1V6UA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-alpha-l-arabinofuranosyl-xylobiose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 168
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6uA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6uA02
4GPNA 4UZSA 3VIGA 4W5ZA 5A8PA 1U2YA 2QMJA 3S8KA 1HCEA 1II4A 1VBUA 1VBRA 2X2TA 2JE8A 4PC4A 3POCA 3Q7WA 1E70M 1UD5A 1BYBA 4PMOA 4Z2KA 5I1BA 3I3DA 3VDHA 4X37A 4DM1A 3N9KA 3A07A 5I0DA 4JQ0A 3FW6A 3OB8A 4MB4A 2NW0A 5HPZA 1ZJBA 3A4XA 3ARVA 1UWIA 2WKGA 4S3JA 3M46A 4UQBA 5B2HA 2CKSA 2P39A 1SR0A 3AIBA 3UD9A 1WD4A 3ZJ6A 2VQTA 1DEDA 1NQ6A 1ITCA 5F8SA 2MIBA 3WQ4A 3I3BA 3FJ9A 5BP5A 2BY1A 2XFYA 1Q03A 5CPQA 3NUKA 1GW1A 1AVAC 3AQUA 2GJXB 2ERMA 2IXVA 3PZVA 2D0FA 1BFFA 3RM8A 2VRKA 3ARYA 3QOKA 3U57A 1DZCA 4U33A 3VDAA 1BLIA 1AQMA 3WDRA 3WD3A 3EYPA 4XUYA 3CA3A 5EB8A 3WN6A 5BCAA 1KQYA 3O5WB 1CXIA 5EG6C 3CRIA 3EBVA 4W7VA 3W82A 1NWTA 5BRQA 1OQLB 4F8XA 4AMCA 3P6JA 1J0KA 3WH9A 1AMYA 1NWUA 4HU8A 3NSXA 3CHCA 1S0EA 1KXTA 2PWHA 5A6BA 5FD0A 5I77A 2VRJA 1ODZA 2YBUA 5JBFA 1PUUB 4I4OA 3BRFA 1TVPA 2E9BA 2GJRA 5I24A 3CU1B 1OD8A 4EANA 4ZLBB 1PIGA 4LXFA 1BGAA 4EFPA 1NWSA 3SUWA 1C8QA 2DSUA 4CGTA 1QW8A 1HKMA 3ZOAA 1GPFA 5D8ZA 3SEPA 4TX8A 4AZ5A 4EAMA 4I96A 1MFVA 2RGLA 1PBGA 2ZIDA 2Y5EA 3RJXA 2CETA 1FV2A 4X9YA 1MWOA 4JL1A 1H41A 1V6XA 3WMSA 2IWTB 2CNCA 4P8XA 5D9OA 5JIWA 3A22A 3T0AA 1KR1A 2DRZA 4NZCA 4WSJA 4D6GA 5EHAA 1OGSA 4OW4A 3FY1A 1DLLA 2IXUA 3POKA 2XTKA 3WFLA 1UA7A 1QHZA 3CA6A 3RMEA 4W84A 4MNMA 4D71A 4YHEA 1G0CA 1QI3A 1G9BA 2XVPA 3QHMA 1S46A 4U3AA 4R27A 5JBEA 1W3GA 3O4CA 3K8LA 2K8RA 2NVHA 3AKGA 1ISXA 1B3ZA 2BHUA 1E4IA 3WH7A 2TAAA 3ARPA 1B31A 3M7SA 3ARTA 4AD3A 3WD4A 1ABRB 5CZKA 1E15A 4LO2A 4JFVA 3F5JA 3LLPA 3VGBA 1NH6A 21BIA 4A7YA 4PN2A 3WMBA 1NUNA 5E6ZA 3FJ8A 3CMJA 1JDDA 2ZWYA 4CVUA 1NZKA 2KH2A 1ZU8A 3RM9A 2G41A 1JF6A 2WVTA 4F66A 4HOZA 1PC8B 5I78A 3H6RA 1GHRA 1CVSA 