The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
IFDIYVVTADYLPLGAEQDAITLREGQYVEVLDAAHPLRWLVRTKPTKSSPSRQGWVSPAYLDRRLKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Sh3-domain
|
| molecule keywords |
OBSCURIN
|
| publication title |
Solution Structure of the SH3 Domain of Obscurin
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
4
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-04-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GLM A; 3U23 A; 1JXO A; 2MOX A; 2OAW A; 2J6K A; 2JT4 A; 1ZUK A; 2EYX A; 3PE0 A; 1WYX A; 4OMM A; 1ZSG A; 5I11 A; 2JS0 A; 3TVT A; 2JM8 A; 2FPE A; 4R0K A; 1W1F A; 2PTK A; 1WX6 A; 2CH4 W; 4RTT A; 2F2V A; 2D1X A; 2YUN A; 3SHW A; 5EC7 A; 3REB B; 4J9H A; 4J9I A; 2L0A A; 4OMP A; 3TSW A; 1UHF A; 3QWY A; 2EVR A; 2BZX A; 2CSI A; 2DE0 X; 1NG2 A; 3UF4 A; 1T3L A; 1PHT A; 1YN8 A; 1GRI A; 1JXM A; 1YP5 A; 2K3B A; 4OMO A; 4M4Z A; 4J9E A; 2B86 A; 2DNU A; 4RTU A; 2YUP A; 2A37 A; 1WI7 A; 2DA9 A; 1KJW A; 2CRE A; 4A63 B; 1K0X A; 2V1Q A; 1B07 A; 2EYW A; 1K9A A; 4AFZ C; 1MV0 B; 2AKL A; 2L3Q A; 4RTY A; 4F17 A; 1T0H A; 1WXU A; 1GCQ A; 1JU5 C; 1WA7 A; 1Z9Z A; 1CSK A; 2YDL A; 3ULR B; 2DX1 A; 2FPD A; 4X1V A; 1T0J A; 1U06 A; 2KBT A; 2GTO A; 2KRS A; 1GBR A; 3ZL7 C; 4J9C A; 2RN8 A; 2D0N A; 1J3T A; 1UFF A; 2L3P A; 2OI3 A; 5IHI A; 1GCQ C; 3VRZ A; 2DL3 A; 2ABL A; 2GBQ A; 1SSH A; 2YUQ A; 2JTE A; 2ESW A; 2J6O A; 2F2X A; 2KXC A; 2X3X D; 2I0N A; 4AG1 C; 2DJQ A; 2LQW A; 1PKT A; 3KFV A; 4Z88 A; 2DVJ A; 2L3S A; 2C0I A; 1A0N B; 1AVZ C; 4WCI A; 1G2B A; 5ECA A; 1AWX A; 1UUE A; 2O31 A; 1TG0 A; 1QLY A; 4KRT A; 1NEB A; 2ROT A; 1NLP C; 1NM7 A; 1SRL A; 1UE9 A; 2DL4 A; 2DM1 A; 1E7O A; 1ZBJ A; 1YWP A; 4AFU C; 4J9B A; 4QT7 A; 3RBB B; 2O9S A; 3QWX X; 4AFQ C; 2PNI A; 2ROL A; 2DIL A; 5IHN A; 1X2Q A; 1MUZ A; 1UG1 A; 2EQI A; 1PNJ A; 2D8H A; 2CUD A; 2DL5 A; 4OMN A; 2BZY A; 1NYF A; 4ZNX A; 1AZE A; 3EHR A; 4CC4 B; 2LX7 A; 2KYM A; 2EPD A; 3EG2 A; 4JJB A; 3PVQ A; 5IH2 A; 3M0Q A; 1I0C