1V4TA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
447
structure length
424
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords glucokinase isoform 2
publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 130
structure length 424
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4tA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4tA01
3D2FA 2FSKA 4CBXA 4CD1A 3QB0A 4H0TB 5BRDA 4E1JA 3WEEA 2QM1A 3H46O 4GNIA 4M63C 3CIPA 5AQQA 4BRPA 5AQFA 2D0PA 4MO5A 1J6ZA 3IMXA 3SLCA 3LDPA 4FOIA 4WQ4C 3GOIA 3GG4A 4B1XB 1GLJO 1XQSC 4BR2A 4FOEA 1BA1A 5EXWA 2UYTA 4B1ZA 2D0OA 3A5OC 3O6WA 1SZ2A 1WOQA 3M3ZA 1T44A 2GEMA 5CE3A 1SQKA 4B1VA 1BU6O 3O5BA 3L4IA 4IZ9A 4I6MA 3A5MC 3O80A 4EIAA 2WUSA 4FO0A 3FR0A 3H1QA 3UB5A 3HM8A 1DKGD 2P9KA 1ATNA 4QS7A 1SAZA 2YHXA 2BUPA 3QMLA 1QHAA 4CZEA 5B8HA 4EHTA 2V51B 5AQOA 5BR9A 3QBWA 2HF3A 3ZEUB 1ZC6A 4A2AA 3LL3A 4DQ8A 3A8YA 3FZLA 4IJNA 3O8MA 4HTLA 4CZJA 3H3OB 2FF6A 4LC9B 4FWSA 5KQDA 1JCEA 3H3NO 4K42A 3B8AX 5AQUA 1HLUA 1HUXA 3WUHA 5EVZA 3KVGA 1R59O 3QBXA 4CZLA 3D2EA 3WXLA 3CHWA 2FSNA 3C7NA 4BR9A 3J8AA 3MK6A 4BRCA 3C0BA 4IO8A 2P9IB 4CJ7A 2VYPA 1U6ZA 3GE1A 3SK3A 2A6AA 5BN9A 1NGAA 5AQVA 5BPLA 2ITMA 1QQOA 1ZXOA 4A61A 2YJEA 1NGCA 3EL2A 4BQZA 2D1KA 5AFUH 3F9MA 4XH1A 3VF2A 2P9UA 3HZ6A 2P9SB 3VF6A 1LOTB 1MWKA 1CZAN 5E84A 5KPZA 1NGJA 1HKBA 1GLBG 1NGGA 3L6QA 5AQHA 2Q2RA 3MCPA 1HJOA 4ISFA 1T6DA 5LJVA 2NRHA 4BVPA 2GWKA 2J4RA 3TU5A 1D4XA 4BC5A 5AFUA 1NGBA 4H03B 5AQLA 4MLHA 4B1WB 5ADXH 1Z05A 2Q0UA 5FPNA 3O1BA 5AQGA 1MWMA 1IG8A 1V4TA 2CGLA 2Q31A 3LM9A 3BUZB 5FPMA 4BRLA 1HKGA 1YXQA 3VESA 3JS6A 1GLCG 2HF4A 2E88A 3EZWA 3S41A 4FSVA 4BR0A 3HSCA 2CH6A 1ESVA 4CZKA 2VCPA 3UKRA 3DAWA 3VF4A 2CH5A 4YDUC 4FWPA 2KHOA 1E4GT 4CZIA 5ADXA 3MN5A 3G25A 2E1YA 4RWTA 1KAXA 4BGAA 4EAHD 1C0GA 1TUYA 5AQTA 3VEZA 4BRGA 3ATUA 1GLFO 1BO5O 4WYBA 5AQYA 2W41A 4JD2A 2E2QA 2YCHA 1NWKA 3BP8A 3A5LC 4RTFD 4BRNA 4CBUA 1XUPO 2QW9A 3GL1A 1KAZA 4PL8A 3FGUA 3FLCO 2I7NA 4HWIA 4WQ4A 5AZIA 5BRFA 