1AVWB 1W9BM 2D3LA 2E4TA 4C7GA 2XPKA 4RE2A 1QQLA 4P6AA 1OCQA 2XIBA 4P8WA 4OUJA 3VMNA 3WQ6A 5CSUA 3H6SE 2EXOA 1TA3B 1V3JA 2ET2A 1C92A 3WNNA 4ML4A 1DQGA 2ZUMA 3GXFA 1QNOA 4J28A 1M03A 1JXKA 5A94A 1WZMA 2GO2A 3AZVA 3B9EA 4GP0A 1TIEA 4R6UB 5IFTA 1UD2A 1H0GA 3ARUA 1XH1A 2DSKA 3A21A 3AHYA 2WWDA 2CBIA 5EFFA 5A6MA 2WW5A 5HNNA 4JL2A 3F62B 4MDPA 4F34A 2J78A 1W91A 3VGFA 4LYRA 5BVPI 3VM7A 1V6UA 5A1AA 3GH7A 1XH2A 1XRVA 2WK2A 2WMFA 4GIAA 3N7LA 4UQDA 4WIWA 3ZR5A 3VGDA 1V3MA 3AHTA 1B3YA 8A3HA 3PHAA 1SMDA 4EKXB 4N0RA 2O9RA 2VZOA 4PRWA 2X0YA 1JI1A 2CIPA 4L4OA 2E40A 2RQ9A 3CH9A 3BAUA 1MW1A 2EPLX 2VR4A 4CCEA 1CXFA 4J3UA 2BY0A 4YOLA 1XG6A 2O9TA 1GQLA 3SCQA 4D1IA 1EXPA 4A3HA 2D43A 1L2HA 4ZXOA 4XB3A 3AIEA 3ARSA 4A7ZA 3FJHA 1I75A 2WLZA 2F61A 4ATLA 4LO0C 4ZGRB 1N4KA 1XD1A 3CAHA 3WUFA 3T2OA 1UOKA 2PWEA 4WK9A 3UEQA 2VX6A 4OWKA 1T4QA 3ZX7A 3GYCA 3PMEA 1V02E 2VMFA 4GQQA 1HVXA 1CBGA 3CUHA 1UQZA 3ARWA 1EDQA 1QNPA 3DYMA 1AVUA 4I4YA 2WYSA 4QDMA 4ISRA 3ZM8A 4AWEA 4TVCA 2Q8XA 2Z49A 4XKIA 2EBNA 1U33A 3W81A 3II1A 2BHYA 3PTMA 2CERA 1XCWA 1FMZA 3BMWA 1JYWA 1JZ5A 4AZCB 3EMZA 3PHZA 1CDGA 1M53A 5A8NA 2VVNA 5D9NA 4D6JA 2VCAA 1E6NA 3UETA 1RPKA 4EB2B 3W6LA 4GI8A 3W26A 1EV2A 1D2KA 1ZBWA 4TXEA 3BADA 1QNRA 4FF5A 4AISA 3E8LC 1BVZA 2DT3A 3F5LA 4JFWA 3FN9A 4RE3A 1AF9A 4MB5A 4MTVA 3CGTA 2NT1A 3KEHA 4KH2A 1Q04A 4WF7A 2WLYA 1ISWA 2ZXDA 1HVQA 1W3HA 3IANA 4GXPA 1YF8B 2J74A 2DEPA 3NBCA 3QR3A 3RCNA 2A3EA 1UWTA 1V3KA 3EDJA 1TWEA 4KEKA 1JFHA 1E5NA 2EPNA 1QI4A 3OIHA 2DT2A 2J7CA 3WEZA 5A2CA 3VT2A 1EPWA 3RSJA 1B3WA 2J79A 5ABGA 1AFCA 3NIYA 3O9NA 1LL4A 3VPLA 4IY8A 1JL8A 2BNJA 3AS1A 1ODUA 3BCDA 1B0IA 1P63A 4IPNB 5C8BB 3RTIB 1E6PA 4IYBA 5FZZA 1R8OA 1LWHA 3ECQA 5BXRA 3HSMA 1ZB5A 3SUSA 5CLTA 4AW7A 1YXWA 1MXDA 2VCBA 5DEZA 4I4RA 4KEIA 5IDIA 5A95A 2DPEA 4P8VA 3MPPG 1BG9A 1EO7A 1LL6A 5CSYA 1VIWA 2WVSA 4FLOA 3VVGA 1CECA 3TA9A 2EPMX 1HF6A 2X05A 4AD0A 2Q3NB 2J8GA 1DQOA 