A; 2KYB A; 2EW3 A; 3VS5 A; 2VKN A; 1GCP A; 5GJV B; 2AKK A; 1QCF A; 2RF0 A; 2YSQ A; 4J9D A; 2KRM A; 1X69 A; 2JMA A; 2RPN A; 1JEG A; 1M8M A; 1UEC A; 3C0C A; 4CC2 A; 2KR3 A; 3TSZ A; 1PRL C; 4CC7 A; 2RMO A; 2EYZ A; 1MV3 A; 1VYU A; 1K76 A; 2RQW A; 1WLP B; 1X6G A; 5IHK A; 1OPL A; 1GFD A; 1YWO A; 2HSP A; 4IIO A; 1HD3 A; 1X2K A; 2LP5 A; 4Z8A A; 2LJ0 A; 3JV3 A; 4LUD A; 2EGC A; 3H0H A; 1W70 A; 3I35 A; 2HDA A; 2BZ8 A; 4HVW A; 2GQI A; 1HSQ A; 4Y92 A; 1X27 A; 4JJD A; 3M0P A; 2RNA A; 3R6N A; 2FPF A; 3M0U A; 4RUG A; 3LH5 A; 4F14 A; 4LUE A; 1M3B A; 1KIK A; 1HJD A; 1AWO A; 4GBQ A; 1CKA A; 1ARK A; 2C0O A; 2K7A A; 1PRM C; 1U3O A; 5HCK A; 1OEB A; 1E6H A; 1G83 A; 1GBQ A; 2DBM A; 1SPK A; 2OJ2 A; 1FYN A; 1SHG A; 2L2P A; 1VYT A; 3VS1 A; 2VWF A; 2AZV A; 4JZ4 A; 1Z9Q A; 4E6R A; 2HEQ A; 4OMQ A; 1E6G A; 3EG0 A; 1H8K A; 3UA6 A; 1WDX A; 1H92 A; 1RLP C; 2JM9 A; 2ECZ A; 1KSW A; 4HVV A; 3EHQ A; 2IIM A; 4ORZ A; 2RQR A; 3VS2 A; 4ESR A; 2C0T A; 5IXF A; 4JPB W; 2EGE A; 2H8H A; 3VS6 A; 2O2O A; 4CC3 A; 2BTT A; 4D8K A; 3H0I A; 1X6B A; 4RTX A; 2YT6 A; 2FO0 A; 4HCK A; 1UTI A; 2MIO A; 2A36 A; 2O88 A; 1CKB A; 2RQU A; 1K0S A; 4JZ3 A; 3H0F A; 3NHN A; 5IXB A; 5FWC A; 2D8J A; 3CQT A; 2K9G A; 3THK A; 1RI9 A; 4HVU A; 1RLQ C; 2GTJ A; 3UA7 A; 2KRO A; 2MCN A; 2CUB A; 1ZLM A; 2M51 A; 1FMK A; 1UJ0 A; 2FRY A; 1X43 A; 1BBZ A; 2KT8 A; 2NUZ A; 2J06 A; 2JMC A; 2DLP A; 2YUO A; 1K4U S; 5GJW B; 1S1N A; 1K1Z A; 1BU1 A; 2KGT A; 1VA7 A; 1EFN A; 4RTZ A; 5FWB A; 2P4R A; 1JQQ A; 4F16 A; 2LJ1 A; 3RNJ A; 2E5K A; 1SEM A; 2EYY A; 2KT1 A; 2KE9 A; 1B3Q A; 1WXB A; 1BK2 A; 2EBP A; 2J05 A; 1AWJ A; 2DL8 A; 1TUD A; 2FG0 A; 1NLO C; 3UAT A; 1XOV A; 2DMO A; 4K11 A; 1N5Z A; 2DBK A; 3H41 A; 2DL7 A; 3VS4 A; 2JW4 A; 1LCK A; 1ABQ A; 1QKX A; 3VS3 A; 2KNB B; 1QWE A; 1I07 A; 1UJY A; 3IQL A; 4DEX A; 2ED1 A; 2X3W D; 4DEY A; 2O9V A; 2FRW A; 2J7I A; 4J9F A; 3EG3 A; 1AEY A; 1NEG A; 2CH4 A; 2JXB A; 2A08 A; 4LE9 A; 2GGR A; 2LMJ A; 1OPK A; 2LQN A; 3EGU A; 2DRM A; 