4H5RA 2F9WA 1U2VB 2VWBA 2YHWA 2ZF5O 2AP1A 3UKUB 3LDLA 1MA9B 3LDNA 3FFKB 4DCHA 2QWRA 1K8KB 3CQXA 2E2NA 2P9NB 3M6GA 1NGHA 1Y64A 2CGJA 3VEXA 1BG3A 2ASOA 3DXMB 3WXJA 5KPRA 4IJAA 3LDQA 1QZ6A 5F2RA 3BEXA 5EY4A 3SMPA 1S3XA 4B1UB 1BA0A 2P9IA 3LDOA 2ZGZA 2E20A 3WEEB 1NMDA 3ZETA 3R8EA 4H0PA 3ULEA 3P4IA 3FZMA 3AY9A 3IUCA 2E1ZA 2CGKA 1ZBSA 2P9LA 3U4LA 1NGEA 1NBWA 1YVNA 2P9SA 4FL9A 2GELA 1G99A 5F1XA 4QS9A 5FPEA 2H3GX 4JAXA 4H0YB 5LJWA 2V7YA 3VPZA 2OANA 2QWPA 4BROA 5AR0A 4PKGA 4I6MB 3VEVA 3HBTA 3O4WA 5KPTA 5AQNA 4BG8A 1X9JA 3AARA 5JLHA 3CJ9A 4C23A 4H0OA 1P8ZA 4BR7A 4BRDA 4PKIA 4A62A 2GUPA 2IVPA 3CJ7A 1QQMA 4JHDB 5JMVA 4BGBA 3OHRA 4FPBA 3MN6A 1YUWA 2E8AA 2P9PB 4FWQA 5BREA 2YHYA 4F9OA 4H5WA 3VGKA 2BTFA 1NGFA 2E2PA 2YI1A 3CETA 3MDQA 1TYQB 1KAYA 4L3QA 4B1YB 3H45C 5AQMA 4JN4A 3DWLA 1X3NA 3U9DA 5AZJB 3CJAA 3VENA 5AQPA 4BRMA 3EKSA 5BRHA 5AQKA 3WQUA 2A3ZA 3D2EB 5EX5A 1RGIA 3R9PA 4FWNA 1S22A 1QZ5A 2ASPA 4FWOA 4BC4A 1HPMA 5JLFA 1RDWX 4EFHA 4PL7A 3U9ZA 3FE1A 4BR4A 4NB4A 3CI5A 5FPDA 4WQ5C 1C0FA 2QWNA 4K41A 4BR5A 1DGKN 3ZX0A 4BRFA 2DPNA 2FXUA 1U2VA 3AAPA 3UKUA 1QQNA 4BREA 2NZTA 3EO3A 3VETA 3JXUA 3RSEB 1GLEG 2W40A 4DB3A 1K8KA 4A2BA 3O1WA 3R6MA 5AQJA 3EN9A 3FZFA 4PKHA 4YDUA 5AQWA 4BQLA 5BN8A 3WXIA 2A40A 4XH4A 2Q97A 3BF1A 3CQYA 2ZWHA 4AM6A 3FZKA 3IFRA 4O8KA 3A0IX 3ZEUA 4K43A 3ZX3A 5F0XA 2HOEA 1OKJA 4DHYA 1E4FT 3DJCA 3H1VX 3WT0A 4MO4A 4XEIA 4BG9A 5LY3A 3QFUA 1ATSA 3QICA 3FZHA 2Q36A 4H5TA 3DXKB 1XC3A 4FWKA 1JCGA 2HMPA 3ID8A 3MN9A 2PAVA 4CI6A 1JCFA 2FF3B 1GLLO 4GY2B 1NGIA 3UKRB 2A41A 3H6EA 2V7ZA 5ELZA 4FWLA 3D2FB 1IJJA 3CJ1A 4FWMA 3ATVA 3VEWA 3I8BA 3A5NC 2I7PA 3BF3A 1DEJA 4FPAA 1HX1A 2IIRA 2QWQA 4H0XB 4JD2B 4Z94A 2A5XA 1T6CA 4BC3A 3CJCA 5JICA 3VEYA 2NLXA 3GBTA 5BPMA 4NO7A 1NLVA 5E26A 2AA4A 3VOVA 4CBWA 4JHDA 1V4SA 5AZIB 5AQIA 3KHYA 2F9TA 3MMVA 4M7XA 5AQXA 5AQRA 1NM1A 2GWJA 2P9PA 4ISGA 3ZX2A 1WUAA 3TPQA 1TYQA 3SJHA 4RCHA 3EKUA 4B9QA 2YJFA 2QWOA 4M7YA 5I9EB 5BPNA 4CD3A 5AZJA 3VGLA 2P9KB 1RFQA 3IDHA 