2OWXA 4DWSD 5DF0A 1SZ6B 3RPMA 3VNYA 2WMJA 4PCSA 3MUIA 1A8DA 1JIBA 4QO3A 1JYXA 4HP5A 3WEMA 1WO2A 4D1JA 5KEZA 1G9CA 2WHJA 4D6EA 2FGFA 3V0AB 1W1PA 1HP5A 3G6MA 3AIRA 3BGAA 1PEZA 2YA0A 2AQZA 4KGJA 3OGRA 1BYCA 4U31A 2J7EA 4NI3A 1LJYA 1M2TB 3HBWA 1B3XA 1TE1A 1JF5A 8I1BA 1GOIA 4P0JA 4UQAA 5A6JA 4H8UA 1J9YA 4PTMA 3AS0A 3VGGA 3AYSA 2PWDA 2CKRA 3DHPA 1VFUA 1WDPA 1RD6A 1DIWA 5AYIA 2Y8VA 4Z2HA 1XSJA 4A7KA 2BV9A 5JMCA 1J0ZA 3GBEA 3WFZA 1SR4A 3VIOA 1GOWA 4K68A 4W8BA 4P7LA 4KC3A 3UG5A 2EPKX 2VURA 4HMCA 3AS2A 1ZBKA 1JZ4A 2ZR1B 1UH4A 3BLPX 4UOJA 2WBCA 3EDEA 4GZIA 2ESCA 2QV4A 3GZAA 1JTCA 1BASA 1UZ4A 5HPCA 4HTYA 3WQWA 1HKIA 1PAMA 4PMVA 1EHAA 3OZPA 2CYGA 1H11A 4I3NA 3G6LA 1IILA 1IZKA 4J2SA 2WHKA 3LMYA 3IIRA 3TTYA 1MQPA 3OBAA 4LQ1A 2VU9A 3OA5A 2NSXA 1W2VA 4AXNA 1XHBA 4QKRA 4RL3A 1Q6EA 2D2OA 5M3WA 1HWOB 2DH3A 2YLLA 4FLRA 1WDRA 3GNPA 1AVXB 2WPGA 3AIVA 2JEQA 2PB1A 3MMDA 3N15A 5A8OA 5GNXA 5AY7A 3A6OA 3WF1A 4EE9A 3EDKA 3AH2A 1UD4A 3AS3A 5DT7A 4GO8A 2B31A 2XIIA 3HALA 2FGZA 1Q6FA 3VD9A 4Z2LA 3OGFA 2QN4A 4QD2B 3O4DA 2A3HA 2GJXA 2VX5A 4HA2A 2NTDA 2QMKA 3OJMA 1W9DM 1CPUA 3WL1A 2E0PA 2E4MC 2OWWA 3AJ6A 3AI0A 3WO3A 1CE7B 1XSIA 1TFMB 2WZHA 1VF8A 4GI9A 4IPLA 5FOOA 2YA2A 4ISQA 3TC2A 4WKFA 1X6LA 4GI6A 3FJKA 3BRDA 3AKHA 4BA0A 2WMKA 3OLEA 2WC3A 4OOZA 3VM5A 1ECEA 4PMQA 3RJYA 3MV01 3RDKA 1JYVA 5EMYA 4W5UA 2UUSA 3IM5A 1HP4A 1TUXA 1BFGA 4CD8A 1WZAA 3VIHA 6A3HA 2D44A 2NP0A 3KZSA 4II0A 3VT1A 5E70A 4AZGA 2K4AB 1G9HA 4IY9A 1RZOB 2YLAA 4Z2IA 2ZWZA 4E4PA 1U30A 2VR5A 4CN1A 2ZE0A 3AZTA 3AMCA 4LPCA 5BOWA 5TD4A 2XG9A 3ZXDA 4TX6A 1EIBA 1VB9A 5JLVA 1IV8A 4CCDA 3AICA 4H7VA 4OEEA 4AEEA 1ILR1 1ZL1A 1KXVA 3MU7A 4FGFA 2EEXA 3I3EA 3NBDA 1CXKA 1TR1A 1CGTA 2XUCA 2W4XA 2G8ZA 1Q1UA 1BTCA 2DSZA 3THDA 3N7JA 4J23B 3WA1A 3VDCA 3U5UA 2ZXBA 1GHSA 1BGGA 1EH9A 1HIBA 1JT7A 4MNJA 1H4PA 2VZSA 3PZTA 3AZWA 2VZVA 5FL1A 1JLYA 1QI5A 1S0LA 2D3NA 2XWEA 3ZMRA 1G94A 5A2AA 1JNEA 