1V6WA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-4-o-methyl-alpha-d-glucuronosyl-xylobiose
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 163
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6wA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6wA02
4NZCA 2Q8XA 4YHGA 2WBGA 1PX4A 6I1BA 3OGGA 1K5VA 4AY1A 2BVYA 2YOCA 2DT1A 2FH6A 3CHDA 5HDRA 3SCRA 6CGTA 4IQPA 1QQLA 4EFQA 1RP9A 3U5YA 1E3XA 1UKTA 4D6IA 1H09A 3HBWA 1EIBA 2XJ7A 1Q6CA 4AZ5A 2XSAA 3ARQA 5BYWA 3AI0A 1M2TB 1XZZA 3HMCA 3W37A 2WHLA 2D3LA 2EJ1A 1HKMA 4HMEA 1MC9A 2V3FA 3AZRA 1HT6A 1JZ2A 4IUGA 5B2HA 3WBAA 1I1XA 3FHQA 2Y8KA 3O44A 1LWHA 3MMWA 1CLVA 3FJBA 4XFTA 3ZOAA 4CGTA 1BF2A 1GOOA 2ZXAA 1MFUA 1HKNA 1UZ1A 4H04A 3WO4A 4Q7NA 4PUDA 2VUAA 4J2YA 1HNYA 5BXRA 1LLOA 3VSFA 1LQ0A 2GJXB 4NSBA 3K8KA 2VZUA 4OBRA 3CLWA 3WD3A 1W3LA 4I1BA 3LMYA 5A6LA 3BTAA 3CHFA 2WBCA 2XFFA 4N0RA 4XV0A 1CXFA 3WMCA 2JF6A 1H41A 4ATDA 3IAQA 2Y4SA 1PUUB 2A3EA 2OYKA 3WQWA 2ZUMA 3BAGA 3VM5A 1J10A 2MANA 1EGZA 5JIWA 4W86A 3EDEA 1J12A 4JZ5A 3ZSTA 5LA0A 1UR9A 2E3ZA 4EAMA 2KLLA 3SUTA 3WD2A 3AOFA 4AZIA 2Y9WC 1NOWA 4GINA 4AD2A 2OYMA 3CH9A 5BWFA 4GI9A 4LO3C 5CXPA 4XKIA 1BVZA 4D6DA 1NWSA 3AS1A 3J7HA 4AMCA 4MNMA 1WPCA 4LO0A 4NRSA 1A3HA 5BXTA 2ZE0A 3IJ7A 4M82A 5A6BD 1JYWA 2BFGA 1W9DM 1KCLA 4B3LA 5A69A 2J7HA 3QHMA 1E3ZA 4FLOA 5IFTA 2Z48A 4TX8A 1DQGA 4LO2A 4W8BA 1E72M 3SCSA 1I1BA 3Q7XA 2WZHA 5A3HA 4Q22A 1GGPB 2WK2A 1OGGA 1R8LA 3IK2A 3BA5A 4GI8A 4TUFA 1CE7B 3RJYA 1MVYA 1JZ5A 2DRYA 4G9MA 3ARXA 1JZ8A 4V28A 4H8HA 5A6KA 5BOWA 4LYPA 2VRJA 1TA3A 1B3VA 1XD1A 3F5LA 2YBUA 2PWHA 5FNXA 3N04A 1P63A 3PZ9A 4LO7B 4D6FA 2XVLA 3UG3A 3WF3A 2VX4A 1RP8A 4LO1A 4UFKA 2WVVA 3AKIA 3U5UA 4HOWA 3ZC8A 3WD1A 3MUAA 5BP5C 4HA1A 2BY0A 1JD9A 4F9JA 3VT2A 2FDBM 5AYBA 2X2SA 4I37A 2BFHA 2UWFA 3IIRA 2VT0A 5I79A 3N9KA 2OSWA 1ONKB 1J9YA 3IJ9A 3WIJA 1VCLA 1E6RA 5JBEA 1IHKA 2IUZA 2VX5A 3U57A 4MTVA 1GOKA 1DEDA 1TE1A 1VEMA 1CGTA 