3LM2A 4BRIA 1GLDG 1KXPA 4IXCA 4BRHA 3ENOA 1YAGA 4KBOA 4H5VA 5EOYA 3M1FA 1TUUA 2V52B 3ZETB 4BVOA 2PBDA 4H5NA 1BUPA 3SMSA 3ULEB 3AAQA 1Q18A 1Z6RA 2QXLA 3O08A 1X3MA 2Q0RA 4IWVA 1MDUB 3VEOA 2P9LB 4ISEA 1GLAG 4BRAA 3CERA 3W3DA 1ATRA 3RSEA 3CJBA 3KZBA 1HKCA 3L0QA 4EHUA 2ZGYA 3C7NB 2FSJA 3ENHA 4AM7A 2QWLA 1BWFO 2Q1NA 1H1VA 4CZGA 3WQTA 4K25A 1LCUA 3D7EO 4BRQA 2D4WA 3VERA 3W0LA 4XH5A 4BC2A 3HTVA 2A42A 2ASMA 3I33A 4H0VB 4JNEA 5TKYA 4BRKA 1NGDA 3QFPA 5AQSA 1BDGA 3VGMA 5AQZA 3HI0A 4CZMA 1EQYA 4O5FA 2IVOA 3WXKA 2IVNA 2P9UB 4WQ5A 3GDQA 3UE5A 5KQ8A 1BOTO 3DXKA 2EWSA 4CZFA 2P9NA 4QS8A 2E2OA 2QWMA 2GTDA 3DXMA 4J8FA 4FWRA 4Y0WA 4MLEA 3U8XA 2FLOA 3QDKA 3MN7A 4CZHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I3UA 3D2FA 2FSKA 3LPTA 4J2EA 4CIEA 3QB0A 4WE1A 4IEEA 4KHUA 4CGJA 3LALA 3B6OA 4CJWA 2WFBA 4BRPA 2HHHK 3BGRA 2WONA 3CM6A 2D0PA 4MO5A 2G8HA 4B8AB 2Q3SA 4FOIA 4X65K 3ZSVA 4BR2A 3M5RA 4I2PA 2D0OA 2O8EA 1S1TA 1BQNA 2O8BA 5J2QA 4CJLA 3AVAA 4YOXA 4L8RB 3MECA 4FO0A 3FR0A 1CLQA 3HM8A 2P9KA 1SKWA 4CF1A 3G10A 4RW4A 1QHAA 4EHTA 5AQOA 5BR9A 3K59A 2HHWA 2HNDA 2HF3A 5HOOA 4IFVA 4KAZA 2JGUA 3F5TA 1VSKA 1YTAA 1VSHA 3SAFA 4FWSA 2B4JA 1NMNA 4KH6A 5AQUA 1HLUA 1J9AA 1HUXA 3T1YK 2XY8A 3DLKA 1FK9A 5C10A 3QBXA 1WB9A 4E1MA 4B08A 3D2EA 3CHWA 2Z1IA 3K57A 3J8AA 3MK6A 4BRCA 3CPEA 2E4LA 4JKFA 4BWJA 5GIOA 4CJ7A 4ELVA 5CY4A 1QQOA 1TK8A 1QVFM 2LSNA 2D1KA 5AFUH 4E7LA 4F3TA 4CE9A 1RT3A 1E3MA 1QHTA 3HZ6A 3MXIA 1BI4A 1LOTB 4X62K 2I5JA 4B9TA 4R5PA 1W97L 2Q2RA 1KVAA 5SWMA 3MCPA 4AQYK 5LJVA 1Q8IA 4BVPA 2GWKA 5AFUA 5AQLA 4MLHA 3ZSZA 1EP4A 1QSLA 2ITGA 2Q31A 4FLVA 1WBDA 3LM9A 3BUZB 1HKGA 3PUFA 3VESA 3SUOA 3E66A 3RRHA 3OY9A 3S41A 1WSHA 3LP3A 3HSCA 3NBPA 1ZBHA 1VSJA 2Z1GA 3K5NA 1NKEA 3BDPA 5GINA 3SAGA 2YNHA 4MQ3A 1KAXA 3PIPL 4DTSA 3ATUA 1BO5O 2FBTA 1IH7A 4JD2A 4ILHA 3T7ZA 3TAGA 2BGGA 2E2QA 2YCHA 3BP8A 4BRNA 1ASUA 2X74A 3GL1A 3U3YA 1TAUA 4CJTA 3FLCO 1JLFA 4CJPA 2R7YA 2YX6A 4U67L 3C6HA 2F9WA 3MCAB 1U2VB 2P1JA 2YHWA 2ZF5O 