4EIK A; 2RQT A; 1JO8 A; 1M27 C; 1GFC A; 1PWT A; 3NMZ C; 1ZUY A; 2HCK A; 2LJ3 A; 1QWF A; 1WFW A; 3SEM A; 2DYB A; 1RUW A; 3O5Z A; 1M30 A; 5I22 A; 1I1J A; 2K2M A; 1KFZ A; 2AZS A; 4FSS A; 1VYV A; 3EG1 A; 2GNC A; 5FW9 A; 1M3A A; 2KEA A; 4D8D A; 1ZX6 A; 2W0Z A; 1OOT A; 2EKH A; 1AOJ A; 1SRM A; 4RTV A; 4IIM A; 3NGP A; 1ZUU A; 1AWW A; 2CT4 A; 3M0R A; 2RQV A; 3REA B; 2LNH B; 1ABO A; 2CDT A; 2LZ6 B; 4AG2 C; 1SHF A; 2J6F A; 1Y57 A; 2ENM A; 3A98 A; 1H3H A; 2G6F X; 2DF6 A; 3GBQ A; 3I9Q A; 1YNZ A; 2QDL A; 3VS0 A; 2NWM A; 3VS7 A; 5L23 A; 3PVL A; 3FJ5 A; 2A28 A; 4AFS C; 4HXJ A; 1M3C A; 1V1C A; 2CSQ A; 3I5R A; 1WXT A; 2V1R A; 2HBW A; 4LN2 A; 4JJC A; 3VRY A; 1GL5 A; 3I5S A; 2M0Y A; 1UDL A; 1AD5 A; 1TUC A; 4LNP A; 1Y0M A; 2W10 A; 1OV3 A; 2LCS A; 2SEM A; 1U5S A; 1NYG A; 4J9G A; 2ED0 A; 1YCS B; 2SRC A; 1UGV A; 1IO6 A; 2FEI A; 2XMF A; 1PKS A; 2K79 A; 1T3S A; 2CT3 A; 1BB9 A; 2KRN A; 2F2W A; 1UHC A; 2EGA A; 4Z89 A; 4RTW A; 2K6D A; 3M0T A; 1AZG B; 1QKW A; 2VVK A; 2DRK A; 2PZ1 A; 1W6X A; 1WIE A; 4OML A; 2JS2 A; 3NPF A; 3M0S A; 2AK5 A; 2KXD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3U23 A; 5I2S A; 4BD3 A; 3JCM J; 2E1H A; 5GAN 3; 1VQM Q; 4YTL A; 2EYX A; 3SWN C; 3WVE B; 1WYX A; 5I11 A; 1W2B S; 3TVT A; 1VQP A; 3OYJ A; 2Y4X A; 3KUF A; 2CH4 W; 3DLM A; 3EFO B; 3HRT A; 1RAI B; 4XU3 A; 1VQ6 T; 2YUN A; 3EH1 A; 1F1B B; 4DBH A; 4Y91 A; 3JB9 D; 3M9Q A; 2L0A A; 2FYK A; 3L2R A; 3TSW A; 4RG2 A; 1VQ5 T; 3CPW S; 4M7D A; 1PHT A; 4PJO D; 1YN8 A; 2COW A; 1GRI A; 2KVQ G; 1WQ7 A; 1KQS A; 4M4Z A; 4J9E A; 3QZ9 B; 1V29 B; 4ZTF A; 3LGL A; 2OAU A; 2E70 A; 2VB6 A; 1WI7 A; 3CCU A; 2F1L A; 3SDZ A; 2V1Q A; 1B07 A; 4BI8 B; 4X9D A; 3RKW A; 2OTL A; 3TEE A; 2V8J A; 2AT1 B; 4F17 A; 1T0H A; 2R5M A; 1VQ4 Q; 3G71 Q; 1NPP A; 5CIU A; 4J6X A; 4JS5 A; 3OA6 A; 1Z9Z A; 3ULR B; 2DX1 A; 4RCC A; 1U06 A; 1GBR A; 2QXF A; 2QQS A; 2L3P A; 2M02 A; 3VRZ A; 1D0Y A; 1K73 U; 2J6O A; 4WF2 A; 2D9T A; 1H64 1; 3QG1 A; 1PKT A; 3M58 A; 1AT1 B; 2KSS