3A22A 2J75A 2VOTA 1SZ6B 2ERMA 4H8VA 3WF0A 3LPPA 2QLYA 2RGMA 1QI0A 3T0DA 4BCEA 4OKDA 5FNWA 3OLGA 2FGZA 4J7RA 3WSUA 3ZXGA 3CUGA 1B31A 1R86A 1JYVA 1H4PA 3A3HA 4DUVA 2KKIA 3I2AA 1L2HA 1HJVA 2DQXA 3BCFA 3EMZA 2ZX8A 1JGIA 3L4VA 3WUEA 3BA7A 2DSZA 3AMKA 1MXDA 1HKKA 1FFRA 4LQ1A 4PC4A 1WZAA 3II1A 4GO8A 3WDIA 3EDJA 2YJQA 1AVXB 3FJCA 1U33A 3ALGA 5EBAA 1M01A 1D2KA 4JKLA 1ABRB 2DH3A 3TA9A 3AJ5A 3VMOA 5JIPA 1BASA 1J0JA 4CKQA 2BV9A 5A8MA 2O9PA 4QC4A 1B90A 2WNWA 3TP4A 1R7AA 4MAVA 2FDMA 2F8XC 3W38A 3ZJ7A 1QVBA 5I0DA 2QPUA 1NM9A 2EPMX 4JCLA 1ODUA 3NSMA 1J0HA 1OINA 2GFTA 2L5XA 2DIJA 2QN4A 3GDBA 4FGFA 5M03A 1B1YA 3WMVA 3K1DA 4W5UA 3VDAA 4AD1A 4I4YA 1MFVA 4HOXA 3PZMA 2QV4A 1UR1A 1ZJBA 2J7BA 1JAKA 1UA3A 5A8NA 4P7QA 1W9UA 3OLIA 2DH2A 4KGLA 1E0WA 2WM0A 3ZT5A 5A2CA 3ALFA 4JRAA 4U33A 2I1BA 1HIZA 4IM4A 3L4UA 4DEPA 1R7OA 3NBEA 5E24E 4A4AA 3VINA 4M80A 1SR4C 1KQZA 1E6NA 3WMBA 1B3YA 1TOOA 2WYSA 2NYYA 4QBCA 1Q6GA 3ZO9A 1KFWA 4CN1A 5A8OA 3BH4A 1CNVA 3MSDA 1DP0A 4W89A 5ECUA 3T2PA 5CGTA 3H6SE 1EH9A 1E1EA 3BAVA 1SFSA 3BAJA 3O4OA 1DWGM 3VDHA 4DCKC 2ZOXA 4KRTA 5CQ1A 4CN6A 4AC1X 3AHXA 5HPZA 1QW8A 4UQDA 2GK1B 1HWMB 1HJWA 1K9FA 4QAWA 1Q6EA 2A3HA 1DWIM 3VO0A 2J78A 3V0AB 1DWHM 1UWUA 3WA1A 2QPSA 1CZ1A 3ZR6A 4M29A 3OJVA 1GQIA 3CA4A 2VI0A 4OWKA 2FHCA 2F2FC 2J74A 1YF8B 3A07A 1EA9C 2D0FA 4Z2KA 4DUWA 2BHYA 1S0CA 2G41A 3Q7WA 2D43A 3D7WB 4AD4A 3SCWA 3MO4A 3NJ5A 2E9BA 4UFIA 2UY2A 2RSTA 5CLTA 3DHUA 1EYLA 4YHEA 1G9DA 1OBAA 2J62A 5GNXA 1ZBKA 5EHAA 3W81A 1FGAA 3NBNA 3ZR5A 4PMRA 3CQAA 1JY0A 1H5VA 5LA1A 2Y9XE 1QXMA 3R4UA 4FK9A 3OBRA 4F66A 3UR7A 2NTDA 1JZ4A 3TONA 1KXTA 4USOA 5FL1A 1DZDA 3SUWA 1PBGA 4OW4A 4I1EA 1V6UA 3WQ6A 4P0JA 1MW3A 2WCAA 5LA2A 1LL7A 3L4ZA 1BLDA 1XD0A 3BA4A 4R5EA 4YN5A 1T4QA 5A6MA 3SNVA 4EANA 4JHOA 3M7SA 1NARA 2WRYA 5IXEA 2D24A 3PG0A 1CTNA 1Y7VA 1JF5A 1W2VA 3UDAA 1N4KA 5FCZA 1SR4A 4WF7A 3EF2A 5C71A 4OWJA 1V6WA 2ZXQA 4XB3A 5FZYA 4JKQA 1XSJA 1H1NA 