The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
EAERKAVQAMWARLYANCEDVGVAILVRFFVNFPSAKQYFSQFKHMEDPLEMERSPQLRKHACRVMGALNTVVENLHDPDKVSSVLALVGKAHALKHKVEPVYFKILSGVILEVVAEEFASDFPPETQRAWAKLRGLIYSHVTAAYKEVGW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Cytoglobin
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| publication title |
Structural basis of human cytoglobin for ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
50
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CMY A; 4ILZ A; 1O1M A; 1TES A; 1HDB A; 1LUE A; 1YMB A; 4N7O B; 2D5Z B; 4PQB A; 3QMA A; 4MQK B; 1CO8 A; 2BKM A; 1SHR A; 1S61 A; 5EE4 D; 2HBE B; 3K8B A; 4F6D A; 3O7N A; 1XY0 A; 4F6G A; 2HBF B; 1MBO A; 2BLJ M; 5ILP A; 1Y0D A; 2B7H A; 1VHB A; 3D7O A; 2ZS1 A; 2QSP B; 1IWH A; 3GKV B; 1DWS A; 1J41 B; 1Y0C A; 1A6G A; 2Z6S A; 1JEB B; 3UHB A; 1MLU A; 3EU1 A; 1K1K B; 1MBD A; 1MLJ A; 5B85 A; 5E29 A; 5EUI B; 3HXN A; 1DXU A; 3U3E A; 1YEU B; 4OF9 A; 1CG5 A; 4HRT B; 3LB3 A; 5KER A; 1OJ6 A; 1AJ9 A; 1CBM A; 2AUO A; 1XCH A; 3PI8 A; 2OLP A; 2AUR A; 3ZJM A; 1NIH B; 1Y4Q B; 1FCS A; 1MDN A; 3DUT A; 1SI4 B; 3WFT A; 2HBC B; 1HBA B; 2WY4 A; 3PT7 A; 1J52 A; 3HYU A; 3G4U A; 2ZSY A; 4PNJ A; 5JDO E; 1EWA A; 2R4X A; 1J3Z A; 3WCV A; 5ILM A; 3QM6 A; 3V2Z A; 2GTL D; 1M9P B; 1IRD A; 3BOM B; 3NFE A; 1MOC A; 1RPS B; 1C7D B; 1MYZ A; 5EV5 A; 1ABY B; 3WCU D; 4XS0 B; 1LFV A; 2D2M D; 3WHM B; 1X9F C; 2DXM B; 1YVT B; 5CN9 A; 1FN3 A; 1OR4 A; 2EKU A; 1I3D A; 3GOU A; 2Z85 A; 2H8F A; 2R1H B; 3DR9 A; 1MTI A; 2HHE A; 1YG5 A; 3ASE A; 1F65 A; 2AV0 A; 1DUO A; 5HBI A; 1QXE B; 3LQD A; 4NS2 A; 3D1K B; 2ZLV A; 3K3U A; 1BZ6 A; 3DHT B; 1A3N A; 1S0H A; 3BJ1 A; 3UI0 A; 3S1J A; 2BNL A; 3QJC A; 1YHR A; 4MQJ B; 3MJP B; 3AQ7 A; 3FS4 B; 3NML A; 3PI4 A; 2ZLT A; 1HSY A; 3R5I A; 1R1Y B; 1HGB A; 1CPW A; 4HHB B; 3WR1 A; 1HHO B; 1Y5K A; 1FAW B; 3FH9 B; 2EB9 A; 3WFU A; 3GLN A; 1RQ3 A; 1XXT B; 1VXG A; 2SPO A; 3HRW A; 3PT8 B; 2PEG B; 5D1V A; 1LHT A; 1CP5 A; 2MGL A; 109M A; 3UHN A; 1Y45 A; 1Q1F A; 1YEO B; 3ARL A; 1Y7Z A; 4B3W A; 1FLP A; 1MOD A; 2ZST A; 2GTL B; 1XZV A; 2QU0 B; 2R80 B; 1Y0T A; 3K9Z A; 1UMO A; 4N7P A; 1MLN A; 3HC9 A; 3ZJR A; 1NEJ B; 1NS6 B; 1GDJ A; 1YHE A; 3WCU B; 1Y85 B; 