2UXCK 2O4IA 1FJGK 2DTUA 3LZJA 4DS5A 5M1NA 2QWRA 3DOLA 4CGGA 4ZTJA 4B8CA 3THVA 4CHQA 3M6GA 5I42A 3VEXA 1VQNN 3PY8A 1BG3A 2O8FA 3VQQA 3WXJA 4BE0A 1QZ6A 5EY4A 1S3XA 4B1UB 3O3GA 2E20A 3NH0A 3R8EA 1JL1A 5CR4A 4W5QA 3L2WA 1VSEA 2OPRA 3IS9A 3A2FA 5CYMA 5KRSA 1ZBSA 2P9LA 4DTUA 3NF9A 4FJ9A 1NBWA 4C8MA 1KC8O 2PYLA 4GKJK 2P9SA 5J2PA 1LWCA 4FL9A 2GELA 4B9UA 1VSDA 2O8BB 3VQ9A 5LJWA 3KLFA 2OANA 4E7IA 5AR0A 4N76A 4PKGA 3G6EN 1DTQA 5HP1A 4FK2A 3VQ8A 5AQNA 4BG8A 1M1KO 5JLHA 4HUEA 3VQDA 2OCEA 4H0OA 1P8ZA 4BR7A 3OYHA 4CEDA 3C95A 4CEQA 4FYDA 4FLZA 3CD6N 3ZLJA 3MEDA 3V1OA 3AV9A 4KTZA 1NOZA 4E7JA 4DSIA 3CM5A 4Q5VA 2E2PA 3RMBA 2YI1A 3IRXA 2WTUA 2YNFA 3MDQA 3HT3A 4LFBK 1I39A 4FM0A 3U9DA 4C8KA 3EKSA 1VQ4N 5AQKA 3WQUA 2A3ZA 3D2EB 5FROA 4CK2A 4FWNA 4BDZA 4JS4A 2X78A 1KD1O 1HYVA 2ASPA 5JLFA 1VAZA 3U9ZA 4BR4A 2YKMA 2XHBA 3VQEA 5FPDA 4NXMK 2DFFA 4B3SK 3UKUA 2NZTA 3SI6A 2RE2A 5C15A 3RSEB 1GLEG 1L3VA 2W40A 4CF0A 4DB3A 4A2BA 5AQJA 1Q82O 4KI4A 2OZMA 4XH4A 3L4QA 1X9SA 3FZKA 3QNNA 1CZBA 1C0TA 4DMNA 5T7BA 4EZ6A 3OYLA 2OTLN 3KWGA 4BG9A 1WAJA 3QFUA 5J1EA 3QICA 1XMOK 3CCEN 3LP1A 2Q36A 4B9SA 4CJQA 3OYNA 1L3SA 3CYMA 1JCGA 4JLHA 1IBKK 5CHIA 5LMNK 1N36K 4JK9A 1J54A 4IFYA 4GY2B 1NGIA 4LF5K 4FJJA 3H6EA 4IDHA 1RBTA 2V7ZA 5ELZA 4FWLA 3QINA 3PO5A 3RMAA 1IJJA 3T3FA 3ATVA 1HPZA 3SPZA 4QCLA 1U49A 1GOBA 1YI2N 4FPAA 4TSXA 1W0HA 2QWQA 4JD2B 1T6CA 4DR4K 3J7YP 3SNNA 1QTMA 3GBTA 4NO7A 1VSIA 1NKCA 1BCOA 4JHDA 1WSIA 5C12A 5AQRA 3EE8A 3T69A 4RW9A 3OA9A 2VG6A 1WUAA 4QOZB 4YOYA 1TYQA 5JVHL 2HNYA 3CMEN 2HBLA 1RFQA 3IDHA 4FJLA 2NRRA 1U47A 3CC7N 3ENOA 3QEWA 4KBOA 4H5VA 2AJQA 5EOYA 2GV9A 5AJ3K 3SPYA 1KVCA 4LF7K 2YKNA 3CXCM 3NHGA 4JRPA 1BUPA 3CPWM 3F9KA 5GAEP 3AAQA 1S6QA 1Q18A 3L8BA 1Z6RA 3O08A 1X3MA 2Q0RA 4FW2A 1VQ6N 2P9LB 3E1YA 1I94K 4BRAA 1VHXA 4ID5A 1HKCA 1N6QA 4UY8O 3CFRA 2QWLA 1BWFO 3WQTA 3BY5A 1LCUA 2D4WA 1NK9A 3KLHA 3EY1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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