4HHB B; 1FCS A; 4NZI A; 1CH3 A; 1Y8H B; 1YHE B; 1YDZ A; 5EU2 A; 1HDS A; 3HF4 A; 1MLU A; 1CQX A; 2MYA A; 2O5L X; 3EOK B; 1YIE A; 3LB1 A; 4ESA B; 4NK1 A; 2G0S A; 4WCH D; 3UHX A; 3UHN A; 1FN3 A; 2QSP A; 4TYX A; 1DLY A; 5F0B A; 1H1X A; 4N7P B; 3UHQ A; 2EF2 A; 1HGA B; 1JY7 B; 4G51 A; 5B85 A; 1JZK A; 1HBS B; 3WCW A; 1UX8 A; 2GRF A; 1IBE B; 1RTX A; 4L2M A; 1DXT B; 1S5Y B; 2GRZ A; 104M A; 2R4X A; 3VAU A; 1YH9 A; 3R0G A; 3WCP A; 2ZLX B; 1Y0A B; 3A0G B; 3UH6 A; 1DUO A; 3A5B A; 1BIJ A; 4IT8 A; 2HBD B; 2H8F A; 2MHB B; 4KN3 A; 4VHB A; 3HEO A; 2VYZ A; 1ECA A; 3NFE B; 3M39 A; 4M4A A; 1XXT A; 1BZZ A; 1LFV B; 1GZX A; 2D2M D; 1M6M A; 2MGF A; 1J3Y B; 1JEB A; 1YGD A; 1J41 B; 3UGZ A; 1CH5 A; 4DC7 A; 1ABY A; 3G4V A; 1A6G A; 3S66 B; 2G12 A; 1S61 A; 1O1O A; 3QJD A; 3KMF C; 4NI0 B; 2QMB B; 1IT2 A; 1RSE A; 4IRO A; 4XS0 B; 3UHT A; 5EQM A; 1HRM A; 4HRT A; 1N9H A; 1AJG A; 4PQ6 A; 2QSS A; 1MLS A; 103M A; 1V4X B; 2DXM B; 5E83 A; 1IRD B; 2D2N A; 3IC0 A; 1YIH A; 108M A; 1THB A; 3DUT B; 1EW6 A; 3WCW C; 1BZ6 A; 5KER A; 2QU0 A; 1FDH G; 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1MYF A; 4F6I A; 1Y0D A; 2OHB A; 2AUO A; 1CG5 A; 1YMC A; 1DO7 A; 1YEN B; 4MBA A; 1U7R A; 3QM8 A; 2HHD B; 4HRT B; 3UHZ A; 1MBI A; 1DXU B; 3ZJP A; 1JP9 A; 1D8U A; 3GK9 A; 4O4Z A; 1BIN A; 2G0X A; 3RJN B; 2ZSZ A; 1J7Y A; 3OVU C; 1GJN A; 1XZ7 A; 1CH7 A; 2GNW A; 1COH A; 5CN6 A; 2OH8 A; 1MNH A; 1VWT A; 1HV4 A; 2RI4 A; 4MXL A; 2M6Z A; 2QU0 B; 1XYE A; 5HU6 A; 1Y01 B; 1GCW A; 1KFR A; 3A59 A; 2Z6T A; 1BBB A; 1MBN A; 4ROL A; 3UI0 A; 1A0U B; 1HBA A; 1NWN A; 3WCU D; 1JDO A; 1RQ4 A; 106M A; 1HDA A; 2D5X A; 110M A; 1CO9 A; 2H35 B; 4XDI A; 1Y7C B; 1NIH A; 1MLG A; 107M A; 1N9F A; 2Z6S A; 1MWB A; 1MBC A; 2DN3 B; 3UHY A; 2WTH A; 3K9Z A; 2HBE B; 3OO5 A; 4MBN A; 2D6C A; 4G1B A; 3UBC A; 2R80 A; 4GZG A; 3LB2 A; 1DXD A; 1XCH A; 1YE0 B; 2G0V A; 5CNF A; 3H57 A; 2HCO A; 2LH6 A; 1PBX A; 1YGF A; 2D2M B; 5D1V A; 3K8B A; 4YU3 B; 3DHT B; 2ZSY A; 4YU4 B; 1QXD B; 2MB5 A; 1NAZ A; 3D7O B; 3LHB A; 1IRC A; 4M4B B; 4L7Y A; 2W6V B; 3P5Q A; 2MGA A; 1YOG A; 2HZ2 A; 1LFL A; 1YHR A; 3MOU A; 2EVP A; 5EUI B; 1CIK A; 3AG0 A; 2QLS A; 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