A; 3OYE A; 1D3B B; 2L3S A; 1IRE B; 3A8L B; 3A1P A; 3OW2 P; 3UT1 A; 1AVZ C; 3CD6 Q; 4C92 C; 1K8A R; 3CC4 Q; 2O31 A; 4C5H A; 1YIJ A; 4L5G A; 3L2V A; 4R55 A; 1N27 A; 3V7C A; 1NJI R; 3OMC A; 3EG9 B; 4B9W A; 4OB2 B; 1IB8 A; 1E7O A; 3TRE A; 1QP3 A; 4CI0 C; 1SF9 A; 3WXM B; 5GAN e; 4J9B A; 2M16 A; 2L8D A; 3RES A; 1ZSZ B; 4N4G A; 2RHU A; 2QA4 Q; 2CZ6 B; 1UG1 A; 1PNJ A; 3JB9 G; 2BZY A; 1AZE A; 3EHR A; 2KYM A; 3EG2 A; 4JJB A; 1UGS B; 5IH2 A; 1I0C A; 2KYB A; 2HQX A; 4PJO G; 2VKN A; 1VQK Q; 1GCP A; 5GJV B; 3LWH A; 4MDW A; 3OS5 A; 5KYW A; 2QQB A; 2FL7 A; 3TU4 K; 2YRC A; 5FU7 C; 3C0C A; 2DTO A; 2E6N A; 3OYY A; 3TSZ A; 2NUP A; 3NFC A; 4ZGD B; 3CC7 Q; 2RMO A; 4E7Z A; 2RQW A; 6AT1 B; 2EJ9 A; 1WLP B; 2E10 A; 1X6G A; 4C92 F; 5IHK A; 4DOV A; 1PG5 B; 3NTI A; 1X2K A; 2LP5 A; 2LJ0 A; 2DEQ A; 2DD5 A; 1YI2 Q; 3QKJ A; 2BZ8 A; 2DVE A; 4HVW A; 1EIF A; 3LGF A; 4Y92 A; 1QMC A; 3CCS T; 1Q82 R; 3R6N A; 2FPF A; 2LX9 A; 4RUG A; 3LH5 A; 3PIO A; 2A3L A; 3QO3 A; 1D0Z A; 1HYO A; 1K73 C; 1KQ2 A; 1M3B A; 1HJD A; 4RG8 A; 1AWO A; 1CKA A; 1VQ9 A; 4PJM A; 4QVD A; 1E6H A; 2MAM A; 1GBQ A; 2X35 A; 1BIB A; 2LQK A; 2OJ2 A; 1SHG A; 2L2P A; 5FU6 B; 2ZAE A; 1QVG S; 2KY9 A; 2AZV A; 3CPW P; 3FJP A; 3ZBD A; 2XI9 A; 2RO0 A; 4IUQ A; 2DPP B; 2PUK B; 3MEA A; 1H8K A; 1I4K 1; 3OYK A; 2ECZ A; 1KSW A; 4E7S A; 3CC2 A; 4FSX A; 4ESR A; 1D1A A; 5GAN 5; 4JPB W; 2EGE A; 5LJ3 d; 4C0Z A; 3S3O A; 1VQ6 Q; 1ZBX A; 1YJN T; 1OUL A; 2O2O A; 2HD0 A; 4CC3 A; 3C94 A; 3H0I A; 1X6B A; 4RTX A; 4BI3 A; 2FO0 A; 4R56 A; 4BUG A; 2JUF A; 2O88 A; 5DY9 A; 5CQY A; 1VQ5 Q; 1CKB A; 4N0A A; 2KQW A; 4E7I A; 3JCM Q; 2FZG B; 4QVC A; 3THK A; 4C0D B; 4HVU A; 3BW1 A; 1RLQ C; 4C8Q C; 3UA7 A; 1M1G A; 5IN1 A; 2KRO A; 1MND A; 2DJZ A; 2EAY A; 2J06 A; 2YLC A; 2DLP A; 2JMC A; 2MWP A; 5GJW B; 5GAN 4; 1K1Z A; 1VQN T; 1IHW A; 2LJ1 A; 3RNJ A; 4N4I A; 2E5K A; 1SEM A; 2EYY A; 1O75 A; 4XTZ A; 4ELZ C; 1Q7Y U; 2RHY A; 1M1K C; 4HKE A; 4KT0 E; 4FYV B; 1TU0 B; 3VV0 A; 5GAN 8; 4DBF A; 3OBW