2OYMA 1PZ3A 1OBAA 4W8AA 2O92A 4C7FA 2J7HA 4DWSB 2VLCA 3CMGA 3N18A 3VINA 4Z9WB 5I2UA 1E6SM 4GZJA 2GDUA 3MMWA 3VMOA 3KMVA 2BVTA 5A69A 3WNLA 7TAAA 1EO5A 1UA3A 3KL0A 1HX0A 4HA4A 4JCMA 1EGZA 1TMQA 3FJIA 1S0DA 1FN0A 2VUAA 3SCRA 3FNDA 4PTWA 3UG3A 1BLDA 4I4PA 4ACZB 1E1FA 1NOUA 4JKMA 5CQ1A 6CGTA 2NZ9A 2G3IA 3SURA 2G3MA 2ZUUA 3AZSA 1LQ0A 4LO3A 1TA3A 2WVVB 3N17A 1JT5A 1E3XA 1E40A 1EYLA 1KCKA 3P53A 4TLPA 1JT3A 4H8VA 3BAVA 5G00A 4BQ4A 2CCRA 1GOMA 1ISZA 3ZJ7A 5BP5C 3RTJB 3ZJ8A 4H8HA 3TTQA 5JIPA 1US2A 2YL5A 4J3VA 1RP8A 1YTOA 5F7UA 4ZA3B 5DFAA 3HJEA 2ZQNA 4R5EA 1QNSA 1Q6GA 1CXLA 4NRRA 4B16A 3OJVA 5FIPA 4C7DA 2Y9FA 1OGBA 4UQEA 1TOOA 1L0PA 2J47A 2X1IA 1JZ8A 1HJVA 4JKQA 1FWVA 2HZ9A 1KGWA 3OJ2A 3WQ8A 3O4OA 4M56A 1M7XA 4BF7A 3MUY1 4ACYA 1CZ1A 3N11A 4U3CA 4GAFA 1JNDA 1UWSA 4WKHA 2D7RA 1UUQA 2BEAA 4M8UA 2UY2A 3SCNA 4UQ9A 5IHSA 4X38A 1BFNA 3WENA 4U2YA 5HDRA 3ARRA 3LPOA 1J0SA 3R4UA 4HZ8A 1VRXA 3SCUA 3TTSA 2ZXAA 1OM0A 3KE0A 4KBBA 4J27A 1H09A 1HWNB 1OINA 4L4PA 2YKKA 2LIEA 2WBGA 4ENDA 3IJ9A 1UKTA 5DMYA 1OD0A 1XSKA 3O44A 2JEPA 4GKLA 3VUOA 4M29A 3ZO9A 5CPTA 2PWGA 2YL8A 2BFGA 4BCEA 2F2FA 5D4YA 5GPRA 2WB5A 1Z4SA 3WD2A 3FAXA 3WNKA 1QI0A 5DO8A 4AN6A 4HA1A 3WNOA 1E0OA 2YDQA 6TAAA 3S2CA 1F4AA 3CA0A 2GFTA 4PUEA 1MC9A 1XD0A 1X1NA 2MLLB 4PMRA 1UR8A 2DRYA 4AZ6A 3BAYA 4IHZA 3PUBA 2QPSA 3BMVA 2ESUA 3PZNA 1I1BA 4AIUA 3WDPP 3VO0A 1TG7A 3AH4A 1FH8A 1Y7VA 2C8NA 5FZYA 1OWQA 1OSEA 1G5AA 3VDBA 1G1YA 3N12A 1J12A 1KR0A 2WCGA 2OSYA 4AZCA 3HOMA 1EHNA 1H49A 2VSEA 4B15A 2D7IA 4UFJA 1GQKA 4ZKTB 1Z0HA 3FJEA 4G9MA 1BHGA 1JD7A 2DSWA 1Q6DA 5CGMA 5D61A 4J3XA 1W1YA 2WNWA 4OZOA 4GZEA 1R8NA 4KWUA 4OJYA 2G3JA 4ZE4A 2A3AA 3HN3A 3UDAA 3CPUA 3AZRA 4CU6A 3TP4A 2VUYA 2ZUWA 4MDOA 4KRTA 3BB2A 3B9UA 3SCSA 3W37A 2QYIB 4PMXA 4I7IA 3WUEA 2NT0A 2IHOA 3WDQA 1W9VA 2VXRA 3P6IA 4LYPA 4BQ2A 4JRAA 1NOWA 1GONA 2FHBA 2XYLA 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