2RG9B 1UD8A 3AIRA 2PI6A 1IJTA 3ARYA 4I4UA 1VFOA 4LXFA 2A3BA 4HA3A 2ZUTA 4HMCA 1GHSA 1E5NA 1LF1A 4AWEA 2Z1KA 1EO7A 1QI3A 1W3GA 1UG6A 1W9PA 1KNMA 2WC4A 1HWNB 4I4XA 3IM6A 2VR5A 3D5HA 4TVCA 4W84A 4D6CA 2VUYA 2XTKA 2WWCA 1VFMA 3UETA 1BVNP 2ZR1B 3SUUA 3UJ0A 5A94A 2QYIB 4B3KA 4ZFUB 4CCDA 1ODZA 1VJSA 2PBOA 3FUQA 1W9VA 3O4AA 3VD7A 1PC8B 4BF7A 2F2FA 3EDFA 4CCCA 4PMDA 1EDGA 3WF2A 3OZPA 3TTQA 5FOOA 3K8MA 3AZSA 6TAAA 2HISA 1GQLA 2BHUA 4LX4A 2CNCA 4E8DA 2VLCA 1T9FA 4EB2B 1ZU8A 1BQCA 3RM4A 5BXPA 1JTCA 1Z0HA 3PTKA 4PN2A 2ZXBA 4TTUA 3KE0A 3WO3A 4UFHA 1EOMA 1K6AA 5ABHA 1ISYA 2V5DA 1EDTA 1MXGA 3BSGA 3AISA 2CBIA 1BARA 1V3HA 1JDCA 1DHKA 3O6AA 2J4GA 4JKKA 3CA0A 1C3FA 4H8UA 4PSRA 1FA2A 3WUBA 3FJIA 1OT2A 1EOKA 3OG2A 3AH4A 3AZVA 5C8BB 3WUFA 2WBKA 3FHAA 3GBDA 4D8HA 2JIWA 1W3HA 3O49A 1HL9A 3P6IA 3DYMA 1L8NA 3CUHA 4X0VA 1QNRA 2WLYA 3H6QA 3S8JA 1TFVA 1ZJAA 3UESA 4D1JA 3A4AA 3RDKA 4H2CA 3A6OA 4AZBA 3WNPA 4ZA3B 3SCOA 4CD4A 5I23A 4EEEB 4DUXA 1UHVA 3TC2A 1ITCA 1G01A 1AVAC 3B9AA 3WN6A 3L4YA 3AKFA 1H3GA 1ISZA 3FJDA 2PC8A 1W9BM 4DENA 1KBBA 1K5UA 3WUGA 3PTMA 4AZ6A 2CCRA 3N15A 4GQQA 2DEPA 4W93A 2Y24A 9CGTA 4CUCA 2D7IA 4A3YA 4AD3A 1VIWA 4W8AA 1AF9A 2YKKA 3U7BA 3VILA 3L4XA 4PTWA 2V38A 1LL6A 1RMLA 4GP0A 4G9NA 5I78A 4AYSA 3CGTA 3BX1C 2X0YA 1E1FA 3W82A 1E70M 1CWYA 4MB4A 3B9DA 3RCNA 2D22A 4I96A 4I4OA 3MUZ1 1UUQA 1EDQA 3KZSA 4Z2JA 1V3JA 1NH6A 2WPGA 1CENA 1CGYA 3P53A 1G94A 4PSPA 1B3WA 2CERA 4QLKA 5JUVA 2VR4A 3FJKA 1Q03A 4Z9WB 3VKKA 8I1BA 2WCSA 4PEEA 1JYXA 1GJUA 3CZLA 4USPA 3LLPA 2VQTA 4JKMA 3BAWA 1S0GA 3KMVA 2JF7A 3VTRA 1UR4A 3BXWA 4UOJA 4W7UA 4C7FA 1V3LA 1RPKA 5DVHA 4J3SA 3AH2A 3PHAA 4F34A 4I4PA 4AN7B 1BYCA 3RMYA 5DZUA 1MQPA 1QHPA 3RIKA 3BRFA 4GKLA 2UUSA 4QALA 1JD7A 2VCAA 5E70A 1SMAA 1BGAA 4AZGA 1AVWB 4MAZA 1KGWA 3VD4A 4LO0C 2Y5EA 3T0AA 4FMVA 5HNNA 4DWSC 3TTYA 5ABFB 1FWVA 2BVTA 1UA7A 3WO2A 4QD2B 1F4AA 4AIOA 4LO2C 3ZJ8A 3AKGA 2IWTB 3HSMA 3WY1A 2PWDA 