A; 4LD9 K; 2VUB A; 2JTM A; 3HTR A; 3E19 A; 4FW2 A; 2LTO A; 2E64 A; 2HKN A; 1MHN A; 1LCK A; 3M4Y A; 4X9C A; 1ABQ A; 1QKX A; 1UJY A; 1I07 A; 3QJY A; 4DEY A; 2X3W D; 5GMK h; 2O9V A; 1EX4 A; 2J7I A; 3EGX B; 4J9F A; 5J26 A; 1QCN A; 4F7U B; 2CH4 A; 2JXB A; 1MGQ A; 4KUL A; 4JRQ A; 4LE9 A; 2GGR A; 1OPK A; 5GAM j; 3EGU A; 1QCO A; 5HY6 A; 2KDS A; 3NMZ C; 3C12 A; 3JCM h; 4PJO A; 3KXT A; 3CXC A; 5GAO n; 4ZN3 A; 2B8A A; 4OMF B; 2EYQ A; 1KQS P; 5GAO q; 1TS9 A; 3T9N A; 1M4Z A; 5I22 A; 2K2M A; 3INZ A; 2PVD B; 4M78 F; 3TQ7 P; 4XTV A; 3X24 B; 1QVP A; 4PLI A; 2QEX T; 3EH2 A; 1OZ3 A; 3GOX A; 2KI7 A; 2W0Z A; 1OOT A; 1D3B A; 4IIM A; 4J7F A; 4IUV A; 2OTJ T; 2CT4 A; 3MEU A; 2K5L A; 3BDU A; 5LJ5 f; 2GCX A; 3REA B; 1NE8 A; 3ER0 A; 1I5O B; 1N8R U; 1VQP T; 2DXB A; 3QBY A; 2LZ6 B; 4AG2 C; 1NJI U; 3L1A A; 4FYY B; 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5KE2 A; 1LJO A; 3P8D A; 4BB7 A; 4X1V A; 5LJ5 d; 2KBT A; 5CR2 A; 5GMK i; 3ZL7 C; 1R77 A; 2D0N A; 1WHK A; 1GCQ C; 2GBQ A; 2ABL A; 5GAO r; 2DD4 A; 2JTE A; 2F2X A; 2X3X D; 4AG1 C; 2JOY A; 2LQW A; 1EZZ B; 2PVG B; 3E9G A; 2M9U A; 3GNG A; 4XAX B; 3RKY A; 2QQA A; 2RI5 A; 3LWI A; 4AT1 B; 5GMK e; 2QQ9 A; 4J83 A; 1G2B A; 2JTF A; 4HT8 A; 3GNF B; 2DER A; 3CCQ A; 2ROT A; 3RER A; 3JCM W; 1N9R A; 3FRN A; 1SRL A; 4A4G A; 3MET A; 3HKS A; 3M55 A; 5HK0 A; 3QWX X; 4ZN1 A; 3JCM e; 1QQJ A; 2PNI A; 2DIL A; 5IHN A; 3OYA A; 1VQ9 T; 3QXE B; 2QEX Q; 2D8H A; 3PMI A; 2DL5 A; 2P0P A; 2X51 A; 4F7U A; 5I2M A; 5A0G A; 3PVQ A; 5LJ3 j; 3M0Q A; 3OB9 A; 1PM3 A; 2FZK B; 1M2O A; 1ZQ1 A; 3OMG A; 2YSQ A; 4KH0 B; 4NOY A; 1WNL A; 3EAE A; 2RI3 A; 2JMA A; 3SB2 A; 1JEG A; 4CC2 A; 3CC2 T; 4P5N A; 2ZPH B; 4EMK C; 1Q7Y R; 2CYZ B; 3NTK A; 1PRL C; 1VQM A; 1M2V B; 3CCE A; 3V8L A; 2JNG A; 3SWN B; 3OS1 A; 3FEO A; 1Q81 C; 3CME A; 3QII A; 4JUV A; 3ASK A; 5GAO m; 4Z8A A; 1TWB A; 4XTX A; 4LDV A; 2HL3 A; 1UGP B; 3MO8 A; 3H0H A; 1W70 A; 3CCR A; 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