4ODC B; 2D2M B; 3NMM B; 1DXC A; 5KKK A; 3W4U B; 4HSX A; 3HEN A; 3OJ1 A; 1S5X A; 1HBG A; 1HBB B; 1X3K A; 1MBA A; 1QXD A; 1S56 A; 1BAB A; 1CH3 A; 1Y4V B; 1GDI A; 4M4B B; 2W6V A; 1MLG A; 3G4Q A; 4NI1 A; 1UIW A; 5KDQ A; 3SDN A; 1JP8 A; 4MBA A; 4MBN A; 2SPL A; 2ZSO A; 1X46 A; 2NRM A; 1FSL A; 1OUU A; 3HEP A; 4HRR A; 1HLB A; 3QQR A; 1NPF A; 1LH3 A; 1QSI B; 1A0Z B; 3VRE B; 2GLN A; 5HY8 A; 5EYS A; 1GZX A; 3OO5 B; 2HZ1 A; 4UUR A; 2MGC A; 1BIJ B; 2D5X A; 2W6X A; 1NS9 B; 1RQ4 A; 1ECD A; 4FC3 A; 1IOP A; 1CG8 A; 1X9F D; 5C6E B; 4KN3 A; 5CN8 A; 2LH3 A; 2G10 A; 1BUW B; 1HJT A; 1N9F A; 1Y0W B; 3QM9 A; 1A01 B; 3GQG B; 1YVQ B; 1Y4B A; 1G0A B; 1LHS A; 1J7S A; 1MBS A; 2ZT2 A; 111M A; 1OUT A; 2W72 A; 1O1I A; 1Y35 B; 3OO4 B; 2ZS1 C; 2ZSS A; 4U8U A; 3MKB B; 1V4U B; 1DXV B; 1BZR A; 1HV4 A; 1RVW A; 1HGA A; 5AZR A; 3WTG A; 3AT5 B; 2D60 B; 2VYY A; 1A00 B; 2YRS B; 3CY5 B; 1Y8K A; 1DXT A; 4M4A B; 2G11 A; 1Y7G B; 3QJB B; 1LJW B; 3G52 A; 3GYS A; 1K0Y A; 4G51 A; 2QLS A; 1XQ5 B; 2G14 A; 4O4T A; 1XZ2 B; 1Y7D B; 4MXK A; 1UC3 A; 5B84 A; 3GQP B; 5CN5 A; 5CHR A; 2O58 X; 3A59 B; 3GDJ B; 1DKE A; 3MYN A; 1MYT A; 1MOA A; 3PI1 A; 1MBN A; 1GCV B; 2C0K A; 2M6Z B; 3AQ6 A; 1MNO A; 110M A; 1V4W B; 5SW7 B; 5CN6 A; 4MQI B; 4MQG A; 2R4Y A; 1J7Y B; 3PEL B; 112M A; 1YFF B; 3D1A A; 3UGZ A; 1C7C B; 5JGG A; 5E83 A; 2EKT A; 1Y8I B; 3WCV C; 3D17 A; 5CMV A; 3UHI A; 1NPG A; 1LFZ A; 2O5B X; 1GBV A; 1VWT A; 3E5I A; 1MYJ A; 2ZLX B; 3VRG A; 4N7N A; 1YGD A; 1GJN A; 1O1O A; 1IT3 A; 2FAL A; 1X9F B; 3GKT A; 2DN3 B; 1O16 A; 1THB B; 1C7B B; 1OFJ A; 3S65 A; 3RJ6 A; 1J7W B; 1O1P A; 1LTW A; 1V4X B; 1HDA B; 4H07 A; 1YCA A; 5HLU A; 5CHQ A; 4F6B A; 1Y8H A; 1DLW A; 1Y0A B; 1LA6 B; 3G4R A; 1JW8 A; 5AZQ A; 2OH9 A; 1YIH A; 4PQ6 A; 2BK9 A; 2VYZ A; 4YU3 A; 2HZ2 A; 1BZ0 A; 1NGK A; 1SPG B; 4IRO A; 4MQC B; 2R50 A; 5JDO F; 1LH6 A; 2RAO B; 5HU6 A; 1YIE A; 1SPE A; 1XZ7 B; 3ARK A; 3ARJ A; 4DC7 A; 4VHB A; 2VM0 A; 3WCT D; 1YGF A; 1MLO A; 3HHB A; 2VRY A; 2H35 B; 4HSW A; 1YEV A; 2MB5 A; 4NXA A; 1RQA B; 1FDH A; 2HBS A; 5EQM A; 4JYQ A; 3WCW A; 5CNB A; 1UT0 A; 1WMU A; 3UH5 A; 3ZJO A; 2GNW A; 2E2Y A; 107M A; 3OVU C; 1QSH B; 3E4N A; 1XZU A; 1Y4F B; 2DN1 A; 3UHQ A; 2ZS1 D; 2D6C A; 4C0N A; 4DWT A; 