2OSXA 3GH4A 4UOQA 4ACYA 5C70A 1UKOA 2Y9GA 4PUEA 2WHJA 3PN8A 3FAXA 1BAGA 1C7TA 1J18A 5E6YA 2VMFA 4MPKA 3VGFA 3G6MA 4A7ZA 3IAPA 4PMVA 1M7XA 1DWAM 2DSVA 4D6GA 1F4HA 4HU0A 4ZEPA 2WHKA 2GJXA 1AVAA 3VWCA 2YLLA 5FL0A 3W26A 3DHPA 2OYLA 4KEKA 2A3AA 1W1PA 1V6YA 1K9DA 4D6HA 4ATWA 3NSNA 4G6MA 4PTXA 4ZXLA 3VVGA 1CXEA 4JPZA 1XCXA 5ABGA 4J23B 4LO1C 3RJXA 2Q3NB 2VU9A 4AEFA 3FW6A 2J79A 1CPUA 1JXJA 1WE5A 4GZEA 4PMUA 1VEOA 1US3A 2ZIDA 4OUJA 1V02E 3WQ8A 1TMQA 3QYDA 1K9EA 2D7RA 4LGXA 5DFAA 1UH3A 1FH8A 4WK9A 1R87A 2D23A 4S3JA 3AFBA 3UCQA 2BY2A 2GZBA 3VUPA 5D9PA 2CITA 3MUY1 3WH5A 1HJUA 1UWRA 2W63A 5D9OA 4HOZA 5FD0A 3WD4A 2J8GA 2WMIB 3WEZA 1XG6A 3VT0A 1BYBA 4U2YA 3VNYA 4FVVA 3MKKA 1O6IA 2RGLA 3N7LA 1EPWA 4KEIA 2DDXA 1CGXA 1KXVA 4M56A 2HVMA 1W1VA 1H49A 4Y7EA 2ZICA 1QHZA 1CXLA 3AHYA 4DM1A 4W85A 4RE4A 1BPLB 1V03A 4U31A 2W67A 1MYRA 2Z49A 1E6PA 1B30A 3QHOA 2VVSA 5M17A 3OB8A 2XUCA 2VC9A 1KR0A 2XGIA 1MWOA 4AISA 1WZLA 2OLHA 1HKIA 3RMXA 2V3EA 4IONA 4DWSA 4MB1A 2VURA 4CU6A 2EPNA 3HOMA 4M1RA 1NZKA 5A6BA 4JKXB 3MPPG 3VIPA 4FF5A 2E8ZA 4AZHA 1UD5A 3WQ4A 1HWOB 1X6NA 3WELA 3GNPA 1OM0A 3L4TA 4P8XA 1W91A 2CESA 3VNZA 4MJ4A 2X2YA 1W3KA 3W25A 2BVDA 2J7CA 1LL4A 2M49A 3WH8A 3EYPA 4UQAA 4XX6A 4JL2A 1DWJM 3JUGA 5D9MA 1GW1A 4R27A 5F8WA 1GZJA 3AHVA 2Y2WA 3I3EA 2X8RA 4WJXA 1OD8A 4ATLA 1WDSA 2ZUWA 3NSXA 3OGVA 2ZUVA 3BAHA 3WKZA 3UJ4A 1CGWA 3POHA 4RE3A 1MD6A 3AJ7A 1XYZA 2NP0A 3WMUA 2GUYA 5HXMA 1GVYA 1XCWA 4KRUA 1JLXA 2J8FA 3CRHA 4RL3A 4JP0A 3AIWA 5DF0A 1DLLA 4C7DA 2VRQA 3GXIA 1UWQA 3WH7A 1GORA 2XPKA 4HMDA 4OIFA 1CVSA 1PIGA 4AN6A 4KC3A 1CXKA 4GPNA 5IFPA 1IRAX 4PMNA 3W28A 2D20A 3NJ3A 1Z32X 2PWFA 4D6JA 2E9MA 2CBVA 3W27A 2O9RA 4P7OA 2XVGA 1CBGA 1HCEA 1GNXA 5JBDA 4D6EA 3CA5A 1JNEA 3AMGA 4GI6A 1TTUA 1WZMA 3F4VA 3WNOA 2ESCA 3OJ2A 3AQUA 4UR9A 5GNZA 5HPOA 3CA6A 3PZTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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