1N9H A; 1MYM A; 4N7O A; 2D5Z A; 1Y4R A; 3MBA A; 2GL3 A; 2MGK A; 2V1K A; 1CH4 A; 4GZG A; 2MYD A; 4PQC A; 3HF4 A; 2XKH A; 1SDK B; 1Y8W B; 4H0B A; 2MGJ A; 5M3S A; 4X0L B; 1MLK A; 1YEN B; 1YE2 B; 4N8T A; 1MWC A; 1O1J A; 5CNG A; 4O35 A; 3QZX A; 1VXB A; 1J3Y A; 2MGG A; 1Y5F B; 3UHD A; 4JAC A; 1SWM A; 1DTI A; 3MVC A; 1JEB A; 1V9Q A; 1O1K A; 1O1N A; 2ZFB B; 1VXD A; 3UHT A; 3ECX A; 1FHJ A; 1NQP B; 1MLS A; 1YEU A; 3WCV D; 3CIU B; 3WCT B; 1NZ5 A; 1CMY B; 1LFT A; 1GLI A; 2HBG A; 1UFJ A; 101M A; 3H57 A; 4H2L A; 1HDB B; 2HHD A; 3A2G A; 2ZT4 A; 1SHR B; 2O5S X; 2V1F A; 2LH1 A; 1BBB B; 2HBC A; 2Z6T A; 3K8B B; 2ZSR A; 1XY0 B; 1CP0 A; 2Z6N A; 3KMF A; 3BA2 A; 1URV A; 1RSE A; 1MNK A; 3E55 A; 2B7H B; 1HAB A; 1BVD A; 2W72 C; 1ABW A; 2ZS1 B; 1IWH B; 3PIA B; 1LFQ B; 1ABS A; 1G09 A; 1C7D A; 4U8U C; 5E6E B; 4F4O A; 1MLQ A; 3GQR A; 1ASH A; 1BZP A; 1JWN A; 3NG6 A; 4G1V A; 1URY A; 4XS0 A; 2ZT3 A; 3AQ8 A; 5EET A; 1Y31 A; 4XDI A; 2GNV A; 2FRK X; 1HLM A; 5E29 B; 3ONZ A; 1HBH B; 4KMV A; 3ZH0 A; 3ED9 A; 1JF3 A; 2BWH A; 5KER B; 1AJ9 B; 1Y4G B; 1HCO A; 2RI4 B; 5CND A; 3PI8 B; 1VXE A; 1G0B A; 1M6M A; 1R1X A; 3QM7 A; 1BZZ A; 1DO4 A; 3P5Q A; 3BJ3 A; 1HGC A; 1LH2 A; 5IKS A; 3HYU B; 1YH9 A; 1NZ3 A; 1JY7 A; 2O5L X; 1J3Z B; 3WCV B; 6HBW A; 1HBI A; 2O5Q X; 1U7R A; 1IRD B; 1DO7 A; 4TWV A; 3NFE B; 1LH1 A; 3FS4 A; 2NSR A; 5F0B A; 4HHB A; 1LFV B; 1FAW A; 1JZM A; 3A5G A; 3FH9 A; 3PI3 A; 1HBS B; 4TWU A; 3IC0 B; 3MJU A; 3M39 A; 3AQ5 A; 1MNH A; 3EDA A; 3UH6 A; 1FN3 B; 3EDB A; 2SPN A; 4AVE A; 3GOU B; 1B0B A; 2H8F B; 4FWZ A; 1COH A; 2GTL A; 2HHB B; 1CH9 A; 1YG5 B; 2QU0 A; 2G0X A; 3S66 A; 3WCP A; 4MXL A; 1NEJ A; 3RGK A; 3TM3 A; 3WCU A; 3ZJI A; 1Y85 A; 1JL7 A; 106M A; 3NMM A; 1GBU A; 1A0U A; 1DWT A; 3SZK B; 1A3N B; 3UHH A; 3BJ1 B; 2DHB A; 1YHU A; 1ECO A; 1HBB A; 2AUQ A; 3QJC B; 2FRF A; 1YHR B; 3OZU A; 3QJD A; 2AV3 A; 1YCB A; 4O2G A; 4M4B A; 3EOK A; 3A0G B; 1NWN A; 1Y2Z B; 1JP6 A; 3ZJQ A; 3VAU A; 4AVD A; 1Y5K B; 1G08 A; 1A3O B; 1MWD A; 1GDK A; 1RQ3 B; 1GCW A; 2G0Z A; 3QM8 A; 3HRW B; 1YEQ B; 1Y22 A; 2ZS0 A; 1Y45 B; 1KFR A; 2ZFO A; 5JDO C; 1KD2 B; 1MBC A; 1DUK A; 1Y0T B; 2QMB A; 1QSI A; 3G46 A; 3ECZ A; 3VRE A; 1CBL A; 1MLF A; 1EBT A; 3OO5 A; 5F2A A; 1FDH G; 2LH7 A; 1BJE A; 1I3E A; 2MYB A; 1NWI A; 1LH5 A; 4U8U D; 1S5X B; 3M38 A; 1CH2 A; 1Y4P A; 4ROM B; 4WJG 1; 3A5A A; 2W6V B; 2OHB A; 1S5Y A; 2H8D B; 2XKI A; 1ECA A; 3ODQ A; 1V75 A; 1LFY A; 1HDS A; 3E5O A; 3BJ2 A; 1A01 A; 1IBE A; 3D4X A; 1XZ5 A; 1Y83 B; 1MYH A; 1OUU B; 1V4U A; 1PBX A; 3PI9 A; 3AQ9 A; 4HRR B; 1T1N A; 2MGD A; 2G3H A; 1XZ4 B; 3UHZ A; 2VYW A; 3UHE A; 3ZHW A; 1GDL A; 3S48 C; 2YRS A; 1LFL B; 1MNJ A; 4C44 A; 5HY8 B; 2G0R A; 3QJB A; 1LJW A; 5HLQ A; 2WTG A; 1MYG A; 4LPI A; 1RQ4 B; 2W6W A; 4FC3 B; 2PGH B; 1CG8 B; 3UHU A; 3GDJ A; 1V5H A; 1CLS A; 1F5P A; 1VRF A; 1GCV A; 5MBA A; 4KMW A; 3G4Y A; 1V4W A; 1TU9 A; 4MQI A; 3UGY A; 1Y5J A; 1DO1 A; 3BCQ A; 1J7Y A; 1Y4B B; 2ZSP A; 1J7S B; 3WFW A; 4F69 A; 5AB8 A; 1OUT B; 3KMF C; 2W72 B; 1O1I B; 3OGB A; 1BZ1 A; 3UBC A; 1QPW A; 2VHB A; 3O89 A; 2MYA A; 2GKM A; 1XYE A; 2BMM A; 4U8U B; 3B75 B; 3G4W A; 3UHX A; 4NZI A; 1HV4 B; 2V1H A; 1RVW B; 1HGA B; 5CNC A; 3A9M A; 3WTG B; 1NAZ A; 2DN3 A; 2D2N A; 4ROL A; 1Y8K B; 1YDZ A; 1MLR A; 2HCO A; 3UHS A; 1HDA A; 2GRH A; 3GYS B; 4G51 B; 4MQH A; 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1VRE A; 1F63 A; 1MLM A; 1EW6 A; 2AUP A; 1BVC A; 1K1K A; 2QRW A; 4YU4 B; 1Y4R B; 1MYF A; 1MLH A; 1N9I A; 1YZI B; 2EVK A; 5EUI A; 4DWU A; 1YOG A; 3HF4 B; 1BBB A; 2KSC A; 3M3A A; 4HRT A; 2VEE A; 4N8T B; 1EBC A; 1O1M B; 1O1J B; 1CIO A; 1NIH A; 1Y4Q A; 2XKG A; 1A6N A; 1J3Y B; 3M3B A; 1WLA A; 3PIA A; 1SI4 A; 4FWY A; 1LFQ A; 1HBA A; 5E6E A; 2WTH A; 1O1K B; 1O1N B; 1Y0D B; 3D7O B; 1FHJ B; 1JPB A; 1M9P A; 3A5B A; 3BOM A; 1HBH A; 3IXF A; 1RPS A; 1Y0C B; 3UHW A; 1LFT B; 1GLI B; 1Y4G A; 3EU1 B; 1ABY A; 2RI4 A; 4H2L B; 2LH2 A; 1AJH A; 2HHD B; 3WHM A; 2DXM A; 2EB8 A; 3GK9 A; 1YVT A; 1MTJ A; 1DXU B; 3HXN B; 1MOH A; 1A9W E; 1CG5 B; 2W6Y A; 1S6A A; 1J3F A; 3LHB A; 4F6F A; 4SDH A; 2R1H A; 1JL6 A; 2Z6N B; 1HAB B; 1YMA A; 4KJT A; 1ABW B; 1CIK A; 1IDR A; 3DUT B; 1QXE A; 3UHK A; 1G09 B; 2V1G A; 2G0S A; 3PT7 B; 3D1K A; 2MGF A; 4F4O B; 3GQR B; 3NG6 B; 5D5R A; 1BIN A; 1GVH A; 3DHT A; 1MCY A; 1Y31 B; 1HBS A; 2GRZ A; 3UHV A; 4B4Y A; 2D2N C; 3IC0 A; 2OHA A; 1YHU D; 3AG0 A; 1AJG A; 3ONZ B; 2VLY A; 4MQJ A; 3LB4 A; 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